NA ----> NA
Intron 1 GCAAGTCGTC ... TGTAATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 41.18 | 10 | 7 | 6.7 |
| A2 | 38.89 | 11 | 7 | 5.3 |
| A3 | 38.46 | 24 | 15 | 8 |
| A4 | 15.38 | 11 | 2 | 6.3 |
| A5 | 47.06 | 18 | 16 | 6 |
| A6 | 31.25 | 22 | 10 | 4 |
| A7 | 35.94 | 41 | 23 | 8 |
| A8 | 42.86 | 28 | 21 | 5.3 |
| A9 | 52.78 | 34 | 38 | 7.3 |
| A10 | 44.83 | 32 | 26 | 8.7 |
>TRINITY_DN115609_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformAAAGCACCAATTGACCCATTTACACGAGAGCGTAGTAAACCCTCAGCATCTCAGGGAGTGCCACTTGGTGGTATGGGGAGTGGTAGCATACGCAGAGGATTCAGAGGAGAGTTCAAACACTGGCAAATGATACCTGGGGTGTGTAAAGCATCTCCAGTGCTGGCAAATCAGTTTTCAATTTTTGTTTCTCGTGATGGGGG
ACGGAAAAAGTATGCATCTGTCTTGGCTCCAGGACGTCCTGAAGAGCTTGGGAAAGGAGACGATTTTGGCATTTCTAATTGGGATTGGGCTTTGGATGGTCAACATTCAACATATCATGCACTATTTCCAAGAGCCTGGACAATATATGATGGTGAGCCAGATCCAGAGCTGAAGATATCATGCCGACAGATCTCACCCT
TCATACCACACAATTATCGAGAAAGTAGCTTACCCGCATGCACTTTTGCATACACTCTTGTAAACACGGGTAAAGAAAGGGCAAATGTGAGCTTACTTTTTACATGGGCGAATTCAGTTGGTGGAATGTCACATATTTCCGGAGGCCATGTCAACGAGCCTTTCATGAGCGATGATGGAGTGCGTGGCATGCTTCTACAT
CACAAGACTGCAGAAGATTATCCTCCAGTTACTTTTGCAATTGCTTCTCGCCAAACTGAGAATGTACATGTGACTGTTTTACCCTGCTTTGGACTGTCAGGCAGAAGTTATACATCTGCTAAGGATATGTGGGTCACTATGAAACAGCAAGGACATTTTGATGATGAGAACTGGAATGATGGTTGCAGTATTGCTTCCCT
GCCTGGAGAAGCAGTCTGTGCTGCAGTTTCTGCCTCTGCAGTAGTAGAGCCTCATGGAACATGTTCAGTAGTTTTTGCTTTAGGATGGGCCTCACCAAAAGTGAAATTTGTGAAAGGAAGTACTTATTTTAGGAGATATACAAAATTCTATGGTACCTCTGTGGATGCAGCTACAAAGTTGGCACATGATGCTTTGATGG
ACTATCGCAGGTGGGAGACAGAAATTGAGGACTGGCAACGTCCTATTCTTAACAATGAAAAGCTTCCTGAATGGTAATTTCATAGACTGATACTCAGAGATCCATTTACATCTTGCTCAGGGCCAGATGTGAACTCAATGAACTAGTTTTGTCTATTATTACTTTT
>TRINITY_DN115609_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:AAAGCACCAATTGACCCATTTACACGAGAGCGTAGTAAACCCTCAGCATCTCAGGGAGTGCCACTTGGTGGTATGGGGAGTGGTAGCATACGCAGAGGATTCAGAGGAGAGTTCAAACACTGGCAAATGATACCTGGGGTGTGTAAAGCATCTCCAGTGCTGGCAAATCAGTTTTCAATTTTTGTTTCTCGTGATGGGGG
ACGGAAAAAGTATGCATCTGTCTTGGCTCCAGGACGTCCTGAAGAGCTTGGGAAAGGAGACGATTTTGGCATTTCTAATTGGGATTGGGCTTTGGATGGTCAACATTCAACATATCATGCACTATTTCCAAGAGCCTGGACAATATATGATGGTGAGCCAGATCCAGAGCTGAAGATATCATGCCGACAGATCTCACCCT
TCATACCACACAATTATCGAGAAAGTAGCTTACCCGCATGCACTTTTGCATACACTCTTGTAAACACGGGTAAAGAAAGGGCAAATGTGAGCTTACTTTTTACATGGGCGAATTCAGTTGGTGGAATGTCACATATTTCCGGAGGCCATGTCAACGAGCCTTTCATGAGCGATGATGGAGTGCGTGGCATGCTTCTACAT
CACAAgcaagtcgtccatccttgaatactctatgctgagggttggtttgcagatttcccttgagacttgctttctcatgatcccaaccatccaactatgatctagtgacagtcaaatttctttcatgttttcttgatgtcatggaaggtgggatcttaatattgttacgagcttgacagtttcttccactctagttccat
ggttatacagccagcttcttttctctaattcttatacccattttattggacatttttattggttccatgcaaacattaactgaatcactactcttgcttatattgttggcccgctggatggtgtttccttttccaactctacctcttatatgaggtcaacaataatatgaatctgctatgtgtaatgcagGACTGCAGAA
GATTATCCTCCAGTTACTTTTGCAATTGCTTCTCGCCAAACTGAGAATGTACATGTGACTGTTTTACCCTGCTTTGGACTGTCAGGCAGAAGTTATACATCTGCTAAGGATATGTGGGTCACTATGAAACAGCAAGGACATTTTGATGATGAGAACTGGAATGATGGTTGCAGTATTGCTTCCCTGCCTGGAGAAGCAGT
CTGTGCTGCAGTTTCTGCCTCTGCAGTAGTAGAGCCTCATGGAACATGTTCAGTAGTTTTTGCTTTAGGATGGGCCTCACCAAAAGTGAAATTTGTGAAAGGAAGTACTTATTTTAGGAGATATACAAAATTCTATGGTACCTCTGTGGATGCAGCTACAAAGTTGGCACATGATGCTTTGATGGACTATCGCAGGTGGG
AGACAGAAATTGAGGACTGGCAACGTCCTATTCTTAACAATGAAAAGCTTCCTGAATGGTACAGGTTCACATTGTTCAATGAACTGTACTACTTGGTTGCTGGAGGAACAATTTGGACAGATGGTGGACTCCCAGTTGAAGAAGACAAAGACAAGATGTTATGTTCTCAGAAAAGATCCAGGAAAAAAGAAAATAAAGCT
GTTGTGCGAGTCATAGTTTCAGCAGAAGAAGATCAGATTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATTGTTCGGCAGAAAAGGACCGGGCTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGATTGAATTGTTCGGCAGAAAAGGACCGGGCTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATGGTTCTGGAGAAAAGGACCAGGC
TAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATGGTTATAACGGTGTTGCTGATGCAGATTTTAATGCCCCTCGTGATCAGAATTTTGAAAATTGTGGAAGAACAGAAATGAATTCTGGGTCCACTGAATATGGATATGATTTACTAGCTGATGAAGAAAATGTTGGTCGCTTTCTGTATTTGGAAGGTGTGGAATATATGA
TGTGGTGTACATATGATGTACATTTTTATGCATCTTTTGCACTACTTGATCTCTTTCCAAAGATTGAGCTTAATATTCAACGTGAGTTTGCAAAAGCTGTATTAATTGAAGATAAGAAAAAAGTTAAATTTCTAGCTGAAGGTAATTGGGGAATTAGAAAGGTAAGAGGTGCTGTACCTCATGATCTAGGATTGCACGAC
CCTTGGCTGGAAATAAATGCATACAATATTCATGATACAAGTCAGTGGAAGGATCTGAACTCAAAGTTTGTACTTCAGGTTTATAGGGATCTGGTTGCAACTGGTGACATGTCTTTTGGCAAAGATGTTTGGCCAGCTGTCTGTGCTTCCATTGAATACATGGAGAAGTTCGATCGGGATGGTGATGGTCTCATTGAGAA
TGATGGATTCCCTGATCAGACATATGACACTTGGACAGTACATGGCATTAGTGCATACTGTGGAGGTCTATGGATCGCCGCACTTCAAGCTGCCTCTGCAATGGCAGATAAATTAGGCCACCAAGAGTACGCAGCAAAATATAGGAAACAATTTCAAAAGGCTAAAGTAGTATATGAAGAGAAGCTTTGGAATGGATCAT
ATTTTAACTATGATAGTGGTACCAGCAGCAACAGCAACTCAATTCAGGCAGATCAATTGGCTGGACAATGGTATGCTTTTGCCTCAGGTCTACCATCACTTTTTGACGATCACAAAATACGAAGTGCTCTGCAGAAAATATATGATTTTAATGTTATGAAAACTAGAGGAGGAAGAATGGGTGCTGTAAATGGTATGCAT
CAAAATGGAAAAGTGGATGAAACGTGCATGCAATCACGGGAGATATGGACAGGTGTAACATATGGTGTTGCAGCAACAATGCTTCATGTAGGATTGGAACATCAGGCGTTCACTACAGCTGAGGGGATCTTTCTAGCGGGCTGGTCAGAAGATGGTTTTGGGTACTGGTTCCAAACACCTGAAGCATGGACAATCGATGG
CCACTATCGGTCCCTGATCTACATGCGTCCCCTTGCAATATGGGCAATGCAGTGGGCTTTAAATCCACCCAAGGCTGTTTTAGAGGCTCCCAGGATAAATGTGATGGAAAGAGAACACGCTTCACAGTTTCATGCCGGACTTGCAGCAGTTGCCGAAGCTTTTAAGCATGTGCATAAACACGGACACTGTAGTTGCTCCA
GTTCTCATTCTGGCTGTCGTTGGAAGTGTACATGCTAGTTTTACCATTATTCAACCAAGGTTTAGTTCTATATTTGGAGTCATTAATTAATTGTTTCCAAGCATCTCCTGCGCTAAGAATGTCAGGGAATGTTTGGTACGATTTTGCAGGTCTATTTTCCAAATGAGAACAAGGGAACTCAAATGTTATTTACAAGTTTC
TCTCTTTTTTCCCCCTGTAAATGCTTCTTACAGCTGTCCTTAGGCTAGGCGGCTGTGCCATGAGGGGTGTTTCTGCGCCGTCAAAAGCATCCAGCACCTGGCGTGGATAAAGCACGCTTGGGGGTGTTTCGAACTCGGATTCTAATGCAGTCCGCGCCCAATTGGGGGGTTTTTGAACTCAGGTCCTAATGTTACGACAA
GTTTGATCACTTCACAGACCACATTCCTGTGGGCTGCTATTTACGAGTCTTAACGAAGCTCTGCCAATTTGAATGTATTTGCATCTATGTTCAGGGGAAAATTGAGATGTATCCAACCTCTAACAGACAATTTGAACCACTGCAAACCCTTCAGTGAAAATTTATTGAATCAATAGGATTGTAGTTAAACATGTTTTCTT
CACTTCTAAAAGCATGTATTGGGTCGCGTTCAAAGTTTCAGC
Intron 2 GTTGGTTTGC ... TGTAATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 15.63 | 27 | 5 | 6.7 |
| A2 | 25 | 9 | 3 | 5.3 |
| A3 | 18.52 | 22 | 5 | 8 |
| A4 | 13.33 | 13 | 2 | 6.3 |
| A5 | 40.74 | 16 | 11 | 6 |
| A6 | 54.55 | 15 | 18 | 4 |
| A7 | 22.58 | 24 | 7 | 8 |
| A8 | 30.19 | 37 | 16 | 5.3 |
| A9 | 41.1 | 43 | 30 | 7.3 |
| A10 | 28.85 | 37 | 15 | 8.7 |
>TRINITY_DN115609_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformAAAGCACCAATTGACCCATTTACACGAGAGCGTAGTAAACCCTCAGCATCTCAGGGAGTGCCACTTGGTGGTATGGGGAGTGGTAGCATACGCAGAGGATTCAGAGGAGAGTTCAAACACTGGCAAATGATACCTGGGGTGTGTAAAGCATCTCCAGTGCTGGCAAATCAGTTTTCAATTTTTGTTTCTCGTGATGGGGG
ACGGAAAAAGTATGCATCTGTCTTGGCTCCAGGACGTCCTGAAGAGCTTGGGAAAGGAGACGATTTTGGCATTTCTAATTGGGATTGGGCTTTGGATGGTCAACATTCAACATATCATGCACTATTTCCAAGAGCCTGGACAATATATGATGGTGAGCCAGATCCAGAGCTGAAGATATCATGCCGACAGATCTCACCCT
TCATACCACACAATTATCGAGAAAGTAGCTTACCCGCATGCACTTTTGCATACACTCTTGTAAACACGGGTAAAGAAAGGGCAAATGTGAGCTTACTTTTTACATGGGCGAATTCAGTTGGTGGAATGTCACATATTTCCGGAGGCCATGTCAACGAGCCTTTCATGAGCGATGATGGAGTGCGTGGCATGCTTCTACAT
CACAAGCAAGTCGTCCATCCTTGAATACTCTATGCTGAGGGACTGCAGAAGATTATCCTCCAGTTACTTTTGCAATTGCTTCTCGCCAAACTGAGAATGTACATGTGACTGTTTTACCCTGCTTTGGACTGTCAGGCAGAAGTTATACATCTGCTAAGGATATGTGGGTCACTATGAAACAGCAAGGACATTTTGATGAT
GAGAACTGGAATGATGGTTGCAGTATTGCTTCCCTGCCTGGAGAAGCAGTCTGTGCTGCAGTTTCTGCCTCTGCAGTAGTAGAGCCTCATGGAACATGTTCAGTAGTTTTTGCTTTAGGATGGGCCTCACCAAAAGTGAAATTTGTGAAAGGAAGTACTTATTTTAGGAGATATACAAAATTCTATGGTACCTCTGTGGA
TGCAGCTACAAAGTTGGCACATGATGCTTTGATGGACTATCGCAGGTGGGAGACAGAAATTGAGGACTGGCAACGTCCTATTCTTAACAATGAAAAGCTTCCTGAATGGTAATTTCATAGACTGATACTCAGAGATCCATTTACATCTTGCTCAGGGCCAGATGTGAACTCAATGAACTAGTTTTGTCTATTATTACTTT
T
>TRINITY_DN115609_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:AAAGCACCAATTGACCCATTTACACGAGAGCGTAGTAAACCCTCAGCATCTCAGGGAGTGCCACTTGGTGGTATGGGGAGTGGTAGCATACGCAGAGGATTCAGAGGAGAGTTCAAACACTGGCAAATGATACCTGGGGTGTGTAAAGCATCTCCAGTGCTGGCAAATCAGTTTTCAATTTTTGTTTCTCGTGATGGGGG
ACGGAAAAAGTATGCATCTGTCTTGGCTCCAGGACGTCCTGAAGAGCTTGGGAAAGGAGACGATTTTGGCATTTCTAATTGGGATTGGGCTTTGGATGGTCAACATTCAACATATCATGCACTATTTCCAAGAGCCTGGACAATATATGATGGTGAGCCAGATCCAGAGCTGAAGATATCATGCCGACAGATCTCACCCT
TCATACCACACAATTATCGAGAAAGTAGCTTACCCGCATGCACTTTTGCATACACTCTTGTAAACACGGGTAAAGAAAGGGCAAATGTGAGCTTACTTTTTACATGGGCGAATTCAGTTGGTGGAATGTCACATATTTCCGGAGGCCATGTCAACGAGCCTTTCATGAGCGATGATGGAGTGCGTGGCATGCTTCTACAT
CACAAGCAAGTCGTCCATCCTTGAATACTCTATGCTGAGGgttggtttgcagatttcccttgagacttgctttctcatgatcccaaccatccaactatgatctagtgacagtcaaatttctttcatgttttcttgatgtcatggaaggtgggatcttaatattgttacgagcttgacagtttcttccactctagttccat
ggttatacagccagcttcttttctctaattcttatacccattttattggacatttttattggttccatgcaaacattaactgaatcactactcttgcttatattgttggcccgctggatggtgtttccttttccaactctacctcttatatgaggtcaacaataatatgaatctgctatgtgtaatgcagGACTGCAGAA
GATTATCCTCCAGTTACTTTTGCAATTGCTTCTCGCCAAACTGAGAATGTACATGTGACTGTTTTACCCTGCTTTGGACTGTCAGGCAGAAGTTATACATCTGCTAAGGATATGTGGGTCACTATGAAACAGCAAGGACATTTTGATGATGAGAACTGGAATGATGGTTGCAGTATTGCTTCCCTGCCTGGAGAAGCAGT
CTGTGCTGCAGTTTCTGCCTCTGCAGTAGTAGAGCCTCATGGAACATGTTCAGTAGTTTTTGCTTTAGGATGGGCCTCACCAAAAGTGAAATTTGTGAAAGGAAGTACTTATTTTAGGAGATATACAAAATTCTATGGTACCTCTGTGGATGCAGCTACAAAGTTGGCACATGATGCTTTGATGGACTATCGCAGGTGGG
AGACAGAAATTGAGGACTGGCAACGTCCTATTCTTAACAATGAAAAGCTTCCTGAATGGTACAGGTTCACATTGTTCAATGAACTGTACTACTTGGTTGCTGGAGGAACAATTTGGACAGATGGTGGACTCCCAGTTGAAGAAGACAAAGACAAGATGTTATGTTCTCAGAAAAGATCCAGGAAAAAAGAAAATAAAGCT
GTTGTGCGAGTCATAGTTTCAGCAGAAGAAGATCAGATTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATTGTTCGGCAGAAAAGGACCGGGCTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGATTGAATTGTTCGGCAGAAAAGGACCGGGCTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATGGTTCTGGAGAAAAGGACCAGGC
TAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATGGTTATAACGGTGTTGCTGATGCAGATTTTAATGCCCCTCGTGATCAGAATTTTGAAAATTGTGGAAGAACAGAAATGAATTCTGGGTCCACTGAATATGGATATGATTTACTAGCTGATGAAGAAAATGTTGGTCGCTTTCTGTATTTGGAAGGTGTGGAATATATGA
TGTGGTGTACATATGATGTACATTTTTATGCATCTTTTGCACTACTTGATCTCTTTCCAAAGATTGAGCTTAATATTCAACGTGAGTTTGCAAAAGCTGTATTAATTGAAGATAAGAAAAAAGTTAAATTTCTAGCTGAAGGTAATTGGGGAATTAGAAAGGTAAGAGGTGCTGTACCTCATGATCTAGGATTGCACGAC
CCTTGGCTGGAAATAAATGCATACAATATTCATGATACAAGTCAGTGGAAGGATCTGAACTCAAAGTTTGTACTTCAGGTTTATAGGGATCTGGTTGCAACTGGTGACATGTCTTTTGGCAAAGATGTTTGGCCAGCTGTCTGTGCTTCCATTGAATACATGGAGAAGTTCGATCGGGATGGTGATGGTCTCATTGAGAA
TGATGGATTCCCTGATCAGACATATGACACTTGGACAGTACATGGCATTAGTGCATACTGTGGAGGTCTATGGATCGCCGCACTTCAAGCTGCCTCTGCAATGGCAGATAAATTAGGCCACCAAGAGTACGCAGCAAAATATAGGAAACAATTTCAAAAGGCTAAAGTAGTATATGAAGAGAAGCTTTGGAATGGATCAT
ATTTTAACTATGATAGTGGTACCAGCAGCAACAGCAACTCAATTCAGGCAGATCAATTGGCTGGACAATGGTATGCTTTTGCCTCAGGTCTACCATCACTTTTTGACGATCACAAAATACGAAGTGCTCTGCAGAAAATATATGATTTTAATGTTATGAAAACTAGAGGAGGAAGAATGGGTGCTGTAAATGGTATGCAT
CAAAATGGAAAAGTGGATGAAACGTGCATGCAATCACGGGAGATATGGACAGGTGTAACATATGGTGTTGCAGCAACAATGCTTCATGTAGGATTGGAACATCAGGCGTTCACTACAGCTGAGGGGATCTTTCTAGCGGGCTGGTCAGAAGATGGTTTTGGGTACTGGTTCCAAACACCTGAAGCATGGACAATCGATGG
CCACTATCGGTCCCTGATCTACATGCGTCCCCTTGCAATATGGGCAATGCAGTGGGCTTTAAATCCACCCAAGGCTGTTTTAGAGGCTCCCAGGATAAATGTGATGGAAAGAGAACACGCTTCACAGTTTCATGCCGGACTTGCAGCAGTTGCCGAAGCTTTTAAGCATGTGCATAAACACGGACACTGTAGTTGCTCCA
GTTCTCATTCTGGCTGTCGTTGGAAGTGTACATGCTAGTTTTACCATTATTCAACCAAGGTTTAGTTCTATATTTGGAGTCATTAATTAATTGTTTCCAAGCATCTCCTGCGCTAAGAATGTCAGGGAATGTTTGGTACGATTTTGCAGGTCTATTTTCCAAATGAGAACAAGGGAACTCAAATGTTATTTACAAGTTTC
TCTCTTTTTTCCCCCTGTAAATGCTTCTTACAGCTGTCCTTAGGCTAGGCGGCTGTGCCATGAGGGGTGTTTCTGCGCCGTCAAAAGCATCCAGCACCTGGCGTGGATAAAGCACGCTTGGGGGTGTTTCGAACTCGGATTCTAATGCAGTCCGCGCCCAATTGGGGGGTTTTTGAACTCAGGTCCTAATGTTACGACAA
GTTTGATCACTTCACAGACCACATTCCTGTGGGCTGCTATTTACGAGTCTTAACGAAGCTCTGCCAATTTGAATGTATTTGCATCTATGTTCAGGGGAAAATTGAGATGTATCCAACCTCTAACAGACAATTTGAACCACTGCAAACCCTTCAGTGAAAATTTATTGAATCAATAGGATTGTAGTTAAACATGTTTTCTT
CACTTCTAAAAGCATGTATTGGGTCGCGTTCAAAGTTTCAGC
Intron 3 GTTTAGTTCT ... GATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 56.52 | 5 | 4 | 9 |
| A2 | 63.64 | 4 | 5 | 9 |
| A3 | 66.67 | 3 | 6 | 6 |
| A4 | 71.43 | 1 | 2 | 3 |
| A5 | 100 | 0 | 2 | 2 |
| A6 | 58.62 | 12 | 14 | 20 |
| A7 | 39.13 | 14 | 9 | 9 |
| A8 | 62.26 | 10 | 12 | 21 |
| A9 | 57.14 | 6 | 8 | 8 |
| A10 | 53.85 | 12 | 12 | 16 |
>TRINITY_DN37025_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoformGCACCATAAAAGCGCAACGGTGACGAGGATGGAAACAGTAGGCAAAATGGTCGGCATGGGCATGCGAGGGGGGCATTGAATAAGGAAGGGGAGGGCGGCTTATTAAATGGGTTCCAACTGAGCAGTGAAAAGATTGACACGCTAGATCTGGCCCATTTCCCACCTGCTCCTCCCTCTTTTGCTGATCAGCATATCACTTC
TGCCTCCGCTTATTGTGTTTTCTGTTTAGTTTTGGTTGGCAATGCATATCTTATTGCAGATCTGAGCAGGTTAATAGTCGATCAAGCGAATATGGTCAGTGGTACCCTTTTCCATGGCAGAAGGCATTCCTGGCCTTGCGAGGATTACGTCCCGAAACCCACTTTACAGCTGTTGGAATCTGACCATGGTGCTCCACCTC
AACAAGCCTGGAGGCGAAGGCTTAACAGCCATGCAAATATTTTGAAAGAGTTCAGTGTGACATTTATGGAGGCTTTGAAGATGGTTCGACTAGGATTTCGTCTTTGGACATATGTTAAAGAAGAACGCTCTCATGGACGGAAAGCACCAATTGACCCATTTACACGAGAGCGTAGTAAACCCTCAGCATCTCAGGGAGTG
CCACTTGGTGGTATGGGGAGTGGTAGCATACGCAGAGGATTCAGAGGAGAGTTCAAACACTGGCAAATGATACCTGGGGTGTGTAAAGCATCTCCAGTGCTGGCAAATCAGTTTTCAATTTTTGTTTCTCGTGATGGGGGACGGAAAAAGTATGCATCTGTCTTGGCTCCAGGACGTCCTGAAGAGCTTGGGAAAGGAGA
CGATTTTGGCATTTCTAATTGGGATTGGGCTTTGGATGGTCAACATTCAACATATCATGCACTATTTCCAAGAGCCTGGACAATATATGATGGTGAGCCAGATCCAGAGCTGAAGATATCATGCCGACAGATCTCACCCTTCATACCACACAATTATCGAGAAAGTAGCTTACCCGCATGCACTTTTGCATACACTCTTG
TAAACACGGGTAAAGAAAGGGCAAATGTGAGCTTACTTTTTACATGGGCGAATTCAGTTGGTGGAATGTCACATATTTCCGGAGGCCATGTCAACGAGCCTTTCATGAGCGATGATGGAGTGCGTGGCATGCTTCTACATCACAAGACTGCAGAAGATTATCCTCCAGTTACTTTTGCAATTGCTTCTCGCCAAACTGAG
AATGTACATGTGACTGTTTTACCCTGCTTTGGACTGTCAGGCAGAAGTTATACATCTGCTAAGGATATGTGGGTCACTATGAAACAGCAAGGACATTTTGATGATGAGAACTGGAATGATGGTTGCAGTATTGCTTCCCTGCCTGGAGAAGCAGTCTGTGCTGCAGTTTCTGCCTCTGCAGTAGTAGAGCCTCATGGAAC
ATGTTCAGTAGTTTTTGCTTTAGGATGGGCCTCACCAAAAGTGAAATTTGTGAAAGGAAGTACTTATTTTAGGAGATATACAAAATTCTATGGTACCTCTGTGGATGCAGCTACAAAGTTGGCACATGATGCTTTGATGGACTATCGCAGGTGGGAGACAGAAATTGAGGACTGGCAACGTCCTATTCTTAACAATGAAA
AGCTTCCTGAATGGTACAGGTTCACATTGTTCAATGAACTGTACTACTTGGTTGCTGGAGGAACAATTTGGACAGATGGTGGACTCCCAGTTGAAGAAGACAAAGACAAGATGTTATGTTCTCAGAAAAGATCCAGGAAAAAAGAAAATAAAGCTGTTGTGCGAGTCATAGTTTCAGCAGAAGAAGATCAGATTAATCAT
GTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATTGTTCGGCAGAAAAGGACCGGGCTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGATTGAATTGTTCGGCAGAAAAGGACCAGGCTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATGGTTCTGGAGAAAAGGACCAGGCTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATGGTTATAACGGTGT
TGCTGATGCAGATTTTAATGCCCCTCGTGATCAGAATTTTGAAAATTGTGGAAGAACAGAAATGAATTCTGGGTCCACTGAATATGGATATGATTTACTAGCTGATGAAGAAAATGTTGGTCGCTTTCTGTATTTGGAAGGTGTGGAATATATGATGTGGTGTACATATGATGTACATTTTTATGCATCTTTTGCACTAC
TTGATCTCTTTCCAAAGATTGAGCTTAATATTCAACGTGAGTTTGCAAAAGCTGTATTAATTGAAGATAAGAAAAAAGTTAAATTTCTAGCTGAAGGTAATTGGGGAATTAGAAAGGTAAGAGGTGCTGTACCTCATGATCTAGGATTGCACGACCCTTGGCTGGAAATAAATGCATACAATATTCATGATACAAGTCAG
TGGAAGGATCTGAACTCAAAGTTTGTACTTCAGGTTTATAGGGATCTGGTTGCAACTGGTGACATGTCTTTTGGCAAAGATGTTTGGCCAGCTGTCTGTGCTTCCATTGAATACATGGAGAAGTTCGATCGGGATGGTGATGGTCTCATTGAGAATGATGGATTCCCTGATCAGACATATGACACTTGGACAGTACATGG
CATTAGTGCATACTGTGGAGGTCTATGGATCGCCGCACTTCAAGCTGCCTCTGCAATGGCAGATAAATTAGGCCACCAAGAGTACGCAGCAAAATATAGGAAACAATTTCAAAAGGCTAAAGTAGTATATGAAGAGAAGCTTTGGAATGGATCATATTTTAACTATGATAGTGGTACCAGCAGCAACAGCAACTCAATTC
AGGCAGATCAATTGGCTGGACAATGGTATGCTTTTGCCTCAGGTCTACCATCACTTTTTGACGATCACAAAATACGAAGTGCTCTGCAGAAAATATATGATTTTAATGTTATGAAAACTAGAGGAGGAAGAATGGGTGCTGTAAATGGTATGCATCAAAATGGAAAAGTGGATGAAACGTGCATGCAATCACGGGAGATA
TGGACAGGTGTAACATATGGTGTTGCAGCAACAATGCTTCATGTAGGATTGGAACATCAGGCGTTCACTACAGCTGAGGGGATCTTTCTAGCGGGCTGGTCAGAAGATGGTTTTGGGTACTGGTTCCAAACACCTGAAGCATGGACAATCGATGGCCACTATCGGTCCCTGATCTACATGCGTCCCCTTGCAATATGGGC
AATGCAGTGGGCTTTAAATCCACCCAAGGCTGTTTTAGAGGCTCCCAGGATAAATGTGATGGAAAGAGAACACGCTTCACAGTTTCATGCCGGACTTGCAGCAGTTGCCGAAGCTTTTAAGCATGTGCATAAACACGGACACTGTAGTTGCTCCAGTTCTCATTCTGGCTGTCGTTGGAAGTGTACATGCTAGTTTTACC
ATTATTCAACCAAGGTCTATTTTCCAAATGAGAACAAGGGAACTCAAATGTTATTTACAAGTTTCTCTCTTTTTTCCCCCTGTAAATGCTTCTTACAGCTGTCCTTAGGCTAGGCGGCTGTGCCATGAGGGGTGTTTCTGCGCCGTCAAAAGCATCCAGCACCTGGCGTGGATAAAGCACGCTTGGGGGTGTTTCGAACT
CGGATTCTAATGCAGTCCGCGCCCAATTGGGGGGTTTTTGAACTCAGGTCCTAATGTTACGACAAGTTTGATCACTTCACAGACCACATTCCTGTGGGCTGCTATTTACGAGTCTTAACGAAGCTCTGCCAATTTGAATGTATTTGCATCTATGTTCAGGGGAAAATTGAGATGTATCCAACCTCTAACAGACAATTTGA
ACCACTGCAAACTCTTCAGTGAAAATTTATTGAATCAATAGGTTTGTAGTTAAACATGTTTTCTTCACTTCTAAAAGCATGTATTGGGTCGCGTTCAAAGTTTCAGCTAATATCAGGAAACTGTTA
>TRINITY_DN37025_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:GCACCATAAAAGCGCAACGGTGACGAGGATGGAAACAGTAGGCAAAATGGTCGGCATGGGCATGCGAGGGGGGCATTGAATAAGGAAGGGGAGGGCGGCTTATTAAATGGGTTCCAACTGAGCAGTGAAAAGATTGACACGCTAGATCTGGCCCATTTCCCACCTGCTCCTCCCTCTTTTGCTGATCAGCATATCACTTC
TGCCTCCGCTTATTGTGTTTTCTGTTTAGTTTTGGTTGGCAATGCATATCTTATTGCAGATCTGAGCAGGTTAATAGTCGATCAAGCGAATATGGTCAGTGGTACCCTTTTCCATGGCAGAAGGCATTCCTGGCCTTGCGAGGATTACGTCCCGAAACCCACTTTACAGCTGTTGGAATCTGACCATGGTGCTCCACCTC
AACAAGCCTGGAGGCGAAGGCTTAACAGCCATGCAAATATTTTGAAAGAGTTCAGTGTGACATTTATGGAGGCTTTGAAGATGGTTCGACTAGGATTTCGTCTTTGGACATATGTTAAAGAAGAACGCTCTCATGGACGGAAAGCACCAATTGACCCATTTACACGAGAGCGTAGTAAACCCTCAGCATCTCAGGGAGTG
CCACTTGGTGGTATGGGGAGTGGTAGCATACGCAGAGGATTCAGAGGAGAGTTCAAACACTGGCAAATGATACCTGGGGTGTGTAAAGCATCTCCAGTGCTGGCAAATCAGTTTTCAATTTTTGTTTCTCGTGATGGGGGACGGAAAAAGTATGCATCTGTCTTGGCTCCAGGACGTCCTGAAGAGCTTGGGAAAGGAGA
CGATTTTGGCATTTCTAATTGGGATTGGGCTTTGGATGGTCAACATTCAACATATCATGCACTATTTCCAAGAGCCTGGACAATATATGATGGTGAGCCAGATCCAGAGCTGAAGATATCATGCCGACAGATCTCACCCTTCATACCACACAATTATCGAGAAAGTAGCTTACCCGCATGCACTTTTGCATACACTCTTG
TAAACACGGGTAAAGAAAGGGCAAATGTGAGCTTACTTTTTACATGGGCGAATTCAGTTGGTGGAATGTCACATATTTCCGGAGGCCATGTCAACGAGCCTTTCATGAGCGATGATGGAGTGCGTGGCATGCTTCTACATCACAAGCAAGTCGTCCATCCTTGAATACTCTATGCTGAGGGACTGCAGAAGATTATCCTC
CAGTTACTTTTGCAATTGCTTCTCGCCAAACTGAGAATGTACATGTGACTGTTTTACCCTGCTTTGGACTGTCAGGCAGAAGTTATACATCTGCTAAGGATATGTGGGTCACTATGAAACAGCAAGGACATTTTGATGATGAGAACTGGAATGATGGTTGCAGTATTGCTTCCCTGCCTGGAGAAGCAGTCTGTGCTGCA
GTTTCTGCCTCTGCAGTAGTAGAGCCTCATGGAACATGTTCAGTAGTTTTTGCTTTAGGATGGGCCTCACCAAAAGTGAAATTTGTGAAAGGAAGTACTTATTTTAGGAGATATACAAAATTCTATGGTACCTCTGTGGATGCAGCTACAAAGTTGGCACATGATGCTTTGATGGACTATCGCAGGTGGGAGACAGAAAT
TGAGGACTGGCAACGTCCTATTCTTAACAATGAAAAGCTTCCTGAATGGTACAGGTTCACATTGTTCAATGAACTGTACTACTTGGTTGCTGGAGGAACAATTTGGACAGATGGTGGACTCCCAGTTGAAGAAGACAAAGACAAGATGTTATGTTCTCAGAAAAGATCCAGGAAAAAAGAAAATAAAGCTGTTGTGCGAG
TCATAGTTTCAGCAGAAGAAGATCAGATTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATTGTTCGGCAGAAAAGGACCGGGCTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGATTGAATTGTTCGGCAGAAAAGGACCAGGCTAATCATGTTGCAGAAGTTCAGAGGTTGAATGGTTCTGGAGAAAAGGACCAGGCTAATCATGTT
GCAGAAGTTCAGAGGTTGAATGGTTATAACGGTGTTGCTGATGCAGATTTTAATGCCCCTCGTGATCAGAATTTTGAAAATTGTGGAAGAACAGAAATGAATTCTGGGTCCACTGAATATGGATATGATTTACTAGCTGATGAAGAAAATGTTGGTCGCTTTCTGTATTTGGAAGGTGTGGAATATATGATGTGGTGTAC
ATATGATGTACATTTTTATGCATCTTTTGCACTACTTGATCTCTTTCCAAAGATTGAGCTTAATATTCAACGTGAGTTTGCAAAAGCTGTATTAATTGAAGATAAGAAAAAAGTTAAATTTCTAGCTGAAGGTAATTGGGGAATTAGAAAGGTAAGAGGTGCTGTACCTCATGATCTAGGATTGCACGACCCTTGGCTGG
AAATAAATGCATACAATATTCATGATACAAGTCAGTGGAAGGATCTGAACTCAAAGTTTGTACTTCAGGTTTATAGGGATCTGGTTGCAACTGGTGACATGTCTTTTGGCAAAGATGTTTGGCCAGCTGTCTGTGCTTCCATTGAATACATGGAGAAGTTCGATCGGGATGGTGATGGTCTCATTGAGAATGATGGATTC
CCTGATCAGACATATGACACTTGGACAGTACATGGCATTAGTGCATACTGTGGAGGTCTATGGATCGCCGCACTTCAAGCTGCCTCTGCAATGGCAGATAAATTAGGCCACCAAGAGTACGCAGCAAAATATAGGAAACAATTTCAAAAGGCTAAAGTAGTATATGAAGAGAAGCTTTGGAATGGATCATATTTTAACTA
TGATAGTGGTACCAGCAGCAACAGCAACTCAATTCAGGCAGATCAATTGGCTGGACAATGGTATGCTTTTGCCTCAGGTCTACCATCACTTTTTGACGATCACAAAATACGAAGTGCTCTGCAGAAAATATATGATTTTAATGTTATGAAAACTAGAGGAGGAAGAATGGGTGCTGTAAATGGTATGCATCAAAATGGAA
AAGTGGATGAAACGTGCATGCAATCACGGGAGATATGGACAGGTGTAACATATGGTGTTGCAGCAACAATGCTTCATGTAGGATTGGAACATCAGGCGTTCACTACAGCTGAGGGGATCTTTCTAGCGGGCTGGTCAGAAGATGGTTTTGGGTACTGGTTCCAAACACCTGAAGCATGGACAATCGATGGCCACTATCGG
TCCCTGATCTACATGCGTCCCCTTGCAATATGGGCAATGCAGTGGGCTTTAAATCCACCCAAGGCTGTTTTAGAGGCTCCCAGGATAAATGTGATGGAAAGAGAACACGCTTCACAGTTTCATGCCGGACTTGCAGCAGTTGCCGAAGCTTTTAAGCATGTGCATAAACACGGACACTGTAGTTGCTCCAGTTCTCATTC
TGGCTGTCGTTGGAAGTGTACATGCTAGTTTTACCATTATTCAACCAAGgtttagttctatatttggagtcattaattaattgtttccaagcatctcctgcgctaagaatgtcagggaatgtttggtacgattttgcagGTCTATTTTCCAAATGAGAACAAGGGAACTCAAATGTTATTTACAAGTTTCTCTCTTTTTT
CCCCCTGTAAATGCTTCTTACAGCTGTCCTTAGGCTAGGCGGCTGTGCCATGAGGGGTGTTTCTGCGCCGTCAAAAGCATCCAGCACCTGGCGTGGATAAAGCACGCTTGGGGGTGTTTCGAACTCGGATTCTAATGCAGTCCGCGCCCAATTGGGGGGTTTTTGAACTCAGGTCCTAATGTTACGACAAGTTTGATCAC
TTCACAGACCACATTCCTGTGGGCTGCTATTTACGAGTCTTAACGAAGCTCTGCCAATTTGAATGTATTTGCATCTATGTTCAGGGGAAAATTGAGATGTATCCAACCTCTAACAGACAATTTGAACCACTGCAAACTCTTCAGTGAAAATTTATTGAATCAATAGGTTTGTAGTTAAACATGTTTTCTTCACTTCTAAA
AGCATGTATTGGGTCGCGTTCAAAGTTTCAGCTAATATCAGGAAACTGTTA