NA ----> NA
Intron 1 GCATTGTTCT ... TGTCTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 61.78 | 30 | 45 | 52 |
| A2 | 61.48 | 26 | 47 | 36 |
| A3 | 62.86 | 26 | 63 | 25 |
| A4 | 67.57 | 12 | 28 | 22 |
| A5 | 64.44 | 16 | 36 | 22 |
| A6 | 59.17 | 168 | 243 | 244 |
| A7 | 60.08 | 105 | 155 | 161 |
| A8 | 62.5 | 144 | 226 | 254 |
| A9 | 63.59 | 71 | 118 | 130 |
| A10 | 65.87 | 43 | 84 | 82 |
>TRINITY_DN113371_c0_g1_i6 from sample A2 / Example spliced isoformGCGATCAAAACTTTTGTTTAAACATCCCATCCCGTCAGTTGACATGTTACTTTTTCAGAATAGGCACGTGCCGGTAACCCTGCCTGTCTGCGAATGTCTGAGCCGGATCGCATTCTTTTCAACACAAACAGTGCCTAGTCTACTACCTTCATGGAATCCAAAAGAATCATCCTCACTTCTCTTCTCCTACTCAGATGAGA
GACGAGAAGGGCTTCTTGATTTTGGGTCCAAGAGGCTACAGATCAAACTGAACAGCAGTCTCGTCAATTGTGGAACAGAACAGAAAATATCGACATTGCCAAATAAGGTTGTTGCTGTTGATTCCAGGGACCATTCTAGTAACTTTCCTGAGCTGAGGATGTCATCTCTCCTTCTCCCCCTTGTGGCCTAAATCTGATCC
GATGCAATTAACATTCCATCCATCCGGAGGAGGAGAAATCATGGGCGGACTCAAAGCCAATTTCAGAGTTAGCGCAGTGGTAATATTTACAGTTTGCGTGGGGCTAGCTGGACTTCTGGGGCTTCTCACACCCATTCCGAACGGGTGCAATATGACGTACATGTATCCCACCTACATTCCCATCCCTCTTCATCCTTCCA
ACAGTAGCATTTCCTCGGCGGCGGGGAAATATGGTCTGTATATGTACCACGAGGGCTGGAAGAAAATTGATTACGATTTGCATCTCCTCAAGCTATCGGGCGTTCCCGTGCTCTTCATTCCTGGCAATGGTGGTAGCTACAAACAGGTGCGCTCATTGGCAGCTGAGTCTGATCGAGCATTTCAGGGAGGTCCTCTAGAG
CGCACTTTTTATCAGGAAGCTTCCTTCACACCTGAAGAGGTAGTCAGAAGTTATAGTTCAACCAAAAAGAATATGCTGGAAGAGGATTGGGAGATCAGGAATCTTTTTTCAAGTGTTAAAGCACCACCCCAATATCCAAATCGTCTCGATTGGTTTGCTGTTGATCTTGAAGGTGAACATTCTGCCATGGATGGGCGGAT
ACTTGAAGAACATACTGAATATGTCGTGAAAGCCATCCACAGGATCTTGGATAGATACAAGGAGTCTTTTAATGCTAGGTCAAAGGACAATAAAGAGAATATTGGTCATCTACCAAGAAGTGTTATTTTGGTTGGCCATTCCATGGGAGGTTTTGTTGCCAGAGCGGCAAGTATTCATCCTCATTTAAGGAAAGGTGTAG
TGGAGACAATTCTCACACTTTCCAGTCCACATCAGTCACCACCCGTGGCATTGCAACCATCTTTGGGCCATTTCTTTTCACAAGTAAATAAGGCTTGGCAAAGTGGATATAAAATTCAAAGGACAAAATCGGGCCACTGGATATCAGATCCAATGCTATCTAATGTTGTGGTTGTATCTATTTCTGGTGGTATTCGTGAC
TACCAGGTACGGTCCAGATTGACCTCTTTGGATGGAATTGTACCTTCCACCCATGGTTTGACAATTGGTGCTACAGGAATGAGGAATGTTTGGTTATCAATGGAACACCAATCGATTTTATGGTGCAATCAGATGGTTGTACAGGTCTCCCATGCAATGCTTCATTTAATTGATCAGAGTACTGGTCAGCCATTTTCAAG
CACACAAAAGAGGCTTGCAGTGTTTGTCTCAAATCTTCGCAGTGGAATACCACAAAGTTTTGATTGGGCAAGGAGTGTACAATTACAGCATTATGCTGAACATTTGCCAATTGAGAAAGAAGAGGATCTGGTGGATTCAGGAAATTTGAGGATCAAAGATCAATTTTGCTGCCCAAAGTCTATTCAGTGGGCAGATGATA
GCCATGAGAGAGATTTATACATTGAATCTACAACTGTGACAGTGTTGGCTATGGATGGAAGGAGGAGATGGATGGACATAAGAAAACAGGCTTCTGATGGCAGAGATCACTTTGTTCTTGTTACAAACCTTGTTCCATGTGTTGGAGTTAGAATTCATCTCTGGCCTGAAAAAAGCAGATTGACTCTGAGAGAGGTGCCT
GCGATTAAAAGGGTAATGGAAGTAACATCCAAGATGGTACACATTCCGGCAGGACCAGCACCAAGGCAGATTGAACCTGGAAGTCAAACCGAACAGGCTCCTCCATCAGCTGTCCTCCGTCTTGGTCCAGATGAGCTACGTGGTTTCCACTTCCTGACAATATCTGTTGCACCTCGTCCGACTGTTTCTGGACGACCACC
TCCAGCAGCTTCTATGGCTGTTGGTCAGTTCTTTAGTCCAAGGGAAGGGAAAGTCAAATTTTCTCCTCAGTCACTGCTGCTTTCAAGTTACAAGCAACAGGATGTTATATTGCAGGAGAATCACCCGCTTGTCATGAACTTATCATTCTCGATAAGCATGGGTATTTTGCCTGTTACTCTAACATTGAAAACGTTAGGAT
GTGGAATAAAAGACTCTGTACTTGCAATGGAACAAACAGGCGATGAAGAACACAGCAGTCTTTGCAAGTTGCGGTGCTTCCCTCCAGTTGCACTTATTTGGGATGCAGAGTCTGGCCTGTATGTTATTCCAAATCTATATTCTGACACGGTTACTGTGGATTCCTCCCCTGCATTGTGGGGTTCAAGACAAGACTCTGGA
AAAACAACTCTATTACTCATGGTAGATCCGCACTGTTCTTACAAAATAAGTGCATCAGTTTCACTCACTGCTGCTGCAAGCAGATTCCTACTCTTACATGGGTCACAGATCATTGGTTTTGCTATGGCAATACTCTTTTTCTCTTTGATGCGACAAGCGCGTGCTTGGGAGCTTGACTTACCACTGCCATCTGTATTGTC
TGCGATAGAATCAAATTTGAGATTACCTCTATCATTCAGCTTTTTCGCGATGGGCCCACTTGCTGTTTATATGCTTCTTGCTCTGCTCGGAACAGAGCCTTGTCCACCATTTGCTAGTTTTGTAATTGTGTCTTTAGTTTGCTACACATTTGCGAATGGAGCTGTGGTTATTCTTACATTGAGCACACAACTTATTTTCT
ACATGGCAGCGTGTATTCAAGTCTTCTTCAAACAAAGGTGGCAAGCTTGGGAAGGAAGATTTCACATTTATTTTATCCATCAATTAATGGATCGTTTCTCTGTCTTCTCAAGTTTCCAGGTGGTCAGAATGCTTAGGGGGAGACCAACTCTAACAGTTGCTATAATTGTAACTGTACTCATCGCCTTTCTTCATCCAGCT
CTAGGGTTGATTGTGCTGATATTATCTCATGCATGGTGTTGCCATACTGCTCTATGCAGCCATGCACATAGAAAGAGCGATTGGCAGAACTCTAAATTAAAAGCTGAAATATTTCCACAAGGTGATAGTTCAATGATTGCTAGTGTCAAGCTGGAGGAAAATCATTCTCCATGTCCAGACTCTGCCATCAGCTTTGGTGA
GACACAGCTGGAATCTTTCAGTTACCAGCAAGGCGTGTTTTTGTTACATCTGGCTGCAACAGCCATGCTGATTCCATCGTTTGTGGCGTGGGGACAGAGACTTGGGATGGACCATACTATTCCATGGTTTCTTGATTCAGCTCTTTCGCTAGGGTTTTATTGCTACTTATCTGGTTTAGCCTTAGCCCCTTACAGAGCTT
TCTATGCTCTTGCTGCAGTTGGTCTACTTTCTGTATGCTTTAGAGTAATTAAGAGGAGATACAGAGAAAGAGGTGATTTTTACTTAAATAGAAGGCATTCTCACAGACATTGATAGCTATGTTTTACATTTGTATCCAGATGGTGCATTTAATTTAGCACCTCCGGGCTCATCATTTTTGACCCCATTCACTGAGGTCTA
ACAGTAGTAGATACACTCTTGTAGGTTAATTTATGTAATAGTAGAATCATGTGTTGCAGGTTTTCATGTGAAAATGGTATTTATCGATGTCATGATTTTTAGAGGAGCGACTTTACCAGGAATTAAATTCCATTTTAGCATTCTTTTATTCAAATTTGTTGAGGTACTACTCTATTCAAACTCATCATTTGGCCAGAAGG
GGTGATTTTCGTTTTCAATTTTTGTCTGGAAATCTAGCCAAAACTGCATTTTGATGAAACTTTGCACCTTCTCTCTTTATTTCTTATCCAGCAGGATTTTACCTTATGTTGGGCTGATAAGAAATTGCATAGCTTGGATATATAACATGGACTAATGGTCAGTGTAATACATGAATCTTATGATTCTTTATGAATTAATA
TTTTCTAAACCTACGATCGTTGAAATCCTCTATGCAGTGAAAGAAAATGGATAAACAGTGAAAGAAATAAGGAATGAATACAGAAGCCCAGTCTGCTATTTCAAATGTGCAGGGTATTCCCTAGATCGGTGCAACGATATAAATGTCCTCTGAAACTGGCGACAGCATGTAGCAAAATATTCAAGATGAGAGGTTTATTA
AATTGTTCGAACTGTTATACCTTAAAGCTCATTTGTACAAAATTATTCTATAGCAATAACGTGGACCTGAAATATAACTTGGATAGATCCAATATTGTATGTGAGCATGTGGC
>TRINITY_DN113371_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:GCGATCAAAACTTTTGTTTAAACATCCCATCCCGTCAGTTGACATGTTACTTTTTCAGAATAGGCACGTGCCGGTAACCCTGCCTGTCTGCGAATGTCTGAGCCGGATCGCATTCTTTTCAACACAAACAGTGCCTAGTCTACTACCTTCATGGAATCCAAAAGAATCATCCTCACTTCTCTTCTCCTACTCAGATGAGA
GACGAGAAGGGCTTCTTGATTTTGGGTCCAAGAGGCTACAGATCAAACTGAACAGCAGTCTCGTCAATTGTGGAACAGAACAGAAAATATCGACATTGCCAAATAAGGTTGTTGCTGTTGATTCCAGGGACCATTCTAGTAACTTTCCTGAGCTGAGAAATCATGGGCGGACTCAAAGCCAATTTCAGAGTTAGCGCAGT
GGTAATATTTACAGTTTGCGTGGGGCTAGCTGGACTTCTGGGGCTTCTCACACCCATTCCGAACGGGTGCAATATGACGTACATGTATCCCACCTACATTCCCATCCCTCTTCATCCTTCCAACAGTAGCATTTCCTCGGCGGCGGGGAAATATGGTCTGTATATGTACCACGAGGGCTGGAAGAAAATTGATTACGATT
TGCATCTCCTCAAGCTATCGGGCGTTCCCGTGCTCTTCATTCCTGGCAATGGTGGTAGCTACAAACAGGTGCGCTCATTGGCAGCTGAGTCTGATCGAGCATTTCAGGGAGGTCCTCTAGAGCGCACTTTTTATCAGGAAGCTTCCTTCACACCTGAAGAGGTAGTCAGAAGTTATAGTTCAACCAAAAAGAATATGCTG
GAAGAGGATTGGGAGATCAGGAATCTTTTTTCAAGTGTTAAAGCACCACCCCAATATCCAAATCGTCTCGATTGGTTTGCTGTTGATCTTGAAGGTGAACATTCTGCCATGGATGGGCGGATACTTGAAGAACATACTGAATATGTCGTGAAAGCCATCCACAGGATCTTGGATAGATACAAGGAGTCTTTTAATGCTAG
GTCAAAGGACAATAAAGAGAATATTGGTCATCTACCAAGAAGTGTTATTTTGGTTGGCCATTCCATGGGAGGTTTTGTTGCCAGAGCGGCAAGTATTCATCCTCATTTAAGGAAAGGTGTAGTGGAGACAATTCTCACACTTTCCAGTCCACATCAGTCACCACCCGTGGCATTGCAACCATCTTTGGGCCATTTCTTTT
CACAAGTAAATAAGGCTTGGCAAAGTGGATATAAAATTCAAAGGACAAAATCGGGCCACTGGATATCAGATCCAATGCTATCTAATGTTGTGGTTGTATCTATTTCTGGTGGTATTCGTGACTACCAGGTACGGTCCAGATTGACCTCTTTGGATGGAATTGTACCTTCCACCCATGGTTTGACAATTGGTGCTACAGGA
ATGAGGAATGTTTGGTTATCAATGGAACACCAATCGATTTTATGGTGCAATCAGATGGTTGTACAGGTCTCCCATGCAATGCTTCATTTAATTGATCAGAGTACTGGTCAGCCATTTTCAAGCACACAAAAGAGGCTTGCAGTGTTTGTCTCAAATCTTCGCAGTGGAATACCACAAAGTTTTGATTGGGCAAGGAGTGT
ACAATTACAGCATTATGCTGAACATTTGCCAATTGAGAAAGAAGAGGATCTGGTGGATTCAGGAAATTTGAGGATCAAAGATCAATTTTGCTGCCCAAAGTCTATTCAGTGGGCAGATGATAGCCATGAGAGAGATTTATACATTGAATCTACAACTGTGACAGTGTTGGCTATGGATGGAAGGAGGAGATGGATGGACA
TAAGAAAACAGGCTTCTGATGGCAGAGATCACTTTGTTCTTGTTACAAACCTTGTTCCATGTGTTGGAGTTAGAATTCATCTCTGGCCTGAAAAAAGCAGATTGACTCTGAGAGAGGTGCCTGCGATTAAAAGGGTAATGGAAGTAACATCCAAGATGGTACACATTCCGGCAGGACCAGCACCAAGGCAGATTGAACCT
GGAAGTCAAACCGAACAGGCTCCTCCATCAGCTGTCCTCCGTCTTGGTCCAGATGAGCTACGTGGTTTCCACTTCCTGACAATATCTGTTGCACCTCGTCCGACTGTTTCTGGACGACCACCTCCAGCAGCTTCTATGGCTGTTGGTCAGTTCTTTAGTCCAAGGGAAGGGAAAGTCAAATTTTCTCCTCAGTCACTGCT
GCTTTCAAGTTACAAGCAACAGGATGTTATATTGCAGGAGAATCACCCGCTTGTCATGAACTTATCATTCTCGATAAGCATGGGTATTTTGCCTGTTACTCTAACATTGAAAACGTTAGGATGTGGAATAAAAGACTCTGTACTTGCAATGGAACAAACAGGCGATGAAGAACACAGCAGTCTTTGCAAGTTGCGGTGCT
TCCCTCCAGTTGCACTTATTTGGGATGCAGAGTCTGGCCTGTATGTTATTCCAAATCTATATTCTGACACGGTTACTGTGGATTCCTCCCCTGCATTGTGGGGTTCAAGACAAGACTCTGGAAAAACAACTCTATTACTCATGGTAGATCCGCACTGTTCTTACAAAATAAGTGCATCAGTTTCACTCACTGCTGCTGCA
AGCAGATTCCTACTCTTACATGGGTCACAGATCATTGGTTTTGCTATGGCAATACTCTTTTTCTCTTTGATGCGACAAGCGCGTGCTTGGGAGCTTGACTTACCACTGCCATCTGTATTGTCTGCGATAGAATCAAATTTGAGATTACCTCTATCATTCAGCTTTTTCGCGATGGGCCCACTTGCTGTTTATATGCTTCT
TGCTCTGCTCGGAACAGAGCCTTGTCCACCATTTGCTAGTTTTGTAATTGTGTCTTTAGTTTGCTACACATTTGCGAATGGAGCTGTGGTTATTCTTACATTGAGCACACAACTTATTTTCTACATGGCAGCGTGTATTCAAGTCTTCTTCAAACAAAGGTGGCAAGCTTGGGAAGGAAGATTTCACATTTATTTTATCC
ATCAATTAATGGATCGTTTCTCTGTCTTCTCAAGTTTCCAGGTGGTCAGAATGCTTAGGGGGAGACCAACTCTAACAGTTGCTATAATTGTAACTGTACTCATCGCCTTTCTTCATCCAGCTCTAGGGTTGATTGTGCTGATATTATCTCATGCATGGTGTTGCCATACTGCTCTATGCAGCCATGCACATAGAAAGAGC
GATTGGCAGAACTCTAAATTAAAAGCTGAAATATTTCCACAAGGTGATAGTTCAATGATTGCTAGTGTCAAGCTGGAGGAAAATCATTCTCCATGTCCAGACTCTGCCATCAGCTTTGGTGAGACACAGCTGGAATCTTTCAGTTACCAGCAAGGCGTGTTTTTGTTACATCTGGCTGCAACAGCCATGCTGATTCCATC
GTTTGTGGCGTGGGGACAGAGACTTGGGATGGACCATACTATTCCATGGTTTCTTGATTCAGCTCTTTCGCTAGgcattgttcttcatggcctctgtgcttctaaagcagactgcaatgttttattacttcgttttccccacttttggggtcctcatgtaggagaagctggtttgagcctcgtctattgtctggcagGGT
TTTATTGCTACTTATCTGGTTTAGCCTTAGCCCCTTACAGAGCTTTCTATGCTCTTGCTGCAGTTGGTCTACTTTCTGTATGCTTTAGAGTAATTAAGAGGAGATACAGAGAAAGAGGTGATTTTTACTTAAATAGAAGGCATTCTCACAGACATTGATAGCTATGTTTTACATTTGTATCCAGATGGTGCATTTAATTT
AGCACCTCCGGGCTCATCATTTTTGACCCCATTCACTGAGGTCTAACAGTAGTAGATACACTCTTGTAGGTTAATTTATGTAATAGTAGAATCATGTGTTGCAGGTTTTCATGTGAAAATGGTATTTATCGATGTCATGATTTTTAGAGGAGCGACTTTACCAGGAATTAAATTCCATTTTAGCATTCTTTTATTCAAAT
TTGTTGAGGTACTACTCTATTCAAACTCATCATTTGGCCAGAAGGGGTGATTTTCGTTTTCAATTTTTGTCTGGAAATCTAGCCAAAACTGCATTTTGATGAAACTTTGCACCTTCTCTCTTTATTTCTTATCCAGCAGGATTTTACCTTATGTTGGGCTGATAAGAAATTGCATAGCTTGGATATATAACATGGACTAA
TGGTCAGTGTAATACATGAATCTTATGATTCTTTATGAATTAATATTTTCTAAACCTACGATCGTTGAAATCCTCTATGCAGTGAAAGAAAATGGATAAACAGTGAAAGAAATAAGGAATGAATACAGAAGCCCAGTCTGCTATTTCAAATGTGCAGGGTATTCCCTAGATCGGTGCAACGATATAAATGTCCTCTGAAA
CTGGCGACAGCATGTAGCAAAATATTCAAGATGAGAGGTTTATTAAATTGTTCGAACTGTTATACCTTAAAGCTCATTTGTACAAAATTATTCTATAGCAATAACGTGGACCTGAAATATAACTTGGATAGATCCAATATTGTATGTGAGCATGTGGC
Intron 2 GTACTACTCT ... CTCTATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 48 | 13 | 15 | 9 |
| A2 | 53.85 | 9 | 16 | 5 |
| A3 | 78.26 | 5 | 25 | 11 |
| A4 | 38.46 | 4 | 5 | 0 |
| A5 | 42.86 | 4 | 6 | 0 |
| A6 | 54.26 | 51 | 104 | 17 |
| A7 | 58.59 | 41 | 76 | 40 |
| A8 | 57.24 | 65 | 133 | 41 |
| A9 | 53.85 | 39 | 68 | 23 |
| A10 | 63.38 | 13 | 31 | 14 |
>TRINITY_DN33183_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformGGAATCCAAAAGAATCATCCTCACTTCTCTTCTCCTACTCAGATGAGAGACGAGAAGGGCTTCTTGATTTTGGGTCCAAGAGGCTACAGATCAAACTGAACAGCAGTCTCGTCAATTGTGGAACAGAACAGAAAATATCGACATTGCCAAATAAGGTTGTTGCTGTTGATTCCAGGGACCATTCTAGTAACTTTCCTGAG
CTGAGGATGTCATCTCTCCTTCTCCCCCTTGTGGCCTAAATCTGATCCGATGCAATTAACATTCCATCCATCCGGAGGAGGAGAAATCATGGGCGGACTCAAAGCCAATTTCAGAGTTAGCGCAGTGGTAATATTTACAGTTTGCGTGGGGCTAGCTGGACTTCTGGGGCTTCTCACACCCATTCCGAACGGGTGCAATA
TGACGTACATGTATCCCACCTACATTCCCATCCCTCTTCATCCTTCCAACAGTAGCATTTCCTCGGCGGCGGGGAAATATGGTCTGTATATGTACCACGAGGGCTGGAAGAAAATTGATTACGATTTGCATCTCCTCAAGCTATCGGGCGTTCCCGTGCTCTTCATTCCTGGCAATGGTGGTAGCTACAAACAGGTGCGC
TCATTGGCAGCTGAGTCTGATCGAGCATTTCAGGGAGGTCCTCTAGAGCGCACTTTTTATCAGGAAGCTTCCTTCACACCTGAAGAGGTAGTCAGAAGTTATAGTTCAACCAAAAAGAATATGCTGGAAGAGGATTGGGAGATCAGGAATCTTTTTTCAAGTGTTAAAGCACCACCCCAATATCCAAATCGTCTCGATTG
GTTTGCTGTTGATCTTGAAGGTGAACATTCTGCCATGGATGGGCGGATACTTGAAGAACATACTGAATATGTCGTGAAAGCCATCCACAGGATCTTGGATAGATACAAGGAGTCTTTTAATGCTAGGTCAAAGGACAATAAAGAGAATATTGGTCATCTACCAAGAAGTGTTATTTTGGTTGGCCATTCCATGGGAGGTT
TTGTTGCCAGAGCGGCAAGTATTCATCCTCATTTAAGGAAAGGTGTAGTGGAGACAATTCTCACACTTTCCAGTCCACATCAGTCACCACCCGTGGCATTGCAACCATCTTTGGGCCATTTCTTTTCACAAGTAAATAAGGCTTGGCAAAGTGGATATAAAATTCAAAGGACAAAATCGGGCCACTGGATATCAGATCCA
ATGCTATCTAATGTTGTGGTTGTATCTATTTCTGGTGGTATTCGTGACTACCAGGTACGGTCCAGATTGACCTCTTTGGATGGAATTGTACCTTCCACCCATGGTTTGACAATTGGTGCTACAGGAATGAGGAATGTTTGGTTATCAATGGAACACCAATCGATTTTATGGTGCAATCAGATGGTTGTACAGGTCTCCCA
TGCAATGCTTCATTTAATTGATCAGAGTACTGGTCAGCCATTTTCAAGCACACAAAAGAGGCTTGCAGTGTTTGTCTCAAATCTTCGCAGTGGAATACCACAAAGTTTTGATTGGGCAAGGAGTGTACAATTACAGCATTATGCTGAACATTTGCCAATTGAGAAAGAAGAGGATCTGGTGGATTCAGGAAATTTGAGGA
TCAAAGATCAATTTTGCTGCCCAAAGTCTATTCAGTGGGCAGATGATAGCCATGAGAGAGATTTATACATTGAATCTACAACTGTGACAGTGTTGGCTATGGATGGAAGGAGGAGATGGATGGACATAAGAAAACAGGCTTCTGATGGCAGAGATCACTTTGTTCTTGTTACAAACCTTGTTCCATGTGTTGGAGTTAGA
ATTCATCTCTGGCCTGAAAAAAGCAGATTGACTCTGAGAGAGGTGCCTGCGATTAAAAGGGTAATGGAAGTAACATCCAAGATGGTACACATTCCGGCAGGACCAGCACCAAGGCAGATTGAACCTGGAAGTCAAACCGAACAGGCTCCTCCATCAGCTGTCCTCCGTCTTGGTCCAGATGAGCTACGTGGTTTCCACTT
CCTGACAATATCTGTTGCACCTCGTCCGACTGTTTCTGGACGACCACCTCCAGCAGCTTCTATGGCTGTTGGTCAGTTCTTTAGTCCAAGGGAAGGGAAAGTCAAATTTTCTCCTCAGTCACTGCTGCTTTCAAGTTACAAGCAACAGGATGTTATATTGCAGGAGAATCACCCGCTTGTCATGAACTTATCATTCTCGA
TAAGCATGGGTATTTTGCCTGTTACTCTAACATTGAAAACGTTAGGATGTGGAATAAAAGACTCTGTACTTGCAATGGAACAAACAGGCGATGAAGAACACAGCAGTCTTTGCAAGTTGCGGTGCTTCCCTCCAGTTGCACTTATTTGGGATGCAGAGTCTGGCCTGTATGTTATTCCAAATCTATATTCTGACACGGTT
ACTGTGGATTCCTCCCCTGCATTGTGGGGTTCAAGACAAGACTCTGGAAAAACAACTCTATTACTCATGGTAGATCCGCACTGTTCTTACAAAATAAGTGCATCAGTTTCACTCACTGCTGCTGCAAGCAGATTCCTACTCTTACATGGGTCACAGATCATTGGTTTTGCTATGGCAATACTCTTTTTCTCTTTGATGCG
ACAAGCGCGTGCTTGGGAGCTTGACTTACCACTGCCATCTGTATTGTCTGCGATAGAATCAAATTTGAGATTACCTCTATCATTCAGCTTTTTCGCGATGGGCCCACTTGCTGTTTATATGCTTCTTGCTCTGCTCGGAACAGAGCCTTGTCCACCATTTGCTAGTTTTGTAATTGTGTCTTTAGTTTGCTACACATTTG
CGAATGGAGCTGTGGTTATTCTTACATTGAGCACACAACTTATTTTCTACATGGCAGCGTGTATTCAAGTCTTCTTCAAACAAAGGTGGCAAGCTTGGGAAGGAAGATTTCACATTTATTTTATCCATCAATTAATGGATCGTTTCTCTGTCTTCTCAAGTTTCCAGGTGGTCAGAATGCTTAGGGGGAGACCAACTCTA
ACAGTTGCTATAATTGTAACTGTACTCATCGCCTTTCTTCATCCAGCTCTAGGGTTGATTGTGCTGATATTATCTCATGCATGGTGTTGCCATACTGCTCTATGCAGCCATGCACATAGAAAGAGCGATTGGCAGAACTCTAAATTAAAAGCTGAAATATTTCCACAAGGTGATAGTTCAATGATTGCTAGTGTCAAGCT
GGAGGAAAATCATTCTCCATGTCCAGACTCTGCCATCAGCTTTGGTGAGACACAGCTGGAATCTTTCAGTTACCAGCAAGGCGTGTTTTTGTTACATCTGGCTGCAACAGCCATGCTGATTCCATCGTTTGTGGCGTGGGGACAGAGACTTGGGATGGACCATACTATTCCATGGTTTCTTGATTCAGCTCTTTCGCTAG
GCATTGTTCTTCATGGCCTCTGTGCTTCTAAAGCAGACTGCAATGTTTTATTACTTCGTTTTCCCCACTTTTGGGGTCCTCATGTAGGAGAAGCTGGTTTGAGCCTCGTCTATTGTCTGGCAGGGTTTTATTGCTACTTATCTGGTTTAGCCTTAGCCCCTTACAGAGCTTTCTATGCTCTTGCTGCAGTTGGTCTACTT
TCTGTATGCTTTAGAGTAATTAAGAGGAGATACAGAGAAAGAGGTGATTTTTACTTAAATAGAAGGCATTCTCACAGACATTGATAGCTATGTTTTACATTTGTATCCAGATGGTGCATTTAATTTAGCACCTCCGGGCTCATCATTTTTGACCCCATTCACTGAGGTCTAACAGTAGTAGATACACTCTTGTAGGTTAA
TTTATGTAATAGTAGAATCATGTGTTGCAGGTTTTCATGTGAAAATGGTATTTATCGATGTCATGATTTTTAGAGGAGCGACTTTACCAGGAATTAAATTCCATTTTAGCATTCTTTTATTCAAATTTGTTGAGTGAAAGAAAATGGATAAACAGTGAAAGAAATAAGGAATGAATACAGAAGCCCAGTCTGCTATTTCA
AATGTGCAGGGTATTCCCTAGATCGGTGCAACGATATAAATGTCCTCTGAAACTGGCGACAGCATGTAGCAAAATATTCAAGATGAGAGGTTTATTAAATTGTTCGAACTGTTATACCTTAAAGCTCATTTGTACAAAATTATTCTATAGCAATAACGTGGACCTGAAATATAACTTGGATAGATCCAATATTGTATGTG
AGCATGTGGCAAAATGTTCAAGATGAGAGGTTTATTAAA
>TRINITY_DN33183_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:GGAATCCAAAAGAATCATCCTCACTTCTCTTCTCCTACTCAGATGAGAGACGAGAAGGGCTTCTTGATTTTGGGTCCAAGAGGCTACAGATCAAACTGAACAGCAGTCTCGTCAATTGTGGAACAGAACAGAAAATATCGACATTGCCAAATAAGGTTGTTGCTGTTGATTCCAGGGACCATTCTAGTAACTTTCCTGAG
CTGAGGATGTCATCTCTCCTTCTCCCCCTTGTGGCCTAAATCTGATCCGATGCAATTAACATTCCATCCATCCGGAGGAGGAGAAATCATGGGCGGACTCAAAGCCAATTTCAGAGTTAGCGCAGTGGTAATATTTACAGTTTGCGTGGGGCTAGCTGGACTTCTGGGGCTTCTCACACCCATTCCGAACGGGTGCAATA
TGACGTACATGTATCCCACCTACATTCCCATCCCTCTTCATCCTTCCAACAGTAGCATTTCCTCGGCGGCGGGGAAATATGGTCTGTATATGTACCACGAGGGCTGGAAGAAAATTGATTACGATTTGCATCTCCTCAAGCTATCGGGCGTTCCCGTGCTCTTCATTCCTGGCAATGGTGGTAGCTACAAACAGGTGCGC
TCATTGGCAGCTGAGTCTGATCGAGCATTTCAGGGAGGTCCTCTAGAGCGCACTTTTTATCAGGAAGCTTCCTTCACACCTGAAGAGGTAGTCAGAAGTTATAGTTCAACCAAAAAGAATATGCTGGAAGAGGATTGGGAGATCAGGAATCTTTTTTCAAGTGTTAAAGCACCACCCCAATATCCAAATCGTCTCGATTG
GTTTGCTGTTGATCTTGAAGGTGAACATTCTGCCATGGATGGGCGGATACTTGAAGAACATACTGAATATGTCGTGAAAGCCATCCACAGGATCTTGGATAGATACAAGGAGTCTTTTAATGCTAGGTCAAAGGACAATAAAGAGAATATTGGTCATCTACCAAGAAGTGTTATTTTGGTTGGCCATTCCATGGGAGGTT
TTGTTGCCAGAGCGGCAAGTATTCATCCTCATTTAAGGAAAGGTGTAGTGGAGACAATTCTCACACTTTCCAGTCCACATCAGTCACCACCCGTGGCATTGCAACCATCTTTGGGCCATTTCTTTTCACAAGTAAATAAGGCTTGGCAAAGTGGATATAAAATTCAAAGGACAAAATCGGGCCACTGGATATCAGATCCA
ATGCTATCTAATGTTGTGGTTGTATCTATTTCTGGTGGTATTCGTGACTACCAGGTACGGTCCAGATTGACCTCTTTGGATGGAATTGTACCTTCCACCCATGGTTTGACAATTGGTGCTACAGGAATGAGGAATGTTTGGTTATCAATGGAACACCAATCGATTTTATGGTGCAATCAGATGGTTGTACAGGTCTCCCA
TGCAATGCTTCATTTAATTGATCAGAGTACTGGTCAGCCATTTTCAAGCACACAAAAGAGGCTTGCAGTGTTTGTCTCAAATCTTCGCAGTGGAATACCACAAAGTTTTGATTGGGCAAGGAGTGTACAATTACAGCATTATGCTGAACATTTGCCAATTGAGAAAGAAGAGGATCTGGTGGATTCAGGAAATTTGAGGA
TCAAAGATCAATTTTGCTGCCCAAAGTCTATTCAGTGGGCAGATGATAGCCATGAGAGAGATTTATACATTGAATCTACAACTGTGACAGTGTTGGCTATGGATGGAAGGAGGAGATGGATGGACATAAGAAAACAGGCTTCTGATGGCAGAGATCACTTTGTTCTTGTTACAAACCTTGTTCCATGTGTTGGAGTTAGA
ATTCATCTCTGGCCTGAAAAAAGCAGATTGACTCTGAGAGAGGTGCCTGCGATTAAAAGGGTAATGGAAGTAACATCCAAGATGGTACACATTCCGGCAGGACCAGCACCAAGGCAGATTGAACCTGGAAGTCAAACCGAACAGGCTCCTCCATCAGCTGTCCTCCGTCTTGGTCCAGATGAGCTACGTGGTTTCCACTT
CCTGACAATATCTGTTGCACCTCGTCCGACTGTTTCTGGACGACCACCTCCAGCAGCTTCTATGGCTGTTGGTCAGTTCTTTAGTCCAAGGGAAGGGAAAGTCAAATTTTCTCCTCAGTCACTGCTGCTTTCAAGTTACAAGCAACAGGATGTTATATTGCAGGAGAATCACCCGCTTGTCATGAACTTATCATTCTCGA
TAAGCATGGGTATTTTGCCTGTTACTCTAACATTGAAAACGTTAGGATGTGGAATAAAAGACTCTGTACTTGCAATGGAACAAACAGGCGATGAAGAACACAGCAGTCTTTGCAAGTTGCGGTGCTTCCCTCCAGTTGCACTTATTTGGGATGCAGAGTCTGGCCTGTATGTTATTCCAAATCTATATTCTGACACGGTT
ACTGTGGATTCCTCCCCTGCATTGTGGGGTTCAAGACAAGACTCTGGAAAAACAACTCTATTACTCATGGTAGATCCGCACTGTTCTTACAAAATAAGTGCATCAGTTTCACTCACTGCTGCTGCAAGCAGATTCCTACTCTTACATGGGTCACAGATCATTGGTTTTGCTATGGCAATACTCTTTTTCTCTTTGATGCG
ACAAGCGCGTGCTTGGGAGCTTGACTTACCACTGCCATCTGTATTGTCTGCGATAGAATCAAATTTGAGATTACCTCTATCATTCAGCTTTTTCGCGATGGGCCCACTTGCTGTTTATATGCTTCTTGCTCTGCTCGGAACAGAGCCTTGTCCACCATTTGCTAGTTTTGTAATTGTGTCTTTAGTTTGCTACACATTTG
CGAATGGAGCTGTGGTTATTCTTACATTGAGCACACAACTTATTTTCTACATGGCAGCGTGTATTCAAGTCTTCTTCAAACAAAGGTGGCAAGCTTGGGAAGGAAGATTTCACATTTATTTTATCCATCAATTAATGGATCGTTTCTCTGTCTTCTCAAGTTTCCAGGTGGTCAGAATGCTTAGGGGGAGACCAACTCTA
ACAGTTGCTATAATTGTAACTGTACTCATCGCCTTTCTTCATCCAGCTCTAGGGTTGATTGTGCTGATATTATCTCATGCATGGTGTTGCCATACTGCTCTATGCAGTTTTTTGGCGCCTTCATTTCGCAGCCATGCACATAGAAAGAGCGATTGGCAGAACTCTAAATTAAAAGCTGAAATATTTCCACAAGGTGATAG
TTCAATGATTGCTAGTGTCAAGCTGGAGGAAAATCATTCTCCATGTCCAGACTCTGCCATCAGCTTTGGTGAGACACAGCTGGAATCTTTCAGTTACCAGCAAGGCGTGTTTTTGTTACATCTGGCTGCAACAGCCATGCTGATTCCATCGTTTGTGGCGTGGGGACAGAGACTTGGGATGGACCATACTATTCCATGGT
TTCTTGATTCAGCTCTTTCGCTAGGCATTGTTCTTCATGGCCTCTGTGCTTCTAAAGCAGACTGCAATGTTTTATTACTTCGTTTTCCCCACTTTTGGGGTCCTCATGTAGGAGAAGCTGGTTTGAGCCTCGTCTATTGTCTGGCAGGGTTTTATTGCTACTTATCTGGTTTAGCCTTAGCCCCTTACAGAGCTTTCTAT
GCTCTTGCTGCAGTTGGTCTACTTTCTGTATGCTTTAGAGTAATTAAGAGGAGATACAGAGAAAGAGGTGATTTTTACTTAAATAGAAGGCATTCTCACAGACATTGATAGCTATGTTTTACATTTGTATCCAGATGGTGCATTTAATTTAGCACCTCCGGGCTCATCATTTTTGACCCCATTCACTGAGGTCTAACAGT
AGTAGATACACTCTTGTAGGTTAATTTATGTAATAGTAGAATCATGTGTTGCAGGTTTTCATGTGAAAATGGTATTTATCGATGTCATGATTTTTAGAGGAGCGACTTTACCAGGAATTAAATTCCATTTTAGCATTCTTTTATTCAAATTTGTTGAGgtactactctattcaaactcatcatttggccagaaggggtga
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