NA ----> NA

Intron 1 ATGTCTATGT ... ATTTGATGAC

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	45.36	212	202	150
A2	41.95	164	128	109
A3	40.16	149	106	94
A4	44.11	147	130	102
A5	43.28	95	70	75
A6	32.08	18	10	7
A7	-1	0	0	0
A8	0	7	0	0
A9	0	3	0	0
A10	-1	0	0	0

>TRINITY_DN120676_c3_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

GTACTATATTTGTGATTGATAATGATGATGATATGTTTGTTGTTTGATGACATGTATGTGTTTGTGTATTCATTATATTTTGATAATCGATGATAATTGGATAATGATGGCATGTATGTGTTTGTGTATTCATTATATTTTGATAATCGATGATAATTGGATAAAGATGACATGTTTGTGTTTGTGTATTCATGATATTT
TGTACTTTATTTGTGATTGTGATTGATGATAGATGATGATGATATGTTTGTGACTATGATATGATAATGATCATGTGTTTGTTGTTTGATGACATGTCTATGTTTGTATTCATGCTATTTTGTACTATGTTTGTAATTGATAATCATGATGGTGTTTTTGTTATTTGATGACATGTTTGTGTTTGTGTATTCATGTTGTT
TTGTACGATGTTTGTAATTAATAATGATAATGATGTGTTTGCTGTTTGATGACATGTTCATGTTTCTGTATTCGTGATATTTTGTACTCTGCTTGTGATTGATAATGATAATGATGTGTTTGTTGTTTGATGACATGTTTGTGTTTGTGTATTCGTGATATTTTGTACTCTGCTTGTGATTGATAATGATAATGATATAT
TTTGTACTTTGTTTGTGATTGTGATTGATGATAGATGATGATGATATGTTTGTGACTATGATATGATAATGATCATGTG

>TRINITY_DN120676_c3_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TTGTTTGTGAATGATGATGATGATATGATTGTTGTTTGATGACATGTATGCGCTTGTGTATTCATTATATTTTGATAATCGATGATAATTGGATAATGATGACATGTATGTGTTTGTGTATTCATTATATTTTGATAATGTTTGTGTTTGTGTATTCATGATATTTTGTACTTTGTTTGTGATTGTGATTGATGATAGAT
GATGATGATATGTTTGTGACTATGATATGATAATGATCATGTGTTTGTTGTTTGATGACatgtctatgtttgtattcatgctattttgtactatgtttgtaattgataatcatgatggtgtttttgttatttgatgacATGTTTGTGTTTGTGTCGTGTATTCATGATGTTTTGTACTATTCATGATGTTTGTAATTAAT
AATGATAATGATGTGTTTGTTGTTTGATGACATGTTTTTGTTTGTGTATTCATGATATTTTGTACTTTGTTTGTGATTGTGATTGATGATAGATGATGATGATATGTTTGTGACTATGATATGATAATGATCATGTG