sp|Q9FV71|E2FB_ARATH ----> Transcription factor E2FB
Intron 1 GTATCCTTTT ... CTCTAAAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 30.53 | 119 | 24.1 | 52 |
| A2 | 35.08 | 94.7 | 30.6 | 51 |
| A3 | 38.3 | 109.8 | 29.5 | 68 |
| A4 | 43.24 | 59.2 | 28.6 | 45 |
| A5 | 37.95 | 27.8 | 2.1 | 17 |
| A6 | 41.82 | 341.2 | 71.6 | 245 |
| A7 | 41.77 | 465.8 | 87 | 334 |
| A8 | 40.07 | 510.5 | 100.8 | 341 |
| A9 | 43.25 | 379.9 | 123 | 289 |
| A10 | 39.02 | 328.5 | 71.1 | 210 |
>TRINITY_DN113476_c0_g2_i2 from sample A1 / Example spliced isoformAGACACCTGGGTCAAACATTGGTAGTAATTGTAGCTTCCTTATTTGCATCCATGACTTTTATGGTCCTTGATGCCAAACCTTTTGGGCTTGAGCATATCAACTTCAAACTTCGTACATAAAAGTTTCTTCCAGTAGATGTTTTTGGATTTAATTTCTCACCCATTTTCTCTATCAGTTAGTACCTGGACAAGAAAGCAGC
TGAATGGTGGTCATTTTGCTTGTGTACTTATTCTTTCTTTTCTTACAGGTTCTCCTTTGGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTGCTTGAGGGGATAGGACTA
ATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGGGTCTTAGTGTGTCGAGATCTGGAGAGGTTGAAGATGAAGCAACAGTTCTCCAGGCTGAAGTTGACAGTCTCTATCGTGAAGAATGCAAGTTAGATGAATGCATACGAGATATGCAGGAGCGATTAAGGATCTTGAGTGAGGATGAGAGGAATAGAAGATGGCT
TTATGTTACTGATGAAGACATTAAGAACCTACCATGTTTTCAGAATGATACGCTTATAGCAATAAAGGCTCCTCATGGAACCACACTGGAAGTTCCAGATCCAGACGAGGCAGTAGAATACCCACAAAGACGCTACCAGATTCTTTTACGAAGTACTATGGGGCCAATTGATGTTTATCTCGTAAGCCAATTTGAGGAGA
ATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTTCCTTTGGGGACTTGTCCTGCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTTCAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAAATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGGTGGAATTATGAGAATAGTT
CCATCAGATGCTAATATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGATTCTGGGGTTGGCATAACAGACATGTGGAGAACTGAATCTAATCCTACATGGGATGAGGTGATTGAACTCAATCCAACAGATTTTGGGATTGGCGAGGGTTCTCCCTGTCCTCAAACTCCTCCAAGCAGTAGTGTATTCTAAAATTTGAAGAATGC
GTGGTGCAGCTTACTGAATTGAACCATCTTATCGCCAAAGTTTACTAGTTGTGCATGAGCATGTTCAACATGTCTTTCAGATTTTTTTGGCACAAATGATATTTATAGGAGATGGAGTTGGGGAACATCTTAACCATACCCTGAGTGTATCAGAATCATGCAGCAGTTACACAGTTCTTGATTATCGACCTCATACTGGG
TGGGTTCTTGAAGAAAAAATACAAAATACAACTGGATTTCTACAACATTTATCTATTCCAGTAATTAATGGATGTAGAGACAACTGGGCCCTGGTTGTATCCAAGTTATTATGCTACAAGTTTAATCTATGCACTTTTTGGCTCATTTACTTCTGTTGTAAAGTTGGAAACTGCATTGCCCTTAGTGCATTGCTTAGACT
GAATTAAATTCTGGTACACTGGAATAGGATAAGCATCTGTAAAGTCGAATGTTTTACGTTACATCTTGACAAACATTTGGAAGTAGTAGCATCTATTGTCAAACAGTATTTTAATTTTACTAGTACTTTAGTCTTCCAAGTTAGTGAGGAATATTTTTGATGCCCCATGGGCAGTTGTTTTGCTGATTAATTATAGAGTA
TCTGTGAGATGATCGTGTCTAGACTTTAAAAAA
>TRINITY_DN113476_c0_g2_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCAATTTGAGGAGAATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTTCCTTTGGGGACTTGTCCTGCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTTCAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAAATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGGTGGAA
TTATGAGAATAGTTCCATCAGATGCTAATATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGATTCTGGGGTTGGCATAACAGACATGTGGAGAACTGAATgtatccttttattttgttcatattctctgtctcatctggaaatgatatttccttttggattcctcgactctaaaaagCTAATCCTACATGGGATGAGGTGATTG
AACTCAATCCAACAGATTTTGGGATTGGCGAGGGTTCTCCCTGTCCTCAAACTCCTCCAAGCAGTAGTGTATTCTAAAATTTGAAGAATGCGTGGTGCAGCTTACTGAATTGAACCATCTTATCGCCAAAGTTTACTAGTTGTGCATGAGCATGTTCAACATGTCTTTCAGATTTTTTTGGCACAAATGATATTTATAGG
AGATGGAGTTGGGGAACATCTTAACCATACCCTGAGTGTATCAGAATCATGCAGCAGTTACACAGTTCTTGATTATCGACCTCATACTGGGTGGGTTCTTGAAGAAAAAATACAAAATACAACTGGATTTCTACAACATTTATCTATTCCAGTAATTAATGGATGTAGAGACAACTGGGCCCTGGTTGTATCCAAGTTAT
TATGCTACAAGTTTAATCTATGCACTTTTTGGCTCATTTACTTCTGTTGTAAAGTTGGAAACTGCATTGCCCTTAGTGCATTGCTTAGACTGAATTAAATTCTGGTACACTGGAATAGGATAAGCATCTGTAAAGTCGAATGTTTTACGTTACATCTTGACAAACATTTGGAAGTAGTAGCATCTATTGTCAAACAGTAT
TTTAATTTTACTAGTACTTTAGTCTTCCAAGTTAGTGAGGAATATTTTTGATGCCCCATGGGCAGTTGTTTTGCTGATTAATTATAGAGTATCTGTGAGATGATCGTGTCTAGACTTTAAAAAA
Intron 2 GTTACTTGAG ... TTTTCTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.61 | 214 | 41 | 77 |
| A2 | 23.6 | 212 | 64 | 67 |
| A3 | 23.21 | 220 | 64 | 69 |
| A4 | 25.57 | 179 | 48 | 75 |
| A5 | 24.43 | 99 | 24 | 40 |
| A6 | 26.12 | 345 | 103 | 141 |
| A7 | 24.02 | 677 | 213 | 215 |
| A8 | 23.89 | 481 | 111 | 191 |
| A9 | 24.11 | 675 | 171 | 258 |
| A10 | 24.75 | 640 | 196 | 225 |
>TRINITY_DN92905_c0_g1_i2 from sample A4 / Example spliced isoformAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAAGTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTTTTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATT
TCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAATACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGAC
ACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTGC
TTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGGGTCTTAGTGTGTCGAGATCTGGAGAGGTTGAAGATGAAGCAACAGTTCTCCAGGCTGAAGTTGACAGTCTCTATCGTGAAGAATGCAAGTTAGATGAATGCATACGAGATATGCAGGAGCGATTAAGGATCTTGAGTGAGGATGAG
AGGAATAGAAGATGGCTTTATGTTACTGATGAAGACATTAAGAACCTACCATGTTTTCAGAATGATACGCTTATAGCAATAAAGGCTCCTCATGGAACCACACTGGAAGTTCCAGATCCAGACGAGGCAGTAGAATACCCACAAAGACGCTACCAGATTCTTTTACGAAGTACTATGGGGCCAATTGATGTTTATCTCGT
AAGCCAATTTGAGGAGAATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTTCCTTTGGGGACTTGTCCTGCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTTCAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAAATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGGTG
GAATTATGAGAATAGTTCCATCAGATGCTAATATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGATTCTGGGGTTGGCATAACAGACATGTGGAGAACTGAATCTAATCCTACATGGGATGAGGTGATTGAACTCAATCCAACAGATTTTGGGATTGGCGAGGGTTCTCCCTGTCCTCAAACTCCTCCAAGCAGTAGTGTATTC
TAAAATTTGAAGAATGCGTGGTGCAGCTTACTGAATTGAACCATCTTATCGCCAAAGTTTACTAGTTGTGCATGAGCATGTTCAACATGTCTTTCAGATTTTTTTGGCACAAATGATATTTATAGGAGATGGAGTTGGGGAACATCTTAACCATACCCTGAGTGTATCAGAATCATGCAGCAGTTACACAGTTCTTGATT
ATCGACCTCATACTGGGTGGGTTCTTGAAGAAAAAATACAAAATACAACTGGATTTCTACAACATTTATCTATTCCAGTAATTAATGGATGTAGAGACAACTGGGCCCTGGTTGTATCCAAGTTATTATGCTACAAGTTTAATCTATGCACTTTTTGGCTCATTTACTTCTGTTGTAAAGTTGGAAACTGCATTGCCCTT
AGTGCATTGCTTAGACTGAATTAAATTCTGGTACACTGGAATAGGATAAGCATCTGTAAAGTCGAATGTTTTACGTTACATCTTGACAAACATTTGGAAGTAGTAGCATCTATTGTCAAACAGTATTTTAATTTTACTAGTACTTTAGTCTTCCAAGTTAGTGAGGAATATTTTTGATGCCCCATGGGCAGTTGTTTTGC
TGATTAATTATAGAGTATCTGTGAGATGATCGTGTCTAGACTTTATTTTACATTTGTTCCTGCTTTCTTGGTACAATCATGTTATGCAAAATTCAGTTTATTAGTTTGCCCTTATTCTTTTCATGTTCAGTT
>TRINITY_DN92905_c0_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:AATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAAGTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTTTTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATT
TCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAATACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGAC
ACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTGC
TTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGGGTCTTAGTGTGTCGAGATCTGGAGAGGTTGAAGATGAAGCAACAGTTCTCCAGGCTGAAGTTGACAGTCTCTATCGTGAAGAATGCAAGTTAGATGAATGCATACGAGATATGCAGGAGCGATTAAGGATCTTGAGTGAGGATGAG
AGGAATAGAAGgttacttgaggcaaaaactattgatgcaatttttttattcattgtcatgttgcatttatattctaattcatggcgggattaatgtgtagcattctatccagttagtgtaattgttcatcgtaaaagatggaatatctaaaactatttcttcaaagcatttttgtttcttttgttgcaacttgattctga
tttttttctgtagATGGCTTTATGTTACTGATGAAGACATTAAGAACCTACCATGTTTTCAGAATGATACGCTTATAGCAATAAAGGCTCCTCATGGAACCACACTGGAAGTTCCAGATCCAGACGAGGCAGTAGAATACCCACAAAGACGCTACCAGATTCTTTTACGAAGTACTATGGGGCCAATTGATGTTTATCTC
GTAAGCCAATTTGAGGAGAATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTTCCTTTGGGGACTTGTCCTGCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTTCAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAAATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGG
TGGAATTATGAGAATAGTTCCATCAGATGCTAATATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGATTCTGGGGTTGGCATAACAGACATGTGGAGAACTGAATCTAATCCTACATGGGATGAGGTGATTGAACTCAATCCAACAGATTTTGGGATTGGCGAGGGTTCTCCCTGTCCTCAAACTCCTCCAAGCAGTAGTGTAT
TCTAAAATTTGAAGAATGCGTGGTGCAGCTTACTGAATTGAACCATCTTATCGCCAAAGTTTACTAGTTGTGCATGAGCATGTTCAACATGTCTTTCAGATTTTTTTGGCACAAATGATATTTATAGGAGATGGAGTTGGGGAACATCTTAACCATACCCTGAGTGTATCAGAATCATGCAGCAGTTACACAGTTCTTGA
TTATCGACCTCATACTGGGTGGGTTCTTGAAGAAAAAATACAAAATACAACTGGATTTCTACAACATTTATCTATTCCAGTAATTAATGGATGTAGAGACAACTGGGCCCTGGTTGTATCCAAGTTATTATGCTACAAGTTTAATCTATGCACTTTTTGGCTCATTTACTTCTGTTGTAAAGTTGGAAACTGCATTGCCC
TTAGTGCATTGCTTAGACTGAATTAAATTCTGGTACACTGGAATAGGATAAGCATCTGTAAAGTCGAATGTTTTACGTTACATCTTGACAAACATTTGGAAGTAGTAGCATCTATTGTCAAACAGTATTTTAATTTTACTAGTACTTTAGTCTTCCAAGTTAGTGAGGAATATTTTTGATGCCCCATGGGCAGTTGTTTT
GCTGATTAATTATAGAGTATCTGTGAGATGATCGTGTCTAGACTTTATTTTACATTTGTTCCTGCTTTCTTGGTACAATCATGTTATGCAAAATTCAGTTTATTAGTTTGCCCTTATTCTTTTCATGTTCAGTT
Intron 3 GTGTGTAGTT ... GTTGAATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 47.22 | 38 | 4 | 34 |
| A2 | 41.03 | 23 | 11 | 16 |
| A3 | 48.78 | 42 | 4 | 40 |
| A4 | 50 | 41 | 4 | 41 |
| A5 | 43.24 | 21 | 1 | 16 |
| A6 | 40.91 | 26 | 2 | 18 |
| A7 | 47.13 | 83 | 5 | 74 |
| A8 | 48.84 | 44 | 2 | 42 |
| A9 | 45.63 | 87 | 5 | 73 |
| A10 | 46.23 | 107 | 6 | 92 |
>TRINITY_DN106296_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoformGAAAGTCTCCGATTCTAGCGCGTCCCTCCCTCCCTCCACAACACGAAAAATAATAATGAAATAAATTAAAAAAACAAGAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAA
GTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTTTTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATTTCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAA
TACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGACACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGGTAATAAACTGCGTTGCAAATTGATTAGGCTGGGGTTGTTAACAA
AGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTGCTTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAG
>TRINITY_DN106296_c0_g1_i8 from sample A2 / Example unspliced isoform:GAAAGTCTCCGATTCTAGCGCGTCCCTCCCTCCCTCCACAACACGAAAAATAATAATGAAATAAATTAAAAAAACAAGAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAA
GTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTTTTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATTTCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAA
TACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGACACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGGTAATAAACTGCGTTGCAAATTGATTAGGCTGGgtgtgtagttgt
tttatttaattctctctatggagctctgcctgtgttaatgtttagaatctgacatagatggctgttttgttgaatcagGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTG
CTTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGTAATTTTCAGCACAACTCCTCTCTGTTAGCTGTTGCAAAAATATACTAGTCATTGTGGGGAGTTACTTGGTGAATTATGATAGCTGATAGTGAGATTTTTTTACCACATGCTCATGACAGGGGTCTTAGTGTGTCGA
Intron 4 GTAATTTTCA ... CTCATGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.87 | 207 | 42 | 18 |
| A2 | 19.31 | 212 | 50.8 | 17.8 |
| A3 | 13.11 | 262 | 39.5 | 20.5 |
| A4 | 14.9 | 187 | 32.8 | 20.3 |
| A5 | 17.92 | 87 | 19 | 8.3 |
| A6 | 10.18 | 289 | 32.8 | 30 |
| A7 | 9.92 | 688 | 75.8 | 57.5 |
| A8 | 11.71 | 441 | 58.5 | 34.5 |
| A9 | 9.19 | 620 | 62.8 | 55.5 |
| A10 | 10.79 | 645 | 78 | 45.8 |
>TRINITY_DN106296_c0_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoformGAAAGTCTCCGATTCTAGCGCGTCCCTCCCTCCCTCCACAACACGAAAAATAATAATGAAATAAATTAAAAAAACAAGAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAA
GTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTTTTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATTTCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAA
TACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGACACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATG
ATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTGCTTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGGGTCTTAGTGTGTCGAGATCTGGAGAGGTTGAAGATGAAGCAACAGTTCTCCAGGCTGAAGTTGACAGT
CTCTATCGTGAAGAATGCAAGTTAGATGAATGCATACGAGATATGCAGGAGCGATTAAGGATCTTGAGTGAGGATGAGAGGAATAGAAGATGGCTTTATGTTACTGATGAAGACATTAAGAACCTACCATGTTTTCAGAATGATACGCTTATAGCAATAAAGGCTCCTCATGGAACCACACTGGAAGTTCCAGATCCAGA
CGAGGCAGTAGAATACCCACAAAGACGCTACCAGATTCTTTTACGAAGTACTATGGGGCCAATTGATGTTTATCTCGTAAGCCAATTTGAGGAGAATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTTCCTTTGGGGACTTGTCCTGCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTT
CAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAAATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGGTGGAATTATGAGAATAGTTCCATCAGATGCTAATATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGATTCTGGGGTTGGCATAACAGACATGTGGAGAACTGAATGTATCCTTTTATTTTGTTCATAT
TCTCTGTCTCATCTGGAAATGATATTTCCTTTTGGATTCCTCGACTCTAAAAAGCTAATCCTACATGGGATGAGGTGATTGAACTCAATCCAACAGATTTTGGGATTGGCGAGGGTTCTCCCTGTCCTCAAACTCCTCCAAGCAGTAGTGTATTCTAAAATTTGAAGAATGCGTGGTGCAGCTTACTGAATTGAACCATC
TTATCGCCAAAGTTTACTAGTTGTGCATGAGCATGTTCAACATGTCTTTCAGATTTTTTTGGCACAAATGATATTTATAGGAGATGGAGTTGGGGAACATCTTAACCATACCCTGAGTGTATCAGAATCATGCAGCAGTTACACAGTTCTTGATTATCGACCTCATACTGGGTGGGTTCTTGAAGAAAAAATACAAAATA
CAACTGGATTTCTACAACATTTATCTATTCCAGTAATTAATGGATGTAGAGACAACTGGGCCCTGGTTGTATCCAAGTTATTATGCTACAAGTTTAATCTATGCACTTTTTGGCTCATTTACTTCTGTTGTAAAGTTGGAAACTGCATTGCCCTTAGTGCATTGCTTAGACTGAATTAAATTCTGGTACACTGGAATAGG
ATAAGCATCTGTAAAGTCGAATGTTTTACGTTACATCTTGACAAACATTTGGAAGTAGTAGCATCTATTGTCAAACAGTATTTTAATTTTACTAGTACTTTAGTCTTCCAAGTTAGTGAGGAATATTTTTGATGCCCCATGGGCAGTTGTTTTGCTGATTAATTATAGAGTATCCGTGAG
>TRINITY_DN106296_c0_g1_i8 from sample A2 / Example unspliced isoform:GAAAGTCTCCGATTCTAGCGCGTCCCTCCCTCCCTCCACAACACGAAAAATAATAATGAAATAAATTAAAAAAACAAGAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAA
GTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTTTTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATTTCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAA
TACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGACACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGGTAATAAACTGCGTTGCAAATTGATTAGGCTGGGTGTGTAGTTGT
TTTATTTAATTCTCTCTATGGAGCTCTGCCTGTGTTAATGTTTAGAATCTGACATAGATGGCTGTTTTGTTGAATCAGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTG
CTTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAgtaattttcagcacaactcctctctgttagctgttgcaaaaatatactagtcattgtggggagttacttggtgaattatgatagctgatagtgagatttttttaccacatgctcatgacagGGGTCTTAGTGTGTCGA
Intron 5 GTTGGTTATT ... TTTTTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.34 | 237 | 56 | 65 |
| A2 | 16.74 | 184 | 24 | 50 |
| A3 | 18.5 | 196 | 41 | 48 |
| A4 | 18.38 | 171 | 34 | 43 |
| A5 | 15.38 | 77 | 18 | 10 |
| A6 | 16.47 | 317 | 50 | 75 |
| A7 | 15.56 | 540 | 103 | 96 |
| A8 | 15.39 | 459 | 68 | 99 |
| A9 | 15.46 | 648 | 96 | 141 |
| A10 | 15.74 | 506 | 76 | 113 |
>TRINITY_DN100337_c0_g1_i6 from sample A5 / Example spliced isoformGAAAAATAATAATGAAATAAATTAAAAAAACAAGAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAAGTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTT
TTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATTTCTTCAAAACCTATTGATTGAGGATGTGAAGGTGGCAATGATTAAACATGGATAAAACTGGTTTCATGGGTTCTGCCAGATGATTCTATGTACTATCTGCATTCAGGATGAAGACAGATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGA
TGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAATACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGACACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGT
TATGATAGCTCTCTTGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTGCTTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGGGTCTTAG
TGTGTCGAGATCTGGAGAGGTTGAAGATGAAGCAACAGTTCTCCAGGCTGAAGTTGACAGTCTCTATCGTGAAGAATGCAAGTTAGATGAATGCATACGAGATATGCAGGAGCGATTAAGGATCTTGAGTGAGGATGAGAGGAATAGAAGATGGCTTTATGTTACTGATGAAGACATTAAGAACCTACCATGTTTTCAGA
ATGATACGCTTATAGCAATAAAGGCTCCTCATGGAACCACACTGGAAGTTCCAGATCCAGACGAGGCAGTAGAATACCCACAAAGACGCTACCAGATTCTTTTACGAAGTACTATGGGGCCAATTGATGTTTATCTCGTAAGCCAATTTGAGGAGAATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTT
CCTTTGGGGACTTGTCCTGCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTTCAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAAATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGGTGGAATTATGAGAATAGTTCCATCAGATGCTAATATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGA
TTCTGGGGTTGGCATAACAGACATGTGGAGAACTGAATCTAATCCTACATGGGATGAGGTGATTGAACTCAATCCAACAGATTTTGGGATTGGCGAGGGTTCTCCCTGTCCTCAAACTCCTCCAAGCAGTAGTGTATTCTAAAATTTGAAGAATGCGTGGTGCAGCTTACTGAATTGAACCATCTTATCGCCAAAGTTTA
CTAGTTGTGCATGAGCATGTTCAACATGTCTTTCAGATTTTTTTGGCACAAATGATATTTATAGGAGATGGAGTTGGGGAACATCTTAACCATACCCTGAGTGTATCAGAATCATGCAGCAGTTACACAGTTCTTGATTATCGACCTCATACTGGGTGGGTTCTTGAAGAAAAAATACAAAATACAACTGGATTTCTACA
ACATTTATCTATTCCAGTAATTAATGGATGTAGAGACAACTGGGCCCTGGTTGTATCCAAGTTATTATGCTACAAGTTTAATCTATGCACTTTTTGGCTCATTTACTTCTGTTGTAAAGTTGGAAACTGCATTGCCCTTAGTGCATTGCTTAGACTGAATTAAATTCTGGTACACTGGAATAGGATAAGCATCTGTAAAG
TCGAATGTTTTACGTTACATCTTGACAAACATTTGGAAGTAGTAGCATCTATTGTCAAACAGTATTTTAATTTTACTAGTACTTTAGTCTTCCAAGTTAGTGAGGAATATTTTTG
>TRINITY_DN100337_c0_g1_i3 from sample A5 / Example unspliced isoform:GAAAAATAATAATGAAATAAATTAAAAAAACAAGAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAAGTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTT
TTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATTTCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAATACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTA
AGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGACACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTC
CAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTGCTTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGGGTCTTAGTGTGTCGAGATCTGGAGAGGTTGAAGATGAAGCAACAGTTCTCCAGGCTGAAGTTGACAGTCTCTATCGTGAAGAATGCAAGTTAGATGAATGCATACGAGATAT
GCAGGAGCGATTAAGGATCTTGAGTGAGGATGAGAGGAATAGAAGATGGCTTTATGTTACTGATGAAGACATTAAGAACCTACCATGTTTTCAGgttggttatttacagcatttgttgtctttgtgtggtgttacaactattgcaaaatgatagatacttaagttttacagtttttggcagAATGATACGCTTATAGCAA
TAAAGGCTCCTCATGGAACCACACTGGAAGTTCCAGATCCAGACGAGGCAGTAGAATACCCACAAAGACGCTACCAGATTCTTTTACGAAGTACTATGGGGCCAATTGATGTTTATCTCGTAAGCCAATTTGAGGAGAATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTTCCTTTGGGGACTTGTCCT
GCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTTCAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAAATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGGTGGAATTATGAGAATAGTTCCATCAGATGCTAATATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGATTCTGGGGTTGGCATAAC
AGACATGTGGAGAACTGAATCTAATCCTACATGGGATGAGGTGATTGAACTCAATCCAACAGATTTTGGGATTGGCGAGGGTTCTCCCTGTCCTCAAACTCCTCCAAGCAGTAGTGTATTCTAAAATTTGAAGAATGCGTGGTGCAGCTTACTGAATTGAACCATCTTATCGCCAAAGTTTACTAGTTGTGCATGAGCAT
GTTCAACATGTCTTTCAGATTTTTTTGGCACAAATGATATTTATAGGAGATGGAGTTGGGGAACATCTTAACCATACCCTGAGTGTATCAGAATCATGCAGCAGTTACACAGTTCTTGATTATCGACCTCATACTGGGTGGGTTCTTGAAGAAAAAATACAAAATACAACTGGATTTCTACAACATTTATCTATTCCAGT
AATTAATGGATGTAGAGACAACTGGGCCCTGGTTGTATCCAAGTTATTATGCTACAAGTTTAATCTATGCACTTTTTGGCTCATTTACTTCTGTTGTAAAGTTGGAAACTGCATTGCCCTTAGTGCATTGCTTAGACTGAATTAAATTCTGGTACACTGGAATAGGATAAGCATCTGTAAAGTCGAATGTTTTACGTTAC
ATCTTGACAAACATTTGGAAGTAGTAGCATCTATTGTCAAACAGTATTTTAATTTTACTAGTACTTTAGTCTTCCAAGTTAGTGAGGAATATTTTTG
Intron 6 GTAATAAACT ... GTTGAATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.21 | 168 | 31 | 34 |
| A2 | 17.86 | 115 | 34 | 16 |
| A3 | 17.53 | 160 | 28 | 40 |
| A4 | 21.61 | 120.3 | 25.3 | 41 |
| A5 | 17.28 | 67 | 12 | 16 |
| A6 | 12.71 | 127 | 19 | 18 |
| A7 | 16.52 | 326 | 55 | 74 |
| A8 | 14.79 | 193 | 25 | 42 |
| A9 | 14.46 | 358 | 48 | 73 |
| A10 | 16.65 | 341.3 | 44.3 | 92 |
>TRINITY_DN106296_c0_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoformGAAAGTCTCCGATTCTAGCGCGTCCCTCCCTCCCTCCACAACACGAAAAATAATAATGAAATAAATTAAAAAAACAAGAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAA
GTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTTTTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATTTCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAA
TACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGACACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATG
ATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTGCTTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGGGTCTTAGTGTGTCGAGATCTGGAGAGGTTGAAGATGAAGCAACAGTTCTCCAGGCTGAAGTTGACAGT
CTCTATCGTGAAGAATGCAAGTTAGATGAATGCATACGAGATATGCAGGAGCGATTAAGGATCTTGAGTGAGGATGAGAGGAATAGAAGATGGCTTTATGTTACTGATGAAGACATTAAGAACCTACCATGTTTTCAGAATGATACGCTTATAGCAATAAAGGCTCCTCATGGAACCACACTGGAAGTTCCAGATCCAGA
CGAGGCAGTAGAATACCCACAAAGACGCTACCAGATTCTTTTACGAAGTACTATGGGGCCAATTGATGTTTATCTCGTAAGCCAATTTGAGGAGAATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTTCCTTTGGGGACTTGTCCTGCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTT
CAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAAATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGGTGGAATTATGAGAATAGTTCCATCAGATGCTAATATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGATTCTGGGGTTGGCATAACAGACATGTGGAGAACTGAATGTATCCTTTTATTTTGTTCATAT
TCTCTGTCTCATCTGGAAATGATATTTCCTTTTGGATTCCTCGACTCTAAAAAGCTAATCCTACATGGGATGAGGTGATTGAACTCAATCCAACAGATTTTGGGATTGGCGAGGGTTCTCCCTGTCCTCAAACTCCTCCAAGCAGTAGTGTATTCTAAAATTTGAAGAATGCGTGGTGCAGCTTACTGAATTGAACCATC
TTATCGCCAAAGTTTACTAGTTGTGCATGAGCATGTTCAACATGTCTTTCAGATTTTTTTGGCACAAATGATATTTATAGGAGATGGAGTTGGGGAACATCTTAACCATACCCTGAGTGTATCAGAATCATGCAGCAGTTACACAGTTCTTGATTATCGACCTCATACTGGGTGGGTTCTTGAAGAAAAAATACAAAATA
CAACTGGATTTCTACAACATTTATCTATTCCAGTAATTAATGGATGTAGAGACAACTGGGCCCTGGTTGTATCCAAGTTATTATGCTACAAGTTTAATCTATGCACTTTTTGGCTCATTTACTTCTGTTGTAAAGTTGGAAACTGCATTGCCCTTAGTGCATTGCTTAGACTGAATTAAATTCTGGTACACTGGAATAGG
ATAAGCATCTGTAAAGTCGAATGTTTTACGTTACATCTTGACAAACATTTGGAAGTAGTAGCATCTATTGTCAAACAGTATTTTAATTTTACTAGTACTTTAGTCTTCCAAGTTAGTGAGGAATATTTTTGATGCCCCATGGGCAGTTGTTTTGCTGATTAATTATAGAGTATCCGTGAG
>TRINITY_DN106296_c0_g1_i8 from sample A2 / Example unspliced isoform:GAAAGTCTCCGATTCTAGCGCGTCCCTCCCTCCCTCCACAACACGAAAAATAATAATGAAATAAATTAAAAAAACAAGAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAA
GTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTTTTCAGGAGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATTTCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAA
TACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCGCAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGACACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGgtaataaactgcgttgcaaattgattaggctgggtgtgtagttgt
tttatttaattctctctatggagctctgcctgtgttaatgtttagaatctgacatagatggctgttttgttgaatcagGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTG
CTTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGTAATTTTCAGCACAACTCCTCTCTGTTAGCTGTTGCAAAAATATACTAGTCATTGTGGGGAGTTACTTGGTGAATTATGATAGCTGATAGTGAGATTTTTTTACCACATGCTCATGACAGGGGTCTTAGTGTGTCGA
Intron 7 GTGAGTTATT ... TGCATGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 4.44 | 147 | 30.6 | 7 |
| A2 | 7.71 | 81.9 | 14.4 | 7 |
| A3 | 1.62 | 82.8 | 11.7 | 1.7 |
| A4 | 6.31 | 81.7 | 0.9 | 5.6 |
| A5 | 1.06 | 36.4 | 8 | 0.4 |
| A6 | 8.1 | 228 | 52.4 | 20.3 |
| A7 | 5.76 | 307 | 62.4 | 19.3 |
| A8 | 6.15 | 386.6 | 75.8 | 26.1 |
| A9 | 6.76 | 363.2 | 78.2 | 26.6 |
| A10 | 8.12 | 269.1 | 58.1 | 24.1 |
>TRINITY_DN113476_c0_g2_i2 from sample A1 / Example spliced isoformAGACACCTGGGTCAAACATTGGTAGTAATTGTAGCTTCCTTATTTGCATCCATGACTTTTATGGTCCTTGATGCCAAACCTTTTGGGCTTGAGCATATCAACTTCAAACTTCGTACATAAAAGTTTCTTCCAGTAGATGTTTTTGGATTTAATTTCTCACCCATTTTCTCTATCAGTTAGTACCTGGACAAGAAAGCAGC
TGAATGGTGGTCATTTTGCTTGTGTACTTATTCTTTCTTTTCTTACAGGTTCTCCTTTGGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAACGCAGAATATATGACATAACCAATGTGCTTGAGGGGATAGGACTA
ATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGGGTCTTAGTGTGTCGAGATCTGGAGAGGTTGAAGATGAAGCAACAGTTCTCCAGGCTGAAGTTGACAGTCTCTATCGTGAAGAATGCAAGTTAGATGAATGCATACGAGATATGCAGGAGCGATTAAGGATCTTGAGTGAGGATGAGAGGAATAGAAGATGGCT
TTATGTTACTGATGAAGACATTAAGAACCTACCATGTTTTCAGAATGATACGCTTATAGCAATAAAGGCTCCTCATGGAACCACACTGGAAGTTCCAGATCCAGACGAGGCAGTAGAATACCCACAAAGACGCTACCAGATTCTTTTACGAAGTACTATGGGGCCAATTGATGTTTATCTCGTAAGCCAATTTGAGGAGA
ATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTTCCTTTGGGGACTTGTCCTGCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTTCAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAAATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGGTGGAATTATGAGAATAGTT
CCATCAGATGCTAATATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGATTCTGGGGTTGGCATAACAGACATGTGGAGAACTGAATCTAATCCTACATGGGATGAGGTGATTGAACTCAATCCAACAGATTTTGGGATTGGCGAGGGTTCTCCCTGTCCTCAAACTCCTCCAAGCAGTAGTGTATTCTAAAATTTGAAGAATGC
GTGGTGCAGCTTACTGAATTGAACCATCTTATCGCCAAAGTTTACTAGTTGTGCATGAGCATGTTCAACATGTCTTTCAGATTTTTTTGGCACAAATGATATTTATAGGAGATGGAGTTGGGGAACATCTTAACCATACCCTGAGTGTATCAGAATCATGCAGCAGTTACACAGTTCTTGATTATCGACCTCATACTGGG
TGGGTTCTTGAAGAAAAAATACAAAATACAACTGGATTTCTACAACATTTATCTATTCCAGTAATTAATGGATGTAGAGACAACTGGGCCCTGGTTGTATCCAAGTTATTATGCTACAAGTTTAATCTATGCACTTTTTGGCTCATTTACTTCTGTTGTAAAGTTGGAAACTGCATTGCCCTTAGTGCATTGCTTAGACT
GAATTAAATTCTGGTACACTGGAATAGGATAAGCATCTGTAAAGTCGAATGTTTTACGTTACATCTTGACAAACATTTGGAAGTAGTAGCATCTATTGTCAAACAGTATTTTAATTTTACTAGTACTTTAGTCTTCCAAGTTAGTGAGGAATATTTTTGATGCCCCATGGGCAGTTGTTTTGCTGATTAATTATAGAGTA
TCTGTGAGATGATCGTGTCTAGACTTTAAAAAA
>TRINITY_DN113476_c0_g2_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:TAATAATGAAATAAATTAAAAAAACAAGAATAGTTCCCTTCCCTCGCCCGCCTACTCCACATATATCTGAACTCAATTCAGACATTCAAACCCCATAAGCTCTTTTTCCCGAGCGGCCTCCCAATGCCATCGAAGGTAAGGCGGGTGTAAGTAAGATCATGCCAGAGTTGGATTGCAGTGACACCCAAATGCTTTTCAGG
AGGCTTCCTCTGATGGGTATCTGACATTTCTTCAAAACCTATAATTACCAGTCAGGTGAAGTGGAAGACTGAAACAGAGGAACATGAGATGGGGTCTAATGAATTGCCATCGGGGCATGGATATGTAGAAGCAGATACAATTGCTATAAATACAGCTGTTTCAGGCACAGGTGGCAGGCGTTATAATCGGTCTAAGCTCG
CAAAGCGTGCAAAGATTGGTCCTCAGACACCTGGGTCAAACATTGGTTCTCCTTTGGGTAATGCTCCTACTCCAATCAGCAGCTGTCGTTATGATAGCTCTCTTGGGTTGTTAACAAAGAAGTTTATTAGTCTAGTCAAGCAGGCTGATGATGGTATTCTTGATCTTAACAAGGCTGCAGATACTTTGGAAGTCCAAAAA
CGCAGAATATATGACATAACCAATGTGCTTGAGGGGATAGGACTAATAGAGAAAAGGCTGAAAAATAGAATTTGCTGGAAGGGTCTTAGTGTGTCGAGATCTGGAGAGGTTGAAGATGAAGCAACAGTTCTCCAGGCTGAAGTTGACAGTCTCTATCGTGAAGAATGCAAGTTAGATGAATGCATACGAGATATGCAGGA
GCGATTAAGGATCTTGAGTGAGGATGAGAGGAATAGAAGATGGCTTTATGTTACTGATGAAGACATTAAGAACCTACCATGTTTTCAGAATGATACGCTTATAGCAATAAAGGCTCCTCATGGAACCACACTGGAAGTTCCAGATCCAGACGAGGCAGTAGAATACCCACAAAGACGCTACCAGATTCTTTTACGAAGTA
CTATGGGGCCAATTGATGTTTATCTCGTAAGCCAATTTGAGGAGAATATTGAAGAGATGAATCCAGTTGATCTGGCAACAGAACTTGTTCCTTTGGGGACTTGTCCTGCAGAAGGGGTACCTATACACAGTGTTCAAGAAGGTGCAACTTCAGCTGATATGGAATGCCAAGGCCGTGAAACTCGTCAACTGTGTACAGAA
ATAACTAGCCCACAGGATTCTGTTGGTGGAATTATGAGAATAGTTCCATCAGATGCTAATgtgagttattgcttgaaaaatgttattgtgtactaaatgatgaaaataagttactgaatcagagaccacatatgtgcatggcagATTGATGCTGATTATTGGCTTCTCTCGGATTCTGGGGTTGGCATAACAGACATGTG
GAGAACTGAAT