sp|Q9C533|ZDHC1_ARATH ----> Probable protein S-acyltransferase 22


Intron 1 GTATTCGTGG ... GGGGTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A155.88303838
A248.44333527
A343.69291926
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A563.64468
A638.7815811
A755.56181728
A851.528710
A937.86322118
A1052.59322843



>TRINITY_DN123650_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform
AGTTAGGGTACACCATGCAATCCTAGAGGGCCAAGCGGAGAGGCACTTGGACCTCTGGGCTTTGGGTGGCGAGCCACTAATGAAGGCTAGATGGGAGGGAAAAGGACACCTGGAGTAGTGGTATGGAGAGTAAGATGCACGAATTAAGTACATAAACCAGGTAGGAGTCTCCATGTACAGTGATTAACCATATCCACATT
GGTGAAACCGACATTGGAAAGAATAACCCAACTATTAATTAAGTGGTTTTTAAGGTGGGCAGAAGCAGGAGGGGATATGGGAGGGAGATTTGTAAGCCAAAGTGTGGATGTTAGCATTGAATGCAAAGGCAGCGGGCAGAAGCAAAGGACATGTCAGAGCTCTAAAGAAGCTGCAGGAGTGAACAGGCAGGAGTAAATAG
TAGTAGTGAGTAGGCATCTTCAAAAGGGAGGGAGGGAAAGAAGCAGAAGCTGTGTTTGGGTCATTATCAGATTGTTGGGGGTGTGGGCATTGGGTGTAAGTATTTGGCTTGTATTGTATTCAAAGAATACATTCCTTGAAGTGGGCCTCCATATGTTAGACTGTGTGTTGATGGAGGTCAAAAGAAAAGAAAAAGGAATG
AAAGAACTTCGGTGGAACGAGGGGGCCATTGCATTGTGACAGGCCAAGTAGCAGATGGCCCATTTTAAGGATGATAACCCATAACTTTTTCCTCTTTTTCTTGGGATGTAAATCTTGTAGGGGAGGCCATCTATGATGATGACAACGAGAGGTGATGATTCCAGACAAGTCATGGTGGTTTAGGTCATTCTCTGATGTGT
GTAATGATTGGAAAACATGTTGCGGTGTTCATGTGTGAGGTGGATGCAATGTTTGATCTCTGTATGAACAGTAATAAGACCTGCATTCCTCCACACTGCTGAGCTGTTTCAGCGAGGCCTGGTATGCATCGGTATCTTTTGGGCTCTGTAAAAGACCGAGCCGATCTCTTTCATTGTTTTAGTTCAAGTCATAAGAGTAG
GCAATCAGAGCTGCTAAGAATTCCTCCATAATGAGGAAGCATGGCTGGGAGCTCCCTTATCATCCTCTGCAGGTGGTGGCTGTGGCAGTGTTCCTTGCTCTGGCATTTGCTTTCTACGTTTTCTTCGTGCCCTTTGTTGGGAAGAAGCTGTTCCAATACATTGCCATGGGCCTCTATTCACCTCTGGTATCACTGGTTTT
CTGTCTATATATATGGTGTGCAGCAACTGACCCAGGAGATCCTGGTGTATTCAGATCTAAAAAGTATGGGAAAATTTCCGATCCTAGAAAAGCTTTATACAATGATCCATTACCTGGATCTGCTGCTTCTGTTGATGATGCAAATACTGAATCTATAGGAGAAAAAGTCCAGTCAGAGGGGCCCCTGGTGACTGTATTGC
CTGTAAAGGAATCGAGGAACTTAGATGAAAAGAAAAGTGGCTTCAATAGTCTTTTATCGTTTTGGATTGTTAGTTGTGCCTGTTTCCCTTTTGCTCATATATGCAAGAGTACTTGTTCCAAAAAACAATCTTCAGAGCAGCAAGTTTGTGATGATGACATGCTGTATTGCAGCCTATGTGAAGTGGAGGTCTTCAAATAC
AGCAAGCACTGTCGAGTATGTGACAAATGTGTTGATGGCTTTGATCATCATTGTCGGTGGCTTAATAACTGCATTGGTAGGAAGAACTACAAGGGCTTTTTCACACTCATGGTATCTGCTCTTTTCCTGCTTATTCTGCAGTGGGTGATAGGAATCGTTGTGCTGGTCTCGTGTTTCATAAATCGGAGTCGTTTTGATGT
GGAGATCATCTCTAAATTGGGCAGCGGTTTCTCGTTGGTGCCATTTATTGTCGTAGTTGCAGCTTGCACCATACTGGCCATGATTGCTTCACTTCCTCTTGGTCAGCTCTTCTTCTTCCACGTTCTGCTTATGAAAAAGGGCATCAGCACTTATGATTACATTATAGCAATGAGGGAACAAGAACAACAAGCTATGGAAG
GAGTACAGAGCCCTCAAATGTCAACTGTAAGCTCTGCTACAGTAATGAGCAGTGCAAGTTCCATCAGTGCTTTACACCGGGGTGCATGGTGCACTCCTCCTCGGCTTCTTTTTGAGGATCAGTTCTCTGTGTTGCCACCAGAAGGAGCAGTGTCTTCTCTTGAGGCAGGGAATAGGAGTGCAAAAAGGAAGCAAGGTGAA
AGAGCAAGACAAAGGAACAGTGCGTCAGTTAAGATAAGCCCGTGGACTCTGGCTCGTTTAAATGCTGAAGAGGTGTCAAAGGCAGCTGCCCAAGCAAGGCAAAAGTCGAAAGTTCTGCAGCCTATATCTAGGCAAGATAGTGCATTAAGGATAGATACGGACAGCAGTTTGGAGAGTAGTAGTAGAGATATAAGCACAGA
CATCATTTCTCGTTCTCAGTACAAGAAGCGGAATTACAAAAGAGGTAGGCAACCATCACCACCCAGACATTTTCCACAAGCAAGGGCATCTAGGCCAACTAGGCTTCCTTTGAAAACTGCGACAGAAGCAGGCTGCAGTGTTGATTATGATAGTGTGGATCGTACCCATCCAATTGCTGAGACTTCTGCTAGTTTGGCTC
CTTTACAATTTGAGGCTAGGAATGCCTTCTGTTCTAATCTAGCAATGTCTACTGGTGGGCAGATTATTTCATCACCTGAAAGTAGTTTAACTTCTCCTGATATTCAACCTTTCAGAGAATCAACATCAAGCAAAGATCTATCAAACCTTTTGGCTGCCCCATTATCTTTTACAAAAGGGGTTCATCTCCACAGGTCTACA
AGCGATGGATATGAAGCATCTGGAGGAGAGAGTCCAGATGATAGTGACCAGGCTTCTGTAAGCCACTGTAAACCAAACTGGAATAAGATGCTTTTTAATCCTGCTTACACTGAAAAATGCCCAGCAGCAGAGCTACTGCCGAATCAGATGAGCATATTGCCTTACAGACCAAACAAAACAAAGTCGACAGGTCAGTCAGC
AGGACTGAGGATGCAGGCGAGTAATGGGAAGGGTGTGATGAGAAAGCTTGCAGAGGAATCCCAGTCAACCAATGAAATCAAATTTTGCCCTTCACAGTACGATTCCCCTGAAAGGGTCTAAAGATTGTTTCCATGTGCGAGAGAGTCTGGCCTGGATAATTATGCTAGGGCAGGGCCTATGGTTTTGGGTTTTGGCTAAT
ACTGTCTTATAAAGACTACAGTTCTCATTTTGTCTCCACGAAGGAGAACCAGAGATGCAAAAAACAAAAATTGTCATTGGTCTACCTCAGCATTGCTGGTTTTGATTAAGTGCCATCAGAGTCATGTTGAAGTCATTCCGTAAATTCCGATAGAGTGCCATGGCATGAAGTCACAGAGAGAAATTGATCTGAGTCTTTAT
CTCTCGATTTCTTTATTATGTTGGGCTATATGCTATAGTATGTGGATTGTTTGGGCCAGTATTCCATTGTTCTGTGATGCCCACCTAAAATATATTTTGGCATCTGCCCGGTTAAGGAAAAAATGCAGCCAAATTTCTTTCATCAGAATATACAAAGGTTTTCATGACTAACAATATGTTAGGGAAGCATAAATGTTTCT
GCTACTACTAACCTCTGTACGATGCAAACAGTTACCTTTTAAATCCTACAACAGGCATCATCAACACAAGCTATGCAAAATTTTGTGTTAACCTATTTGAAGTCTCTTTACAAGCTGCATCCCTTCATTTTCTTGGACACAGCAAAACCTGATCAAGTTGTTTCTATTAAAAATAAATTGGCAGCTGTTGCCAAGCATGT
ATTGTGCTTTCTAGCTTGATAGGTTTTTGGACAGTCTTTAATCCCTCAAATATTGCGAG


>TRINITY_DN123650_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GTATGAGGCTCTGACACTTTTGCTCTGGGTCTCTTTTTTGGTTTACAAATTTATGAAGGAACAATACCCATGTCTGTGATTGTTGATACATTGCTGTAGGTGGTGGCTGTGGCAGTGTTCCTTGCTCTGGCATTTGCTTTCTACGTTTTCTTCGTGCCCTTTGTTGGGAAGAAGCTGTTCCAATACATTGCCATGGGCCT
CTATTCACCTCTGGTATCACTGGTTTTCTGTCTATATATATGGTGTGCAGCAACTGACCCAGGAGATCCTGGTGTATTCAGATCTAAAAAGTATGGGAAAATTTCCGATCCTAGAAAAGCTTTATACAATGATCCATTACCTGGATCTGCTGCTTCTGTTGATGATGCAAATACTGAATCTATAGGAGAAAAAGTCCAGT
CAGAGGGGCCCCTGGTGACTGTATTGCCTGTAAAGGAATCGAGGAACTTAGATGAAAAGAAAAGTGGCTTCAATAGTCTTTTATCGTTTTGGATTGTTAGTTGTGCCTGTTTCCCTTTTGCTCATATATGCAAGAGTACTTGTTCCAAAAAACAATCTTCAGAGCAGCAAGTTTGTGATGATGACATGCTGTATTGCAGC
CTATGTGAAGTGGAGGTCTTCAAATACAGCAAGCACTGTCGAGTATGTGACAAATGTGTTGATGGCTTTGATCATCATTGTCGGTGGCTTAATAACTGCATTGGTAGGAAGAACTACAAGGGCTTTTTCACACTCATGGTATCTGCTCTTTTCCTGgtattcgtggtttgtacgtcttggaattggggttgcagCTTATT

CTGCAGTGGGTGATAGGAATCGTTGTGCTGGTCTCGTGTTTCATAAATCGGAGTCGTTTTGATGTGGAGATCATCTCTAAATTGGGCAGCGGTTTCTCGTTGGTGCCATTTATTGTCGTAGTTGCAGCTTGCACCATACTGGCCATGATTGCTTCACTTCCTCTTGGTCAGCTCTTCTTCTTCCACGTTCTGCTTATGAA
AAAGGGCATCAGCACTTATGATTACATTATAGCAATGAGGGAACAAGAACAACAAGCTATGGAAGGAGTACAGAGCCCTCAAATGTCAACTGTAAGCTCTGCTACAGTAATGAGCAGTGCAAGTTCCATCAGTGCTTTACACCGGGGTGCATGGTGCACTCCTCCTCGGCTTCTTTTTGAGGATCAGTTCTCTGTGTTGC
CACCAGAAGGAGCAGTGTCTTCTCTTGAGGCAGGGAATAGGAGTGCAAAAAGGAAGCAAGGTGAAAGAGCAAGACAAAGGAACAGTGCGTCAGTTAAGATAAGCCCGTGGACTCTGGCTCGTTTAAATGCTGAAGAGGTGTCAAAGGCAGCTGCCCAAGCAAGGCAAAAGTCGAAAGTTCTGCAGCCTATATCTAGGCAA
GATAGTGCATTAAGGATAGATACGGACAGCAGTTTGGAGAGTAGTAGTAGAGATATAAGCACAGACATCATTTCTCGTTCTCAGTACAAGAAGCGGAATTACAAAAGAGGTAGGCAACCATCACCACCCAGACATTTTCCACAAGCAAGGGCATCTAGGCCAACTAGGCTTCCTTTGAAAACTGCGACAGAAGCAGGCTG
CAGTGTTGATTATGATAGTGTGGATCGTACCCATCCAATTGCTGAGACTTCTGCTAGTTTGGCTCCTTTACAATTTGAGGCTAGGAATGCCTTCTGTTCTAATCTAGCAATGTCTACTGGTGGGCAGATTATTTCATCACCTGAAAGTAGTTTAACTTCTCCTGATATTCAACCTTTCAGAGAATCAACATCAAGCAAAG
ATCTATCAAACCTTTTGGCTGCCCCATTATCTTTTACAAAAGGGGTTCATCTCCACAGGTCTACAAGCGATGGATATGAAGCATCTGGAGGAGAGAGTCCAGATGATAGTGACCAGGCTTCTGTAAGCCACTGTAAACCAAACTGGAATAAGATGCTTTTTAATCCTGCTTACACTGAAAAATGCCCAGCAGCAGAGCTA
CTGCCGAATCAGATGAGCATATTGCCTTACAGACCAAACAAAACAAAGTCGACAGGTCAGTCAGCAGGACTGAGGATGCAGGCGAGTAATGGGAAGGGTGTGATGAGAAAGCTTGCAGAGGAATCCCAGTCAACCAATGAAATCAAATTTTGCCCTTCACAGTACGATTCCCCTGAAAGGGTCTAAAGATTGTTTCCATG
TGCGAGAGAGTCTGGCCTGGATAATTATGCTAGGGCAGGGCCTATGGTTTTGGGTTTTGGCTAATACTGTCTTATAAAGACTACAGTTCTCATTTTGTCTCCACGAAGGAGAACCAGAGATGCAAAAAACAAAAATTGTCATTGGTCTACCTCAGCATTGCTGGTTTTGATTAAGTGCCATCAGAGTCATGTTGAAGTCA
TTCCGTAAATTCCGATAGAGTGCCATGGCATGAAGTCACAGAGAGAAATTGATCTGAGTCTTTATCTCTCGATTTCTTTATTATGTTGGGCTATATGCTATAGTATGTGGATTGTTTGGGCCAGTATTCCATTGTTCTGTGATGCCCACCTAAAATATATTTTGGCATCTGCCCGGTTAAGGAAAAAATGCAGCCAAATT
TCTTTCATCAGAATATACAAAGGTTTTCATGACTAACAATATGTTAGGGAAGCATAAATGTTTCTGCTACTACTAACCTCTGTACGATGCAAACAGTTACCTTTTAAATCCTACAACAGGCATCATCAACACAAGCTATGCAAAATTTTGTGTTAACCTATTTGAAGTCTCTTTACAAGCTGCATCCCTTCATTTTCTTG
GACACAGCAAAACCTGATCAAGTTGTTTCTATTAAAAATAAATTGGCAGCTGTTGCCAAGCATGTATTGTGCTTTCTAGCTTGATAGGTTTTTGGACAGTCTTTAATCCCTCAAATATTGCGAG




Intron 2 GTAGGCAACC ... AACCTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A871.3445108116
A964.296013086
A1061.97615691



>TRINITY_DN40066_c0_g1_i6 from sample A9 / Example spliced isoform
AGTTAGGGTACACCATGCAATCCTAGAGGGCCAAGCGGAGAGGCACTTGGACCTCTGGGCTTTGGGTGGCGAGCCACTAATGAAGGCTAGATGGGAGGGAAAAGGACACCTGGAGTAGTGGTATGGAGAGTAAGATGCACGAATTAAGTACATAAACCAGGTAGGAGTCTCCATGTACAGTGATTAACCATATCCACATT
GGTGAAACCGACATTGGAAAGAATAACCCAACTATTAATTAAGTGGTTTTTAAGGTGGGCAGAAGCAGGAGGGGATATGGGAGGGAGATTTGTAAGCCAAAGTGTGGATGTTAGCATTGAATGCAAAGGCAGCGGGCAGAAGCAAAGGACATGTCAGAGCTCTAAAGAAGCTGCAGGAGTGAACAGGCAGGAGTAAATAG
TAGTAGTGAGTAGGCATCTTCAAAAGGGAGGGAGGGAAAGAAGCAGAAGCTGTGTTTGGGTCATTATCAGATTGTTGGGGGTGTGGGCATTGGGTGTAAGTATTTGGCTTGTATTGTATTCAAAGAATACATTCCTTGAAGTGGGCCTCCATATGTTAGACTGTGTGTTGATGGAGGTCAAAAGAAAAGAAAAAGGAATG
AAAGAACTTCGGTGGAACGAGGGGGCCATTGCATTGTGACAGGCCAAGTAGCAGATGGGCCATTTTAAGGATGATAACCCATAACTTTTTCCTCTTTTTCTTGGGATGTAAATCTTGTAGGGGAGGCCATCTATGATGATGACAACGAGAGGTGATGATTCCAGACAAGTCATGGTGGTTTAGGTCATTCTCTGATGTGT
GTAATGATTGGAAAACATGTTGCGGTGTTCATGTGTGAGGTGGATGCAATGTTTGATCTCTGTATGAACAGTAATAAGACCTGCATTCCTCCACACTGCTGAGCTGTTTCAGCGAGGCCTGGTATGCATCGGTATCTTTTGGGCTCTGTAAAAGACCGAGCCGATCTCTTTCATTGTTTTAGTTCAAGTCATAAGAGTAG
GCAATCAGAGCTGCTAAGAATTCCTCCATAATGAGGAAGCATGGCTGGGAGCTCCCTTATCATCCTCTGCAGGTGGTGGCTGTGGCAGTGTTCCTTGCTCTGGCATTTGCTTTCTACGTTTTCTTCGTGCCCTTTGTTGGGAAGAAGCTGTTCCAATACATTGCCATGGGCCTCTATTCACCTCTGGTATCACTGGTTTT
CTGTCTATATATATGGTGTGCAGCAACTGACCCAGGAGATCCTGGTGTATTCAGATCTAAAAAGTATGGGAAAATTTCCGATCCTAGAAAAGCTTTATACAATGATCCATTACCTGGATCTGCTGCTTCTGTTGATGATGCAAATACTGAATCTATAGGAGAAAAAGTCCAGTCAGAGGGGCCCCTGGTGACTGTATTGC
CTGTAAAGGAATCGAGGAACTTAGATGAAAAGAAAAGTGGCTTCAATAGTCTTTTATCGTTTTGGATTGTTAGTTGTGCCTGTTTCCCTTTTGCTCATATATGCAAGAGTACTTGTTCCAAAAAACAATCTTCAGAGCAGCAAGTTTGTGATGATGACATGCTGTATTGCAGCCTATGTGAAGTGGAGGTCTTCAAATAC
AGCAAGCACTGTCGAGTATGTGACAAATGTGTTGATGGCTTTGATCATCATTGTCGGTGGCTTAATAACTGCATTGGTAGGAAGAACTACAAGGGCTTTTTCACACTCATGGTATCTGCTCTTTTCCTGGTATTCGTGGTTTGTACGTCTTGGAATTGGGGTTGCAGCTTATTCTGCAGTGGGTGATAGGAATCGTTGTG
CTGGTCTCGTGTTTCATAAATCGGAGTCGTTTTGATGTGGAGATCATCTCTAAATTGGGCAGCGGTTTCTCGTTGGTGCCATTTATTGTCGTAGTTGCAGCTTGCACCATACTGGCCATGATTGCTTCACTTCCTCTTGGTCAGCTCTTCTTCTTCCACGTTCTGCTTATGAAAAAGGGCATCAGCACTTATGATTACAT
TATAGCAATGAGGGAACAAGAACAACAAGCTATGGAAGGAGTACAGAGCCCTCAAATGTCAACTGTAAGCTCTGCTACAGTAATGAGCAGTGCAAGTTCCATCAGTGCTTTACACCGGGGTGCATGGTGCACTCCTCCTCGGCTTCTTTTTGAGGATCAGTTCTCTGTGTTGCCACCAGAAGGAGCAGTGTCTTCTCTTG
AGGCAGGGAATAGGAGTGCAAAAAGGAAGCAAGGTGAAAGAGCAAGACAAAGGAACAGTGCGTCAGTTAAGATAAGCCCGTGGACTCTGGCTCGTTTAAATGCTGAAGAGGTGTCAAAGGCAGCTGCCCAAGCAAGGCAAAAGTCGAAAGTTCTGCAGCCTATATCTAGGCAAGATAGTGCATTAAGGATAGATACGGAC
AGCAGTTTGGAGAGTAGTAGTAGAGATATAAGCACAGACATCATTTCTCGTTCTCAGTACAAGAAGCGGAATTACAAAAGAGAGAATCAACATCAAGCAAAGATCTATCAAACCTTTTGGCTGCCCCATTATCTTTTACAAAAGGGGTTCATCTCCACAGGTCTACAAGCGATGGATATGAAGCATCTGGAGGAGAGAGT
CCAGATGATAGTGACCAGGCTTCTGTAAGCCACTGTAAACCAAACTGGAATAAGATGCTTTTTAATCCTGCTTACACTGAAAAATGCCCAGCAGCAGAGCTACTGCCGAATCAGATGAGCATATTGCCTTACAGACCAAACAAAACAAAGTCGACAGGTCAGTCAGCAGGACTGAGGATGCAGGCGAGTAATGGGAAGGG
TGTGATGAGAAAGCTTGCAGAGGAATCCCAGTCAACCAATGAAATCAAATTTTGCCCTTCACAGTACGATTCCCCTGAAAGGGTCTAAAGATTGTTTCCATGTGCGAGAGAGTCTGGCCTGGATAATTATGCTAGGGCAGGGCCTATGGTTTTGGGTTTTGGCTAATACTGTCTTATAAAGACTACAGTTCTCATTTTGT
CTCCACGAAGGAGAACCAGAGATGCAAAAAACAAAAATTGTCATTGGTCTACCTCAGCATTGCTGGTTTTGATTAAGTGCCATCAGAGTCATGTTGAAGTCATTCCGTAAATTCCGATAGAGTGCCATGGCATGAAGTCACAGAGAGAAATTGATCTGAGTCTTTATCTCTCGATTTCTTTATTATGTTGGGCTATATGC
TATAGTATGTGGATTGTTTGGGCCAGTATTCCATTGTTCTGTGATGCCCACCTAAAATATATTTTGGCATCTGCCCGGTTAAGGAAAAAATGCAGCCAAATTTCTTTCATCAGAATATACAAAGGTTTTCATGACTAACAATATGTTAGGGAAGCATAAATGTTTCTGCTACTACTAACCTCTGTACGATGCAAACAGTT
ACCTTTTAAATCCTACAACAGGCATCATCAACACAAGCTATGCAAAATTTTGTGTTAACCTATTTGAAGTCTCTTTACAAGCTGCATCCCTTCATTTTCTTGGACACAGCAAAACCTGATCAAGTTGTTTCTATTAAAAATAAATTGGCAGCTGTTGCCAAGCATGTATTGTGCTTTCTAGCTTGATAGGTTTTTGGACA
GTCTTTAATCCCTCAAATATTGCGAGTTCAAATAGGTTTTGTGTTTTCAAATTTGTGAGCTCAATTGTAGCTTAGTTGAAACTTGAAAATGATGTCAAGTGAGGTTTATGGACATTCTTTTGAATCCATTTGGCTTTTGGGATGAAGCTTAGTGACGAAAATAAGTGTTGTACGATAATCATCATGTTGGGGAAGTATGC
CAGAGTTGTACAATGCATAGTATTTGTCTGTTTTGGTAAGAGGTAAGGCTGGTGGTGTACTAAGAAAGGAAGACATGCAGTCATCATTAAAACATGTATCGGCACCAATAGTTTTCTAAGTTCTCTTTTCCCTGGTAATGTTATGAAATATTATTTTATCTGGGAAAATATGCATTGATACATCCGCACAGAGAAGTTTT
TCTCAACTTTACAACTGTGGTGACATTGGATAAGTCTTATGCCACCCAATTGTAACGAGGATAGTAAGAGTAAAAAAAGAACTTCCTGCATCATGAAAGGTACGCAGTTGACTCCTTTCAAGTATCCATTACCACCCAGCATCAGCATGAGGAAACAATAAGCTTCCTGCACCATGAGAGGTATGGGGTTCACTCCTGGC
AAGTATCCTTTATAACTCAATACCCACAAAAGGCACAGGTATTGAGTTATTGGTGGTACCAGTGCCATTTAGGGTATGCACTTTCCAAAAGCTTCAATTTTGCAACCTACCAGCACTTGCTTACAGAGGCTTGGAGCTTTGCTTTGTCATCTCATCTGTCCTAAAAATTGATATCCACTGGCTCTATATGAAAAAATGCA
AGTGTGTTTGCAGCAAGTTTTACAAGATTTTGATCTACTTTGATGGGGGGGGATTTTGTGGTTCGAGTTAACAATTTTTCTTGAGAAGCCCTTCAATCTGCATGCTTGGATGAATGATCAGTGTATTGGCTACTACTTCAATTTTTCTTGAGAAGCCCTTCAATCTGCATGCTTGGATGAATGATCAGTGCATTGGCTAC
TACTAAACATTCAGCGTGCCATAATGATCCGCCAACTACAATGTAACTTGCATCTTGAATTTAAGCTTGCAGTGCGTCATTGGCTCACAACCTCATCAACTAAAATATCCCAAGATAATTAATTCAATGTCTGGACTATTTGTAATAGAAATGTCGC


>TRINITY_DN40066_c0_g1_i7 from sample A9 / Example unspliced isoform:
AAAGAAACCAATTTGTCAGATCATTGGTTTTGTTGCATGGCATCTCCTGTTCATGCTTATCTGGTATTGTGTATTTTCTTCATATAATTTCTTTGGGCAAACCCACCTTACAATAAAATCTGAAGCTGAGTTTCTCGGAATGTTTCCCTTCCCCCTGTTTCCTTCCAGGAAATGTTTTGAAAATGGAAACACCCGTGAAA
CTCCTGGCAAACATTTCCTGTCCTCTGGCCGGAAAAAAGGTCTTCAAATACAGCAAGCACTGTCGAGTATGTGACAAATGTGTTGATGGCTTTGATCATCATTGTCGGTGGCTTAATAACTGCATTGGTAGGAAGAACTACAAGGGCTTTTTCACACTCATGGTATCTGCTCTTTTCCTGCTTATTCTGCAGTGGGTGAT
AGGAATCGTTGTGCTGGTCTCGTGTTTCATAAATCGGAGTCGTTTTGATGTGGAGATCATCTCTAAATTGGGCAGCGGTTTCTCGTTGGTGCCATTTATTGTCGTAGTTGCAGCTTGCACCATACTGGCCATGATTGCTTCACTTCCTCTTGGTCAGCTCTTCTTCTTCCACGTTCTGCTTATGAAAAAGGGCATCAGCA
CTTATGATTACATTATAGCAATGAGGGAACAAGAACAACAAGCTATGGAAGGAGTACAGAGCCCTCAAATGTCAACTGTAAGCTCTGCTACAGTAATGAGCAGTGCAAGTTCCATCAGTGCTTTACACCGGGGTGCATGGTGCACTCCTCCTCGGCTTCTTTTTGAGGATCAGTTCTCTGTGTTGCCACCAGAAGGAGCA
GTGTCTTCTCTTGAGGCAGGGAATAGGAGTGCAAAAAGGAAGCAAGGTGAAAGAGCAAGACAAAGGAACAGTGCGTCAGTTAAGATAAGCCCGTGGACTCTGGCTCGTTTAAATGCTGAAGAGGTGTCAAAGGCAGCTGCCCAAGCAAGGCAAAAGTCGAAAGTTCTGCAGCCTATATCTAGGCAAGATAGTGCATTAAG
GATAGATACGGACAGCAGTTTGGAGAGTAGTAGTAGAGATATAAGCACAGACATCATTTCTCGTTCTCAGTACAAGAAGCGGAATTACAAAAGAGgtaggcaaccatcaccacccagacattttccacaagcaagggcttctaggccaactaggcttcctttgaaaactgcgacagaagcaggctgcagtgttgattatg
atagtgtggatcgtacccatccaattgctgagacttctgctagtttggctcctttacaatttgaggctaggaatgccttctgttctaatctagcaatgtctactggtgggcagattatttcatcacctgaaagtagtttaacttctcctgatattcaacctttcag
AGAATCAACATCAAGCAAAGATCTATCAAACCTT
TTGGCTGCCCCATTATCTTTTACAAAAGGGGTTCATCTCCACAGGTCTACAAGCGATGGATATGAAGCATCTGGAGGAGAGAGTCCAGATGATAGTGACCAGGCTTCTGTAAGCCACTGTAAACCAAACTGGAATAAGATGCTTTTTAATCCTGCTTACACTGAAAAATGCCCAGCAGCAGAGCTACTGCCGAATCAGAT
GAGCATATTGCCTTACAGACCAAACAAAACAAAGTCGACAGGTCAGTCAGCAGGACTGAGGATGCAGGCGAGTAATGGGAAGGGTGTGATGAGAAAGCTTGCAGAGGAATCCCAGTCAACCAATGAAATCAAATTTTGCCCTTCACAGTACGATTCCCCTGAAAGGGTCTAAAGATTGTTTCCATGTGCGAGAGAGTCTG
GCCTGGATAATTATGCTAGGGCAGGGCCTATGGTTTTGGGTTTTGGCTAATACTGTCTTATAAAGACTACAGTTCTCATTTTGTCTCCACGAAGGAGAACCAGAGATGCAAAAAACAAAAATTGTCATTGGTCTACCTCAGCATTGCTGGTTTTGATTAAGTGCCATCAGAGTCATGTTGAAGTCATTCCGTAAATTCCG
ATAGAGTGCCATGGCATGAAGTCACAGAGAGAAATTGATCTGAGTCTTTATCTCTCGATTTCTTTATTATGTTGGGCTATATGCTATAGTATGTGGATTGTTTGGGCCAGTATTCCATTGTTCTGTGATGCCCACCTAAAATATATTTTGGCATCTGCCCGGTTAAGGAAAAAATGCAGCCAAATTTCTTTCATCAGAAT
ATACAAAGGTTTTCATGACTAACAATATGTTAGGGAAGCATAAATGTTTCTGCTACTACTAACCTCTGTACGATGCAAACAGTTACCTTTTAAATCCTACAACAGGCATCATCAACACAAGCTATGCAAAATTTTGTGTTAACCTATTTGAAGTCTCTTTACAAGCTGCATCCCTTCATTTTCTTGGACACAGCAAAACC
TGATCAAGTTGTTTCTATTAAAAATAAATTGGCAGCTGTTGCCAAGCATGTATTGTGCTTTCTAGCTTGATAGGTTTTTGGACAGTCTTTAATCCCTCAAATATTGCGAGTTCAAATAGGTTTTGTGTTTTCAAATTTGTGAGCTCAATTGTAGCTTAGTTGAAACTTGAAAATGATGTCAAGTGAGGTTTATGGACATT
CTTTTGAATCCATTTGGCTTTTGGGATGAAGCTTAGTGACGAAAATAAGTGTTGTACGATAATCATCATGTTGGGGAAGTATGCCAGAGTTGTACAATGCATAGTATTTGTCTGTTTTGGTAAGAGGTAAGGCTGGTGGTGTACTAAGAAAGGAAGACATGCAGTCATCATTAAAACATGTATCGGCACCAATAGTTTTC
TAAGTTCTCTTTTCCCTGGTAATGTTATGAAATATTATTTTATCTGGGAAAATATGCATTGATACATCCGCACAGAGAAGTTTTTCTCAACTTTACAACTGTGGTGACATTGGATAAGTCTTATGCCACCCAATTGTAACGAGGATAGTAAGAGTAAAAAAAGAACTTCCTGCATCATGAAAGGTACGCAGTTGACTCCT
TTCAAGTATCCATTACCACCCAGCATCAGCATGAGGAAACAATAAGCTTCCTGCACCATGAGAGGTATGGGGTTCACTCCTGGCAAGTATCCTTTATAACTCAATACCCACAAAAGGCACAGGTATTGAGTTATTGGTGGTACCAGTGCCATTTAGGGTATGCACTTTCCAAAAGCTTCAATTTTGCAACCTACCAGCAC
TTGCTTACAGAGGCTTGGAGCTTTGCTTTGTCATCTCATCTGTCCTAAAAATTGATATCCACTGGCTCTATATGAAAAAATGCAAGTGTGTTTGCAGCAAGTTTTACAAGATTTTGATCTACTTTGATGGGGGGGGATTTTGTGGTTCGAGTTAACAATTTTTCTTGAGAAGCCCTTCAATCTGCATGCTTGGATGAATG
ATCAGTGTATTGGCTACTACTTCAATTTTTCTTGAGAAGCCCTTCAATCTGCATGCTTGGATGAATGATCAGTGCATTGGCTACTACTAAACATTCAGCGTGCCATAATGATCCGCCAACTACAATGTAACTTGCATCTTGAATTTAAGCTTGCAGTGCGTCATTGGCTCACAACCTCATCAACTAAAATATCCCAAGAT
AATTAATTCAATGTCTGGACTATTTGTAATAGAAATGTCGC




Intron 3 GTATGAGGCT ... ATTGCTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A118.451914
A2251866
A326.6733159
A418.1858.51214
A511.111622
A620420
A730733
A833.33211
A914.752681
A1026.8915110



>TRINITY_DN40276_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform
GTTAGGGTACACCATGCAATCCTAGAGGGCCAAGCGGAGAGGCACTTGGACCTCTGGGCTTTGGGTGGCGAGCCACTAATGAAGGCTAGATGGGAGGGAAAAGGACACCTGGAGTAGTGGTATGGAGAGTAAGATGCACGAATTAAGTACATAAACCAGGTAGGAGTCTCCATGTACAGTGATTAACCATATCCACATTG
GTGAAACCGACATTGGAAAGAATAACCCAACTATTAATTAAGTGGTTTTTAAGGTGGGCAGAAGCAGGAGGGGATATGGGAGGGAGATTTGTAAGCCAAAGTGTGGATGTTAGCATTGAATGCAAAGGCAGCGGGCAGAAGCAAAGGACATGTCAGAGCTCTAAAGAAGCTGCAGGAGTGAACAGGCAGGAGTAAATAGT
AGTAGTGAGTAGGCATCTTCAAAAGGGAGGGAGGGAAAGAAGCAGAAGCTGTGTTTGGGTCATTATCAGATTGTTGGGGGTGTGGGCATTGGGTGTAAGTATTTGGCTTGTATTGTATTCAAAGAATACATTCCTTGAAGTGGGCCTCCATATGTTAGACTGTGTGTTGATGGAGGTCAAAAGAAAAGAAAAAGGAATGA
AAGAACTTCGGTGGAACGAGGGGGCCATTGCATTGTGACAGGCCAAGTAGCAGATGGGCCATTTTAAGGATGATAACCCATAACTTTTTCCTCTTTTTCTTGGGATGTAAATCTTGTAGGGGAGGCCATCTATGATGATGACAACGAGAGGTGATGATTCCAGACAAGTCATGGTGGTTTAGGTCATTCTCTGATGTGTG
TAATGATTGGAAAACATGTTGCGGTGTTCATGTGTGAGGTGGATGCAATGTTTGATCTCTGTATGAACAGTAATAAGACCTGCATTCCTCCACACTGCTGAGCTGTTTCAGCGAGGCCTGGTATGCATCGGTATCTTTTGGGCTCTGTAAAAGACCGAGCCGATCTCTTTCATTGTTTTAGTTCAAGTCATAAGAGTAGG
CAATCAGAGCTGCTAAGAATTCCTCCATAATGAGGAAGCATGGCTGGGAGCTCCCTTATCATCCTCTGCAGGTGGTGGCTGTGGCAGTGTTCCTTGCTCTGGCATTTGCTTTCTACGTTTTCTTCGTGCCCTTTGTTGGGAAGAAGCTGTTCCAATACATTGCCATGGGCCTCTATTCACCTCTGGTATCACTGGTTTTC
TGTCTATATATATGGTGTGCAGCAACTGACCCAGGAGATCCTGGTGTATTCAGATCTAAAAAGTATGGGAAAATTTCCGATCCTAGAAAAGCTTTATACAATGATCCATTACCTGGATCTGCTGCTTCTGTTGATGATGCAAATACTGAATCTATAGGAGAAAAAGTCCAGTCAGAGGGGCCCCTGGTGACTGTATTGCC
TGTAAAGGAATCGAGGAACTTAGATGAAAAGAAAAGTGGCTTCAATAGTCTTTTATCGTTTTGGATTGTTAGTTGTGCCTGTTTCCCTTTTGCTCATATATGCAAGAGTACTTGTTCCAAAAAACAATCTTCAGAGCAGCAAGTTTGTGATGATGACATGCTGTATTGCAGCCTATGTGAAGTGGAGGTCTTCAAATACA
GCAAGCACTGTCGAGTATGTGACAAATGTGTTGATGGCTTTGATCATCATTGTCGGTGGCTTAATAACTGCATTGGTAGGAAGAACTACAAGGGCTTTTTCACACTCATGGTATCTGCTCTTTTCCTGGTATTCGTGGTTTGTACGTCTTGGAATTGGGGTTGCAGCTTATTCTGCAGTGGGTGATAGGAATCGTTGTGC
TGGTCTCGTGTTTCATAAATCGGAGTCGTTTTGATGTGGAGATCATCTCTAAATTGGGCAGCGGTTTCTCGTTGGTGCCATTTATTGTCGTAGTTGCAGCTTGCACCATACTGGCCATGATTGCTTCACTTCCTCTTGGTCAGCTCTTCTTCTTCCACGTTCTGCTTATGAAAAAGGGCATCAGCACTTATGATTACATT
ATAGCAATGAGGGAACAAGAACAACAAGCTATGGAAGGAGTACAGAGCCCTCAAATGTCAACTGTAAGCTCTGCTACAGTAATGAGCAGTGCAAGTTCCATCAGTGCTTTACACCGGGGTGCATGGTGCACTCCTCCTCGGCTTCTTTTTGAGGATCAGTTCTCTGTGTTGCCACCAGAAGGAGCAGTGTCTTCTCTTGA
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>TRINITY_DN40276_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
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