sp|Q5NA18|MTP5_ORYSJ ----> Metal tolerance protein 5

Intron 1 GTCAGTTTCG ... CTCTATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	52.31	31	4	34
A2	50.7	35	3	36
A3	48.28	30	5	28
A4	51.11	22	6	23
A5	50	13	14	13
A6	51.61	105	1	112
A7	53.17	96	1	109
A8	54.29	80	0	95
A9	50.81	122	1	126
A10	51.94	99	3	107

>TRINITY_DN41909_c0_g1_i19 from sample A9 / Example spliced isoform

AGATGAGATTTGAAATTCCAGGCCTGCTTGTCAGTCATCCCCTTGTCAATGGACACCTTGTCTATCATCCCCTTTGCTCGGAAACTGTCCATTGTGCTCAACAATCTCAGACTTAGACGAATTCATAACTCTTCACTGCCTTTAATTTAATTTTCTAAACCACTTTTAGGATCTGATTTCAGGGAATTATGGTTTTTGCT
ACAATCATGGCTACACTGGGATTGGAGATCTTACTAGAGTCTTGTCGTGATCTTGTTTCCAAGAAACATACTTCATCTTTAGAAGACGGCAAATGGCATTGGGTGGTTGGAATCATGGTTTCAGTCACTGTTGTGAAGTTGGTCCTTGTAATCTATTGTCGACGTTTTACGAATGAGATTGTGAAGGCATATGCTCAAGA
TCATTTCTTTGATGTCATCACAAATGCAATTGGTCTAATTGCTGCTATCCTTGCAAGTAAGCTATACTGGTGGATAGATCCTGCTGGAGCAATTGTGCTGGCTCTGTACACAATGAGAACATGGTCGAAGACAGTTTTGGAAAATGTGAACTCATTGGTTGGCAAATCAGCATCGCCTGATTATTTGCAGAAGTTGACAT
ATATCTGTTGGAATCATCACCAAGACATACAGCATATTGATACAGTGAAAGCTTACACATTTGGTTCTCATTATTTTGTCGAGGTGGACATTGTGCTACCCAGTGATATGCCTTTACAACAAGCTCATAACATTGGAGAAACACTTCAGGATAAACTGGAATCTCTTCCTGACATAGAACGGGCCTTTGTACATGTAGAC
TATGAATATACTCACAGACCCGAGCATGGGAAAAAATCCTCCTAACTCTGTACTTCAGTGTCATATTGTATAATAGGAACTTCATAATGTCATTTTCAGGTCTTCTTTTAGTCTCTCAGTGCCAATGTAATCATCCTAATGTGAAATGTCAAAGCAATATTGTGGGACTTGTAACTCTCCCCTCTTGGCAGATTATTACA
AAGTTAGCATATTTTGCTTTGGAAAAATTGCAGAAATCAACAACAAATGTATGCTGCATATTTTGCTTTGGGAAAATTGCATAAATCAACGACGAATGTATGCCTGGACTTCCTAAGAACTTGGTCTTAATGACTTAAGTTAGAAGGGGGATACAAAATTCTTGTATTTTGCTGGAAATTTTGAATAATTTTTTTTTGAA
ACATTTGTTGTCTTAGCTTGTCATCCTCTTTATATAATGAAAAATCTGCTGAATCATTCATTTCTTAAAGCCAAGGGTTATATCAACATTAAATTTGAA

>TRINITY_DN41909_c0_g1_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:

AGATGAGATTTGAAATTCCAGGCCTGCTTGTCAGTCATCCCCTTGTCAATGGACACCTTGTCTATCATCCCCTTTGCTCGGAAACTGTCCATTGTGCTCAACAATCTCAGACTTAGACGAATTCATAACTCTTCACTGCCTTTAATTTAATTTTCTAAACCACTTTTAGGATCTGATTTCAGgtcagtttcggtgtaagg
attttaggaaacaagggattaattttagtttaggtctagatgagagtaggtgtttgatgtcttgataacaaatcatccatgttgtttatgatgattctgcttttacttagtattggaaggcggtcagtttcttttgtggtgctgactattcgaaagctagggggttcttttagagtacagacctatggtttctaatcact
agggttaagtattccatctatatatgcacaatatttgggaacacgctgaaataaaacattccatcttctgataattagttttttcagtatatatgattgtgataaatttttatgtgctcttattcagtttgttgcactttattgcttaaagcattaataatttgatttacaatattttctaagcattgatcctcaagaaa
atgctctctatgcagGGAATTATGGTTTTTGCTACAATCATGGCTACACTGGGATTGGAGATCTTACTAGAGTCTTGTCGTGATCTTGTTTCCAAGAAACATACTTCATCTTTAGAAGACGGCAAATGGCATTGGGTGGTTGGAATCATGGTTTCAGTCACTGTTGTGAAGTTGGTCCTTGTAATCTATTGTCGACGTTT
TACGAATGAGATTGTGAAGGCATATGCTCAAGATCATTTCTTTGATGTCATCACAAATGCAATTGGTCTAATTGCTGCTATCCTTGCAAGTAAGCTATACTGGTGGATAGATCCTGCTGGAGCAATTGTGCTGGCTCTGTACACAATGAGAACATGGTCGAAGACAGTTTTGGAAAATGTGAACTCATTGGTTGGCAAAT
CAGCATCGCCTGATTATTTGCAGAAGTTGACATATATCTGTTGGAATCATCACCAAGACATACAGCATATTGATACAGTGAAAGCTTACACATTTGGTTCTCATTATTTTGTCGAGGTGGACATTGTGCTACCCAGTGATATGCCTTTACAACAAGCTCATAACATTGGAGAAACACTTCAGGATAAACTGGAATCTCTT
CCTGACATAGAACGGGCCTTTGTACATGTAGACTATGAATATACTCACAGACCCGAGCATGGGAAAAAATCCTCCTAACTCTGTACTTCAGTGTCATATTGTATAATAGGAACTTCATAATGTCATTTTCAGGTCTTCTTTTAGTCTCTCAGTGCCAATGTAATCATCCTAATGTGAAATGTCAAAGCAATATTGTGGGA
CTTGTAACTCTCCCCTCTTGGCAGATTATTACAAAGTTAGCATATTTTGCTTTGGAAAAATTGCAGAAATCAACAACAAATGTATGCTGCATATTTTGCTTTGGGAAAATTGCATAAATCAACGACGAATGTATGCCTGGACTTCCTAAGAACTTGGTCTTAATGACTTAAGTTAGAAGGGGGATACAAAATTCTTGTAT
TTTGCTGGAAATTTTGAATAATTTTTTTTTGAAACATTTGTTGTCTTAGCTTGTCATCCTCTTTATATAATGAAAAATCTGCTGAATCATTCATTTCTTAAAGCCAAGGGTTATATCAACATTAAATTTGAA

Intron 2 GTTTGGTGAT ... ATACTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	9.1	789	34.3	79
A2	7.39	752	25.9	60
A3	9.31	838	36.5	86
A4	10.68	627	41.1	75
A5	4.45	408	15.1	19
A6	6.86	2130	89.5	157
A7	5.99	3340.5	122.3	213
A8	6.62	1960	65	139
A9	6.2	3056	105.9	202
A10	6.27	3006.4	96.9	201

>TRINITY_DN109091_c1_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

CAAGTATGATGTGAAACGGACGTAGATCGGTAGATAATTAAGGTCAAAGAATAATGGTAAACACTGGACCGGTGAAAGAAACACTCTGAATGGGCAGGCATCCGTCTGCTAGGGCACATTCGATTTCATTGACAGAAAAAGTCTGAAGTCGACATCCTTCTGCTAGGGCACATTCAATTTCATTTACTCTCACTTTTAAC
ATCTTCAACATCTTCATGCCCATTGCACAATACTATTATTTAATCATCAACCTCTTTTGACAATCTGAATATGTATACTCTTAAGCTCGGATATTCCTGCAATATCGATTCTTCTCCTTCTGTCTTGTCGTCCTACGATGGTTGATTCTCTATCCTCGCATCCGGATGAACGTGGGACCGAAATCATGGTTTCGGAGATC
ATGCCCACGGAGGAGAATGCATGGCGCTTGAATTTCAATGGAGTTCCGAGGCCAGAAAGGGATCGAAAGCCTCGGCGCAGCCTTCTTGAAACCGTCCGTGCGATCGGTCCTGTTTATGGTGGGGTGGCCAGATATTATCAGCAGCAGGGTGAGATGCTTGATGGATTCACAGAAATGGATACTGTCAATGAGCATGGACA
TTGGTCTGGCATGTCTGAGGAAGAGTCCAACAAGGGTGCAAGAAGTGAGAGGACTGCAATTCATATATCAAACTCCGCAAACGTTGTCCTTTTCATTGCAAAAGTATATGCATCGATAAAGAGTGGATCATTAGCTATAATTGCTTCAACTCTAGATTCACTTCTGGATCTTCTATCAGGGTTTATTCTTTGGTTTACTG
CAGTTAAGATGCAGTCACCAAATCCTTACCGTTATCCCATCGGGAAGAAACGCATGCAACCGCTGGGAATTATGGTTTTTGCTACAGTCATGGCAACATTGGGATTGGAGATCTTGCTAGAGTCTTTTCGTGATCTTACTTCCAAGAAGCATACTTCATCTTTAGATGACGGAAAATGGCATTGGGTGGTTGGAATCATG
GTTTCAGTCACTATTGTGAAGTTGGTCCTTGTAATCTATTGTCGAAGTTTTACGAATGAGATTGTGAAGGCATATGCTCAAGATCATTTCTTTGATGTCATCACAAATGCAATTGGTCTAATTGCTGCTATCCTTGCAAGTAAGCTATACTGGTGGATAGATCCTGCTGGAGCAATTGTGCTGGCTCTCTACACTATGAG
AACATGGTCAAAAACGGTTTTGGAAAATGTGAAATCGATGGTTGGGAAATCAGCTTCACCTGATTATTTGCAAAAGTTGACATATCTCTGCTGGAATCATCACCAAGCTATACGACATATTGATACAGTGAAAGGCTACACATTTGGTGCTCATTACTTTGTTGAGGTAGACATTGTGCTACCCAGAGATATGCCTTTAG
AAGAGGCTCATGACGTTGGAGAAAAACTACAGGAAAAATTGGAATCTCTTCCTGAGGTAGAGCGAGCTTTTGTGCATTTAGACTATGAATGTACACATAAACCTGAGCATGGGAAAAGATACTCCTAACTTTGTACTTCAGTGTAT

>TRINITY_DN109091_c1_g1_i7 from sample A2 / Example unspliced isoform:

ACATTGGTCTGGCATGTCTGAGgtttggtgattatatttattgctgttatgtgcattccagtaaacaaattagtgcaacagtgaacctgctttcaccaacagtgtttaaagatattgaaagcagaactgtttggtcaaatacttgcagGAAGAGTCCAACAAGGGTGCAAGAAGTGAGAGGACTGCAATTCATATATCAA
ACTCCGCAAACGTTGTCCTTTTCATTGCAAAAGTATATGCATCGATAAAGAGTGGATCATTAGCTATAATTGCTTCAACTCTAGATTCACTTCTGGATCTTCTATCAGGGTTTATTCTTTGGTTTACTGCAGTTAAGATGCAGTCACCAAATCCTTACCGTTATCCCATCGGGAAGAAACGCATGCAACCGCTGGGAATT
ATGGTTTTTGCTACAGTCATGGCAACATTGGGATTGGAGATCTTGCTAGAGTCTTTTCGTGATCTTACTTCCAAG