sp|D0EL35|CTC1_ARATH ----> CST complex subunit CTC1
Intron 1 GTGGGTGGCG ... AAATTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 61.54 | 5 | 4 | 12 |
| A2 | 59.38 | 13 | 17 | 21 |
| A3 | 57.63 | 6 | 10 | 6.3 |
| A4 | 45.31 | 9.7 | 11 | 5 |
| A5 | 100 | 0 | 0 | 2 |
| A6 | 55.56 | 18 | 26 | 19 |
| A7 | 43.9 | 23 | 23 | 13 |
| A8 | 48.87 | 34 | 30 | 35 |
| A9 | 56.1 | 18 | 28 | 18 |
| A10 | 50 | 14 | 9 | 19 |
>TRINITY_DN118634_c4_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoformAAATTCCTGTCTGAAGAGAGGCTCAAAGAAGTCCATAAGCGAGGTACAAGAAGTACGATTTACATTAGCACAACGCACACGCAGAGGGGAGGAGAGGAGGGCAATCGAACAGAGATAATAAGAGATATATGGATTATGCGGTGCAATCCATTCAAGACTTGATTCGACAAGCATCTCCACTCACAGGTGCTGTTTCTCTC
GACCCGTTTTCTACTGTTGATTTTCCTTCCTCCGTTCTCCAAACTCCATCCCACCGCAATCTTTCCTCGGCTTCGACCTCGAGGCCTCAAAGTCCTCCGAAGAAACGATTACGTTCAAATCGTGATAACCCTAGCGCCAATTCTGGAACCCAGTGGAAAACTTTAAAGCCTTTGAAACATCCGACCATCATAATTGGAAC
GATACACCTCTGGAACAGCAATTCACATTTCCAGGCTTGTACCTTAAAAGCTGATTGTTTGGCTTTCACAGACCACACCTCTACGATTTGCTGTGTAGTGCTCGACCTCGACCCTCGCGTGATCGGTCGCCAACTTCTAGTTCTGTCATGGAATTTTATACCGGCTAAAACTGGCAGTGGATATCTAGAAATCAATAAAT
GGACATTAGCCGACGAGAATCCTGAGCTGCAGAAGCATAATTTTCCTTCCCTGTATCTCAGTCCTACCGCGGCTCGAACTCGGAACCTTATGTTAGAAACCCTTCCCTGCAAAAGAAGAGTCCACAGTTCTCGCACTACCATCCGCGGCAAATTGTATGCCCTGAGCCCTCCCTTCGTTCTTCCCTGCAAGAAGCCTGAT
ATTATCGCCAAACATAATAATGTTGCCAACAATAGACAAAACGGAGCTTCAAGAATTGACACAATGTCTGATAATGCCTCCAAAGATATCAGATTTGTTAAAAATAGAAAAGATATGACAATGGAGAATGATGCAATTGGCGCCGTCCCTTGCATTCTTCATGTTAAAAGAAAGTTGTTGGGGAAAACGGGTGAAAATAC
ATTTTCGTCTGACCTTCCTGAATACAAATATAGCCTTTTTCAAAAGTCCTCCAAAGACGAAACTGTCAAATCTTTGAATGAAAAGTCAAGGGTCTCATCTGTGGAAGATCATAACAATGAAGACAATGTTATTAAATCTAACAAGAGATCAAGAGTTTCCATGGGAGAAGACAATGGTGAAGCGATAAATGCCAGTAATG
TGGGCACAAAAGCGAGAGTTTTACACAAGGAAAATACTAGCAATGGGGAGCCTTTTACTACAAAAAAAAGAGCCAGGGTATCGTCAGCAGAAAAGGAGGACATAGAGGAAAGTGTGCTTGGCTTCTTGGTGGAACTCCGGGCATGCAATCATGAAATCGTTTGCAAGGCAATTTCGGAAGACTTGCTTTACACGCATGTT
GTCGGGGAGAAACAACATGTTTGTGTGAATCCAGTGTTTGTTTACTTCAGTGGCTCTGTTGCTGCTTGGCGGCCTGTGTTGTCGAGCTTATTTGGCAAATGCCTCACTATTACAGGGTTGAAGAGGAAGTTGATGGTTGTAGGGGAAGAAAAAGAAGAATATAATGCTTTTGTTGCAACCACAACTAGTATATTGTCTTT
AGTATGCCCAGAGAATAACTCACTAGTTCCAACAAATGAATCCAATAGGGAACATTATCAATTGCAAGATGATAATACTTATCGTACGAACAGGGGAATCCAAGCAAGCTTGGTATGCAATGTTTCTAAAACAATAGCTGATATGAATAACGTTGAAGCAACTATTAAAAAGAATGATTACATTCTTAGAAGTGGGAAAA
ATGATGTACCTGCTTGCTTCTCTGCTACACCTGCATTGTTAACTGGCAAGCTGAATAAACAGCGACAGAGCAGAACAGGGTCATATGTTGGTACTGTCACTGGCATCCATATGCAAGGTTTGGTTATAGAGCTTGACGGGAATGTGTGGCTTCTCCTTACCCATCAGCCACTTGCTCAAATACATGGACTTAGAATTGGG
GTTCTACTGGCTTTGAGGCATGTTCACTTCATAAAGATAGAGTTTAAATGGGAAAAAATACTCTTGCTTGGAGCTTGCTTCAAGTCTCACATCGTTGTCAAATCATTTTCACCGCTGAGAGCTCCGTTTAATGCCAGGCCCCATGCAGGCAGTATCTTAAGCAGATTTATCGAGTCTCTTTCTTTTACAGCTGGATTTTG
GGTGTTACTTGTAACTGTATGCTTCAGGCATAAATTTCATGGTATTTTCTCTGAGAAGGAGATTCTAGGTTCAAAAAATCGTGAAGGTATGGTGCAGAGATATGCCCGCTCTTGGTGCTCTTCTTTTCAGTCTTCACATCGGGATGTGTTGAAGGAATTCTTCAATCATGACTGCAGTTGCCCTGTGGGTGAACCTGCCA
AAACTGTATTACAATTGATTGCACCAATAAATAAGTTTTGTAGACAAATTGAAGCCATGTGGGTAGATCAGTCTTCTATGATATGGAAAATGAAAAGAGATACCCTTAGAAAAGCTGCCAGAGAATTAGCTTGTGGGATGGAAGAACCTGCTACCAAGAAAGCACGTGGGATGGAAGAAATTGGTGCCAAGAAATCATGT
GGGATAGAAGAACTTGGTGCCAATAAAGATGTTAGAGGTCGTTTTGTTCGTCGGATCATTTCAAGCAAGGACCTTGGTGTTGTTCTTGTTGGCATTCTACAGGTTTCTCAGGAATCAGGTCAGTTGCAGTTGGTAGATGCAACAGGAGCTGTAGATGTGGTTGTACCAGATTTTGTCTTGCATACATCTTTGGAAATTTT
TTATGAGGTGACAGACTTCAGTGTTGTGGTTGAAGGGTTTTGTGGGCTATTCTGTTCATTAGATACAATTGATTATGTGCAACCACTTTCATGTGCAAGAATCTTTGATGAATTTGTTTCTAAACGCAAGCTTTCTTCAGTAACATATTATGTTCACTTTTACTTGAAGAAGGCTGTTAGTTTCAATGTGCCTAGATGGC
CTGTAGCTTGTGTTAATAAACCTAGTGATATCAAAAGGGAAGAATTACAAGAGGGAGGGATATTCTGGATAATGTTGGTGACACATAAATATCTTATTAATGGCAAGTTAGGTGTTGATAAGGAAGATCATAATGCACGCGGTTCTTTTGCTGAAGCTATTATCCTCCCATATAGTATTGCCACAGAAGATAGAAAACAT
AGTGGTGATAACAGAAGTCTTGTAAAAGAAGAAACTAGGAAAAAATTGGAGCATGATATCTTCACAGATATCAGCACAAGATATTCTTTTGAGGCAGCCACATGTTGCAGCGCAAGAGGAGATAGAGTAGATACAAAGGGATTTGATAATACAAATGTGAAATGCATGTGCAGTATTTCAACTCCAAACAGCTGTGATGG
TGATGGGGTTCAAGATCAGCCCTCAATTTATATTGATAAGGAGCAATTGATTTCTGAAAAATACTACTATAGACAGTCAGAAGAACGACAGAAACTACAGTGTTCTTTGTATTTCAGAAATTTATATAGAGAAGATGTTTTGCTTCATGGCAACCTTTTCATTCTAATTAATCATCTTAAGTCAAAAGAGTTATCAGAGG
AGAATTCTTGCTTAAAGAAAGTCCTCCTGGAATTTGGTTGCCAAAGTTTGAGCTATTACCAGCTACTGCAGATTGGAGATTGTTATTTGATTCAATGCCAAGCTGAGGATTGCTCTTCAGACCCATTCATGGCTTTTTCTTCTTTGAAGACTAGTAAAATTGTGGTGTCATCTCACAACCCTATTTGGAGTCTTTCTATT
GCTTCTTACAATCAGATCACAAGACAAAGTGCCCATCAAATTCCCATTTCTTCTGTAAATGACTACAATACACCACCTTTGACTTTGCAGTTCTATGACATCAATGAACCTACTTCATCAGTGAACCTTAGAGATGTTATGCTTTACATTCCATGTGAAGCAATTGTTATCATACAAGAGTTTATTGAGCATGTCAAAGC
TAACATGATCCCTATAATCATGGGTGTGTATGATGCTTTTGAAAAATGTTTAGCTCACAGAACCATGGTAGGTGCCCCTCCACAATTTTCTAAGGCTACAGTAACTGATAATAGTACCAAATTTGAAGGTAATTTACTGGAGGGAGAGTTGATATCCTTGCATGGAGAAGTTAAAGATGTCCTTTGCAAGGAACTGAATC
CTTTTCTAAAGGAAAATAGAAACAGTTGCAAATGTCTATCTGCAGATATCAGTTCAATCTTTCTTCAGAAAGTAATGTACACTATCCATTTACAAGGCTCACATGGTTCTGAGAAGATCCATCTTCGTGGAATATTCAAGAAATGTGTTTTGCCTCTTGGATTTGGACCAGGAGTGACTGCATCATTTTATCGTGTGCTT
TTACGAAGTGACCCCAATGGAGAACAAGAGTTGTTGATTACTCCAGCATCATCTATTATGGTTAAGGCCACAAAAGAGGTTCTGTATCATGCTAATGGTAGATATAACACTGAAGCCAGTGATCCGTTGCTTACACAGAATGACAGGAACATTAAGGATTCGATTTTGATTTCATGTTTATCTAATGGCATTACTGAAGA
AGGCATAAGACTTTGTTGCAGGGTTGTTTCTGTTCAGAGTTTAGTTCTAGAATGGCAGCCTGGAAAATATGAATCTGCTTGTTCATTGTTAAGAGGTGCCTTAAATTCTATTCAAATAATTTCAGGGACTTTCATTTTAGATGATGGCTCAGGATTATGTGATTGCTGGGCTAGTGGTGTGAGGGCAGCACATCTGCTTA
GTATATATTCAACAGCTAGAGAAATTTTTGAGAACTTGGGATCTCCACACAAGTTTTCAAAGAGAGGTGGAAAGAAGCCTAAGAGTACTGTTGGTTTCTTTCTAGAAAAGTTGGCAAAGAAGCATCGACAAATTACTGTACAAAAGAACAATAGTGTGAGTTCCTCACATGCAAAGTTTATGATCCAAGGAGCTTCAAAG
GAGATTCTAAGTCCAGAAGAGCAAATACTGATTTCGTTTGTCCTTGGAAAGGCATGTGATTCTGCTCCACTGGTGATTATTGGTAGCATTCTTAATTCACCAGATCAAGAAACTGGAGAACAAAGCACGCATGATAAACTCGAAATAACTGGTGATCAGGAGAATTTTAGTACACTTACAGAATGCAGAAGAAAGATTTT
GGCTAGACATGTTTCTGCTGTTAACTACTTACAGGAGGCTGGCAACATTTTTGAAGAGCTCGCCTGTGAAATTTAGTGGAACGGATGCAATGATTCACTTTTTATGTTTTTCAGGTTTGCAAAGTTCTAGTGAAAATGCTTGATTGCATTCCCAGACATTTGTGATTGAGTGAGATCTGTCATGTTTATACCAAAAGGGT
TGCATGGTACACAGCTGGAGGCAATCTAATTAACCAGAGATTGATTTGATATAGTACTCCATCTCGTACTTGTACCTGTTGTATTTGCTGTAAGATGTAATGATAATTCAATACTATTTATTTAATCAGAACTAGGCAATTCAAAGGCTTGATCCATCATGCTAATTTTCATTGAGATCAGATGGTTTAGCCTCATGTGA
AGCTGGTTATGGATTCTGAGGAAGGGAATTTGAAGGAACTTGGAAGGGGCTTTTGACCAACGGAAATAAAATAATATAAAGAAGTTGTTTGGTCTCCATCAAATACAGCTCTTGATATAAGATATGATTGCACTTCGAAGATGATCTTTATAAGGGCATGGATGTTTGAAGAAAACATCAAGAATCCGAAGGAGATTGAC
GATATATGGTGCCGAGTTTATAGGCTGATTCCTTGCATCAATCTGTGCCCCATGGTAATCATTTTATTGTACTAGTAACCACTGCCATCTTTACATAAAGGCAAAGTTGTATATTATATTTCAGGAGAATATGTATTTGTATCATA
>TRINITY_DN118634_c4_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:AAATTCCTGTCTGAAGAGAGGCTCAAAGAAGTCCATAAGCGAGGTACAAGAAGTACGATTTACATTAGCACAACGCACACGCAGAGGGGAGGAGAGGAGGGCAATCGAACAGAGATAATAAGAGATATATGGATTATGCGGTGCAATCCATTCAAGACTTGATTCGACAAGCATCTCCACTCACAGGTGCTGTTTCTCTC
GACCCGTTTTCTACTGTTGATTTTCCTTCCTCCGTTCTCCAAACTCCATCCCACCGCAATCTTTCCTCGGCTTCGACCTCGAGGCCTCAAAGTCCTCCGAAGAAACGATTACGTTCAAATCGTGATAACCCTAGCGCCAATTCTGGAACCCAGTGGAAAACTTTAAAGCCTTTGAAACATCCGACCATCATAATTGGAAC
GATACACCTCTGGAACAGCAATTCACATTTCCAGGCTTGTACCTTAAAAGCTGATTGTTTGGCTTTCACAGACCACACCTCTACGATTTGCTGTGTAGTGCTCGACCTCGACCCTCGCGTGATCGGTCGCCAACTTCTAGTTCTGTCATGGAATTTTATACCGGCTAAAACTGGCAGTGGATATCTAGAAATCAATAAAT
GGACATTAGCCGACGAGAATCCTGAGCTGCAGAAGCATAATTTTCCTTCCCTGTATCTCAGTCCTACCGCGGCTCGAACTCGGAACCTTATGTTAGAAACCCTTCCCTGCAAAAGAAGAGTCCACAGTTCTCGCACTACCATCCGCGGCAAATTGTATGCCCTGAGCCCTCCCTTCGTTCTTCCCTGCAAGAAGCCTGAT
ATTATCGCCAAACATAATAATGTTGCCAACAATAGACAAAACGGAGCTTCAAGAATTGACACAATGTCTGATAATGCCTCCAAAGATATCAGATTTGTTAAAAATAGAAAAGATATGACAATGGAGAATGATGCAATTGGCGCCGTCCCTTGCATTCTTCATGTTAAAAGAAAGTTGTTGGGGAAAACGGGTGAAAATAC
ATTTTCGTCTGACCTTCCTGAATACAAATATAGCCTTTTTCAAAAGTCCTCCAAAGACGAAACTGTCAAATCTTTGAATGAAAAGTCAAGGGTCTCATCTGTGGAAGATCATAACAATGAAGACAATGTTATTAAATCTAACAAGAGATCAAGAGTTTCCATGGGAGAAGACAATGGTGAAGCGATAAATGCCAGTAATG
TGGGCACAAAAGCGAGAGTTTTACACAAGGAAAATACTAGCAATGGGGAGCCTTTTACTACAAAAAAAAGAGCCAGGGTATCGTCAGCAGAAAAGGAGGACATAGAGGAAAGTGTGCTTGGCTTCTTGGTGGAACTCCGGGCATGCAATCATGAAATCGTTTGCAAGGCAATTTCGGAAGACTTGCTTTACACGCATGTT
GTCGGGGAGAAACAACATGTTTGTGTGAATCCAGTGTTTGTTTACTTCAGTGGCTCTGTTGCTGCTTGGCGGCCTGTGTTGTCGAGCTTATTTGGCAAATGCCTCACTATTACAGGGTTGAAGAGGAAGTTGATGGTTGTAGGGGAAGAAAAAGAAGAATATAATGCTTTTGTTGCAACCACAACTAGTATATTGTCTTT
AGTATGCCCAGAGAATAACTCACTAGTTCCAACAAATGAATCCAATAGGGAACATTATCAATTGCAAGATGATAATACTTATCGTACGAACAGGGGAATCCAAGCAAGCTTGGTATGCAATGTTTCTAAAACAATAGCTGATATGAATAACGTTGAAGCAACTATTAAAAAGAATGATTACATTCTTAGAAGTGGGAAAA
ATGATGTACCTGCTTGCTTCTCTGCTACACCTGCATTGTTAACTGGCAAGCTGAATAAACAGCGACAGAGCAGAACAGGGTCATATGTTGGTACTGTCACTGGCATCCATATGCAAGGTTTGGTTATAGAGCTTGACGGGAATGTGTGGCTTCTCCTTACCCATCAGCCACTTGCTCAAATACATGGACTTAGAATTGGG
GTTCTACTGGCTTTGAGGCATGTTCACTTCATAAAGATAGAGTTTAAATGGGAAAAAATACTCTTGCTTGGAGCTTGCTTCAAGTCTCACATCGTTGTCAAATCATTTTCACCGCTGAGAGCTCCGTTTAATGCCAGGCCCCATGCAGGCAGTATCTTAAGCAGATTTATCGAGTCTCTTTCTTTTACAGCTGGATTTTG
GGTGTTACTTGTAACTGTATGCTTCAGGCATAAATTTCATGGTATTTTCTCTGAGAAGGAGATTCTAGGTTCAAAAAATCGTGAAGGTATGGTGCAGAGATATGCCCGCTCTTGGTGCTCTTCTTTTCAGTCTTCACATCGGGATGTGTTGAAGGAATTCTTCAATCATGACTGCAGTTGCCCTGTGGGTGAACCTGCCA
AAACTGTATTACAATTGATTGCACCAATAAATAAGTTTTGTAGACAAATTGAAGCCATGTGGGTAGATCAGTCTTCTATGATATGGAAAATGAAAAGAGATACCCTTAGAAAAGCTGCCAGAGAATTAGCTTGTGGGATGGAAGAACCTGCTACCAAGAAAGCACGTGGGATGGAAGAAATTGGTGCCAAGAAATCATGT
GGGATAGAAGAACTTGGTGCCAATAAAGATGTTAGAGGTCGTTTTGTTCGTCGGATCATTTCAAGCAAGGACCTTGGTGTTGTTCTTGTTGGCATTCTACAGGTTTCTCAGGAATCAGGTCAGTTGCAGTTGGTAGATGCAACAGGAGCTGTAGATGTGGTTGTACCAGATTTTGTCTTGCATACATCTTTGGAAATTTT
TTATGAGGTGACAGACTTCAGTGTTGTGGTTGAAGGGTTTTGTGGGCTATTCTGTTCATTAGATACAATTGATTATGTGCAACCACTTTCATGTGCAAGAATCTTTGATGAATTTGTTTCTAAACGCAAGCTTTCTTCAGTAACATATTATGTTCACTTTTACTTGAAGAAGGCTGTTAGTTTCAATGTGCCTAGATGGC
CTGTAGCTTGTGTTAATAAACCTAGTGATATCAAAAGGGAAGAATTACAAGAGGGAGGGATATTCTGGATAATGTTGGTGACACATAAATATCTTATTAATGGCAAGTTAGGTGTTGATAAGGAAGATCATAATGCACGCGGTTCTTTTGCTGAAGCTATTATCCTCCCATATAGTATTGCCACAGAAGATAGAAAACAT
AGTGGTGATAACAGAAGTCTTGTAAAAGAAGAAACTAGGAAAAAATTGGAGCATGATATCTTCACAGATATCAGCACAAGATATTCTTTTGAGGCAGCCACATGTTGCAGCGCAAGAGGAGATAGAGTAGATACAAAGGGATTTGATAATACAAATGTGAAATGCATGTGCAGTATTTCAACTCCAAACAGCTGTGATGG
TGATGGGGTTCAAGATCAGCCCTCAATTTATATTGATAAGGAGCAATTGATTTCTGAAAAATACTACTATAGACAGTCAGAAGAACGACAGAAACTACAGTGTTCTTTGTATTTCAGAAATTTATATAGAGAAGATGTTTTGCTTCATGGCAACCTTTTCATTCTAATTAATCATCTTAAGTCAAAAGAGTTATCAGAGG
AGAATTCTTGCTTAAAGAAAGTCCTCCTGGAATTTGGTTGCCAAAGTTTGAGCTATTACCAGCTACTGCAGATTGGAGATTGTTATTTGATTCAATGCCAAGCTGAGGATTGCTCTTCAGACCCATTCATGGCTTTTTCTTCTTTGAAGACTAGTAAAATTGTGGTGTCATCTCACAACCCTATTTGGAGTCTTTCTATT
GCTTCTTACAATCAGATCACAAGACAAAGTGCCCATCAAATTCCCATTTCTTCTGTAAATGACTACAATACACCACCTTTGACTTTGCAGTTCTATGACATCAATGAACCTACTTCATCAGTGAACCTTAGAGATGTTATGCTTTACATTCCATGTGAAGCAATTGTTATCATACAAGAGTTTATTGAGCATGTCAAAGC
TAACATGATCCCTATAATCATGGGTGTGTATGATGCTTTTGAAAAATGTTTAGCTCACAGAACCATGGTAGGTGCCCCTCCACAATTTTCTAAGGCTACAGTAACTGATAATAGTACCAAATTTGAAGGTAATTTACTGGAGGGAGAGTTGATATCCTTGCATGGAGAAGTTAAAGATGTCCTTTGCAAGGAACTGAATC
CTTTTCTAAAGGAAAATAGAAACAGTTGCAAATGTCTATCTGCAGATATCAGTTCAATCTTTCTTCAGAAAGTAATGTACACTATCCATTTACAAGGCTCACATGGTTCTGAGAAGATCCATCTTCGTGGAATATTCAAGAAATGTGTTTTGCCTCTTGGATTTGGACCAGGAGTGACTGCATCATTTTATCGTGTGCTT
TTACGAAGTGACCCCAATGGAGAACAAGAGTTGTTGATTACTCCAGCATCATCTATTATGGTTAAGGCCACAAAAGAGGTTCTGTATCATGCTAATGGTAGATATAACACTGAAGCCAGTGATCCGTTGCTTACACAGAATGACAGGAACATTAAGGATTCGATTTTGATTTCATGTTTATCTAATGGCATTACTGAAGA
AGGCATAAGACTTTGTTGCAGGGTTGTTTCTGTTCAGAGTTTAGTTCTAGAATGGCAGCCTGGAAAATATGAATCTGCTTGTTCATTGTTAAGAGGTGCCTTAAATTCTATTCAAATAATTTCAGGGACTTTCATTTTAGATGATGGCTCAGGATTATGTGATTGCTGGGCTAGTGGTGTGAGGGCAGCACATCTGCTTA
GTATATATTCAACAGCTAGAGAAATTTTTGAGAACTTGGGATCTCCACACAAGTTTTCAAAGAGAGGTGGAAAGAAGCCTAAGAGTACTGTTGGTTTCTTTCTAGAAAAGTTGGCAAAGAAGCATCGACAAATTACTGTACAAAAGAACAATAGTGTGAGTTCCTCACATGCAAAGTTTATGATCCAAGGAGCTTCAAAG
GAGATTCTAAGTCCAGAAGAGCAAATACTGATTTCGTTTGTCCTTGGAAAGGCATGTGATTCTGCTCCACTGGTGATTATTGGTAGCATTCTTAATTCACCAGATCAAGAAACTGGAGAACAAAGCACGCATGATAAACTCGAAATAACTGGTGATCAGGAGAATTTTAGTACACTTACAGAATGCAGAAGAAAGATTTT
GGCTAGACATGTTTCTGCTGTTAACTACTTACAGGAGGCTGGCAACATTTTTGAAGAGCTCGCCTGTGAAATTTAGTGGAACGGATGCAATGATTCACTTTTTATGTTTTTCAGGTTTGCAAAGTTCTAGTGAAAATGCTTGATTGCATTCCCAGACATTTGTGATTGAGTGAGATCTGTCATGTTTATACCAAAAGGGT
TGCATGGTACACAGCTGGAGGCAATCTAATTAACCAGAGATTGATTTGATATAGTACTCCATCTCGTACTTGTACCTGTTGTATTTGCTGTAAGATGTAATGATAATTCAATACTATTTATTTAATCAGAACTAGGCAATTCAAAGGCTTGATCCATCATGCTAATTTTCATTGAGATCAGATGGTTTAGCCTCATGTGA
AGCTGGTTATGGATTCTGAGGAAGGGAATTTGAAGGAACTTGGAAGGGGCTTTTGACCAACGGAAATAAAATAATATAAAGAAGTTGTTTGGTCTCCATCAAATACAGCTCTTGATATAAGATATGATTGCACTTCGAAGATgtgggtggcggtaaattctatttttttatattctggctttgaagatgcaccagagcag
acatcttggactactgactcagtttctattctgtattgactttatcaaatttacagGATCTTTATAAGGGCATGGATGTTTGAAGAAAACATCAAGAATCCGAAGGAGATTGACGATATATGGTGCCGAGTTTATAGGCTGATTCCTTGCATCAATCTGTGCCCCATGGTAATCATTTTATTGTACTAGTAACCACTGCC
ATCTTTACATAAAGGCAAAGTTGTATATTATATTTCAGGAGAATATGTATTTGTATCATA
Intron 2 GTGCCTTAAA ... TTCATTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 76.27 | 7 | 20 | 25 |
| A2 | 61.9 | 12 | 25 | 14 |
| A3 | 78.26 | 5 | 17 | 19 |
| A4 | 58.49 | 11 | 15 | 16 |
| A5 | 53.85 | 6 | 5 | 9 |
| A6 | 86.67 | 1 | 6 | 7 |
| A7 | 81.48 | 5 | 21 | 23 |
| A8 | 73.33 | 8 | 23 | 21 |
| A9 | 75 | 6 | 16 | 20 |
| A10 | 75.76 | 4 | 13 | 12 |
>TRINITY_DN128350_c1_g2_i3 from sample A1 / Example spliced isoformAGAGGCTCAAAGAAGTCCATAAGCGAGGTACAAGAAGTACGATTTACATTAGCACAACGCACACGCAGAGGGGAGGAGAGGAGGGCAATCGAACAGAGATAATAAGAGATATATGGATTATGCGGTGCAATCCATTCAAGACTTGATTCGACAAGCATCTCCACTCACAGGTGCTGTTTCTCTCGACCCGTTTTCTACTG
TTGATTTTCCTTCCTCCGTTCTCCAAACTCCATCCCACCGCAATCTTTCCTCGGCTTCGACCTCGAGGCCTCAAAGTCCTCCGAAGAAACGAAAACGTTCAAATCGTGATAACCTTGGCGCCAATTCTGGAACCCAGTGGAAAACTTTAAAGCCTTTGAAACATCCGACCATCATAATTGGAACGATACACCTCTGGAAC
AGCAATTCACATTTCCAGGCTTGTACCTTAAAAGCTGATTGTTTGGCTTTCACAGACCACACCTCTACGATTTGCTGTGTAGTGCTCGACCTCGACCCTCGCGTGATCGGTCGCCAACTTCTAGTTCTGTCATGGAATTTTATACCGGCTAAAACTGGCAGTGGATATCTAGAAATCAATAAATGGACATTAGCCGACGA
GAATCCTGAGCTGCAGAAGCATAATTTTCCTTCCCTGTATCTCAGTCCTACCGCGGCTCGAACTCGGAACCTTATGTTAGAAACCCTTCCCTGCAAAAGAAGAGTCCACAGTTCTCGCACTACCATCCGCGGCAAATTGTATGCCATGAGCCCTCCCTTCGTTCTTCCCTGCAAGAAGCCTGATATTATCGCCAAACATA
ATAATGTTGCCAACACTAGACAAAACGGAGCTTCAAGAATTGACACAATGTCTGATAATGCCTCCAAAGATATCAGATTTGTTAAAAATAGAAAAGATACGACAATGGAGAATGATGCAATTGGCGCCGTCCCTTGCATTCTTCATGTTAAAAGAAAGTTGTTGGGGAAAACGGGTGAAAATACATTTTCGTCTGACCTT
CCTGAATACAAATATAGCCTTTTTCAAAAGTCCTCCAAAGACGAAACTGTCAAATCTTTGAATGAAAAGTCAAGGGTCTCATCTGTGGAAGATCATAACAATGAAGACAATGTTATTAAATCTAACAAGAGATCAAGAGTTTCCATGGGAGAAGACAATGGTGAAGCGATAAATGCCAGTAATGTGGGCACAAAAGCGAG
AGTTTTACACAAGGAAAATACTAGCAATGGGGAGCCTTTTACTACAAAAAAAAGAGCCAGGGTATCGTCAGCAGAAAAGGAGGACATAGAGGAAAGTGTGCTTGGCTTCTTGGTGGAACTCCGGGCATGCAATCATGAAATCGTTTGCAAGGCAATTTCGGAAGACTTGCTTTACACGCATGTTGTCGGGGAGAAACAAC
ATGTTTGTGTGAATCCAGTGTTTGTTTACTTCAGTGGCTCTGTTGCTGCTTGGCGGCCTGTGTTGTCGAGCTTATTTGGCAAATGCCTCACTATTACAGGTTTGAAGAGGAAGTTGATGGTTGTAGGGGAAGAAAAAGAAGAATATAATGCTTTTGTTGCAACCACAACTAGTATATTGTCTTTAGTATGCCCAGAGAAT
AACTCACTAGTTCCAACAAATGAATCCAATAGGGAACATTATCAATTGCAAGATGATAATACTTATCGTACGAACAGGGGAATCCAAGCAAGCTTGGTATGCAATGTTTCTAAAACAATAGCTGATATGAATAACGTTGAAGCAACTATTAAAAAGAATGATTACATTCTTAGAAGTGGGAAAAATGATGTACCTGCTTG
CTTCTCTGCTACACCTGCATTGTTAACTGGCAAGCTGAATAAACAGCGACAGAGCAGAACAGGGTCATATGTTGGTACTGTCACTGGCATCCATATGCAAGGTTTGGTTATAGAGCTTGACGGGAATGTGTGGCTTCTCCTTACCCATCAGCCACTTGCTCAAATACATGGACTTCGAATTGGGGTTCTACTGGCTTTGA
GGCATGTTCACTTCATAAAGATAGAGTTTAAATGGGAAAAAATACTCTTGCTTGGGGCTTGCTTCAAGTCTCACATCGTTGTCAAATCATTTTCACCGCTGAGAGCTCCGTTTAATGCCAGGCCCCATGCAGGCAGTATCTTAAGCAGATTTATCGAGTCTCTTTCTTTTACAGCTGGATTTTGGGTGTTACTTGTAACT
GTATGCTTCAGGCATAAATTTCATGGTATTTTCTCTGAGAAGGAGATTCTAGGTTCAAAAAATCGTGAAGGTATGGTGCAGAGATATGCCCGCTCTTGGTGCTCTTCTTTTCAGTCTTCACATCGGGATGTGTTGAAGGAATTCTTCAATCATGACTGCAGTTGCCCTGTGGGTGAACCTGCCAAAACTGTATTACAATT
GATTGCACCAATAAATAAGTTTTGTAGACAAATTGAAGCCATGTGGGTAGATCAGTCTTCTATGATATGGAAAATGAAAAGAGATACCCTTAGAAAAGCTGCCAGAGAATTAGCTTGTGGGATGGAAGAACCTGCTACCAAGAAAGCACGTGGGATGGAAGAAATTGGTGCCAAGAAATCATGTGGGATAGAAGAACTTG
GTGCCAATAAAGATGTTAGAGGTCGTTTTGTTCGTCGGATCATTTCAAGCAAGGACCTTGGTGTTGTTCTTGTTGGCATTCTACAGGTTTCTCAGGAATCAGGTCAGTTGCAGTTGGTAGATGCAACAGGAGCTGTAGATGTGGTTGTACCAGATTTTGTCTTGCATACATCTTTGGAAATTTTTTATGAGGTGATAGAC
TTCAGTGTTGTGGTTGAAGGGTTTTGTGGGCTATTCTGTTCATTAGATACAATTGATTATGTGCAACCACTTTCATGTGCAAGAATCTTTGATGAATTTGTTTCTAAACGCAAGCTTTCTTCAGTAACATATTATGTTCACTTTTACTTGAAGAAGGCAGTTAGTTTCAATGTGCCTAGATGGCCTGTAGCTTGTGTTAA
TAAACCTAGTAATATCAAAAGGGAAGAATTACAAGAGGGAGGGATATTCTGGATAATGTTGGTGACACATAAATATCTTATTAATGGCAAGTTAGGTGTTGATAAGGAAGATCATAATGCACGCGGTTCTTTTGCTGAAGCTATTATCCTCCCATATAGTATTGCCACAGAAGATAGAAAACATAGTGGTGATAACAGAA
GTCTTGTAAAAGAAGAAACTAGGAAAAAATTGGAGCATGATATCTTCACAGATATCAGCACAAGATATTCTTTTGAGGCAGCCACATGTTCCAGCACAAGAGGAGATAGAGTAGATACAAAGGGATTTGATAATACAAATGTGAAATGCATGTGCAGTATTTCAACTCCAAACAGCTGTGATGGTGATGGGGTTCAAGAT
CAGCCCTCAATTTATTTTGATAAGGAGCAATTGATTTCTGAAAAATACTACTATAGACAGTCAGAAGAACGACAGAAACTACAGTGTTCTTTGTATTTCAGAAATTTATATAGAGAAGATGTTTTGCTTCATGGCAACCTTTTCATTCTAATTAATCATCTTAAGTCAAAAGAGTTATCAGAGGAGAATTCTTGCTTAAA
GAAAGTCCTCCTGGAATTTGGTTGCCAAAGTTTGAGCTATTACCAGCTACTGCAGATTGGAGATTGTTATTTGATTCAATGCCAAGCTGAGGATTGCTCTTCAGACCCATTCATGGCTTTTTCTTCTTTGAAGACTAGTAAAATTGTGGTGTCATCTCACAACCCTATTTGGAGTCTTTCTATTGCTTCTTACAATCAGA
TCACAAGACAAAGTGCCCATCAAATTCCCATTTCTTCTGTAAATGACTACAATACACCACCTTTGACTTTGCAGTTCTATGACATCAATGAACCTACTTCATCAGTGAACCTTAGAGATGTTATGCTTTACATTCCATGTGAAGCAATTGTTATCATACAAGAGTTTATTGAGCATGTCAAAGCTAACATGATCCCTATA
ATCATGGGTGTGTATGATGCTTTTGAAAAATGTTTAGCTCACAGAACCATGGTAGGTGCCCCTCCACAATTTTCTAAGGCTACAGTAACTGATAATAGTACCAAATTTGAAGGTAATTTACTGGAGGGAGAGTTGATATCCTTGCATGGAGAAGTTAAAGATGTCCTTTGCAAGGAACTGAATCCTTTTCTAAAGGAAAA
TAGAAACAGTTGCAAATGTCTATCTGCAGATATCAGTTCAATCTTTCTTCAGAAAGTAATGTACACTATCCATTTACAAGGCTCACATGGTTCTGGGAAGATCCATCTTCGTGGAATATTCAAGAAATGTGTTTTGCCTCTTGGATTTGGACCAGGAGTGACTGCATCATTTTATCGTGTGCTTTTACGAAGTGACCCCA
ATGGAGAACAAGAGTTGTTGATTACTCCAGCATCATCTATTATGGTTAAGGCCACAAAAGAGGTTCTGTATCATGCTAATGGTAGATATAACACTGAAGCCAGTGATCCGTTGCTTACACAGAATGACAGGAACATTAAGGATTCGATTTTGATTTCATGTTTATCTAATAGCATTACTGAAGAAGGCATAAGACTTTGT
TGCAGGGTTGTTTCTGTTCAGAGTTTAGTTCTAGAATGGCAGCCTGGAAAATATGAATCTGCTTGTTCATTGTTAAGAGATGATGGCTCAGGATTATGTGATTGCTGGGCTAGTGGTGTGAGGGCAGCACATCTTCTTAGTATATATTCAACAGCTAGAGAAATTTTTGAGAACTTGGGATCTCCACACAAGTTTTCAAA
GAGAGGTGGAAAGAAGCCTAAGAGTACTGTTGGTTTCTTTCTAGAAAAGTTGGCAAAGAAGCATCGACAAATTACTGTACAAAAGAACAATAGTGTGAGTTCCTCACATGCAAAGTTTATGATCCAAGGAGCTTCAAAGGAGATTCTAAGTCCAGAAGAGCAAATACTGATTTCGTTTGTCCTTGGAAAGGCATGTGATT
CTGCTCCACTGGTGATTATTGGTAGCATTCTTAATTCACCAGATCAAGAAACTGGAGAACAAAGCACGCATGATAAACTCGAAATAACTGGTGATCAGGAGAATTTTAGTACACTTACAGAATGCAGAAGAAAGATTTTGGCTAGACATGTTTCTGCTGTTAACTACTTACAGGAGGCTGGCAACATTTTTGAAGAGCTT
GCCTGTGAAATTTAGTGGAACAGATACAATGATTCACTTTTTATGTTTTTCAGGTTTGCAAAGTTCTAGTGAAAATGCTTGATTGCATTCCCAGACATTTGTGATTGAGTGAGATCTGTCATGTTTATACCAAAAGGGTTGCATGGTACACAGCTGGAGGCAATCTAATTAACCAGAGATTGATTTGATATAGTACTCCA
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>TRINITY_DN128350_c1_g2_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:AGAGGCTCAAAGAAGTCCATAAGCGAGGTACAAGAAGTACGATTTACATTAGCACAACGCACACGCAGAGGGGAGGAGAGGAGGGCAATCGAACAGAGATAATAAGAGATATATGGATTATGCGGTGCAATCCATTCAAGACTTGATTCGACAAGCATCTCCACTCACAGGTGCTGTTTCTCTCGACCCGTTTTCTACTG
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