sp|O23617|TPS5_ARATH ----> Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 5
Intron 1 GTAAGCTTCG ... TCAATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 61.29 | 24 | 23 | 53 |
| A2 | 61.04 | 30 | 29 | 65 |
| A3 | 59.44 | 29 | 28 | 57 |
| A4 | 63.87 | 28 | 47 | 52 |
| A5 | 61.24 | 25 | 28 | 51 |
| A6 | 40 | 3 | 0 | 4 |
| A7 | 64.29 | 5 | 7 | 11 |
| A8 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A9 | 68.42 | 3 | 5 | 8 |
| A10 | 47.69 | 17 | 2 | 29 |
>TRINITY_DN41517_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoformGTGGATGGACGCCGCGAGTTCGAAACGCGCTGCGCATGGGTTTGTCGTTGCAGGCTTTATAGTGCCGAAGAACATATGATGCAAAGTTGCGTCTATTTTGAATTCGCACCACAATTGAGCTGCTGGGATTTGCTCAGTTTCGTGGAATTAAGGGTTACCAAGAAGGAAGAAGGTATCGGCTTTTCTTAAATCATCATTTG
CTGGCTTACAGATGGCAGGAATTCTTTTACTGTCATTGTTGTTATACTAAGTTTTAAAGAAAGAACGGGCCACAAAGCAGAAGGAATTATATAGAAAAGGTGCAGAGTTCTGTAAAATCGACTTAATCATCAAATCGGTTATTTGAACTGGCTTGTTTTATGAACCTAAGGAATCTAAAAGGGCCAGAAGAATTGACTCT
GTAGTGATAAACCTTGCAGATACCTTGATTTGAAAGGAAGTTTTTAGCTTTTTGATAGTTTGAAGGAAAAATGACGTCAAGATCTTATACAAATCTTATGGATCTGGCCACCGGGAATTTCCCGGCGTTCGGAAAGGTTGGGAAACGACTTCCTCGAATCATGACTGTCCCTGGGATCATCTCGGAGTTTGATGATGATA
ATTCAAACAGCGTCACATCGGATGTGCCGTCGTCCATCTGCCAGGATCGTATGATCATTGTGGCTAATCAGCTTCCGTTGCAAGCACACAGGAGGCCAGATAACAGAGGTTGGGCATTCAGCTGGGATGAAGATTCTTTGCTTTTGCAGATGAAGGATGGGTTACCAGAGGATATGGAACTCATTTATGTCGGTAGTCTA
AAGGTGGAAGTTGAGCCGAGTGAACAAGATGATGTTGCGCAGGTTCTCCTTGAAAATTTCAAGTGCGTGCCAGCGTTTCTCCCTCCTGAAATCTTGAGCAAATTTTATCATGGGTTTTGCAAGCAGCAACTCTGGCCATTATTCCATTACATGTTGCCTCTTTCCCCAGAGCATGGGGTTCGCTATGATCGATCGCTGTG
GCAGGCTTATGTGTCTGCAAACAAAATTTTTGCAGACAAGGTCATGGAAGTGATCAGCCCAGAAGATGACTATGTCTGGGTCCATGATTACCATCTCATGGTGCTGCCCACTTTCCTCAGGAAGCGATTTCCCAGGATCAAGCTTGGTTTCTTTCTACACAGTCCCTTCCCTTCATCTGAAATTTACCGAACACTGCCAG
TCAGGGACGAGATTCTCAGAGCTCTTCTTAATTCAGATTTGATAGGTTTCCATACCTTTGATTATGCGAGGCATTTCCTTTCCTGCTGCAGCAGGATGTTGGGTCTCGAATATGAGTCTAAGAGAGGATATATTGGGTTGGATTATTATGGCCGTACTGTGGGTATCAAGATTCTACCAGTGGGAATACACATGGGTCAA
CTAGAATCTGTGTTGAATCTTGCTGATACAGAGTGGAGGGTTAGGGAGCTGAGGGACCAGTTCAAGGGAAAGAAGCTGCTGCTGGGTGTTGACGACATGGATATTTTTAAAGGTATCAGCTTGAAAATTTTAGCCATGGAGCAGCTACTTAAGATCCATCCTGAGTGGAGAGGCAAGGTAGTTTTGGTGCAGATTGCTAA
TCCTGCGAGGAGCAGGGGTAAAGATGTGGAAGATGTGCAAGCTGAGACATATTCTGCAGCCAAAAGAATCAACGAGACCTTTGGGTGCCCGGGCTATGAGCCTGTTGTATTGATAGACAGGTCTGTTCCATTCTATGAAAGAATTGCATTCTACACCATTGCAGAATGTGTTGTGGTCACTGCAGTTAGGGACGGAATGA
ATCTCACGCCCTATGAATACATTGTTTCTAGGCAGGGGAGCGCCAAACTAGATGAAACATTAGGATTGAGTCCTAATTCTCTGAAAAAGAGTATGCTGGTGGTGTCCGAGTTTATTGGGTGCTCCCCATCTCTAAGTGGTGCTATTAGGGTAAATCCTTGGAACATTGATGCCGTAGCTGAGGCTATGAACACAGCCATT
GCCATGCCTGAGTCTGAAGCTCAACTGAGACATGAAAAACATTACAGGTATGTTAGCACCCATGATGTGGGATACTGGGCACACAGTTTCACACATGATCTCGAGAGATCGTGTAGGGATCACATTCGTAGGAGGTGCTATGGCATTGGCTTTGGGTTTGGCTTCAGGGTAGTAGCACTTGATCCAAACTTCAGTAAACT
TTCGATTGATCACATTGTTTCTGCATATAAGAGGACCAAGTGTAGAGCAATATTATTGGACTATGATGGTACAATGATGCCCCAGACTTCTATTAACAGAACACCTGGGCCTGACGTTATTTCTGTTTTGAATAGCTTGTGCAATGATCCCCGAAACATTGTTTTTATTGTTAGTGGGAGGGGAAGGCAAACTCTGAGCC
AGTGGTTCTCTTCATGCGAAATGTTGGGGATTGCAGCAGAGCATGGCTATTTTATAAGGTGGACTCGAGATGCAGAATGGGAAACTTGTACGCAGGGTGCAGACTTTGGCTGGCAACAAATTGCAGAGCCTGTAATGAAATTGTATACAGAGACTACTGATGGCTCTACAATAGAAACAAAAGAGAGCGCTTTGGTTTGG
CATCATCAAGATGCAGACCCAGATTTTGGTTCTTGTCAGGCGAAGGAACTTTTAGATCACCTTGAGAGTGTGCTTGCAAACGAGCCTGTGGTTGTCAAAAGTGGTCAACATATTGTAGAAGTCAAGCCTCAGGGCATAAGCAAAGGTCTAGTAGCAGAGCAACTTCTTTCAACAATGGTGCAGAGAGGGAAACGGCCAGA
CTTTGTCTTGTGCATTGGAGATGACAGGTCAGATGAAGACATGTTTGAGGGTATCACACGTGCTATGACAGGACCTACACTTTCTCCGATAGCAGAAGTATTTGCATGCACAGTTGGTCAGAAACCCAGTAAAGCAAAATACTATCTTGATGATACTGTGGAGGTTGTAAGAATGCTTCAGGGTCTGGCCATGGCTTCTG
ATCAGGCAGCAAATAATTTATCTGCTCAAGTTGCAGAGCTTACTTTGAGTACATAATTTGAAGATGCGTTTTTTCTTTGCCACCGTTGAAGCTACAAATAAATTGATACATTTGGTAAGAAAGATGTTCAAATGCAACAGCATGCAAACATGAAGCTGCAGCGAGGACAAAACTAACTATGGGTTACTGCTGTCCCCTTG
GAGAAAGAATTTCCGATACATGGCTGAAGGGTTGAAGTTGTGAATGCAATTTACTAATTTTGAGTTTAGGAATCTCTCAAGTAGGTGGATTCAACTGTTGGATGCGGTAGTGTGGGTGCTCTTGCACATGTTCCATGGATCATTCAGTTTTTCATGTAAGTAAATACATTGTAACCATGTAGAATATTATTTCATAATAT
TCTTCTGAAACCACTGCAGAATAATCACTGAATTCCATTGTGACACTGCCTGGTTCAAAAACATATTTGCATTGCTGCCACTAGAGTTCTAGGTTCAGAAGACCAGAATCTGAGGTGTAAAATGTGGTTTTAATTCAACCCAAGACCTGAGAGCTAAGCCTTGAGTTTAGGGTCATCTCTTCTGAGTCTATGCCCAGGTT
GGTAGAGGATTTTTTTTTAGTTGTTCTATTTAATCTTCAACTAAATTCTTCCAAGCATCACTTTCTGAGAAGAGAGCATTTCTTCAACATTGTGGCTCAGGCCATCTCATCATAAATCAAGCAGATAATTTTCTCGAGGGAAATAATAAATTGTATTCATTTGTGGCATATTATTGATATGAATTTGGAACTTGAGTGTG
TTATCATCGAGAGTGCTTATATATAACTGAGTTAGGTTCTTTATGTCAGCCCGATCCAGAAGCAAGTAGATGTTTGTCACCTACATTTACAAAATGTCACCTACAC
>TRINITY_DN41517_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:GTGGATGGACGCCGCGAGTTCGAAACGCGCTGCGCATGGGTTTGTCGTTGCAGGCTTTATAGTGCCGgtaagcttcgaatcttaaaaatttcaatctttgaacacagatcaatgcttcttggaagctacaggcatcggggttttgagattttgcggatttaaagcctgaaagtatagatcttttgtgttgaaattcgagg
ttttgcactgaaggcatatatacacaggtcgcgttgtttgtttgaaaagccgaaaggcgagaagtgtgagtttaaatcgagatagcagtgtcgattgcggcctagatttggcgggagctgtgtattgcattgctttgcttctcgaaactttgttttcatagctttataccccctagaatccgctagggtttcagtgggtt
ctttaaatctgttgttttgtgctaaattgagtctaagttgcaagggatccttggaagccgttctattcaaagtgcttgcctcgcaaaatttgctaggctttctgtggatttgtcagcggatttgtcaaatctggtgttttttgcaaagtagagagtttataggactaaaatctgagcctaagcggtgaagaatccccaaa
acttgttttgtttcaagtgcaaacctctcaaaactcgccaggctttcagtggattctttgaagatcgcgctttgtgtgaagtaagggattttttgagcctaagttgtctctatgttacgtgggatcctcagtaattgttatatttcaattgcagAAGAACATATGATGCAAAGTTGCGTCTATTTTGAATTCGCACCACA
ATTGAGCTGCTGGGATTTGCTCAGTTTCGTGGAATTAAGGGTTACCAAGAAGGAAGAAGGTATCGGCTTTTCTTAAATCATCATTTGCTGGCTTACAGATGGCAGGAATTCTTTTACTGTCATTGTTGTTATACTAAGTTTTAAAGAAAGAACGGGCCACAAAGCAGAAGGAATTATATAGAAAAGGTGCAGAGTTCTGT
AAAATCGACTTAATCATCAAATCGGTTATTTGAACTGGCTTGTTTTATGAACCTAAGGAATCTAAAAGGGCCAGAAGAATTGACTCTGTAGTGATAAACCTTGCAGATACCTTGATTTGAAAGGAAGTTTTTAGCTTTTTGATAGTTTGAAGGAAAAATGACGTCAAGATCTTATACAAATCTTATGGATCTGGCCACCG
GGAATTTCCCGGCGTTCGGAAAGGTTGGGAAACGACTTCCTCGAATCATGACTGTCCCTGGGATCATCTCGGAGTTTGATGATGATAATTCAAACAGCGTCACATCGGATGTGCCGTCGTCCATCTGCCAGGATCGTATGATCATTGTGGCTAATCAGCTTCCGTTGCAAGCACACAGGAGGCCAGATAACAGAGGTTGG
GCATTCAGCTGGGATGAAGATTCTTTGCTTTTGCAGATGAAGGATGGGTTACCAGAGGATATGGAACTCATTTATGTCGGTAGTCTAAAGGTGGAAGTTGAGCCGAGTGAACAAGATGATGTTGCGCAGGTTCTCCTTGAAAATTTCAAGTGCGTGCCAGCGTTTCTCCCTCCTGAAATCTTGAGCAAATTTTATCATGG
GTTTTGCAAGCAGCAACTCTGGCCATTATTCCATTACATGTTGCCTCTTTCCCCAGAGCATGGGGTTCGCTATGATCGATCGCTGTGGCAGGCTTATGTGTCTGCAAACAAAATTTTTGCAGACAAGGTCATGGAAGTGATCAGCCCAGAAGATGACTATGTCTGGGTCCATGATTACCATCTCATGGTGCTGCCCACTT
TCCTCAGGAAGCGATTTCCCAGGATCAAGCTTGGTTTCTTTCTACACAGTCCCTTCCCTTCATCTGAAATTTACCGAACACTGCCAGTCAGGGACGAGATTCTCAGAGCTCTTCTTAATTCAGATTTGATAGGTTTCCATACCTTTGATTATGCGAGGCATTTCCTTTCCTGCTGCAGCAGGATGTTGGGTCTCGAATAT
GAGTCTAAGAGAGGATATATTGGGTTGGATTATTATGGCCGTACTGTGGGTATCAAGATTCTACCAGTGGGAATACACATGGGTCAACTAGAATCTGTGTTGAATCTTGCTGATACAGAGTGGAGGGTTAGGGAGCTGAGGGACCAGTTCAAGGGAAAGAAGCTGCTGCTGGGTGTTGACGACATGGATATTTTTAAAGG
TATCAGCTTGAAAATTTTAGCCATGGAGCAGCTACTTAAGATCCATCCTGAGTGGAGAGGCAAGGTAGTTTTGGTGCAGATTGCTAATCCTGCGAGGAGCAGGGGTAAAGATGTGGAAGATGTGCAAGCTGAGACATATTCTGCAGCCAAAAGAATCAACGAGACCTTTGGGTGCCCGGGCTATGAGCCTGTTGTATTGA
TAGACAGGTCTGTTCCATTCTATGAAAGAATTGCATTCTACACCATTGCAGAATGTGTTGTGGTCACTGCAGTTAGGGACGGAATGAATCTCACGCCCTATGAATACATTGTTTCTAGGCAGGGGAGCGCCAAACTAGATGAAACATTAGGATTGAGTCCTAATTCTCTGAAAAAGAGTATGCTGGTGGTGTCCGAGTTT
ATTGGGTGCTCCCCATCTCTAAGTGGTGCTATTAGGGTAAATCCTTGGAACATTGATGCCGTAGCTGAGGCTATGAACACAGCCATTGCCATGCCTGAGTCTGAAGCTCAACTGAGACATGAAAAACATTACAGGTATGTTAGCACCCATGATGTGGGATACTGGGCACACAGTTTCACACATGATCTCGAGAGATCGTG
TAGGGATCACATTCGTAGGAGGTGCTATGGCATTGGCTTTGGGTTTGGCTTCAGGGTAGTAGCACTTGATCCAAACTTCAGTAAACTTTCGATTGATCACATTGTTTCTGCATATAAGAGGACCAAGTGTAGAGCAATATTATTGGACTATGATGGTACAATGATGCCCCAGACTTCTATTAACAGAACACCTGGGCCTG
ACGTTATTTCTGTTTTGAATAGCTTGTGCAATGATCCCCGAAACATTGTTTTTATTGTTAGTGGGAGGGGAAGGCAAACTCTGAGCCAGTGGTTCTCTTCATGCGAAATGTTGGGGATTGCAGCAGAGCATGGCTATTTTATAAGGTGGACTCGAGATGCAGAATGGGAAACTTGTACGCAGGGTGCAGACTTTGGCTGG
CAACAAATTGCAGAGCCTGTAATGAAATTGTATACAGAGACTACTGATGGCTCTACAATAGAAACAAAAGAGAGCGCTTTGGTTTGGCATCATCAAGATGCAGACCCAGATTTTGGTTCTTGTCAGGCGAAGGAACTTTTAGATCACCTTGAGAGTGTGCTTGCAAACGAGCCTGTGGTTGTCAAAAGTGGTCAACATAT
TGTAGAAGTCAAGCCTCAGGGCATAAGCAAAGGTCTAGTAGCAGAGCAACTTCTTTCAACAATGGTGCAGAGAGGGAAACGGCCAGACTTTGTCTTGTGCATTGGAGATGACAGGTCAGATGAAGACATGTTTGAGGGTATCACACGTGCTATGACAGGACCTACACTTTCTCCGATAGCAGAAGTATTTGCATGCACAG
TTGGTCAGAAACCCAGTAAAGCAAAATACTATCTTGATGATACTGTGGAGGTTGTAAGAATGCTTCAGGGTCTGGCCATGGCTTCTGATCAGGCAGCAAATAATTTATCTGCTCAAGTTGCAGAGCTTACTTTGAGTACATAATTTGAAGATGCGTTTTTTCTTTGCCACCGTTGAAGCTACAAATAAATTGATACATTT
GGTAAGAAAGATGTTCAAATGCAACAGCATGCAAACATGAAGCTGCAGCGAGGACAAAACTAACTATGGGTTACTGCTGTCCCCTTGGAGAAAGAATTTCCGATACATGGCTGAAGGGTTGAAGTTGTGAATGCAATTTACTAATTTTGAGTTTAGGAATCTCTCAAGTAGGTGGATTCAACTGTTGGATGCGGTAGTGT
GGGTGCTCTTGCACATGTTCCATGGATCATTCAGTTTTTCATGTAAGTAAATACATTGTAACCATGTAGAATATTATTTCATAATATTCTTCTGAAACCACTGCAGAATAATCACTGAATTCCATTGTGACACTGCCTGGTTCAAAAACATATTTGCATTGCTGCCACTAGAGTTCTAGGTTCAGAAGACCAGAATCTGA
GGTGTAAAATGTGGTTTTAATTCAACCCAAGACCTGAGAGCTAAGCCTTGAGTTTAGGGTCATCTCTTCTGAGTCTATGCCCAGGTTGGTAGAGGATTTTTTTTTAGTTGTTCTATTTAATCTTCAACTAAATTCTTCCAAGCATCACTTTCTGAGAAGAGAGCATTTCTTCAACATTGTGGCTCAGGCCATCTCATCAT
AAATCAAGCAGATAATTTTCTCGAGGGAAATAATAAATTGTATTCATTTGTGGCATATTATTGATATGAATTTGGAACTTGAGTGTGTTATCATCGAGAGTGCTTATATATAACTGAGTTAGGTTCTTTATGTCAGCCCGATCCAGAAGCAAGTAGATGTTTGTCACCTACATTTACAAAATGTCACCTACAC
Intron 2 GTAAAGTCCT ... TGTGCCTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 14.29 | 54 | 4 | 14 |
| A2 | 20 | 38 | 9 | 10 |
| A3 | 6.47 | 65 | 4 | 5 |
| A4 | 13.04 | 40 | 0 | 12 |
| A5 | 27.27 | 32 | 14 | 10 |
| A6 | 17.31 | 43 | 9 | 9 |
| A7 | 16.58 | 78 | 7 | 24 |
| A8 | 16.52 | 48 | 6 | 13 |
| A9 | 14.71 | 29 | 5 | 5 |
| A10 | 21.1 | 43 | 6 | 17 |
>TRINITY_DN40243_c1_g2_i3 from sample A9 / Example spliced isoformCCCGGGGACGGTATTTTATAAATGCTTAAACGCACGTCCTTAGGGTTTACAGGGACGAATTTAGAAGAGAATAGTAATAAGTCTTCTTCAGAAATCCGACGCTGCATTGGATTTTATCTCCATGGAATGATTTCATTCATCCGAGGACATCGAATCTGCAGCGGCCGGATTTCCATTTTAATGCTTCCCGGTTTGAATTC
GGCTCTGTAATTACAGCATGCCGGTGGATGTGGATGGACGCCGCGAGTTCGAAACGCGCTGCGCATGGGTTTGTCGTTGCAGGCTTTATAGTGCCGGTAAGCTTCGAATCTTAAAAATTTCAATCTTTGAACACAGATCAATGCTTCTTGGAAGCTACAGGCATCGGGGTTTTGAGATTTTGCGGATTTAAAGCCTGAAA
GTATAGATCTTTTGTGTTGAAATTCGAGGTTTTGCACTGAAGGCATATATACACAGGTCGCGTTGTTTGTTTGAAAAGCCGAAAGGCGAGAAGTGTGAGTTTAAATCGAGATAGCAGTGTCGATTGCGGCCTAGATTTGGCGGGAGCTGTGTATTGCATTGCTTTGCTTCTCGAAACTTTGTTTTCATAGCTTTATACCC
CCTAGAATCCGCTAGGGTTTCAGTGGGTTCTTTAAATCTGTTGTTTTGTGCTAAATTGAGTCTAAGTTGCAAGGGATCCTTGGAAGCCGTTCTATTCAAAGTGCTTGCCTCGCAAAATTTGCTAGGCTTTCTGTGGATTTGTCAGCGGATTTGTCAAATCTGGTGTTTTTTGCAAAGTAGAGAGTTTATAGGACTAAAAT
CTGAGCCTAAGCGGTGAAGAATCCCCAAAACTTGTTTTGTTTCAAGTGCAAACCTCTCAAAACTCGCCAGGCTTTCAGTGGATTCTTTGAAGATCGCGCTTTGTGTGAAGTAAGGGATTTTTTGAGCCTAAGTTGTCTCTATGTTACGTGGGATCCTCAGTAATTGTTATATTTCAATTGCAGAAGAACATATGATGCAA
AGTTGCGTCTATTTTGAATTCGCACCACAATTGAGCTGCTGGGATTTGCTCAGTTTCGTGGAATTAAGGGTTACCAAGAAGGAAGAAGGTATCGGCTTTTCTTAAATCATCATTTGCTGGCTTACAGATGGCAGGAATTCTTTTACTGTCATTGTTGTTATACTAAGTTTTAAAGAAAGAACGGGCCACAAAGCAGAAGG
AATTATATAGAAAAGGTGCAGAGTTCTGTAAAATCGACTTAATCATCAAATCGGTTATTTGAACTGGCTTGTTTTATGAACCTAAGGAATCTAAAAGGGCCAGAAGAATTGACTCTGTAGTGATAAACCTTGCAGATACCTTGATTTGAAAGGAAGTTTTTAGCTTTTTGATAGTTTGAAGGAAAAATGACGTCAAGATC
TTATACAAATCTTATGGATCTGGCCACCGGGAATTTCCCGGCGTTCGGAAAGGTTGGGAAACGACTTCCTCGAATCATGACTGTCCCTGGGATCATCTCGGAGTTTGATGATGATAATTCAAACAGCGTCACATCGGATGTGCCGTCGTCCATCTGCCAGGATCGTATGATCATTGTGGCTAATCAGCTTCCGTTGCAAG
CACACAGGAGGCCAGATAACAGAGGTTGGGCATTCAGCTGGGATGAAGATTCTTTGCTTTTGCAGATGAAGGATGGGTTACCAGAGGATATGGAACTCATTTATGTCGGTAGTCTAAAGGTGGAAGTTGAGCCGAGTGAACAAGATGATGTTGCGCAGGTTCTCCTTGAAAATTTCAAGTGCGTGCCAGCGTTTCTCCCT
CCTGAAATCTTGAGCAAATTTTATCATGGGTTTTGCAAGCAGCAACTCTGGCCATTATTCCATTACATGTTGCCTCTTTCCCCAGAGCATGGGGTTCGCTATGATCGATCGCTGTGGCAGGCTTATGTGTCTGCAAACAAAATTTTTGCAGACAAGGTCATGGAAGTGATCAGCCCAGAAGATGACTATGTCTGGGTCCA
TGATTACCATCTCATGGTGCTGCCCACTTTCCTCAGGAAGCGATTTCCCAGGATCAAGCTTGGTTTCTTTCTACACAGTCCCTTCCCTTCATCTGAAATTTACCGAACACTGCCAGTCAGGGACGAGATTCTCAGAGCTCTTCTTAATTCAGATTTGATAGGTTTCCATACCTTTGATTATGCGAGGCATTTCCTTTCCT
GCTGCAGCAGGATGTTGGGTCTCGAATATGAGTCTAAGAGAGGATATATTGGGTTGGATTATTATGGCCGTACTGTGGGTATCAAGATTCTACCAGTGGGAATACACATGGGTCAACTAGAATCTGTGTTGAATCTTGCTGATACAGAGTGGAGGGTTAGGGAGCTGAGGGACCAGTTCAAGGGAAAGAAGCTGCTGCTG
GGTGTTGACGACATGGATATTTTTAAAGGTATCAGCTTGAAAATTTTAGCCATGGAGCAGCTACTTAAGATCCATCCTGAGTGGAGAGGCAAGGTAGTTTTGGTGCAGATTGCTAATCCTGCGAGGAGCAGGGGTAAAGATGTGGAAGATGTGCAAGCTGAGACATATTCTGCAGCCAAAAGAATCAACGAGACCTTTGG
GTGCCCGGGCTATGAGCCTGTTGTATTGATAGACAGGTCTGTTCCATTCTATGAAAGAATTGCATTCTACACCATTGCAGAATGTGTTGTGGTCACTGCAGTTAGGGACGGAATGAATCTCACGCCCTATGAATACATTGTTTCTAGGCAGGGGAGCGCCAAACTAGATGAAACATTAGGATTGAGTCCTAATTCTCTGA
AAAAGAGTATGCTGGTGGTGTCCGAGTTTATTGGGTGCTCCCCATCTCTAAGTGGTGCTATTAGGGTAAATCCTTGGAACATTGATGCCGTAGCTGAGGCTATGAACACAGCCATTGCCATGCCTGAGTCTGAAGCTCAACTGAGACATGAAAAACATTACAGGTATGTTAGCACCCATGATGTGGGATACTGGGCACAC
AGTTTCACACATGATCTCGAGAGATCGTGTAGGGATCACATTCGTAGGAGGTGCTATGGCATTGGCTTTGGGTTTGGCTTCAGGGTAGTAGCACTTGATCCAAACTTCAGTAAACTTTCGATTGATCACATTGTTTCTGCATATAAGAGGACCAAGTGTAGAGCAATATTATTGGACTATGATGGTACAATGATGCCCCA
GACTTCTATTAACAGAACACCTGGGCCTGACGTTATTTCTGTTTTGAATAGCTTGTGCAATGATCCCCGAAACATTGTTTTTATTGTTAGTGGGAGGGGAAGGCAAACTCTGAGCCAGTGGTTCTCTTCATGCGAAATGTTGGGGATTGCAGCAGAGCATGGCTATTTTATAAGGTGGACTCGAGATGCAGAATGGGAAA
CTTGTACGCAGGGTGCAGACTTTGGCTGGCAACAAATTGCAGAGCCTGTAATGAAATTGTATACAGAGACTACTGATGGCTCTACAATAGAAACAAAAGAGAGCGCTTTGGTTTGGCATCATCAAGATGCAGACCCAGATTTTGGTTCTTGTCAGGCGAAGGAACTTTTAGATCACCTTGAGAGTGTGCTTGCAAACGAG
CCTGTGGTTGTCAAAAGTGGTCAACATATTGTAGAAGTCAAGCCTCAGGGCATAAGCAAAGGTCTAGTAGCAGAGCAACTTCTTTCAACAATGGTGCAGAGAGGGAAACGGCCAGACTTTGTCTTGTGCATTGGAGATGACAGGTCAGATGAAGACATGTTTGAGGGTATCACACGTGCTATGACAGGACCTACACTTTC
TCCGATAGCAGAAGTATTTGCATGCACAGTTGGTCAGAAACCCAGTAAAGCAAAATACTATCTTGATGATACTGTGGAGGTTGTAAGAATGCTTCAGGGTCTGGCCATGGCTTCTGATCAGGCAGCAAATAATTTATCTGCTCAAGTTGCAGAGCTTACTTTGAGTACATAATTTGAAGATGCGTTTTTTCTTTGCCACC
GTTGAAGCTACAAATAAATTGATACATTTGGTAAGAAAGATGTTCAAATGCAACAGCATGCAAACATGAAGCTGCAGCGAGGACAAAACTAACTATGGGTTACTGCTGTCCCCTTGGAGAAAGAATTTCCGATACATGGCTGAAGGGTTGAAGTTGTGAATGCAATTTACTAATTTTGAGTTTAGGAATCTCTCAAGTAG
GTGGATTCAACTGTTGGATGCGGTAGTGTGGGTGCTCTTGCACATGTTCCATGGATCATTCAGTTTTTCATGTAAGTAAATACATTGTAACCATGTAGAATATTATTTCATAATATTCTTCTGAAACCACTGCAGAATAATCACTGAATTCCATTGTGACACTGCCTGGTTCAAAAACATATTTGCATTGCTGCCACTAG
AGTTCTAGGTTCAGAAGACCAGAATCTGAGGTGTAAAATGTGGTTTTAATTCAACCCAAGACCTGAGAGCTAAGCCTTGAGTTTAGGGTCATCTCTTCTGAGTCTATGCCCAGGTTGGTAGAGGATTTTTTTTTAGTTGTTCTATTTAATCTTCAACTAAATTCTTCCAAGCATCACTTTCTGAGAAGAGAGCATTTCTT
CAACATTGTGGCTCAGGCCATCTCATCATAAATCAAGCAGATAATTTTCTCGAGGGAAATAATAAATTGTATTCATTTGTGGCATATTATTGATATGAATTTGGAACTTGAGTGTGTTATCATCGAGAGTGCTTATATATAACTGAGTTAGGTTCTTTATGTCAGCCCGATCCAGAAGCAAGTAGATGTTTGTCACCTAC
ATTTACAAAATGTCACCTACACTACAAAATGTGATTGCGATTTTTGATC
>TRINITY_DN40243_c1_g2_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:CCCGGGGACGGTATTTTATAAATGCTTAAACGCACGTCCTTAGGGTTTACAGGGACGAATTTAGAAGAGAATAGTAATAAGTCTTCTTCAGAAATCCGACGCTGCATTGGATTTTATCTCCATGGAATGATTTCATTCATCCGAGGACATCGAATCTGCAGCGGCCGGATTTCCATTTTAATGCTTCCCGGTTTGAATTC
GGCTCTGTAATTACAGCATGCCGGTGGATGTGGATGGACGCCGCGAGTTCGAAACGCGCTGCGCATGGGTTTGTCGTTGCAGGCTTTATAGTGCCGGTAAGCTTCGAATCTTAAAAATTTCAATCTTTGAACACAGATCAATGCTTCTTGGAAGCTACAGGCATCGGGGTTTTGAGATTTTGCGGATTTAAAGCCTGAAA
GTATAGATCTTTTGTGTTGAAATTCGAGGTTTTGCACTGAAGGCATATATACACAGGTCGCGTTGTTTGTTTGAAAAGCCGAAAGGCGAGAAGTGTGAGTTTAAATCGAGATAGCAGTGTCGATTGCGGCCTAGATTTGGCGGGAGCTGTGTATTGCATTGCTTTGCTTCTCGAAACTTTGTTTTCATAGCTTTATACCC
CCTAGAATCCGCTAGGGTTTCAGTGGGTTCTTTAAATCTGTTGTTTTGTGCTAAATTGAGTCTAAGTTGCAAGGGATCCTTGGAAGCCGTTCTATTCAAAGTGCTTGCCTCGCAAAATTTGCTAGGCTTTCTGTGGATTTGTCAGCGGATTTGTCAAATCTGGTGTTTTTTGCAAAGTAGAGAGTTTATAGGACTAAAAT
CTGAGCCTAAGCGGTGAAGAATCCCCAAAACTTGTTTTGTTTCAAGTGCAAACCTCTCAAAACTCGCCAGGCTTTCAGTGGATTCTTTGAAGATCGCGCTTTGTGTGAAGTAAGGGATTTTTTGAGCCTAAGTTGTCTCTATGTTACGTGGGATCCTCAGTAATTGTTATATTTCAATTGCAGAAGAACATATGATGCAA
AGTTGCGTCTATTTTGAATTCGCACCACAATTGAGCTGCTGGGATTTGCTCAGTTTCGTGGAATTAAGGGTTACCAAGAAGGAAGAAGGTATCGGCTTTTCTTAAATCATCATTTGCTGGCTTACAGATGGCAGGAATTCTTTTACTGTCATTGTTGTTATACTAAGTTTTAAAGAAAGAACGGGCCACAAAGCAGAAGG
AATTATATAGAAAAGGTGCAGAGTTCTGTAAAATCGACTTAATCATCAAATCGGTTATTTGAACTGGCTTGTTTTATGAACCTAAGGAATCTAAAAGGGCCAGAAGAATTGACTCTGTAGTGATAAACCTTGCAGATACCTTGATTTGAAAGGAAGTTTTTAGCTTTTTGATAGTTTGAAGGAAAAATGACGTCAAGATC
TTATACAAATCTTATGGATCTGGCCACCGGGAATTTCCCGGCGTTCGGAAAGGTTGGGAAACGACTTCCTCGAATCATGACTGTCCCTGGGATCATCTCGGAGTTTGATGATGATAATTCAAACAGCGTCACATCGGATGTGCCGTCGTCCATCTGCCAGGATCGTATGATCATTGTGGCTAATCAGCTTCCGTTGCAAG
CACACAGGAGGCCAGATAACAGAGGTTGGGCATTCAGCTGGGATGAAGATTCTTTGCTTTTGCAGATGAAGGATGGGTTACCAGAGGATATGGAACTCATTTATGTCGGTAGTCTAAAGGTGGAAGTTGAGCCGAGTGAACAAGATGATGTTGCGCAGGTTCTCCTTGAAAATTTCAAGTGCGTGCCAGCGTTTCTCCCT
CCTGAAATCTTGAGCAAATTTTATCATGGGTTTTGCAAGCAGCAACTCTGGCCATTATTCCATTACATGTTGCCTCTTTCCCCAGAGCATGGGGTTCGCTATGATCGATCGCTGTGGCAGGCTTATGTGTCTGCAAACAAAATTTTTGCAGACAAGGTCATGGAAGTGATCAGCCCAGAAGATGACTATGTCTGGGTCCA
TGATTACCATCTCATGGTGCTGCCCACTTTCCTCAGGAAGCGATTTCCCAGGATCAAGCTTGGTTTCTTTCTACACAGTCCCTTCCCTTCATCTGAAATTTACCGAACACTGCCAGTCAGGGACGAGATTCTCAGAGCTCTTCTTAATTCAGATTTGATAGGTTTCCATACCTTTGATTATGCGAGGCATTTCCTTTCCT
GCTGCAGCAGGATGTTGGGTCTCGAATATGAGTCTAAGAGAGGATATATTGGGTTGGATTATTATGGCCGTACTGTGGGTATCAAGATTCTACCAGTGGGAATACACATGGGTCAACTAGAATCTGTGTTGAATCTTGCTGATACAGAGTGGAGGGTTAGGGAGCTGAGGGACCAGTTCAAGGGAAAGAAGCTGCTGCTG
GGTGTTGACGACATGGATATTTTTAAAGGTATCAGCTTGAAAATTTTAGCCATGGAGCAGCTACTTAAGATCCATCCTGAGTGGAGAGGCAAGGTAGTTTTGGTGCAGATTGCTAATCCTGCGAGGAGCAGGGGTAAAGATGTGGAAGATGTGCAAGCTGAGACATATTCTGCAGCCAAAAGAATCAACGAGACCTTTGG
GTGCCCGGGCTATGAGCCTGTTGTATTGATAGACAGGTCTGTTCCATTCTATGAAAGAATTGCATTCTACACCATTGCAGAATGTGTTGTGGTCACTGCAGTTAGGGACGGAATGAATCTCACGCCCTATGAATACATTGTTTCTAGGCAGGGGAGCGCCAAACTAGATGAAACATTAGGATTGAGTCCTAATTCTCTGA
AAAAGAGTATGCTGGTGGTGTCCGAGTTTATTGGGTGCTCCCCATCTCTAAGTGGTGCTATTAGGGTAAATCCTTGGAACATTGATGCCGTAGCTGAGGCTATGAACACAGCCATTGCCATGCCTGAGTCTGAAGCTCAACTGAGACATGAAAAACATTACAGGTATGTTAGCACCCATGATGTGGGATACTGGGCACAC
AGTTTCACACATGATCTCGAGAGATCGTGTAGGGATCACATTCGTAGGAGGTGCTATGGCATTGGCTTTGGGTTTGGCTTCAGGGTAGTAGCACTTGATCCAAACTTCAGTAAACTTTCGATTGATCACATTGTTTCTGCATATAAGAGGACCAAGTGTAGAGCAATATTATTGGACTATGATGGTACAATGATGCCCCA
GACTTCTATTAACAGAACACCTGGGCCTGACGTTATTTCTGTTTTGAATAGCTTGTGCAATGATCCCCGAAACATTGTTTTTATTGTTAGTGGGAGGGGAAGGCAAACTCTGAGCCAGTGGTTCTCTTCATGCGAAATGTTGGGGATTGCAGCAGAGCATGGCTATTTTATAAGgtaaagtccttactactacaaatgat
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