sp|P92964|SRS31_ARATH ----> Serine/arginine-rich splicing factor RS31
Intron 1 GTAAGAAAAT ... TTTTTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 46.41 | 112 | 8 | 97 |
| A2 | 50.33 | 76 | 1 | 77 |
| A3 | 45 | 77 | 8 | 63 |
| A4 | 49.17 | 92 | 5 | 89 |
| A5 | 51.16 | 21 | 3 | 22 |
| A6 | 48.62 | 167 | 5 | 158 |
| A7 | 48.07 | 310 | 15 | 287 |
| A8 | 47.23 | 314 | 14 | 281 |
| A9 | 48.12 | 290 | 8 | 269 |
| A10 | 47.45 | 227 | 5 | 205 |
>TRINITY_DN37566_c0_g1_i7 from sample A7 / Example spliced isoformGTGGCTCTCAAGCTTTTGGTTTTATATATTGAACAGCCTTGTGATCCGATTCTCACTGCTGGAGCTGTCCTGGCACCGGTCAGGTTTAAGTGTCAGGTAGCTATAAAGTTGGCAAGCATTGGTGACCAACAGCAAGAATTTCAAGATGCGGCCTGTGTTTTGTGGCAATTTTGAGTATGATACTCGCCAATCAGAGTTAG
AGCAAATGTTTTCCAGATATGGAACAGTGGAACGAGTGGACATGAAATCAGGTTTTGCTTTTGTGTACATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAGAATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTG
TTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCAC
AGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGGTGACCGTGGAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGT
TATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTGAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTGGAGTGTACACACATGA
G
>TRINITY_DN37566_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:TGCTCTTGTATTCCTTTTAATATTTACATATTGTTTTATCATGTAATATATTCTTGAATTTGTCTGCAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTAT
CCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCA
TTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGgtaagaaaatactagaactatcagtgatgtagaaattgtttagttttgtctgcttgctgaatttcatgatcatgctgttaaggaggttgaggggattacaagatgtatcctggatttgacttttggacag
ctgactatctccttgaaagctgacctttggactcggcgtatattgtaacctttatagctgactatctccttgaaagctgacctttggactgagggtatattgtaacctttatttttttttctggattcatgcctcgataatgcagagcctaggattttctgccatgtttaaagggatactcaccaaatgacagtatactg
tttgctttttgtgctctacttagcctgaggttttttggaccttaatggacttcctatgtggtcatgggtaatagttcattcttagaacccttgctcaacctagaaacttctcaataatctgtcacagattagtttacttcaaaacttgtaaacatttctagctttagcattgattttgttaaattgcactcctggttatg
acttgaaattcaaagcatgggaagtgtccttattcacgtagatctgttctatttttgtactacctatatccacataataaatagaaagatatatcccaaaaagggtttgtaaggttctaataattatcctatctttcctcgagtttttgagtcttgagctatttgagcgcaagtaaatgttcctgatctatgcacctaaa
tatttgggtcatggaaagtccaaatcccttggtttccgagtagctctagtggtgctgccaatatctcagaaattcaaatttatgattatatagaggctatgtttaatcgtttaatcatttgttgcagtttctttttggcttgacaagactaatgatctcatggcttctgctaaaaatatgtttttggcagGGTGACCGTG
GAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTGAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACA
AAAGCCTTGGAGTGTACACACATGAGGTATGGGAATACGAATATGATATTCTTTTTTTGTTGACATACGTAGATGCGTAGAGAACATATTGGTTTTGGAATGTATGTAGACTTCCTCCTAGCTGCATCTCTTGATTGGAACTTTCAATTAGCACCGTTAATTGCATAGTCCACTTGGATAATTGTGAACATATATTCATA
GGCAAGGTAAAATATTTGATTGAAGAGCTGTGATGCTTATTTTCGTAGCCATATTTTGTCTTTGAACTTTGGTGCC
Intron 2 GTAATGTTCT ... TTGTCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.74 | 36 | 10 | 22 |
| A2 | 37.76 | 61 | 37 | 16 |
| A3 | 5.71 | 33 | 2 | 9 |
| A4 | 27.59 | 42 | 16 | 15 |
| A5 | 38.1 | 26 | 16 | 4 |
| A6 | 33.59 | 87 | 44 | 13 |
| A7 | 32.58 | 178 | 86 | 23 |
| A8 | 32.86 | 94 | 46 | 15 |
| A9 | 40.16 | 219 | 147 | 13 |
| A10 | 37.18 | 174 | 103 | 16 |
>TRINITY_DN94618_c0_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoformCCCCTTTAGTTCAACATGCAAGGTCTGTTCCTGACATCCTTTTGTGCAGCATATCTTTATAAGATGGCTTGCAGGTGTTGTTTTTCTGTATATCTGTAGAGGGCAAGCATTGTTTGGTGTTGTTCTGTTTATGATGATCAAATTAAGGAGTTACCCATTTTCTGACATTTCCACTGTATTGCAGGTTTTGCTTTTGTGTA
CATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAGAATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCAC
TTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATC
AGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGTAAGAAAATACTAGAACTATCAGTGATGTAGAAATTGTTTAGTTTTGTCTGCTTGCTGAATTTCATGATCATGCTGTTAAGGAGGTTGAGGGGATTACAAG
ATGTATCCTGGATTTGACTTTTGGACAGCTGACTATCTCCTTGAAAGCTGACCTTTGGACTCGGCGTATATTGTAACCTTTATAGCTGACTATCTCCTTGAAAGCTGACCTTTGGACTGAGGGTATATTGTAACCTTTATTTTTTTTTCTGGATTCATGCCTCGATAATGCAGAGCCTAGGATTTTCTGCCATGTTTAAA
GGGATACTCACCAAATGACAGTATACTGTTTGCTTTTTGTGCTCTACTTAGCCTGAGGTTTTTTGGACCTTAATGGACTTCCTATGTGGTCATGGGTAATAGTTCATTCTTAGAACCCTTGCTCAACCTAGAAACTTCTCAATAATCTGTCACAGATTAGTTTACTTCAAAACTTGTAAACATTTCTAGCTTTAGCATTG
ATTTTGTTAAATTGCACTCCTGGTTATGACTTGAAATTCAAAGCATGGGAAGTGTCCTTATTCACGTAGATCTGTTCTATTTTTGTACTACCTATATCCACATAATAAATAGAAAG
>TRINITY_DN94618_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:CCCCTTTAGTTCAACATGCAAGGTCTGTTCCTGACATCCTTTTGTGCAGCATATCTTTATAAGATGGCTTGCAGGTGTTGTTTTTCTGTATATCTGTAGAGGGCAAGCATTGTTTGGTGTTGTTCTGTTTATGATGATCAAATTAAGGAGTTACCCATTTTCTGACATTTCCACTGTATTGCAGGTTTTGCTTTTGTGTA
CATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAGAATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGgtaatgttctagtttgctcttgtattccttttaatatttacatattgttttatcatgtaatatattcttgaatttgtctgcagAGGTGGCTCATCAATAATTT
TTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAA
ATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGGTGACCGTGGAGTTAGAC
ACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTGAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTG
GAGTGTACACACATGAGCAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATACGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTTATGATCGATCCGTCAGTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAG
GCAGGCAAGAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAGATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGCCGCTCACCAGTCAGACGGCCAAGGACTGGAAGGATATATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAAT
ATGGAATAAACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTAAAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTTTGCAGCGGAACCTGATTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGG
AATTTATTCCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGATTTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGTAAGAGACAGCACATCGAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGT
TTAATTATGGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAATTGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGAAGATCAGTTGAGCAGGTGGG
Intron 3 GTAATAAAAA ... TTTGCGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.44 | 183 | 48.7 | 36 |
| A2 | 12.29 | 157 | 37.8 | 22 |
| A3 | 21.5 | 168 | 47.1 | 46 |
| A4 | 14.37 | 137 | 32.5 | 23 |
| A5 | 18.52 | 44 | 10.8 | 10 |
| A6 | 14.89 | 766.1 | 200.8 | 134 |
| A7 | 16.31 | 1165.1 | 318 | 227 |
| A8 | 15.44 | 1309.1 | 305.3 | 239 |
| A9 | 15.14 | 1216.1 | 308.8 | 217 |
| A10 | 15.11 | 882 | 259.3 | 157 |
>TRINITY_DN36852_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoformGCCTTGGAGTGTACACACATGAGGTATGGGAATACGAATATGATATTCTTTTTTTGTTGACATACGTAGATGCGTAGAGAACATATTGGTTTTGGAATGTATGTAGACTTCCTCCTAGCTGCATCTCTTGATTGGAACTTTCAATTAGCACCGTTAATTGCATAGTCCACTTGGATAATTGTGAACATATATTCATAGGC
AAGGTAAAATATTTGATTGAAGAGCTGTGATGCTTATTTTCGTAGCCATATTTTGTCTTTGAACTTTGGTGCCTTGACCATTGTATTTGATTGAATATGTATCTGGTGTTAACTTCTATTGTGAATATTAAGTTCTAATGCCAGTCTTGATTTTAATTCCAAACTCTTGTTTAGTAACCAACTTATTCATGCATTATTGG
TTCAAGCAGCAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATACGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTTATGATCGATCCGTCAGTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAGGCAGGCAA
GAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAGATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGCCGCTCACCAGTCAGACGGCCAAGGACTGGAAGGATATATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAATATGGAATA
AACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTAAAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTTTGCAGCGGAACCTGATTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGGAATTTATT
CCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGATTTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGTAAGAGACAGCACATCGAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGTTTAATTAT
GGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAATTGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGAAGATCAGTTGAGCAGGTGGGATTTGAATTGTTTAATTTTTTGAAATTAGATGGTCCTTGACTGTAGTGGTTC
TGTTTGAACAAGATCAATCCCTCCGAGGTTCAACTTAGATAGCTTCAAGACGTGCAAGACACTACACAATTCAACTTCTATTGTCCTTGGTTTACCTATATGAGAAGAGTTTCAAATCACTGCT
>TRINITY_DN36852_c0_g1_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:AGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTT
AGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGA
TTGGTAAGAAAATACTAGAACTATCAGTGATGTAGAAATTGTTTAGTTTTGTCTGCTTGCTGAATTTCATGATCATGCTGTTAAGGAGGTTGAGGGGATTACAAGATGTATCCTGGATTTGACTTTTGGACAGCTGACTATCTCCTTGAAAGCTGACCTTTGGACTCGGCGTATATTGTAACCTTTATAGCTGACTATCT
CCTTGAAAGCTGACCTTTGGACTGAGGGTATATTGTAACCTTTATTTTTTTTTCTGGATTCATGCCTCGATAATGCAGAGCCTAGGATTTTCTGCCATGTTTAAAGGGATACTCACCAAATGACAGTATACTGTTTGCTTTTTGTGCTCTACTTAGCCTGAGGTTTTTTGGACCTTAATGGACTTCCTATGTGGTCATGG
GTAATAGTTCATTCTTAGAACCCTTGCTCAACCTAGAAACTTCTCAATAATCTGTCACAGATTAGTTTACTTCAAAACTTGTAAACATTTCTAGCTTTAGCATTGATTTTGTTAAATTGCACTCCTGGTTATGACTTGAAATTCAAAGCATGGGAAGTGTCCTTATTCACGTAGATCTGTTCTATTTTTGTACTACCTAT
ATCCACATAATAAATAGAAAGATATATCCCAAAAAGGGTTTGTAAGGTTCTAATAATTATCCTATCTTTCCTCGAGTTTTTGAGTCTTGAGCTATTTGAGCGCAAGTAAATGTTCCTGATCTATGCACCTAAATATTTGGGTCATGGAAAGTCCAAATCCCTTGGTTTCCGAGTAGCTCTAGTGGTGCTGCCAATATCTC
AGAAATTCAAATTTATGATTATATAGAGGCTATGTTTAATCGTTTAATCATTTGTTGCAGTTTCTTTTTGGCTTGACAAGACTAATGATCTCATGGCTTCTGCTAAAAATATGTTTTTGGCAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCT
ATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAATACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGAC
ATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCATTCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGGTGACCGTGGAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTG
TGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTGAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTGGAGTGTACACACATGAGCAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATA
CGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTTATGATCGATCCGTCAGTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAG
ATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGgtaataaaaatcttccatggatatattttaatagcaatttaatagctatcggaactaatgcctccaggattcactgttaatatggcaattctcatttatcattgcagcagtcatgtttaatcttagacccaggtgaattaata
tctctaaacatacattggttttctaatattttatatattcttttgcgacagCCGCTCACCAGTCAGACGGCCAAGGACTGGAAGGATATATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAATATGGAATAAACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTA
AAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTTTGCAGCGGAACCTGATTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGGAATTTATTCCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGAT
TTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGTAAGAGACAGCACATCGAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGTTTAATTATGGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAAT
TGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGAAGATCAGTTGAGCAGGTGGGATTTGAATTGTTTAATTTTTTGAAATTAGATGGTCCTTGACTGTAGTGGTTCTGTTTGAACAAGATCAATCCCTCCGAGGTTCAACTTAGATAGCTTCAAGACGTGC
AAGACACTACACAATTCAACTTCTATTGTCCTTGGTTTACCTATATGAGAAGAGTTTCAAATCACTGCT
Intron 4 GTATGGGAAT ... GTTCAAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.64 | 247 | 20.1 | 39 |
| A2 | 13.8 | 256 | 21 | 41 |
| A3 | 13.16 | 330 | 18.3 | 50 |
| A4 | 14.98 | 210 | 10.3 | 37 |
| A5 | 10.83 | 107 | 4.7 | 13 |
| A6 | 14.18 | 890 | 44.6 | 147 |
| A7 | 13.98 | 1606 | 76.9 | 261 |
| A8 | 13.84 | 1158 | 51.4 | 186 |
| A9 | 12.2 | 1518 | 50.7 | 211 |
| A10 | 13.61 | 1314 | 51.1 | 207 |
>TRINITY_DN113832_c0_g3_i7 from sample A1 / Example spliced isoformCCACCTTTTATACATTCATGCATCAAAAGAAAATAGTATATATATATCTATTGGATTCTTGCTTTTGTGGAATATATAACGTGGCTCTCAAGCTTTTGGTTTTATATATTGAACAGCCTTGTGATCCGATTCTCACTGCTGGAGCTGTCCTGGCACCGGTCAGGTTTAAGTGTCAGGTAGCTATAAAGTTGGCAAGCATT
GGTGACCAACAGCAAGAATTTCAAGATGCGGCCTGTGTTTTGTGGCAATTTTGAGTATGATACTCGCCAATCAGAGTTAGAGCAAATGTTTTCCAGATATGGAACAGTGGAACGAGTGGACATGAAATCAGGTTTTGCTTTTGTGTACATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAG
AATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGAGGTGGCTCATCAATAATTTTTTGGGAGAATCACTGTTTTATGGATACACATCATGTTATCATACTATACAATACCTATACTAGATGAACTAAGTGGTTGCACTTCCTTGTAGCTCACAGAACTTGTCTATCCTTACAAGCAGCTGCCTGCCTGAA
TACTACATTATAGCATAAATTGAATAATGAGCACATCGGTTTAGATTCAGAAAACAAAATCAAAATCACTTCTAGGCCACAGGATGCAGCTACCAACCTTCCCTGGGCTGACAGACCTGACATACAAAAACAGTGTACAGTGAGATCAGTTGGCATCATCCATTCAGCCAAATCATTGCAGTCAGAAGTTGTTCCATCAT
TCTCTGTTTTCAGCTCTTTCTTCATAAGATCCCTGAAATTGATTGGGTGACCGTGGAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGT
GAGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTGGAGTGTACACACATGAGCAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATACGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTT
ATGATCGATCCGTCAGTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAGATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGCCGCTCACCAGTCAGACGGCCA
AGGACTGGAAGGATATATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAATATGGAATAAACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTAAAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTT
TGCAGCGGAACCTGATTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGGAATTTATTCCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGATTTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGT
AAGAGACAGCACATCGAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGTTTAATTATGGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAATTGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGA
A
>TRINITY_DN113832_c0_g3_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCACCTTTTATACATTCATGCATCAAAAGAAAATAGTATATATATATCTATTGGATTCTTGCTTTTGTGGAATATATAACGTGGCTCTCAAGCTTTTGGTTTTATATATTGAACAGCCTTGTGATCCGATTCTCACTGCTGGAGCTGTCCTGGCACCGGTCAGGTTTAAGTGTCAGGTAGCTATAAAGTTGGCAAGCATT
GGTGACCAACAGCAAGAATTTCAAGATGCGGCCTGTGTTTTGTGGCAATTTTGAGTATGATACTCGCCAATCAGAGTTAGAGCAAATGTTTTCCAGATATGGAACAGTGGAACGAGTGGACATGAAATCAGGTTTTGCTTTTGTGTACATGGAAGATGAGCGCGATGCAAAAGATGCTATACGAGGTCTTGACAACACAG
AATTTGGCCGGCAAAGGCGTCGCCTTTCTGTGGAGTGGGCAAAGGGTGACCGTGGAGTTAGACACCAGGAGGAGGGTGTTATGCGACTTGCAAACACAAAACCTACAAAGACACTATTTGTGATCAATTTTGATCCCTTCATAACCAGGGTTAGAGACTTTGAGAGACATTTTGAGCCATATGGTAAATTATTACATGTG
AGGATCAGGAGGAACTTTGCATTTATCCAATACGAAACACAGGAAGAAGCAACAAAAGCCTTGGAGTGTACACACATGAGgtatgggaatacgaatatgatattctttttttgttgacatacgtagatgcgtagagaacatattggttttggaatgtatgtagacttcctcctagctgcatctcttgattggaactttca
attagcaccgttaattgcatagtccacttggataattgtgaacatatattcataggcaaggtaaaatatttgattgaagagctgtgatgcttattttcgtagccatattttgtctttgaactttggtgccttgaccattgtatttgattgaatatgtatctggtgttaacttctattgtgaatattaagttctaatgcca
gtcttgattttaattccaaactcttgtttagtaaccaacttattcatgcattattggttcaagcagCAATTTGCTGGACCGTGTTATTTCTGTGGAGTATGCTATACGTGATGATGATGACAGAAATGGTCAACGGGAAAGCCCAGGACGGAGAGGTGGCTATGGAAGGCGGGTAAGCCCAGCTTATGATCGATCCGTCA
GTCCTATTTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTAGTCCTGATTATGGCAGGCAGGCAAGAAGGCTTACTCCTGATTATGGAAGGGCTCCAAGTCCCTTTTACGAGAGATATCGTGGTCCTGTTAATGATAGAATTCACAGTCCTATTTTTGACAGGTATCGCAGCCGCTCACCAGTCAGACGGCCAAGGACTGGAAGGATA
TATTGAACATTGGGAATTTGGAATTCAGATAGCTGTAGAAGACTCAAATATGGAATAAACTGTTTATTGTTCTCATGAATTTTTGAGGAAAGATTATGCTGCTACTCTTTTAAAGAGGAATTTTATGGATTTGATACGGACTATATGTTGGTGTGGTAGACGAAAGTTTCCAGTAGACTTAAGTTTGCAGCGGAACCTGA
TTTTTAGGTTTATCACCTATCAGACAATGGCATACAATGTAATAGAAGGAATTTATTCCTAATGTCCTTTAGTTGGGATACTGTTGATGTAATATCTTTGTTGGTATCAGATTTCCGGAATCTTTATGAGCTGAGCACGACATATAAATTGCACAAAGCTTGATCTGGAATCACAGTCCGACTGTAAGAGACAGCACATC
GAGTTGCTGAATGATATGTGTGCAACTTATCATAAGATGTTGCTGTAGTTTAATTATGGGTTGAAATGAATTTGTAGGTTTGTTGCCTAGTGAGAGCAGGAAAAGTTTAAATTGTGAAACAGAATTAATCATCTGCACTGGCATAAAAACCATTTAATCACGATATTACATGACATGAGTTCAGAA