sp|Q7XTV7|HIP1_ORYSJ ----> Probable E3 ubiquitin-protein ligase HIP1
Intron 1 GTGAGTGTTT ... TTGACGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 40.13 | 47 | 31 | 32 |
| A2 | 45.58 | 40 | 26 | 41 |
| A3 | 35.06 | 50 | 19 | 35 |
| A4 | 49.18 | 31 | 41 | 19 |
| A5 | 37.37 | 31 | 9 | 28 |
| A6 | 80 | 1 | 5 | 3 |
| A7 | 41.67 | 7 | 6 | 4 |
| A8 | 25 | 3 | 1 | 1 |
| A9 | 50 | 3 | 1 | 5 |
| A10 | 23.53 | 13 | 2 | 6 |
>TRINITY_DN103375_c12_g1_i3 from sample A5 / Example spliced isoformGTTTAAACTTGGCGAAAGTTAGATACCGGGTTTTGCGTCTAAAGACAGACTTTTGATTCGCCGTCACATGAAACCCTCGTCCGTCGACATTACAGGCTTTAAATTTGGTCTCCGTTTGCACAGATTTGTCTTCAAATTGTTTTCGATCGAATCCTGCGAGATGTCCGGTTGAGGCAACCTATATTGCTTTTCAAGAAATA
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AAAAATTTAGAAGATATTTCTGGGCATTCATCTTATGATGGTCCACCACATTCTTTTAACTGGGAAGAGGGTAATTCGTCAAGGTTCACTGGTCCAATAAGACATGATATGGGCAGTGTATCAAGTTTTTCTGCCTCTGGAGTAACACCTGTAAGGGTTAGAGAATGGGAAGAACCGGTGGTGCCTAGGCCTGGACTTAT
GGTTGGCTCAGGCAGGGCTGTAGATTACAGGAACAGTGCCTTGTCTGTGACTGCAGCAATGGAAGGTGCTCAAAGAAGTGTCCGAAGCAGATCTAATTCTACACGTTATCAGGAACCAAATTTATTACATTTGCGACCTTCAGGCAATCATGCCCGGCATTTTCAGGTGAGAAATCATTCTTCAGTTGATCAGCCTGCAA
ACATGGAACCGGCAGAAACTGGTGCCAGTGCCACTATGCATGACACCTGTCAGTTTCCGACCTCATCTACCTTTCAAAGGAGGAATTTAGGAGGATGGAATGAAAATATGCCCAGGGCTAGCGGTCATTTCAGTTCCATCCCTATTGAGAGGGACAGGTCAGCTTCTTTGCATTCTGCAACCAGCTCAAGCAGCACAGTC
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AAATTCTGGTGTTGCACAAGAATCACTGTCTTCTCTGAGGCCTGGACAAAGCAATCATTTTTCTAGGCCACCTGGACCTTTTGCTCCTCCACTGGATATGGTTCTCAATCCTGCAGCAGGGTTGCAAGGTCCTCATTACTTAAGATCATCGTTGGTGGAACATCGTGATCAGAATGCTAGACCTCTTATAAGAAGCATTT
TAGATGTTTCCTTTGAAAGACTCCAAACTCTACAGAATGAGCATGGCGGGCATAATAGAATAATGCCTGAGGTTTGTTCTTTCTTCCAAACTTTGACTTTACTCTTCATTTCTTCATTCACATCTTTTCATGTATGCTTGCTTTACAGTTAAGAGGTTTGAACTCTTAAGCTAAATAAATTTAGCTGGGTGTATGCTTAT
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TTTTATTCCTGTCAGCAGGGTCATATATGCGGAGCTGATGCACAATGCATACCTGATTCATCTCTTAGTACAAGCTTTTTCAGATATATATTTTATTTTTATTGGCAAAACAAAGTGAGGAGCTAAATTATTATAATATAGCCTATATACATGATCTTTACTGGGAATTTCTGGAGTGAGTATCTGGTACGGAAGTATAG
TTAAATATTTTGAATGTGGGTTGCCTCAGAGTTAGTTGGGGAATAGATTCTGTAGTTTTGTTAGAAGGAATCTGATTCTGTTTAAGCAGTCAAAAGTTTAGTAGGAGCATGAAAAGGGAGCTTGATGGGTCTCCCAAATCAGGTTCTTTCAATAAATTAAAGTGATCATTGGAAAGGGAAGTTTGGTTTTTGTGGTTATA
TGTGATGTTCTTGCACCTTCCTTATTTGTTGGATTTTGAATCTGTTATATATATATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAATGCATTTACTAGGAAACCCGCCATGTACTTCCCCTCATTATGAGGATGTTATCCAGTGTAAACCCTGATTCTTCAGGGCTCAAGGTCAGGTCAACAGTCAACACTTGGCTTA
TGAAGATCACAAGCATGTCACAAAGTGGGATTTGAATGATGGTGGAGGTCGATAAGCACTTTCGTCCCAGCCACTCGAGCTACACCCAATCGACTTCTGTCTTGTATGTATATTCAGCTATATATTAGAATAATATGTGAGCGTGTCTAGTTGATTCTTGCATGCTTTGTACCTAACATCTATGTATTCATTCATATATG
TATTAAACCTCTCACATTTCCAAAATTATTATGCCAAGACTCTAAGCTCTGTCTTTCACTGCTTAGGACTACTTTTAATCAGAGTGATTAAGTTTTTATCCCTACACTGTAGATGATTGTAGCTTTTACGAAAGTTTACATTTTACTCACGATCCCTGGATGTAACATTGATTATTATGTCCATGTGACTTATCTGTCCT
GTGGTAATCTATTTCCTATTTCCTCCACATTTTTGTTGATACCAAAACCTGTTTTTTGGTTGCTTATAGATGACGCCTTCATTTATAGAGGTTGCTTATAGATGACGCCTCCAGATTTTGACTGATACCAAAGCCTGCTTTTGGTTGCTTATAGATTTTGCCTTCATACAGAGAGGTGTGCATAAGTTGCATCTTGATAG
TCTGATAGTGTTGGAAAAAATGTGGATATACTTGAATACTCTATACTTGTTATTTAAAGCCAGTGTAGATCCATCTCGACCTCGGATCTATTCAGCACCTTGAAGGATCAAAACGAAACTGAGGCATAAAATTTTTGGTGCTCAAGAGATCAGGGTTATGATGGGTCTACACTCGTTTAAATACTCTATACTTGTGACTT
ACAGCCATTGTAGATCCATCCCAACCCTGGATCTATTAAGCACCTTGAGGGATCAAAAAGAAGCTGAGGCACAAACATTTTGGTGCTTAAGAGATCAGGGTTATGATGGGTCTACACTGGTTTATTTTATTATTATTATGGTCAGTTTTTTTTTCACTTGTATGTTACAGACCTAACTTTTAAGTTTTTGGTGCTTAAGA
GATCAGAGTTACGATGGGTCTACACTTGTTTACATTCTCTATACTTGTGACTTACAGCCATTGTAGATCCATGCCGACCCCGGATCTATTAGGCACCTTGAGGGATCAAAAAGAAGCTGAGGCACAAACATTTTGGTGCTTAAGAGATCAGGGTTATGATGGGTGTACACTGTACACTGGTTTATTTTATTATTATTATG
GTCAGTTTTTTTTTCACTTGTATGTTACAGACCTAACTTTTAAGTTTTTGGTGCTTAAGAGATCAGAGTTACGATGGGTCTACACTTGTTTACATTCTCTATACTTGTGACTTACAGCC