sp|Q8LG03|FB345_ARATH ----> F-box protein At4g00755
Intron 1 GTGAGGAGAT ... TCCGCTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 71.37 | 12 | 19 | 41 |
| A2 | 96.68 | 1 | 20 | 38.5 |
| A3 | 89.7 | 3 | 16 | 36.5 |
| A4 | 83.44 | 6 | 20 | 40.5 |
| A5 | 100 | 0 | 4 | 17.5 |
| A6 | 44.42 | 6 | 3 | 7 |
| A7 | 70.46 | 9 | 21 | 22 |
| A8 | 59.87 | 7 | 8 | 13 |
| A9 | 55.95 | 4 | 7 | 3.5 |
| A10 | 60.58 | 16 | 20.5 | 30 |
>TRINITY_DN43281_c0_g2_i10 from sample A6 / Example spliced isoformGTGACGGTTTTCGAGATGCTGCTACACTCATTCAATGGTTCTGGAACCTTCATCTGTATAACCGTTGGCCTTAGATGCTTGCTTTTCATTGGAATTCAATCTCTGCCTGTGTTTTCTTCGCCCTTTGTTTACTGCTTTTGCGTCTCCTTTTCTTACTGTTTATTTTTTCGTTCTGTGTTTTACTGTTATTTTTTTCGTTC
TCTGTTTTCTTCTGTTAGGTTTGTTTATCGATTTTCCTTTAAGTTTCCTGTTGTTTCTATCGTTTTCTGCGACGCTCTCTATTTCATTTTTTGTAGTAGCCTACGGTTTAATGTTTCTTGGCAAAGATCCGCACGGATTTTGTGTGGAATTTTACCGTGAGAGAGTAAAGCTTGTTTGAATGTTTAATGTTTCTTGATTT
TGAAAGATCGGCATGGATTTTGTATGGAATTTTAGCGCGAGAGAGTAAAGCCTGTTTGAATTCCTTCAACATTTGCTATTCCGCTGTAGCTATGGAGGATCAGCAATCGGGAGTGAATTTTGAACCATTTTTTTAGACTAGAGGATAGTTCTGATTGAACGAGACGCTGCGTTGGATTGTTATTTAGATCAGTTGATAAA
TCTCTATGGAAGATCAGCAACGGGGAATGAATTTTGAACAATTTTTTAGGCGACCAGCTGCAGAGGATGGTTTTGATTGAAGGAGATGCTACATCGGATGTTGATAAATCTGGAAAATAACCAAAAAGCGGACCAGGCATCCAAAGAAGGGCAGAACATGGATTTTGGCACTTGGAAAGTAGTCGAAGAGAATGATGGAC
AGAGAACTGAGTTCCTACTCAGACCCTTCATTGATGAAAACATTATTTGATGCTGTTAGATAGCTGAAAAACATAGTTTTAATTTCTGTTAAAAGTGCTGATTTACATAATCGGCATGAATGGTTTTTATATAAAACTTTTGAAGTTGTAATAGAAAGATAGTCCGTTGGGACAGAACCTTATTATTTTGGAAAATAGGG
TAGCAACAATTTTTTCATTTTGAAAGAAGACGTAACAGTCTCATCAAGTGAACCAAACTTTTGGATTGGACAATTTACTGATACAGTGAATACTGCC
>TRINITY_DN43281_c0_g2_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:GTGACGGTTTTCGAGATGCTGCTACACTCATTCAATGGTTCTGGAACCTTCATCTGTATAACCGTTGGCCTTAGATGCTTGCTTTTCATTGGAATTCAATCTCTGCCTGTGTTTTCTTCGCCCTTTGTTTACTGCTTTTGCGTCTCCTTTTCTTACTGTTTATTTTTTCGTTCTGTGTTTTACTGTTATTTTTTTCGTTC
TCTGTTTTCTTCTGTTAGGTTTGTTTATCGATTTTCCTTTAAGTTTCCTGTTGTTTCTATCGTTTTCTGCGACGCTCTCTATTTCATTTTTTGTAGTAGCCTACGGTTTAATGTTTCTTGGCAAAGATCCGCACGGATTTTGTGTGGAATTTTACCGTGAGAGAGTAAAGCTTGTTTGAATGTTTAATGTTTCTTGATTT
TGAAAGATCGGCATGGATTTTGTATGGAATTTTAGCGCGAGAGAGTAAAGCCTGTTTGAATTCCTTCAACATTTGCTATTCCGCTGTAGCTATGGAGGATCAGCAATCGGGAGTGAATTTTGAACCATTTTTTTAGACTAGAGGATAGTTCTGATTGAACGAGACGCTGCGTTGGATTGTTATTTAGATCAGTTGATAAA
TCTgtgaggagatcacattataatttctctgccctttgacctttgtttactgctttttcgtctccttttcttgctgtttcctttttcgttctgtgttttattgctattttctttttcgttctctgttttcttttgttaggtttgtttattggttttccctttagtttccagttgtttctatctttttctgtgacgctctc
tatttcatttttcttagtattatactgtttaatgtttcttgattttgaaagatccgcacggattctgtgtgcaattttgtcgtaagagagtaaagcttgtttgaatttctttaacattttctattccgctgtagCTATGGAAGATCAGCAACGGGGAATGAATTTTGAACAATTTTTTAGGCGACCAGCTGCAGAGGATG
GTTTTGATTGAAGGAGATGCTACATCGGATGTTGATAAATCTGGAAAATAACCAAAAAGCGGACCAGGCATCCAAAGAAGGGCAGAACATGGATTTTGGCACTTGGAAAGTAGTCGAAGAGAATGATGGACAGAGAACTGAGTTCCTACTCAGACCCTTCATTGATGAAAACATTATTTGATGCTGTTAGATAGCTGAAA
AACATAGTTTTAATTTCTGTTAAAAGTGCTGATTTACATAATCGGCATGAATGGTTTTTATATAAAACTTTTGAAGTTGTAATAGAAAGATAGTCCGTTGGGACAGAACCTTATTATTTTGGAAAATAGGGTAGCAACAATTTTTTCATTTTGAAAGAAGACGTAACAGTCTCATCAAGTGAACCAAACTTTTGGATTGG
ACAATTTACTGATACAGTGAATACTGCC
Intron 2 GTAATTAAAT ... TTCTAAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 61.58 | 39 | 90 | 35 |
| A2 | 68.22 | 17 | 41 | 32 |
| A3 | 49.51 | 26 | 39 | 12 |
| A4 | 56 | 33 | 55 | 29 |
| A5 | 72.09 | 6 | 23 | 8 |
| A6 | 43.59 | 11 | 15 | 2 |
| A7 | 23.08 | 35 | 20 | 1 |
| A8 | 42.86 | 4 | 6 | 0 |
| A9 | 35.71 | 9 | 8 | 2 |
| A10 | 38.89 | 11 | 12 | 2 |
>TRINITY_DN47515_c0_g4_i16 from sample A10 / Example spliced isoformGGTTTTGATTGAAGGAGACGCTATATCGGATGTTGATAAATCTGATCGGCATGGATTTTGTGTGGAATTTTACCGCGAGAGAGTAAAGCTTGTTTGAATTCCTTCAACATTTGCTATTCCGCTGTAGCTTATGGAGGATCAGCAATGGGGAGTGAATTTTGAACCAATTTTTTAGACCAGAGGATGGTCCTGATTGAAGA
GATCACATTGTAATTTCTCTGCCCTTTGCCCTTTGTTTACTGCTTTTGCG
>TRINITY_DN47515_c0_g4_i19 from sample A10 / Example unspliced isoform:ATTTTTAACATCAATTCAAATTTCAAACGGTTGGCCTTAAATGCTTACTCCTCGTGAAAAAGGAGATTTGTAAATTTCTAACGCTCACGCTTTATCCGTTTCTTGCACGTCGACGGTTTTCGAGATGCTGCTACACTCATTCAATGGTTCTGGAACCTTCATCTGTATAACCGTTGGCCTTAGATGCTTGCTTTTCATTG
GAATTCAATCTCTGCCTGTGTTTTCTTCGCCCTTTGTTTACTGCTTTTGCGTCTCCTTTTCTTACTGTTTATTTTTTCGTTCTGTGTTTTACTGTTATTTTTTTCGTTCTCTGTTTTCTTCTGTTAGGTTTGTTTATCGGTTTTCCTTTTATTTTCCTGTTGTTTCTATCGTTTTCTGCGACGCTCTCTATTTTATTTTT
CGTAGTAACCTACTGTTTAATGTTTCTTGGTTTTGAAAGATCGGCACGGATTTTGTGTGGAATTTTACCGTGAGAGAGTAGAGCTTGTTTGAATGTTTAATGTTTCTTGATTTTGAAGGATCGGCACGGATTTTGTGTGGAATTTTACCGCGAGAGAGTAAAGCTTGTTTGAATTCCTTCAACATTTGCTATTCCGCTGT
AGCTTATGGAGGATCAGCAATGGGGAGTGAATTTTGAACCAATTTTTTAGACCAGgtaattaaatcgttcctatgttatgttaaaagctctgtttagttttctttctaagtcagggtttgcaaaactgtttataaagaggatagataaaagaaagactgggagatcacattgtaatttaaaatgtctatatataatatgt
tttttaagtttatgatcttacatcccttcgaataaaatctgatgagatttatatttctaagcagAGGATGGTCCTGATTGAAGAGATCACATTGTAATTTCTCTGCCCTTTGCCCTTTGTTTACTGCTTTTGCGTCTCCTTTTCTTACTGTTTATTTTTTCGTTCTGTGTTTTACTGTTATTTTTTTCGTTCTCTGTTTT
CTTCTGTTAGGTTTGTTTATCGATTTTCCTTTTAGTTTCCTGTTGTTTCTATCGTTTTCTGCGACGCTCTCTATTTCATTTTTTGTAGTAGCCTACTGTTTAATGTTTCTTGGCAAAGATCCGCACGGATTTTGTGTGGAATTTTACCGTGAGAGAGTAGAGCTTGTTTGAATGTTTAATGTTTCTTGATTTTGAAAGAT
CGGCATGGATTTTGTGTGGAATTTTAGCGCGAGGGAGTAAAGCCTGTTTGAATTCCTTCAACATTTGCTATTCCGCTGTAGCTATGGAGGATCAGCAATCGGGAGTGAATTTTGAACCATTTTTTTAGACTAGAGGATAGTTCTGATTGAACGAGACGCTGCGTTGGATTGTTATTTAGATCAGTTGATAAATCTGTGAG
GAGATCACATTATAATTTCTCTGCCCTTTGTCCTTTGTTTACTGCTTTTTCGTCTCCTTTTCTTGCTGTTTCCTTTTTCGTTCTGTGTTTTATTGCTATTTTCTTTTTCGTTCTCTGTTTTCTTTTGTTAGGTTTGTTTATTGGTTTTCCCTTTAGTTTCCAGTTGTTTCTATCTTTTTCTGTGACGCTCTCTATTTCAT
TTTTCTTAGTATTATACTGTTTAATGTTTCTTGATTTTGAAAGATCCGCACGGATTCTGTGTGCAATTTTGTCGTGAGTAAAGCTTGTTTGAATTTATTTAACATTTTCTATTCCGCTGTAGCTATGGAAGATCAGCAACGGGGAATGAATTTTGAACAATTTTTTAGGCGACCAGCTGCAGAGGATGGTTTTGATTGAA
GGAGATGCTACATCGGATGTTGATAAATCTGGTGATGGAGGAGCTCTGCGATGGAGGTAGGGTTTCACGATGGTGGAGGGTAGCTGGGAGCTACCGGCCGCGTTAGGGGAGAGGTCGCTGCCAAACCTCTCTCTGTCACATTTTTCGTGGAATTATACGGAAAACGATGGAGGAAGAATTTACTCGGGTAAGGGTTTGAG
TTTTTTATTCTGCCGCTGGTCGTTTTCTGTGTGGCATCAGGGTTCTGGAGCCCGTGGCGGAGAAGTGGGGTATTGGTGGGATTACAGATGTGATCAGGGGTTGTTTGGCTTCGGTGGAGGAATGGACATGGCAGCGTTCTCTGGGGTACAGATGGAGGATTATGATGCTTGGGGGGTGCCAGGTGGAGGGCAGATGGAGG
GCCTGGAAGGTTTCTCATTGCTAGGGACTGGTGGTACTGTATCAGCCGGTATGGGGCAGGTGAGGCCGGAATATGGATTAACAACCTCGGATTATTCGACATGCTCCCCTTGTGGTTTCTTGCCGAAAAATCTGGAAAACGATGTACTGTCAGTGGATATCTTGGGTAGTCAGGATTGGAGAGAGGCTGATGATTTCGTT
GCACGGAACCTGGGTTTTCCGGTGTCAGGGTTACTGGAAGGTTTTGAAGCAGTGGTCGAAATTGAAAAGATTGTTGATGAGGGTGTGGCTCGTCTGGTTCAGCAGTCGGTTGGGACGGTTGGAGGTGGTACTGGAGGGGCTGTGAGAGTGCCTCTGGAGATAAATGAACATCGGGGTTTTGGTAGCCCTACGGCGGTTGC
TGGGTCACAGCAGGCTCGTGTTGGGGTTGATTTGGGGGTCGGGGCTACTCGTAAAGGACCTTGCAGGCGTCGAAAGAAAAGCTGGATTAAAACCCGGATTGTGGGTAGCTATGCTGTAGGCGAGGATATTGCCTGGGAACGAGTCCTTGAGATGTCTTGTTTGACGCTGGTAGGTAGGGTTATGGGCAGAATGTTTTCCC
GTCCCACTGTGATGGCTTGGGTAGATTCACATTGGCGCGGGG