NA ----> NA

Intron 1 GTAAGATATT ... ATTTAAGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	36.17	15	6	11
A2	16.28	18	3	4
A3	11.76	15	2	2
A4	36.84	12	2	12
A5	20	12	2	4
A6	16.67	15	2	4
A7	18.75	13	3	3
A8	29.73	13	5	6
A9	18.37	20	3	6
A10	25	12	4	4

>TRINITY_DN92977_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GTGAAAAAAGGTTTTGATCAAGGTTTTATTAAGATGGATTTTTTTTTGCGAAAACCGATGATGTCTTCCCATCCTCAAATCTTGCCGAAGTGTTAATAGCACCTACGAAAATTGTGTGACTCTTAAAAACTTGTGCGTTCATTTTGGTTTGAATGTATGAGTCGCGCTTTTGAGAAGAATCTCTACTGTCAAGTCAAGAA
TTTAGGTCAATGGAGAGTGAACAAACGTCCTATTCATGTTACTGAGATAATTAAATTTCTGATGCCGAAACAAGGGGGAGCGTATAGGGGAGGGTGAAGGGCGTAGCTTACCATGATTACTCGCAAATTTATGGAATAAAATTCTGTAAAACTATGACTTCTGACAGTCAACAGCAACTGTCGAGATCTCTGAGCGTTTA
TAGAATTTTAAACCAAGTTGCCAATTTTAAATGGGGGCGAAATCCATTATATAAATATACATTCTGCGACGGCGGCGGCACAACCAGCACGCTCATTGTACCTTTTTAATCACGACAAAACACAGTGGTATTTATGTTTGTAATTTTTTTGGCATTCAAAATTCTGTTACAATCATCATGAATTCTCCATCACGCGCAGA
CAGGTCAGGCAGAGGGATTATATTAGGGCTAAATCCCAGATTAGAAATGGTACGAAATTAAAATTGAGGTAATCGGGTCCTGGAAACGAAAATAACTGCGATGCCGTTGAGGATAATTGATTGTATCCACTGGAGTGTACTCTTGTTGTTCAAGGAATACCCGACAAGCCTCTTTGGATGCTTCAGTCTCGGTCTGGTCC
GTTGATTGGTGGCCTGGACGGTTGGGATGGGGCCACGTAAGGTTGATGGTGTTGTTCTCGAGGTGGGGATGATCCCAAATGGCCTTTTATTGATGACCCAGATGGTGGAAATGTCAGAAAGTTGTGGGGTTTTAGTATGGAAGACGGGGATTTCAACGGTTTTGAACGGTCTGAGGAACTGAGAACGAGGTCAACCTAGT
GGGCAGAGTGGGGAATTTGCAGATAATGATGATATGATTTTGGGTTGGTGTAGTGTGTGTTATTATCATTTGGGTAAGCAGTTGCTGCTAATTTTATTGATTCTGGGATTGGTGATGCATATATAGGGTTCGGGAATGGGGTTTTCTGGAGAGTTGGGTTGGTGTAATGTGTTAACATCGTCTGTGTATTCAGTAGATTG
CTAATTTTATTGATATGTGGTTGGTGGATGTATTTAGATGTATTTATATAGATTGCAAATGGATTTTTTTTTTGGAAAGTTGAGTTCTGATTTTGTCATTTGCGTATTCAAGTGATGAAGATATTATTGAGTATGGGACTGGTGGGGTATAATTAGTATTTGCAAACGGGGTTATTGAGAGTTGGATTGCTGTGAGCTTT
GATTTTGTCATTTGGGTATTCAAGTGATTGCTGATGTGATTGAGAGTTGGATTGCTGTGAGCTTTGATTTTGTCATTTGGGTATTCAAGTGATTGCTGATTTGATTGATTATGGGATTGGTGGCTTAGTTTATATTGTGGTGGAAATGGGATCTCTGAGCGTTGGGTGACTCTGAGTTCTGACATTTTCATTTGGATGTT
CAAGAGGTGCTGATATTGATGATTATGGGATTAGTGGGTTCGCTTATATTGTGCTGGAAATGGGGTTTTTGAGAGTTGTTGGGAGGATGTTAGGCTGTACGAGTTGTGAAATAATTAGAATAAAAGAAACAAATATTATGGATGAAGGTCTGGCTTGGAAGGGAGCGGGATTGGGAGCTTTAGAGTGGGAGTTGTATGAG
AGAACAAGAGAAGCAACTGAAGAAGCACAGAGACAAGGTGCAGCTCAATTGAAAGCAGCAGTCGAGGCAGGTGGAGCAGTTAAACCTCTTGATTCTAATTCTTTGAGCAATAGGTGGTCATTCGGATTCAAGGACTCAGGACTTGAGGGGGCTTACAGGATCAAATCCGTTTCATTCTCATGCTTCAATAAGATTGTCTC
CTTTCCTGTTGCATGTGAACTAGCTGCCTGCACTCTGCACCTCTTCAGGACGAAAATGATAACAGATTTGCCGTCTTCTCTGGTGCATTTCCTGGGTTACATTTGCGTCGCTGTTTGCTGTATCACAGTACTAAGTTCCCAAATGTTATTTTCTGAGTGGTACCAAGGTTGTAGGGTTATCATCTTGCAATATATGACGA
CTATGCTGTGGATTTGGGAAAGTATTCAGATCTTCCTGATGGCTGATCATGAATGGACGTACATTTCTTATCATGCTCTAGCCCTTTCCACGTGCACAAGTGTGCTCTACCAAGTGCCTTTTTACATGCATCTGCGGCTAAGAATCTTTGGGCTAGCATGTCAAGCTGCTGCTATTTTGGCAAGAGGCAAACGGCAAGAT
AGTTTAACTTTGTTGTTTGTAATTACAGCTAGTCATTTGTTGGGTGTTTTACTGTCTTATGTTCTTGAAAGAAGAGCTAGGTTGTGTTTCCTGAAGTCAATGCCATGCTGGCAAGCAGAGGATGTGACTGTAGCTCCTCTCCAGTCGGAGTTTTCAGAACCGTTTCAGGATTCTCTTTTCAATCAGTATTGCAATATCTT
ATGCTCCCAAACTCTCGAGAAAACCTCTTCAAAGTTGAGCACTGTGATGATCACTCCTGGTGATCGAAGTGCACCTCACAGGGCTCTTGGTGGTTTTGCGGGTGGCTTTGCCGGTGTTTCAGGCCTGAAATGCAAGCTTCCTCCTCCCACTACTTCACTATTTTCATCTAGTGATAGCCTCTCGGGACATGGTAGGATGT
CAGATTCTGAATCAGACGAGGATGTAAATAGCTCAACAAGTGTTGCAGAACTGAGGTTGCGGTACACACATAACAAAGTTGAAGGCAGATGGATACAGGAAACCATTACTGACAGCGCTTATTCACAGGTTAAAAGCAGTTGCACTTCAAGTCAGAAGCAGCAGCTAGGAGGCCAGAATTGAATATCGTAGTTTGAATTA
TTTTCTATCTTGGCATTTCCATTTTCACTTTAATCATTTATCAATGCATATTGAGTAGGCAGCAACAATATTCTTCTGCATATTGTGCCAAGCAGCATTGTCTATATATCTGTATGTTTTTGGGAGGTAATTGAAGTCATCTTCTGCTTCATTGTGATTATATGTGTTTGTTTTAATGGCTTTGGGTCTTATGGATTGTA
CTGATAGATTTTTATGCTATCAAGGATAATGTTTTAAACAACTATGTTTGAATTTTGCATTCAAAGTAACTTGATGTTCTTATGTTTGGTTTCAACACATATCAATCTGTCGTCTTTTTAACTAG

>TRINITY_DN92977_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GTTTCCTTTAGTATCCAGTTGCATAATCTGACTTGTATAGCAAGACTGACATATCAGAATATAATTTTGGCATTTTCTCTTTAGGTCTATAATCAAAATAGATTGTTTCTCCTTGTCTATGGTCTTACAACTGGAAAATGTGTGTTGTGAGATTTGACCCGAAAATATCTTCAGGTACCAAGGTTGTAGGGTTATCATCT
TGCAATATATGACGACTATGCTGTGGATTTGGGAAAGTATTCAGATCTTCCTGATGGCTGATCATgtaagatattctgctcagtttgctggcatttggattttgtcaccctttttcccaagtaaaatattaagctctttacacctcagtgaattttagttttgttataaagagttgcttatggaatccaaagcaagcttt
ccataagaacaactttattcatttgtgattttattcattaaggaagaaccctgtttgacatatttaagcagGAATGGACGTACATTTCTTATCATGCTCTAGCCCTTTCCACGTGCACAAGTGTGCTCTACCAAGTGCCTTTTTACATGCATCTGCGGCTAAGAATCTTTGGGCTAGCATGTCAAGCTGCTGCTATTTTG
GCAAGAGGCAAACGGCAAGATAGTTTAACTTTGTTGTTTGTAATTACAGCTAGTCATTTGTTGGGTGTTTTACTGTCTTATGTTCTTGAAAGAAGAGCTAGGTTGTGTTTCCTGAAGTCAATGCCATGCTGGCAAGCAGAGGATGTGACTGTAGCTCCTCTCCAGTCGGAGTTTTCAGAACCGTTTCAGGATTCTCTTTT
CAATCAGTATTGCAATATCTTATGCTCCCAAACTCTCGAGAAAACCTCTTCAAAGTTGAGCACTGTGATGATCACTCCTGGTGATCGAAGTGCACCTCACAGGGCTCTTGGTGGTTTTGCGGGTGGCTTTGCCGGTGTTTCAGGCCTGAAATGCAAGCTTCCTCCTCCCACTACTTCACTATTTTCATCTAGTGATAGCC
TCTCGGGACATGGTAGGATGTCAGATTCTGAATCAGACGAGGATGTAAATAGCTCAACAAGTGTTGCAGAACTGAGGTTGCGGTACACACATAACAAAGTTGAAGGCAGATGGATACAGGAAACCATTACTGACAGCGCTTATTCACAGGTTAAAAGCAGTTGCACTTCAAGTCAGAAGCAGCAGCTAGGAGGCCAGAAT
TGAATATCGTAGTTTGAATTATTTTCTATCTTGGCATTTCCATTTTCACTTTAATCATTTATCAATGCATATTGAGTAGGCAGCAACAATATTCTTCTGCATATTGTGCCAAGCAGCATTGTCTATATATCTGTATGTTTTTGGGAGGTAATTGAAGTCATCTTCTGCTTCATTGTGATTATATGTGTTTGTTTTAATGG
CTTTGGGTCTTATGGATTGTACTGATAGATTTTTATGCTATCAAGGATAATGTTTTAAACAACTATGTTTGAATTTTGCATTCAAAGTAACTTGATGTTCTTATGTTTGGTTTCAACACATATCAATCTGTCGTCTTTTTAACTAG

Intron 2 GTAAGATATT ... TTCCCAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	36.17	15	6	11
A2	20	18	4	5
A3	18.92	15	4	3
A4	29.41	12	2	8
A5	20	12	2	4
A6	14.29	15	2	3
A7	31.58	13	5	7
A8	36.59	13	7	8
A9	20	20	6	4
A10	48.94	12	12	11

>TRINITY_DN40550_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

GGATTATATTAGGGCTAAATCCCAGATTAGAAATGGTACGAAATTAAAATTGAGGTAATCGGGTCCTGGAAACGAAAATAACTGCGATGCCGTTGAGGATAATTGATTGTATCCACTGGAGTGTACTCTTGTTGTTCAAGGAATACCCGACAAGCCTCTTTGGATGCTTCAGTCTCGGTCTGGTCCGTTGATTGGTGGCC
TGGACGGTTGGGATGGGGCCACGTAAGGTTGATGGTGTTGTTCTCGAGGTGGGGATGATCCCAAATGGCCTTTTATTGATGACCCAGATGGTGGAAATGTCAGAAAGTTGTGGGGTTTTAGTATGGAAGACGGGGATTTCAACGGTTTTGAACGGTCTGAGGAACTGAGAACGAGGTCAACCTAGTGGGCAGAGTGGGGA
ATTTGCAGATAATGATGATATGATTTTGGGTTGGTGTAGTGTGTGTTATTATCATTTGGGTAAGCAGTTGCTGCTAATTTTATTGATTCTGGGATTGGTGATGCATATATAGGGTTCGGGAATGGGGTTTTCTGGAGAGTTGGGTTGGTGTAATGTGTTAACATCGTCTGTGTATTCAGTAGATTGCTAATTTTATTGAT
ATGTGGTTGGTGGATGTATTTAGATGTATTTATATAGATTGCAAATGGATTTTTTTTTTGGAAAGTTGAGTTCTGATTTTGTCATTTGCGTATTCAAGTGATGAAGATATTATTGAGTATGGGACTGGTGGGGTATAATTAGTATTTGCAAACGGGGTTATTGAGAGTTGGATTGCTGTGAGCTTTGATTTTGTCATTTG
GGTATTCAAGTGATTGCTGATGTGATTGAGAGTTGGATTGCTGTGAGCTTTGATTTTGTCATTTGGGTATTCAAGTGATTGCTGATTTGATTGATTATGGGATTGGTGGCTTAGTTTATATTGTGGTGGAAATGGGATCTCTGAGCGTTGGGTGACTCTGAGTTCTGACATTTTCATTTGGATGTTCAAGAGGTGCTGAT
ATTGATGATTATGGGATTAGTGGGTTCGCTTATATTGTGCTGGAAATGGGGTTTTTGAGAGTTGTTGGGAGCATGTTAGGCTGTACGAGTTGTGAAATAATTAGAATAAAAGAAACAAATATTATGGATGAAGGTCTGGCTTGGAAGGGAGCGGGATTGGGAGCTTTAGAGTGGGAGTTGTATGAGAGAACAAGAGAAGC
AACTGAAGAAGCACAGAGACAAGGTGCAGCTCAATTGAAAGCAGCAGTCGAGGCAGGTGGAGCAGTTAAACCTCTTGATTCTAATTCTTTGAGCAATAGGTGGTCATTCGGATTCAAGGACTCAGGACTTGAGGGGGCTTACAGGATCAAATCCGTTTCATTCTCATGCTTCAATAAGATTGTCTCCTTTCCTGTTGCAT
GTGAACTAGCTGCCTGCACTCTGCACCTCTTCAGGATGAAAATGATAACAGATTTGCCGTCTTCTCTGGTGCATTTCCTGGGTTACATTTGCGTCGCTGTTTGCTGTATCACAGTACTAAGTTCCCAAATGTTATTTTCTGAGTGGTACCAAGGTTGTAGGGTTATCATCTTGCAATATATGACGACTATGCTGTGGATT
TGGGAAAGTATTCAGATCTTCCTGATGGCTGATCATGAATGGACGTACATTTCTTATCATGCTCTAGCCCTTTCCACGTGCACAAGTGTGCTCTACCAAGTGCCTTTTTACATGCATCTGCGGCTAAGAATCTTTGGGCTAGCATGTCAAGCTGCTGCTATTTTGGCAAGAGGCAAACGGCAAGATAGTTTAACTTTGTT
GTTTGTAATTACAGCTAGTCATTTGTTGGGTGTTTTACTGTCTTATGTTCTTGAAAGAAGAGCTAGGTTGTGTTTCCTGAAGTCAATGCCATGCTGGCAAGCAGAGGATGTGACTGTAGCTCCTCTCCAGTCGGAGTTTTCAGAACCGTTTCAGGATTCTCTTTTCAATCAGTATTGCAATATCTTATGCTCCCAAACTC
TCGAGAAAACCTCTTCAAAGTTGAGCACTGTGATGATCACTCCTGGTGATCGAAGTGCACCTCACAGGGCTCTTGGTGGTTTTGCGGGTGGCTTTGCCGGTGTTTCAGGCCTGAAATGCAAGCTTCCTCCTCCCACTACTTCACTATTTTCATCTAGTGATAGCCTCTCGGGACATGGTAGGATGTCAGATTCTGAATCA
GACGAGGATGTAAATAGCTCAACAAGTGTTGCAGAACTGAGGTTGCGGTACACACATAACAAAGTTGAAGGCAGATGGATACAGGAAACCATTACTGACAGCGCTTATTCACAGGTTAAAAGCAGTTGCACTTCAAGTCAGAAGCAGCAGCTAGGAGGCCAGAATTGAATATCGTAGTTTGAATTATTTTCTATCTTGGC
ATTTCCATTTTCACTTTAATCATTTATCAATGCATATTGAGTAGGCAGCAACAATATTCTTCTGCATATTGTGCCAAGCAGCATTGTCTATATATCTGTATGTTTTTGGGAGGTAATTGAAGTCATCTTCTGCTTCG

>TRINITY_DN40550_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GGATTATATTAGGGCTAAATCCCAGATTAGAAATGGTACGAAATTAAAATTGAGGTAATCGGGTCCTGGAAACGAAAATAACTGCGATGCCGTTGAGGATAATTGATTGTATCCACTGGAGTGTACTCTTGTTGTTCAAGGAATACCCGACAAGCCTCTTTGGATGCTTCAGTCTCGGTCTGGTCCGTTGATTGGTGGCC
TGGACGGTTGGGATGGGGCCACGTAAGGTTGATGGTGTTGTTCTCGAGGTGGGGATGATCCCAAATGGCCTTTTATTGATGACCCAGATGGTGGAAATGTCAGAAAGTTGTGGGGTTTTAGTATGGAAGACGGGGATTTCAACGGTTTTGAACGGTCTGAGGAACTGAGAACGAGGTCAACCTAGTGGGCAGAGTGGGGA
ATTTGCAGATAATGATGATATGATTTTGGGTTGGTGTAGTGTGTGTTATTATCATTTGGGTAAGCAGTTGCTGCTAATTTTATTGATTCTGGGATTGGTGATGCATATATAGGGTTCGGGAATGGGGTTTTCTGGAGAGTTGGGTTGGTGTAATGTGTTAACATCGTCTGTGTATTCAGTAGATTGCTAATTTTATTGAT
ATGTGGTTGGTGGATGTATTTAGATGTATTTATATAGATTGCAAATGGATTTTTTTTTTGGAAAGTTGAGTTCTGATTTTGTCATTTGCGTATTCAAGTGATGAAGATATTATTGAGTATGGGACTGGTGGGGTATAATTAGTATTTGCAAACGGGGTTATTGAGAGTTGGATTGCTGTGAGCTTTGATTTTGTCATTTG
GGTATTCAAGTGATTGCTGATGTGATTGAGAGTTGGATTGCTGTGAGCTTTGATTTTGTCATTTGGGTATTCAAGTGATTGCTGATTTGATTGATTATGGGATTGGTGGCTTAGTTTATATTGTGGTGGAAATGGGATCTCTGAGCGTTGGGTGACTCTGAGTTCTGACATTTTCATTTGGATGTTCAAGAGGTGCTGAT
ATTGATGATTATGGGATTAGTGGGTTCGCTTATATTGTGCTGGAAATGGGGTTTTTGAGAGTTGTTGGGAGCATGTTAGGCTGTACGAGTTGTGAAATAATTAGAATAAAAGAAACAAATATTATGGATGAAGGTCTGGCTTGGAAGGGAGCGGGATTGGGAGCTTTAGAGTGGGAGTTGTATGAGAGAACAAGAGAAGC
AACTGAAGAAGCACAGAGACAAGGTGCAGCTCAATTGAAAGCAGCAGTCGAGGCAGGTGGAGCAGTTAAACCTCTTGATTCTAATTCTTTGAGCAATAGGTGGTCATTCGGATTCAAGGACTCAGGACTTGAGGGGGCTTACAGGATCAAATCCGTTTCATTCTCATGCTTCAATAAGATTGTCTCCTTTCCTGTTGCAT
GTGAACTAGCTGCCTGCACTCTGCACCTCTTCAGGATGAAAATGATAACAGATTTGCCGTCTTCTCTGGTGCATTTCCTGGGTTACATTTGCGTCGCTGTTTGCTGTATCACAGTACTAAGTTCCCAAATGTTATTTTCTGAGTGGTACCAAGGTTGTAGGGTTATCATCTTGCAATATATGACGACTATGCTGTGGATT
TGGGAAAGTATTCAGATCTTCCTGATGGCTGATCATgtaagatattctgctcagtttgctggcatttggattttgtcaccctttttcccaacagGAATGGACGTACATTTCTTATCATGCTCTAGCCCTTTCCACGTGCACAAGTGTGCTCTACCAAGTGCCTTTTTACATGCATCTGCGGCTAAGAATCTTTGGGCTAG
CATGTCAAGCTGCTGCTATTTTGGCAAGAGGCAAACGGCAAGATAGTTTAACTTTGTTGTTTGTAATTACAGCTAGTCATTTGTTGGGTGTTTTACTGTCTTATGTTCTTGAAAGAAGAGCTAGGTTGTGTTTCCTGAAGTCAATGCCATGCTGGCAAGCAGAGGATGTGACTGTAGCTCCTCTCCAGTCGGAGTTTTCA
GAACCGTTTCAGGATTCTCTTTTCAATCAGTATTGCAATATCTTATGCTCCCAAACTCTCGAGAAAACCTCTTCAAAGTTGAGCACTGTGATGATCACTCCTGGTGATCGAAGTGCACCTCACAGGGCTCTTGGTGGTTTTGCGGGTGGCTTTGCCGGTGTTTCAGGCCTGAAATGCAAGCTTCCTCCTCCCACTACTTC
ACTATTTTCATCTAGTGATAGCCTCTCGGGACATGGTAGGATGTCAGATTCTGAATCAGACGAGGATGTAAATAGCTCAACAAGTGTTGCAGAACTGAGGTTGCGGTACACACATAACAAAGTTGAAGGCAGATGGATACAGGAAACCATTACTGACAGCGCTTATTCACAGGTTAAAAGCAGTTGCACTTCAAGTCAGA
AGCAGCAGCTAGGAGGCCAGAATTGAATATCGTAGTTTGAATTATTTTCTATCTTGGCATTTCCATTTTCACTTTAATCATTTATCAATGCATATTGAGTAGGCAGCAACAATATTCTTCTGCATATTGTGCCAAGCAGCATTGTCTATATATCTGTATGTTTTTGGGAGGTAATTGAAGTCATCTTCTGCTTCG

Intron 3 GTAAGTTTTC ... TCTGTAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	4.19	11.7	0	1
A2	23.15	4.3	1	1
A3	25.92	6	2	1
A4	19.49	10.7	5	0
A5	19.05	6.3	1	1
A6	17.33	7.7	1	2
A7	21.26	13	0	7
A8	26.04	16	2	9
A9	11.75	13	0	3
A10	23.45	16.3	2	8

>TRINITY_DN39621_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

TAAAAACTTGTGCGTTCATTTTGGTTTGAATGTATGAGTCGCGCTTTTGAGAAGAATCTCTACTGTCAAGTCAAGAATTTAGGTCAATGGAGAGTGAACAAACGTCCTATTCATGTTACTGAGATAATTAAATTTCTGATGCCGAAACAAGGGGGAGCGTATAGGGGAGGGTGAAGGGCGTAGCTTACCATGATTACTCG
CAAATTTATGGAATAAAATTCTGTAAAACTATGACTTCTGACAGTCAACAGCAACTGTCGAGATCTCTGAGCGTTTATAGAATTTTAAACCAAGTTGCCAATTTTAAATGGGGGCGAAATCCATTATATAAATATACATTCTGCGACGGCGGCGGCACAACCAGCACGCTCATTGTACCTTTTTAATCACGACAAAACAC
AGTGGTATTTATGTTTGTAATTTTTTTGGCATTCAAAATTCTGTTACAATCATCATGAATTCTCCATCACGCGCAGACAGGTCAGGCAGAGGGATTATATTAGGGCTAAATCCCAGATTAGAAATGGTACGAAATTAAAATTGAGGTAATCGGGTCCTGGAAACGAAAATAACTGCGATGCCGTTGAGGATAATTGATTG
TATCCACTGGAGTGTACTCTTGTTGTTCAAGGAATACCCGACAAGCCTCTTTGGATGCTTCAGTCTCGGTCTGGTCCGTTGATTGGTGGCCTGGACGGTTGGGATGGGGCCACGTAAGGTTGATGGTGTTGTTCTCGAGGTGGGGATGATCCCAAATGGCCTTTTATTGATGACCCAGATGGTGGAAATGTCAGAAAGTT
GTGGGGTTTTAGTATGGAAGACGGGGATTTCAACGGTTTTGAACGGTCTGAGGAACTGAGAACGAGGTCAACCTAGTGGGCAGAGTGGGGAATTTGCAGATAATGATGATATGATTTTGGGTTGGTGTAGTGTGTGTTATTATCATTTGGGTAAGCAGTTGCTGCTAATTTTATTGATTCTGGGATTGGTGATGCATATA
TAGGGTTCGGGAATGGGGTTTTCTGGAGAGTTGGGTTGGTGTAATGTGTTAACATCGTCTGTGTATTCAGTAGATTGCTAATTTTATTGATATGTGGTTGGTGGATGTATTTAGATGTATTTATATAGATTGCAAATGGATTTTTTTTTTGGAAAGTTGAGTTCTGATTTTGTCATTTGCGTATTCAAGTGATGAAGATA
TTATTGAGTATGGGACTGGTGGGGTATAATTAGTATTTGCAAACGGGGTTATTGAGAGTTGGATTGCTGTGAGCTTTGATTTTGTCATTTGGGTATTCAAGTGATTGCTGATGTGATTGAGAGTTGGATTGCTGTGAGCTTTGATTTTGTCATTTGGGTATTCAAGTGATTGCTGATTTGATTGATTATGGGATTGGTGG
CTTAGTTTATATTGTGGTGGAAATGGGATCTCTGAGCGTTGGGTGACTCTGAGTTCTGACATTTTCATTTGGATGTTCAAGAGGTGCTGATATTGATGATTATGGGATTAGTGGGTTCGCTTATATTGTGCTGGAAATGGGGTTTTTGAGAGTTGTTGGGAGCATGTTAGGCTGTACGAGTTGTGAAATAATTAGAATAA
AAGAAACAAATATTATGGATGAAGGTCTGGCTTGGAAGGGAGCGGGATTGGGAGCTTTAGAGTGGGAGTTGTATGAGAGAACAAGAGAAGCAACTGAAGAAGCACAGAGACAAGGTGCAGCTCAATTGAAAGCAGCAGTCGAGGCAGGTGGAGCAGTTAAACCTCTTGATTCTAATTCTTTGAGCAATAGGTGGTCATTC
GGATTCAAGGACTCAGGACTTGAGGGGGCTTACAGGATCAAATCCGTTTCATTCTCATGCTTCAATAAGATTGTCTGCTTTCCTGTTGCATGTGAACTAGCTGCCTGCACTCTGCACCTCTTCAGGACGAAAATGATAACAGATTTGCCGTCTTCTCTGGTGCATTTCCTGGGTTACATTTGCGTCGCTGTTTGCTGTAT
CACAGTACTAAGTTCCCAAATGTTATTTTCTGAGTGGTACCAAGGTTGTAGGGTTATCATCTTGCAATATATGACGACTATGCTGTGGATTTGGGAAAGTATTCAGATCTTCCTGATGGCTGATCATGAATGGACGTACATTTCTTATCATGCTCTAGCCCTTTCCACGTGCACAAGTGTGCTCTACCAAGTGCCTTTTT
ACATGCATCTGCGGCTAAGAATCTTTGGGCTAGCATGTCAAGCTGCTGCTATTTTGGCAAGAGGCAAACGGCAAGATAGTTTAACTTTGTTGTTTGTAATTACAGCTAGTCATTTGTTGGGTGTTTTACTGTCTTATGTTCTTGAAAGAAGAGCTAGGTTGTGTTTCCTGAAGTCAATGCCATGCTGGCAAGCAGAGGAT
GTGACTGTAGCTCCTCTCCAGTCGGAGTTTTCAGAACCGTTTCAGGATTCTCTTTTCAATCAGTATTGCAATATCTTATGCTCCCAAACTCTCGAGAAAACCTCTTCAAAGTTGAGCACTGTGATGATCACTCCTGGTGATCGAAGTGCACCTCACAGGGCTCTTGGTGGTTTTGCGGGTGGCTTTGCCGGTGTTTCAGG
CCTGAAATGCAAGCTTCCTCCTCCCACTACTTCACTATTTTCATCTAGTGATAGCCTCTCGGGACATGGTAGGATGTCAGATTCTGAATCAGACGAGGATGTAAATAGCTCAACAAGTGTTGCAGAACTGAGGTTGCGGTACACACATAACAAAGTTGAAGGCAGATGGATACAGGAAACCATTACTGACAGCGCTTATT
CACAGGTTAAAAGCAGTTGCACTTCAAGTCAGAAGCAGCAGCTAGGAGGCCAGAATTGAATATCGTAGTTTGAATTATTTTCTATCTTGGCATTTCCATTTTCACTTTAATCATGTATCAATGCATATTGAGTAGGCAGCAACAATATTCTTCTGCATATTGTGCCAAGCAGCATTGTCTATATATCTGTATGTTTTTGG
GAGGTAATTGAAGTCATCTTCTGCTTCATTGTGATTATATGTGTTTGTTTTAATGGCTTTGGGTCTTATGG

>TRINITY_DN39621_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

ATTAAACTCTTTACACCTCAGTGAATTTTAGTTTTGTTATAAAGAGTTGCTTATGGAATCCAAAGCAAGCTTTCCATAAGAACAACTTTATTCATTTGTGATTTTATTCATTAAGGAAGAACCCTGTTTGACATATTTAAGCAGGAATGGACGTACATTTCTTATCATGCTCTAGCCCTTTCCACGTGCACAAGTGTGCT
CTACCAAGTGCCTTTTTAgtaagttttctggacattagactagtgaatgataagtatgttttcttaaaataattttcattggatctttctacatatagtacagtaatgtgttttgtgtaattagaagaattttcaagtagtttcttctggcatttgtatgtcatttaaaatctttaatttattttagctccaatggttct
ttgtcattgtgagtacctgcgattaccatattgtcttagagttgatatttatcattagctcatcaatataagaatgttgaaacgtgcgaaatctcgtgtttctgtaacagCATGCATCTGCGGCTAAGAATCTTTGGGCTAGCATGTCAAGCTGCTGCTATTTTGGCAAGAGGCAAACGGCAAGATAGTTTAACTTTGTT
GTTTGTAATTACAGCTAGTCATTTGTTGGGTGTTTTACTGTCTTATGTTCTTGAAAGAAGAGCTAGGTTGTGTTTCCTGAAGTCAATGCCATGCTGGCAAGCAGAGGATGTGACTGTAGCTCCTCTCCAGTCGGAGTTTTCAGAACCGTTTCAGGATTCTCTTTTCAATCAGTATTGCAATATCTTATGCTCCCAAACTC
TCGAGAAAACCTCTTCAAAGTTGAGCACTGTGATGATCACTCCTGGTGATCGAAGTGCACCTCACAGGGCTCTTGGTGGTTTTGCGGGTGGCTTTGCCGGTGTTTCAGGCCTGAAATGCAAGCTTCCTCCTCCCACTACTTCACTATTTTCATCTAGTGATAGCCTCTCGGGACATGGTAGGATGTCAGATTCTGAATCA
GACGAGGATGTAAATAGCTCAACAAGTGTTGCAGAACTGAGGTTGCGGTACACACATAACAAAGTTGAAGGCAGATGGATACAGGAAACCATTACTGACAGCGCTTATTCACAGGTTAAAAGCAGTTGCACTTCAAGTCAGAAGCAGCAGCTAGGAGGCCAGAATTGAATATCGTAGTTTGAATTATTTTCTATCTTGGC
ATTTCCATTTTCACTTTAATCATGTATCAATGCATATTGAGTAGGCAGCAACAATATTCTTCTGCATATTGTGCCAAGCAGCATTGTCTATATATCTGTATGTTTTTGGGAGGTAATTGAAGTCATCTTCTGCTTCATTGTGATTATATGTGTTTGTTTTAATGGCTTTGGGTCTTATGG