NA ----> NA
Intron 1 GTCAGTCTCT ... TATGCACTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.23 | 159 | 167 | 38 |
| A2 | 44.74 | 105 | 85 | 40 |
| A3 | 51.05 | 163 | 170 | 24 |
| A4 | 51.09 | 90 | 94 | 27 |
| A5 | 36.88 | 89 | 52 | 15 |
| A6 | 31.22 | 747 | 339 | 69 |
| A7 | 29.86 | 982 | 418 | 96 |
| A8 | 37.74 | 922 | 559 | 124 |
| A9 | 36.6 | 835 | 482 | 84 |
| A10 | 29.73 | 676 | 286 | 58 |
>TRINITY_DN46453_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAACAAATTGTTTGCATTATTGAATGCAGTGTGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAGAGGGCTATATGCGGCGGGAGATGGGAAAGATTTTGAAGATACTAAGGAGGGATTCAGATAAGAGCTGCAACAGGCAGGAATTATCAGAGTCTGCATCGTGCATCCGTTTGACATTTGGAGAAG
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>TRINITY_DN46453_c0_g1_i8 from sample A8 / Example unspliced isoform:GCACGAATATTCCATTTAAAATCTTTTAATGCAATGGGATCACAGGGTTACCGTGTCGTGAGTGTGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAGAGGGCTATATGCGGCGGGAGATGGGAAAGATTTTGAAGATACTAAGGAGGGATTCAGATAAGAGCTGCAACAGGCAGGAATTATCAGgtcagtctctgtatgcaatatcca
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taagtttaattattataaattatttttttccaattttatgcactagAGTCTGCATCGTGCATCCGTTTGACATTTGGAGAAGACTGAAGAGCATCTCTCCATAGCAGTTCACTGGTTTTCCTACAGAAATCCACCTTGTCAATTGGGTGGCTTTATAATCCTTCGAGGTTTGAATCTTTGGGACTTTTGGTTCCGACATG
ACCAAATTCAAAGTCCCCTCCTTGTAATCTACAACAGATACCAATTTGGTTTGGTCCTTTTTGTCCCATATTTTGACGCTTAATATCCATATACTGAGTGAATACAGTAGGCTGTGACTAAGAGGCCCCATTTGGTGTAGAAGCTTGTTGTGTTGCTGGTGTAGGCAACATTGCGGATGTAACATACTCAATGGTAATAG
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ATTTCTTGCTAAATATCGTATTTTTATTATAACATTATTAGTATCATGTTTTTGCCTAGACATGTTTACGTGCAAC
Intron 2 GTCAGTCTCT ... TATGCACTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.23 | 159 | 167 | 38 |
| A2 | 44.74 | 105 | 85 | 40 |
| A3 | 51.05 | 163 | 170 | 24 |
| A4 | 51.09 | 90 | 94 | 27 |
| A5 | 36.88 | 89 | 52 | 15 |
| A6 | 31.22 | 747 | 339 | 69 |
| A7 | 29.86 | 982 | 418 | 96 |
| A8 | 37.74 | 922 | 559 | 124 |
| A9 | 36.6 | 835 | 482 | 84 |
| A10 | 29.73 | 676 | 286 | 58 |
>TRINITY_DN46453_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAACAAATTGTTTGCATTATTGAATGCAGTGTGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAGAGGGCTATATGCGGCGGGAGATGGGAAAGATTTTGAAGATACTAAGGAGGGATTCAGATAAGAGCTGCAACAGGCAGGAATTATCAGAGTCTGCATCGTGCATCCGTTTGACATTTGGAGAAG
ACTGAAGAGCATCTCTCCATAGCAGTTCACTGGTTTTCCTACAGAAATCCACCTTGTCAATTGGGTGGCTTTATAATCCTTCGAGGTTTGAATCTTTGGGACTTTTGGTTCCGACATGACCAAATTCAAAGTCCCCTCCTTGTAATCTACAACAGATACCAATTTGGTTTGGTCCTTTTTGTCCCATATTTTGACGCTTA
ATATCCATATACTGAGTGAATACAGTAGGCTGTGACTAAGAGGCCCCATTTGGTGTAGAAGCTTGTTGTGTTGCTGGTGTAGGCAACATTGCGGATGTAACATACTCAATGGTAATAGCAAGCTTTCTTGATGTTGTCTTAGGCTTGGTTGAGGCTGTCTCAAGCTCAATCAATGTTTTTTTGGTGGTCTTCAATTTCTA
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>TRINITY_DN46453_c0_g1_i10 from sample A8 / Example unspliced isoform:GCACGAATATTCCATTTAAAATCTTTTAATGCAATGGGATCACAGGGTTACCGTGTCGTGAGTGTGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAGAGGGCTATATGCGGCGGGAGATGGGAAAGATTTTGAAGATACTAAGGAGGGATTCAGATAAGAGCTGCAACAGGCAGGAATTATCAGgtcagtctctgtatgcaatatcca
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AATCCACCTTGTCAATTGGGTGGCTTTATAATCCTTCGAGGTTTGAATCTTTGGGACTTTTGGTTCCGACATGACCAAATTCAAAGTCCCCTCCTTGTAATCTACAACAGATACCAATTTGGTTTGGTCCTTTTTGTCCCATATTTTGACGCTTAATATCCATATACTGAGTGAATACAGTAGGCTGTGACTAAGAGGCC
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GGTATTTATGAGGCGAGAGTGCTTCCTATGTGTTGAACTCACACACTAATCGATTTTGTGAATTATAACATTGAACCATCCAGTCAAGTTGGCTATGGAAATGACATTATTGAAATATAAATTTAGTGATTAC
Intron 3 GTCAGTCTCT ... TATGCACTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.23 | 159 | 167 | 38 |
| A2 | 44.74 | 105 | 85 | 41 |
| A3 | 51.05 | 163 | 170 | 24 |
| A4 | 51.09 | 90 | 94 | 27 |
| A5 | 36.88 | 89 | 52 | 15 |
| A6 | 31.22 | 747 | 339 | 74 |
| A7 | 29.86 | 982 | 418 | 96 |
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| A9 | 36.6 | 835 | 482 | 87 |
| A10 | 29.73 | 676 | 286 | 60 |
>TRINITY_DN46453_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAACAAATTGTTTGCATTATTGAATGCAGTGTGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAGAGGGCTATATGCGGCGGGAGATGGGAAAGATTTTGAAGATACTAAGGAGGGATTCAGATAAGAGCTGCAACAGGCAGGAATTATCAGAGTCTGCATCGTGCATCCGTTTGACATTTGGAGAAG
ACTGAAGAGCATCTCTCCATAGCAGTTCACTGGTTTTCCTACAGAAATCCACCTTGTCAATTGGGTGGCTTTATAATCCTTCGAGGTTTGAATCTTTGGGACTTTTGGTTCCGACATGACCAAATTCAAAGTCCCCTCCTTGTAATCTACAACAGATACCAATTTGGTTTGGTCCTTTTTGTCCCATATTTTGACGCTTA
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>TRINITY_DN46453_c0_g1_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:GCACGAATATTCCATTTAAAATCTTTTAATGCAATGGGATCACAGGGTTACCGTGTCGTGAGTGTGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAGAGGGCTATATGCGGCGGGAGATGGGAAAGATTTTGAAGATACTAAGGAGGGATTCAGATAAGAGCTGCAACAGGCAGGAATTATCAGgtcagtctctgtatgcaatatcca
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ATGTTGTCTTAGGCTTGGTTGAGGCTGTCTCAAGCTCAATCAATGTTTTTTTGGTGGTCTTCAATTTCTAAACCTATGTTCTTACTTCTTCCTCAATCCTATACTTCTTGTTTGATTGCTCTATTAGATTTTAAATTATTATCTTGATTACAAGTCCTCAATTCTCTGAAGGACTTGAGCGAAGTATAATTTCTTGCTAA
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AATCGATTTTGTGAATTACATCATTGAACCATCCAGTCAACTTGGCTATGGAAATGATTACCAAACCATCTACAGTCTTATAAACTTGTTAGTTACCATTGTGACTTAATATAGAAAAATATTTGTTAATTTTTATAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTACAGGTTTTTTTTAACTAATATGAAATACTAATATTAATCAT
GTTAACTAATCTTATAGAGAAATACAAGTTGTTTCATTTTGTACAATTGAATGTGTGAGTTTTTTCATTTTGTATAATGAATTTAATCATACTTTCCTTGAATTAGCAGAAATCTTAATCCAAGGTAAATTGCTTTATGTAAAAATATTGACCAAGCCTTCCTAGTGCTCATTTTGAATGTGTGAATTTTTTCATTTTGT
ATAATGAATTTAATCATACTTTCGATGAATTAGCAGAGATCTTAATCCAAGGTAAATTGCTTTATGTAAAAATATTGACCAAGCCTTCCTAGTGCTCATGGAAATATGTAGTACTTTCCTAAGAACACACATGTCTTGGAAAGTTATACCTCATCTCAATTTACCTAGTATTTATGGATTTGAAATTATTTTATGATCTT
AAAGAGTAGACTTTCTTGGATTTGTAATTATTTTATAATATTAAAGCATAT
Intron 4 GTCAGTCTCT ... TATGCACTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.08 | 159 | 166 | 38 |
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| A9 | 35.76 | 835 | 465 | 87 |
| A10 | 28.76 | 676 | 273 | 60 |
>TRINITY_DN46453_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAACAAATTGTTTGCATTATTGAATGCAGTGTGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAGAGGGCTATATGCGGCGGGAGATGGGAAAGATTTTGAAGATACTAAGGAGGGATTCAGATAAGAGCTGCAACAGGCAGGAATTATCAGAGTCTGCATCGTGCATCCGTTTGACATTTGGAGAAG
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>TRINITY_DN46453_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:GCACGAATATTCCATTTAAAATCTTTTAATGCAATGGGATCACAGGGTTACCGTGTCGTGAGTGTGCTGGGTTCGATTCTGATTGTTAGAGGGCTATATGCGGCGGGAGATGGGAAAGATTTTGAAGATACTAAGGAGGGATTCAGATAAGAGCTGCAACAGGCAGGAATTATCAGgtcagtctctgtatgcaatatcca
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