sp|Q8RY59|RCD1_ARATH ----> Inactive poly [ADP-ribose] polymerase RCD1


Intron 1 GTGAGTTTAC ... GTTTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A558.827310
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A747.3790181
A847.481250113
A947.641220111
A1046.358250



>TRINITY_DN110254_c0_g1_i17 from sample A4 / Example spliced isoform
AGTCTACTACATCCACGAATAAGGTACTGTAAGAAGACAAAGATTTACAAAAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTC
AAGCTCGCACATCAGATGACAGACATTACCTAGTTTGATCTTATGATCAGTTGAAGCTGCCACTGTTCAATGATGTAATTTGATTAATATCTTTGACAATGTAATGGAAGGACACCATACTTCTTGTTTCTAGTACTATCTAGTTAGTAGCTATACGTTAATGTTAAAATTCAAGTGATCCATACAGATCAATAGCTTAC
TGCCTGATAATATTTCAGTAATAGCTGTTACACTTGGTTATGTCTAGAAGGTACTAACTAAAATCCACTGAATATGGTGGACATCTGCTGCATGGAGGACAAGGTTCCTTTGCACACTCTTATATTTAGGGTCTATCTTCTGTTTTCTTTTTCAGAGTGTCATGATGCATGGAGATGAAAATAACATTCTTCTCAAAGGA
TTTCCTTCTCCATTTCTTGGCATGGCAATGATGATTTAAAGTCATCTAGTTTGGATTACCTGATAATGGCTTTGGAAGGTTAATGTTTAGGATATGAGATGACTTTTCCAATTTGATATGGCAAGAAGCGCCTTAATGAAGTTTCTATTTGTGGGATTTAGTTTGTGAATTTCTCAAAGTTCAGAAATGAAAAACTTGGA
TTTTGTATAAAGTTAGAATCATTTGAATCCTGCGAGGTTGGTTTCATGTGGAAATGGTGCAAGATTTTGATTGGATTTCATACAATATGGTAACTTTTAAACTAAATTTAACCCAATAAAGCTATTCTACTGAATATAGAAAACTATAAAATTGAAAGAAAATATGTGCAGCATGAAGGCTCAAAAACACTGATCTCATA
CTTATTTTTATTGTGATGTGAGAAAAGGAATAAATTTATGACATTTTGGTTTTAAGAAAATTTTTCTGTTCGAAGAAGAAACTAGACTTGAAAATTGAAAGGAAAAGGAAGCCATAGGCTTGACAGGACAAATTGAGGCATGAAGGCATCGAATTCTCATTTCTA


>TRINITY_DN110254_c0_g1_i14 from sample A4 / Example unspliced isoform:
AGTCTACTACATCCACGAATAAGGTACTGTAAAAAGACAAAGATTTACAAAgtgagtttacagattatctgtctttaatgataatatctgcattttttcaaatttgtcatgctcattttatgttatttgcctataaattttgaagactatttttatagcaaccatgctctggtacagttggagtaatgggaaagtccttt
ataaagacaattaagttctggcttatgatatctagcactcggaggatacactgactttctgtttattagtaggtgccgggagttctttaacatgggtgattaagagcagttgaaaatggagttctttaaaatatgtaattttggggtatctttagcaacatgctgcagggtgatatgccatttttcgtagtcatagatat
gttttcaatttggaatgtggaactatggtaatctaatcccctacaaagatgattattaggcccatgttcccttttgctggtccgtccaaccagtgttaggattaatgtagttagtgatgctactcaatggggcttgaactcatgttcactgtttggcaagtaccatggctaaccactaggttactacattattggtaata
gggatcgtgctattggtcttgttcacgtatattgttatgtctgtctaggtagccttgtattggtaaagtgtattttcaactattttgtgtttttgctctatgaaattgattttagctgaatgcattataaagcataaatttattccattgttgctattgtgctattggtcttgttcacatatattgttatgtctttatag
gtaactgtgtagtgataaaggattttgtttgtttttgttttatatcttttgtggttgggttccttttgtatggatttgttaatgcagttgtaaggcgtaaattgtattgttcatcttgtgagttttttaaggaaggtttcctttctcaattccggctgtcatttgtttttgcag
AAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAA
AGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCTCGCACATCAGATGACAGACATTACCTAGTTTGATCTTATGATCAGTTGAAGCTGCCACTGTTCAATGATGTA
ATTTGATTAATATCTTTGACAATGTAATGGAAGGACACCATACTTCTTGTTTCTAGTACTATCTAGTTAGTAGCTATACGTTAATGTTAAAATTCAAGTGATCCATACAGATCAATAGCTTACTGCCTGATAATATTTCAGTAATAGCTGTTACACTTGGTTATGTCTAGAAGGTACTAACTAAAATCCACTGAATATGG
TGGACATCTGCTGCATGGAGGACAAGGTTCCTTTGCACACTCTTATATTTAGGGTCTATCTTCTGTTTTCTTTTTCAGAGTGTCATGATGCATGGAGATGAAAATAACATTCTTCTCAAAGGATTTCCTTCTCCATTTCTTGGCATGGCAATGATGATTTAAAGTCATCTAGTTTGGATTACCTGATAATGGCTTTGGAA
GGTTAATGTTTAGGATATGAGATGACTTTTCCAATTTGATATGGCAAGAAGCGCCTTAATGAAGTTTCTATTTGTGGGATTTAGTTTGTGAATTTCTCAAAGTTCAGAAATGAAAAACTTGGATTTTGTATAAAGTTAGAATCATTTGAATCCTGCGAGGTTGGTTTCATGTGGAAATGGTGCAAGATTTTGATTGGATT
TCATACAATATGGTAACTTTTAAACTAAATTTAACCCAATAAAGCTATTCTACTGAATATAGAAAACTATAAAATTGAAAGAAAATATGTGCAGCATGAAGGCTCAAAAACACTGATCTCATACTTATTTTTATTGTGATGTGAGAAAAGGAATAAATTTATGACATTTTGGTTTTAAGAAAATTTTTCTGTTCGAAGAA
GAAACTAGACTTGAAAATTGAAAGGAAAAGGAAGCCATAGGCTTGACAGGACAAATTGAGGCATGAAGGCATCGAATTCTCATTTCTA




Intron 2 GTACCCACTT ... TGCTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A71.95905.51620
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A101.69783324



>TRINITY_DN133342_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
GAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGGTAATGTTCCCATTTTACCTTTTCTTGTGCCATATGACGAATGATAAATATTTCACAAACTTGGTTAACTGTT
CCAGTTAGCATGCATAGGCCCCAGCTGAATACTAGCTAAATATTGATGTCTTACTGCTATAGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGGTAACTAATATGACTTGGAATAGTGTCT
ATTTTTATAGGCAATTGAATGTATAAATTTGGGAGATGTATTACTGCTTCTTCTTTCTTAGATTTACACTAAACCTATAGGTGACATGTAATTGGTAGTGTGGTGGCAATTTCCATTTTCCTTTATGCACTGGAGGTTTTATCTCTCCTACAGGTTAATGTAAGTCATTAGTTCTTGGTTTTATCCTATTGGCAATTTCT
TTTGGTTTGATACTGCTTATATTGGTTTCCAGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCTATGCT
CAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATC
CACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCCCGC


>TRINITY_DN133342_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
GAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGA
TGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCT
ATGCTCAGTACAAGGTAGCTATTCTTCTTTTGTAGAGTTTTGTTGCCATTGATATAGCGACGCAGATTGCAGAATCAAATGCACAGAAAGTTAGATCCATGCCCCTGTGTGTAATTGTCAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTC
AAAGCATTAGAGGCCAGgtacccacttttttgaattcagacgtccaggatttgaattgtttgctagcatctccagcttttgctaccaagataaactgtgtcacacaaaatattggaataatgttggattaacctgcttgttttttactttagagtcacaactaggtttacatcagctaactgggtttatataattccaat
aaaatggcctgtatatatgagttttcacatactgttgccttgtctacttttgagatgtattttgtttttgttcctcaattttttatgccatcgctcttgcattttagagttagctgtataatttttcattcttgtcatttttatgtagaaaaagatcaagttcagcatgctatatgttgctttgcag
ATGAAATGTACAC
AAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGGTACTGTAAGAAGACAAAGATTTACAAAGTGAGTTTACAGATTATCTGTCTTTAATGATAATATCTGCATTTTTTCAAATTTGTCATGCTCATTTTATGTTATTTGCC
TATAAATTTTGAAGACTATTTTTATAGCAACCATGCTCTGGTACAGTTGGAGTAATGGGAAAGTCCTTTATAAAGACAATTAAGTTCTGGCTTATGATATCTAGCACTCGGAGGATACACTGACTTTCTGTTTATTAGTAGGTGCTGGGAGTTCTTTAACATGGGTGATTAAGAGCAGTTGAAAATGGAGTTCTTAAAAA
TATGTAATTTTGGGGTATCTTTAGCAACATGCTGCAGGGTGATATGCCATTTTTCGTAGTCATAGATATGTTTTCAATTTGGAATGTGGAACTATGGTAATCTAATCCCCTACAAAGATGATTATTAGGCCCAGGTTCGCTTTTGCTGGTCCGTCCAACCAGTGTTAGGATTAATGTAGTTAGTGATGCTACTCAATGGG
GCTTGAACTCATGTTCACTGTTTGGCAAGTACCATGGCTAACCACTAGGTTACTACATTATTGGTAATAGGGATCGTGCTATTGGTCTTGTTCACGTATATTGTTATGTCTGTCTAGGTAGCCTTGTATTTGTAAAGTGTATTTTCAACTAGTTTGTGTTTTTGCTCTATGATAAATTTATTCCATTGTTGCTATTGTGC
TATTGGTCTTGTTCACATATATTGTTATGTCTTTATAGGTAACTGTGTAGTGATAAAGGATTTTGTTTGTTTTTGTTTTATATCTTTTGTGGTTGGGTTCCTTTTGTATGGATTTGTTAATGCAGTTGTAAGGCGTAAATTGTATTGTTCATCTTGTGAGTTTTTTAAGGAAGGTTTCCTTTCTCAATTCCGGCTCTCAT
TTGTTTTTGCAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGACCCTTGCAATTAGGCGACAATCACAAATAAATGGCCAGAGCTCTAGCAGGCCAGGGTCCTGTTCTGATCAGAATTCAATTCA
TTGTGAGAAGGAAAATTCTTCTCCAATCACTGGGGCTGTCTAGACACCGGATTTCAAGATTAATGAATAAAGGTTCACACGTGGTTTCACATGCACCAGTTTTCAAGAATAGATTCATGGCATGCTTGATAGATTTGCAGCCATGTCCTTTTCCTCGTTGGAATTCTAGCGTTTTCAATCTTGAGTAGTAATGTCATTAA
CATGTTTCTCTCTTTTCTTAGCAAATGGAAGTATGCAGCTTTTGCATATGGTGCCAATTTAACTCATCTAAGGAAATTTCTGAACTAATTATTCCTTAGCTCTCTTTTGATTGAAGAGTCTAAAGTTTCTCTCTTCCTAAGGCAAAAATGTGCGTAATTTACACAACTTAAGGATATGTATGAAAACTGTTCTCTCTTCT
TTAATATATTATTGAGATTTTAATGATATTTATCTCTAC




Intron 3 GTAACAACAA ... TCTTTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A128.18232.495.172
A224.75171.665.120
A324.79150.855.718
A430.69117.854.127
A529.3852.723.919
A617.54336.683.764
A720.69466.9138.672
A820.02656.3185.8126
A918.86523.1143.572
A1019.4294.583.645



>TRINITY_DN122603_c1_g3_i2 from sample A2 / Example spliced isoform
TTGCTAGCCACCGCCTAATCGACACATTGGAAAACTAACATTTTATGTTTATACTATTATTGAAAAATCTTCAAATTTAGATTTTTAATATTTTTTAAAGTATAAAATAAATGTAGATATTTTTGCGCAATATATAGGAGAGATGAACAGAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGG
GAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTACTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTC
CGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAATAGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATA
TAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTCACAAACACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAAT
TGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTGTTCCTGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTTCCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTT
GAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTTCCTGGATAGACAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTCGAGGATAATATTGA
TGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTTCTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTA
ACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAATGTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAG
GCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCTCTCCGGTTTCAGTAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCG
AAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATGGTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTG
TTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACACATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGTGAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATT
ATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGC
TTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCTGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCTATGCTCAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATG
TCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAAT
GTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCTCGCACATCAGATGACAGACATTACCTAGTTTGATCTTATGATCAGTTGAAGCTGCCACTGTTCAATGATGTAATTTGATTAA
TATCTTTGACAATGTAATGGAAGGACACCATACTTCTTGTTTCTAGTACTATCTAGTTAGTAGCTATATGTTAATGTTAAAATTCAAGTGATCCATACAGATCAATAGCTTACTGCCTGATAATATCTCAGTAATAGCTGTTACACTTGGTTACGTTTAGAAGGTACTAACTAAAATCCACTGAATATGGTGGACATCTG
CTGCATGGAGGACAAGGTTCCTTTTCACACTCTTATATATAGGGTCTATCTTCTGTTTTCTTTTTCAGAGTGTCATGATGCATGGAGATGAAAATAACATTCTTCTCAAAGGATTTCCTTCGCCATTTCTTGGCATGGCAATGATGATTTAAAGTCATCTAGTTTGGATTACCTGATAATGGCTTTGGAAGGTTAATGTT
TAGGATATGAGATGACTTTTCCAATTTGATATGGCAAGAAGCGCCTTAATGAAGTTTCTATTTGTGGGATTTAGTTTGTGAATTTCTCAAAGTTCAGAAATGAAAAACTTGGATTTTGTATAAAGTTAGAATCATTTGAATCCCACGAGGTTGGTTTCATGTGGAAATGGTGCAAGATTTTGATTGGATTTCATACAATA
TGGTAACTTTTAAACTAAATTTAACCCAATAAAGCTATTCTACTGAATATAGAAAACTATAAAATTGAAAGAAAATATGTGCAGCATGAAGGCTCAAAAACACTGATCTCATACTTATTTTTATTGTGATGTGAGAAAAGGAATAAATTTATGACATTTTGGTTTTAAGAAAATTTTTCTGTTCGAAGAAGAAACTAGAC
TTGAAAATTGAAAGGAAAAGGAAGCCATAGGCTTGACAGGACAAATTGAGGCATGAAGGCATCGAATTCTCATTTCTATTTGTAAAATGCTTAAGTGCAAAGAAAATTAGGAAACAAGAAATAATAAAAAGAGACATCAAAGAGTTGTGGAATATCTCTAGTAATGAGTGCTGATATTTTGTGTGATGACATGGTCATAG
GGAGGAGAGTTATGCCCTCATTATAGTACGGGGTTTGAAAAATGTAAAATTGACTTCTGCCTAGAAAGTACAAGGGCTAGAAACATTCAAGAAGGATAACCCATAGCTAGGATGCAAAACATAATTGATGATTGTGATTCTAGAAAACATTGAACATGGATTTGAAGGGACTATATAAGGAAATGGAGGAAAGGGCAGAT
GTGGAGTAATGATGCTGAAGTGATGTAGGAAATTTTACAACTACAGAACTTATTACTTGACCACAAAAATAG


>TRINITY_DN122603_c1_g3_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TTGCTAGCCACCGCCTAATCGACACATTGGAAAACTAACATTTTATGTTTATACTATTATTGAAAAATCTTCAAATTTAGATTTTTAATATTTTTTAAAGTATAAAATAAATGTAGATATTTTTGCGCAATATATAGGAGAGATGAACAGAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGG
GAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTACTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTC
CGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAATAGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATA
TAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTCACAAACACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAAT
TGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTGTTCCTGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTTCCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTT
GAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTTCCTGGATAGACAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTCGAGGATAATATTGA
TGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTTCTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTA
ACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAATGTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAG
GCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCTCTCCGGTTTCAGTAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCG
AAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATGGTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTG
TTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACACATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGTGAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATT
ATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGC
TTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCTGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCTATGCTCAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATG
TCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAAT
GTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGgtaacaacaatctttttaataaaagaaaaatgatccacttttaatatgaatacatcatatgtctatttaaaaatggttaatgttgaaattgaaaaaggtagcttggaagatctcagaaataatctatcaag
tgtgttttggtatggttgaaaaataaggaatgttccttttcagccataaaaattgatacataaatttaaaatttaatgcgatcaaatttctttttcag
CCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCTCGCACATCAGATGACAGACATTACCTAGTTTGATCTTATGATCAGTTGAAGCT
GCCACTGTTCAATGATGTAATTTGATTAATATCTTTGACAATGTAATGGAAGGACACCATACTTCTTGTTTCTAGTACTATCTAGTTAGTAGCTATATGTTAATGTTAAAATTCAAGTGATCCATACAGATCAATAGCTTACTGCCTGATAATATCTCAGTAATAGCTGTTACACTTGGTTACGTTTAGAAGGTACTAAC
TAAAATCCACTGAATATGGTGGACATCTGCTGCATGGAGGACAAGGTTCCTTTTCACACTCTTATATATAGGGTCTATCTTCTGTTTTCTTTTTCAGAGTGTCATGATGCATGGAGATGAAAATAACATTCTTCTCAAAGGATTTCCTTCGCCATTTCTTGGCATGGCAATGATGATTTAAAGTCATCTAGTTTGGATTA
CCTGATAATGGCTTTGGAAGGTTAATGTTTAGGATATGAGATGACTTTTCCAATTTGATATGGCAAGAAGCGCCTTAATGAAGTTTCTATTTGTGGGATTTAGTTTGTGAATTTCTCAAAGTTCAGAAATGAAAAACTTGGATTTTGTATAAAGTTAGAATCATTTGAATCCCACGAGGTTGGTTTCATGTGGAAATGGT
GCAAGATTTTGATTGGATTTCATACAATATGGTAACTTTTAAACTAAATTTAACCCAATAAAGCTATTCTACTGAATATAGAAAACTATAAAATTGAAAGAAAATATGTGCAGCATGAAGGCTCAAAAACACTGATCTCATACTTATTTTTATTGTGATGTGAGAAAAGGAATAAATTTATGACATTTTGGTTTTAAGAA
AATTTTTCTGTTCGAAGAAGAAACTAGACTTGAAAATTGAAAGGAAAAGGAAGCCATAGGCTTGACAGGACAAATTGAGGCATGAAGGCATCGAATTCTCATTTCTATTTGTAAAATGCTTAAGTGCAAAGAAAATTAGGAAACAAGAAATAATAAAAAGAGACATCAAAGAGTTGTGGAATATCTCTAGTAATGAGTGC
TGATATTTTGTGTGATGACATGGTCATAGGGAGGAGAGTTATGCCCTCATTATAGTACGGGGTTTGAAAAATGTAAAATTGACTTCTGCCTAGAAAGTACAAGGGCTAGAAACATTCAAGAAGGATAACCCATAGCTAGGATGCAAAACATAATTGATGATTGTGATTCTAGAAAACATTGAACATGGATTTGAAGGGAC
TATATAAGGAAATGGAGGAAAGGGCAGATGTGGAGTAATGATGCTGAAGTGATGTAGGAAATTTTACAACTACAGAACTTATTACTTGACCACAAAAATAG




Intron 4 GTAATGTTCC ... ACTGCTATAG

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>TRINITY_DN133342_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform
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CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
GAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGA
TGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCT
ATGCTCAGTACAAGGTAGCTATTCTTCTTTTGTAGAGTTTTGTTGCCATTGATATAGCGACGCAGATTGCAGAATCAAATGCACAGAAAGTTAGATCCATGCCCCTGTGTGTAATTGTCAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTC
AAAGCATTAGAGGCCAGGTACCCACTTTTTTGAATTCAGACGTCCAGGATTTGAATTGTTTGCTAGCATCTCCAGCTTTTGCTACCAAGATAAACTGTGTCACACAAAATATTGGAATAATGTTGGATTAACCTGCTTGTTTTTTACTTTAGAGTCACAACTAGGTTTACATCAGCTAACTGGGTTTATATAATTCCAAT
AAAATGGCCTGTATATATGAGTTTTCACATACTGTTGCCTTGTCTACTTTTGAGATGTATTTTGTTTTTGTTCCTCAATTTTTTATGCCATCGCTCTTGCATTTTAGAGTTAGCTGTATAATTTTTCATTCTTGTCATTTTTATGTAGAAAAAGATCAAGTTCAGCATGCTATATGTTGCTTTGCAGATGAAATGTACAC
AAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGGTACTGTAAGAAGACAAAGATTTACAAAGTGAGTTTACAGATTATCTGTCTTTAATGATAATATCTGCATTTTTTCAAATTTGTCATGCTCATTTTATGTTATTTGCC
TATAAATTTTGAAGACTATTTTTATAGCAACCATGCTCTGGTACAGTTGGAGTAATGGGAAAGTCCTTTATAAAGACAATTAAGTTCTGGCTTATGATATCTAGCACTCGGAGGATACACTGACTTTCTGTTTATTAGTAGGTGCTGGGAGTTCTTTAACATGGGTGATTAAGAGCAGTTGAAAATGGAGTTCTTAAAAA
TATGTAATTTTGGGGTATCTTTAGCAACATGCTGCAGGGTGATATGCCATTTTTCGTAGTCATAGATATGTTTTCAATTTGGAATGTGGAACTATGGTAATCTAATCCCCTACAAAGATGATTATTAGGCCCAGGTTCGCTTTTGCTGGTCCGTCCAACCAGTGTTAGGATTAATGTAGTTAGTGATGCTACTCAATGGG
GCTTGAACTCATGTTCACTGTTTGGCAAGTACCATGGCTAACCACTAGGTTACTACATTATTGGTAATAGGGATCGTGCTATTGGTCTTGTTCACGTATATTGTTATGTCTGTCTAGGTAGCCTTGTATTTGTAAAGTGTATTTTCAACTAGTTTGTGTTTTTGCTCTATGATAAATTTATTCCATTGTTGCTATTGTGC
TATTGGTCTTGTTCACATATATTGTTATGTCTTTATAGGTAACTGTGTAGTGATAAAGGATTTTGTTTGTTTTTGTTTTATATCTTTTGTGGTTGGGTTCCTTTTGTATGGATTTGTTAATGCAGTTGTAAGGCGTAAATTGTATTGTTCATCTTGTGAGTTTTTTAAGGAAGGTTTCCTTTCTCAATTCCGGCTCTCAT
TTGTTTTTGCAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGACCCTTGCAATTAGGCGACAATCACAAATAAATGGCCAGAGCTCTAGCAGGCCAGGGTCCTGTTCTGATCAGAATTCAATTCA
TTGTGAGAAGGAAAATTCTTCTCCAATCACTGGGGCTGTCTAGACACCGGATTTCAAGATTAATGAATAAAGGTTCACACGTGGTTTCACATGCACCAGTTTTCAAGAATAGATTCATGGCATGCTTGATAGATTTGCAGCCATGTCCTTTTCCTCGTTGGAATTCTAGCGTTTTCAATCTTGAGTAGTAATGTCATTAA
CATGTTTCTCTCTTTTCTTAGCAAATGGAAGTATGCAGCTTTTGCATATGGTGCCAATTTAACTCATCTAAGGAAATTTCTGAACTAATTATTCCTTAGCTCTCTTTTGATTGAAGAGTCTAAAGTTTCTCTCTTCCTAAGGCAAAAATGTGCGTAATTTACACAACTTAAGGATATGTATGAAAACTGTTCTCTCTTCT
TTAATATATTATTGAGATTTTAATGATATTTATCTCTAC


>TRINITY_DN133342_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
GAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGgtaatgttcccattttaccttttcttgtgccatatgacgaatgataaatatttcacaaacttggttaactgtt
ccagttagcatgcataggccccagctgaatactagctaaatattgatgtcttactgctatag
AATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGGTAACTAATATGACTTGGAATAGTGTCT
ATTTTTATAGGCAATTGAATGTATAAATTTGGGAGATGTATTACTGCTTCTTCTTTCTTAGATTTACACTAAACCTATAGGTGACATGTAATTGGTAGTGTGGTGGCAATTTCCATTTTCCTTTATGCACTGGAGGTTTTATCTCTCCTACAGGTTAATGTAAGTCATTAGTTCTTGGTTTTATCCTATTGGCAATTTCT
TTTGGTTTGATACTGCTTATATTGGTTTCCAGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCTATGCT
CAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATC
CACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCCCGC




Intron 5 GTATGTCGTG ... GCCATGGCAG

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>TRINITY_DN48852_c0_g2_i4 from sample A7 / Example spliced isoform
CGCGGGCATTGTTGACTTTTGCAGAAGCCGATGCCTATTTTTAAGGGGGAGCTTGCTTTCGCCCCAAGCAAAGAAAAGCAAAAAGACTTTAAAAAATTATAAAGAGACTTTAATAACTCAAACAGTTTGGTGGGGTCAGGCGGTTAGCTTGACGGCCAAGTTCAATTGCTAGCCACCGCCTAATCGACACATTGGAAAAC
TAACATTTTATGTTTATACTATTATTGAAAAATCTTCAAATTTAGATTTTTAATATTTTTTAAAGTATAAAATAAATGTAGATATTTTTGCGCAATATATAGGAGAGATGAACAGAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAA
GGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTACTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGAT
ACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAATAGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAA
GGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAACACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTGAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGA
AATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTGTTCCTGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTTCCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGA
TGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGACAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGA
TCGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTTCTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCAC
AAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAATGTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATT
AGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCTCTCCGGTTTCAGTAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGAC
TGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATGGTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGT
GCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACACATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGTGAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCC
GGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCAT
CTGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCTATGCTCAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAATGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCA
GCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTGCTCGTGTCCAAGAAACTACA
TATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGACCCTTGCAATTAGGCGACAATCACAAATAAATGGTCAGAGCTCTAGTAGGCCAGGGTCCTGTTCTGATCAGAATTCAATTCATTGTGAGAAGGAAAATTCTTCTCCAATCACTGGGGCAGCAAGAATCGAGCTTCATCATTTCAAGAGTTAAATACTGGTTATCA
AAAAACACCTGAGAAACAATGGTGGTGCGTCAAATTCAAAAGTGGCATGGGTCGTGTAAGGCAGCAAGAATTGAGCTTCATCATTCAAGAGTTAAACCCTGGTCATCAAGGAAACCTGAGAAACAATGGAGGTGCATCAAATTCAAAAGTGACAAGGGTCGAGTAAGACTGGATTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGG
GCACCATGGAAGACACTGGCTTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTGCAGAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACATGAATTGGAGACAAAGGATAGAAGCAAATGGGCATCATGGAACGTCA
CACAGGATTGTTGCAGCCAAAGGATATTTTATGCAAATCTGAAGCAAATGGGCACCATGGGACGTGATAAAGGATTGCAGGGAAAGGATATTTTATGCAAATCTTCCGAGATTCTAAACATTTCAGGGAGAGCAATCTTGAATATTTATAATCCTCAAAATGTTAACTGGCAAATCTTTTGTATCTTTTCCGGTTTCAAT
ATATTTTATAAAATAAGTCTGTGAACTTCTAAATAAAATTAAATTTATTATAAACTATACAAGGGCATTTATTTTCAGCTTTTTTATTATGAATGTAATATTTTTTTAAAAAAGTCCAATGATGAAAATCCAAGAGAAACTGGGCAGACTCGGA


>TRINITY_DN48852_c0_g2_i14 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TCCATTTTGACATCCACGCGTAAAGTTCCAATTTGTTAAAGAATGTTGATGTAGAAGCTTTGCGTAGACCACCAAAACATGCTTTCATAAATACCATACTCTGTACTGTATGGTAGATGTGTTGGTAAGATGTTAAATTGGGTATTGGGGAGTTTTAATTCTAGTTGGCTTGGTGACATGATCGTGCATTTTTGGCAGTA
CGGTTAACGTATGTGAGTAACATCAATTTGCGGTTTTGTCAACTACAACCTTCTGGGAGTTGCTGGCTTTGTTGATCGCACCAGAATCTAGTACATTGAAATTAGTTGGTTTGAACTCACCTGAATGGGCTTTTTTGGTTCCATCTCGAGCAAAATCAGTTGATGGATGCATCCTTCAGTGTAGATTGTTATACGTACAC
GCAAGATGTCCTTGTATATTGGACAGAAGCAGTAGCCAAGCATCTAGTGGCAGCAAGAATCGAGCTTCATCATTTCAAGAGTTAAATACTGGTTATCAAAAAACACCTGAGAAACAATGGTGGTGCGTCAAATTCAAAAGTGGCATGGGTCGTGTAAGgtatgtcgtggtgctatcacaatgagtctggccatattatac
tcgccacaatgaaaagctgactatgagatgtaagaaatgagttacagatggaattagaaaagtgtggttttaattgggaccacaaccaggagagtaaaataaagttttgggcctattgtctctcttcaaattagttcttttgaaccgatctgaatgggcttttttggttccatctcgagcaaaattagttgattgatgca
tcctatagtgtagattgttattagtaacacacaagctgtaattgtatgttggacagaagcagcaacgaagcttctagtggtaaacaagtggcatccatttgcatgcggctctgcaattgtccgattctcagcttggattaaacttcatctaaatgctttttttctcctttgtttgattaagtattttgctttggctgtgc
aattgttcataaaatttacaaaccatgctttccattttatgccatggcag
GCAGCAAGAATTGAGCTTCATCATTCAAGAGTTAAACCCTGGTCATCAAGGAAACCTGAGAAACAATGGAGGTGCATCAAATTCAAAAGTGACAAGGGTCGAGTAAGGTATGTCGTGATGCTATCACAATGATTCTGGCCATATTATATT
CGCAACAATGAAAAGCTGACTATTAGAAGTAAGAAACGGGTCTTACAGATTGAATTAGAGAAGTGTGGTTTTAATTGGGATCACAACCAGGAGATTAAAGTTTTGGGTTAACTAGTCTCTCTTCAAATGGTCTAATGGAGCATATTGCTTTGATAATATTTTTAATTCAATCCGGTGGCAAATTCAAGCATAAGGGCTTT
GTTGCGATTTTTAATTCAAACCGATGGCAAGATGCCATGGTTGGTGACATTGCTGACGAGGGATATTTAATGCAATTTTTTTAAAGATTCGGAAAGATTAAGTAACCGTGTTGAATATTTAATGGCAAACTGGATTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGGACACTGGATTGCAGACCAA
GGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTGCAGAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACATGAATTGGAGACAAAGGATAGAAGCAAATGGGCATCATGGAACGTCACACAGGATTGTTGCAGCCAAAGGATATTTTATGCAAATCTGAAGCAAATGGGCACCATGGGACGTGATAAAGGATTGC
AGGGAAAGGATATTTTATGCAAATCTTC




Intron 6 GTATGTAAGG ... TAACTTGCAG

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>TRINITY_DN122437_c1_g2_i4 from sample A3 / Example spliced isoform
GAGAGATGAACAGAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCT
ACTCCACACTTACTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCA
GGGCTGAATAATAGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAG
GATCTTACAAACACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGC
AAGAGTGCGGTTCCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCAT
TTCCTGGATAGACAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATG
TGCCTCCCAGTTCTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCATACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGC
CACAAAGGCAATGTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGATGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCA
AAATCGTTTTCTCTCCGGTTTCAGTAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAA
TCATACTTCATGGTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTC
CATCCTAGTTGTGAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAG
TTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCTGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACAT
TGGAACACCTCTATGCTCAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAATGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGAAAAAGATCAAGTTCAGCATGCTATATGTTGCTTTGCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGT
CCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGACCCTTGCAATTAGGCGACAATCACAAAT
AAATGGCCAGAGCTCTAGCAGGCCAGGGTCCTGTTCTGATCAGAATTCAATTCATTGTGAGAAGGAAAATTCTTCTCCAATCACTGGGGCTGTCTAGACACCGGATTTCAAGATTAATGAATAAAGGTTCACACGTGGTTTCACATGCACCAGTTTTCAAGAATAGATTCATGGCATGCTTGATAGATTTGCAGCCATGT
CGTTTTCCTCGTTGGAATTCTAACGTTTTCAATCTTGAGTAGTAATGTCATTAACATGTTTCTCTCTTTTCTTAGCAAATGGAAGTATGCAGCTTTTGCATATGGTGCCAATTTAACTCATCTAAGGAAATTTCTGAACTAATTATTCCTTAGCTCTCTTTTGATTGAAGAGTCTAAAGTTTCTCTCTTCCTAAGGCAAA
AATGTGCGTAATTTACACAACTTAAGGATATGTATGAAAACTGTTCTCTCTTCTTTAATATATTATTGAGATTTTAATGATATTTATCTCTACACTGCAAAATAGAGTAATGCCGATCAGTTTTTGATTTTTAGGTCTGCTTGAAGAATATTAGAACTGCTGTTATTTTATTATGTTAATAGCTGTTTTTTATTGTTTTG
GGAAGAGGCATATTATTTGACCTTGATCAGTGGTGGAAAACTGTACATGATTTCTTTGTTTGGAAATTTAGCTTTTGTCATAGTTCCAGTCACTATCGCGATTCATTACACTGATGCAAATGTAGTTTGCATGCAATATTTTACATATATTTTCTGCTGTTAAAACGAGAGAATTTGTATATTGCTTTTGTAAATAATGT
TTCAAACAAATGTATATTAGACTAAGACTCCACACTGTCGACAATGGGATAGTATTTGTTATTCGCATGTAAATTTGTCACTCGTGAATTTTGCCCGTTTTAGATGTTGATGGGCATATAAAAAGAAAATGGCACATGGATTATTAAAACACTTTAATTTGTAAAATGATGCACATTACGAAGTACATTGTAATAACACT
TTAATCTATCACTAATCAAATTTCTAGAAATAGTAGCGGAAATGGACTAATTTCTAAAACATGTACTGTTGTTGAAGTGATTTTTTCTTATTCTGTAAATTGCACTTTACTCTTGAATGATAGAATGGTAAGGCAATATATGGACAATATTTTGGTTGTTCAAAATTGTTTTACTGTATTTTGAGAACGTTGATTTCGTA
TGGGTTCTGTGATATCCATTTTGACACCCACGCGTAAAGTTCCAATTTGTTAAAGAATGTTGATGTAGAAGCTTTGCGTAGACCACCAAAACATGCTTTCATAAATACCATACTCTGTACTGTATGGTAGATGTGTTGGTAAGATGTTAAATTGGGTATTGGGGAGTTTTAATTCTAGTTGGCTTGGTGACATGATCGTG
CATTTTTGGCAGTACGGTTAACGTATGTGAGTAACATCAATTTGCGGTTTTGTCAACTACAACCTTCTGGGAGTTGCTGGCTTTGTTGATCGCACCAGAATCTAGTACATTGAAATTGTTGGTTTGAACTCACCTGAATGGGCTTTTTTGGTTCCATCTCGAGCAAAATCAGTTGATGGATGCATCCTTCAGTGTAGATT
GTTATACGTACACGCAAGATGTCCTTGTATATTGGACAGAAGCAGTAGCGAAGCTTCTAGTGGTAGACAAGTGGCATCCATTTGCATTCTGCTCTGCATTTATATGTCCGATGCTCAGCTTGGACCAAACTTCATCAAAATGCTTATTTCCTCCTTTGTTTGGTCAAGTATTTTGCTTTTTCTGTGCTATTGTTTATCAA
ATTTACAGACACTGCTTTCC


>TRINITY_DN122437_c1_g2_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:
GAGAGATGAACAGAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCT
ACTCCACACTTACTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCA
GGGCTGAATAATAGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAG
GATCTTACAAACACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGC
AAGAGTGCGGTTCCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCAT
TTCCTGGATAGACAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATG
TGCCTCCCAGTTCTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCATACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGC
CACAAAGGCAATGTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGATGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCA
AAATCGTTTTCTCTCCGGTTTCAGTAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAA
TCATACTTCATGGTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTC
CATCCTAGTTGTGAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAG
TTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCTGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACAT
TGGAACACCTCTATGCTCAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAATGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGAT
AATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGACCCTTGCAATTAGGCGACAATCACAAATAAATGGCCAGAGCTCTAGCAGGCCAGGGTCCTGTTCTGA
TCAGAATTCAATTCATTGTGAGAAGGAAAATTCTTCTCCAATCACTGGGgtacgtaaggactagcactattttctttgtcttcctttcttttctggaagagatttgaacatctttaacagtttatttctttgtttcctgggaaagtattttcgatctatgttaatgtagtgtggtttgtagtagcaatgatgaagtttgt
tgggaatgcaaaggttctgtaactattgacgttggggaagaaaaacattaatccaatgttgttagtggtgtgttttgtttgagatttttataatgaaagtttagttttttacaatattatggcttgctgataagggatgatctgttgtgaattgtcataacttgcag
GCTGTCTAGACACCGGATTTCAAGATTAATGAA
TAAAGGTTCACACGTGGTTTCACATGCACCAGTTTTCAAGAATAGATTCATGGCATGCTTGATAGATTTGCAGCCATGTCGTTTTCCTCGTTGGAATTCTAACGTTTTCAATCTTGAGTAGTAATGTCATTAACATGTTTCTCTCTTTTCTTAGCAAATGGAAGTATGCAGCTTTTGCATATGGTGCCAATTTAACTCAT
CTAAGGAAATTTCTGAACTAATTATTCCTTAGCTCTCTTTTGATTGAAGAGTCTAAAGTTTCTCTCTTCCTAAGGCAAAAATGTGCGTAATTTACACAACTTAAGGATATGTATGAAAACTGTTCTCTCTTCTTTAATATATTATTGAGATTTTAATGATATTTATCTCTACACTGCAAAATAGAGTAATGCCGATCAGT
TTTTGATTTTTAGGTCTGCTTGAAGAATATTAGAACTGCTGTTATTTTATTATGTTAATAGCTGTTTTTTATTGTTTTGGGAAGAGGCATATTATTTGACCTTGATCAGTGGTGGAAAACTGTACATGATTTCTTTGTTTGGAAATTTAGCTTTTGTCATAGTTCCAGTCACTATCGCGATTCATTACACTGATGCAAAT
GTAGTTTGCATGCAATATTTTACATATATTTTCTGCTGTTAAAACGAGAGAATTTGTATATTGCTTTTGTAAATAATGTTTCAAACAAATGTATATTAGACTAAGACTCCACACTGTCGACAATGGGATAGTATTTGTTATTCGCATGTAAATTTGTCACTCGTGAATTTTGCCCGTTTTAGATGTTGATGGGCATATAA
AAAGAAAATGGCACATGGATTATTAAAACACTTTAATTTGTAAAATGATGCACATTACGAAGTACATTGTAATAACACTTTAATCTATCACTAATCAAATTTCTAGAAATAGTAGCGGAAATGGACTAATTTCTAAAACATGTACTGTTGTTGAAGTGATTTTTTCTTATTCTGTAAATTGCACTTTACTCTTGAATGAT
AGAATGGTAAGGCAATATATGGACAATATTTTGGTTGTTCAAAATTGTTTTACTGTATTTTGAGAACGTTGATTTCGTATGGGTTCTGTGATATCCATTTTGACACCCACGCGTAAAGTTCCAATTTGTTAAAGAATGTTGATGTAGAAGCTTTGCGTAGACCACCAAAACATGCTTTCATAAATACCATACTCTGTACT
GTATGGTAGATGTGTTGGTAAGATGTTAAATTGGGTATTGGGGAGTTTTAATTCTAGTTGGCTTGGTGACATGATCGTGCATTTTTGGCAGTACGGTTAACGTATGTGAGTAACATCAATTTGCGGTTTTGTCAACTACAACCTTCTGGGAGTTGCTGGCTTTGTTGATCGCACCAGAATCTAGTACATTGAAATTGTTG
GTTTGAACTCACCTGAATGGGCTTTTTTGGTTCCATCTCGAGCAAAATCAGTTGATGGATGCATCCTTCAGTGTAGATTGTTATACGTACACGCAAGATGTCCTTGTATATTGGACAGAAGCAGTAGCGAAGCTTCTAGTGGTAGACAAGTGGCATCCATTTGCATTCTGCTCTGCATTTATATGTCCGATGCTCAGCTT
GGACCAAACTTCATCAAAATGCTTATTTCCTCCTTTGTTTGGTCAAGTATTTTGCTTTTTCTGTGCTATTGTTTATCAAATTTACAGACACTGCTTTCC




Intron 7 GTAGACAAGT ... GCCATGGCAG

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>TRINITY_DN48852_c0_g2_i14 from sample A7 / Example spliced isoform
TCCATTTTGACATCCACGCGTAAAGTTCCAATTTGTTAAAGAATGTTGATGTAGAAGCTTTGCGTAGACCACCAAAACATGCTTTCATAAATACCATACTCTGTACTGTATGGTAGATGTGTTGGTAAGATGTTAAATTGGGTATTGGGGAGTTTTAATTCTAGTTGGCTTGGTGACATGATCGTGCATTTTTGGCAGTA
CGGTTAACGTATGTGAGTAACATCAATTTGCGGTTTTGTCAACTACAACCTTCTGGGAGTTGCTGGCTTTGTTGATCGCACCAGAATCTAGTACATTGAAATTAGTTGGTTTGAACTCACCTGAATGGGCTTTTTTGGTTCCATCTCGAGCAAAATCAGTTGATGGATGCATCCTTCAGTGTAGATTGTTATACGTACAC
GCAAGATGTCCTTGTATATTGGACAGAAGCAGTAGCCAAGCATCTAGTGGCAGCAAGAATCGAGCTTCATCATTTCAAGAGTTAAATACTGGTTATCAAAAAACACCTGAGAAACAATGGTGGTGCGTCAAATTCAAAAGTGGCATGGGTCGTGTAAGGTATGTCGTGGTGCTATCACAATGAGTCTGGCCATATTATAC
TCGCCACAATGAAAAGCTGACTATGAGATGTAAGAAATGAGTTACAGATGGAATTAGAAAAGTGTGGTTTTAATTGGGACCACAACCAGGAGAGTAAAATAAAGTTTTGGGCCTATTGTCTCTCTTCAAATTAGTTCTTTTGAACCGATCTGAATGGGCTTTTTTGGTTCCATCTCGAGCAAAATTAGTTGATTGATGCA
TCCTATAGTGTAGATTGTTATTAGTAACACACAAGCTGTAATTGTATGTTGGACAGAAGCAGCAACGAAGCTTCTAGTGGTAAACAAGTGGCATCCATTTGCATGCGGCTCTGCAATTGTCCGATTCTCAGCTTGGATTAAACTTCATCTAAATGCTTTTTTTCTCCTTTGTTTGATTAAGTATTTTGCTTTGGCTGTGC
AATTGTTCATAAAATTTACAAACCATGCTTTCCATTTTATGCCATGGCAGGCAGCAAGAATTGAGCTTCATCATTCAAGAGTTAAACCCTGGTCATCAAGGAAACCTGAGAAACAATGGAGGTGCATCAAATTCAAAAGTGACAAGGGTCGAGTAAGGTATGTCGTGATGCTATCACAATGATTCTGGCCATATTATATT
CGCAACAATGAAAAGCTGACTATTAGAAGTAAGAAACGGGTCTTACAGATTGAATTAGAGAAGTGTGGTTTTAATTGGGATCACAACCAGGAGATTAAAGTTTTGGGTTAACTAGTCTCTCTTCAAATGGTCTAATGGAGCATATTGCTTTGATAATATTTTTAATTCAATCCGGTGGCAAATTCAAGCATAAGGGCTTT
GTTGCGATTTTTAATTCAAACCGATGGCAAGATGCCATGGTTGGTGACATTGCTGACGAGGGATATTTAATGCAATTTTTTTAAAGATTCGGAAAGATTAAGTAACCGTGTTGAATATTTAATGGCAAACTGGATTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGGACACTGGATTGCAGACCAA
GGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTGCAGAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACATGAATTGGAGACAAAGGATAGAAGCAAATGGGCATCATGGAACGTCACACAGGATTGTTGCAGCCAAAGGATATTTTATGCAAATCTGAAGCAAATGGGCACCATGGGACGTGATAAAGGATTGC
AGGGAAAGGATATTTTATGCAAATCTTC


>TRINITY_DN48852_c0_g2_i15 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TCCATTTTGACATCCACGCGTAAAGTTCCAATTTGTTAAAGAATGTTGATGTAGAAGCTTTGCGTAGACCACCAAAACATGCTTTCATAAATACCATACTCTGTACTGTATGGTAGATGTGTTGGTAAGATGTTAAATTGGGTATTGGGGAGTTTTAATTCTAGTTGGCTTGGTGACATGATCGTGCATTTTTGGCAGTA
CGGTTAACGTATGTGAGTAACATCAATTTGCGGTTTTGTCAACTACAACCTTCTGGGAGTTGCTGGCTTTGTTGATCGCACCAGAATCTAGTACATTGAAATTAGTTGGTTTGAACTCACCTGAATGGGCTTTTTTGGTTCCATCTCGAGCAAAATCAGTTGATGGATGCATCCTTCAGTGTAGATTGTTATACGTACAC
GCAAGATGTCCTTGTATATTGGACAGAAGCAGTAGCCAAGCATCTAGTGgtagacaagtggcatccatttgcattctgctctgcatttatatgtccgatgctcagcttggaccaaacttcatcaaaatgcttatttcctcctttgtttggtcaagtattttgctttttctgtgctattgtttatcaaatttacagacact
gctttccattctatgccatggcag
GCAGCAAGAATCGAGCTTCATCATTTCAAGAGTTAAATACTGGTTATCAAAAAACACCTGAGAAACAATGGTGGTGCGTCAAATTCAAAAGTGGCATGGGTCGTGTAAGGTATGTCGTGGTGCTATCACAATGAGTCTGGCCATATTATACTCGCCACAATGAAAAGCTGACTATG
AGATGTAAGAAATGAGTTACAGATGGAATTAGAAAAGTGTGGTTTTAATTGGGACCACAACCAGGAGAGTAAAATAAAGTTTTGGGCCTACTTGTCTCTCTTCAAATTAGTTCTTTTGAACCGATCTGAATGGGCTTTTTTGGTTCCATCTCGAGCAAAATTAGTTGATTGATGCATCCTATAGTGTAGATTGTTATTAG
TAACACACAAGCTGTAATTGTATGTTGGACAGAAGCAGCAGCGAAGCTTCTAGTGGTAAACAAGTGGCATCCATTTGCATGCGGCTCTGCAATTATATGCAGCAAGAATTGAGCTTCATCATTCAAGAGTTAAACCCTGGTCATCAAGGAACACCTGAGAAACAATGGAGGTGCATCAAATTCAAAAGTGACAAGGGTCG
AGTAAGGTATGTCGTGATGCTATCACAATGATTCTGGCCATATTATATTCGCAACAATGAAAAGCTGACAGAAACGGGTCTTACAGATTGAATTAGAGAAGTGTGGTTTTAATTGGGATCACAACCAGGAGAGTAAAGTTTTGGGTTAACTCTAGTCTCTCTTCAAATGGTCTAATGGAGCATATTGCTTTGATAATATT
TTTAATTCAATCCGGTGGCAAATTCAAGCATAAGGGCTTTGTTGCGATTTTTAATTCAAACCGATGGCAAGATGCCATGGTTGGTGACACGGGATTGCTGACGAGGGATATTTAATGCAATTTTTTTAAAGATTCGGAAAGATTAAGTAACCGTGTTGAATAATTAATGGCAAATAGGAGCAAATGGGCACCATGGAAGA
CACTGGATTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTCTTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTGCAGAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACATGAATTGGAG
ACAAAGGATAGAAGCAAATGGGCATCATGGAACGTCACACAGGATTGTTGCAGCCAAAGGATATTTTATGCAAATCTGAAGCAAATGGGCACCATGGGACGTGATAAAGGATTGCAGGGAAAGGATATTTTATGCAAATCTTCTGAGATTCCAAACATTTCAGGGAGAGCAATCTTGAATATTTATAATCCTCAAAATGT
TAACTGGCAAATCTTTTGTATCTTTTCCGGTTTCAATATATTTTATAAAATAAGTCTGTGAACTTCTAAATAAAATTAAATTTATTATAAACTATACAAGGGCATTTATTTTCAGCTTTTTTATTATGAATGTAATATTTTTTTAAAAAAGTCCAATGATGAAAATCCAAGAGAAACTGGGCAGACTCGGA




Intron 8 GTAACTAATA ... TGGTTTCCAG

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>TRINITY_DN133342_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
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TGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCT
ATGCTCAGTACAAGGTAGCTATTCTTCTTTTGTAGAGTTTTGTTGCCATTGATATAGCGACGCAGATTGCAGAATCAAATGCACAGAAAGTTAGATCCATGCCCCTGTGTGTAATTGTCAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTC
AAAGCATTAGAGGCCAGGTACCCACTTTTTTGAATTCAGACGTCCAGGATTTGAATTGTTTGCTAGCATCTCCAGCTTTTGCTACCAAGATAAACTGTGTCACACAAAATATTGGAATAATGTTGGATTAACCTGCTTGTTTTTTACTTTAGAGTCACAACTAGGTTTACATCAGCTAACTGGGTTTATATAATTCCAAT
AAAATGGCCTGTATATATGAGTTTTCACATACTGTTGCCTTGTCTACTTTTGAGATGTATTTTGTTTTTGTTCCTCAATTTTTTATGCCATCGCTCTTGCATTTTAGAGTTAGCTGTATAATTTTTCATTCTTGTCATTTTTATGTAGAAAAAGATCAAGTTCAGCATGCTATATGTTGCTTTGCAGATGAAATGTACAC
AAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGGTACTGTAAGAAGACAAAGATTTACAAAGTGAGTTTACAGATTATCTGTCTTTAATGATAATATCTGCATTTTTTCAAATTTGTCATGCTCATTTTATGTTATTTGCC
TATAAATTTTGAAGACTATTTTTATAGCAACCATGCTCTGGTACAGTTGGAGTAATGGGAAAGTCCTTTATAAAGACAATTAAGTTCTGGCTTATGATATCTAGCACTCGGAGGATACACTGACTTTCTGTTTATTAGTAGGTGCTGGGAGTTCTTTAACATGGGTGATTAAGAGCAGTTGAAAATGGAGTTCTTAAAAA
TATGTAATTTTGGGGTATCTTTAGCAACATGCTGCAGGGTGATATGCCATTTTTCGTAGTCATAGATATGTTTTCAATTTGGAATGTGGAACTATGGTAATCTAATCCCCTACAAAGATGATTATTAGGCCCAGGTTCGCTTTTGCTGGTCCGTCCAACCAGTGTTAGGATTAATGTAGTTAGTGATGCTACTCAATGGG
GCTTGAACTCATGTTCACTGTTTGGCAAGTACCATGGCTAACCACTAGGTTACTACATTATTGGTAATAGGGATCGTGCTATTGGTCTTGTTCACGTATATTGTTATGTCTGTCTAGGTAGCCTTGTATTTGTAAAGTGTATTTTCAACTAGTTTGTGTTTTTGCTCTATGATAAATTTATTCCATTGTTGCTATTGTGC
TATTGGTCTTGTTCACATATATTGTTATGTCTTTATAGGTAACTGTGTAGTGATAAAGGATTTTGTTTGTTTTTGTTTTATATCTTTTGTGGTTGGGTTCCTTTTGTATGGATTTGTTAATGCAGTTGTAAGGCGTAAATTGTATTGTTCATCTTGTGAGTTTTTTAAGGAAGGTTTCCTTTCTCAATTCCGGCTCTCAT
TTGTTTTTGCAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGACCCTTGCAATTAGGCGACAATCACAAATAAATGGCCAGAGCTCTAGCAGGCCAGGGTCCTGTTCTGATCAGAATTCAATTCA
TTGTGAGAAGGAAAATTCTTCTCCAATCACTGGGGCTGTCTAGACACCGGATTTCAAGATTAATGAATAAAGGTTCACACGTGGTTTCACATGCACCAGTTTTCAAGAATAGATTCATGGCATGCTTGATAGATTTGCAGCCATGTCCTTTTCCTCGTTGGAATTCTAGCGTTTTCAATCTTGAGTAGTAATGTCATTAA
CATGTTTCTCTCTTTTCTTAGCAAATGGAAGTATGCAGCTTTTGCATATGGTGCCAATTTAACTCATCTAAGGAAATTTCTGAACTAATTATTCCTTAGCTCTCTTTTGATTGAAGAGTCTAAAGTTTCTCTCTTCCTAAGGCAAAAATGTGCGTAATTTACACAACTTAAGGATATGTATGAAAACTGTTCTCTCTTCT
TTAATATATTATTGAGATTTTAATGATATTTATCTCTAC


>TRINITY_DN133342_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
GAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGGTAATGTTCCCATTTTACCTTTTCTTGTGCCATATGACGAATGATAAATATTTCACAAACTTGGTTAACTGTT
CCAGTTAGCATGCATAGGCCCCAGCTGAATACTAGCTAAATATTGATGTCTTACTGCTATAGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGgtaactaatatgacttggaatagtgtct
atttttataggcaattgaatgtataaatttgggagatgtattactgcttcttctttcttagatttacactaaacctataggtgacatgtaattggtagtgtggtggcaatttccattttcctttatgcactggaggttttatctctcctacaggttaatgtaagtcattagttcttggttttatcctattggcaatttct
tttggtttgatactgcttatattggtttccag
CACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCTATGCT
CAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATC
CACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCCCGC




Intron 9 GTAGCTACTC ... TAATTGTCAG

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>TRINITY_DN133342_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
GAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGGTAATGTTCCCATTTTACCTTTTCTTGTGCCATATGACGAATGATAAATATTTCACAAACTTGGTTAACTGTT
CCAGTTAGCATGCATAGGCCCCAGCTGAATACTAGCTAAATATTGATGTCTTACTGCTATAGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGGTAACTAATATGACTTGGAATAGTGTCT
ATTTTTATAGGCAATTGAATGTATAAATTTGGGAGATGTATTACTGCTTCTTCTTTCTTAGATTTACACTAAACCTATAGGTGACATGTAATTGGTAGTGTGGTGGCAATTTCCATTTTCCTTTATGCACTGGAGGTTTTATCTCTCCTACAGGTTAATGTAAGTCATTAGTTCTTGGTTTTATCCTATTGGCAATTTCT
TTTGGTTTGATACTGCTTATATTGGTTTCCAGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCTATGCT
CAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATC
CACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCCCGC


>TRINITY_DN133342_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
GAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGA
TGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCT
ATGCTCAGTACAAGgtagctattcttcttttgtagagttttgttgccattgatatagcgacgcagattgcagaatcaaatgcacagaaagttagatccatgcccctgtgtgtaattgtcagGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTC
AAAGCATTAGAGGCCAGGTACCCACTTTTTTGAATTCAGACGTCCAGGATTTGAATTGTTTGCTAGCATCTCCAGCTTTTGCTACCAAGATAAACTGTGTCACACAAAATATTGGAATAATGTTGGATTAACCTGCTTGTTTTTTACTTTAGAGTCACAACTAGGTTTACATCAGCTAACTGGGTTTATATAATTCCAAT
AAAATGGCCTGTATATATGAGTTTTCACATACTGTTGCCTTGTCTACTTTTGAGATGTATTTTGTTTTTGTTCCTCAATTTTTTATGCCATCGCTCTTGCATTTTAGAGTTAGCTGTATAATTTTTCATTCTTGTCATTTTTATGTAGAAAAAGATCAAGTTCAGCATGCTATATGTTGCTTTGCAGATGAAATGTACAC
AAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGGTACTGTAAGAAGACAAAGATTTACAAAGTGAGTTTACAGATTATCTGTCTTTAATGATAATATCTGCATTTTTTCAAATTTGTCATGCTCATTTTATGTTATTTGCC
TATAAATTTTGAAGACTATTTTTATAGCAACCATGCTCTGGTACAGTTGGAGTAATGGGAAAGTCCTTTATAAAGACAATTAAGTTCTGGCTTATGATATCTAGCACTCGGAGGATACACTGACTTTCTGTTTATTAGTAGGTGCTGGGAGTTCTTTAACATGGGTGATTAAGAGCAGTTGAAAATGGAGTTCTTAAAAA
TATGTAATTTTGGGGTATCTTTAGCAACATGCTGCAGGGTGATATGCCATTTTTCGTAGTCATAGATATGTTTTCAATTTGGAATGTGGAACTATGGTAATCTAATCCCCTACAAAGATGATTATTAGGCCCAGGTTCGCTTTTGCTGGTCCGTCCAACCAGTGTTAGGATTAATGTAGTTAGTGATGCTACTCAATGGG
GCTTGAACTCATGTTCACTGTTTGGCAAGTACCATGGCTAACCACTAGGTTACTACATTATTGGTAATAGGGATCGTGCTATTGGTCTTGTTCACGTATATTGTTATGTCTGTCTAGGTAGCCTTGTATTTGTAAAGTGTATTTTCAACTAGTTTGTGTTTTTGCTCTATGATAAATTTATTCCATTGTTGCTATTGTGC
TATTGGTCTTGTTCACATATATTGTTATGTCTTTATAGGTAACTGTGTAGTGATAAAGGATTTTGTTTGTTTTTGTTTTATATCTTTTGTGGTTGGGTTCCTTTTGTATGGATTTGTTAATGCAGTTGTAAGGCGTAAATTGTATTGTTCATCTTGTGAGTTTTTTAAGGAAGGTTTCCTTTCTCAATTCCGGCTCTCAT
TTGTTTTTGCAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGACCCTTGCAATTAGGCGACAATCACAAATAAATGGCCAGAGCTCTAGCAGGCCAGGGTCCTGTTCTGATCAGAATTCAATTCA
TTGTGAGAAGGAAAATTCTTCTCCAATCACTGGGGCTGTCTAGACACCGGATTTCAAGATTAATGAATAAAGGTTCACACGTGGTTTCACATGCACCAGTTTTCAAGAATAGATTCATGGCATGCTTGATAGATTTGCAGCCATGTCCTTTTCCTCGTTGGAATTCTAGCGTTTTCAATCTTGAGTAGTAATGTCATTAA
CATGTTTCTCTCTTTTCTTAGCAAATGGAAGTATGCAGCTTTTGCATATGGTGCCAATTTAACTCATCTAAGGAAATTTCTGAACTAATTATTCCTTAGCTCTCTTTTGATTGAAGAGTCTAAAGTTTCTCTCTTCCTAAGGCAAAAATGTGCGTAATTTACACAACTTAAGGATATGTATGAAAACTGTTCTCTCTTCT
TTAATATATTATTGAGATTTTAATGATATTTATCTCTAC




Intron 10 GTACCCACTT ... TGCTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A120.2341815106
A228.1639815156
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A623.875395169
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A825.03113512379
A922.5594119274
A1026.757837286



>TRINITY_DN110254_c0_g1_i11 from sample A4 / Example spliced isoform
GCGGGAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTACTGTGAT
TTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAATAGCTGGG
GGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGTGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAACACAGTGA
TATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTTCCTGAGA
GGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGACAAGAAT
GGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATCGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTTCTGACCC
CTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCATACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAATGTGCCGG
CTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGATGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCTCTCCGGT
TTCAGTAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACGTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATGGTTTTAG
CTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGTGAAAAGT
TCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGATGTTGAA
GTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCTATGCTCA
GTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAATGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCA
CGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCTCGCACATCAGATGACAGACATTACCTAGTTTGATCTTA
TGATCAGTTGAAGCTGCCACTGTTCAATGATGTAATTTGATTAATATCTTTGACAATGTAATGGAAGGACACCATACTTCTTGTTTCTAGTACTATCTAGTTAGTAGCTATACGTTAATGTTAAAATTCAAGTGATCCATACAGATCAATAGCTTACTGCCTGATAATATTTCAGTAATAGCTGTTACACTTGGTTATGT
CTAGAAGGTACTAACTAAAATCCACTGAATATGGTGGACATCTGCTGCATGGAGGACAAGGTTCCTTTGCACACTCTTATATTTAGGGTCTATCTTCTGTTTTCTTTTTCAGAGTGTCATGATGCATGGAGATGAAAATAACATTCTTCTCAAAGGATTTCCTTCTCCATTTCTTGGCATGGCAATGATGATTTAAAGTC
ATCTAGTTTGGATTACCTGATAATGGCTTTGGAAGGTTAATGTTTAGGATATGAGATGACTTTTCCAATTTGATATGGCAAGAAGCGCCTTAATGAAGTTTCTATTTGTGGGATTTAGTTTGTGAATTTCTCAAAGTTCAGAAATGAAAAACTTGGATTTTGTATAAAGTTAGAATCATTTGAATCCTGCGAGGTTGGTT
TCATGTGGAAATGGTGCAAGATTTTGATTGGATTTCATACAATATGGTAACTTTTAAACTAAATTTAACCCAATAAAGCTATTCTACTGAATATAGAAAACTATAAAATTGAAAGAAAATATGTGCAGCATGAAGGCTCAAAAACACTGATCTCATACTTATTTTTATTGTGATGTGAGAAAAGGAATAAATTTATGACA
TTTTGGTTTTAAGAAAATTTTTCTGTTCGAAGAAGAAACTAGACTTGAAAATTGAAAGGAAAAGGAAGCCATAGGCTTGACAGGACAAATTGAGGCATGAAGGCATCGAATTCTCATTTCTATTTGTAAAATGCTTAAGTGCAAAGAAAATTAGGAAACAAGAAATAATAAAAAGAGACATCAAAGAGTTGTGGAATATC
TCTAGTAATGAGTGCTGATATTTTGTGTGATGACATGGTCATAGGGAGGAGAGTTATGCCCTCATTATAGTACGGGGTTTGAAAAATGTAAAATTGACTTCTGCCTAGAAAGTACAAGGGCTAGAAACATTCAAGAAGGATAACCCATAGCTAGGATGCAAAACATAATTGATGATTGTGATTCTAGAAAACATTGAACA
TGGATTTGAAGGGACTATATAAGGAAATGGAGGAAAGGGCAGATGTGGAGTAATGATGCTGAAGTGATGTAGGAAATTTTACAACTACAGAACTTATTACTTGACCACAAAAATAGACTCTTTAAAAA


>TRINITY_DN110254_c0_g1_i10 from sample A4 / Example unspliced isoform:
GCTATTCTTCTTTTGTAGAGTTTTGTTGCCATTGATATAGCGACGCAGATTGCAGAATCAAATGCACAGAAAGTTAGATCCATGCCCCTGTGTGTAATTGTCAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAATGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAG


gtacccacttttttgaattcagacgtccaggatttgaattgtttgctagcatctccagcttttgcttaccaagataaactgtgtcacacaaaatattggaataatgttggattaacctgcttgttttttactttagagtcacaactaggtttacatcagctaactgggtttatataattccaataaaatggcctgtatat
atgagttttcacatactgttgccttgtctacttttgagatgtattttgtttttgttcctcaattttttatgccatcgctcttgcattttagagttagctgtataatttttcattcttgtcatttttatgtagaaaaagatcaagttcagcatgctatatgttgctttgcag
ATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGT
GGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGGTAACAACAATCTTTTTAA
TAAAAGAAAAATGATCCACTTTTAATATGAATACATCATATGTCTATTTAAAAATGGTTAATGTTGAAATTGAAAAAGGTAGCTTGGAAGATCTCAGAAATAATCTATCAAGTGTGTTTTGGTATGGTTGAAAAATAAGGAATGTTCCTTTTCAGCCATAAAAATTGATACATAAATTTAAAATTTAATGCGATCAAATT
TCTTTTTCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCTCGCACATCAGATGACAGACATTACCTAGTTTGATCTTATGATCAGTTGAAGCTGCCACTGTTCAATGATGTAATTTGATTAATATCTTTGACAATGTAATGGAAGGACACCATACTTCTTGTTTCTAGTACTATCTAGTTA
GTAGCTATACGTTAATGTTAAAATTCAAGTGATCCATACAGATCAATAGCTTACTGCCTGATAATATTTCAGTAATAGCTGTTACACTTGGTTATGTCTAGAAGGTACTAACTAAAATCCACTGAATATGGTGGACATCTGCTGCATGGAGGACAAGGTTCCTTTGCACACTCTTATATTTAGGGTCTATCTTCTGTTTT
CTTTTTCAGAGTGTCATGATGCATGGAGATGAAAATAACATTCTTCTCAAAGGATTTCCTTCTCCATTTCTTGGCATGGCAATGATGATTTAAAGTCATCTAGTTTGGATTACCTGATAATGGCTTTGGAAGGTTAATGTTTAGGATATGAGATGACTTTTCCAATTTGATATGGCAAGAAGCGCCTTAATGAAGTTTCT
ATTTGTGGGATTTAGTTTGTGAATTTCTCAAAGTTCAGAAATGAAAAACTTGGATTTTGTATAAAGTTAGAATCATTTGAATCCTGCGAGGTTGGTTTCATGTGGAAATGGTGCAAGATTTTGATTGGATTTCATACAATATGGTAACTTTTAAACTAAATTTAACCCAATAAAGCTATTCTACTGAATATAGAAAACTA
TAAAATTGAAAGAAAATATGTGCAGCATGAAGGCTCAAAAACACTGATCTCATACTTATTTTTATTGTGATGTGAGAAAAGGAATAAATTTATGACATTTTGGTTTTAAGAAAATTTTTCTGTTCGAAGAAGAAACTAGACTTGAAAATTGAAAGGAAAAGGAAGCCATAGGCTTGACAGGACAAATTGAGGCATGAAGG
CATCGAATTCTCATTTCTA




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>TRINITY_DN133342_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
GAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGGTAATGTTCCCATTTTACCTTTTCTTGTGCCATATGACGAATGATAAATATTTCACAAACTTGGTTAACTGTT
CCAGTTAGCATGCATAGGCCCCAGCTGAATACTAGCTAAATATTGATGTCTTACTGCTATAGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGATGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGGTAACTAATATGACTTGGAATAGTGTCT
ATTTTTATAGGCAATTGAATGTATAAATTTGGGAGATGTATTACTGCTTCTTCTTTCTTAGATTTACACTAAACCTATAGGTGACATGTAATTGGTAGTGTGGTGGCAATTTCCATTTTCCTTTATGCACTGGAGGTTTTATCTCTCCTACAGGTTAATGTAAGTCATTAGTTCTTGGTTTTATCCTATTGGCAATTTCT
TTTGGTTTGATACTGCTTATATTGGTTTCCAGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCTATGCT
CAGTACAAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTCAAAGCATTAGAGGCCAGATGAAATGTACACAAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATC
CACGAATAAGAAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGCCATGAAATTCTGGCATCAGGATGGTTTTTAGGGATTTGCTTTCAAGCCCGC


>TRINITY_DN133342_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
GTGCCGGCTGCTTTACCCTCCAAATCATCGAAAGATTCAAAAGATGAGGAGGCTACTGGCAGTGCTGTCAATAGTTCTCAAGGATTAGAATCCAAACAGTGTTCAAGTTTAGAAGCTTCTGAATTTGAATCGTTGGGTGACAGACTGATCAAATTGGAAGATGGAAATGAAGAGTATGCGGCCGTGCAAAATCGTTTTCT
CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
GAAAAGTTCGATTCTGGGGTTGATGATCTCACAAATCCGAAGTGTTACATTATTTGGAGCACTCACATGAACATGCATATTCTTCCGGAGTACATTGTGAGCTTTAAGGTTCCACATCAAATGCATGAATGCTGGGATGAAATGAAAGCAAAGCAAGGCATCTGTGGTGTTCCCAAAAGTTTCAGCAGTTCTCTGGAGGA
TGTTGAAGTTGCTCGCCAGGGTTCTATCTATGAGACGCACCTTTCTTCAGCTTCAGCTGAGGGAAGAAAATGCAAGACGCAAGCATCGGCAAAAGGATCAACACGAATTCCCAGTACTGCTAACATGTCATTCCCAAAGTTGTTCTCAGTCATAAGAAAGTCCATGCCTACATCTTATATGAATACATTGGAACACCTCT
ATGCTCAGTACAAGGTAGCTATTCTTCTTTTGTAGAGTTTTGTTGCCATTGATATAGCGACGCAGATTGCAGAATCAAATGCACAGAAAGTTAGATCCATGCCCCTGTGTGTAATTGTCAGGTAGGAAAAATTGGCAAAGACATCATCGTAAGGAATGTCAGAACGATTGTTGGAGATAAGTTGCTGATTGCAGCTATTC
AAAGCATTAGAGGCCAGGTACCCACTTTTTTGAATTCAGACGTCCAGGATTTGAATTGTTTGCTAGCATCTCCAGCTTTTGCTACCAAGATAAACTGTGTCACACAAAATATTGGAATAATGTTGGATTAACCTGCTTGTTTTTTACTTTAGAGTCACAACTAGGTTTACATCAGCTAACTGGGTTTATATAATTCCAAT
AAAATGGCCTGTATATATGAGTTTTCACATACTGTTGCCTTGTCTACTTTTGAGATGTATTTTGTTTTTGTTCCTCAATTTTTTATGCCATCGCTCTTGCATTTTAGAGTTAGCTGTATAATTTTTCATTCTTGTCATTTTTATGTAGAAAAAGATCAAGTTCAGCATGCTATATGTTGCTTTGCAGATGAAATGTACAC
AAATGTTAAACAGAGTGGAGCATCGTCCACATTCTTTCCTGGGTTCTGACAGGCTAAATCTAGATAATGAGTCTACTACATCCACGAATAAGgtactgtaagaagacaaagatttacaaagtgagtttacagattatctgtctttaatgataatatctgcattttttcaaatttgtcatgctcattttatgttatttgcc
tataaattttgaagactatttttatagcaaccatgctctggtacagttggagtaatgggaaagtcctttataaagacaattaagttctggcttatgatatctagcactcggaggatacactgactttctgtttattagtaggtgctgggagttctttaacatgggtgattaagagcagttgaaaatggagttcttaaaaa
tatgtaattttggggtatctttagcaacatgctgcagggtgatatgccatttttcgtagtcatagatatgttttcaatttggaatgtggaactatggtaatctaatcccctacaaagatgattattaggcccaggttcgcttttgctggtccgtccaaccagtgttaggattaatgtagttagtgatgctactcaatggg
gcttgaactcatgttcactgtttggcaagtaccatggctaaccactaggttactacattattggtaatagggatcgtgctattggtcttgttcacgtatattgttatgtctgtctaggtagccttgtatttgtaaagtgtattttcaactagtttgtgtttttgctctatgataaatttattccattgttgctattgtgc
tattggtcttgttcacatatattgttatgtctttataggtaactgtgtagtgataaaggattttgtttgtttttgttttatatcttttgtggttgggttccttttgtatggatttgttaatgcagttgtaaggcgtaaattgtattgttcatcttgtgagttttttaaggaaggtttcctttctcaattccggctctcat
ttgtttttgcag
AAAGATTTCATGGAGGCGGTTAACAAAGTAGATAATGTTCCCCATTCTTTTCTCGTGTCCAAGAAACTACATATGGACAATAAATGCAATTCATTGATAAATCAGACCCTTGCAATTAGGCGACAATCACAAATAAATGGCCAGAGCTCTAGCAGGCCAGGGTCCTGTTCTGATCAGAATTCAATTCA
TTGTGAGAAGGAAAATTCTTCTCCAATCACTGGGGCTGTCTAGACACCGGATTTCAAGATTAATGAATAAAGGTTCACACGTGGTTTCACATGCACCAGTTTTCAAGAATAGATTCATGGCATGCTTGATAGATTTGCAGCCATGTCCTTTTCCTCGTTGGAATTCTAGCGTTTTCAATCTTGAGTAGTAATGTCATTAA
CATGTTTCTCTCTTTTCTTAGCAAATGGAAGTATGCAGCTTTTGCATATGGTGCCAATTTAACTCATCTAAGGAAATTTCTGAACTAATTATTCCTTAGCTCTCTTTTGATTGAAGAGTCTAAAGTTTCTCTCTTCCTAAGGCAAAAATGTGCGTAATTTACACAACTTAAGGATATGTATGAAAACTGTTCTCTCTTCT
TTAATATATTATTGAGATTTTAATGATATTTATCTCTAC




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>TRINITY_DN48852_c0_g2_i6 from sample A7 / Example spliced isoform
TCCATTTTGACATCCACGCGTAAAGTTCCAATTTGTTAAAGAATGTTGATGTAGAAGCTTTGCGTAGACCACCAAAACATGCTTTCATAAATACCATACTCTGTACTGTATGGTAGATGTGTTGGTAAGATGTTAAATTGGGTATTGGGGAGTTTTAATTCTAGTTGGCTTGGTGACATGATCGTGCATTTTTGGCAGTA
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GCAAGATGTCCTTGTATATTGGACAGAAGCAGTAGCCAAGCATCTAGTGGCAGCAAGAATCGAGCTTCATCATTTCAAGAGTTAAATACTGGTTATCAAAAAACACCTGAGAAACAATGGTGGTGCGTCAAATTCAAAAGTGGCATGGGTCGTGTAAGCAGCAGCGAAGCTTCTAGTGGTAAACAAGTGGCATCCATTTG
CATGCGGCTCTGCAATTATATGCAGCAAGAATTGAGCTTCATCATTCAAGAGTTAAACCCTGGTCATCAAGGAACACCTGAGAAACAATGGAGGTGCATCAAATTCAAAAGTGACAAGGGTCGAGTAAGGAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGAC
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>TRINITY_DN48852_c0_g2_i15 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TCCATTTTGACATCCACGCGTAAAGTTCCAATTTGTTAAAGAATGTTGATGTAGAAGCTTTGCGTAGACCACCAAAACATGCTTTCATAAATACCATACTCTGTACTGTATGGTAGATGTGTTGGTAAGATGTTAAATTGGGTATTGGGGAGTTTTAATTCTAGTTGGCTTGGTGACATGATCGTGCATTTTTGGCAGTA
CGGTTAACGTATGTGAGTAACATCAATTTGCGGTTTTGTCAACTACAACCTTCTGGGAGTTGCTGGCTTTGTTGATCGCACCAGAATCTAGTACATTGAAATTAGTTGGTTTGAACTCACCTGAATGGGCTTTTTTGGTTCCATCTCGAGCAAAATCAGTTGATGGATGCATCCTTCAGTGTAGATTGTTATACGTACAC
GCAAGATGTCCTTGTATATTGGACAGAAGCAGTAGCCAAGCATCTAGTGGTAGACAAGTGGCATCCATTTGCATTCTGCTCTGCATTTATATGTCCGATGCTCAGCTTGGACCAAACTTCATCAAAATGCTTATTTCCTCCTTTGTTTGGTCAAGTATTTTGCTTTTTCTGTGCTATTGTTTATCAAATTTACAGACACT
GCTTTCCATTCTATGCCATGGCAGGCAGCAAGAATCGAGCTTCATCATTTCAAGAGTTAAATACTGGTTATCAAAAAACACCTGAGAAACAATGGTGGTGCGTCAAATTCAAAAGTGGCATGGGTCGTGTAAGgtatgtcgtggtgctatcacaatgagtctggccatattatactcgccacaatgaaaagctgactatg
agatgtaagaaatgagttacagatggaattagaaaagtgtggttttaattgggaccacaaccaggagagtaaaataaagttttgggcctacttgtctctcttcaaattagttcttttgaaccgatctgaatgggcttttttggttccatctcgagcaaaattagttgattgatgcatcctatagtgtagattgttattag
taacacacaagctgtaattgtatgttggacagaag
CAGCAGCGAAGCTTCTAGTGGTAAACAAGTGGCATCCATTTGCATGCGGCTCTGCAATTATATGCAGCAAGAATTGAGCTTCATCATTCAAGAGTTAAACCCTGGTCATCAAGGAACACCTGAGAAACAATGGAGGTGCATCAAATTCAAAAGTGACAAGGGTCG
AGTAAGGTATGTCGTGATGCTATCACAATGATTCTGGCCATATTATATTCGCAACAATGAAAAGCTGACAGAAACGGGTCTTACAGATTGAATTAGAGAAGTGTGGTTTTAATTGGGATCACAACCAGGAGAGTAAAGTTTTGGGTTAACTCTAGTCTCTCTTCAAATGGTCTAATGGAGCATATTGCTTTGATAATATT
TTTAATTCAATCCGGTGGCAAATTCAAGCATAAGGGCTTTGTTGCGATTTTTAATTCAAACCGATGGCAAGATGCCATGGTTGGTGACACGGGATTGCTGACGAGGGATATTTAATGCAATTTTTTTAAAGATTCGGAAAGATTAAGTAACCGTGTTGAATAATTAATGGCAAATAGGAGCAAATGGGCACCATGGAAGA
CACTGGATTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTCTTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTGCAGACCAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACACTGGATTGCAGAAGGATAGAAGCAAATGGGCACCATGGAAGACATGAATTGGAG
ACAAAGGATAGAAGCAAATGGGCATCATGGAACGTCACACAGGATTGTTGCAGCCAAAGGATATTTTATGCAAATCTGAAGCAAATGGGCACCATGGGACGTGATAAAGGATTGCAGGGAAAGGATATTTTATGCAAATCTTCTGAGATTCCAAACATTTCAGGGAGAGCAATCTTGAATATTTATAATCCTCAAAATGT
TAACTGGCAAATCTTTTGTATCTTTTCCGGTTTCAATATATTTTATAAAATAAGTCTGTGAACTTCTAAATAAAATTAAATTTATTATAAACTATACAAGGGCATTTATTTTCAGCTTTTTTATTATGAATGTAATATTTTTTTAAAAAAGTCCAATGATGAAAATCCAAGAGAAACTGGGCAGACTCGGA




Intron 13 GTACTGTAAA ... GTTTTTGCAG

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>TRINITY_DN133342_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
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CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
ACAGTGATATATATCGTAGTGGCTTAACATCGGGTAGAGGGGCTTTAAAATTGGCTAAGGGGACGAGTGTTGTTCCTAACTCTAGAAATGGAACACGTCAAGCTGTCGGGAATGTGAAATGCTGTGATGGGTGTCGAATGGAGGGTTATTCCCGCAAGGCAATTTTGCACAATTATGGGAATTTTCGCAAGAGTGCGGTT
CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
CAAGAATGGCTCTTGTTTTTTCCCTAAAGGCTTCTTTGAGGATAATATTGATGATGTCGACTTCGCCCCCAAAGTCGAGGTTGAGATTGAGATTCGAATAAGTGCAACTGAGGGTTCGCAGGCTGAGAAACGTCGAGTTCAGGGTAACTTGGAGCCCTTGTCCGAGGCTTCGGACACTAAAAGACATGTGCCTTCCAGTT
CTGACCCCTCATTCGCTGTTGCGAAAACTGAGAAATACGAACTTGCTAGTAACTTAGAGTCCTGGAAGGTTACCAAATCTGATCACAAGAGTAAAGTACTCTGTGATGACATTAAAGCAGACAAATTGACCAGGAAAGCATCAGTTGAGGTCCCTGCACCTACAAATGAATTGGAGAGAGGTTCGAGCCACAAAGGCAAT
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CTCCGGTTTCAGCAAAAGTGCAGTTGCAACCACTGTTACTGGTATTTATCGAAATACCCATGCAAGTGCGATGGGCCAGGTTCGACTGCACGCTTTTCGGAGGCAGGTTGAGATAACTAGGAGGTCCCGTGGTAATGCAAATGTCAGGACTGCCTGGCATGGCACTTCCAGCAAATGTGCTGCAGCAATCATACTTCATG
GTTTTAGCTTGAGCAAAACACATGATAATGGCCCATCATATGGTGTTGGTGTTTATCTTGCTCCAGAAGGTCGCTCCCATCTCAGTGCTGCATTTTCGGATATCGACAAAAATGGTGAACAACATATGGTGCTGTGTCGGGTTATTCTGGGAAATGTGGAGAGAGTCCCTCTTGGCTCTCATCAGTTCCATCCTAGTTGT
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ATTTTTATAGGCAATTGAATGTATAAATTTGGGAGATGTATTACTGCTTCTTCTTTCTTAGATTTACACTAAACCTATAGGTGACATGTAATTGGTAGTGTGGTGGCAATTTCCATTTTCCTTTATGCACTGGAGGTTTTATCTCTCCTACAGGTTAATGTAAGTCATTAGTTCTTGGTTTTATCCTATTGGCAATTTCT
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>TRINITY_DN133342_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAGAAGCAATACAGCGAGGGTTTGTACGAGAAATAAACTTGCATTGTGTGGGAAGCAGGTGTTTCTGGAGGCAAGTAAGGAAGGAAGGAGGAAGAGCTTTGCAGGAGCAAATTCTGTGGGGGCTTTGTTTTCTTCGGAACAAAAAAATTTAGCCTTTGGTCCTGCAGGTTCTGATTCTTGACCTTGCTACTCCACACTTA
CTGTGATTTTTTGTTCTCTTTTTCGTTTGGGTTTGGTGTTGTGTATATTTCCGGCGGGGACTTGTTAGGGTTTATGAAAACCAGATACTAGATTTGGCTCTTTAATTTTGTGGCTTCATCTGGTTAGGGGGTTAAAAAATTTGTGGGAAGTTAAATTTGGGGTTGTAAGTTGTTTTCGCGGGGTTGCAGGGCTGAATAAT
AGCTGGGGGCCAGCTTGTTCAGTCCTGAAATGGTGTCGCGAACCTAAAATATAGTGCATCGTGATAGCGATGTTGTAAATAAATAAGGAACCTGTGGGGTAAATTCATGATAGAAATGGAGAACAAAGGGGAGTATATCTCCAAGCTTGCCAGAAGCATTGTGCATAGAGTTCAAATGAAAAGAAAAGGATCTTACAAAC
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CCTGAGAGGCTTATGTATTATTGGAATGGCGGGTGGAATGATTTTTCCGTTGAAGCTTCAGAGTCGCTTCGGAAGGCATTCTCAGATGGCATGCCCAGTATAGAAGTGGTAATAGATGAATCGCGTTACCTCGTCGATTTTTTGCGCATGCTGCAAATAGATTTGAGGGTGGGTTGTCAAAGATCCATTGCCTGGATAGA
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