sp|P93422|SYHC_ORYSJ ----> Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic
Intron 1 GTGGAAAAAA ... TTATGTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 1 | 2 |
| A2 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A3 | 60 | 3 | 4 | 5 |
| A4 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 61.29 | 6 | 11 | 8 |
| A7 | 38.46 | 8 | 3 | 7 |
| A8 | 54.93 | 16 | 19 | 20 |
| A9 | 50 | 7 | 9 | 5 |
| A10 | 46.67 | 4 | 4 | 3 |
>TRINITY_DN120608_c0_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoformGGGCACTACATAGGAAAACATCAAAAGCAGACAGAGTATTGTATGCCAATTAATCCTTCGAGCTCCTAGTCAATTTTCCTGACCATTACGCCATGGAAACTCCACAGGTTAATTTTGTCCAACCAGGCCCTATGCATCCTCATATTTATAATGATGGTCACATATGTCTAGAAAAGAGAAATTCCACTACAAATGCTGGC
TCGACTTAAACTGCGAAGGCATCTGTTTTCTACAGCATGATGAGCTCTGTACTTGCACTTACAGAAATGGAAAATGTATTTCAGTATCTAGAACTTTCATATTGTCTAAACAAGATTGTATTTGATCTTAGTCTTGCAAGAGGTCTTGACTACTACACTGGAGTGATATATGAAGCTGTTTTCAAGGGCAGCACACAGGT
TGGTTCCATTGCAGCTGGAGGACGTTATGACAATCTTGTTGGTATGTTCAGTGGGAAGCAAGTTCCTGCCGTAGGTGTGAGCCTTGGGATTGAGAGAGTATTTACAATAATGGAGGAAGAATGCAAAAATGCAATTTATGCAACACAGACAGAAGTTTTGGTGGTGGCCTTAGGAGATGATATGGGAGTAGCTATCGAAC
TAGTTAGCAAGCTTTGGGCTGCCAAATTGAAAGCAGAATTTGTTCTAACAACCAGCAGAAAAATTGTGAAATGCATAGCTGATGCATCAAAGGCTGGTATACCTTGGATGTTGATCGTGGGTGAGAATGAACTGCAGAAGGGTTTGATTACACTGAGAGACATTCAAGCTAAGAGGCAAGAAGAGGTTCCAAGGGATAAG
ATTGTTGAGGAACTAAAGATGAGATTGAATTCTTCCAGTTCTGATAATTACATTGTTGTTCAATGAAAGGGCTCCTCAAGTTTTGATTTTATATGGAGCTCTCAGATCGTCTTATTTGCATGGGAAGGATACAAAGGCTATGAATTCACGGTGGCTGTGTTTTATTTTTATATGAGAAAACACCATGAATTCATCTGCGA
AAATTGAGAGTAATTTCCTTGTTAGTTTGCTACACTATTATATCTATTCAGCGGGAAGTTTTCAACAATTAGATGAGCCATGACAGGTATCTCATATCTGGTCAGTTTTAAGTTATGAGCTATGATGTAAATGATTCTTTAAACTATTTGAAAAGAATGTTCCATGAATCATGATTTGGATAAAATTGGCATTGTCTACA
TTTTCATTCTGCGAGAGGCTAGAAGCAACCATAGAAAGATTTATG
>TRINITY_DN120608_c0_g1_i13 from sample A3 / Example unspliced isoform:GGGCACTACATAGGAAAACATCAAAAGCAGACAGAGTATTGTATGCCAATTAATCCTTCGAGCTCCTAGTCAATTTTCCTGACCATTACGCCATGGAAACTCCACAGGTTAATTTTGTCCAACCAGGCCCTATGCATCCTCATATTTATAATGATGGTCACATATGTCTAGgtggaaaaaaaggttcactaaaagtgtct
gatagcattggatcttatgtacagAAAAGAGAAATTCCACTACAAATGCTGGCTCGACTTAAACTGCGAAGGCATCTGTTTTCTACAGCATGATGAGCTCTGTACTTGCACTTACAGAAATGGAAAATGTATTTCAGTATCTAGAACTTTCATATTGTCTAAACAAGATTGTATTTGATCTTAGTCTTGCAAGAGGTCTT
GACTACTACACTGGAGTGATATATGAAGCTGTTTTCAAGGGCAGCACACAGGTTGGTTCCATTGCAGCTGGAGGACGTTATGACAATCTTGTTGGTATGTTCAGTGGGAAGCAAGTTCCTGCCGTAGGTGTGAGCCTTGGGATTGAGAGAGTATTTACAATAATGGAGGAAGAATGCAAAAATGCAATTTATGCAACACA
GACAGAAGTTTTGGTGGTGGCCTTAGGAGATGATATGGGAGTAGCTATCGAACTAGTTAGCAAGCTTTGGGCTGCCAAATTGAAAGCAGAATTTGTTCTAACAACCAGCAGAAAAATTGTGAAATGCATAGCTGATGCATCAAAGGCTGGTATACCTTGGATGTTGATCGTGGGTGAGAATGAACTGCAGAAGGGTTTGA
TTACACTGAGAGACATTCAAGCTAAGAGGCAAGAAGAGGTTCCAAGGGATAAGATTGTTGAGGAACTAAAGATGAGATTGAATTCTTCCAGTTCTGATAATTACATTGTTGTTCAATGAAAGGGCTCCTCAAGTTTTGATTTTATATGGAGCTCTCAGATCGTCTTATTTGCATGGGAAGGATACAAAGGCTATGAATTC
ACGGTGGCTGTGTTTTATTTTTATATGAGAAAACACCATGAATTCATCTGCGAAAATTGAGAGTAATTTCCTTGTTAGTTTGCTACACTATTATATCTATTCAGCGGGAAGTTTTCAACAATTAGATGAGCCATGACAGGTATCTCATATCTGGTCAGTTTTAAGTTATGAGCTATGATGTAAATGATTCTTTAAACTAT
TTGAAAAGAATGTTCCATGAATCATGATTTGGATAAAATTGGCATTGTCTACATTTTCATTCTGCGAGAGGCTAGAAGCAACCATAGAAAGATTTATG
Intron 2 GCAAATTTCT ... TTATTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.52 | 97 | 38 | 32 |
| A2 | 22.83 | 71 | 13 | 29 |
| A3 | 27.59 | 84 | 21 | 43 |
| A4 | 30.83 | 46 | 12 | 29 |
| A5 | 38.95 | 29 | 10 | 27 |
| A6 | 21.47 | 75 | 13 | 28 |
| A7 | 22.09 | 134 | 22 | 54 |
| A8 | 23.7 | 103 | 14 | 50 |
| A9 | 24.32 | 98 | 19 | 44 |
| A10 | 22.14 | 109 | 21 | 41 |
>TRINITY_DN120608_c0_g1_i7 from sample A3 / Example spliced isoformATCGAATAGACCGCTTCATAGACTTCAAAATCTCCCCCATCTCCGAGTAACTCGCTCACCGCGAATCTAACAACAAATATTTTAATAGTTCACCAAGCATCACATTCGTCGCAGGGAAAACATAAGGTAAACATCTATGTTTGTCGGAGCACCTTCACCATAAATTGTCTCTCATTACAGGTTCCAATCCGGCGTAATTT
TGCCATTGATCGTAACAAGTTCCACTCCGGGCAACCTCGAAAAACAGGGTTTTATTTTTCCATCAATGGCAACCGTTGTCTTGGGCAGCAAGGGCTCGGCTCTGTCTGCAGAAGCGATTTACAATGTCGCACACGAACTCTCTAGGCTACAGTTAGATTCGTCGGCCTTGCAAAGGCTTTTTCAACTATCAGGTAAGTCT
TCTCCTGCTCAAGCAAACGTTCCTGCAAATGTAAATTCATACGAAAATGCGAACGGAAACGGACCGTATTTAACCCGCGTGGAAGCCAGAGCTGCACTCGTGGTACTTGTAAACAAGCTGCTGCAATCGAAGGCTCGAATCCATCCTGTTATTCCACTCTTTATTGTATATACTTTGAATAATAACAATAATAGAGCTTT
GGATCTTCCCCAGTCATATTCTGAAATAGTACGCGCGGTTGTGGGAGCAATTTACAGGTTTAAAGATGATTTCAGGGCCGAGTCTTTTACAAGAATTTCAAGGGACGATTTCTTTGTTACGGCAGAGGAAATTGAGGTCATGGAGGCGTGTTTTCCGGCCACTATCGGAATTAGTGCGCTCGCCATTTATACTTCGTCAG
CTTTGTCTGTGACTGTAGACGCTGTTGCCGCTTTGTCCTGCGAAGCTGTCCAAATTAACACGCAGGCTTTTGATCTAGAGATTTCAAGCGAGGGGTTTTCAAATAAGGCCGACAACGACGTTGCCAGTGATATGCGCACGCTTTTGTTCTGTTCGAAACTAGCGAACCCTAAGAATTTAGGGTTTGATGGAGATTGTGCG
TTTTTTGCTATCCCTTACAATCACGGATGCCTTAGAGAAAATGTTAAAATGTCTCAGAACAAGATTAGGATTGAAGTTAACAGCACAGTTTACGGTAAGAATAAATCCAGCGCTAAGCAGGGTTCAGGCGAAGCAGTGCAGCTTCAGGATTTAAAGCAGGCTGTTTTGTCACTTGCCGTTTCGTTGCAGGCGGTCGGAGC
GAATAGCTTCCGCAGAGCTGAGCGCAGTGTTAGCGTTTTTAACAGCCTCGACAGTGTTGTGAAGCTGGATGAGCATTTTCTGCGGCAGCACGATTACTCAAAGGCCTCAAACGATAAAGTGCAATCGATATTTTCTAAGGTTGTTTCTAAATGTGATTCGGACGGAGTTCTAGTGGCCAGCGATGTTCTTGCCTTGTTGC
AAGAGACGAGAAGAATTCTGGCCTGTGAAGCAGTTTGTGCACTCTCTTTGCTCAGTTTGCGGGAAAAGCTTGTTGCAGGTGGAACTGCAGAGAAAAACCGCCCCGATGAAATTGTGGCCCAGGATGTGCCTGTTAAAGAGTGCGGCAATGCAGGGGGGAACGTAGAGGAAAATAATACGAAGGCACATGAAAGAAAGGGG
AAGTCAAAAGGCGAGAAGAAGAAGAAGGGGAACCAGGAAATTGGTTTGGGAAAGGGAACTGCTACTGTCAGGGAGCTCATTGTTCAAATTATTCAAAAGAGATTACACCTTGGTACTACACCAACTCAAGTTTATGTGTCTCCGGATGAATGGGCCAAGGAATTGGATTCGTTCTTTGATCAGAAAGACTCAGAACTTCA
GATGCTCTTAGAGACTATGAAGACAATTTTAGAAAGCAATGAAACTAGAAGGTTACCTAAAATTCCCAAGGGTACCCGTGATTTCACACCAGAACAGATGGCCATAAGAGAGAGAGCATTTTCCATAATAGTAGGTGTGTTCAAGCGTCATGGTGCTGTGTCCCTTGATACTCCGGTTTTTGAATTGAGAGAAACTCTGA
TGGGAAAGTACGGTGAAGATTCCAAGCTAATCTATGACCTTGCTGATCAGGGTGGTGAAATATGCTCTTTGAGATATGATTTGACTGTGCCTTTTGCGCGGTATTTAGCTATGCATGGCATCAGCAATCTGAAAAGATATCACATTGCAAGGGTCTACAGGAGGGATAACCCTTCTAAGGGACGTTACCGCGAATTCTAT
CAATGTGATTTTGATATTGCTGGGCAGTATTCCCCAATGGTACCTGATTTTGAAGTGATGAAAGTCTTGACTGAGATCTTAGATGAACTTAACATTGGGCACTACGAGGTGAAGATGAACCATCGAAAATTGTTGGATGGAATGTTAGAGATATGTGGAGTACCTCAGGGAAAATTCAGAAGTATATGCTCTGCAATTGA
TAAGCTGGATAAGCAGCCATGGGAGCAAGTTCGAAAAGAAATGGTGGAAGAGAAAGGTTTAACTCCAGAAATGGCTGATAGCATTGGATCTCTTGTACTAAAAAGAGGAATGCCACTGCAGATGCTGGCTGAGCTTAAACAGGAAGGCAGCTGTTTTTTGCAGCATGATGGCTCTGTACATGCACTTAATGAACTGGAAA
TTTTGTTTCAGTATCTAGAGCGTTCAGGTTGTCTGAACAAGATAGTATTTGATCTTAGTCTTGCAAGAGGTCTTGACTACTACACTGGAGTGATATATGAAGCTGTTTTCAAGGGCAGCACACAGGTTGGTTCCATTGCAGCTGGAGGACGTTATGACAATCTTGTTGGTATGTTCAGTGGGAAGCAAGTTCCTGCCGTA
GGTGTGAGCCTTGGGATTGAGAGAGTATTTACAATAATGGAGGAAGAATGCAAAAATGCAATTTATGCAACACAGACAGAAGTTTTGGTGGTGGCCTTAGGAGATGATATGGGAGTAGCTATCGAACTAGTTAGCAAGCTTTGGGCTGCCAAATTGAAAGCAGAATTTGTTCTAACAACCAGCAGAAAAATTGTGAAATG
CATAGCTGATGCATCAAAGGCTGGTATACCTTGGATGTTGATCGTGGGTGAGAATGAACTGCAGAAGGGTTTGATTACACTGAGAGACATTCAAGCTAAGAGGCAAGAAGAGGTTCCAAGGGATAAGATTGTTGAGGAACTAAAGATGAGATTGAATTCTTCCAGTTCTGATAATTACATTGTTGTTCAATGAAAGGGCT
CCTCAAGTTTTGATTTTATATGGAGCTCTCAGATCGTCTTATTTGCATGGGAAGGATACAAAGGCTATGAATTCACGGTGGCTGTGTTTTATTTTTATATGAGAAAACACCATGAATTCATCTGCGAAAATTGAGAGTAATTTCCTTGTTAGTTTGCTACACTATTATATCTATTCAGCGGGAAGTTTTCAACAATTAGA
TGAGCCATGACAGGTATCTCATATCTGGTCAGTTTTAAGTTATGAGCTATGATGTAAATGATTCTTTAAACTATTTGAAAAGAATGTTCCATGAATCATGATTTGGATAAAATTGGCATTGTCTACATTTTCATTCTGCGAGAGGCTAGAAGCAACCATAGAAAGATTTATG
>TRINITY_DN120608_c0_g1_i8 from sample A3 / Example unspliced isoform:ATCGAATAGACCGCTTCATAGACTTCAAAATCTCCCCCATCTCCGAGTAACTCGCTCACCGCGAATCTAACAACAAATATTTTAATAGTTCACCAAGCATCACATTCGTCGCAGGGAAAACATAAGGTAAACATCTATGTTTGTCGGAGCACCTTCACCATAAATTGTCTCTCATTACAGGTTCCAATCCGGCGTAATTT
TGCCATTGATCGTAACAAGTTCCACTCCGGGCAACCTCGAAAAACAGGGTTTTATTTTTCCATCAATGGCAACCGTTGTCTTGGGCAGCAAGGGCTCGGCTCTGTCTGCAGAAGCGATTTACAATGTCGCACACGAACTCTCTAGGCTACAGTTAGATTCGTCGGCCTTGCAAAGGCTTTTTCAACTATCAGGTAAGTCT
TCTCCTGCTCAAGCAAACGTTCCTGCAAATGTAAATTCATACGAAAATGCGAACGGAAACGGACCGTATTTAACCCGCGTGGAAGCCAGAGCTGCACTCGTGGTACTTGTAAACAAGCTGCTGCAATCGAAGGCTCGAATCCATCCTGTTATTCCACTCTTTATTGTATATACTTTGAATAATAACAATAATAGAGCTTT
GGATCTTCCCCAGTCATATTCTGAAATAGTACGCGCGGTTGTGGGAGCAATTTACAGGTTTAAAGATGATTTCAGGGCCGAGTCTTTTACAAGAATTTCAAGGGACGATTTCTTTGTTACGGCAGAGGAAATTGAGGTCATGGAGGCGTGTTTTCCGGCCACTATCGGAATTAGTGCGCTCGCCATTTTTACTTCGTCAG
CTTTGTCTGTGACTGTAGACGCTGTTGCCGCTTTGTCCTGCGAAGCTGTCCAAATTAACACGCAGGCTTTTGATCTAGAGATTTCAAGCGAGGGGTTTTCAAATAAGGCCGACAACGACGTTGCCAGTGATATGCGCACGCTTTTGTTCTGTTCGAAACTAGCGAACCCTAAGAATTTAGGGTTTGATGGAGATTGTGCG
TTTTTTGCTATCCCTTACAATCACGGATGCCTTAGAGAAAATGTTAAAATGTCTCAGAACAAGATTAGGATTGAAGTTAACAGCACAGTTTACGGTAAGAATAAATCCAGCGCTAAGCAGGGTTCAGGCGAAGCAGTGCAGCTTCAGGATTTAAAGCAGGCTGTTTTGTCACTTGCCGTTTCGTTGCAGGCGGTCGGAGC
GAATAGCTTCCGCAGAGCTGAGCGCAGTGTTAGCGTTTTTAACAGCCTCGACAGTGTTGTGAAGCTGGATGAGCATTTTCTGCGGCAGCACGATTACTCAAAGGCCTCAAACGATAAAGTGCAATCGATATTTTCTAAGGTTGTTTCTAAATGTGATTCGGACGGAGTTCTAGTGGCCAGCGATGTTCTTGCCTTGTTGC
AAGAGACGAGAAGAATTCTGGCCTGTGAAGCAGTTTGTGCACTCTCTTTGCTCAGTTTGCGGGAAAAGCTTGTTGCAGGTGGAACTGCAGAGAAAAACCGCCCCGATGAAATTGTGGCCCAGGATGTGCCTGTTAAAGAGTGCGGCAATGCAGGGGGGAACGTAGAGGAAAATAATACGAAGGCACATGAAAGAAAGGGG
AAGTCAAAAGGCGAGAAGAAGAAGAAGGGGAACCAGGAAATTGGTTTGGGAAAGGGAACTGCTACTGTCAGGGAGCTCATTGTTCAAATTATTCAAAAGAGATTACACCTTGGTACTACACCAACTCAAGTTTATGTGTCTCCGGATGAATGGGCCAAGGAATTGGATTCGTTCTTTGATCAGAAAGACTCAGAACTTCA
GATGCTCTTAGAGACTATGAAGACAATTTTAGAAAGCAATGAAACTAGAAGGTTACCTAAAATTCCCAAGGGTACCCGTGATTTCACACCAGAACAGATGGCCATAAGAGAGAGAGCATTTTCCATAATAGTAGGTGTGTTCAAGCGTCATGGTGCTGTGTCCCTTGATACTCCGGTTTTTGAATTGAGAGAAACTCTGA
TGGGAAAGTACGGTGAAGATTCCAAGCTAATCTATGACCTTGCTGATCAGgcaaatttctgctgtacattctggagatccattattctagaatatttgctatggccatttgataaagaaccagaaactcaattctcaggcacattcaattcatgttcttagtttatgggctttaacaggggtgtagtggtccaatttcga
cctctacgctatggtgtcaacatcctttgattatggcacaatgtttcatatatgagacatggccttccttcgagtcaacaatatctccattatcagtacatatatatttaggcacagttcataagttattttatttgttttatttatattttcatgattctaaggtggcgttttgagggttatccatattgattattttg
aggattaatgggtgtagttgctgtccactttgttgaacttctatattgtttatttccagGGTGGTGAAATATGCTCTTTGAGATATGATTTGACTGTGCCTTTTGCGCGGTATTTAGCTATGCATGGCATCAGCAATCTGAAAAGATATCACATTGCAAGGGTCTACAGGAGGGATAACCCTTCTAAGGGACGTTACCGC
GAATTCTATCAATGTGATTTTGATATTGCTGGGCAGTATTCCCCAATGGTACCTGATTTTGAAGTGATGAAAGTCTTGACTGAGATCTTAGATGAACTTAACATTGGGCACTACGAGGTGAAGATGAACCATCGAAAATTGTTGGATGGAATGTTAGAGATATGTGGAGTACCTCAGGGAAAATTCAGAAGTATATGCTC
TGCAATTGATAAGCTGGATAAGCAGCCATGGGAGCAAGTTCGAAAAGAAATGGTGGAAGAGAAAGGTTTAACTCCAGAAATGGCTGATAGCATTGGATCTCTTGTACTAAAAAGAGGAATGCCACTGCAGATGCTGGCTGAGCTTAAACAGGAAGGCAGCTGTTTTTTGCAGCATGATGGCTCTGTACATGCACTTAATG
AACTGGAAATTTTGTTTCAGTATCTAGAGCGTTCAGGTTGTCTGAACAAGATAGTATTTGATCTTAGTCTTGCAAGAGGTCTTGACTACTACACTGGAGTGATATATGAAGCTGTTTTCAAGGGCAGCACACAGGTTGGTTCCATTGCAGCTGGAGGACGTTATGACAATCTTGTTGGTATGTTCAGTGGGAAGCAAGTT
CCTGCCGTAGGTGTGAGCCTTGGGATTGAGAGAGTATTTACAATAATGGAGGAAGAATGCAAAAATGCAATTTATGCAACACAGACAGAAGTTTTGGTGGTGGCCTTAGGAGATGATATGGGAGTAGCTATCGAACTAGTTAGCAAGCTTTGGGCTGCCAAATTGAAAGCAGAATTTGTTCTAACAACCAGCAGAAAAAT
TGTGAAATGCATAGCTGATGCATCAAAGGCTGGTATACCTTGGATGTTGATCGTGGGTGAGAATGAACTGCAGAAGGGTTTGATTACACTGAGAGACATTCAAGCTAAGAGGCAAGAAGAGGTTCCAAGGGATAAGATTGTTGAGGAACTAAAGATGAGATTGAATTCTTCCAGTTCTGATAATTACATTGTTGTTCAAT
GAAAGGGCTCCTCAAGTTTTGATTTTATATGGAGCTCTCAGATCGTCTTATTTGCATGGGAAGGATACAAAGGCTATGAATTCACGGTGGCTGTGTTTTATTTTTATATGAGAAAACACCATGAATTCATCTGCGAAAATTGAGAGTAATTTCCTTGTTAGTTTGCTACACTATTATATCTATTCAGCGGGAAGTTTTCA
ACAATTAGATGAGCCATGACAGGTATCTCATATCTGGTCAGTTTTAAGTTATGAGCTATGATGTAAATGATTCTTTAAACTATTTGAAAAGAATGTTCCATGAATCATGATTTGGATAAAATTGGCATTGTCTACATTTTCATTCTGCGAGAGGCTAGAAGCAACCATAGAAAGATTTATG
Intron 3 GTAATTGTTG ... AATCTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.39 | 53 | 19 | 0 |
| A2 | 12.22 | 79 | 11 | 0 |
| A3 | 20.25 | 63 | 16 | 0 |
| A4 | 20.69 | 69 | 18 | 3 |
| A5 | 18 | 41 | 9 | 0 |
| A6 | 15.19 | 67 | 12 | 0 |
| A7 | 9.77 | 120 | 13 | 0 |
| A8 | 9.9 | 91 | 10 | 0 |
| A9 | 12.64 | 152 | 22 | 0 |
| A10 | 13.79 | 125 | 20 | 0 |
>TRINITY_DN109375_c0_g1_i12 from sample A4 / Example spliced isoformAGACTTCAAAATCTCCCCCATCTCCGAGTAACTCGCTCACCGCGAATCTAACAACAAATATTTTAATAGTTCACCAAGCATCACATTCGTCGCAGGGAAAACATAAGGTAAACATCTATGTTTGTCGGAGCACCTTCACCATAAATTGTCTCTCATTACAGGTTCCAATCCGGCGTAATTTTGCCATTGATCGTAACAAG
TTCCACTCCGGGCAACCTCGAAAAACAGGGTTTTATTTTTCCATCAATGGCAACCGTTGTCTTGGGCAGCAAGGGCTCGGCTCTGTCTGCAGAAGCGATTTACAATGTCGCACACGAACTCTCTAGGCTACAGTTAGATTCGTCGGCCTTGCAAAGGCTTTTTCAACTATCAGGTAAGTCTTCTCCTGCTCAAGCAAACG
TTCCTGCAAATGTAAATTCATACGAAAATGCGAACGGAAACGGACCGTATTTAACCCGCGTGGAAGCCAGAGCTGCACTCGTGGTACTTGTAAACAAGCTGCTGCAATCGAAGGCTCGAATCCGTCCTGTTATTCCACTCTTTATTGAATATACTTTGAATAATAACGATAACAGAGCTTTGGATTTGCCCCAGTCGGAT
TCTGAAATTGTACGCGCGGTTGTGGGAGCAATTTACAGGTTTAAAGATGATTTCAGGGCCGAGTCTTTTACAAGAATTTCAAGGGACGATTTCTTTGTTACGGCAGAGGAAATTGAGGTCACGGAGGCGTGTTTTCCGGCCACTATCGGAATTAGTGCGCTCGCCATTTTTACTTCGTCAGCTTTGTCTGTGACTGTAGA
CGCTGTTGCCGCTTTGTCCTGCGAAGCTGTCCAAATTAACACGCAGGCTTTTGATCTAGAGATTTCAAGCGAGGGGTTTTCAAATAAGGCCGACAACGACGTTGCCAGTGATATGCGCACGCTTTTGTTCTGTTCGAAACTAGCAAACCCTAAGAATTTAGGGTTTGATGGAGATTGTGCGTTTTTTGCTATCCCTTACA
ATCACGGATGCCTTAGAGAAAATGTTAAAATGTCTCAGAACAAGATTAGGATTGAAGTTAACAGCACAGTTTACGGTAAGAATAAATCCAGCGCTAAGCAGGGTTCAGGCGAAGCAGTGCAGCTTCAGGATTTAAAGCAGGCTGTTTTGTCACTTGCCGTTTCGTTGCAGGCGGTCGGAGCGAATAGCTTCCGCAGAGCT
GAGCGCAGTGTTAGCGTTTTTAACAGCCTCGACAGTGTTGTGAAGCTGGATGAGCATTTTCTGCGGCAGCACGATTACTCAAAGGCCTCAAACGATAAAGTGCAATCGATATTTTCTAAGGTTGTTTCTAAATGTGATTCGGACGGAGTTCTAGTGGCCAGCGATGTTCTTGCCTTGTTGCAAGAGACGAGAAGAATTCT
GGCCTGTGAAGCAGTTTGTGCACTCTCTTTGCTCAGTTTGCGGGAAAAGCTTGTTGCAGGTGGAACTGCAGAGAAAAACCGCCCCGATGAAATTGTGGCCCAGGATGTGCCTGTTAAAGAGTGCGGCAATGCAGGGGGGAACGTAGAGGAAAATAATACGAAGGCACATGAAAGAAAGGGGAAGCCAAAAGGCGAGAAGA
AGAAGAAGGGGAACCAGGAAATTGGTTTGGGAAAGGGAACTGCTACTGTCAGGGAGCTCATTGTTCAAATTATTCAAAAGAGATTACACCTTGGTACTACACCAACTCAAGTTTATGTGTCTCCGGATGAATGGGCCAAGGAATTGGATTCGTTCTTTGATCAGAAAGACTCAGAACTTCAGATGCTCTTAGAGACTATG
AAGACAATTTTAGAAAGCAATGAAACTAGAAGGTTACCTAAAATTCCCAAGGGTACCCGTGATTTCACACCAGAACAGATGGCCATAAGAGAGAGAGCATTTTCCATAATAGTAGGTGTGTTCAAGCGTCATGGTGCTGTGTCCCTTGATACTCCGGTTTTTGAATTGAGAGAAACTCTGATGGGAAAGTACGGTGAAGA
TTCCAAGCTAATCTATGACCTTGCTGATCAGGGTGGTGAAATATGCTCTTTGAGATATGATTTGACTGTGCCTTTTGCGCGGTATTTAGCTATGCATGGCATCAGCAATCTGAAAAGATATCACATTGCAAGGGTCTACAGGAGGGATAACCCTTCTAAGGGACGTTACCGCGAATTCTATCAATGTGATTTTGATATTG
CTGGGCAGTATTCCCCAATGGTACCTGATTTTGAAGTGATGAAAGTCTTGACTGAGATCTTAGATGAACTTAACATTGGGCACTACGAGGTGAAGATGAACCATCGAAAATTGTTGGATGGAATGTTAGAGATATGTGGAGTACCTCAGGGAAAATTCAGAAGTATATGCTCTGCAATTGATAAGCTGGATAAGCAGCCA
TGGGAGCAAGTTCGAAAAGAAATGGTGGAAGAGAAAGGTTTAACTCCAGAAATGGCTGATAGCATTGGATCTCTTGTACTAAAAAGAGGAATGCCACTGCAGATGCTGGCTGAGCTTAAACAGGAAGGCAGCTGTTTTTTGCAGCATGATGGCTCTGTACATGCACTTAATGAACTGGAAATTTTGTTTCAGTATCTAGA
GCGTTCAGGTTGTCTGAACAAGATAGTATTTGATCTTAGTCTTGCAAGAGGTCTTGACTACTACACTGGAGTGATATATGAAGCTGTTTTCAAGGGCAGCACACAGGTTGGTTCCATTGCAGCTGGAGGACGTTATGACAATCTTGTTGGTATGTTCAGTGGGAAGCAAGTTCCTGCCGTAGGTGTGAGCCTTGGGATTG
AGAGAGTATTTACAATAATGGAGGAAGAATGCAAAAATGCAATTTATGCAACACAGACAGAAGTTTTGGTGGTGGCCTTAGGAGATGATATGGGAGTAGCTATCGAACTAGTTAGCAAGCTTTGGGCTGCCAAATTGAAAGCAGAATTTGTTCTAACAACCAGCAGAAAAATTGTGAAATGCATAGCTGATGCATCAAAG
GCTGGTATACCTTGGATGTTGATCGTGGGTGAGAATGAACTGCAGAAGGGTTTGATTACACTGAGAGACATTCAAGCTAAGAGGCAAGAAGAGGTTCCAAGGGATAAGATTGTTGAGGAACTAAAGATGAGATTGAATTCTTCCAGTTCTGATAATTACATTGTTGTTCAATGAAAGGGCTCCTCAAGTTTTGATTTTAT
ATGGAGCTCTCAGATCGTCTTATTTGCATGGGAAGGATACAAAGGCTATGAATTCACGGTGGCTGTGTTTTATTTTTATATGAGAAAACACCATGAATTCATCTGCGAAAATTGAGAGTAATTTCCTTGTTAGTTTGCTACACTATTATATCTATTCAGCGGGAAGTTTTCAACAATTAGATGAGCCATGACAGGTATCT
CATATCTGGTCAGTTTTAAGTTATGAGCTATGATGTAAATGATTCTTTAAACTATTTGAAAAGAATGTTCCATGAATCATGATTTGGATAAAATTGGCATTGTCTACATTTTCATTCTGCGAGAGGCTAGAAGCAACCATAGAAAGATTTATGTATGAACTGTGATAAGCAAGTCATGTTTGCACGCTGATCTATAGTTT
TGCATCAGTAAAAGACATTGTTC
>TRINITY_DN109375_c0_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:AGACTTCAAAATCTCCCCCATCTCCGAGTAACTCGCTCACCGCGAATCTAACAACAAATATTTTAATAGTTCACCAAGCATCACATTCGTCGCAGGGAAAACATAAGGTAAACATCTATGTTTGTCGGAGCACCTTCACCATAAATTGTCTCTCATTACAGGTTCCAATCCGGCGTAATTTTGCCATTGATCGTAACAAG
TTCCACTCCGGGCAACCTCGAAAAACAGGGTTTTATTTTTCCATCAATGGCAACCGTTGTCTTGGGCAGCAAGGGCTCGGCTCTGTCTGCAGAAGCGATTTACAATGTCGCACACGAACTCTCTAGGCTACAGTTAGATTCGTCGGCCTTGCAAAGGCTTTTTCAACTATCAGGTAAGTCTTCTCCTGCTCAAGCAAACG
TTCCTGCAAATGTAAATTCATACGAAAATGCGAACGGAAACGGACCGTATTTAACCCGCGTGGAAGCCAGAGCTGCACTCGTGGTACTTGTAAACAAGCTGCTGCAATCGAAGGCTCGAATCCGTCCTGTTATTCCACTCTTTATTGAATATACTTTGAATAATAACGATAACAGAGCTTTGGATTTGCCCCAGTCGGAT
TCTGAAATTGTACGCGCGGTTGTGGGAGCAATTTACAGGTTTAAAGATGATTTCAGGGCCGAGTCTTTTACAAGAATTTCAAGGGACGATTTCTTTGTTACGGCAGAGGAAATTGAGGTCACGGAGGCGTGTTTTCCGGCCACTATCGGAATTAGTGCGCTCGCCATTTTTACTTCGTCAGCTTTGTCTGTGACTGTAGA
CGCTGTTGCCGCTTTGTCCTGCGAAGCTGTCCAAATTAACACGCAGGCTTTTGATCTAGAGATTTCAAGCGAGGGGTTTTCAAATAAGGCCGACAACGACGTTGCCAGTGATATGCGCACGCTTTTGTTCTGTTCGAAACTAGCAAACCCTAAGAATTTAGGGTTTGATGGAGATTGTGCGTTTTTTGCTATCCCTTACA
ATCACGGATGCCTTAGAGAAAATGTTAAAATGTCTCAGAACAAGATTAGGATTGAAGTTAACAGCACAGTTTACGGTAAGAATAAATCCAGCGCTAAGCAGGGTTCAGGCGAAGCAGTGCAGCTTCAGGATTTAAAGCAGGCTGTTTTGTCACTTGCCGTTTCGTTGCAGGCGGTCGGAGCGAATAGCTTCCGCAGAGCT
GAGCGCAGTGTTAGCGTTTTTAACAGCCTCGACAGTGTTGTGAAGCTGGATGAGCATTTTCTGCGGCAGCACGATTACTCAAAGGCCTCAAACGATAAAGTGCAATCGATATTTTCTAAGGTTGTTTCTAAATGTGATTCGGACGGAGTTCTAGTGGCCAGCGATGTTCTTGCCTTGTTGCAAGAGACGAGAAGAATTCT
GGCCTGTGAAGCAGTTTGTGCACTCTCTTTGCTCAGTTTGCGGGAAAAGCTTGTTGCAGGTGGAACTGCAGAGAAAAACCGCCCCGATGAAATTGTGGCCCAGGATGTGCCTGTTAAAGAGTGCGGCAATGCAGGGGGGAACGTAGAGGAAAATAATACGAAGGCACATGAAAGAAAGGGGAAGCCAAAAGGCGAGAAGA
AGAAGAAGGGGAACCAGGAAATTGGTTTGGGAAAGGGAACTGCTACTGTCAGGGAGCTCATTGTTCAAATTATTCAAAAGAGATTACACCTTGGTACTACACCAACTCAAGTTTATGTGTCTCCGGATGAATGGGCCAAGGAATTGGATTCGTTCTTTGATCAGAAAGACTCAGAACTTCAGATGCTCTTAGAGACTATG
AAGACAATTTTAGAAAGCAATGAAACTAGAAGGTTACCTAAAATTCCCAAGGGTACCCGTGATTTCACACCAGAACAGATGGCCATAAGAGAGAGAGCATTTTCCATAATAGTAGGTGTGTTCAAGCGTCATGGTGCTGTGTCCCTTGATACTCCGGTTTTTGAATTGAGAGAAACTCTGATGGGAAAGTACGGTGAAGA
TTCCAAGCTAATCTATGACCTTGCTGATCAGGGTGGTGAAATATGCTCTTTGAGATATGATTTGACTGTGCCTTTTGCGCGGTATTTAGCTATGCATGGCATCAGCAATCTGAAAAGATATCACATTGCAAGGGTCTACAGGAGGGATAACCCTTCTAAGGGACGTTACCGCGAATTCTATCAATGTGATTTTGATATTG
CTGGGCAGTATTCCCCAATGGTACCTGATTTTGAAGTGATGAAAGTCTTGACTGAGATCTTAGATGAACTTAACATTGGGCACTACGAGGTGAAGATGAACCATCGAAAATTGTTGGATGGAATGTTAGAGATATGTGGAGTACCTCAGGGAAAATTCAGAAGTATATGCTCTGCAATTGATAAGCTGGATAAGCAGCCA
TGGGAGCAAGTTCGAAAAGAAATGGTGGAAGAGAAAGGTTTAACTCCAGAAATGGCTGATAGCATTGGATCTCTTGTACTAAAAAGAGGAATGCCACTGCAGATGCTGGCTGAGCTTAAACAGGAAGGCAGCTGTTTTTTGCAGCATGATGGCTCTGTACATGCACTTAATGAACTGGAAATTTTGTTTCAGTATCTAGA
GCGTTCAGGTTGTCTGAACAAGATAGTATTTGATCTTAGTCTTGCAAGAGGTCTTGACTACTACACTGGAGTGATATATGAAGCTGTTTTCAAGGGCAGCACACAGTGCAGGCAAATTTCTGCTGTACATTCTGGAGATCCATTATTCTAGAATATTTGCTATGGCCATTTGATAAAGAACCAGAAACTCAATTCTCAGG
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