NA ----> NA
Intron 1 GTAAAGAACT ... TCTGTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.22 | 14 | 5 | 3 |
| A2 | 12 | 11 | 3 | 0 |
| A3 | 40 | 9 | 1 | 11 |
| A4 | 73.91 | 3 | 5 | 12 |
| A5 | 29.41 | 6 | 3 | 2 |
| A6 | 24.14 | 11 | 0 | 7 |
| A7 | 38.64 | 27 | 9 | 25 |
| A8 | 23.08 | 30 | 3 | 15 |
| A9 | 17.14 | 29 | 4 | 8 |
| A10 | 31.15 | 21 | 9 | 10 |
>TRINITY_DN115040_c2_g6_i1 from sample A3 / Example spliced isoformATAACGTTTATAATGTGTAATGATGCTGTTTTTGGATTCGAGTAGCACAGATTTGTAAATAGTCCATCACTCTGCCTTGTGGGTTTGGCGGTTGATTGTTTAACCGAACAGTAGTGCAAGGATGCAAGCTTGATAACCATCTTCAGAAACCAACGTGAAGGAATGAATAATGAAGCAAAGGCGCACGATGAAGGCAATGC
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GATCCAAATAGGAAGGAACTTATTTGGCGAGGTATATCTGCTTCATTGGGAATATTAATAAGAAAAGGCGTAGTCCGGTCCCTGGAACCAATATTGTCATGTAATTTTATCGCCCCTTCAATCAGAGAGAAATTAACAAACTTTCTTTCACCAGCACACTCCAAAGTTGATCACAATATTACAGGAAGAATGGAGAAACC
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TGGGAGTAGCTCAAGTTAAACATTTATAGATAAAAAATGGATTGTACATATGAAACAAGAAGGGAACCAAATTGTACTTACATGTCATTGGTGCATCAGCATTGTCTATAAGAGCATAGCTTATACATAAAGAATAGAGGAACTACACATCAGTAGAAGCACCTATGTTATTCTGTGTGTTATGTTTTCA
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CTTGTGGTTTTGGCGGTCAATTGTTTAATTGAACAGGAATGCAAGATTTCAAGCTGGATAACCATCTTCGTAAACCACTGCGAAGGAATGAATGATGAAGCAGAAATGAGCATGATGAAGGCAAGGGATCTCTCCACGTTATCAGAAAAAATGCTATCAACTAGTTGAATTGAAGCAAAATGGCCTCCAAAATAATCCGT
AGGTCTCCCCACGAAGCCGAAGACCCACTGGAAACCCTACTGCTCCAATCCTTCACAGACTTGCAATCCCAACTAACACCACTCTACCAACTCACTCTGCACACTCCACATGAATACGCGCGCTTAATGCAAGCTCTTCTCTATGCCATCTTAACCCAACCACAGTCGGGCCAAACCCATGTCACCCACCTCAAGGCAAT
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TGTGGTTAGCCCTCGAGTTACTTCACGTTCTACATAGTAACTGGAACTGGGTCATTGCCAATCCGGGGCTTGTAACAGGTGCATTGTTTACTTACTTGAGATTATTGCCTGATCATTGTAGGTCGAAGAGCCAGTTATTGAATGTTTTGAAGAAGAATGAAATTGAATTCTGTGTTAGGGTTTTGAGGGAATGCTTCCAG
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TCTTGAAGTGTTGTAGAAGCAAGCATGTAGAGGCGAATGCGAAATTGGCATTGTTCTATGACTGGCTTTTTTTTACGGACAAGATTGACAATATCATGAATATCGAACCTGCAATTCTTCTTATGGTGCATTCTATACCAAAGTATATCGATATTACAGAATCCCTTTTGGATTTTTTGTTTCTTCTCATGGAACATTAT
GATCCAAATAGGAAGGAACTTATTTGGCGAGGTATATCTGCTTCATTGGGAATATTAATAAGAAAAGGCGTAGTCCGGTCCCTGGAACCAATATTGTCATGTAATTTTATCGCCCCTTCAATCAGAGAGAAATTAACAAACTTTCTTTCACCAGCACACTCCAAAGTTGATCACAATATTACAGGAAGAATGGAGAAACC
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TGAGTTGTAATATTATTCAAGTAGAAATCAGACTGgtaaagaacttatttttaaaccaagtttcatgttgctaatttatataatttcttttactgccaatcttatcttcttttctgttacagGATATGCAGTTTTACTAAATAATATAGTTCAAATAAAGACAGTGCACCCGGGTTCAAGAAGCGAGGTGATCGGGCTTG
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GAGAAAGTAAATGTTTCTTTGGTGTGTGTGGAGCTATGAATCCCAACACTACATTATCATGGCCCCACTTCAATGTGGTGAGCTGTCAAACTTGGCCAACACACATTGTTCTAGGGCTTTATGCTCACCACGGGTTGAACCTGGGTTGTTAGAATGGCAATGCCCTGTCTCAACCACTAGATCACCGTCCGACAAACCTA
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GCATAGCTTATACATAAAGAATAGAGGAACTACACATCAGTAGAAGCACCTATGTTATTCTGTGTGTTATGTTTTCA