NA ----> NA
Intron 1 GTACTTCTCG ... GGGTTAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 68.6 | 38 | 81 | 85 |
| A2 | 62.81 | 45 | 87 | 65 |
| A3 | 64.29 | 40 | 77 | 67 |
| A4 | 65.55 | 41 | 75 | 81 |
| A5 | 60.42 | 38 | 57 | 59 |
| A6 | 61.97 | 613 | 997 | 1001 |
| A7 | 62.89 | 360 | 641 | 579 |
| A8 | 61.59 | 449 | 710 | 730 |
| A9 | 61.21 | 456.3 | 736.3 | 704 |
| A10 | 59.19 | 344 | 566 | 432 |
>TRINITY_DN124153_c0_g1_i6 from sample A1 / Example spliced isoformATCCGGAACTTCTTACCGATTTCTCTTACCGATCAGTGATCATAGTATGTTGAGACTTATATGTTATAATTATATAATTATAAGCGAGAAGTAAGTGATTAGTGATGGAATTCTTCCTTCACACGCAAACCGCACAAGAAGTCCAAGTCCCCAAGATCACTTATTTCACATAGGCGACTCACAAGAAGTTCCCCAGATCA
CTCATTTCACATACCCAACCACGCAAGAAGACCGCCAGATTTATTATTTCTTCACACAGGCAACCAGATAAGAAGTTCCGGAGCTGATCATAGAAGAAGAGGGGAACGCTGAACAAGAGAGAACACCTGTAATCCGTCCGCTGGCTTATTGGCATCTTGGGAAAGGTGATTGTAAAAATCTCTGGTTGAAAAAAGAATTC
GATTCCATTTTTTCCTTTGACCGAAGAAAATCTGAAAGAGTTCTAGCGAGGGATGGCGGCAGCAGCGTTTGGAAAGAAGATTATTAGCATTCTACGCCCTCATAATATTCCCTCTCATTACCCCTCGGCAGCAGCAGCTGTTACCTTCTCTATCTCCATGAGAGGAAGAAGCATCTCTTCACAGGAATCTCTTATCTCAC
GCCTGGCGGATGAGTTGGAGGTCTTGGCAGAGGAGCAGCGTATCATAATGGGTGCTCCCGATTGGATGCCCTTCCGCCCTGGCTCTTCCTATTGGCTGCCCGACTTGGAAGATTACAAGACATTGCTCCTTAAGCAGCAGCAGGAGGAGGATAAGGAAACGATGCTCCCCCGTGACACATCTTACTTGCTCTCTTTGTGC
CCTTAAACTCTAGGGTTTCTACTGCAAATCAGATCTGAGAGAGATGGCATTTTTTACAGTTGGACTATACCTTTTTGTAAAGTATGATCACATTACACAGTTGTTGAATCTGGGATAATGATGCAGTTATTTGGGATTTCCTGGGCATGGCCCCGTAATTTTTCTTTTCTGCTACCCATTTCAATGAAGTTCAATCTGAG
GTGCGGTTGAATTTTATTTACCACTGCAGCTTCCAGTTGTCTTAATGAGAATAACTTGTATTTAAAGACCAGATTTCAATGTCTGGGTATATCCTAAAATAGAAATCTAGACCAATATTTTTTTTACTGGAGGATGAACAAGGTGATTACTATGTCCAGAATTTGGGTTCTTAAGGAATTGTGCCAGGATAGGGTAAAGC
ATTGCAGCCAGAACTCCAGTAATGGTATCATGTTTTTCAGTAATTTAATTTCTTTTACTAATAAATAAATAATAATTTGAAAGAAGGCCAGACTGACTAGTTAGGTACCTGGGATTTATCAAGGCTACCAGCAGATTTTAAATTTCTGAATAGGTGTAGTAATAGGAGGTGGGTGTCCATTGGCAATGGCCTGTTATCCT
CCGCCAAAGTCACGGCCTAACTGCTTTTGGGAAGATGGTACTTTGTTTGCTTCTGCTGGTGTAGAAGCAATTGCACCAATTGGTATAGATATTGGGGCACACGGCTGGAGGCAGGTGGAAACTTGGTGGGCAAAACCTACACACTGTTGATTGGAAATATGTTGGTGAATCCCACAAACGCAAATCTAAATAGGGTATGA
GGAAATATGGTTAACATTACACCGTGAGTGTGTCTGTTAGGCTATGGTCTAGAACCAAATTGGAGTGCTTGTTCCAACGATGACACAGGTTCAAAACCTGGCAGATGCACTTCCCATGATAATGAGGTTGATTGGGCCATTCGAGATGTGGATTGTGTTAATGTGGAGAAATTATTTCTGTGATAATGCGGTGCTGTAAA
TAGATGTTACTGTGCTATTGCAGTTGAATCATGCCATGCTAAAAGGGGTTTTCTGACCTAAAAATAACAACAGCTATAATTGTGAACCATGTCTGGGTTTTCTTCTTCTGAGAAACATTAAGCCACTGAACCAATTAGGGCTACTTCCAATGCTAGTTAGATTAAGGCCTGTTTTGCTCACTGTTTGATTACAAGATTTG
GATTACACTTCACACAACACTGTCAAGCAATTTTTTAAAGAATAATCTCAATTAAATTTAACTAAATGTTGAGATGCATGTGCCTCGAGAGTGGCAAAAGTTACATTTTTGACACTGTTCTATTTAATTTTATTCAAGCATATCAGCAAGTGCAAAATGGGCCTAGATTAATATTATATGATTTCATTACTGCTGTGCAC
TGAATTCTATCAAGAATTTCTGAAGTAAATTTTGAATAACTGATGATTTCATTACTGCTGTGCCTTTTAATCTCCTTAAAAGTAACTGATGAACTCTACAAATTTTGCAAATGTGGAATGTAACTTATCTGAAAATAATCTGTTGTCACTTACTTGGAGTTATAGACTTGTGCAAAGTAACCCTTCTAGCCTTAGTTGAA
TGGATGATAGCATCTGGTAGCTTTAAATGCTGGATTGAAACTATTTTGTTTTAATCTTACTCCTGTATGAGTCACAAATCCGTTGTATATTTTGGATAAAGACTACTGTCAACTTTTGGTTTCATATCTTCTAAATCAAGGTTTGCCGCTAAATGATTTGTCTCTTGTTAGCAAATGCATTGTACTTCAAATTTCAATAC
TGCAGTGCAGCTTGTTTATAGTATTATCAACTAATTATTTATTCCTAGAAGTGGAAGTTCCACCTAGTTCCACCTAATAGCCTTTTTAGACCTTCTTTGTGGTTATCCATTCATATAGTATATTGATCCTGTTAGGTTGCCCAATGGGCAAATGAGCA
>TRINITY_DN124153_c0_g1_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATCCGGAACTTCTTACCGATTTCTCTTACCGATCAGTGATCATAGTATGTTGAGACTTATATGTTATAATTATATAATTATAAGCGAGAAGTAAGTGATTAGTGATGGAATTCTTCCTTCACACGCAAACCGCACAAGAAGTCCAAGTCCCCAAGATCACTTATTTCACATAGGCGACTCACAAGAAGTTCCCCAGATCA
CTCATTTCACATACCCAACCACGCAAGAAGACCGCCAGATTTATTATTTCTTCACACAGGCAACCAGATAAGAAGTTCCGGAGCTGATCATAGAAGAAGAGGGGAACGCTGAACAAGAGAGAACACCTGTAATCCGTCCGCTGGCTTATTGGCATCTTGGGAAAGGTGATTGTAAAAATCTCTGGTTGAAAAAAGAATTC
GATTCCATTTTTTCCTTTGACCGAAGAAAATCTGAAAGAGTTCTAGCGAGGGATGGCGGCAGCAGCGTTTGGAAAGAAGATTATTAGCATTCTACGCCCTCATAATATTCCCTCTCATTACCCCTCGGCAGCAGCAGCTGTTACCTTCTCTATCTCCATGAGAGGAAGAAGCATCTCTTCACAGGAATCTCTTATCTCAC
GCCTGGCGGATGAGTTGGAGGTCTTGGCAGAGGAGCAGCGTATCATAATGGGTGCTCCCGATTGGATGCCCTTCCGCCCTGGCTCTTCCTATTGGCTGCCCGACTTGGAAGATTACAAGACATTGCTCCTTAAGCAGCAGCAGGAGGAGGATAAGGAAACGATGCTCCCCCGTGACACATCTTACTTGgtacttctcgac
tctttttcagactctgagaattaaatttggttttcaggatttgctcatttacatcacataaaatagcataacatagctagaattcagatgggttgtaacttctttttgctgattttacataaatcacaccatgggttagcagCTCTCTTTGTGCCCTTAAACTCTAGGGTTTCTACTGCAAATCAGATCTGAGAGAGATG
GCATTTTTTACAGTTGGACTATACCTTTTTGTAAAGTATGATCACATTACACAGTTGTTGAATCTGGGATAATGATGCAGTTATTTGGGATTTCCTGGGCATGGCCCCGTAATTTTTCTTTTCTGCTACCCATTTCAATGAAGTTCAATCTGAGGTGCGGTTGAATTTTATTTACCACTGCAGCTTCCAGTTGTCTTAAT
GAGAATAACTTGTATTTAAAGACCAGATTTCAATGTCTGGGTATATCCTAAAATAGAAATCTAGACCAATATTTTTTTTACTGGACCAATATTTTTTTTACTGGAGGATGAACAAGGTGATTACTATGTCCAGAATTTGGGTTCTTAAGGAATTGTGCCAGGATAGGGTAAAGCATTGCAGCCAGAACTCCAGTAATGGT
ATCATGTTTTTCAGTAATTTAATTTCTTTTACTAATAAATAAATAATAATTTGAAAGAAGGCCAGACTGACTAGTTAGGTACCTGGGATTTATCAAGGCTACCAGCAGATTTTAAATTTCTGAATAGGTGTAGTAATAGGAGGTGGGTGTCCATTGGCAATGGCCTGTTATCCTCCGCCAAAGTCACGGCCTAACTGCTT
TTGGGAAGATGGTACTTTGTTTGCTTCTGCTGGTGTAGAAGCAATTGCACCAATTGGTATAGATATTGGGGCACACGGCTGGAGGCAGGTGGAAACTTGGTGGGCAAAACCTACACACTGTTGATTGGAAATATGTTGGTGAATCCCACAAACGCAAATCTAAATAGGGTATGAGGAAATATGGTTAACATTACACCGTG
AGTGTGTCTGTTAGGCTATGGTCTAGAACCAAATTGGAGTGCTTGTTCCAACGATGACACAGGTTCAAAACCTGGCAGATGCACTTCCCATGATAATGAGGTTGATTGGGCCATTCGAGATGTGGATTGTGTTAATGTGGAGAAATTATTTCTGTGATAATGCGGTGCTGTAAATAGATGTTACTGTGCTATTGCAGTTG
AATCATGCCATGCTAAAAGGGGTTTTCTGACCTAAAAATAACAACAGCTATAATTGTGAACCATGTCTGGGTTTTCTTCTTCTGAGAAACATTAAGCCACTGAACCAATTAGGGCTACTTCCAATGCTAGTTAGATTAAGGCCTGTTTTGCTCACTGTTTGATTACAAGATTTGGATTACACTTCACACAACACTGTCAA
GCAATTTTTTAAAGAATAATCTCAATTAAATTTAACTAAATGTTGAGATGCATGTGCCTCGAGAGTGGCAAAAGTTACATTTTTGACACTGTTCTATTTAATTTTATTCAAGCATATCAGCAAGTGCAAAATGGGCCTAGATTAATATTATATGATTTCATTACTGCTGTGCACTGAATTCTATCAAGAATTTCTGAAGT
AAATTTTGAATAACTGATGATTTCATTACTGCTGTGCCTTTTAATCTCCTTAAAAGTAACTGATGAACTCTACAAATTTTGCAAATGTGGAATGTAACTTATCTGAAAATAATCTGTTGTCACTTACTTGGAGTTATAGACTTGTGCAAAGTAACCCTTCTAGCCTTAGTTGAATGGATGATAGCATCTGGTAGCTTTAA
ATGCTGGATTGAAACTATTTTGTTTTAATCTTACTCCTGTATGAGTCACAAATCCGTTGTATATTTTGGATAAAGACTACTGTCAACTTTTGGTTTCATATCTTCTAAATCAAGGTTTGCCGCTAAATGATTTGTCTCTTGTTAGCAAATGCATTGTACTTCAAATTTCAATACTGCAGTGCAGCTTGTTTATAGTATTA
TCAACTAATTATTTATTCCTAGAAGTGGAAGTTCCACCTAGTTCCACCTAATAGCCTTTTTAGACCTTCTTTGTGGTTATCCATTCATATAGTATATTGATCCTGTTAGGTTGCCCAATGGGCAAATGAGCA