sp|Q9FDX9|GG1_ARATH ----> Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma 1

Intron 1 GTATGCATGC ... TTTCTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20.12	25	3.7	6
A2	25.67	41.7	2.3	14
A3	12.15	30	3.3	4
A4	6.6	17.3	3.3	1
A5	41.88	12.7	1	9
A6	20.39	135.7	15.7	33
A7	17.28	175.3	21.7	35
A8	20.66	116.7	17.7	29
A9	13.92	167.3	18.3	26
A10	16.36	127	15.3	24

>TRINITY_DN32521_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

TTTTTGGACACTGGCAAAAACTTTAGGTAATGAAAGAATTATTGACATGCAGATATCGACATGAACTACGACCATTGGCTGTGATTCAGGTCAAAAAGAGCCAATAAAATAAACGTTATTTAAAAGATGTATATGTGTATTTATTGAGAGGAAAGAAGGTGACTGCAACACAACATTAGAGAAAATGCAGTCTAATGAGC
CGACTGTCTTGGCTTTACGCAGAATGGCTTCAAATTCTGCATTTTTTTGACACAAATTCCTTCTTATTGACGAGAATTCCTAGATGAATTCTTTGATATCAATAGATTGATCTTTTCTTGGGTTTCATTTGGAGCTCCTTTTAGGTCATCCTGCAGCAAATTTGAGTCACTCTCTGTGTTACATTGGTGTCGTCTGTTGG
TTTGCTGTTTTCTTATCATGGACTGAGATCAGTTGATGGGCAGTTAGTTAAATCATCCATGGTTTGGTATAATTTTAGGGTCCAACTGTAGAAGCCCAAATGAAGCAAATGGTCATTGCGTTATGGACTTGAAAAACCCAGTTGAAAACATCACATGAGCAGGCTGTTTGGAGATTTTGTCGTGTTTTCATAGGAACAAA
TATTCACATGGAGCAGGAAACAGATAGGTCTGTGAGTACAGGAACTCAGAATGGTCGGCCACAGAATTCGAAACCTCCAGCTACAGAGATGGATGTGGGTGGAAAGCATCGCAAGGTTGCAGAACTGCATAGACTGAATCAGGAAATTCGGTTTTTGGAGGAAGAATTAGAAGATTTGGACAAAATAGATAAAGCGACAT
CTGCTTGCAAGGAAATGCTACTGATAATTGAGAACACACCAGATCCTCTTCTGTCTGTCACAAAAGGACCAGAGAACCCAGCCTGGGATCGATGGTTTGAAGGACCAGTAGAGTCTGATGGCTGCAAGTGTTGGATAATTTGAAGGTTTTTCTCAGTTGAAATTATCTTCTATTGCTTTTATGGTGGTGTCTCAGGAGCA
TTGGTTAGCGGAGAGTTCATTTCGGGTATGAATGAAGACTTTGCTTTTGTATCAAACTCCAGGAATTGTTCTTCTCTCAATTTTTTGTGCTAGAGAACCAAGTTTCTATCAGCGCAAGGCACTTTTGTTATCTATTTGCATAAATCCTTTTATTGTTCTCCAATCTAATATCAGGCCTGCGAAAACTGGAAATACAAGAA
AGGAAAAAAGAGGTTGATTTATCCCTGATTATGCTAATGTCAATCCATTAATTGTTCCCGAGAAGTTAGAACTATCCATCTTCATTAAATGCCTTCGAAACATCTATGTATTGGCATGTGATTCTTGCCTTGTATGAAAGCTTCACTATTAAGTTCTTCTTGTTAACTCTGTTGCATTGTATTACCAGAGTGTTTCATAG
TTCAGTGATGCTTCATTTGTTCATTTCAGTAAATTTGTATCAAGCGGAATCTGGTTTCGCAGAGAATTCTTGTCATTAGTTAGGATACGGGAAGTAATCAGTTGGCGTGGACATTTGACAGATCTTTAAAGGGTATTATTGACAAAGGGAGTTTTGTTAAGCAAATCTTCTTATTGACGTGAACAATTAATTTTGACAAC
ATTTTGTTTTTTCTTGTGCATTTTTTATTTCTACATCTGTTCAATTGCAATGTGATAACACAATGTGGATTGTTATATTCGTTTCAAATATTATTAGGAATCTTCAAGGGTCTATGTGGTTA

>TRINITY_DN32521_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:

GTGAGAATGAATGTCTAGGCTTGCTTCAGCAAGCTTGATTATTGTTTCTATATTGAAATTATTTTCCTTAAATTTCAAGGATATTACAGAAAGCAAATGCACATGGTTTACTGGCATTATGCAGAAGTGAAAATGCAAAGTTAGGGGGTCAAGCTGTAAGTTTTACAATTTTACATAGGTTCATTCACATTGTGATGGGA
GTGCTTTCTGCTCTTGGTCTTACTATTAGAGAAAAATTTGCAGGGTTGTTTCTTTTGAAGCTCATTGCTCTTGTATCCAACATTTTTACTCAAACATTACAACTTTTTGTGCATGCAGGAAGAATTAGAAGATTTGGACAAAATAGATAAAGCGACATCTGCTTGCAAGGAgtatgcatgctactttagatctttagatg
atcaagttttaggagtatgcatgctactttatatctttagatgatcaagttttaggcttgctatgtagcttgaattgacagattgattacattttggttatttcttgcagAATGCTACTGATAATTGAGAACACACCAGATCCTCTTCTGTCTGTCACAAAAGGACCAGAGAACCCAGCCTGGGATCGATGGTTTGAAGG
ACCAGTAGAGTCTGATGGCTGCAAGTGTTGGATAATTTGAAGGTTTTTCTCAGTTGAAATTATCTTCTATTGCTTTTATGGTGGTGTCTCAGGAGCATTGGTTAGCGGAGAGTTCATTTCGGGTATGAATGAAGACTTTGCTTTTGTATCAAACTCCAGGAATTGTTCTTCTCTCAATTTTTTGTGCTAGAGAACCAAGT
TTCTATCAGCGCAAGGCACTTTTGTTATCTATTTGCATAAATCCTTTTATTGTTCTCCAATCTAATATCAGGCCTGCGAAAACTGGAAATACAAGAAAGGAAAAAAGAGGTTGATTTATCCCTGATTATGCTAATGTCAATCCATTAATTGTTCCCGAGAAGTTAGAACTATCCATCTTCATTAAATGCCTTCGAAACAT
CTATGTATTGGCATGTGATTCTTGCCTTGTATGAAAGCTTCACTATTAAGTTCTTCTTGTTAACTCTGTTGCATTGTATTACCAGAGTGTTTCATAGTTCAGTGATGCTTCATTTGTTCATTTCAGTAAATTTGTATCAAGCGGAATCTGGTTTCGCAGAGAATTCTTGTCATTAGTTAGGATACGGGAAGTAATCAGTT
GGCGTGGACATTTGACAGATCTTTAAAGGGTATTATTGACAAAGGGAGTTTTGTTAAGCAAATCTTCTTATTGACGTGAACAATTAATTTTGACAACATTTTGTTTTTTCTTGTGCATTTTTTATTTCTACATCTGTTCAATTGCAATGTGATAACACAATGTGGATTGTTATATTCGTTTCAAATATTATTAGGAATCT
TCAAGGGTCTATGTGGTTA

Intron 2 GTAAGTTTTA ... GTGCATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	36.36	7	5	3
A2	0	9	0	0
A3	4.76	10	1	0
A4	27.27	4	2	1
A5	33.33	3	0	3
A6	0	29	0	0
A7	1.37	36	0	1
A8	9.09	25	2	3
A9	2.7	36	1	1
A10	2.63	37	0	2

>TRINITY_DN32521_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform

TGCAAAGTTAGGGGGTCAAGCTGAAGAATTAGAAGATTTGGACAAAATAGATAAAGCGACATCTGCTTGCAAGGAAATGCTACTGATAATTGAGAACACACCAGATCCTCTTCTGTCTGTCACAAAAGGACCAGAGAACCCAGCCTGGGATCGATGGTTTGAAGGACCAGTAGAGTCTGATGGCTGCAAGTGTTGGATAA
TTTGAAGGTTTTTCTCAGTTGAAATTATCTTCTATTGCTTTTATGGTGGTGTCTCAGGAGCATTGGTTAGCGGAGAGTTCATTTCGGGTATGAATGAAGACTTTGCTTTTGTATCAAACTCCAGGAATTGTTCTTCTCTCAATTTTTTGTGCTAGAGAACCAAGTTTCTATCAGCGCAAGGCACTTTTGTTATCTATTTG
CATAAATCCTTTTATTGTTCTCCAATCTAATATCAGGCCTGCGAAAACTGGAAATACAAGAAAGGAAAAAAGAGGTTGATTTATCCCTGATTATGCTAATGTCAATCCATTAATTGTTCCCGAGAAGTTAGAACTATCCATCTTCATTAAATGCCTTCGAAACATCTATGTATTGGCATGTGATTCTTGCCTTGTATGAA
AGCTTCACTATTAAGTTCTTCTTGTTAACTCTGTTGCATTGTATTACCAGAGTGTTTCATAGTTCAGTGATGCTTCATTTGTTCATTTCAGTAAATTTGTATCAAGCGGAATCTGGTTTCGCAGAGAATTCTTGTCATTAGTTAGGATACGGGAAGTAATCAGTTGGCGTGGACATTTGACAGATCTTTAAAGGGTATTA
TTGACAAAGGGAGTTTTGTTAAGCAAATCTTCTTATTGACGTGAACAATTAATTTTGACAACATTTTGTTTTTTCTTGTGCATTTTTTATTTCTACATCTGTTCAATTGCAATGTGATAACACAATGTGGATTGTTATATTCGTTTCAAATATTATTAGGAATCTTCAAGGGTCTATGTGGTTA

>TRINITY_DN32521_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:

GTGAGAATGAATGTCTAGGCTTGCTTCAGCAAGCTTGATTATTGTTTCTATATTGAAATTATTTTCCTTAAATTTCAAGGATATTACAGAAAGCAAATGCACATGGTTTACTGGCATTATGCAGAAGTGAAAATGCAAAGTTAGGGGGTCAAGCTgtaagttttacaattttacataggttcattcacattgtgatggga
gtgctttctgctcttggtcttactattagagaaaaatttgcagggttgtttcttttgaagctcattgctcttgtatccaacatttttactcaaacattacaactttttgtgcatgcagGAAGAATTAGAAGATTTGGACAAAATAGATAAAGCGACATCTGCTTGCAAGGAGTATGCATGCTACTTTAGATCTTTAGATG
ATCAAGTTTTAGGAGTATGCATGCTACTTTATATCTTTAGATGATCAAGTTTTAGGCTTGCTATGTAGCTTGAATTGACAGATTGATTACATTTTGGTTATTTCTTGCAGAATGCTACTGATAATTGAGAACACACCAGATCCTCTTCTGTCTGTCACAAAAGGACCAGAGAACCCAGCCTGGGATCGATGGTTTGAAGG
ACCAGTAGAGTCTGATGGCTGCAAGTGTTGGATAATTTGAAGGTTTTTCTCAGTTGAAATTATCTTCTATTGCTTTTATGGTGGTGTCTCAGGAGCATTGGTTAGCGGAGAGTTCATTTCGGGTATGAATGAAGACTTTGCTTTTGTATCAAACTCCAGGAATTGTTCTTCTCTCAATTTTTTGTGCTAGAGAACCAAGT
TTCTATCAGCGCAAGGCACTTTTGTTATCTATTTGCATAAATCCTTTTATTGTTCTCCAATCTAATATCAGGCCTGCGAAAACTGGAAATACAAGAAAGGAAAAAAGAGGTTGATTTATCCCTGATTATGCTAATGTCAATCCATTAATTGTTCCCGAGAAGTTAGAACTATCCATCTTCATTAAATGCCTTCGAAACAT
CTATGTATTGGCATGTGATTCTTGCCTTGTATGAAAGCTTCACTATTAAGTTCTTCTTGTTAACTCTGTTGCATTGTATTACCAGAGTGTTTCATAGTTCAGTGATGCTTCATTTGTTCATTTCAGTAAATTTGTATCAAGCGGAATCTGGTTTCGCAGAGAATTCTTGTCATTAGTTAGGATACGGGAAGTAATCAGTT
GGCGTGGACATTTGACAGATCTTTAAAGGGTATTATTGACAAAGGGAGTTTTGTTAAGCAAATCTTCTTATTGACGTGAACAATTAATTTTGACAACATTTTGTTTTTTCTTGTGCATTTTTTATTTCTACATCTGTTCAATTGCAATGTGATAACACAATGTGGATTGTTATATTCGTTTCAAATATTATTAGGAATCT
TCAAGGGTCTATGTGGTTA

Intron 3 GTATGAATGA ... TTCATTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	76.67	7	27	19
A2	77.08	11	53	21
A3	73.91	6	29	5
A4	76.47	6	27	12
A5	89.47	1	13	4
A6	68.4	137	359	234
A7	70.03	92	303	127
A8	66.54	150	344.5	252
A9	69.69	126	366.5	213
A10	74.26	65	277	98

>TRINITY_DN104943_c0_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoform

GCAACACAACATTAGAGAAAATGCAGTCTAATGAGCCGACTGTCTTGGCTTTACGCAGAATGGCTTCAAATTCTGCATTTTTTTGACACAAATTCCTTCTTATTGACGAGAATTCCTAGATGAATTCTTTGATATCAATAGATTGATCTTTTCTTGGGTTTCATTTGGAGCTCCTTTTAGGTCATCCTGCAGCAAATTTG
AGTCACTCTCTGTGTTACATTGGTGTCGTCTGTTGGTTTGCTGTTTTCTTATCATGGACTGAGATCAGTTGATGGGCAGTTAGTTAAATCATCCATGGTTTGGTATAATTTTAGGGTCCAACTGTAGAAGCCCAAATGAAGCAAATGGTCATTGCGTTATGGACTTGAAAAACCCAGTTGAAAACATCACATGAGCAGGC
TGTTTGGAGATTTTGTCGTGTTTTCATAGGAACAAATATTCACATGGAGCAGGAAACAGATAGGTCTGTGAGTACAGGAACTCAGAATGGTCGGCCACAGAATTCGAAACCTCCAGCTACAGAGATGGATGTGGGTGGAAAGCATCGCAAGGTTGCAGAACTGCATAGACTGAATCAGGAAATTCGGTTTTTGGAGGAAG
AATTAGAAGATTTGGACAAAATAGATAAAGCGACATCTGCTTGCAAGGAAATGCTACTGATAATTGAGAACACACCAGATCCTCTTCTGTCTGTCACAAAAGGACCAGAGAACCCAGCCTGGGATCGATGGTTTGAAGGACCAGTAGAGTCTGATGGTTGCAAGTGTTGGATAATTTGAAGGTTTTTCTCAGTTGAAATT
ATCTTCTATTGCTTTTATGGTGGTGTCTCAGGAGCATTGGTTAGCGGAGAGTTCATTTCGGTAAATTTGTATCAAGCGGAATCTGGTTTCGCAGAGAATTCTTGTCATTAGTTAGGATACGGGAAGTAATCAGTTGGCGTGGACATTTGACAGATCTTTAAAGGGTATTATTGACAAAGGGAGTTTTGTTAAGCAAATCT
TCTTATTGACGTGAACAATTAATTTTGACAACATTTTGTTTTTTCTTGTGCATTTTTTATTTCTACATCTGTTCAATTGCAATGTGATAACACAATGTGGATTGTTATATTCGTTTCAAATATTATTAGGAATCTTCAAGGGTCTATGTGGTTAAGTACATATTCTTTTGGC

>TRINITY_DN104943_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GCAACACAACATTAGAGAAAATGCAGTCTAATGAGCCGACTGTCTTGGCTTTACGCAGAATGGCTTCAAATTCTGCATTTTTTTGACACAAATTCCTTCTTATTGACGAGAATTCCTAGATGAATTCTTTGATATCAATAGATTGATCTTTTCTTGGGTTTCATTTGGAGCTCCTTTTAGGTCATCCTGCAGCAAATTTG
AGTCACTCTCTGTGTTACATTGGTGTCGTCTGTTGGTTTGCTGTTTTCTTATCATGGACTGAGATCAGTTGATGGGCAGTTAGTTAAATCATCCATGGTTTGGTATAATTTTAGGGTCCAACTGTAGAAGCCCAAATGAAGCAAATGGTCATTGCGTTATGGACTTGAAAAACCCAGTTGAAAACATCACATGAGCAGGC
TGTTTGGAGATTTTGTCGTGTTTTCATAGGAACAAATATTCACATGGAGCAGGAAACAGATAGGTCTGTGAGTACAGGAACTCAGAATGGTCGGCCACAGAATTCGAAACCTCCAGCTACAGAGATGGATGTGGGTGGAAAGCATCGCAAGGTTGCAGAACTGCATAGACTGAATCAGGAAATTCGGTTTTTGGAGGAAG
AATTAGAAGATTTGGACAAAATAGATAAAGCGACATCTGCTTGCAAGGAAATGCTACTGATAATTGAGAACACACCAGATCCTCTTCTGTCTGTCACAAAAGGACCAGAGAACCCAGCCTGGGATCGATGGTTTGAAGGACCAGTAGAGTCTGATGGTTGCAAGTGTTGGATAATTTGAAGGTTTTTCTCAGTTGAAATT
ATCTTCTATTGCTTTTATGGTGGTGTCTCAGGAGCATTGGTTAGCGGAGAGTTCATTTCGGgtatgaatgaagactttgcttttgtatcaaactccaggaattgttcttctctcaattttttgtgctagagaaccaagtttctatcagcgcaaggcacttttgttatctatttgcataaatccttttattgttctccaat
ctaatatcaggcctgcgaaaactggaaatacaagaaaggaaaaaagaggttgatttatccctgattatgctaatgtcaatccattaattgttcccgagaagttagaactatccatcttcattaaatgccttcgaaacatctatgtattggcatgtgattcttgccttgtatgaaagcttcactattaagttcttcttgtt
aactctgttgcattgtattaccagagtgtttcatagttcagtgatgcttcatttgttcatttcagTAAATTTGTATCAAGCGGAATCTGGTTTCGCAGAGAATTCTTGTCATTAGTTAGGATACGGGAAGTAATCAGTTGGCGTGGACATTTGACAGATCTTTAAAGGGTATTATTGACAAAGGGAGTTTTGTTAAGCAA
ATCTTCTTATTGACGTGAACAATTAATTTTGACAACATTTTGTTTTTTCTTGTGCATTTTTTATTTCTACATCTGTTCAATTGCAATGTGATAACACAATGTGGATTGTTATATTCGTTTCAAATATTATTAGGAATCTTCAAGGGTCTATGTGGTTAAGTACATATTCTTTTGGC