NA ----> NA


Intron 1 GTAATGAACT ... GACATTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A180.6638167150
A277.443011690
A385.1320125104
A475.653312085
A582.1894241
A674.07143842
A782.1638172178
A881.9134166142
A98426132141
A1080.1137150148



>TRINITY_DN42678_c0_g1_i5 from sample A6 / Example spliced isoform
GCGTGTCGCTTACGTTATTTGGAGGGTCTCCCCAACACTTCTCCATTGTTGATCCCCATTGAAGTTGCACTGCATCACCGTTGGGCCGAACTCAAAAGTTGTATGGCGGTCACCATTTATACAAACTAGTTGCAGGTTTCCTTTACAAACTGCAAGCACATGCCCAACCCAAGGGCGAACGAGAAAGGTGACCGACATTT
CATTCTTGCCCACTTTCCATGAGAAATTTTAAACCAGAACGCCCATTGCTCTGCCTCTCAAATTCAAGAAAGTACAAATTTGAATTCCCGCACAGCCATTTTATCATCAACACCACATTTTCAGTCGGTGGGTGCTATTGTTCTCTACAACCCTACAGCTCAAACCCCACCGAAGTCATATCTCAGTGCCTCGCTATCTC
ACTCCCATCCTCAAAAAGAATATCCAAATGGGTTTATCGTATGTTATCTTCACTGCCATGGTCATCATTGCCTCTTGTTATCCTGTCATGGTCCAGAGCGAACCAGAGACATTCATCAGCCTTAAAGAACTGAGAGAGCTAATAAAGCAGAGGATACCAGACGAAGAGACTGCACCACAGTATCAGGATAATTACGAGGA
GCCCTTGCAGCTTTTGATGCCCAGTAAAGGACATGATAAGCTGGAATTGAATGAAATTGTACTTGAAACATTGGCTAGTATTGAGGACCCAGTTGCCTTTGTGGCTGTTGTTGGACCATACCATTGTGGCAAATCATTTCTGTTAAATGTTCTACTCAATTCCACACATGGGTTCACAGTGGGTTCAAGACCCGAGCCTG
AAACAAGAGGTATTTGGATCAGGATTGTGCCCAAAAGCAAACTGAAAGCTGTTGATGGATCTCAGGTAATTCTATTGGACACTGAAGGATTCTTTGGGGAGGGAGCCACTCGCTTGTATGATGCTAAGGTGTTTGCTATTGCTACTCTCCTAAGCTCCCACCTGGTTTACAACACCTTGAGGATGCTTGGTGATGCACAG
TCTGTGAGCTCCTTAGCTGTTTTGTCAAAGCAGGCCCAAATCTTCAATCTCCAAAATTGGCTTCACTCTGCTGAATTTGAAGAAGAGCATTCTCCTTCAATAGATATGGACACTTCTCTGCTGTTAAAGACACTTGACTTCCCACCACTGACATGGGTTGTCCAGGGATTTGACATTGATCTCGAGCCTTCAGAAGCACC
TATGCATTATCTTCAACGCTATATAGATGCGCAAGAACATGCTGGAGACCGAACATTGGAGACCTTATTTTCACATGGAATTTCGTGTTATACTCTTCGAACTCCAGCAGATCTAAATAATCTACGTGAAAGATATGGGAGCAAAGCATTGGCAGCAGAAGAAGAATTGTTTTATAGTCTCCATCCTAAGTACCTCATGG
ATGTTGAAATTCTGCGTAGAGCAGTTTTTGGGGATTTAATGGCAAAAGGTGGTCAGAAGCTCACAGGAAAGAGAGTGGCAAAATTGTTGCCCCTTCTAGTCCACTATGTTAATGAAGATTTCCCTTTAAATGCAGATCGAAAGCTAAGGGATGTCCTTGTTGATGTCATAATTGATGGTGCATTTAGTGGAGGTGTGCAG
TATTTCGAAAAAGAGATGCAATCAATTTTCTCAAGGCCTGAAAATTTAAACTTATCAGGAAGAGATCTGAGCTCTGATTCAGAGAATCTGGAGGCTCTTTCAGCTTCGGCTATGTCAGCACTTACAAGCCAGGAATTCAATGAGATAATAACAGCTGCAGAAAAGAAAGCAATTGATTACTGCCAGCGCCGATGTGTTGG
AGTGCCTTCAGTCCTTATATCTTCAGCATGTGAAGTTAGTCTGGGTACAAAGATAGATAGGATGAAACCATTTTACAGGGAAAAAAATGATCGTCAGGTTAGGGAAGTCCTTGTGCGTCTTGGAGAAACTCTTCGTGACAAAGCTGAGAAGATTCTGTTTAATATCAGTTTGCCCATTCCTGAAACTGAAATTCAAGATA
ACTGCAGTAAAGTGATAAATTCTGCTTTGAAAAGGTATGAGGGCCTTGTGGGTCCTCATCAAGGCAGTCAGATGTATAATGAAGCATGTAAGCAGATGCATGAGCAAATTTTGGTTAAATGTATTCAAGTTACAGACATCAATAGAGGAAAGATTTCATCCATACTAAACAGTGGAAAAGCTGCATACCAGATTGCATAT
AATGAGGCCTTTTCTGCTGCTATTGGAGATTACATGATTGAGGCCCAGAAAAATATAGCTGCAGAGAATTCAGTCAGCTATAGTGAGGGACAGAGAAGGCCTATGCCACCTAGAAAAGTGGCTGAGGTTCATGCTGCGAGCTTGAAGGTTGCTCAGAAAGCATATGATGAAGTGGTCAAAGGAGGGGGGTTAAGTTGGAT
TGGGTCTGTGAAGTTCAGGGAGACTGTGTCAAAAATCAGTCCATTTCCAGATAATGATGAAATCATTTCAGGAAAGGCAGATGTAATTTCTAAGAAGTTGTTGGAAGAGTATATTATGGTGACAAAAGAATATGGTATTCCAGAGGTGGAAGAAAAGAAGAAAGAATTAACACAATACATTGAAGATGCACGTGCACACT
TGATAAAAAAAAATACTGCCTTGATGGCAGCATATTGTTATGACCCACTCATGGATGCATATCGAGAGCTTCATATGGAAGATTGTGAGAGAACTATCCATAATATGTTTGTTTCATGGTCGATCTGGTCCCTGAAGTGTCTATGGCCTGGCCCACGCTACACATTTGGATTCAAACATGCTGCATATATTACAGCTCGG
AAGCATTTGGACAAAGCTCAGGCATCAGCAAGGCATGAATCTAAATTACCATCTGCAAATCATGACATGGCAAAAGGGGTCATACTGAGTCCGGCAACACAGAACAAAGTCATTCAAGCTTGGATTGATCATGACTTGGCCCATCATGCAAATGTAGTGCTTGTAAATTTTACCTGTATCATCACTCTCATTGTTGTAAT
TGTCACAAGCCTGTATATTAGAAAAAGGCGTCTATCTGATACGTCAAGTCAAAATACTAGTACTAATAAGTGGCAGCCAGATGGGAAACATTTCAACTGGAAGCAGACAGGTTATGAGGGATATTCAGGGGCATCAAGACTACATAACCGTGATCGTTTCTAATGCACTTGTCTTTTCAGAGGTCTGTATATGTCTGCTG
TTTATTCCGAGTTCCAGAGTGCAAATTACAGATTCTAGTATGCAATCTTCATCGTCATTGGGCTCGTTCTTGTTTTCTTTATATCGAAGATTGCAAAATAAAATCAAATCCTCGTCAACAAAGGTTCTTTGAGTTCTTGTGAAATGGAATGAAATTGTAGTAATGTCTACCCATGACCAGAGAAAGGTCAATGGGACTCA
AGGTTATGGTTGGCACAAATTGCAAATTATTGGGGTGAGTTTTTCATTGAAGAGCACCTAACCCTGTTTGTTCGCATGGCAATGAAATACTTTGTCATTTGGAATCAAAGTCACAAATAGCTTAATAGGTGCATAAAAGATGAGGGGTTTGGGATCCACTTATTGTTTGCAAACTTTGAGGGGTCCATACAGCTGATGCT
TTTTTCGACTCATTGAGCTGCTAATTCTGATAATCAAGGCATCATTAGCAATAAGATCATTAGCATAAGCGTATTCGCTTATACGTGTCTGAAAGAGGGCTAAGTTTTGTTTCAAAGGAAGACGCTGACTAAGGCTTCTCATTGCCTTTATTTTATTTGATTACTTGAATTACAGATAATGAAGTTACCGTGCCCAACCA
AGACATTGAAACTTTTGAAGGCATATGGCCAAATCGGACTTTTGCATACATCGACATATTTGATGGTTTATGTTACTGTTGGTTTTTGGATTGCATACACCGATAATGCTTATTTATAGAATTGCAGGCATAAGAGAGAATCTTAGAAGGCAATGCTTCTTTAAAGTTTGTTCTCATTTTCTTCAAGTTCAATTTGGATG
TTAGCAATAATTCATTTATTCCTGGGTCAAATTGTTGTAATTCTGATGGTGTTGGTGAAAATTGTTTGTGAAATAACATATTATATTAAAACAGTGATTTTGGT


>TRINITY_DN42678_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:
GCGTGTCGCTTACGTTATTTGGAGGGTCTCCCCAACACTTCTCCATTGTTGATCCCCATTGAAGTTGCACTGCATCACCGTTGGGCCGAACTCAAAAGTTGTATGGCGGTCACCATTTATACAAACTAGTTGCAGGTTTCCTTTACAAACTGCAAGCACATGCCCAACCCAAGGGCGAACGAGAAAGGTGACCGACATTT
CATTCTTGCCCACTTTCCATGAGAAATTTTAAACCAGAACGCCCATTGCTCTGCCTCTCAAATTCAAGAAAGTACAAATTTGAATTCCCGCACAGCCATTTTATCATCAACACCACATTTTCAGTCGGTGGGTGCTATTGTTCTCTACAACCCTACAGCTCAAACCCCACCGAAGTCATATCTCAGTGCCTCGCTATCTC
ACTCCCATCCTCAAAAAGAATATCCAAATGGGTTTATCGTATGTTATCTTCACTGCCATGGTCATCATTGCCTCTTGTTATCCTGTCATGGTCCAGAGCGAACCAGAGACATTCATCAGCCTTAAAGAACTGAGAGAGCTAATAAAGCAGAGGATACCAGACGAAGAGACTGCACCACAGTATCAGGATAATTACGAGGA
GCCCTTGCAGCTTTTGATGCCCAGTAAAGGACATGATAAGCTGGAATTGAATGAAATTGTACTTGAAACATTGGCTAGTATTGAGGACCCAGTTGCCTTTGTGGCTGTTGTTGGACCATACCATTGTGGCAAATCATTTCTGTTAAATGTTCTACTCAATTCCACACATGGGTTCACAGTGGGTTCAAGACCCGAGCCTG
AAACAAGAGGTATTTGGATCAGGATTGTGCCCAAAAGCAAACTGAAAGCTGTTGATGGATCTCAGGTAATTCTATTGGACACTGAAGGATTCTTTGGGGAGGGAGCCACTCGCTTGTATGATGCTAAGGTGTTTGCTATTGCTACTCTCCTAAGCTCCCACCTGGTTTACAACACCTTGAGGATGCTTGGTGATGCACAG
TCTGTGAGCTCCTTAGCTGTTTTGTCAAAGCAGGCCCAAATCTTCAATCTCCAAAATTGGCTTCACTCTGCTGAATTTGAAGAAGAGCATTCTCCTTCAATAGATATGGACACTTCTCTGCTGTTAAAGACACTTGACTTCCCACCACTGACATGGGTTGTCCAGGGATTTGACATTGATCTCGAGCCTTCAGAAGCACC
TATGCATTATCTTCAACGCTATATAGATGCGCAAGAACATGCTGGAGACCGAACATTGGAGACCTTATTTTCACATGGAATTTCGTGTTATACTCTTCGAACTCCAGCAGATCTAAATAATCTACGTGAAAGATATGGGAGCAAAGCATTGGCAGCAGAAGAAGAATTGTTTTATAGTCTCCATCCTAAGTACCTCATGG
ATGTTGAAATTCTGCGTAGAGCAGTTTTTGGGGATTTAATGGCAAAAGGTGGTCAGAAGCTCACAGGAAAGAGAGTGGCAAAATTGTTGCCCCTTCTAGTCCACTATGTTAATGAAGATTTCCCTTTAAATGCAGATCGAAAGCTAAGGGATGTCCTTGTTGATGTCATAATTGATGGTGCATTTAGTGGAGGTGTGCAG
TATTTCGAAAAAGAGATGCAATCAATTTTCTCAAGGCCTGAAAATTTAAACTTATCAGGAAGAGATCTGAGCTCTGATTCAGAGAATCTGGAGGCTCTTTCAGCTTCGGCTATGTCAGCACTTACAAGCCAGGAATTCAATGAGATAATAACAGCTGCAGAAAAGAAAGCAATTGATTACTGCCAGCGCCGATGTGTTGG
AGTGCCTTCAGTCCTTATATCTTCAGCATGTGAAGTTAGTCTGGGTACAAAGATAGATAGGATGAAACCATTTTACAGGGAAAAAAATGATCGTCAGGTTAGGGAAGTCCTTGTGCGTCTTGGAGAAACTCTTCGTGACAAAGCTGAGAAGATTCTGTTTAATATCAGTTTGCCCATTCCTGAAACTGAAATTCAAGATA
ACTGCAGTAAAGTGATAAATTCTGCTTTGAAAAGGTATGAGGGCCTTGTGGGTCCTCATCAAGGCAGTCAGATGTATAATGAAGCATGTAAGCAGATGCATGAGCAAATTTTGGTTAAATGTATTCAAGTTACAGACATCAATAGAGGAAAGATTTCATCCATACTAAACAGTGGAAAAGCTGCATACCAGATTGCATAT
AATGAGGCCTTTTCTGCTGCTATTGGAGATTACATGATTGAGGCCCAGAAAAATATAGCTGCAGAGAATTCAGTCAGCTATAGTGAGGGACAGAGAAGGCCTATGCCACCTAGAAAAGTGGCTGAGGTTCATGCTGCGAGCTTGAAGGTTGCTCAGAAAGCATATGATGAAGTGGTCAAAGGAGGGGGGTTAAGTTGGAT
TGGGTCTGgtaatgaactgtatgactttaatcaatttcagtgcttacagtggtccatgcagcgtttgagtgaatatcaggtccaaaaccgtgcagatatcttagcatttctgaaatacttggtctctgacattgcagTGAAGTTCAGGGAGACTGTGTCAAAAATCAGTCCATTTCCAGATAATGATGAAATCATTTCAG
GAAAGGCAGATGTAATTTCTAAGAAGTTGTTGGAAGAGTATATTATGGTGACAAAAGAATATGGTATTCCAGAGGTGGAAGAAAAGAAGAAAGAATTAACACAATACATTGAAGATGCACGTGCACACTTGATAAAAAAAAATACTGCCTTGATGGCAGCATATTGTTATGACCCACTCATGGATGCATATCGAGAGCTT
CATATGGAAGATTGTGAGAGAACTATCCATAATATGTTTGTTTCATGGTCGATCTGGTCCCTGAAGTGTCTATGGCCTGGCCCACGCTACACATTTGGATTCAAACATGCTGCATATATTACAGCTCGGAAGCATTTGGACAAAGCTCAGGCATCAGCAAGGCATGAATCTAAATTACCATCTGCAAATCATGACATGGC
AAAAGGGGTCATACTGAGTCCGGCAACACAGAACAAAGTCATTCAAGCTTGGATTGATCATGACTTGGCCCATCATGCAAATGTAGTGCTTGTAAATTTTACCTGTATCATCACTCTCATTGTTGTAATTGTCACAAGCCTGTATATTAGAAAAAGGCGTCTATCTGATACGTCAAGTCAAAATACTAGTACTAATAAGT
GGCAGCCAGATGGGAAACATTTCAACTGGAAGCAGACAGGTTATGAGGGATATTCAGGGGCATCAAGACTACATAACCGTGATCGTTTCTAATGCACTTGTCTTTTCAGAGGTCTGTATATGTCTGCTGTTTATTCCGAGTTCCAGAGTGCAAATTACAGATTCTAGTATGCAATCTTCATCGTCATTGGGCTCGTTCTT
GTTTTCTTTATATCGAAGATTGCAAAATAAAATCAAATCCTCGTCAACAAAGGTTCTTTGAGTTCTTGTGAAATGGAATGAAATTGTAGTAATGTCTACCCATGACCAGAGAAAGGTCAATGGGACTCAAGGTTATGGTTGGCACAAATTGCAAATTATTGGGGTGAGTTTTTCATTGAAGAGCACCTAACCCTGTTTGT
TCGCATGGCAATGAAATACTTTGTCATTTGGAATCAAAGTCACAAATAGCTTAATAGGTGCATAAAAGATGAGGGGTTTGGGATCCACTTATTGTTTGCAAACTTTGAGGGGTCCATACAGCTGATGCTTTTTTCGACTCATTGAGCTGCTAATTCTGATAATCAAGGCATCATTAGCAATAAGATCATTAGCATAAGCG
TATTCGCTTATACGTGTCTGAAAGAGGGCTAAGTTTTGTTTCAAAGGAAGACGCTGACTAAGGCTTCTCATTGCCTTTATTTTATTTGATTACTTGAATTACAGATAATGAAGTTACCGTGCCCAACCAAGACATTGAAACTTTTGAAGGCATATGGCCAAATCGGACTTTTGCATACATCGACATATTTGATGGTTTAT
GTTACTGTTGGTTTTTGGATTGCATACACCGATAATGCTTATTTATAGAATTGCAGGCATAAGAGAGAATCTTAGAAGGCAATGCTTCTTTAAAGTTTGTTCTCATTTTCTTCAAGTTCAATTTGGATGTTAGCAATAATTCATTTATTCCTGGGTCAAATTGTTGTAATTCTGATGGTGTTGGTGAAAATTGTTTGTGA
AATAACATATTATATTAAAACAGTGATTTTGGT



Intron 2 GTGTTGAACT ... CTTTGTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A121.3137337
A219.0585320
A322.6878.5723
A418.48106824
A525.5352.5618
A67.691201
A716.6755311
A824.6224.518
A913.645799
A1014.074968



>TRINITY_DN106956_c0_g1_i2 from sample A5 / Example spliced isoform
CCCAACACTTCTCCATTGTTGATCCCCATTGAAGTTGCACTGCATCACCGTTGGGCCGAACTCAAAAGTTGTATGGCGGTCACCATTTATACAAACTAGTTGCAGGTTTCCTTTACAAACTGCAAGCACATGCCCAACCCAAGGGCGAACGAGAAAGGTGACCGACATTTCATTCTTGCCCACTTTCCATGAGAAATTTT
AAACCAGAACGCCCATTGCTCTGCCTCTCAAATTCAAGAAAGTACAAATTTGAATTCCCGCACAGCCATTTTATCATCAACACCACATTTTCAGTCGGTGGGTGCTATTGTTCTCTACAACCCTACAGCTCAAACCCCACCGAAGTCATATCTCAGTGCCTCGCTATCTCACTCCCATCCTCAAAAAGAATATCCAAATG
GGTTTATCGTATGTTATCTTCACTGCCATGGTCATCATTGCCTCTTGTTATCCTGTCATGGTCCAGAGCGAACCAGAGACATTCATCAGCCTTAAAGAACTGAGAGAGCTAATAAAGCAGAGGATACCAGAGGAAGAGACTGCACCACAGTATCAGGATAATTACGAGGAGCCCTTGCAGCTTTTGATGCCCAGTAAAGG
ACATGATAAGCTGGAATTGAATGAAATTGTACTTGAAACATTGGCTAGTATTGAGGACCCAGTTGCCTTTGTGGCTGTTGTTGGACCATACCATTGGTGATGCACAGTCTGTGAGCTCCTTAGCTGTTTTGTCAAAGCAGGCCCAAATCTTCAATCTCCAAAATTGGCTTCACTCTGCTGAATTTGAAGAAGAGCATTCT
CCTTCAATAGATATGGACACTTCTCTGCTGTTAAAGACACTTGACTTCCCACCACTGACATGGGTTGTCCAGGGATTTGACATTGATCTCGAGCCTTCAGAAGCACCTATGCATTATCTTCAACGCTATATAGATGCGCAAGAACATGCTGGAGACCGAACATTGGAGACCTTATTTTCACATGGAATTTCGTGTTATAC
TCTTCGAACTCCAGCAGATCTAAATAATCTACGTGAAAGATATGGGAGCAAAGCATTGGCAGCAGAAGAAGAATTGTTTTATAGTCTCCATCCTAAGTACCTCATGGATGTTGAAATTCTGCGTAGAGCAGTTTTTGGGGATTTAATGGCAAAAGGTGGTCAGAAGCTCACAGGAAAGAGAGTGGCAAAATTGTTGCCCC
TTCTAGTCCACTATGTTAATGAAGATTTCCCTTTAAATGCAGATCGAAAGCTAAGGGATGTCCTTGTTGATGTCATAATTGATGGTGCATTTAGTGGAGGTGTGCAGTATTTCGAAAAAGAGATGCAATCAATTTTCTCAAGGCCTGAAAATTTAAACTTATCAGGAAGAGATCTGAGCTCTGATTCAGAGAATCTGGAG
GCTCTTTCAGCTTCGGCTATGTCAGCACTTACAAGCCAGGAATTCAATGAGATAATAACAGCTGCAGAAAAGAAAGCAATCGATTACTGCCAGCGCCGATGTGTTGGAGTGCCTTCAGTCCTTATATCTTCAGCATGTGAAGTTAGTCTGGGTACAAAGATAGATAGGATGAAACCATTTTACAGGGAAAAAAATGATCG
TCAGGTTAGGGAAGTCCTTGTGCGTCTTGGAGAAACTCTTCGTGACAAAGCTGAGAAGATTCTGTTTAATATCAGTTTGCCCATTCCTGAAACTGAAATTCAAGATAACTGCAGTAAAGTGATAAATTCTGCTTTGAAAAGGTATGAGGGCCTTGTGGGTCCTCATCAAGGCAGTCAGATGTATAATGAAGCATGTAAGC
AGATGCATGAGCAAATTTTGGTTAAATGTATTCAAGTTACAGACATCAATAGAGGAAAGATTTCATCCATACTAAACAGTGGAAAAGCTGCATACCAGATTGCATATAATGAGGCCTTTTCTGCTGCTATTGGAGATTACATGATTGAGGCCCAGAAAAATATAGCTGCAGAGAATTCAGTCAGCTATAGTGAGGGACAG
AGAAGGCCTATGCCACCTAGAAAAGTGGCTGAGGTTCATGCTGCGAGCTTGAAGGTTGCTCAGAAAGCATATGATGAAGTGGTCAAAGGAGGGGGGTTAAGTTGGATTGGGTCTGGTAATGAACTGTATGACTTTAATCAATTTCAGTGCTTACAGTGGTCCATGCAGCGTTTGAGTGAATATCAGGTCCAAAACCGTGC
AGATATCTTAGCATTTCTGAAATACTTGGTCTCTGACATTGCAGTGAAGTTCAGGGAGACTGTGTCAAAAATCAGTCCATTTCCAGATAATGATGAAATCATTTCAGGAAAGGCAGATGTAATTTCTAAGAAGTTGTTGGAAGAGTATATTATGGTGACAAAAGAATATGGTATTCCAGAGGTGGAAGAAAAGAAGAAAG
AATTAACACAATACATTGAAGATGCACGTGCACACTTGATAAAAAAAAATACTGCCTTGATGGCAGCATATTGTTATGACCCACTCATGGATGCATATCGAGAGCTTCATATGGAAGATTGTGAGAGAACTATCCATAATATGTTTGTTTCATGGTCGATCTGGTCCCTGAAGTGTCTATGGCCTGGCCCACGCTACACA
TTTGGATTCAAACATGCTGCATATATTACAGCTCGGAAGCATTTGGACAAAGCTCAGGCATCAGCAAGGCATGAATCTAAATTACCATCTGCAAATCATGACATGGCAAAAGGGGTCATACTGAGTCCGGCAACACAGAACAAAGTCATTCAAGCTTGGATTGATCATGACTTGGCCCATCATGCAAATGTAGTGCTTGT
AAATTTTACCTGTATCATCACTCTCATTGTTGTAATTGTCACAAGCCTGTATATTAGAAAAAGGCGTCTATCTGATACGTCAAGTCAAAATACTAGTACTAATAAGTGGCAGCCAGATGGGAAACATTTCAACTGGAAGCAGACAGGTTATGAGGGATATTCAGGGGCATCAAGACTACATAACCGTGATCGTTTCTAAT
GCACTTGTCTTTTCAGAGGTCTGTATATGTCTGCTGTTTATTCCGAGTTCCAGAGTGCAAATTACAGATTCTAGTATGCAATCTTCATCGTCATTGGGCTCGTTCTTGTTTTCTTTATATCGAAGATTGCAAAATAAAATCAAATCCTCGTCAACAAAGGTTCTTTGAGTTCTTGTGAAATGGAATGAAATTGTAGTAAT
GTCTACCCATGACCAGAGAAAGGTCAATGGGACTCAAGGTTATGGTTGGCACAAATTGCAAATTATTGGGGTGAGTTTTTCATTGAAGAGCACCTAACCCTGTTTGTTCGCATGGCAATGAAATACTTTGTCATTTGGAATCAAAGTCACAAATAGCTTAATAGGTGCATAAAAGATGAGGGGTTTGGGATCCACTTATT
GTTTGCAAACTTTGAGGGGTCCATACAGCTGATGCTTTTTTCGACTCATTGAGCTGCTAATTCTGATAATCAAGGCATCATTAGCAATAAGATCATTAGCATAAGCGTATTCGCTTATACGTGTCTGAAAGAGGGCTAAGTTTTGTTTCAAAGGAAGACGCTGACTAAGGCTTCTCATTGCCTTTATTTTATTTGATTAC
TTGAATTACAGATAATGAAGTTACCGTGCCCAACCAAGACATTGAAACTTTTGAAGGCATATGGCCAAATCGGACTTTTGCATACATCGACATATTTGATGGTTTATGTTACTGTTGGTTTTTGGATTGCATACACCGATAATGCTTATTTATAGAATTGCAGGCATAAGAGAGAATCTTAGAAGGCAATGCTTCTTTAA
AGTTTGTTCTCATTTTCTTCAAGTTCAATTTGGATGTTAGCA


>TRINITY_DN106956_c0_g1_i1 from sample A5 / Example unspliced isoform:
CCCAACACTTCTCCATTGTTGATCCCCATTGAAGTTGCACTGCATCACCGTTGGGCCGAACTCAAAAGTTGTATGGCGGTCACCATTTATACAAACTAGTTGCAGGTTTCCTTTACAAACTGCAAGCACATGCCCAACCCAAGGGCGAACGAGAAAGGTGACCGACATTTCATTCTTGCCCACTTTCCATGAGAAATTTT
AAACCAGAACGCCCATTGCTCTGCCTCTCAAATTCAAGAAAGTACAAATTTGAATTCCCGCACAGCCATTTTATCATCAACACCACATTTTCAGTCGGTGGGTGCTATTGTTCTCTACAACCCTACAGCTCAAACCCCACCGAAGTCATATCTCAGTGCCTCGCTATCTCACTCCCATCCTCAAAAAGAATATCCAAATG
GGTTTATCGTATGTTATCTTCACTGCCATGGTCATCATTGCCTCTTGTTATCCTGTCATGGTCCAGAGCGAACCAGAGACATTCATCAGCCTTAAAGAACTGAGAGAGCTAATAAAGCAGAGGATACCAGAGGAAGAGACTGCACCACAGTATCAGGATAATTACGAGGAGCCCTTGCAGCTTTTGATGCCCAGTAAAGG
ACATGATAAGCTGGAATTGAATGAAATTGTACTTGAAACATTGGCTAGTATTGAGGACCCAGTTGCCTTTGTGGCTGTTGTTGGACCATACCATTGGTGATGCACAGTCTGTGAGCTCCTTAGCTGTTTTGTCAAAGCAGGCCCAAATCTTCAATCTCCAAAATTGGCTTCACTCTGCTGAATTTGAAGgtgttgaactg
ggttaaacagtggttgatatgtggttaatttttctttgtacagAAGAGCATTCTCCTTCAATAGATATGGACACTTCTCTGCTGTTAAAGACACTTGACTTCCCACCACTGACATGGGTTGTCCAGGGATTTGACATTGATCTCGAGCCTTCAGAAGCACCTATGCATTATCTTCAACGCTATATAGATGCGCAAGAACA
TGCTGGAGACCGAACATTGGAGACCTTATTTTCACATGGAATTTCGTGTTATACTCTTCGAACTCCAGCAGATCTAAATAATCTACGTGAAAGATATGGGAGCAAAGCATTGGCAGCAGAAGAAGAATTGTTTTATAGTCTCCATCCTAAGTACCTCATGGATGTTGAAATTCTGCGTAGAGCAGTTTTTGGGGATTTAA
TGGCAAAAGGTGGTCAGAAGCTCACAGGAAAGAGAGTGGCAAAATTGTTGCCCCTTCTAGTCCACTATGTTAATGAAGATTTCCCTTTAAATGCAGATCGAAAGCTAAGGGATGTCCTTGTTGATGTCATAATTGATGGTGCATTTAGTGGAGGTGTGCAGTATTTCGAAAAAGAGATGCAATCAATTTTCTCAAGGCCT
GAAAATTTAAACTTATCAGGAAGAGATCTGAGCTCTGATTCAGAGAATCTGGAGGCTCTTTCAGCTTCGGCTATGTCAGCACTTACAAGCCAGGAATTCAATGAGATAATAACAGCTGCAGAAAAGAAAGCAATCGATTACTGCCAGCGCCGATGTGTTGGAGTGCCTTCAGTCCTTATATCTTCAGCATGTGAAGTTAG
TCTGGGTACAAAGATAGATAGGATGAAACCATTTTACAGGGAAAAAAATGATCGTCAGGTTAGGGAAGTCCTTGTGCGTCTTGGAGAAACTCTTCGTGACAAAGCTGAGAAGATTCTGTTTAATATCAGTTTGCCCATTCCTGAAACTGAAATTCAAGATAACTGCAGTAAAGTGATAAATTCTGCTTTGAAAAGGTATG
AGGGCCTTGTGGGTCCTCATCAAGGCAGTCAGATGTATAATGAAGCATGTAAGCAGATGCATGAGCAAATTTTGGTTAAATGTATTCAAGTTACAGACATCAATAGAGGAAAGATTTCATCCATACTAAACAGTGGAAAAGCTGCATACCAGATTGCATATAATGAGGCCTTTTCTGCTGCTATTGGAGATTACATGATT
GAGGCCCAGAAAAATATAGCTGCAGAGAATTCAGTCAGCTATAGTGAGGGACAGAGAAGGCCTATGCCACCTAGAAAAGTGGCTGAGGTTCATGCTGCGAGCTTGAAGGTTGCTCAGAAAGCATATGATGAAGTGGTCAAAGGAGGGGGGTTAAGTTGGATTGGGTCTGGTAATGAACTGTATGACTTTAATCAATTTCA
GTGCTTACAGTGGTCCATGCAGCGTTTGAGTGAATATCAGGTCCAAAACCGTGCAGATATCTTAGCATTTCTGAAATACTTGGTCTCTGACATTGCAGTGAAGTTCAGGGAGACTGTGTCAAAAATCAGTCCATTTCCAGATAATGATGAAATCATTTCAGGAAAGGCAGATGTAATTTCTAAGAAGTTGTTGGAAGAGT
ATATTATGGTGACAAAAGAATATGGTATTCCAGAGGTGGAAGAAAAGAAGAAAGAATTAACACAATACATTGAAGATGCACGTGCACACTTGATAAAAAAAAATACTGCCTTGATGGCAGCATATTGTTATGACCCACTCATGGATGCATATCGAGAGCTTCATATGGAAGATTGTGAGAGAACTATCCATAATATGTTT
GTTTCATGGTCGATCTGGTCCCTGAAGTGTCTATGGCCTGGCCCACGCTACACATTTGGATTCAAACATGCTGCATATATTACAGCTCGGAAGCATTTGGACAAAGCTCAGGCATCAGCAAGGCATGAATCTAAATTACCATCTGCAAATCATGACATGGCAAAAGGGGTCATACTGAGTCCGGCAACACAGAACAAAGT
CATTCAAGCTTGGATTGATCATGACTTGGCCCATCATGCAAATGTAGTGCTTGTAAATTTTACCTGTATCATCACTCTCATTGTTGTAATTGTCACAAGCCTGTATATTAGAAAAAGGCGTCTATCTGATACGTCAAGTCAAAATACTAGTACTAATAAGTGGCAGCCAGATGGGAAACATTTCAACTGGAAGCAGACAG
GTTATGAGGGATATTCAGGGGCATCAAGACTACATAACCGTGATCGTTTCTAATGCACTTGTCTTTTCAGAGGTCTGTATATGTCTGCTGTTTATTCCGAGTTCCAGAGTGCAAATTACAGATTCTAGTATGCAATCTTCATCGTCATTGGGCTCGTTCTTGTTTTCTTTATATCGAAGATTGCAAAATAAAATCAAATC
CTCGTCAACAAAGGTTCTTTGAGTTCTTGTGAAATGGAATGAAATTGTAGTAATGTCTACCCATGACCAGAGAAAGGTCAATGGGACTCAAGGTTATGGTTGGCACAAATTGCAAATTATTGGGGTGAGTTTTTCATTGAAGAGCACCTAACCCTGTTTGTTCGCATGGCAATGAAATACTTTGTCATTTGGAATCAAAG
TCACAAATAGCTTAATAGGTGCATAAAAGATGAGGGGTTTGGGATCCACTTATTGTTTGCAAACTTTGAGGGGTCCATACAGCTGATGCTTTTTTCGACTCATTGAGCTGCTAATTCTGATAATCAAGGCATCATTAGCAATAAGATCATTAGCATAAGCGTATTCGCTTATACGTGTCTGAAAGAGGGCTAAGTTTTGT
TTCAAAGGAAGACGCTGACTAAGGCTTCTCATTGCCTTTATTTTATTTGATTACTTGAATTACAGATAATGAAGTTACCGTGCCCAACCAAGACATTGAAACTTTTGAAGGCATATGGCCAAATCGGACTTTTGCATACATCGACATATTTGATGGTTTATGTTACTGTTGGTTTTTGGATTGCATACACCGATAATGCT
TATTTATAGAATTGCAGGCATAAGAGAGAATCTTAGAAGGCAATGCTTCTTTAAAGTTTGTTCTCATTTTCTTCAAGTTCAATTTGGATGTTAGCA



Intron 3 GTTTGTATGT ... CTCATTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A120176144
A219.51132032
A321.13153041
A420.48132234
A513.565108
A613.893105
A72080020
A821.8243012
A92064016
A1017.5494020



>TRINITY_DN126606_c9_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform
ACCCAACACTTCTCCATTGTTGATCCCCATTGAAGTTGCACTGCATCACCGTTGGGCCGAACTCAAAAGTTGTATGGCGGTCACCATTTATACAAACTAGTTGCAGGTTTCCTTTACAAACTGCAAGCACATGCCCAACCCAAGGGCGAACGAGAAAGGTGACCGACATTTCATTCTTGCCCACTTTCCATGAGAAATTT
TAAACCAGAACGCCCATTGCTCTGCCTCTCAAATTCAAGAAAGTACAAATTTGAATTCCCGCACAGCCATTTTATCATCAAGACCACATTTTCAGTCGGTGGGTGCTATTGTTCTCTACAACCCTACAGCTCAAACCCCACCGAAGTCATATCTCAGTGCCTCGCTATCTCACTCCCATCCTCAAAAAGAATATCCAAAT
GGGTTTATCGTATGTTATCTTCACTGCCATGGTCATCATTGCCTCTTGTTATCCTGTCATGGTCCAGAGCGAACCAGAGACATTCATCAGCCTTAAAGAACTGAGAGAGCTAATAAAGCAGAGGATACCAGAGGAAGAGACTGCACCACAGTATCAGGATAATTACGAGGAGCCCTTGCAGCTTTTGATGCCCAGTAAAG
GACATGATAAGCTGGAATTGAATGAAATTGTACTTGAAACATTGGCTAGTATTGAGGACCCAGTTGCCTTTGTGGCTGTTGTTGGACCATACCATTGTGGCAAATCATTTCTGTTAAATGTTCTACTCAATTCCACACATGGGTTCACAGTGGGTTCAAGACCCGAGCCTGAAACAAGAGGTATTTGGATCAGGATTGTG
CCCAAAAGCAAACTGAAAGCAGTTGATGGATCTCAGGTAATTCTATTGGACACTGAAGGATTCTTTGGGGAGGGAGCCACTCGCTTGTATGATGCTAAGGTGTTTGCTATTGCTACTCTCCTAAGCTCCCACCTGGTTTACAACACCTTGAGGATGCTTGGTGATGCACAGTCTGTGAGCTCCTTAGCTGTTTTGTCAAA
GCAGGCCCAAATCTTCAATCTCCAAAATTGGCTTCACTCTGCTGAATTTGAAGAAGAGCATTCTCCTTCAATAGATATGGACACTTCTCTGCTGTTAAAGACACTTGACTTCCCACCACTGACATGGGTTGTCCAGGGATTTGACATTGATCTCGAGCCTTCAGAAGCACCTATGCATTATCTTCAACGCTATATAGATG
CGCAAGAACATGCTGGAGACCGAACATTGGAGACCTTATTTTCACATGGAATTTCGTGTTATACTCTTCGAACTCCAGCAGATCTAAATAATCTACGTGAAAGATATGGGAGCAAAGCATTGGCAGCAGAAGAAGAATTGTTTTATAGTCTCCATCCTAAGTACCTCATGGATGTTGAAATTCTGCGTAGAGCAGTTTTT
GGGGATTTAATGGCAAAAGGTGGTCAGAAGCTCACAGGAAAGAGAGTGGCAAAATTGTTGCCCCTTCTAGTCCACTATGTTAATGAAGATTTCCCTTTAAATGCAGATCGAAAGCTAAGGGATGTCCTTGTTGATGTCATAATTGATGGTGCATTTAGTGGAGGTGTGCAGTATTTCGAAAAAGAGATGCAATCAATTTT
CTCAAGGCCTGAAAATTTAAACTTATCAGGAAGAGATCTGAGCTCTGATTCAGAGAATCTGGAGGCTCTTTCAGCTTCGGCTATGTCAGCACTTACAAGCCAGGAATTCAATGAGATAATAACAGCTGCAGAAAAGAAAGCAATTGATTACTGCCAGCGCCGATGTGTTGGAGTGCCTTCAGTCCTTATATCTTCAGCAT
GTGAAGTTAGTCTGGGTACAAAGATAGATAGGATGAAACCATTTTACAGGGAAAAAAATGATCGTCAGGTTAGGGAAGTCCTTGTGCGTCTTGGAGAAACTCTTCGTGACAAAGCTGAGAAGATTCTGTTTAATATCAGTTTGCCCATTCCTGAAACTGAAATTCAAGATAACTGCAGTAAAGTGATAAATTCTGCTTTG
AAAAGGTATGAGGGCCTTGTGGGTCCTCATCAAGGCAGTCAGATGTATAATGAAGCATGTAAGCAGATGCATGAGCAAATTTTGGTTAAATGTATTCAAGTTACAGACATCAATAGAGGAAAGATTTCATCCATACTAAACAGTGGAAAAGCTGCATACCAGATTGCATATAATGAGGCCTTTTCTGCTGCTATTGGAGA
TTACATGATTGAGGCCCAGAAAAATATAGCTGCAGAGAATTCAGTCAGCTATAGTGAGGGACAGAGAAGGCCTATGCCACCTAGAAAAGTGGCTGAGGTTCATGCTGCGAGCTTGAAGGTTGCTCAGAAAGCATATGATGAGGTGGTCAAAGGAGGGGGGTTAAGTTGGATTGGGTCTGGTAATGAACTGTATGACTTTA
ATCAATTTCAGTGCTTACAGTGGTCCATGCAGCGTTTGAGTGAATATCAGGTCCAAAACCGTGCAGATATCTTAGCATTTCTGAAATACTTGGTCTCTGACATTGCAGTGAAGTTCAGGGAGACTGTGTCAAAAATCAGTCCATTTCCAGATAATGATGAAATCATTTCAGGAAAGCAGTTCCACAGATGCGATCTATGG
TTTGCACATAGGCACTTGACAGAAACGTTTTCAGCTAGCTCAGAGATACTTCCAGCTTATTCAGCCTACCTTGCCACTTGACAGAGACAGAT


>TRINITY_DN126606_c9_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
ATAGGATGAAACCATTTTACAGgtttgtatgtcactgtagagatattagctgaaaatagggaagaaattattgaacgagtctctggtttggtatatttggttgccactcagaagttttccttttcattggtcaagtttgaagttgccatatggcatatatttatgaaatagcaaatcatatgaaagtttttactttctca
ttgtagGGAAAAAAATGATCGTCAGGTTAGGGAAGTCCTTGTGCGTCTTGGAGAAACTCTTCGTGACAAAGCTGAGAAGATTCTGTTTAATATCAGTTTGCCCATTCCTGAAACTGAAATTCAAGATAACTGCAGTAAAGTGATAAATTCTGCTTTGAAAAGGTATGAGGGCCTTGTGGGTCCTCATCAAGGCAGTCAGA
TGTATAATGAAGCATGTAAGCAGATGCATGAGCAAATTTTGGTTAAATGTATTCAAGTTACAGACATCAATAGAGGAAAGATTTCATCCATACTAAACAGTGGAAAAGCTGCATACCAGATTGCATATAATGAGGCCTTTTCTGCTGCTATTGGAGATTACATGATTGAGGCCCAGAAAAATATAGCTGCAGAGAATTCA
GTCAGCTATAGTGAGGGACAGAGAAGGCCTATGCCACCTAGAAAAGTGGCTGAGGTTCATGCTGCGAGCTTGAAGGTTGCTCAGAAAGCATATGATGAGGTGGTCAAAGGAGGGGGGTTAAGTTGGATTGGGTCTGGTAATGAACTGTATGACTTTAATCAATTTCAGTGCTTACAGTGGTCCATGCAGCGTTTGAGTGA
ATATCAGGTCCAAAACCGTGCAGATATCTTAGCATTTCTGAAATACTTGGTCTCTGACATTGCAGTGAAGTTCAGGGAGACTGTGTCAAAAATCAGTCCATTTCCAGATAATGATGAAATCATTTCAGGAAAGCAGTTCCACAGATGCGATCTATGGTTTGCACATAGGCACTTGACAGAAACGTTTTCAGCTAGCTCAG
AGATACTTCCAGCTTATTCAGCCTACCTTGCCACTTGACAGAGACAGAT



Intron 4 GTAATTCTTA ... CACTAAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A120.851123227
A222.52862822
A320621813
A417.46781221
A519.6141614
A615.79812
A716.9844711
A822.221462
A918.032574
A1015.792472



>TRINITY_DN107690_c0_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoform
GTCGCTTACGTTATTTGGAGGGTCTCCCCAACACTTCTCCATTGTTGATCCCCATTGAAGTTGCACTGCATCACCGTTGGGCCGAACTCAAAAGTTGTATGGCGGTCACCATTTATACAAACTAGTTGCAGGTTTCCTTTACAAACTGCAAGCACATGCCCAACCCAAGGGCGAACGAGAAAGGTGACCGACATTTCATT
CTTGCCCGCTTTCCATGAGAAATTTTAAACCAGAACGCCCATTGCTCTGCCTCTCAAATTCAAGAAAGTACAAATTTGAATTCCCGCACAGCCATTTTATCATCAAGACCACATTTTCAGTCGGTGGGTGCTATTGTTCTCTACAACCCTACAGCTCAAACCCCACCGAAGTCATATCTCAGTGCCTCGCTATCTCACTC
CCATCCTCAAAAAGAATATCCAAATGGGTTTATCGTATGTTATCTTCACTGCCATGGTCATCATTGCCTCTTGTTATCCTGTCATGGTCCAGAGCGAACCAGAGACATTCATCAGCCTTAAAGAACTGAGAGAGCTAATAAAGCAGAGGATACCAGACGAAGAGACTGCACCACAGTATCAGGATAATTACGAGGAGCCC
TTGCAGCTTTTGATGCCCAGTAAAGGACATGATAAGCTGGAATTGAATGAAATTGTACTTGAAACATTGGCTAGTATTGAGGACCCAGTTGCCTTTGTGGCTGTTGTTGGACCATACCATTGTGGCAAATCATTTCTGTTAAATGTTCTACTCAATTCCACACATGGGTTCACAGTGGGTTCAAGACCCGAGCCTGAAAC
AAGAGGTATTTGGATCAGGATTGTGCCCAAAAGCAAACTGAAAGCAGTTGATGGATCTCAGGTAATTCTATTGGACACTGAAGGATTCTTTGGGGAGGGAGCCACTCGCTTGTATGATGCTAAGGTGTTTGCTATTGCTACTCTCCTAAGCTCCCACCTGGTTTACAACACCTTGAGGATGCTTGGTGATGCACAGTCTG
TGAGCTCCTTAGCTGTTTTGTCAAAGCAGGCCCAAATCTTCAATCTCCAAAATTGGCTTCACTCTGCTGAATTTGAAGAAGAGCATTCTCCTTCAATAGATATGGACACTTCTCTGCTGTTAAAGACACTTGACTTCCCACCACTGACATGGGTTGTCCAGGGATTTGACATTGATCTCGAGCCTTCAGAAGCACCTATG
CATTATCTTCAACGCTATATAGATGCGCAAGAACATGCTGGAGACCGAACATTGGAGACCTTATTTTCACATGGAATTTCGTGTTATACTCTTCGAACTCCAGCAGATCTAAATAATCTACGTGAAAGATATGGGAGCAAAGCATTGGCAGCAGAAGAAGAATTGTTTTATAGTCTCCATCCTAAGTACCTCATGGATGT
TGAAATTCTGCGTAGAGCAGTTTTTGGGGATTTAATGGCAAAAGGTGGTCAGAAGCTCACAGGAAAGAGAGTGGCAAAATTGTTGCCCCTTCTAGTCCACTATGTTAATGAAGATTTCCCTTTAAATGCAGATCGAAAGCTAAGGGATGTCCTTGTTGATGTCATAATTGATGGTGCATTTAGTGGAGGTGTGCAGTATT
TCGAAAAAGAGATGCAATCAATTTTCTCAAGGCCTGAAAATTTAAACTTATCAGGAAGAGATCTGAGCTCTGATTCAGAGAATCTGGAGGCTCTTTCAGCTTCGGCTATGTCAGCACTTACAAGCCAGGAATTCAATGAGATAATAACAGCTGCAGAAAAGAAAGCAATTGATTACTGCCAGCGCCGATGTGTTGGAGTG
CCTTCAGTCCTTATATCTTCAGCATGTGAAGTTAGTCTGGGTACAAAGATAGATAGGATGAAACCATTTTACAGGGAAAAAAATGATCGTCAGGTTAGGGAAGTCCTTGTGCGTCTTGGAGAAACTCTTCGTGACAAAGCTGAGAAGATTCTGTTTAATATCAGTTTGCCCATTCCTGAAACTGAAATTCAAGATAACTG
CAGTAAAGTGATAAATTCTGCTTTGAAAAGGTATGAGGGCCTTGTGGGTCCTCATCAAGGCAGTCAGATGTATAATGAAGCATGTAAGCAGATGCATGAGCAAATTTTGGTTAAATGTATTCAAGTTACAGACATCAATAGAGGAAAGATTTCATCCATACTAAACAGTGGAAAAGCTGCATACCAGATTGCATATAATG
AGGCCTTTTCTGCTGCTATTGGAGATTACATGATTGAGGCCCAGAAAAATATAGCTGCAGAGAATTCAGTCAGCTATAGTGAGGGACAGAGAAGGCCTATGCCACCTAGAAAAGTGGCTGAGGTTCATGCTGCGAGCTTGAAGGTTGCTCAGAAAGCATATGATGAGGTGGTCAAAGGAGGGGGGTTAAGTTGGATTGGG
TCTGGTAATGAACTGTATGACTTTAATCAATTTCAGTGCTTACAGTGGTCCATGCAGCGTTTGAGTGAATATCAGGTCCAAAACCGTGCAGATATCTTAGCATTTCTGAAATACTTGGTCTCTGACATTGCAGTGAAGTTCAGGGAGACTGTGTCAAAAATCAGTCCATTTCCAGATAATGATGAAATCATTTCAGGAAA
GGCAGATGTAATTTCTAAGAAGTTGTTGGAAGAGTATATTATGGTGACAAAAGAATATGGTATTCCAGAGGTGGAAGAAAAGAAGAAAGAATTAACACAATACATTGAAGATGCACGTGCACACTTGATAAAAAAAAATACTGCCTTGATGGCAGCATATTGTTATGACCCACTCATGGATGCATATCGAGAGCTTCATA
TGGAAGATTGTGAGAGAACTATCCATAATATGTTTGTTTCATGGTCGATCTGGTCCCTGAAGTGTCTATGGCCTGGCCCACGCTACACATTTGGATTCAAACATGCTGCATATATTACAGCTCGGAAGCATTTGGACAAAGCTCAGGCATCAGCAAGGCATGAATCTAAATTACCATCTGCAAATCATGACATGGCAAAA
GGGGTCATACTGAGTCCGGCAACACAGAACAAAGTCATTCAAGCTTGGATTGATCATGACTTGGCCCATCATGCAAATGTAGTGCTTGTAAATTTTACCTGTATCATCACTCTCATTGTTGTAATTGTCACAAGCCTGTATATTAGAAAAAGGCGTCTATCTGATACGTCAAGTCAAAATACTAGTACTAATAAGTGGCA
GCCAGATGGGAAACATTTCAACTGGAAGCAGACAGGTTATGAGGGATATTCAGGGGCATCAAGACTACATAACCGTGATCGTTTCTAATGCACTTGTCTTTTCAGAGGTCTGTATATGTCTGCTGTTTATTCCGAGTTCCAGAGTGCAAATTACAGATTCTAGTATGCAATCTTCATCTTCATTGGGCTCATTCTTGTTT
TCTTTATATCGAAGATTGCAAAATAAAATCAAATCCTCGTCAGCAAAGGTTCTTTGAGTTCTTGTGAAATGGAATGAAATTGTAGTAATGTCTACCCATGACCAGAGAAAGGTCAATGGGACTCAAGGTTATGGTTGGCACAAATTGCAAATTATTGGGGTGAGTTTTTCATTGAAGAGCACCTAACCCTGTTTGTTCGC
ATGGCAATGAAATACTTTGTCATTTGGAATCAAAGTCACAAATAGCTTAATAGGTGCATAAAAGATGAGGGGTTTGGGATCCACTTATTGTTTGCAAACTTTGAGGGGTCCATACAGCTGATGCTTTTTTCGACTCATTGAGCTGCTAATTCTGATAATCAAGGCATCATTAGCAATAAGATCATTAGCATAAGCGTATT
CGCTTATACGTGTCTGAAAGAGGGCTAAGTTTTGTTTCAAAGGAAGACGCTGACTAAGGCTTCTCATTGCCTTTATTTTATTTGATTACTTGAATTACAGATAATGAAGTTACCGTGCCCAACCAAGACATTGAAACTTTTGAAGGCATATGGCCAAATCGGACTTTTGCATACATCGACATATTTGATGGTTTATGTTA
CTGTTGGTTTTTGGATTGCATACACCGATAATGCTTATTTATAGAATTGCAGGCATAAGAGAGAATCTTAGAAGGCAATGCTTCTTTAAAGTTTGTTCTCATTTTCTTCAAGTTCAATTTGGATGTTAGCAATAATTCATTTATTCCCGG


>TRINITY_DN107690_c0_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:
GTCGCTTACGTTATTTGGAGGGTCTCCCCAACACTTCTCCATTGTTGATCCCCATTGAAGTTGCACTGCATCACCGTTGGGCCGAACTCAAAAGTTGTATGGCGGTCACCATTTATACAAACTAGTTGCAGGTTTCCTTTACAAACTGCAAGCACATGCCCAACCCAAGGGCGAACGAGAAAGGTGACCGACATTTCATT
CTTGCCCGCTTTCCATGAGAAATTTTAAACCAGAACGCCCATTGCTCTGCCTCTCAAATTCAAGAAAGTACAAATTTGAATTCCCGCACAGCCATTTTATCATCAAGACCACATTTTCAGTCGGTGGGTGCTATTGTTCTCTACAACCCTACAGCTCAAACCCCACCGAAGTCATATCTCAGTGCCTCGCTATCTCACTC
CCATCCTCAAAAAGAATATCCAAATGGGTTTATCGTATGTTATCTTCACTGCCATGGTCATCATTGCCTCTTGTTATCCTGTCATGGTCCAGAGCGAACCAGAGACATTCATCAGCCTTAAAGAACTGAGAGAGCTAATAAAGCAGAGGATACCAGACGAAGAGACTGCACCACAGTATCAGGATAATTACGAGGAGCCC
TTGCAGCTTTTGATGCCCAGTAAAGGACATGATAAGCTGGAATTGAATGAAATTGTACTTGAAACATTGGCTAGTATTGAGGACCCAGTTGCCTTTGTGGCTGTTGTTGGACCATACCATTGTGGCAAATCATTTCTGTTAAATGTTCTACTCAATTCCACACATGGGTTCACAGTGGGTTCAAGACCCGAGCCTGAAAC
AAGAGGTATTTGGATCAGGATTGTGCCCAAAAGCAAACTGAAAGCTGTTGATGGATCTCAGgtaattcttattttttccttttcctgagaatatattgatgtgcacattgacttccacaagtgaaacacatgagatcctttccttttgaagtgtgagatacgttattttcgtggggtaaggcttctctgtgacaaaatgt
tctctacactcactaaacagGTAATTCTATTGGACACTGAAGGATTCTTTGGGGAGGGAGCCACTCGCTTGTATGATGCTAAGGTGTTTGCTATTGCTACTCTCCTAAGCTCCCACCTGGTTTACAACACCTTGAGGATGCTTGGTGATGCACAGTCTGTGAGCTCCTTAGCTGTTTTGTCAAAGCAGGCCCAAATCTTC
AATCTCCAAAATTGGCTTCACTCTGCTGAATTTGAAGAAGAGCATTCTCCTTCAATAGATATGGACACTTCTCTGCTGTTAAAGACACTTGACTTCCCACCACTGACATGGGTTGTCCAGGGATTTGACATTGATCTCGAGCCTTCAGAAGCACCTATGCATTATCTTCAACGCTATATAGATGCGCAAGAACATGCTGG
AGACCGAACATTGGAGACCTTATTTTCACATGGAATTTCGTGTTATACTCTTCGAACTCCAGCAGATCTAAATAATCTACGTGAAAGATATGGGAGCAAAGCATTGGCAGCAGAAGAAGAATTGTTTTATAGTCTCCATCCTAAGTACCTCATGGATGTTGAAATTCTGCGTAGAGCAGTTTTTGGGGATTTAATGGCAA
AAGGTGGTCAGAAGCTCACAGGAAAGAGAGTGGCAAAATTGTTGCCCCTTCTAGTCCACTATGTTAATGAAGATTTCCCTTTAAATGCAGATCGAAAGCTAAGGGATGTCCTTGTTGATGTCATAATTGATGGTGCATTTAGTGGAGGTGTGCAGTATTTCGAAAAAGAGATGCAATCAATTTTCTCAAGGCCTGAAAAT
TTAAACTTATCAGGAAGAGATCTGAGCTCTGATTCAGAGAATCTGGAGGCTCTTTCAGCTTCGGCTATGTCAGCACTTACAAGCCAGGAATTCAATGAGATAATAACAGCTGCAGAAAAGAAAGCAATTGATTACTGCCAGCGCCGATGTGTTGGAGTGCCTTCAGTCCTTATATCTTCAGCATGTGAAGTTAGTCTGGG
TACAAAGATAGATAGGATGAAACCATTTTACAGGGAAAAAAATGATCGTCAGGTTAGGGAAGTCCTTGTGCGTCTTGGAGAAACTCTTCGTGACAAAGCTGAGAAGATTCTGTTTAATATCAGTTTGCCCATTCCTGAAACTGAAATTCAAGATAACTGCAGTAAAGTGATAAATTCTGCTTTGAAAAGGTATGAGGGCC
TTGTGGGTCCTCATCAAGGCAGTCAGATGTATAATGAAGCATGTAAGCAGATGCATGAGCAAATTTTGGTTAAATGTATTCAAGTTACAGACATCAATAGAGGAAAGATTTCATCCATACTAAACAGTGGAAAAGCTGCATACCAGATTGCATATAATGAGGCCTTTTCTGCTGCTATTGGAGATTACATGATTGAGGCC
CAGAAAAATATAGCTGCAGAGAATTCAGTCAGCTATAGTGAGGGACAGAGAAGGCCTATGCCACCTAGAAAAGTGGCTGAGGTTCATGCTGCGAGCTTGAAGGTTGCTCAGAAAGCATATGATGAGGTGGTCAAAGGAGGGGGGTTAAGTTGGATTGGGTCTGGTAATGAACTGTATGACTTTAATCAATTTCAGTGCTT
ACAGTGGTCCATGCAGCGTTTGAGTGAATATCAGGTCCAAAACCGTGCAGATATCTTAGCATTTCTGAAATACTTGGTCTCTGACATTGCAGTGAAGTTCAGGGAGACTGTGTCAAAAATCAGTCCATTTCCAGATAATGATGAAATCATTTCAGGAAAGGCAGATGTAATTTCTAAGAAGTTGTTGGAAGAGTATATTA
TGGTGACAAAAGAATATGGTATTCCAGAGGTGGAAGAAAAGAAGAAAGAATTAACACAATACATTGAAGATGCACGTGCACACTTGATAAAAAAAAATACTGCCTTGATGGCAGCATATTGTTATGACCCACTCATGGATGCATATCGAGAGCTTCATATGGAAGATTGTGAGAGAACTATCCATAATATGTTTGTTTCA
TGGTCGATCTGGTCCCTGAAGTGTCTATGGCCTGGCCCACGCTACACATTTGGATTCAAACATGCTGCATATATTACAGCTCGGAAGCATTTGGACAAAGCTCAGGCATCAGCAAGGCATGAATCTAAATTACCATCTGCAAATCATGACATGGCAAAAGGGGTCATACTGAGTCCGGCAACACAGAACAAAGTCATTCA
AGCTTGGATTGATCATGACTTGGCCCATCATGCAAATGTAGTGCTTGTAAATTTTACCTGTATCATCACTCTCATTGTTGTAATTGTCACAAGCCTGTATATTAGAAAAAGGCGTCTATCTGATACGTCAAGTCAAAATACTAGTACTAATAAGTGGCAGCCAGATGGGAAACATTTCAACTGGAAGCAGACAGGTTATG
AGGGATATTCAGGGGCATCAAGACTACATAACCGTGATCGTTTCTAATGCACTTGTCTTTTCAGAGGTCTGTATATGTCTGCTGTTTATTCCGAGTTCCAGAGTGCAAATTACAGATTCTAGTATGCAATCTTCATCTTCATTGGGCTCATTCTTGTTTTCTTTATATCGAAGATTGCAAAATAAAATCAAATCCTCGTC
AGCAAAGGTTCTTTGAGTTCTTGTGAAATGGAATGAAATTGTAGTAATGTCTACCCATGACCAGAGAAAGGTCAATGGGACTCAAGGTTATGGTTGGCACAAATTGCAAATTATTGGGGTGAGTTTTTCATTGAAGAGCACCTAACCCTGTTTGTTCGCATGGCAATGAAATACTTTGTCATTTGGAATCAAAGTCACAA
ATAGCTTAATAGGTGCATAAAAGATGAGGGGTTTGGGATCCACTTATTGTTTGCAAACTTTGAGGGGTCCATACAGCTGATGCTTTTTTCGACTCATTGAGCTGCTAATTCTGATAATCAAGGCATCATTAGCAATAAGATCATTAGCATAAGCGTATTCGCTTATACGTGTCTGAAAGAGGGCTAAGTTTTGTTTCAAA
GGAAGACGCTGACTAAGGCTTCTCATTGCCTTTATTTTATTTGATTACTTGAATTACAGATAATGAAGTTACCGTGCCCAACCAAGACATTGAAACTTTTGAAGGCATATGGCCAAATCGGACTTTTGCATACATCGACATATTTGATGGTTTATGTTACTGTTGGTTTTTGGATTGCATACACCGATAATGCTTATTTA
TAGAATTGCAGGCATAAGAGAGAATCTTAGAAGGCAATGCTTCTTTAAAGTTTGTTCTCATTTTCTTCAAGTTCAATTTGGATGTTAGCAATAATTCATTTATTCCCGG