sp|A8MQA3|PP330_ARATH ----> Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21065


Intron 1 GTTAATAAAT ... CATAAAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A184.62174
A266.67113
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A4100087
A571.43264
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A773.33256
A836.5913105
A966.67122
A1086.67194



>TRINITY_DN37684_c1_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform
ATTGGAAACCCCCATAATTTGGTCGCCTGCCACGATTCCAGAGCATCCGACCACCCGAGGGATTGATGATGGCCCCGAAACACATAAGAATATGACTCGATCTACTCCACTACACAGATATTTGGCTCGATTGGTGCCATATTTTTGGCTTTGGCGGTAGGGGAGGGCATTTGGGTTTGAGAGGCCATTTAATAACTCAC
GCTGGTTGGAAATTGAGTTTGGGGTTTGGGAAATTATCTATATATTTGGACTTGTTGTAATGCAGAAAGACACAACAGCACAGGGCAGAACTTGGAGCACAAAGACAGAATTTGGAAGCTTCTGAAGAGGCGAGCGAGGGCTTCTGCAACAACACAGCTCAAATCTACGTCTTCTTGTCAGAGTGGACATGAAGCCTATG
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AATGTAGAGTTTTATCGCGGAAGAGTTGGTCTTTATGCAAATAAGGCCTATTATGTTCCTCAGAGTTTTATGTAGGCGGAAGAGTTGGTCTTTATGCAAATAAGGCCTATTCTAGGGTTTTATCGCCACTCTTCTGTAATGGGCTTTTACTTAACACAGCCCTGGTATTCTGCAATGGATAACACATTGAAATATGTAGA
TTTGCTGTCTGGTTTCAGTATAC


>TRINITY_DN37684_c1_g1_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:
ATTGGAAACCCCCATAATTTGGTCGCCTGCCACGATTCCAGAGCATCCGACCACCCGAGGGATTGATGATGGCCCCGAAACACATAAGAATATGACTCGATCTACTCCACTACACAGATATTTGGCTCGATTGGTGCCATATTTTTGGCTTTGGCGGTAGGGGAGGGCATTTGGGTTTGAGAGGCCATTTAATAACTCAC
GCTGGTTGGAAATTGAGTTTGGGGTTTGGGAAATTATCTATATATTTGGACTTGTTGTAATGCAGAAAGACACAACAGCACAGGGCAGAACTTGGAGCACAAAGACAGAATTTGGAAGCTTCTGAAGAGGCGAGCGAGGGCTTCTGCAACAACACAGCTCAAATCTACGTCTTCTTGTCAGgttaataaataccctgttt
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TGAATGGATTGTTTGAGGAAAGGTTGGAATGCTATTGCCAAATGCAACGAGCAGGTACGTTGCCCAATAACTTCACTTTTCCTTTTTCCCTCAAGGCATGTGCTGCCTTATCAGCTCTATAAGAGGGAAAACAGATTCATGGTCATGTAGTCAGAAATGGGCTTGATTTGGATGTTTTTGTGGCGAATGCCCTTGTGGAA
ATGTATGCCAAATGTGGTAGTTTGGATATTGCACACCAACTGTTCGACAAAATGCCCGAACGAGATGTTCTCTCATGGAATGCAATGATAGTAGGGTATGCTGAGAATGGGAAATCCCTTGAAGTCTTGGGAATTTTTAACGAAATGCAATAGACAGAGATTGTGCCAGATTCCATTACAGTGAAAACCCTGCTCCCCGC
ATGCGCTCATTTAGCAGCTATCCAGGAGGGCAAACTGATCCATGGATTTGTAATTCGAAGTGATCTTGTTTCAGATGTGTCAGTTGGGAATTCTCTCATTGATATGTATGCGAAATGTGGCAATGTAGAGTTTTATCGCGGAAGAGTTGGTCTTTATGCAAATAAGGCCTATTATGTTCCTCAGAGTTTTATGTAGGCGG
AAGAGTTGGTCTTTATGCAAATAAGGCCTATTCTAGGGTTTTATCGCCACTCTTCTGTAATGGGCTTTTACTTAACACAGCCCTGGTATTCTGCAATGGATAACACATTGAAATATGTAGATTTGCTGTCTGGTTTCAGTATAC