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CGTATAGAAATTCCTTTAGGTGTTCTCAAATTCGTCGATTTGGTTGTTTTTTCGTCAAATTCGGCGTCCTTCAGGTAACGATCTGAGGTTTGAGGGAAATCTGTGCTTTTTTCGCCAAATTTTCTGATGTCTGAGGGGGTTTTATATACAAGAAAAGGCTCGGTGGAAGACAATCATTTTAGCAGAGAGGCGGTGAAGGT
GAAGTTCTTTTTGCCTGTGACTGGTGTGTTTTTGGGATAAAAGATCGGACCGGAAATGAACAAATGTTTTATGTCGCATAACAATCAAGAATTTTAGCACTTAAGAGGTTTCTGCTTGGCTATCAAATAAATATAATACGAGAAAGACTAGCTGTCCGAGTTGTACGACATACTTTAATGTCCGGAAACCCCAGTCTGTA
CAGACAATCGGAGCACGGGGTCGAGATTTAGAAACTTTGTTCTTGCAGCAGCAGAATCTTCTGTACAGTTATTGAAGAGCATCGTGAAATCTTAAATGATCTTCACCGAATTATTTATTTAGAGTTCTATATTTTGTGTACTTGTAATTATATTGGTCCATTTAACTGATCGATCGAAATGGTGACCGAGAGTCCAGTAA
AGATGTTTCCTGGTCTCGGAATGAGAGGATCATTAGGTGACGGCCTTGGAGGAAGTAGTCCAAGCATGCAAGACCCATCATACACTGACGAGTTAGGGAAAGAACTCGGCATGATGCTCCGAGATCAACGCCGTTATGAGATAAATGAAAGGGAAAGAGAATTGAACCTGTACCGAAGCGGGAGCGCACCGCCAACAGTG
GAAGGATCGCTGGCTGCCGTTGGAGGCTTTTTCAATCGTAATGGCGTCTCTGGATCCACAGCTTCTGACAACGGCAGAGCTAATAATAATAATAATAATAATGTTAACAACATCAATATTAGTAATAATAATCACAGCTTCATGTCTGAAGAAGAGCTGAGGTCCGATCCAGCATACTTGTCCTACTATTATTCTCATGT
AAACCTAAACCCTAGACTCCCACCTCCAATACTCTCCAAGGAAGACTGGCGTTTTGCGCAGAGATTGAGAGCGGGAGCATCGCCGCACGGCGGTATTGGTGACAGAAGAAAGTTGAAGTCATTCGATGATGGAAACAGCAAATCCCTATTTTCCCTGCAGCCGGTACTTCCCACTCACAAAGAAGAAAATGAACGCCTGG
AGAAGTTAGCGCAGGGTAATCTGGCGCGGCAATCTTCTGCAGAGTGGTTTGAACGAGGAGCGGATGGATTGATTGGGTTATCATCAGTAGGAGGACTGGGAGCCAGGAGAAAAAGTCTCGCAGATATACTCCAGGAAGATCTTGGGAGGTCTTCTCCTGCTCCTAGACATCCTTCCAGACCGGCAAGCCGCAATGCTTAT
GATGATGGAGTTGATCCTATTGGTGCTGCTGAGGGACAGGTTGTAAACATGCGTCATGAATTGGCTGCCGTTGAAAGCGTGCGATCTGGCTCAGCAATGCCAGGACTGGCAAGAGTACAAAGTCTTGGTGCCCAGTCTTCTCATGCTTTTGCAGCAGCTCTAGGTGCTTCTCTGTCAAGAAACCAAACTCCTGATCCTCA
GCACGTGATGACAAGGTCTCCTAGCCCCCGCCCTGTTGGAATGGGGGGGAGATTTGGTGCGTCTGATAAGCAAAACATTGTTTGCCCCAACTCATTTAATGGGGTTTCTTCAAATGCGAGTGAATCTGCAGAAATTGCTGCTGCTTTGTCAGGCATGAGCCTCTTATCTAATGGAGTAATGGAAGAAGAAAAACATGTAC
AATCACAGATGCAACAAGAGATGTCAGAGCATCGAAATTACCTTTTCCATCTCCAAAGTGATCAGAACCAAAATCAGCAGCATGCACAACTTGGGAAGTCTCAAGTTGAATCTATACAGACACCCATTTTGACAAAATCAGTGCAACAGTCATGTGGTGTCCTTAATCAAAGCAACAGGGCTCTGACTGATTCTAACATG
TCCTCTGTCACTTCTCAAGTGCAACGTGAAAATATTCGATCTCCACAACAATCTGGATCTCTTACTCGTGATTTCTCCTCAACAGCAGTGGAATCAGCATCAGCTGCTGATGGTATTTCTAATATTGAAGGAACAAGTGGACCCTACCACAATGCAAATGTTTCTAATATGTGTTCTCCAAATTATGGTATGAATGGGTA
TCCAATTAATTCAATGTTACCATCCATGATGTCTGGATACCTTGCTCCGGGTAGTCTACATCCTACATTTGATAATGGTGTTGCTGGCATGGACTCAAGAAATACAGCAGGTGGTCTTCCTGGAGGAACATCCCGAGGCACTGGAGATTTGCAGAATCTCTATAGATTAGGTGGGCAGGTGGGGACTGGACTTCAGATGC
CTGTTGACCCGTTATATGTTCAGTATTTGCAGAGGACAGCAGCTGAATATGCTACACAAATGGCTGCAGGCTTGAGTGATCCTTCCATGGCAAGGAATTACATGGGGGGACCTTATGTTGATATGCTTGAATTTCAAAAAGCGTATTTGGGGGCATTGTTTGCTCAACAGAAGTCACAGTATGGCCTACCCTATTTAGGA
AAAGGTGGCACTCTTAATCCGGCATATAATTTTAACCCATCCTTTGGTCTCGCAATGCCATTTCCAGGTAGTCCTATTGCCAGTCCCGTGCTTCCGAGCTCTCCTGTAGCACCTGCAAGCCCACCTATTAGACCAAATGAACGGAACCATCGTTTCCCTACTGGTGCAAGAAGTTCATCTGGAGTAGTTGTGGGTCCTTG
GCATGCTGAAAATGGGGTGAATATGGAAGATGCATACGGTTCTTCTTTGTTGGAAGAATTCAAGAATAGTAAGACCCGATGTTTTGAACTGTCAGAGATCGTGGGGCATGTAGTCGAGTTCAGTTCTGATCAGTATGGGAGTCGATTTATTCAACAAAAACTAGAAACCGCAACAGTTGAGGAGAAAAACATGGTGTTTC
AGGAGATATTTCCTCAAGCATTAACTCTTATGACAGATGTCTTTGGGAATTATGTTATACAGAAGTTCTTTGAGCATGGTACAGCAAGCCAAAGGAAAGACCTGGCAAACCAGCTTTCTGGCCACATTTTAGCTCTTAGTCTTCAAATGTATGGCTGCCGTGTAATCCAGAAGGCCATTGAGGTTGTTGATGCAGATCAA
CAAGCACAGATGGTTTTGGAGCTGGAAGGGCATGTCATGCGCTGTGTTCGTGATCAAAATGGGAACCATGTCGTTCAGAAGTGCATTGAATGTATTCCCCAGGATAAAATTCAGTTTATCATTTCATCTTTTTTTGGACAAGTTGTGGCCTTGTCCACCCATCCATATGGCTGTCGTGTCATACAGAGGGTGCTGGAGCA
TTGCACTGATGCAAAGACAGAGAGCATTATGATGGAAGAGATCTTGCAGTCAGTCTGTACTCTTGCACAAGACCAGTATGGAAATTATGTTGTGCAGCATGTACTTGAGCATGGTAAACCACATGAACGCTCTGCTGTAATTAAGAAACTAGCAGGACAAATAGTTCAAATGAGCCAACAAAAGTTTGCTTCAAATGTAG
TAGAAAAATGTTTAGTGTTTGGAGGTCCTGCCGAGCGAGAATTTTTGATTAAAGAGATGCTTGGCTTAACTGATGAAAATGAGCCTCTACAGGCAATGATGAAAGATCAATTTGCCAATTATGTTGTACAGAAGGTTCTTGAGACTTGTGATGATCAACAGCGTGAACTAATTCTTTCTCGAATCAAAGTGCATTTAAAT
GCACTGAAAAAATACACATATGGAAAACATATTGTTGCCCGAGTTGAGAAGCTTGTTGCAGCTGGAGAGAGGCGTATTGGAACTCAATCAACATATCAGTCCTAAAATTCTAGGATACACATACATGAGGATTTGTACAGATGGGGAGGTTGGTTATAAACCATTTCCAATCTTTTAAACTGGGTCATGGTTGCATTCTA
GTACAGGTGTCTTTAGATTATCTTGGTGCTTCAAAAAAAGGTACAAGCTAGTGTATATGCACATACTGTAATAATTCTGCTTGTACTGGGTTGTACATTCTGTAGTTTGTATGAATGTAGGGTTTAAATGTTTTAGGAAAAGCAGAGTTGATAACGAGGCTTTGTCTCAGTCAAATAGGAAAGTGTCAATTGTCTGTTGA
ACAGGATATATTTGTGATTATAGAGCATACTTGTTACCTTGCAATGGTTGGTACGAGTAACTAATTCTGTAAAGGAGAGGGATTGGTAACATAACTGTAAAGATGAAATATACTTGTGGTATTTGGGCCTAGCATTGGCTACAAGTTTTGCACTTTATTAATACTCTACTTTTGTTTATTTTATCTCACTGTAAGAAATG
CGCTTTATAATGACTTGGTACTAGAATCCAAGTTCACATTCTTTTCTTAACATAAATCTCGTAATTTATAAGCAACATATTGTCTCTCATGGCAGAGATTAAGCATTGTTATATTTTGCACTTCAACAAAAGTCTTGATTTCAT


>TRINITY_DN115644_c0_g3_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TGGGGATTCTAAACCGTTCGATAACAGAGCCAACGGCCCTGATTCCTTCGCTCTTCGAGCTTATCTTCGACGCGTGTGTCCACCTAATTTCTTTCTCGCACCTCTGCTACACTGCCTTTGCTCTGGAGATCAAAATCAATCAAAAGGATGATCGACAAATGCCTGGATTTCGCACGTTTTGGACCGTCTGGACTGTGAAT
CGTATAGAAATTCCTTTAGGTGTTCTCAAATTCGTCGATTTGGTTGTTTTTTCGTCAAATTCGGCGTCCTTCAGGTAACGATCTGAGGTTTGAGGGAAATCTGTGCTTTTTTCGCCAAATTTTCTGATGTCTGAGGGGGTTTTATATACAAGAAAAGGCTCGGTGGAAGACAATCATTTTAGCAGAGAGGCGGTGAAGGT
GAAGTTCTTTTTGCCTGTGACTGGTGTGTTTTTGGGATAAAAGATCGGACCGGAAATGAACAAATGTTTTATGTCGCATAACAATCAAGAATTTTAGCACTTAAGAGGTTTCTGCTTGGCTATCAAATAAATATAATACGAGAAAGACTAGCTGTCCGAGTTGTACGACATACTTTAATGTCCGGAAACCCCAGTCTGTA
CAGACAATCGGAGCACGGGGTCGAGATTTAGAAACTTTGTTCTTGCAGCAGCAGAATCTTCTGTACAGTTATTGAAGAGCATCGTGAAATCTTAAATGATCTTCACCGAATTATTTATTTAGAGTTCTATATTTTGTGTACTTGTAATTATATTGGTCCATTTAACTGATCGATCGAAATGGTGACCGAGAGTCCAGTAA
AGATGTTTCCTGGTCTCGGAATGAGAGGATCATTAGGTGACGGCCTTGGAGGAAGTAGTCCAAGCATGCAAGACCCATCATACACTGACGAGTTAGGGAAAGAACTCGGCATGATGCTCCGAGATCAACGCCGTTATGAGATAAATGAAAGGGAAAGAGAATTGAACCTGTACCGAAGCGGGAGCGCACCGCCAACAGTG
GAAGGATCGCTGGCTGCCGTTGGAGGCTTTTTCAATCGTAATGGCGTCTCTGGATCCACAGCTTCTGACAACGGCAGAGCTAATAATAATAATAATAATAATGTTAACAACATCAATATTAGTAATAATAATCACAGCTTCATGTCTGAAGAAGAGCTGAGGTCCGATCCAGCATACTTGTCCTACTATTATTCTCATGT
AAACCTAAACCCTAGACTCCCACCTCCAATACTCTCCAAGGAAGACTGGCGTTTTGCGCAGAGATTGAGAGCGGGAGCATCGCCGCACGGCGGTATTGGTGACAGAAGAAAGTTGAAGTCATTCGATGATGGAAACAGCAAATCCCTATTTTCCCTGCAGCCGGTACTTCCCACTCACAAAGAAGAAAATGAACGCCTGG
AGAAGTTAGCGCAGGGTAATCTGGCGCGGCAATCTTCTGCAGAGTGGTTTGAACGAGGAGCGGATGGATTGATTGGGTTATCATCAGTAGGAGGACTGGGAGCCAGGAGAAAAAGTCTCGCAGATATACTCCAGGAAGATCTTGGGAGGTCTTCTCCTGCTCCTAGACATCCTTCCAGACCGGCAAGCCGCAATGCTTAT
GATGATGGAGTTGATCCTATTGGTGCTGCTGAGGGACAGGTTGTAAACATGCGTCATGAATTGGCTGCCGTTGAAAGCGTGCGATCTGGCTCAGCAATGCCAGGACTGGCAAGAGTACAAAGTCTTGGTGCCCAGTCTTCTCATGCTTTTGCAGCAGCTCTAGGTGCTTCTCTGTCAAGAAACCAAACTCCTGATCCTCA
GCACGTGATGACAAGGTCTCCTAGCCCCCGCCCTGTTGGAATGGGGGGGAGATTTGGTGCGTCTGATAAGCAAAACATTGTTTGCCCCAACTCATTTAATGGGGTTTCTTCAAATGCGAGTGAATCTGCAGAAATTGCTGCTGCTTTGTCAGGCATGAGCCTCTTATCTAATGGAGTAATGGAAGAAGAAAAACATGTAC
AATCACAGATGCAACAAGAGATGTCAGAGCATCGAAATTACCTTTTCCATCTCCAAAGTGATCAGAACCAAAATCAGCAGCATGCACAACTTGGGAAGTCTCAAGTTGAATCTATACAGACACCCATTTTGACAAAATCAGTGCAACAGTCATGTGGTGTCCTTAATCAAAGCAACAGGGCTCTGACTGATTCTAACATG
TCCTCTGTCACTTCTCAAGTGCAACGTGAAAATATTCGATCTCCACAACAATCTGGATCTCTTACTCGTGATTTCTCCTCAACAGCAGTGGAATCAGCATCAGCTGCTGATGGTATTTCTAATATTGAAGGAACAAGTGGACCCTACCACAATGCAAATGTTTCTAATATGTGTTCTCCAAATTATGGTATGAATGGGTA
TCCAATTAATTCAATGTTACCATCCATGATGTCTGGATACCTTGCTCCGGGTAGTCTACATCCTACATTTGATAATGGTGTTGCTGGCATGGACTCAAGAAATACAGCAGGTGGTCTTCCTGGAGGAACATCCCGAGGCACTGGAGATTTGCAGAATCTCTATAGATTAGGTGGGCAGGTGGGGACTGGACTTCAGATGC
CTGTTGACCCGTTATATGTTCAGTATTTGCAGAGGACAGCAGCTGAATATGCTACACAAATGGCTGCAGGCTTGAGTGATCCTTCCATGGCAAGGAATTACATGGGGGGACCTTATGTTGATATGCTTGAATTTCAAAAAGCGTATTTGGGGGCATTGTTTGCTCAACAGAAGTCACAGTATGGCCTACCCTATTTAGGA
AAAGGTGGCACTCTTAATCCGGCATATAATTTTAACCCATCCTTTGGTCTCGCAATGCCATTTCCAGGTAGTCCTATTGCCAGTCCCGTGCTTCCGAGCTCTCCTGTAGCACCTGCAAGCCCACCTATTAGACCAAATGAACGGAACCATCGTTTCCCTACTGGTGCAAGAAGTTCATCTGGAGTAGTTGTGGGTCCTTG
GCATGCTGAAAATGGGGTGAATATGGAAGATGCATACGGTTCTTCTTTGTTGGAAGAATTCAAGAATAGTAAGACCCGATGTTTTGAACTGTCAGAGATCGTGGGGCATGTAGTCGAGTTCAGgtatatatattttttcaattaatacatcattacaagcaaactgcaataaatcctatgaatctaaccctttggttttt
acagTTCTGATCAGTATGGGAGTCGATTTATTCAACAAAAACTAGAAACCGCAACAGTTGAGGAGAAAAACATGGTGTTTCAGGAGATATTTCCTCAAGCATTAACTCTTATGACAGATGTCTTTGGGAATTATGTTATACAGAAGTTCTTTGAGCATGGTACAGCAAGCCAAAGGAAAGACCTGGCAAACCAGCTTTCT
GGCCACATTTTAGCTCTTAGTCTTCAAATGTATGGCTGCCGTGTAATCCAGAAGGCCATTGAGGTTGTTGATGCAGATCAACAAGCACAGATGGTTTTGGAGCTGGAAGGGCATGTCATGCGCTGTGTTCGTGATCAAAATGGGAACCATGTCGTTCAGAAGTGCATTGAATGTATTCCCCAGGATAAAATTCAGTTTAT
CATTTCATCTTTTTTTGGACAAGTTGTGGCCTTGTCCACCCATCCATATGGCTGTCGTGTCATACAGAGGGTGCTGGAGCATTGCACTGATGCAAAGACAGAGAGCATTATGATGGAAGAGATCTTGCAGTCAGTCTGTACTCTTGCACAAGACCAGTATGGAAATTATGTTGTGCAGCATGTACTTGAGCATGGTAAAC
CACATGAACGCTCTGCTGTAATTAAGAAACTAGCAGGACAAATAGTTCAAATGAGCCAACAAAAGTTTGCTTCAAATGTAGTAGAAAAATGTTTAGTGTTTGGAGGTCCTGCCGAGCGAGAATTTTTGATTAAAGAGATGCTTGGCTTAACTGATGAAAATGAGCCTCTACAGGCAATGATGAAAGATCAATTTGCCAAT
TATGTTGTACAGAAGGTTCTTGAGACTTGTGATGATCAACAGCGTGAACTAATTCTTTCTCGAATCAAAGTGCATTTAAATGCACTGAAAAAATACACATATGGAAAACATATTGTTGCCCGAGTTGAGAAGCTTGTTGCAGCTGGAGAGAGGCGTATTGGAACTCAATCAACATATCAGTCCTAAAATTCTAGGATACA
CATACATGAGGATTTGTACAGATGGGGAGGTTGGTTATAAACCATTTCCAATCTTTTAAACTGGGTCATGGTTGCATTCTAGTACAGGTGTCTTTAGATTATCTTGGTGCTTCAAAAAAAGGTACAAGCTAGTGTATATGCACATACTGTAATAATTCTGCTTGTACTGGGTTGTACATTCTGTAGTTTGTATGAATGTA
GGGTTTAAATGTTTTAGGAAAAGCAGAGTTGATAACGAGGCTTTGTCTCAGTCAAATAGGAAAGTGTCAATTGTCTGTTGAACAGGATATATTTGTGATTATAGAGCATACTTGTTACCTTGCAATGGTTGGTACGAGTAACTAATTCTGTAAAGGAGAGGGATTGGTAACATAACTGTAAAGATGAAATATACTTGTGG
TATTTGGGCCTAGCATTGGCTACAAGTTTTGCACTTTATTAATACTCTACTTTTGTTTATTTTATCTCACTGTAAGAAATGCGCTTTATAATGACTTGGTACTAGAATCCAAGTTCACATTCTTTTCTTAACATAAATCTCGTAATTTATAAGCAACATATTGTCTCTCATGGCAGAGATTAAGCATTGTTATATTTTGC
ACTTCAACAAAAGTCTTGATTTCAT



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>TRINITY_DN121915_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform
GCCAGGTGCGGTGGGGATTCTAAACCGTTCGATAACAGAGCCAACGGCCCTGATTCCTTCGCTCTTCGAGCTTATCTTCGACGCGTGTGTCCACCTAATTTCTTTCTCGCACCTCTGCTACACTGCCTTTGCTCTGGAGATCAAAATCAATCAAAAGGATGATCGACAAATGCCTGGATTTCGCACGTTTTGGACCGTCT
GGACTGTGAATCGTATAGAAATTCCTTTAGGTGTTCTCAAATTCGTCGATTTGGTTGTTTTTTCGTCAAATTCGGCGTCCTTCAGGTAACGATCTGAGGTTTGAGGGAAATCTGTGCTTTTTTCGCCAAATTTTCTGATGTCTGAGGGGGTTTTATATACAAGAAAAGGCTCGGTGGAAGACAATCATTTTAGCAGAGAG
GCGGTGAAGGTGAAGTTCTTTTTGCCTGTGACTGGTGTGTTTTTGGGATAAAAGATCGGACCGGAAATGAACAAATGTTTTATGTCGCATAACAATCAAGAATTTTAGCACTTAAGAGGTTTCTGCTTGGCTATCAAATAAATATAATACGAGAAAGACTAGCTGTCCGAGTTGTACGACATACTTTAATGTCCGGAAAC
CCCAGTCTGTACAGACAATCGGAGCACGGGGTCGAGATTTAGAAACTTTGTTCTTGCAGCAGCAGAATCTTCTGTACAGTTATTGAAGAGCATCGTGAAATCTTAAATGATCTTCACCGAATTATTTATTTAGAGTTCTATATTTTGTGTACTTGTAATTATATTGGTCCATTTAACTGATCGATCGAAATGGTGACCGA
GAGTCCAGTAAAGATGTTTCCTGGTCTCGGAATGAGAGGATCATTAGGTGACGGCCTTGGAGGAAGTAGTCCAAGCATGCAAGACCCATCATACACTGACGAGTTAGGGAAAGAACTCGGCATGATGCTCCGAGATCAACGCCGTTATGAGATAAATGAAAGGGAAAGAGAATTGAACCTGTACCGAAGCGGGAGCGCAC
CGCCAACAGTGGAAGGATCGCTGGCTGCCGTTGGAGGCTTTTTCAATCGTAATGGCGTCTCTGGATCCACAGCTTCTGACAACGGCAGAGCTAATAATAATAATAATAATAATGTTAACAACATCAATATTAGTAATAATAATCACAGCTTCATGTCTGAAGAAGAGCTGAGGTCCGATCCAGCATACTTGTCCTACTAT
TATTCTCATGTAAACCTAAACCCTAGACTCCCACCTCCAATACTCTCCAAGGAAGACTGGCGTTTTGCGCAGAGATTGAGAGCGGGAGCATCGCCGCACGGCGGTATTGGTGACAGAAGAAAGTTGAAGTCATTCGATGATGGAAACAGCAAATCCCTATTTTCCCTGCAGCCGGTACTTCCCACTCACAAAGAAGAAAA
TGAACGCCTGGAGAAGTTAGCGCAGGGTAATCTGGCGCGGCAATCTTCTGCAGAGTGGTTTGAACGAGGAGCGGATGGATTGATTGGGTTATCATCAGTAGGAGGACTGGGAGCCAGGAGAAAAAGTCTCGCAGATATACTCCAGGAAGATCTTGGGAGGTCTTCTCCTGCTCCTAGACATCCTTCCAGACCGGCAAGCC
GCAATGCTTATGATGATGGAGTTGATCCTATTGGTGCTGCTGAGGGACAGGTTGTAAACATGCGTCATGAATTGGCTGCCGTTGAAAGCGTGCGATCTGGCTCAGCAATGCCAGGACTGGCAAGAGTACAAAGTCTTGGTGCCCAGTCTTCTCATGCTTTTGCAGCAGCTCTAGGTGCTTCTCTGTCAAGAAACCAAACT
CCTGATCCTCAGCACGTGATGACAAGGTCTCCTAGCCCCCGCCCTGTTGGAATGGGGGGGAGATTTGGTGCGTCTGATAAGCAAAACATTGTTTGCCCCAACTCATTTAATGGGGTTTCTTCAAATGCGAGTGAATCTGCAGAAATTGCTGCTGCTTTGTCAGGCATGAGCCTCTTATCTAATGGAGTAATGGAAGAAGA
AAAACATGTACAATCACAGATGCAACAAGAGATGTCAGAGCATCGAAATTACCTTTTCCATCTCCAAAGTGATCAGAACCAAAATCAGCAGCATGCACAACTTGGGAAGTCTCAAGTTGAATCTATACAGACACCCATTTTGACAAAATCAGTGCAACAGTCATGTGGTGTCCTTAATCAAAGCAACAGGGCTCTGACTG
ATTCTAACATGTCCTCTGTCACTTCTCAAGTGCAACGTGAAAATATTCGATCTCCACAACAATCTGGATCTCTTACTCGTGATTTCTCCTCAACAGCAGTGGAATCAGCATCGGCTGCTGATGGTATTTCTAATATTGAAGGAACAAGTGGACCCTACCACAATGCAAATGTTTCTAATATGTGTTCTCCAAATTATGGT
ATGAATGGGTATCCAATTAATTCAATGTTACCATCCATGATGTCTGGATACCTTGCTCCGGGTAGTCTACATCCTACATTTGATAATGGTGTTGCTGGCATGGACTCGAGAAATACAGCAGGTGGTCTTCCTGGAGGAACATCCCGAGGCACTGGAGATTTGCAGAATCTCTATAGATTAGGTGGGCAGGTGGGGACTGG
ACTTCAGATGCCTGTTGACCCGTTATATGTTCAGTATTTGCAGAGGACAGCAGCTGAATATGCTACACAAATGGCTGCAGGCTTGAGTGATCCTTCCATGGCAAGGAATTACATGGGGGGACCTTATGTTGATATGCTTGAATTTCAAAAAGCGTATTTGGGGGCATTGTTTGCTCAACAGAAGTCACAGTATGGCCTAC
CCTATTTAGGAAAAGGTGGCACTCTTAATCCGGCATATAATTTTAACCCATCCTTTGGTCTCGCAATGCCATTTCCAGGTAGTCCTATTGCCAGTCCCGTGCTTCCGAGCTCTCCTGTAGCACCTGCAAGCCCACCTATTAGACCAAATGAACGGAACCATCGTTTCCCTACTGGTGCAAGAAGTTCATCTGGAGTAGTT
GTGGGTCCTTGGCATGCTGAAAATGGGGTGAATATGGAAGATGCATACGGTTCTTCTTTGTTGGAAGAATTCAAGAATAGTAAGACCCGATGTTTTGAACTGTCAGAGATCGTGGGGCATGTAGTCGAGTTCAGTTCTGATCAGTATGGGAGTCGATTTATTCAACAAAAACTAGAAACCGCAACAGTTGAGGAGAAAAA
CATGGTGTTTCAGGAGATATTTCCTCAAGCATTAACTCTTATGACAGATGTCTTCGGGAATTATGTTATACAGAAGTTCTTTGAGCATGGTACAGCAAGCCAAAGGAAAGACCTGGCAAACCAGCTTTCTGGCCACATTTTAGCTCTTAGTCTTCAAATGTATGGCTGCCGTGTAATCCAGAAGGCCATTGAGGTTGTTG
ATGCAGATCAACAAGCACAGATGGTTTTGGAGCTGGAAGGGCATGTCATGCGCTGTGTTCGTGATCAAAATGGGAACCATGTCGTTCAGAAGTGCATTGAATGTATTCCCCAGGATAAAATTCAGTTTATCATTTCATCTTTTTTTGGACAAGTTGTGGCCTTGTCCACCCATCCATATGGCTGTCGTGTCATACAGAGG
GTGCTGGAGCATTGCACTGATGCAAAGACAGAGAGCATTATGATGGAAGAGATCTTGCAGTCAGTCTGTACTCTTGCACAAGACCAGTATGGAAATTATGTTGTGCAGCATGTACTTGAGCATGGTAAACCACATGAACGCTCTGCTGTAATTAAGAAACTAGCAGGACAAATAGTTCAAATGAGCCAACAAAAGTTTGC
TTCAAATGTAGTAGAAAAATGTTTAGTGTTTGGAGGTCCTGCCGAGCGAGAATTTTTGATTAAAGAGATGCTTGGCTTAACTGATGAAAATGAGCCTCTACAGGCAATGATGAAAGATCAATTTGCCAATTATGTTGTACAGAAGGTTCTTGAGACTTGTGATGATCAACAGCGTGA


>TRINITY_DN121915_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GCCAGGTGCGGTGGGGATTCTAAACCGTTCGATAACAGAGCCAACGGCCCTGATTCCTTCGCTCTTCGAGCTTATCTTCGACGCGTGTGTCCACCTAATTTCTTTCTCGCACCTCTGCTACACTGCCTTTGCTCTGGAGATCAAAATCAATCAAAAGGATGATCGACAAATGCCTGGATTTCGCACGTTTTGGACCGTCT
GGACTGTGAATCGTATAGAAATTCCTTTAGGTGTTCTCAAATTCGTCGATTTGGTTGTTTTTTCGTCAAATTCGGCGTCCTTCAGGTAACGATCTGAGGTTTGAGGGAAATCTGTGCTTTTTTCGCCAAATTTTCTGATGTCTGAGGGGGTTTTATATACAAGAAAAGGCTCGGTGGAAGACAATCATTTTAGCAGAGAG
GCGGTGAAGGTGAAGTTCTTTTTGCCTGTGACTGGTGTGTTTTTGGGATAAAAGATCGGACCGGAAATGAACAAATGTTTTATGTCGCATAACAATCAAGAATTTTAGCACTTAAGAGGTTTCTGCTTGGCTATCAAATAAATATAATACGAGAAAGACTAGCTGTCCGAGTTGTACGACATACTTTAATGTCCGGAAAC
CCCAGTCTGTACAGACAATCGGAGCACGGGGTCGAGATTTAGAAACTTTGTTCTTGCAGCAGCAGAATCTTCTGTACAGTTATTGAAGAGCATCGTGAAATCTTAAATGATCTTCACCGAATTATTTATTTAGAGTTCTATATTTTGTGTACTTGTAATTATATTGGTCCATTTAACTGATCGATCGAAATGGTGACCGA
GAGTCCAGTAAAGATGTTTCCTGGTCTCGGAATGAGAGGATCATTAGGTGACGGCCTTGGAGGAAGTAGTCCAAGCATGCAAGACCCATCATACACTGACGAGTTAGGGAAAGAACTCGGCATGATGCTCCGAGATCAACGCCGTTATGAGATAAATGAAAGGGAAAGAGAATTGAACCTGTACCGAAGCGGGAGCGCAC
CGCCAACAGTGGAAGGATCGCTGGCTGCCGTTGGAGGCTTTTTCAATCGTAATGGCGTCTCTGGATCCACAGCTTCTGACAACGGCAGAGCTAATAATAATAATAATAATAATGTTAACAACATCAATATTAGTAATAATAATCACAGCTTCATGTCTGAAGAAGAGCTGAGGTCCGATCCAGCATACTTGTCCTACTAT
TATTCTCATGTAAACCTAAACCCTAGACTCCCACCTCCAATACTCTCCAAGGAAGACTGGCGTTTTGCGCAGAGATTGAGAGCGGGAGCATCGCCGCACGGCGGTATTGGTGACAGAAGAAAGTTGAAGTCATTCGATGATGGAAACAGCAAATCCCTATTTTCCCTGCAGCCGGTACTTCCCACTCACAAAGAAGAAAA
TGAACGCCTGGAGAAGTTAGCGCAGGGTAATCTGGCGCGGCAATCTTCTGCAGAGTGGTTTGAACGAGGAGCGGATGGATTGATTGGGTTATCATCAGTAGGAGGACTGGGAGCCAGGAGAAAAAGTCTCGCAGATATACTCCAGGAAGATCTTGGGAGGTCTTCTCCTGCTCCTAGACATCCTTCCAGACCGGCAAGCC
GCAATGCTTATGATGATGGAGTTGATCCTATTGGTGCTGCTGAGGGACAGGTTGTAAACATGCGTCATGAATTGGCTGCCGTTGAAAGCGTGCGATCTGGCTCAGCAATGCCAGGACTGGCAAGAGTACAAAGTCTTGGTGCCCAGTCTTCTCATGCTTTTGCAGCAGCTCTAGGTGCTTCTCTGTCAAGAAACCAAACT
CCTGATCCTCAGCACGTGATGACAAGGTCTCCTAGCCCCCGCCCTGTTGGAATGGGGGGGAGATTTGGTGCGTCTGATAAGCAAAACATTGTTTGCCCCAACTCATTTAATGGGGTTTCTTCAAATGCGAGTGAATCTGCAGAAATTGCTGCTGCTTTGTCAGGCATGAGCCTCTTATCTAATGGAGTAATGGAAGAAGA
AAAACATGTACAATCACAGATGCAACAAGAGATGTCAGAGCATCGAAATTACCTTTTCCATCTCCAAAGTGATCAGAACCAAAATCAGCAGCATGCACAACTTGGGAAGTCTCAAGTTGAATCTATACAGACACCCATTTTGACAAAATCAGTGCAACAGTCATGTGGTGTCCTTAATCAAAGCAACAGGGCTCTGACTG
ATTCTAACATGTCCTCTGTCACTTCTCAAGTGCAACGTGAAAATATTCGATCTCCACAACAATCTGGATCTCTTACTCGTGATTTCTCCTCAACAGCAGTGGAATCAGCATCGGCTGCTGATGGTATTTCTAATATTGAAGGAACAAGTGGACCCTACCACAATGCAAATGTTTCTAATATGTGTTCTCCAAATTATGGT
ATGAATGGGTATCCAATTAATTCAATGTTACCATCCATGATGTCTGGATACCTTGCTCCGGGTAGTCTACATCCTACATTTGATAATGGTGTTGCTGGCATGGACTCGAGAAATACAGCAGGTGGTCTTCCTGGAGGAACATCCCGAGGCACTGGAGATTTGCAGAATCTCTATAGATTAGGTGGGCAGGTGGGGACTGG
ACTTCAGATGCCTGTTGACCCGTTATATGTTCAGTATTTGCAGAGGACAGCAGCTGAATATGCTACACAAATGGCTGCAGGCTTGAGTGATCCTTCCATGGCAAGGAATTACATGGGGGGACCTTATGTTGATATGCTTGAATTTCAAAAAGCGTATTTGGGGGCATTGTTTGCTCAACAGAAGTCACAGTATGGCCTAC
CCTATTTAGGAAAAGGTGGCACTCTTAATCCGGCATATAATTTTAACCCATCCTTTGGTCTCGCAATGCCATTTCCAGGTAGTCCTATTGCCAGTCCCGTGCTTCCGAGCTCTCCTGTAGCACCTGCAAGCCCACCTATTAGACCAAATGAACGGAACCATCGTTTCCCTACTGGTGCAAGAAGTTCATCTGGAGTAGTT
GTGGGTCCTTGGCATGCTGAAAATGGGGTGAATATGGAAGATGCATACGGTTCTTCTTTGTTGGAAGAATTCAAGAATAGTAAGACCCGATGTTTTGAACTGTCAGAGATCGTGGGGCATGTAGTCGAGTTCAGTTCTGATCAGTATGGGAGTCGATTTATTCAACAAAAACTAGAAACCGCAACAGTTGAGGAGAAAAA
CATGGTGTTTCAGGAGATATTTCCTCAAGCATTAACTCTTATGACAGATGTCTTTGGGAATTATGTTATACAGAAGgtatatgtaatttgcctgtaaattaagtcctacaaagcttactctatttttgtctctatattaattttgtcttgtatgtaactttataggaatcaatttataatgaccgtaacatgattgtttg
tgctctcatagTTCTTTGAGCATGGTACAGCAAGCCAAAGGAAAGACCTGGCAAACCAGCTTTCTGGCCACATTTTAGCTCTTAGTCTTCAAATGTATGGCTGCCGTGTAATCCAGAAGGCCATTGAGGTTGTTGATGCAGATCAACAAGCACAGATGGTTTTGGAGCTGGAAGGGCATGTCATGCGCTGTGTTCGTGAT
CAAAATGGGAACCATGTCGTTCAGAAGTGCATTGAATGTATTCCCCAGGATAAAATTCAGTTTATCATTTCATCTTTTTTTGGACAAGTTGTGGCCTTGTCCACCCATCCATATGGCTGTCGTGTCATACAGAGGGTGCTGGAGCATTGCACTGATGCAAAGACAGAGAGCATTATGATGGAAGAGATCTTGCAGTCAGT
CTGTACTCTTGCACAAGACCAGTATGGAAATTATGTTGTGCAG



Intron 3 GTAAGCTGAG ... CTGTTTGAAG

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