sp|Q9LH39|PHSD_ARATH ----> Probable polyamine transporter At3g19553
Intron 1 GTCTGACTAA ... TTCTGCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 36.59 | 13 | 12 | 3 |
| A2 | 35.14 | 12 | 9 | 4 |
| A3 | 34.62 | 17 | 8 | 10 |
| A4 | 20 | 14 | 3 | 4 |
| A5 | 41.18 | 5 | 4 | 3 |
| A6 | 31.01 | 89 | 43 | 37 |
| A7 | 33.33 | 59 | 41 | 18 |
| A8 | 29.27 | 58 | 33 | 15 |
| A9 | 26.72 | 48 | 21 | 14 |
| A10 | 23.44 | 49 | 17 | 13 |
>TRINITY_DN109835_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCCAAAGACGGAGGAGTAGCGAAATCTAGCTTCAGAAATCGCCCTAGCTTCCGTTCGACGCATTCGGCCATCGAGGAATTTCCATTAATTTTCTAACAGGATGAAGGTTTTTTACCCATCTTCAAGACCATTTCTTCGACAATTATGGTTTCTCCGCTGAAAAGTAAACGTAGATGGATGCCTCTGAGGCACTAAGCTGCA
CAAGCCCAGGGCGCCAAGAGTTTACCATATATGATCACTGTGTGCATGAATTTTCCTTGAAGAAAATCTAGTTATCTTCTTGGTTTGGATTGGAATTCTGTCAGGGATGTGCGTGGCTTTATTTTTGGGAATCAGAGGGAGGAGATGCCTTCCTGAGAAAGTCCGGAGATTGGCAATGTCATACCCTGGGATTGCAAATT
TTATGGTCTCCTGGCTCAAATTTCCATATTCATCGGGTGTTATTTGATAAGAGGAACACAGCCTCAGATCTGTAACAACGGAAAAGGTCATAAATTGGTAAGTTTTTCAAGGTTTCTTCGTGTAAAATTACTCGCCCATGATCAGACTTGAAGCACACATTATCCAATGGATTATTTGAGTTAATAAAACAATTTTAAGT
TAGAGTTAAGATCAAATTATCTTCAATCAGAGACGATTACACTCAATAGCGATAAGAAATGTGAATTTTATTTGCAATTAAATAATAATGGAGTGAATCGATAATGTTAGAATGCGAGTGGGAGAAAGATAAAATGTAAATTGAACATATTGGTTGTGAACAGATCTATCGAGTCCCCAGAAACAAACCATTTTGATATC
TTGGCCAGTCTCAGTAATTGAGGGATTGGGGGACGGATAATGGAGGAGTACTCGCATGAAAGTCACGCCCAAACCAATGAGGACTCTTCCAAATATGATAAACCGGGCAATGGTGGGTTGCCTAAACTCTCCATGCTTCCTCTCGTCGCTCTTATATTCTATGAGGTCTCTGGGGGTCCTTTTGGTATAGAGGATTCTGT
AAGGGCAGGAGGCCCACTCTTGGCTTTATTGGGGTTTATCATATTTCCCTTTATCTGGAGTATCCCTGAAGCCCTAATAACAGCAGAACTTGCCACTACTTTTCCTGAGAATGGAGGTTATGTGCTCTGGATATCTGCTGCATTTGGGCCCTTTTGGGGTTTTCAAGAGGGTGTGTGGAAGTGGTTCAGTGGTGTTATGG
ACAATGCTCTCTATCCTGTTCTCTTTCTGGATTACTTGAAGCATTCATTCCCAATTTTTGCAAGAGGCTGGACACGAATCTCAACCCTCCTCGGGATCACTTTTTCTTTGACCTATCTAAACTACAGAGGATTAACCATTGTGGGCTTTGCTGCAGTAGGCCTTGCAATCTTTTCTCTTATTCCTTTTGCTGTGATGGGG
GTGTTGTCGATTCCCCGTCTTAGGCCACGACAATGGCTGATCGTTGACATAAGGAAAACTGACTGGAGAGGATACTTAAACAGCCTCTTTTGGAATCTGAATTACTGGGATAAGGCCAGTACCTTGGCTGGGGAGGTGGAATCTCCAAACAAGACCTTTCCAAAGGCTCTTATGTTAGCAGTTATTTTGGTGGTTTGTTC
CTATATAATTCCACTGCTTGCAGGTACAGGGGCTGTAGATATATCCACAAATGATTGGAGTGATGGCTATTTTGCAGAGGTGGCAATGTTGATAGGTGGTGCCTGGCTGAAATGGTGGATTCAGGCAGCAGCAGCAATGTCAAATTTGGGCTTGTTTGAAGCAGAGATGAGCGGCGATGCATTCCAGCTACTTGGCATGA
GTGAGATGGGCATGTTGCCGGAGATCTTTGCACACAGGTCCAAGCATGGAACTCCCACATTTAGCATTATCTGTTCTGCTACTGGAGTAATCTTTTTATCCTGGATGAGCTTTCAAGAGATTTTGGAGTTTCTGAATTTTGTCTACTGTATTGGGATGCTTCTTGAGTTTGCAGCTTTTGTTTGGTTGAGAATAAAGCAA
CCAGATCTCCAACGGCCTTACAAAGTCCCTTTAAATACATTTTGGGTCGCTGTCCTCTGCATCCCACCCTCAGTATTGCTCATTATTGTCATGTGCTTGGCTTCCTTAAAAACTTTAATTGTAAGCTGCGCTGTTGTCATGGTAGGCTTCTTGTTGTACCCCTGCATAGGTTACATGAAAGCAAGGGAGTATTTGAAGTT
TGTTAAGTCAGATAAGGAAGTCATAGTACCAACTTCTGAAGGCCATGGACAGACTGATGAAGATTCTATAGGACTGTTGAATGACTTGTCTTGTGAACCTAAGGAAAAGGATATCCTTATCAATTTTCAATTAAACGTGGGGAAAGACTAATACCTATAGCAACAACCGTGGATATTAAAGAAGGGCTATTGACATTCAG
TTTAAAATGGGTCCATTGAGCCCTATGTTTGGGATCACAAACTTTCAGCTATACCTTTTTGAGTATGGAGACAGCATAATGTAAATTCCTATCAAACTATTATACATGTCTAAAAAATGGCACCTTAGGGTTTCAATGAAGTTTTTATAATGGCTGCA
>TRINITY_DN109835_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCAAAGACGGAGGAGTAGCGAAATCTAGCTTCAGAAATCGCCCTAGCTTCCGTTCGACGCATTCGGCCATCGAGGAATTTCCATTAATTTTCTAACAGGATGAAGGTTTTTTACCCATCTTCAAGACCATTTCTTCGACAATTATGGTTTCTCCGCTGAAAAGTAAACGTAGATGGATGCCTCTGAGGCACTAAGCTGCA
CAAGCCCAGGGCGCCAAGAGTTTACCATATATGATCACTGTGTGCATGAATTTTCCTTGAAGAAAATCTAGTTATCTTCTTGGTTTGGATTGGAATTCTGTCAGGGATGTGCGTGGCTTTATTTTTGGGAATCAGAGGGAGGAGATGCCTTCCTGAGAAAGTCCGGAGATTGGCAATGTCATACCCTGGGATTGCAAATT
TTATGGTCTCCTGGCTCAAATTTCCATATTCATCGGGTGTTATTTGATAAGAGGAACACAGCCTCAGATCTGTAACAACGGAAAAGGTCATAAATTGGTAAGTTTTTCAAGGTTTCTTCGTGTAAAATTACTCGCCCATGATCAGACTTGAAGCACACATTATCCAATGGATTATTTGAGTTAATAAAACAATTTTAAGT
TAGAGTTAAGATCAAATTATCTTCAATCAGAGACGATTACACTCAATAGCGATAAGAAATGTGAATTTTATTTGCAATTAAATAATAATGGAGTGAATCGATAATGTTAGAATGCGAGTGGGAGAAAGATAAAATGTAAATTGAACATATTGGTTGTGAACAGATCTATCGAGTCCCCAGAAACAAACCATTTTGATATC
TTGGCCAGTCTCAGTAATTGAGGGATTGGGGGACGGATAATGGAGGAGTACTCGCATGAAAGTCACGCCCAAACCAATGAGGACTCTTCCAAATATGATAAACCGGGCAATGGTGGGTTGCCTAAACTCTCCATGCTTCCTCTCGTCGCTCTTATATTCTATGAGGTCTCTGGGGGTCCTTTTGGTATAGAGGATTCTGT
AAGGGCAGGAGGCCCACTCTTGGCTTTATTGGGGTTTATCATATTTCCCTTTATCTGGAGTATCCCTGAAGCCCTAATAACAGCAGAACTTGCCACTACTTTTCCTGAGAATGGAGGTTATGTGCTCTGGATATCTGCTGCATTTGGGCCCTTTTGGGGTTTTCAAGAGGGTGTGTGGAAGTGGTTCAGTGGTGTTATGG
ACAATGCTCTCTATCCTGTTCTCTTTCTGGATTACTTGAAGCATTCATTCCCAATTTTTGCAAGAGGCTGGACACGAATCTCAACCCTCCTCGGGATCACTTTTTCTTTGACCTATCTAAACTACAGAGGATTAACCATTGTGGGCTTTGCTGCAGTAGGCCTTGCAATCTTTTCTCTTATTCCTTTTGCTGTGATGGGG
GTGTTGTCGATTCCCCGTCTTAGGCCACGACAATGGCTGATCGTTGACATAAGGAAAACTGACTGGAGAGGATACTTAAACAGCCTCTTTTGGAATCTGAATTACTGGGATAAGGCCAGTACCTTGGCTGGGGAGGTGGAATCTCCAAACAAGACCTTTCCAAAGGCTCTTATGTTAGCAGTTATTTTGGTGGTTTGTTC
CTATATAATTCCACTGCTTGCAGGTACAGGGGCTGTAGATATATCCACAAATGATTGGAGTGATGGCTATTTTGCAGAGGTGGCAATGTTGATAGGTGGTGCCTGGCTGAAATGGTGGATTCAGGCAGCAGCAGCAATGTCAAATTTGGGCTTGTTTGAAGCAGAGATGAGCGGCGATGCATTCCAGCTACTTGGCATGA
GTGAGATGGGCATGTTGCCGGAGATCTTTGCACACAGgtctgactaatttctactcttaaactgtaatttcattttacaggacctgtgtagccaactcattggggtgaacttaactggaatctttatggcccatggctctatataaagaaatagattacttacaatctgttcatgctgggacacaaaaaaaggcacaagg
tgatgaatctttttttattttctgcacagGTCCAAGCATGGAACTCCCACATTTAGCATTATCTGTTCTGCTACTGGAGTAATCTTTTTATCCTGGATGAGCTTTCAAGAGATTTTGGAGTTTCTGAATTTTGTCTACTGTATTGGGATGCTTCTTGAGTTTGCAGCTTTTGTTTGGTTGAGAATAAAGCAACCAGATCT
CCAACGGCCTTACAAAGTCCCTTTAAATACATTTTGGGTCGCTGTCCTCTGCATCCCACCCTCAGTATTGCTCATTATTGTCATGTGCTTGGCTTCCTTAAAAACTTTAATTGTAAGCTGCGCTGTTGTCATGGTAGGCTTCTTGTTGTACCCCTGCATAGGTTACATGAAAGCAAGGGAGTATTTGAAGTTTGTTAAGT
CAGATAAGGAAGTCATAGTACCAACTTCTGAAGGCCATGGACAGACTGATGAAGATTCTATAGGACTGTTGAATGACTTGTCTTGTGAACCTAAGGAAAAGGATATCCTTATCAATTTTCAATTAAACGTGGGGAAAGACTAATACCTATAGCAACAACCGTGGATATTAAAGAAGGGCTATTGACATTCAGTTTAAAAT
GGGTCCATTGAGCCCTATGTTTGGGATCACAAACTTTCAGCTATACCTTTTTGAGTATGGAGACAGCATAATGTAAATTCCTATCAAACTATTATACATGTCTAAAAAATGGCACCTTAGGGTTTCAATGAAGTTTTTATAATGGCTGCA
Intron 2 GTAAGTTTTT ... TTGTGAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 43.84 | 9.6 | 6 | 8 |
| A2 | 68 | 4 | 4 | 11 |
| A3 | 50.65 | 5 | 3 | 6 |
| A4 | 68 | 0.8 | 1 | 2 |
| A5 | 45.67 | 4.4 | 3 | 4 |
| A6 | 56.8 | 14.6 | 12 | 24 |
| A7 | 68.52 | 6 | 8 | 17 |
| A8 | 42.11 | 10.4 | 12 | 3 |
| A9 | 52.77 | 9 | 5 | 12 |
| A10 | 47.42 | 19.4 | 7 | 20 |
>TRINITY_DN96295_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoformCGCCATTAAAAAAAACACTTTCAAATACGATATTTGAGAGCGTTGACGGAATATAGGAATGTAAAAATCTATGCAACCAAAGACGGAGGAGTAGCGAAATCTAGCTTCAGAAATCGCCCTAGCTTCCGTTCGACGCATTCGGCCATCGAGGAATTTCCATTAATTTTCTAACAGGATGAAGGTTTTTTACCCATCTTCAA
GACCATTTCTTCGACAATTATGGTTTCTCCGCTGAAAAGTAAACGTAGATGGATGCCTCTGAGGCACTAAGCTGCACAAGCCCAGGGCGCCAAGAGTCCACCATATATGATCACTGTGTGCATGAATTTTCCTTGAAGAAAATCTAGTTATCTTCTTGGTTTGGATTGGAATTCTGTCAGGGATGTGCGTGGCTTTATTT
TTGGGAATCAGAGGGAGGAGATGCCTTCCTGAGAAAGTCCGGAGATTGGCAATGTCATACCCTGGGATTGCAAATTTTATGGTCTCCTGGCTCAAATTTCCATATTCATCGGGTGTTATTTGATAAGAGGAACACAGCCTCAGATCTGTAACAACGGAAAAGGTCATAAATTGATCTATCGAGTCCCCAGAAACAAACCA
TTTTGATATCTTGGCCAGTCTCAGTAATTGAGGGATTGGGGGACGGATAATGGAGGAGTACTCGCATGAAAGTCACGCCCAAACCAATGAGGACTCTTCCAAATATGATAAACCGGGCAATGGTGGGTTGCCTAAACTCTCCATGCTTCCTCTCGTCGCTCTTATATTCTATGAGGTCTCTGGGGGTCCTTTTGGTATAG
AGGATTCTGTAAGGGCAGGAGGCCCACTCTTGGCTTTATTGGGGTTTATCATATTTCCCTTTATCTGGAGTATCCCTGAAGCCCTAATAACAGCAGAACTTGCCACTACTTTTCCTGAGAATGGAGGTTATGTGCTCTGGATATCTGCTGCATTTGGGCCCTTTTGGGGTTTTCAAGAGGGTGTGTGGAAGTGGTTCAGT
GGTGTTATGGACAATGCTCTCTATCCTGTTCTCTTTCTGGATTACTTGAAGCATTCATTCCCAATTTTTGCAAGAGGCTGGACACGAATCTCAACCCTCCTCGGGATCACTTTTTCTTTGACCTATCTAAACTACAGAGGATTAACCATTGTGGGCTTTGCTGCAGTAGGCCTTGCAATCTTTTCTCTTATTCCTTTTGC
TGTGATGGGGGTGTTGTCGATTCCCCGTCTTAGGCCACGACAATGGCTGATCGTTGACATAAGGAAAACTGACTGGAGAGGATACTTAAACAGCCTCTTTTGGAATCTGAATTACTGGGATAAGGCCAGTACCTTGGCTGGGGAGGTGGAATCTCCAAACAAGACCTTTCCAAAGGCTCTTATGTTAGCAGTTATTTTGG
TGGTTTGTTCCTATATAATTCCACTGCTTGCAGGTACAGGGGCTGTAGATATATCCACAAATGATTGGAGTGATGGCTATTTTGCAGAGGTGGCAATGTTGATAGGTGGTGCCTGGCTGAAATGGTGGATTCAGGCAGCAGCAGCAATGTCAAATTTGGGCTTGTTTGAAGCAGAGATGAGCGGCGATGCATTCCAGCTA
CTTGGCATGAGTGAGATGGGCATGTTGCCGGAGATCTTTGCACACAGGTCCAAGCATGGAACTCCCACATTTAGCATTATCTGTTCTGCTACTGGAGTAATCTTTTTATCCTGGATGAGCTTTCAAGAGATTTTGGAGTTTCTGAATTTTGTCTACTGTATTGGGATGCTTCTTGAGTTTGCAGCTTTTGTTTGGTTGAG
AATAAAGCAACCAGATCTCCAACGGCCTTACAAAGTCCCTTTAAATACATTTTGGGTCGCTGTCCTCTGCATCCCACCCTCAGTATTGCTCATTATTGTCATGTGCTTGGCTTCCTTAAAAACTTTAATTGTAAGCTG
>TRINITY_DN96295_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:CGCCATTAAAAAAAACACTTTCAAATACGATATTTGAGAGCGTTGACGGAATATAGGAATGTAAAAATCTATGCAACCAAAGACGGAGGAGTAGCGAAATCTAGCTTCAGAAATCGCCCTAGCTTCCGTTCGACGCATTCGGCCATCGAGGAATTTCCATTAATTTTCTAACAGGATGAAGGTTTTTTACCCATCTTCAA
GACCATTTCTTCGACAATTATGGTTTCTCCGCTGAAAAGTAAACGTAGATGGATGCCTCTGAGGCACTAAGCTGCACAAGCCCAGGGCGCCAAGAGTCCACCATATATGATCACTGTGTGCATGAATTTTCCTTGAAGAAAATCTAGTTATCTTCTTGGTTTGGATTGGAATTCTGTCAGGGATGTGCGTGGCTTTATTT
TTGGGAATCAGAGGGAGGAGATGCCTTCCTGAGAAAGTCCGGAGATTGGCAATGTCATACCCTGGGATTGCAAATTTTATGGTCTCCTGGCTCAAATTTCCATATTCATCGGGTGTTATTTGATAAGAGGAACACAGCCTCAGATCTGTAACAACGGAAAAGGTCATAAATTGgtaagtttttcaaggtttcttcgtgta
aaattactcgcccatgatcagacttgaagcacacattatccaatggattatttgagttaataaaacaattttaagttagagttaagatcaaattatcttcaatcagagacgattacactcaatagcgataagaaatgtgaattttatttgcaattaaataataatggagtgaatcgataatgttagaatgcgagtgggag
aaagataaaatgtaaattgaacatattggttgtgaacagATCTATCGAGTCCCCAGAAACAAACCATTTTGATATCTTGGCCAGTCTCAGTAATTGAGGGATTGGGGGACGGATAATGGAGGAGTACTCGCATGAAAGTCACGCCCAAACCAATGAGGACTCTTCCAAATATGATAAACCGGGCAATGGTGGGTTGCCTA
AACTCTCCATGCTTCCTCTCGTCGCTCTTATATTCTATGAGGTCTCTGGGGGTCCTTTTGGTATAGAGGATTCTGTAAGGGCAGGAGGCCCACTCTTGGCTTTATTGGGGTTTATCATATTTCCCTTTATCTGGAGTATCCCTGAAGCCCTAATAACAGCAGAACTTGCCACTACTTTTCCTGAGAATGGAGGTTATGTG
CTCTGGATATCTGCTGCATTTGGGCCCTTTTGGGGTTTTCAAGAGGGTGTGTGGAAGTGGTTCAGTGGTGTTATGGACAATGCTCTCTATCCTGTTCTCTTTCTGGATTACTTGAAGCATTCATTCCCAATTTTTGCAAGAGGCTGGACACGAATCTCAACCCTCCTCGGGATCACTTTTTCTTTGACCTATCTAAACTA
CAGAGGATTAACCATTGTGGGCTTTGCTGCAGTAGGCCTTGCAATCTTTTCTCTTATTCCTTTTGCTGTGATGGGGGTGTTGTCGATTCCCCGTCTTAGGCCACGACAATGGCTGATCGTTGACATAAGGAAAACTGACTGGAGAGGATACTTAAACAGCCTCTTTTGGAATCTGAATTACTGGGATAAGGCCAGTACCT
TGGCTGGGGAGGTGGAATCTCCAAACAAGACCTTTCCAAAGGCTCTTATGTTAGCAGTTATTTTGGTGGTTTGTTCCTATATAATTCCACTGCTTGCAGGTACAGGGGCTGTAGATATATCCACAAATGATTGGAGTGATGGCTATTTTGCAGAGGTGGCAATGTTGATAGGTGGTGCCTGGCTGAAATGGTGGATTCAG
GCAGCAGCAGCAATGTCAAATTTGGGCTTGTTTGAAGCAGAGATGAGCGGCGATGCATTCCAGCTACTTGGCATGAGTGAGATGGGCATGTTGCCGGAGATCTTTGCACACAGGTCCAAGCATGGAACTCCCACATTTAGCATTATCTGTTCTGCTACTGGAGTAATCTTTTTATCCTGGATGAGCTTTCAAGAGATTTT
GGAGTTTCTGAATTTTGTCTACTGTATTGGGATGCTTCTTGAGTTTGCAGCTTTTGTTTGGTTGAGAATAAAGCAACCAGATCTCCAACGGCCTTACAAAGTCCCTTTAAATACATTTTGGGTCGCTGTCCTCTGCATCCCACCCTCAGTATTGCTCATTATTGTCATGTGCTTGGCTTCCTTAAAAACTTTAATTGTAA
GCTG