sp|Q9SY55|ECA3_ARATH ----> Calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type
Intron 1 GTTGATATAA ... ATGGTGTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 65.79 | 13 | 0 | 25 |
| A2 | 51.85 | 13 | 4 | 14 |
| A3 | 44.44 | 25 | 18 | 20 |
| A4 | 66.67 | 11 | 1 | 22 |
| A5 | 56.52 | 10 | 4 | 13 |
| A6 | 42.11 | 11 | 5 | 8 |
| A7 | 50 | 5 | 0 | 5 |
| A8 | 66.67 | 2 | 0 | 4 |
| A9 | 50 | 4 | 0 | 4 |
| A10 | 50 | 2 | 0 | 2 |
>TRINITY_DN118706_c0_g1_i18 from sample A3 / Example spliced isoformTCGTCAGTGACTACCCAAAACCTTAGACCGACACCAATACATGAAAACGAAAAACAATAACTAAAACTTACTCGCAAACTATTCTTCATCTCCACTCCTCAACTTTTAGGAGAAGAATCCTAAAGCGTACAATGTACAACAAGTCACAGAGCGCACACGTCCAATAAACCCCTCTATGTTTTTTTCCTTAAATTATTACC
ACGGCAGATGGATAACTAGAGTTATATTTCGTAATCAGCCCGAAAAATCACTCTCCCTTTAATGCATCTTGTTTCAACTCTTTTCCACACCCTGCTCTGCTTTACGGGAAAAAAATGGAGGACGCTTACGCCAGATCTGTAACCGAGGTTCTTGAAGCTTTCGGGGTCGACCCTGCTAAAGGTCTCACAGATTCGCAGGT
TGCTGAACATGCAAGGATTTACGGCAGAAATGCGCTGCCTGAAGAACCCTGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTAAAAATATTGATCGCAGCTGCTGTGATTTCTTTTATATTGGCTGTGATTGATGGAGAAACAGGACTTGGTGCTTTTTTGGAACCTTCTGTTATATTATTGA
TCCTGGCAGCTAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAGTAAGTCTCGAATGCCACACCTCATTCTTGTTTTAGAATGTTTTTGAAAAATTAGATATGTTTATTTTTGAATTTTTGGATTTAGGGACACAGGAAATAATCATCAAAAACAGGTAAGGCAAATGGATATAGAAAATC
ATATTCCTTTATATCCTCCACTTATTTATATTGCTAAAACTAGATATAGAGATGTGATTCATGTTCTCCATTTTTGACTTGTAAGTTGTCAATTTTATGTTATCTTTAGCCTTTACTTCCTAGTGGCACTTAAAACATTCATGTTTTTTCATATTATAATTTCATGTGTGCACATATGTCCTCAGGTGTGCTGTTAATAA
GTAAGCTACTTTAGGTCTAAACTATTGAGATCCTGATGTGTAACGATGACCAAGTTTGTCATGCTGGGGCTAGAGTTGTTGTTTGAGGGATCATATCATTTTGGAGGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTTGCAACTGTATTGAGGAATGGCCTTTTATCAATCATTCCAGCATCAGATCTTGTTCCAGGGGATATAG
TTGAAGTTGGAGTTGGATGCAAAGTTCCAGCTGATATGCGAGTCATCAAAATGTTCGGTAACCAGTTGCGTGTAGATCAAGCGATACTAACTGGTGAGAGTTGTTCGGTGGGAAAAGAATTGGGTGTTGCATGTACAACCAAAGCTGTCTATCAAGACAAGACGAACATTCTCTTTTCTGGAACTGTTGTCGCAACTGGA
CGGGCAAAAGCGATTGTTGTTGGTGTTGGCTCTAACACAGCAATGGGAAGTATTCGTGATGCAATGTTAAGGACAGAAGATGAATCGACACCACTAAAGAAAAAGCTAGATGAATTTGGTGCCTTTCTCGCTAAGGTTATTGCAGTGATTTGTGTTTTAGTATGGGTTGTAAATATCGGTCATTTTCATGACCCTGCTCA
TGGTGGTATCTTGCGTGGAGCTATCCATTATTTCAAGATTGCTGTTGCTCTAGCAGTTGCTGCCATTCCAGAAGGCCTTCCAGCTGTTGTTACAACGTGCCTTGCACTTGGGACAAAGAGGATGGCAAAGTTGAATGCTATTGTGCGGTCTCTACCTTCTGTCGAGACACTAGGATGCACGACAGTGATTTGCAGTGACA
AGACAGGCACTCTAACGACCAATATGATGTCTGTTTCTAAGATTTGTGTAATTCGTTCTGTTCATCACGGTCCTGTCTCGGCAGAATATACAGTCACCGGGACAACATACGCTCCAGACGGTGTCATTTATGATTCTGCTGGTTTACAGCTTCAACATCCTGCACATTTTCCCTGCTTGCTTCACATAGCTATGTGTTCG
GCTCTGTGCAATGACTCAAGCTTGCAGTATAATCCAGACAAGGGAGCATATGAAAAAATTGGAGAGTCTACAGAAGTTGCTCTCCGTGTTCTTGCAGAAAAGGTTGGCTTGCCAGGTTTTGATTCAATGCCATCTGCATTAAATATGCTGAGCAAACATGAACGTGCGTCTTACTGCAATCATTATTGGGAGCATCAATT
TAGAAAGGTTGCTGTTTTGGAATTTTCCCGAGATCGTAAGATGATGAGTGTTCTTTGTAGTCGTAAGCAACAAGAAATTATGTTTTCAAAAGGTGCTCCAGAGAGTATTATTGCTCGATGCTCAAATGTTCTTTGTAATGATGATGGCTCTGCTATACCTCTAACTGTTGATGTTAGATCAGAGTTGGAGAACAGGTTCC
ATAGCTTTGGGCAAAAGGAGACATTGAGGTGTTTAGCTCTTGCTTTGAAACGGATGCCACCGGGCCAGCAATCATTGAATTTTGAGGACGAGTCAAATCTTACGTTTATTGGCTTGGTTGGAATGCTTGATCCACCAAGAGCTGAGGTGAGGAATGCCATACAAACATGCATGTCTGCTGGAATACGTGTTATTGTGGTC
ACGGGTGACAACAAGTCAACAGCAGAGTCTGTTTGTCGCCGAATTGGAGCCTTTGATCCATTGGATGACCTAGTTGGGCGTTCATACACTGCATCAGAGTTTGAGGAGTTATCACCCATACAAAGAGCAATAGCTCTACAACGCATGGTACTATTTTCAAGGGTTGAACCAGCTCACAAAAGGATGCTTGTTGAAGCCCT
ACAGCACCAAAACGAAGTGGTTGCAATGACAGGTGACGGAGTAAATGATGCACCAGCTCTCAAAAAAGCAGATATAGGAATTGCCATGGGATCTGGAACTGCTGTTGCAAAGGGTGCTTCTGATATGGTGTTAACTGATGATAACTTTGCCTCAATTGTTGCAGCTGTTGCAGAAGGGCGGGCCATATATAATAATACGA
AACAGTTCATCCGTTATATGATCTCCTCGAACATTGGAGAAGTAGTGTGCATATTTGTGGCTGCTGTCCTTGGAATGCCAGAGACCCTTGTACCTGTGCAACTCCTCTGGGTGAATTTAGTGACGGATGGATTACCTGCAACTGCTATTGGATTTAATAAGCAGGATCGCAAAGTAATGATGGTGAGACCTCGAAAGGTT
AATGAAGCTATCGTTAATGGCTGGCTATTCTTCCGCTATTTGGTGATAGGTGCTTATGTCGGTCTTGCTACTATTGCGGGTTTTGCATGGTGGTTTCTATATTATGAAGGTGGCCCAAAATTACCCTACAGAGAACTCGTTAATTTTGATACATGTTCACAGAGAGAAACAACCTATTCATGCAACATATTTGAAGATCG
GCATCCATCAACAGTCTCAATGAGTGTACTTGTGGTGGTTGAGATGTTTAATGCACTAAATAACCTTAGTGAAAACCAAAGTCTTCTCGTTCTTCCTCCATGGAGTAATTTATGGCTGGTATCATCGATTATTTTGACTATGATTCTTCATATATTGATACTTTATGTACAACCATTATCCATTCTGTTTTCAGTAACAC
CATTGTCATGGACTGAATGGAAAGCTGTTCTCTTTCTTTCGTTTCCTGTAATTTTAGTTGATGAGATCCTAAAGTTTTCCTCCAGAAATCTTAAAGGAAAAAATATTCGCTTCAGGTTCCGTAAGCGTGATTCAATACCTAGAACCCAGTTGCATGATAAATAAAGGCATTACGAGTTCTTTTCCCATGAAAAGATTCAA
TTTTGTATTTACTATTATTTTGTAAGGCCATTATCGAAGGATGTACAATGAAGTTACAGAGGAAAGGCGTTTACTCTGGAACAAGGAACCTTACAAGGGAATTTTCTCTGTACCTCTTTGCCAATGAAGGAGAGAATCAATCTACTTGTGAAATTCGAAAAGACTAGCACAAATTAATGGAATATCTTTCGATGTTAGAG
GAAAAAATAAGGCAACAGTGGTGAGGAGAAAAGATTAAGATTCTTTGGAGAACAAATGATATCTTTTATGCATTTACAGAGAAACAGTTAAGCATTTGACTATTTGTAACATGTTTTTTATAATATATTTACATGGTAACATGATTTACGCTCATTTACCGTCTAAATTCTCAAGCCGACAGTGAGATTTGAATCAAATG
TATTTTAAGATAAATTTAGCCTAATCATTTTGAGAAGGATTAATGAAATCTGGGATTCCAACTCATTAACTTCCCTACAAAATACACGGGTTTTACTTTTCCCTTAGCCTTGGTTAATCATAGAGTTGGCGATTGGTTGGGAATAATAGACAAAAGTGAGAATAAAAT
>TRINITY_DN118706_c0_g1_i10 from sample A3 / Example unspliced isoform:TCGTCAGTGACTACCCAAAACCTTAGACCGACACCAATACATGAAAACGAAAAACAATAACTAAAACTTACTCGCAAACTATTCTTCATCTCCACTCCTCAACTTTTAGGAGAAGAATCCTAAAGCGTACAATGTACAACAAGTCACAGAGCGCACACGTCCAATAAACCCCTCTATGTTTTTTTCCTTAAATTATTACC
ACGGCAGATGGATAACTAGAGTTATATTTCGTAATCAGCCCGAAAAATCACTCTCCCTTTAATGCATCTTGTTTCAACTCTTTTCCACACCCTGCTCTGCTTTACGGGAAAAAAATGGAGGACGCTTACGCCAGATCTGTAACCGAGGTTCTTGAAGCTTTCGGGGTCGACCCTGCTAAAGGTCTCACAGATTCGCAGGT
TGCTGAACATGCAAGGATTTACGGCAGAAATGCGCTGCCTGAAGAACCCTGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTTATATTATTGATCCTGGCAGCTAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAGTAAGTCTCGAATGCCACACCTCATTCT
TGTTTTAGAATGTTTTTGAAAAATTAGATATGTTTATTTTTGAATTTTTGGATTTAGGGACACAGGAAATAATCATCAAAAACAGGTAAGGCAAATGGATATAGAAAATCATATTCCTTTATATCCTCCACTTATTTATATTGCTAAAACTAGATATAGAGATGTGATTCATGTTCTCCATTTTTGACTTGTAAGTTGTC
AATTTTATGTTATCTTTAGCCTTTACTTCCTAGTGGCACTTAAAACATTCATGTTTTTTCATATTATAATTTCATGTGTGCACATATGTCCTCAGGTGTGCTGTTAATAAGTAAGCTACTTTAGGTCTAAACTATTGAGATCCTGATGTGTAACGATGACCAAGTTTGTCATGCTGGGGCTAGAGTTGTTGTTTGAGGGA
TCATATCATTTTGGAGgttgatataaacacagtcgcttctctgatgtagtctcttattgttgtgatatttatgagtgtatgcaatactagctttgaccttttcgattatgtagttactttacctcactgatattccctttatgaatacatatatttgcattttccctttgcttagtaagggggctggtttccttgctagt
gcaatacctgtaaggtcttgaatcattaattaacttagcttagttgaacttgttttcttcttgtgtttttctttgcactgataatattagtttatgttttactggttactcacatgacgactatggtgttagGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTTGCAACTGTATTGAGGAATGGCCTTTTATCAATCATTCCAGC
ATCAGATCTTGTTCCAGGGGATATAGTTGAAGTTGGAGTTGGATGCAAAGTTCCAGCTGATATGCGAGTCATCAAAATGTTCGGTAACCAGTTGCGTGTAGATCAAGCGATACTAACTGGTGAGAGTTGTTCGGTGGGAAAAGAATTGGGTGTTGCATGTACAACCAAAGCTGTCTATCAAGACAAGACGAACATTCTCT
TTTCTGGAACTGTTGTCGCAACTGGACGGGCAAAAGCGATTGTTGTTGGTGTTGGCTCTAACACAGCAATGGGAAGTATTCGTGATGCAATGTTAAGGACAGAAGATGAATCGACACCACTAAAGAAAAAGCTAGATGAATTTGGTGCCTTTCTCGCTAAGGTTATTGCAGTGATTTGTGTTTTAGTATGGGTTGTAAAT
ATCGGTCATTTTCATGACCCTGCTCATGGTGGTATCTTGCGTGGAGCTATCCATTATTTCAAGATTGCTGTTGCTCTAGCAGTTGCTGCCATTCCAGAAGGCCTTCCAGCTGTTGTTACAACGTGCCTTGCACTTGGGACAAAGAGGATGGCAAAGTTGAATGCTATTGTGCGGTCTCTACCTTCTGTCGAGACACTAGG
ATGCACGACAGTGATTTGCAGTGACAAGACAGGCACTCTAACGACCAATATGATGTCTGTTTCTAAGATTTGTGTAATTCGTTCTGTTCATCACGGTCCTGTCTCGGCAGAATATACAGTCACCGGGACAACATACGCTCCAGACGGTGTCATTTATGATTCTGCTGGTTTACAGCTTCAACATCCTGCACATTTTCCCT
GCTTGCTTCACATAGCTATGTGTTCGGCTCTGTGCAATGACTCAAGCTTGCAGTATAATCCAGACAAGGGAGCATATGAAAAAATTGGAGAGTCTACAGAAGTTGCTCTCCGTGTTCTTGCAGAAAAGGTTGGCTTGCCAGGTTTTGATTCAATGCCATCTGCATTAAATATGCTGAGCAAACATGAACGTGCGTCTTAC
TGCAATCATTATTGGGAGCATCAATTTAGAAAGGTTGCTGTTTTGGAATTTTCCCGAGATCGTAAGATGATGAGTGTTCTTTGTAGTCGTAAGCAACAAGAAATTATGTTTTCAAAAGGTGCTCCAGAGAGTATTATTGCTCGATGCTCAAATGTTCTTTGTAATGATGATGGCTCTGCTATACCTCTAACTGTTGATGT
TAGATCAGAGTTGGAGAACAGGTTCCATAGCTTTGGGCAAAAGGAGACATTGAGGTGTTTAGCTCTTGCTTTGAAACGGATGCCACCGGGCCAGCAATCATTGAATTTTGAGGACGAGTCAAATCTTACGTTTATTGGCTTGGTTGGAATGCTTGATCCACCAAGAGCTGAGGTGAGGAATGCCATACAAACATGCATGT
CTGCTGGAATACGTGTTATTGTGGTTACGGGTGACAACAAGGTAATAGCCATCAGCATTGACTACTAATTCTCATAACAGGCAGATTTCTAATCTGCATCTACCCATGTGGATTTTTCGG
Intron 2 GTAAGTCTCG ... ATGGTGTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 34.51 | 40.4 | 17.5 | 25 |
| A2 | 25.86 | 32.6 | 8.8 | 14 |
| A3 | 18.08 | 68.9 | 10.6 | 20 |
| A4 | 25.92 | 45.9 | 10.1 | 22 |
| A5 | 29.16 | 23 | 6 | 13 |
| A6 | 19.74 | 17.8 | 0.8 | 8 |
| A7 | 10.82 | 36.3 | 3.9 | 5 |
| A8 | 19.49 | 9.8 | 0.8 | 4 |
| A9 | 11.92 | 21.3 | 1.9 | 4 |
| A10 | 3.49 | 37.8 | 0.8 | 2 |
>TRINITY_DN118706_c0_g1_i13 from sample A3 / Example spliced isoformTCGTCAGTGACTACCCAAAACCTTAGACCGACACCAATACATGAAAACGAAAAACAATAACTAAAACTTACTCGCAAACTATTCTTCATCTCCACTCCTCAACTTTTAGGAGAAGAATCCTAAAGCGTACAATGTACAACAAGTCACAGAGCGCACACGTCCAATAAACCCCTCTATGTTTTTTTCCTTAAATTATTACC
ACGGCAGATGGATAACTAGAGTTATATTTCGTAATCAGCCCGAAAAATCACTCTCCCTTTAATGCATCTTGTTTCAACTCTTTTCCACACCCTGCTCTGCTTTACGGGAAAAAAATGGAGGACGCTTACGCCAGATCTGTAACCGAGGTTCTTGAAGCTTTCGGGGTCGACCCTGCTAAAGGTCTCACAGATTCGCAGGT
TGCTGAACATGCAAGGATTTACGGCAGAAATGCGCTGCCTGAAGAACCCTGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTTATATTATTGATCCTGGCAGCTAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTTG
CAACTGTATTGAGGAATGGCCTTTTATCAATCATTCCAGCATCAGATCTTGTTCCAGGGGATATAGTTGAAGTTGGAGTTGGATGCAAAGTTCCAGCTGATATGCGAGTCATCAAAATGTTCGGTAACCAGTTGCGTGTAGATCAAGCGATACTAACTGGTGAGAGTTGTTCGGTGGGAAAAGAATTGGGTGTTGCATGT
ACAACCAAAGCTGTCTATCAAGACAAGACGAACATTCTCTTTTCTGGAACTGTTGTCGCAACTGGACGGGCAAAAGCGATTGTTGTTGGTGTTGGCTCTAACACAGCAATGGGAAGTATTCGTGATGCAATGTTAAGGACAGAAGATGAATCGACACCACTAAAGAAAAAGCTAGATGAATTTGGTGCCTTTCTCGCTAA
GGTTATTGCAGTGATTTGTGTTTTAGTATGGGTTGTAAATATCGGTCATTTTCATGACCCTGCTCATGGTGGTATCTTGCGTGGAGCTATCCATTATTTCAAGATTGCTGTTGCTCTAGCAGTTGCTGCCATTCCAGAAGGCCTTCCAGCTGTTGTTACAACGTGCCTTGCACTTGGGACAAAGAGGATGGCAAAGTTGA
ATGCTATTGTGCGGTCTCTACCTTCTGTCGAGACACTAGGATGCACGACAGTGATTTGCAGTGACAAGACAGGCACTCTAACGACCAATATGATGTCTGTTTCTAAGATTTGTGTAATTCGTTCTGTTCATCACGGTCCTGTCTCGGCAGAATATACAGTCACCGGGACAACATACGCTCCAGACGGTGTCATTTATGAT
TCTGCTGGTTTACAGCTTCAACATCCTGCACATTTTCCCTGCTTGCTTCACATAGCTATGTGTTCGGCTCTGTGCAATGACTCAAGCTTGCAGTATAATCCAGACAAGGGAGCATATGAAAAAATTGGAGAGTCTACAGAAGTTGCTCTCCGTGTTCTTGCAGAAAAGGTTGGCTTGCCAGGTTTTGATTCAATGCCATC
TGCATTAAATATGCTGAGCAAACATGAACGTGCGTCTTACTGCAATCATTATTGGGAGCATCAATTTAGAAAGGTTGCTGTTTTGGAATTTTCCCGAGATCGTAAGATGATGAGTGTTCTTTGTAGTCGTAAGCAACAAGAAATTATGTTTTCAAAAGGTGCTCCAGAGAGTATTATTGCTCGATGCTCAAATGTTCTTT
GTAATGATGATGGCTCTGCTATACCTCTAACTGTTGATGTTAGATCAGAGTTGGAGAACAGGTTCCATAGCTTTGGGCAAAAGGAGACATTGAGGTGTTTAGCTCTTGCTTTGAAACGGATGCCACCGGGCCAGCAATCATTGAATTTTGAGGACGAGTCAAATCTTACGTTTATTGGCTTGGTTGGAATGCTTGATCCA
CCAAGAGCTGAGGTGAGGAATGCCATACAAACATGCATGTCTGCTGGAATACGTGTTATTGTGGTCACGGGTGACAACAAGTCAACAGCAGAGTCTGTTTGTCGCCGAATTGGAGCCTTTGATCCATTGGATGACCTAGTTGGGCGTTCATACACTGCATCAGAGTTTGAGGAGTTATCACCCATACAAAGAGCAATAGC
TCTACAACGCATGGTACTATTTTCAAGGGTTGAACCAGCTCACAAAAGGATGCTTGTTGAAGCCCTACAGCACCAAAACGAAGTGGTTGCAATGACAGGTGACGGAGTAAATGATGCACCAGCTCTCAAAAAAGCAGATATAGGAATTGCCATGGGATCTGGAACTGCTGTTGCAAAGGGTGCTTCTGATATGGTGTTAA
CTGATGATAACTTTGCCTCAATTGTTGCAGCTGTTGCAGAAGGGCGGGCCATATATAATAATACGAAACAGTTCATCCGTTATATGATCTCCTCGAACATTGGAGAAGTAGTGTGCATATTTGTGGCTGCTGTCCTTGGAATGCCAGAGACCCTTGTACCTGTGCAACTCCTCTGGGTGAATTTAGTGACGGATGGATTA
CCTGCAACTGCTATTGGATTTAATAAGCAGGATCGCAAAGTAATGATGGTGAGACCTCGAAAGGTTAATGAAGCTATCGTTAATGGCTGGCTATTCTTCCGCTATTTGGTGATAGGTGCTTATGTCGGTCTTGCTACTATTGCGGGTTTTGCATGGTGGTTTCTATATTATGAAGGTGGCCCAAAATTACCCTACAGAGA
ACTCGTAAGAGCCTAATTCTTTTTTTCGGTTAATTTTGATACATGTTCACAGAGAGAAACAACCTATTCATGCAACATATTTGAAGATCGGCATCCATCAACAGTCTCAATGAGTGTACTTGTGGTGGTTGAGATGTTTAATGCACTAAATAACCTTAGTGAAAACCAAAGTCTTCTCGTTCTTCCTCCATGGAGTAATT
TATGGCTGGTATCATCGATTATTTTGACTATGATTCTTCATATATTGATACTTTATGTACAACCATTATCCATTCTGTTTTCAGTAACACCATTGTCATGGACTGAATGGAAAGCTGTTCTCTTTCTTTCGTTTCCTGTAATTTTAGTTGATGAGATCCTAAAGTTTTCCTCCAGAAATCTTAAAGGAAAAAATATTCGC
TTCAGGTTCCGTAAGCGTGATTCAATACCTAGAACCCAGTTGCATGATAAATAAAGGCATTACGAGTTCTTTTCCCATGAAAAGATTCAATTTTGTATTTACTATTATTTTGTAAGGCCATTATCGAAGGATGTACAATGAAGTTACAGAGG
>TRINITY_DN118706_c0_g1_i10 from sample A3 / Example unspliced isoform:TCGTCAGTGACTACCCAAAACCTTAGACCGACACCAATACATGAAAACGAAAAACAATAACTAAAACTTACTCGCAAACTATTCTTCATCTCCACTCCTCAACTTTTAGGAGAAGAATCCTAAAGCGTACAATGTACAACAAGTCACAGAGCGCACACGTCCAATAAACCCCTCTATGTTTTTTTCCTTAAATTATTACC
ACGGCAGATGGATAACTAGAGTTATATTTCGTAATCAGCCCGAAAAATCACTCTCCCTTTAATGCATCTTGTTTCAACTCTTTTCCACACCCTGCTCTGCTTTACGGGAAAAAAATGGAGGACGCTTACGCCAGATCTGTAACCGAGGTTCTTGAAGCTTTCGGGGTCGACCCTGCTAAAGGTCTCACAGATTCGCAGGT
TGCTGAACATGCAAGGATTTACGGCAGAAATGCGCTGCCTGAAGAACCCTGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTTATATTATTGATCCTGGCAGCTAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAgtaagtctcgaatgccacacctcattct
tgttttagaatgtttttgaaaaattagatatgtttatttttgaatttttggatttagggacacaggaaataatcatcaaaaacaggtaaggcaaatggatatagaaaatcatattcctttatatcctccacttatttatattgctaaaactagatatagagatgtgattcatgttctccatttttgacttgtaagttgtc
aattttatgttatctttagcctttacttcctagtggcacttaaaacattcatgttttttcatattataatttcatgtgtgcacatatgtcctcaggtgtgctgttaataagtaagctactttaggtctaaactattgagatcctgatgtgtaacgatgaccaagtttgtcatgctggggctagagttgttgtttgaggga
tcatatcattttggaggttgatataaacacagtcgcttctctgatgtagtctcttattgttgtgatatttatgagtgtatgcaatactagctttgaccttttcgattatgtagttactttacctcactgatattccctttatgaatacatatatttgcattttccctttgcttagtaagggggctggtttccttgctagt
gcaatacctgtaaggtcttgaatcattaattaacttagcttagttgaacttgttttcttcttgtgtttttctttgcactgataatattagtttatgttttactggttactcacatgacgactatggtgttagGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTTGCAACTGTATTGAGGAATGGCCTTTTATCAATCATTCCAGC
ATCAGATCTTGTTCCAGGGGATATAGTTGAAGTTGGAGTTGGATGCAAAGTTCCAGCTGATATGCGAGTCATCAAAATGTTCGGTAACCAGTTGCGTGTAGATCAAGCGATACTAACTGGTGAGAGTTGTTCGGTGGGAAAAGAATTGGGTGTTGCATGTACAACCAAAGCTGTCTATCAAGACAAGACGAACATTCTCT
TTTCTGGAACTGTTGTCGCAACTGGACGGGCAAAAGCGATTGTTGTTGGTGTTGGCTCTAACACAGCAATGGGAAGTATTCGTGATGCAATGTTAAGGACAGAAGATGAATCGACACCACTAAAGAAAAAGCTAGATGAATTTGGTGCCTTTCTCGCTAAGGTTATTGCAGTGATTTGTGTTTTAGTATGGGTTGTAAAT
ATCGGTCATTTTCATGACCCTGCTCATGGTGGTATCTTGCGTGGAGCTATCCATTATTTCAAGATTGCTGTTGCTCTAGCAGTTGCTGCCATTCCAGAAGGCCTTCCAGCTGTTGTTACAACGTGCCTTGCACTTGGGACAAAGAGGATGGCAAAGTTGAATGCTATTGTGCGGTCTCTACCTTCTGTCGAGACACTAGG
ATGCACGACAGTGATTTGCAGTGACAAGACAGGCACTCTAACGACCAATATGATGTCTGTTTCTAAGATTTGTGTAATTCGTTCTGTTCATCACGGTCCTGTCTCGGCAGAATATACAGTCACCGGGACAACATACGCTCCAGACGGTGTCATTTATGATTCTGCTGGTTTACAGCTTCAACATCCTGCACATTTTCCCT
GCTTGCTTCACATAGCTATGTGTTCGGCTCTGTGCAATGACTCAAGCTTGCAGTATAATCCAGACAAGGGAGCATATGAAAAAATTGGAGAGTCTACAGAAGTTGCTCTCCGTGTTCTTGCAGAAAAGGTTGGCTTGCCAGGTTTTGATTCAATGCCATCTGCATTAAATATGCTGAGCAAACATGAACGTGCGTCTTAC
TGCAATCATTATTGGGAGCATCAATTTAGAAAGGTTGCTGTTTTGGAATTTTCCCGAGATCGTAAGATGATGAGTGTTCTTTGTAGTCGTAAGCAACAAGAAATTATGTTTTCAAAAGGTGCTCCAGAGAGTATTATTGCTCGATGCTCAAATGTTCTTTGTAATGATGATGGCTCTGCTATACCTCTAACTGTTGATGT
TAGATCAGAGTTGGAGAACAGGTTCCATAGCTTTGGGCAAAAGGAGACATTGAGGTGTTTAGCTCTTGCTTTGAAACGGATGCCACCGGGCCAGCAATCATTGAATTTTGAGGACGAGTCAAATCTTACGTTTATTGGCTTGGTTGGAATGCTTGATCCACCAAGAGCTGAGGTGAGGAATGCCATACAAACATGCATGT
CTGCTGGAATACGTGTTATTGTGGTTACGGGTGACAACAAGGTAATAGCCATCAGCATTGACTACTAATTCTCATAACAGGCAGATTTCTAATCTGCATCTACCCATGTGGATTTTTCGG
Intron 3 GTGTGCTGTT ... CATTTTGGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 32.35 | 36.5 | 15 | 0 |
| A2 | 33.93 | 28 | 11 | 4 |
| A3 | 30.38 | 63 | 25 | 15 |
| A4 | 23.91 | 41.3 | 12 | 1 |
| A5 | 34.17 | 20.3 | 8 | 2 |
| A6 | 24.67 | 15.5 | 4 | 3 |
| A7 | 20.55 | 32.3 | 7 | 0 |
| A8 | 20.56 | 8.8 | 2 | 0 |
| A9 | 23.93 | 18.7 | 4 | 0 |
| A10 | 6.39 | 33.8 | 2 | 0 |
>TRINITY_DN107942_c1_g1_i9 from sample A4 / Example spliced isoformGGTATATTTTTGGTGTTTATAATATTTGATGCAAAGCTCTGTCATTTGTTGACAGGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTAAAAATATTGATCGCAGCTGCTGTGATTTCTTTTATATTGGCTGTGATTGATGGAGAAACAGGACTTGGTGCTTTTTTGGAACCTTCTGTTATATT
ATTGATCCTGGCAGCTAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTTGCAACTGTATTGAGGAATGGCCTTTTATCAATCATTCCAGCATCAGATCTTGTTCCAGGGGATATAGTTGAAGTTGGAGTTGGATGCAAAGTTCCAGCTGATATGC
GAGTCATCAAAATGTTCGGTAACCAGTTGCGTGTAGATCAAGCGATACTAACTGGTATTTGCATGCATATCTTTAATTCTAATTTGCATTAATTCATCCT
>TRINITY_DN107942_c1_g1_i17 from sample A4 / Example unspliced isoform:TCCGGGGAGAGTTATATTTCGTAATCAGCCCGAAAAATCACTCTCCCTTTAATGCATCTTGTTTCAACTCTTTTCCACACCCTGCTCTGCTTTACGGGAAAAAAATGGAGGACGCTTACGCCAGATCTGTAACCGAGGTTCTTGAAGCTTTCGGGGTCGACCCTGCTAAAGGTCTCACAGATTCGCAGGTTGCTGAACAT
GCAAGGATTTACGGCAGAAATGCGCTGCCTGAAGAACCCTGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTAAAAATATTGATCGCAGCTGCTGTGATTTCTTTTATATTGGCTGTGATTGATGGAGAAACAGGACTTGGTGCTTTTTTGGAACCTTCTGTTATATTATTGATCCTGGCAGC
TAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAgtgtgctgttaataagtaagctactttaggtctaaactattgagatcctgatgtgtaacgatgaccaagtttgtcatgctggggctagagttgttgtttgagggatcatatcattttggagGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTT
GCAACTGTATTGAGGAATGG
Intron 4 GTAAGTCTCG ... CATTTTGGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.15 | 42 | 25 | 13 |
| A2 | 25.84 | 33 | 10 | 13 |
| A3 | 24.06 | 71 | 20 | 25 |
| A4 | 20 | 46 | 12 | 11 |
| A5 | 30.43 | 24 | 11 | 10 |
| A6 | 26.53 | 18 | 2 | 11 |
| A7 | 13.95 | 37 | 7 | 5 |
| A8 | 16.67 | 10 | 2 | 2 |
| A9 | 16.98 | 22 | 5 | 4 |
| A10 | 5 | 38 | 2 | 2 |
>TRINITY_DN118706_c0_g1_i5 from sample A3 / Example spliced isoformTCGTCAGTGACTACCCAAAACCTTAGACCGACACCAATACATGAAAACGAAAAACAATAACTAAAACTTACTCGCAAACTATTCTTCATCTCCACTCCTCAACTTTTAGGAGAAGAATCCTAAAGCGTACAATGTACAACAAGTCACAGAGCGCACACGTCCAATAAACCCCTCTATGTTTTTTTCCTTAAATTATTACC
ACGGCAGATGGATAACTAGAGTTATATTTCGTAATCAGCCCGAAAAATCACTCTCCCTTTAATGCATCTTGTTTCAACTCTTTTCCACACCCTGCTCTGCTTTACGGGAAAAAAATGGAGGACGCTTACGCCAGATCTGTAACCGAGGTTCTTGAAGCTTTCGGGGTCGACCCTGCTAAAGGTCTCACAGATTCGCAGGT
TGCTGAACATGCAAGGATTTACGGCAGAAATGCGCTGCCTGAAGAACCCTGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTAAAAATATTGATCGCAGCTGCTGTGATTTCTTTTATATTGGCTGTGATTGATGGAGAAACAGGACTTGGTGCTTTTTTGGAACCTTCTGTTATATTATTGA
TCCTGGCAGCTAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTTGCAACTGTATTGAGGAATGGCCTTTTATCAATCATTCCAGCATCAGATCTTGTTCCAGGGGATATAGTTGAAGTTGGAGTTGGATGCAAAGTTCCAGCTGATATGCGAGTC
ATCAAAATGTTCGGTAACCAGTTGCGTGTAGATCAAGCGATACTAACTGGTGAGAGTTGTTCGGTGGGAAAAGAATTGGGTGTTGCATGTACAACCAAAGCTGTCTATCAAGACAAGACGAACATTCTCTTTTCTGGAACTGTTGTCGCAACTGGACGGGCAAAAGCGATTGTTGTTGGTGTTGGCTCTAACACAGCAAT
GGGAAGTATTCGTGATGCAATGTTAAGGACAGAAGATGAATCGACACCACTAAAGAAAAAGCTAGATGAATTTGGTGCCTTTCTCGCTAAGGTTATTGCAGTGATTTGTGTTTTAGTATGGGTTGTAAATATCGGTCATTTTCATGACCCTGCTCATGGTGGTATCTTGCGTGGAGCTATCCATTATTTCAAGATTGCTG
TTGCTCTAGCAGTTGCTGCCATTCCAGAAGGCCTTCCAGCTGTTGTTACAACGTGCCTTGCACTTGGGACAAAGAGGATGGCAAAGTTGAATGCTATTGTGCGGTCTCTACCTTCTGTCGAGACACTAGGATGCACGACAGTGATTTGCAGTGACAAGACAGGCACTCTAACGACCAATATGATGTCTGTTTCTAAGATT
TGTGTAATTCGTTCTGTTCATCACGGTCCTGTCTCGGCAGAATATACAGTCACCGGGACAACATACGCTCCAGACGGTGTCATTTATGATTCTGCTGGTTTACAGCTTCAACATCCTGCACATTTTCCCTGCTTGCTTCACATAGCTATGTGTTCGGCTCTGTGCAATGACTCAAGCTTGCAGTATAATCCAGACAAGGG
AGCATATGAAAAAATTGGAGAGTCTACAGAAGTTGCTCTCCGTGTTCTTGCAGAAAAGGTTGGCTTGCCAGGTTTTGATTCAATGCCATCTGCATTAAATATGCTGAGCAAACATGAACGTGCGTCTTACTGCAATCATTATTGGGAGCATCAATTTAGAAAGGTTGCTGTTTTGGAATTTTCCCGAGATCGTAAGATGA
TGAGTGTTCTTTGTAGTCGTAAGCAACAAGAAATTATGTTTTCAAAAGGTGCTCCAGAGAGTATTATTGCTCGATGCTCAAATGTTCTTTGTAATGATGATGGCTCTGCTATACCTCTAACTGTTGATGTTAGATCAGAGTTGGAGAACAGGTTCCATAGCTTTGGGCAAAAGGAGACATTGAGGTGTTTAGCTCTTGCT
TTGAAACGGATGCCACCGGGCCAGCAATCATTGAATTTTGAGGACGAGTCAAATCTTACGTTTATTGGCTTGGTTGGAATGCTTGATCCACCAAGAGCTGAGGTGAGGAATGCCATACAAACATGCATGTCTGCTGGAATACGTGTTATTGTGGTTACGGGTGACAACAAGGTAATAGCCATCAGCATTGACTACTAATT
CTCATAACAGGCAGATTTCTAATCTGCATCTACCCATGTGGATTTTTCGG
>TRINITY_DN118706_c0_g1_i18 from sample A3 / Example unspliced isoform:TCGTCAGTGACTACCCAAAACCTTAGACCGACACCAATACATGAAAACGAAAAACAATAACTAAAACTTACTCGCAAACTATTCTTCATCTCCACTCCTCAACTTTTAGGAGAAGAATCCTAAAGCGTACAATGTACAACAAGTCACAGAGCGCACACGTCCAATAAACCCCTCTATGTTTTTTTCCTTAAATTATTACC
ACGGCAGATGGATAACTAGAGTTATATTTCGTAATCAGCCCGAAAAATCACTCTCCCTTTAATGCATCTTGTTTCAACTCTTTTCCACACCCTGCTCTGCTTTACGGGAAAAAAATGGAGGACGCTTACGCCAGATCTGTAACCGAGGTTCTTGAAGCTTTCGGGGTCGACCCTGCTAAAGGTCTCACAGATTCGCAGGT
TGCTGAACATGCAAGGATTTACGGCAGAAATGCGCTGCCTGAAGAACCCTGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTAAAAATATTGATCGCAGCTGCTGTGATTTCTTTTATATTGGCTGTGATTGATGGAGAAACAGGACTTGGTGCTTTTTTGGAACCTTCTGTTATATTATTGA
TCCTGGCAGCTAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAgtaagtctcgaatgccacacctcattcttgttttagaatgtttttgaaaaattagatatgtttatttttgaatttttggatttagggacacaggaaataatcatcaaaaacaggtaaggcaaatggatatagaaaatc
atattcctttatatcctccacttatttatattgctaaaactagatatagagatgtgattcatgttctccatttttgacttgtaagttgtcaattttatgttatctttagcctttacttcctagtggcacttaaaacattcatgttttttcatattataatttcatgtgtgcacatatgtcctcaggtgtgctgttaataa
gtaagctactttaggtctaaactattgagatcctgatgtgtaacgatgaccaagtttgtcatgctggggctagagttgttgtttgagggatcatatcattttggagGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTTGCAACTGTATTGAGGAATGGCCTTTTATCAATCATTCCAGCATCAGATCTTGTTCCAGGGGATATAG
TTGAAGTTGGAGTTGGATGCAAAGTTCCAGCTGATATGCGAGTCATCAAAATGTTCGGTAACCAGTTGCGTGTAGATCAAGCGATACTAACTGGTGAGAGTTGTTCGGTGGGAAAAGAATTGGGTGTTGCATGTACAACCAAAGCTGTCTATCAAGACAAGACGAACATTCTCTTTTCTGGAACTGTTGTCGCAACTGGA
CGGGCAAAAGCGATTGTTGTTGGTGTTGGCTCTAACACAGCAATGGGAAGTATTCGTGATGCAATGTTAAGGACAGAAGATGAATCGACACCACTAAAGAAAAAGCTAGATGAATTTGGTGCCTTTCTCGCTAAGGTTATTGCAGTGATTTGTGTTTTAGTATGGGTTGTAAATATCGGTCATTTTCATGACCCTGCTCA
TGGTGGTATCTTGCGTGGAGCTATCCATTATTTCAAGATTGCTGTTGCTCTAGCAGTTGCTGCCATTCCAGAAGGCCTTCCAGCTGTTGTTACAACGTGCCTTGCACTTGGGACAAAGAGGATGGCAAAGTTGAATGCTATTGTGCGGTCTCTACCTTCTGTCGAGACACTAGGATGCACGACAGTGATTTGCAGTGACA
AGACAGGCACTCTAACGACCAATATGATGTCTGTTTCTAAGATTTGTGTAATTCGTTCTGTTCATCACGGTCCTGTCTCGGCAGAATATACAGTCACCGGGACAACATACGCTCCAGACGGTGTCATTTATGATTCTGCTGGTTTACAGCTTCAACATCCTGCACATTTTCCCTGCTTGCTTCACATAGCTATGTGTTCG
GCTCTGTGCAATGACTCAAGCTTGCAGTATAATCCAGACAAGGGAGCATATGAAAAAATTGGAGAGTCTACAGAAGTTGCTCTCCGTGTTCTTGCAGAAAAGGTTGGCTTGCCAGGTTTTGATTCAATGCCATCTGCATTAAATATGCTGAGCAAACATGAACGTGCGTCTTACTGCAATCATTATTGGGAGCATCAATT
TAGAAAGGTTGCTGTTTTGGAATTTTCCCGAGATCGTAAGATGATGAGTGTTCTTTGTAGTCGTAAGCAACAAGAAATTATGTTTTCAAAAGGTGCTCCAGAGAGTATTATTGCTCGATGCTCAAATGTTCTTTGTAATGATGATGGCTCTGCTATACCTCTAACTGTTGATGTTAGATCAGAGTTGGAGAACAGGTTCC
ATAGCTTTGGGCAAAAGGAGACATTGAGGTGTTTAGCTCTTGCTTTGAAACGGATGCCACCGGGCCAGCAATCATTGAATTTTGAGGACGAGTCAAATCTTACGTTTATTGGCTTGGTTGGAATGCTTGATCCACCAAGAGCTGAGGTGAGGAATGCCATACAAACATGCATGTCTGCTGGAATACGTGTTATTGTGGTC
ACGGGTGACAACAAGTCAACAGCAGAGTCTGTTTGTCGCCGAATTGGAGCCTTTGATCCATTGGATGACCTAGTTGGGCGTTCATACACTGCATCAGAGTTTGAGGAGTTATCACCCATACAAAGAGCAATAGCTCTACAACGCATGGTACTATTTTCAAGGGTTGAACCAGCTCACAAAAGGATGCTTGTTGAAGCCCT
ACAGCACCAAAACGAAGTGGTTGCAATGACAGGTGACGGAGTAAATGATGCACCAGCTCTCAAAAAAGCAGATATAGGAATTGCCATGGGATCTGGAACTGCTGTTGCAAAGGGTGCTTCTGATATGGTGTTAACTGATGATAACTTTGCCTCAATTGTTGCAGCTGTTGCAGAAGGGCGGGCCATATATAATAATACGA
AACAGTTCATCCGTTATATGATCTCCTCGAACATTGGAGAAGTAGTGTGCATATTTGTGGCTGCTGTCCTTGGAATGCCAGAGACCCTTGTACCTGTGCAACTCCTCTGGGTGAATTTAGTGACGGATGGATTACCTGCAACTGCTATTGGATTTAATAAGCAGGATCGCAAAGTAATGATGGTGAGACCTCGAAAGGTT
AATGAAGCTATCGTTAATGGCTGGCTATTCTTCCGCTATTTGGTGATAGGTGCTTATGTCGGTCTTGCTACTATTGCGGGTTTTGCATGGTGGTTTCTATATTATGAAGGTGGCCCAAAATTACCCTACAGAGAACTCGTTAATTTTGATACATGTTCACAGAGAGAAACAACCTATTCATGCAACATATTTGAAGATCG
GCATCCATCAACAGTCTCAATGAGTGTACTTGTGGTGGTTGAGATGTTTAATGCACTAAATAACCTTAGTGAAAACCAAAGTCTTCTCGTTCTTCCTCCATGGAGTAATTTATGGCTGGTATCATCGATTATTTTGACTATGATTCTTCATATATTGATACTTTATGTACAACCATTATCCATTCTGTTTTCAGTAACAC
CATTGTCATGGACTGAATGGAAAGCTGTTCTCTTTCTTTCGTTTCCTGTAATTTTAGTTGATGAGATCCTAAAGTTTTCCTCCAGAAATCTTAAAGGAAAAAATATTCGCTTCAGGTTCCGTAAGCGTGATTCAATACCTAGAACCCAGTTGCATGATAAATAAAGGCATTACGAGTTCTTTTCCCATGAAAAGATTCAA
TTTTGTATTTACTATTATTTTGTAAGGCCATTATCGAAGGATGTACAATGAAGTTACAGAGGAAAGGCGTTTACTCTGGAACAAGGAACCTTACAAGGGAATTTTCTCTGTACCTCTTTGCCAATGAAGGAGAGAATCAATCTACTTGTGAAATTCGAAAAGACTAGCACAAATTAATGGAATATCTTTCGATGTTAGAG
GAAAAAATAAGGCAACAGTGGTGAGGAGAAAAGATTAAGATTCTTTGGAGAACAAATGATATCTTTTATGCATTTACAGAGAAACAGTTAAGCATTTGACTATTTGTAACATGTTTTTTATAATATATTTACATGGTAACATGATTTACGCTCATTTACCGTCTAAATTCTCAAGCCGACAGTGAGATTTGAATCAAATG
TATTTTAAGATAAATTTAGCCTAATCATTTTGAGAAGGATTAATGAAATCTGGGATTCCAACTCATTAACTTCCCTACAAAATACACGGGTTTTACTTTTCCCTTAGCCTTGGTTAATCATAGAGTTGGCGATTGGTTGGGAATAATAGACAAAAGTGAGAATAAAAT
Intron 5 GTGACGGAGT ... ATTGTTGCAG
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| A5 | 70.97 | 9 | 15 | 29 |
| A6 | 71.79 | 11 | 15 | 41 |
| A7 | 70.54 | 19 | 39 | 52 |
| A8 | 75 | 14 | 32 | 52 |
| A9 | 58.47 | 38 | 54 | 53 |
| A10 | 62.2 | 31 | 33 | 69 |
>TRINITY_DN44816_c1_g2_i5 from sample A8 / Example spliced isoformTTTTAGGAGAAGAATCCTAAAGCGTACAATGTACAACAAGTCACAGAGCGCACACGTCCAATAAACCCCTCTATGTTTTTTTCCTTAAATTATTACCACGGCAGATGGATAACTAGAGTTATATTTCGTAATCAGCCCGAAAAATCACTCTCCCTTTAATGCATCTTGTTTCAACTCTTTTCCACACCCTGCTCTGCTTT
ACGGGAAAAAAATGGAGGACGCTTACGCCAGATCTGTAACCGAGGTTCTTGAAGCTTTCGGGGTCGACCCTGCTAAAGGTCTCACAGATTCGCAGGTTGCTGAACATGCAAGGATTTACGGCAGAAATGCGCTGCCTGAAGAACCCTGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTAAAA
ATATTGATCGCAGCTGCTGTGATTTCTTTTATATTGGCTGTGATTGATGGAGAAACAGGACTTGGTGCTTTTTTGGAACCTTCTGTTATATTATTGATCCTGGCAGCTAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTTGCAACTGTATTGAG
GAATGGCCTTTTATCAATCATTCCAGCATCAGATCTTGTTCCAGGGGATATAGTTGAAGTTGGAGTTGGATGCAAAGTTCCAGCTGATATGCGAGTCATCAAAATGTTCGGTAACCAGTTGCGTGTAGATCAAGCGATACTAACTGGTGAGAGTTGTTCGGTGGGAAAAGAATTGGGTGTTGCATGTACAACCAAAGCTG
TCTATCAAGACAAGACGAACATTCTCTTTTCTGGAACTGTTGTCGCAACTGGACGGGCAAAAGCGATTGTTGTTGGTGTTGGCTCTAACACAGCAATGGGAAGTATTCGTGATGCAATGTTAAGGACAGAAGATGAATCGACACCACTAAAGAAAAAGCTAGATGAATTTGGTGCCTTTCTCGCTAAGGTTATTGCAGTG
ATTTGTGTTTTAGTATGGGTTGTAAATATCGGTCATTTTCATGACCCTGCTCATGGTGGTATCTTGCGTGGAGCTATCCATTATTTCAAGATTGCTGTTGCTCTAGCAGTTGCTGCCATTCCAGAAGGCCTTCCAGCTGTTGTTACAACGTGCCTTGCACTTGGGACAAAGAGGATGGCAAAGTTGAATGCTATTGTGCG
GTCTCTACCTTCTGTCGAGACACTAGGATGCACGACAGTGATTTGCAGTGACAAGACAGGCACTCTAACGACCAATATGATGTCTGTTTCTAAGATTTGTGTAATTCGTTCTGTTCATCACGGTCCTGTCTCGGCAGAATATACAGTCACCGGGACAACATACGCTCCAGACGGTGTCATTTATGATTCTGCTGGTTTAC
AGCTTCAACATCCTGCACATTTTCCCTGCTTGCTTCACATAGCTATGTGTTCGGCTCTGTGCAATGACTCAAGCTTGCAGTATAATCCAGACAAGGGAGCATATGAAAAAATTGGAGAGTCTACAGAAGTTGCTCTCCGTGTTCTTGCAGAAAAGGTTGGCTTGCCAGGTTTTGATTCAATGCCATCTGCATTAAATATG
CTGAGCAAACATGAACGTGCGTCTTACTGCAATCATTATTGGGAGCATCAATTTAGAAAGGTTGCTGTTTTGGAATTTTCCCGAGATCGTAAGATGATGAGTGTTCTTTGTAGTCGTAAGCAACAAGAAATTATGTTTTCAAAAGGTGCTCCAGAGAGTATTATTGCTCGATGCTCAAATGTTCTTTGTAATGATGATGG
CTCTGCTATACCTCTAACTGTTGATGTTAGATCAGAGTTGGAGAACAGGTTCCATAGCTTTGGGCAAAAGGAGACATTGAGGTGTTTAGCTCTTGCTTTGAAACGGATGCCACCGGGCCAGCAATCATTGAATTTTGAGGACGAGTCAAATCTTACGTTTATTGGCTTGGTTGGAATGCTTGATCCACCAAGAGCTGAGG
TGAGGAATGCCATACAAACATGCATGTCTGCTGGAATACGTGTTATTGTGGTCACGGGTGACAACAAGTCAACAGCAGAGTCTGTTTGTCGCCGAATTGGAGCCTTTGATCCATTGGATGACCTAGTTGGGCGTTCATACACTGCATCAGAGTTTGAGGAGTTATCACCCATACAAAGAGCAATAGCTCTACAACGCATG
GTACTATTTTCAAGGGTTGAACCAGCTCACAAAAGGATGCTTGTTGAAGCCCTACAGCACCAAAACGAAGTGGTTGCAATGACAGCTGTTGCAGAAGGGCGGGCCATATATAATAATACGAAACAGTTCATCCGTTATATGATCTCCTCGAACATTGGAGAAGTAGTGTGCATATTTGTGGCTGCTGTCCTTGGAATGCC
AGAGACCCTTGTACCTGTGCAACTCCTCTGGGTGAATTTAGTGACGGATGGATTACCTGCAACTGCTATTGGATTTAATAAGCAGGATCGCAAAGTAATGATGGTGAGACCTCGAAAGGTTAATGAAGCTATCGTTAATGGCTGGCTATTCTTCCGCTATTTGGTGATAGGTGCTTATGTCGGTCTTGCTACTATTGCGG
GTTTTGCATGGTGGTTTCTATATTATGAAGGTGGCCCAAAATTACCCTACAGAGAACTC
>TRINITY_DN44816_c1_g2_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:TTTTAGGAGAAGAATCCTAAAGCGTACAATGTACAACAAGTCACAGAGCGCACACGTCCAATAAACCCCTCTATGTTTTTTTCCTTAAATTATTACCACGGCAGATGGATAACTAGAGTTATATTTCGTAATCAGCCCGAAAAATCACTCTCCCTTTAATGCATCTTGTTTCAACTCTTTTCCACACCCTGCTCTGCTTT
ACGGGAAAAAAATGGAGGACGCTTACGCCAGATCTGTAACCGAGGTTCTTGAAGCTTTCGGGGTCGACCCTGCTAAAGGTCTCACAGATTCGCAGGTTGCTGAACATGCAAGGATTTACGGCAGAAATGCGCTGCCTGAAGAACCCTGTACACCTTTCTGGAAATTAGTCCTGAAGCAGTTTGATGATTTGCTGGTAAAA
ATATTGATCGCAGCTGCTGTGATTTCTTTTATATTGGCTGTGATTGATGGAGAAACAGGACTTGGTGCTTTTTTGGAACCTTCTGTTATATTATTGATCCTGGCAGCTAATGCAGCCGTTGGAGTTATTACAGAAACAAATGCTGAAAAGGCTCTTGAAGAACTAAAAGCATATCAAGCTGATGTTGCAACTGTATTGAG
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TCTATCAAGACAAGACGAACATTCTCTTTTCTGGAACTGTTGTCGCAACTGGACGGGCAAAAGCGATTGTTGTTGGTGTTGGCTCTAACACAGCAATGGGAAGTATTCGTGATGCAATGTTAAGGACAGAAGATGAATCGACACCACTAAAGAAAAAGCTAGATGAATTTGGTGCCTTTCTCGCTAAGGTTATTGCAGTG
ATTTGTGTTTTAGTATGGGTTGTAAATATCGGTCATTTTCATGACCCTGCTCATGGTGGTATCTTGCGTGGAGCTATCCATTATTTCAAGATTGCTGTTGCTCTAGCAGTTGCTGCCATTCCAGAAGGCCTTCCAGCTGTTGTTACAACGTGCCTTGCACTTGGGACAAAGAGGATGGCAAAGTTGAATGCTATTGTGCG
GTCTCTACCTTCTGTCGAGACACTAGGATGCACGACAGTGATTTGCAGTGACAAGACAGGCACTCTAACGACCAATATGATGTCTGTTTCTAAGATTTGTGTAATTCGTTCTGTTCATCACGGTCCTGTCTCGGCAGAATATACAGTCACCGGGACAACATACGCTCCAGACGGTGTCATTTATGATTCTGCTGGTTTAC
AGCTTCAACATCCTGCACATTTTCCCTGCTTGCTTCACATAGCTATGTGTTCGGCTCTGTGCAATGACTCAAGCTTGCAGTATAATCCAGACAAGGGAGCATATGAAAAAATTGGAGAGTCTACAGAAGTTGCTCTCCGTGTTCTTGCAGAAAAGGTTGGCTTGCCAGGTTTTGATTCAATGCCATCTGCATTAAATATG
CTGAGCAAACATGAACGTGCGTCTTACTGCAATCATTATTGGGAGCATCAATTTAGAAAGGTTGCTGTTTTGGAATTTTCCCGAGATCGTAAGATGATGAGTGTTCTTTGTAGTCGTAAGCAACAAGAAATTATGTTTTCAAAAGGTGCTCCAGAGAGTATTATTGCTCGATGCTCAAATGTTCTTTGTAATGATGATGG
CTCTGCTATACCTCTAACTGTTGATGTTAGATCAGAGTTGGAGAACAGGTTCCATAGCTTTGGGCAAAAGGAGACATTGAGGTGTTTAGCTCTTGCTTTGAAACGGATGCCACCGGGCCAGCAATCATTGAATTTTGAGGACGAGTCAAATCTTACGTTTATTGGCTTGGTTGGAATGCTTGATCCACCAAGAGCTGAGG
TGAGGAATGCCATACAAACATGCATGTCTGCTGGAATACGTGTTATTGTGGTCACGGGTGACAACAAGTCAACAGCAGAGTCTGTTTGTCGCCGAATTGGAGCCTTTGATCCATTGGATGACCTAGTTGGGCGTTCATACACTGCATCAGAGTTTGAGGAGTTATCACCCATACAAAGAGCAATAGCTCTACAACGCATG
GTACTATTTTCAAGGGTTGAACCAGCTCACAAAAGGATGCTTGTTGAAGCCCTACAGCACCAAAACGAAGTGGTTGCAATGACAGgtgacggagtaaatgatgcaccagctctcaaaaaagcagatataggaattgccatgggatctggaactgctgttgcaaagggtgcttctgatatggtgttaactgatgataactt
tgcctcaattgttgcagCTGTTGCAGAAGGGCGGGCCATATATAATAATACGAAACAGTTCATCCGTTATATGATCTCCTCGAACATTGGAGAAGTAGTGTGCATATTTGTGGCTGCTGTCCTTGGAATGCCAGAGACCCTTGTACCTGTGCAACTCCTCTGGGTGAATTTAGTGACGGATGGATTACCTGCAACTGCTA
TTGGATTTAATAAGCAGGATCGCAAAGTAATGATGGTGAGACCTCGAAAGGTTAATGAAGCTATCGTTAATGGCTGGCTATTCTTCCGCTATTTGGTGATAGGTGCTTATGTCGGTCTTGCTACTATTGCGGGTTTTGCATGGTGGTTTCTATATTATGAAGGTGGCCCAAAATTACCCTACAGAGAACTCCGTTCTTCC
TCCATGGAGTAATTTATGGCTGGTATCATCGATTATTTTGACTATGATTCTTCATATATTGATACTTTATGTACAACCATTATCCATTCTGTTTTCAGTAACACCATTGTCATGGACTGAATGGAAAGCTGTTCTCTTTCTTTCGTTTCCTGTAATTTTAGTTGATGAGATCCTAAAGTTTTCCTCCAGAAATCTTAAAG
GAAAAAATATTCGCTTCAGGTTCCGTAAGCGTGATTCAATACCTAGAACCCAGTTGCATGATAAATAAAGGCATTACGAGTTCTTTTCCCATGAAAAGATTCAATTTTGTATTTACTATTATTTTGTAAGGCCATTATCGAAGGATGTACAATGAAGTTACAGAGGAAAGGCGTTTACTCTGGAACAAGGAACCTTACAA
GGGAATTTTCTCTGTACCTCTTTGCCAATGAAGGAGAGAATCAATCTACTTGTGAAATTCGAAAAGACTAGCACAAATTAATGGAATATCTTTCGATGTTAGAGGAAAAAATAAGGCAACAGTGGTGAGGAGAAAAGATTAAGATTCTTTGGAGAACAAATGATATCTTTTATGCATTTACAGAGAAACAGTTAAGCATT
TGACTATTTGTAACATGTTTTTTATAATATATTTACATGGTAACATGATTTACGCTCATTTACCGTCTAAATTCTCAAGCCGACAGTGAGATTTGAATCAAATGTATTTTAAGATAAATTTAGCCTAATCATTTTGAGAAGGATTAATGAAATCTGGGATTCCAACTCATTAACTTCCCTACAAAATACACGGGTTTTAC
TTTTCCCTTAGCCTTGGTTAATCATAGAGTTGGCGATTGGTTGGGAATAATAGACAAAAGTGAGAATAAAATAGACCCCTGGGTAAATAGAAGTTTTTCCCAAGAATAAGTTTGGCATATGGTTAGTTCTAAGTTGCAGGAAAACGTGTTCCCCATCTCGGCTCGTTTCCATACAGAATGCGGAAATACATTTCGTATGG
CATAGAATCATGTTTTCGATATTTTTAATGTAAAAGTGACATTCTCTTTATCTTTCATTTTCTATCATTTTACTAAAAAATTT