sp|P92964|SRS31_ARATH ----> Serine/arginine-rich splicing factor RS31


Intron 1 GTAAGAAAAT ... TTTTTGGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A146.41112897
A250.3376177
A34577863
A449.1792589
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A648.621675158
A748.0731015287
A847.2331414281
A948.122908269
A1047.452275205



>TRINITY_DN37566_c0_g1_i7 from sample A7 / Example spliced isoform
GTGGCTCTCAAGCTTTTGGTTTTATATATTGAACAGCCTTGTGATCCGATTCTCACTGCTGGAGCTGTCCTGGCACCGGTCAGGTTTAAGTGTCAGGTAGCTATAAAGTTGGCAAGCATTGGTGACCAACAGCAAGAATTTCAAGATGCGGCCTGTGTTTTGTGGCAATTTTGAGTATGATACTCGCCAATCAGAGTTAG
AGCAAATGTTTTCCAGATATGGAACAGTGGAACGAGTGGACATGAAATCAGGTTTTGCTTTTGTGTACATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAGAATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTG
TTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCAC
AGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGGTGACCGTGGAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGT
TATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTGAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTGGAGTGTACACACATGA
G


>TRINITY_DN37566_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TGCTCTTGTATTCCTTTTAATATTTACATATTGTTTTATCATGTAATATATTCTTGAATTTGTCTGCAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTAT
CCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCA
TTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGgtaagaaaatactagaactatcagtgatgtagaaattgtttagttttgtctgcttgctgaatttcatgatcatgctgttaaggaggttgaggggattacaagatgtatcctggatttgacttttggacag
ctgactatctccttgaaagctgacctttggactcggcgtatattgtaacctttatagctgactatctccttgaaagctgacctttggactgagggtatattgtaacctttatttttttttctggattcatgcctcgataatgcagagcctaggattttctgccatgtttaaagggatactcaccaaatgacagtatactg
tttgctttttgtgctctacttagcctgaggttttttggaccttaatggacttcctatgtggtcatgggtaatagttcattcttagaacccttgctcaacctagaaacttctcaataatctgtcacagattagtttacttcaaaacttgtaaacatttctagctttagcattgattttgttaaattgcactcctggttatg
acttgaaattcaaagcatgggaagtgtccttattcacgtagatctgttctatttttgtactacctatatccacataataaatagaaagatatatcccaaaaagggtttgtaaggttctaataattatcctatctttcctcgagtttttgagtcttgagctatttgagcgcaagtaaatgttcctgatctatgcacctaaa
tatttgggtcatggaaagtccaaatcccttggtttccgagtagctctagtggtgctgccaatatctcagaaattcaaatttatgattatatagaggctatgtttaatcgtttaatcatttgttgcagtttctttttggcttgacaagactaatgatctcatggcttctgctaaaaatatgtttttggcag
GGTGACCGTG
GAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTGAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACA
AAAGCCTTGGAGTGTACACACATGAGGTATGGGAATACGAATATGATATTCTTTTTTTGTTGACATACGTAGATGCGTAGAGAACATATTGGTTTTGGAATGTATGTAGACTTCCTCCTAGCTGCATCTCTTGATTGGAACTTTCAATTAGCACCGTTAATTGCATAGTCCACTTGGATAATTGTGAACATATATTCATA
GGCAAGGTAAAATATTTGATTGAAGAGCTGTGATGCTTATTTTCGTAGCCATATTTTGTCTTTGAACTTTGGTGCC




Intron 2 GTAATGTTCT ... TTGTCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A35.713329
A427.59421615
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A633.59874413
A732.581788623
A832.86944615
A940.1621914713
A1037.1817410316



>TRINITY_DN94618_c0_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoform
CCCCTTTAGTTCAACATGCAAGGTCTGTTCCTGACATCCTTTTGTGCAGCATATCTTTATAAGATGGCTTGCAGGTGTTGTTTTTCTGTATATCTGTAGAGGGCAAGCATTGTTTGGTGTTGTTCTGTTTATGATGATCAAATTAAGGAGTTACCCATTTTCTGACATTTCCACTGTATTGCAGGTTTTGCTTTTGTGTA
CATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAGAATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCAC
TTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATC
AGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGTAAGAAAATACTAGAACTATCAGTGATGTAGAAATTGTTTAGTTTTGTCTGCTTGCTGAATTTCATGATCATGCTGTTAAGGAGGTTGAGGGGATTACAAG
ATGTATCCTGGATTTGACTTTTGGACAGCTGACTATCTCCTTGAAAGCTGACCTTTGGACTCGGCGTATATTGTAACCTTTATAGCTGACTATCTCCTTGAAAGCTGACCTTTGGACTGAGGGTATATTGTAACCTTTATTTTTTTTTCTGGATTCATGCCTCGATAATGCAGAGCCTAGGATTTTCTGCCATGTTTAAA
GGGATACTCACCAAATGACAGTATACTGTTTGCTTTTTGTGCTCTACTTAGCCTGAGGTTTTTTGGACCTTAATGGACTTCCTATGTGGTCATGGGTAATAGTTCATTCTTAGAACCCTTGCTCAACCTAGAAACTTCTCAATAATCTGTCACAGATTAGTTTACTTCAAAACTTGTAAACATTTCTAGCTTTAGCATTG
ATTTTGTTAAATTGCACTCCTGGTTATGACTTGAAATTCAAAGCATGGGAAGTGTCCTTATTCACGTAGATCTGTTCTATTTTTGTACTACCTATATCCACATAATAAATAGAAAG


>TRINITY_DN94618_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:
CCCCTTTAGTTCAACATGCAAGGTCTGTTCCTGACATCCTTTTGTGCAGCATATCTTTATAAGATGGCTTGCAGGTGTTGTTTTTCTGTATATCTGTAGAGGGCAAGCATTGTTTGGTGTTGTTCTGTTTATGATGATCAAATTAAGGAGTTACCCATTTTCTGACATTTCCACTGTATTGCAGGTTTTGCTTTTGTGTA
CATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAGAATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGgtaatgttctagtttgctcttgtattccttttaatatttacatattgttttatcatgtaatatattcttgaatttgtctgcagAGGTGGCTCATCAATAATTT
TTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAA
ATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGGTGACCGTGGAGTTAGAC
ACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTGAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTG
GAGTGTACACACATGAGCAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATACGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTTATGATCGATCCGTCAGTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAG
GCAGGCAAGAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAGATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGCCGCTCACCAGTCAGACGGCCAAGGACTGGAAGGATATATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAAT
ATGGAATAAACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTAAAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTTTGCAGCGGAACCTGATTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGG
AATTTATTCCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGATTTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGTAAGAGACAGCACATCGAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGT
TTAATTATGGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAATTGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGAAGATCAGTTGAGCAGGTGGG




Intron 3 GTAATAAAAA ... TTTGCGACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A116.4418348.736
A212.2915737.822
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A614.89766.1200.8134
A716.311165.1318227
A815.441309.1305.3239
A915.141216.1308.8217
A1015.11882259.3157



>TRINITY_DN36852_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform
GCCTTGGAGTGTACACACATGAGGTATGGGAATACGAATATGATATTCTTTTTTTGTTGACATACGTAGATGCGTAGAGAACATATTGGTTTTGGAATGTATGTAGACTTCCTCCTAGCTGCATCTCTTGATTGGAACTTTCAATTAGCACCGTTAATTGCATAGTCCACTTGGATAATTGTGAACATATATTCATAGGC
AAGGTAAAATATTTGATTGAAGAGCTGTGATGCTTATTTTCGTAGCCATATTTTGTCTTTGAACTTTGGTGCCTTGACCATTGTATTTGATTGAATATGTATCTGGTGTTAACTTCTATTGTGAATATTAAGTTCTAATGCCAGTCTTGATTTTAATTCCAAACTCTTGTTTAGTAACCAACTTATTCATGCATTATTGG
TTCAAGCAGCAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATACGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTTATGATCGATCCGTCAGTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAGGCAGGCAA
GAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAGATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGCCGCTCACCAGTCAGACGGCCAAGGACTGGAAGGATATATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAATATGGAATA
AACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTAAAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTTTGCAGCGGAACCTGATTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGGAATTTATT
CCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGATTTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGTAAGAGACAGCACATCGAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGTTTAATTAT
GGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAATTGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGAAGATCAGTTGAGCAGGTGGGATTTGAATTGTTTAATTTTTTGAAATTAGATGGTCCTTGACTGTAGTGGTTC
TGTTTGAACAAGATCAATCCCTCCGAGGTTCAACTTAGATAGCTTCAAGACGTGCAAGACACTACACAATTCAACTTCTATTGTCCTTGGTTTACCTATATGAGAAGAGTTTCAAATCACTGCT


>TRINITY_DN36852_c0_g1_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:
AGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTT
AGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGA
TTGGTAAGAAAATACTAGAACTATCAGTGATGTAGAAATTGTTTAGTTTTGTCTGCTTGCTGAATTTCATGATCATGCTGTTAAGGAGGTTGAGGGGATTACAAGATGTATCCTGGATTTGACTTTTGGACAGCTGACTATCTCCTTGAAAGCTGACCTTTGGACTCGGCGTATATTGTAACCTTTATAGCTGACTATCT
CCTTGAAAGCTGACCTTTGGACTGAGGGTATATTGTAACCTTTATTTTTTTTTCTGGATTCATGCCTCGATAATGCAGAGCCTAGGATTTTCTGCCATGTTTAAAGGGATACTCACCAAATGACAGTATACTGTTTGCTTTTTGTGCTCTACTTAGCCTGAGGTTTTTTGGACCTTAATGGACTTCCTATGTGGTCATGG
GTAATAGTTCATTCTTAGAACCCTTGCTCAACCTAGAAACTTCTCAATAATCTGTCACAGATTAGTTTACTTCAAAACTTGTAAACATTTCTAGCTTTAGCATTGATTTTGTTAAATTGCACTCCTGGTTATGACTTGAAATTCAAAGCATGGGAAGTGTCCTTATTCACGTAGATCTGTTCTATTTTTGTACTACCTAT
ATCCACATAATAAATAGAAAGATATATCCCAAAAAGGGTTTGTAAGGTTCTAATAATTATCCTATCTTTCCTCGAGTTTTTGAGTCTTGAGCTATTTGAGCGCAAGTAAATGTTCCTGATCTATGCACCTAAATATTTGGGTCATGGAAAGTCCAAATCCCTTGGTTTCCGAGTAGCTCTAGTGGTGCTGCCAATATCTC
AGAAATTCAAATTTATGATTATATAGAGGCTATGTTTAATCGTTTAATCATTTGTTGCAGTTTCTTTTTGGCTTGACAAGACTAATGATCTCATGGCTTCTGCTAAAAATATGTTTTTGGCAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCT
ATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGAC
ATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGGTGACCGTGGAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTG
TGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTGAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTGGAGTGTACACACATGAGCAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATA
CGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTTATGATCGATCCGTCAGTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAG
ATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGgtaataaaaatcttccatggatatattttaatagcaatttaatagctatcggaactaatgcctccaggattcactgttaatatggcaattctcatttatcattgcagcagtcatgtttaatcttagacccaggtgaattaata
tctctaaacatacattggttttctaatattttatatattcttttgcgacag
CCGCTCACCAGTCAGACGGCCAAGGACTGGAAGGATATATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAATATGGAATAAACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTA
AAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTTTGCAGCGGAACCTGATTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGGAATTTATTCCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGAT
TTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGTAAGAGACAGCACATCGAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGTTTAATTATGGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAAT
TGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGAAGATCAGTTGAGCAGGTGGGATTTGAATTGTTTAATTTTTTGAAATTAGATGGTCCTTGACTGTAGTGGTTCTGTTTGAACAAGATCAATCCCTCCGAGGTTCAACTTAGATAGCTTCAAGACGTGC
AAGACACTACACAATTCAACTTCTATTGTCCTTGGTTTACCTATATGAGAAGAGTTTCAAATCACTGCT




Intron 4 GTATGGGAAT ... GTTCAAGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A113.6424720.139
A213.82562141
A313.1633018.350
A414.9821010.337
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A813.84115851.4186
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A1013.61131451.1207



>TRINITY_DN113832_c0_g3_i7 from sample A1 / Example spliced isoform
CCACCTTTTATACATTCATGCATCAAAAGAAAATAGTATATATATATCTATTGGATTCTTGCTTTTGTGGAATATATAACGTGGCTCTCAAGCTTTTGGTTTTATATATTGAACAGCCTTGTGATCCGATTCTCACTGCTGGAGCTGTCCTGGCACCGGTCAGGTTTAAGTGTCAGGTAGCTATAAAGTTGGCAAGCATT
GGTGACCAACAGCAAGAATTTCAAGATGCGGCCTGTGTTTTGTGGCAATTTTGAGTATGATACTCGCCAATCAGAGTTAGAGCAAATGTTTTCCAGATATGGAACAGTGGAACGAGTGGACATGAAATCAGGTTTTGCTTTTGTGTACATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAG
AATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAA
TACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCAT
TCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGGTGACCGTGGAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGT
GAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTGGAGTGTACACACATGAGCAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATACGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTT
ATGATCGATCCGTCAGTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAGATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGCCGCTCACCAGTCAGACGGCCA
AGGACTGGAAGGATATATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAATATGGAATAAACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTAAAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTT
TGCAGCGGAACCTGATTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGGAATTTATTCCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGATTTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGT
AAGAGACAGCACATCGAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGTTTAATTATGGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAATTGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGA
A


>TRINITY_DN113832_c0_g3_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CCACCTTTTATACATTCATGCATCAAAAGAAAATAGTATATATATATCTATTGGATTCTTGCTTTTGTGGAATATATAACGTGGCTCTCAAGCTTTTGGTTTTATATATTGAACAGCCTTGTGATCCGATTCTCACTGCTGGAGCTGTCCTGGCACCGGTCAGGTTTAAGTGTCAGGTAGCTATAAAGTTGGCAAGCATT
GGTGACCAACAGCAAGAATTTCAAGATGCGGCCTGTGTTTTGTGGCAATTTTGAGTATGATACTCGCCAATCAGAGTTAGAGCAAATGTTTTCCAGATATGGAACAGTGGAACGAGTGGACATGAAATCAGGTTTTGCTTTTGTGTACATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAG
AATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGGGTGACCGTGGAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTG
AGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTGGAGTGTACACACATGAGgtatgggaatacgaatatgatattctttttttgttgacatacgtagatgcgtagagaacatattggttttggaatgtatgtagacttcctcctagctgcatctcttgattggaactttca
attagcaccgttaattgcatagtccacttggataattgtgaacatatattcataggcaaggtaaaatatttgattgaagagctgtgatgcttattttcgtagccatattttgtctttgaactttggtgccttgaccattgtatttgattgaatatgtatctggtgttaacttctattgtgaatattaagttctaatgcca
gtcttgattttaattccaaactcttgtttagtaaccaacttattcatgcattattggttcaagcag
CAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATACGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTTATGATCGATCCGTCA
GTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAGATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGCCGCTCACCAGTCAGACGGCCAAGGACTGGAAGGATA
TATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAATATGGAATAAACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTAAAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTTTGCAGCGGAACCTGA
TTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGGAATTTATTCCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGATTTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGTAAGAGACAGCACATC
GAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGTTTAATTATGGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAATTGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGAA