sp|O48651|SQE1_PANGI ----> Squalene monooxygenase SE1

Intron 1 GTATAGTTTC ... GCTGGGCAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	75.76	24	4	75
A2	82.43	13	2	61
A3	76.56	15	2	49
A4	72.97	20	2	54
A5	77.78	12	1	42
A6	78.93	62	4	232.3
A7	79.37	50	0	192.3
A8	83.21	23	3	114
A9	80.61	38	0	158
A10	76.1	49	2	156

>TRINITY_DN130173_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

AATGTTATGTATATAAATCTACATAGTCTTAGTTAATACATAATATAATAATAAGAGGAGAATCATAAATAAATAAATAAATAATACATATATTAGTAATAGTAAATAAAATAATAAATTATTATTATTAAACTAAAAGACATGCTTTTTAAAATGAAAAGGCACAAATAGACCTATTTAAAGGTCTCTTTGTACTTGCA
TTTGTTAGGTTGCCCATTGGGCAAATAGGAAAAATATTGGCTTAACACATAGCCAAACACATAATATCAAAACGGAACGTTTCTTGCAAGGATGGAAGACGCGTTCTTGTAATTGAGAGAGACCTGAGTGAACCTGATAGGATTGTAGGGGAACTTTTACAGCCAGGCGGATACTTGAAACTGATTGAGCTGGGACTAGA
AGATTGTGTTGAAGGAATTGATGCCCAGCGTATAATGGGGTATGCTTTATTCAAGGAAGGAAAAGACACCAAAGTGGCATATCCATTAGATAGCCACCATGTGGATGTAGCTGGAAGGAGTTTCCACAATGGGCGTTTCATCCAGCGCATGCGAGAAAAGGCTGCTTCACTTCCTACGGTTCGTCTGGAGCAAGGAACTG
TACTTTCTTTGATTGAAAAGGATGGGGTTGTGAAGGGTGTAAAGTACAAGTCTACAGCTGGCGAGGAACTTGAAACATTTGCTCCTCTTACTGTTGTTTGTGATGGATGCTTTTCAAATCTGAGGCGATCACTTTGCAATGCAAAGGTGGATGTGCCTTCATGTTTTGTAGGTCTTGTGCTGGAAAATTGCAACCTTCCA
CACCCTAATCATGGGCATGTTATATTAGCAGATCCCTCTCCTCTCCTATTCTATCCAATTAGCAGCACTGAAGTGCGCTGCTTAGTTGATGTACCTGGTAAAAAGGTTCCATCTGTGGGCAATGGAGACATGGCAAAATATTTGCAAACTGTGGTGGCTCCTCAGCTTCCAAAGCAGCTACAAGTACCCTTTTTAGCTGC
TGTTGAAAAGGGCAATATACGGACCATGCCAAACAAGAGTATGCCAGCCTCACCATTGCCTAGGCCTGGAGCTCTTCTTCTAGGGGATGCCTTCAATATGCGGCATCCATTAACTGGTGGTGGAATGACTGTTGCATTGTCTGACATTGTTGTTCTTGAGAGGCTTCTTAAACCTCTCCATAACCTTCATGATGCATCTT
CCCTTTGTGAATATTTGGAAGCCTTTTACACACTACGTAAGCCTGTTGCATCAACAATAAATACTTTGGCAGCTGCTTTGTATAAAGTCTTTTGTGCTTCACCTGATCAAGCGATGAAAGAGATGCGCCAAGCTTGTTTTGACTATTTAAGCTTAGGAGGCGTGTTTTCCAGTGGACCTGTGGCA

>TRINITY_DN130173_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AATCGTTTAGGTATTTCGGCGATAGGTATCACTCAAATCGTTTAGGTATTTCGGCGATCGGTATCACTGAGGTATCACTCAAATCGTTTAGGTATTTCGGCGCAAATGCTATTGGACATACAACCATTGATTTACTCTAGGCCTAAGAATAATAGAGGCTCTGATACCACTGTCACTGTCAGGTTTCTCATTGGGAAAGT
AGAAAAAATATTGGCTTATCACATAGCCAAACACATAATATCAAAACGGAACGTTTCTTGCAAGgtatagtttcattgtttttaattatttttttggaattttgacgatctggatcattttaaaatgagcaaaaatccataataatatagttacacgtgaaactacaattccaccgatttttataaccaagggaacaaat
caccagaaaaacggggcgatttgcatgacatttattaagtaaactttcacttggccaccgattagccacgcgattcatcctgtttttctgagtatgaaggccatacgttttttaagcgaggacactgtgccaacggtatattgtgttatatggttctaatattcaaagatttatggacagaaatgcatgagaggaagaga
atcgtagccatcgtggatctgtgaagtagcacattgagtaattgacgatcccgtctggaatggaacatcatacggtgatgattgcaatggccattgcctttgcttctgtattaatgttttattatacaataaacagcaggtggagttacagaaacaaggaaatgcggggaatgcagagcaagatttctaagaaatcagca
gagaataatggcaccaccaataccggagctgctgtaggaaggatcgatgttataattgtgggagcaggggtcgcgggttcagctctggctaacacgctgggcaagGATGGAAGACGCGTTCTTGTAATTGAGAGAGACCTGAGTGAACCTGATAGGATTGTAGGGGAACTTTTACAGCCAGGCGGATACTTGAAACTGAT
TGAGCTGGGACTAGAAGATTGTGTTGAAGGAATTGATGCCCAGCGTATAATGGGGTATGCTTTATTCAAGGAAGGAAAAGACACCAAAGTGGCATATCCATTAGATAGCCACCATGTGGATGTAGCTGGAAGGAGTTTCCACAATGGGCGTTTCATCCAGCGCATGCGAGAAAAGGCTGCTTCACTTCCTACGGTTCGTC
TGGAGCAAGGAACTGTACTTTCTTTGATTGAAAAGGATGGGGTTGTGAAGGGTGTAAAGTACAAGTCTACAGCTGGCGAGGAACTTGAAACATTTGCTCCTCTTACTGTTGTTTGTGATGGATGCTTTTCAAATCTGAGGCGATCACTTTGCAATGCAAAGGTGCTTATCCCTATTATTTGCCACAAAGATTATTTGCT

Intron 2 GTATAGTTTC ... GCTGGGCAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	75.76	24	4	75
A2	82.43	13	2	61
A3	76.56	15	2	49
A4	72.97	20	2	54
A5	76.36	13	0	42
A6	77.41	68	1	233
A7	79.18	51	0	194
A8	83.21	23	3	114
A9	80.2	39	0	158
A10	75	52	0	156

>TRINITY_DN111920_c0_g1_i6 from sample A3 / Example spliced isoform

GATACCACTGTCACTGTCAGGTTTCTCATTGGGAAAGTAGAAAAAATATTGGCTTAACACATAGCCAAACACATAATATCAAAACGGAACGTTTCTTGCAAGGATGGAAGACGCGTTCTTGTAATTGAGAGAGACCTGAGTGAACCTGATAGGATTGTAGGGGAACTTTTACAGCCAGGCGGATACTTGAAACTGATTGA
GCTGGGACTAGAAGATTGTGTTGAAGGAATTGATGCCCAGCGTATAATGGGGTATGCTTTATTCAAGGAAGGAAAAGACACCAAAGTGGCATATCCATTAGATAGCCACCATGTGGATGTAGCTGGAAGGAGTTTCCACAATGGGCGTTTCATCCAGCGCATGCGAGAAAAGGCTGCTTCACTTCCTACGTACACACAAT
ACTTTCTCTGTTTTGTTTACTATGAGAACACAGTTGCATTTTTTAAATATTTTATCAAAA

>TRINITY_DN111920_c0_g1_i9 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GATACCACTGTCACTGTCAGGTTTCTCATTGGGAAAGTAGAAAAAATATTGGCTTAACACATAGCCAAACACATAATATCAAAACGGAACGTTTCTTGCAAGgtatagtttcattgtttttaattatttttttggaattttgacgatctggatcattttaaaatgagcaaaaatccataataatatagttacacagtgaa
actacaatttcaccgatttttataacccagggaacaaatcacgagaaaaacggagcgatttgcatgacatttattaagtaaactttcacttgcgccaccgattagccacgcgattcatcctgtttttctgagtatgaaggccatacgttttttaagcaaggacactgtgccaacggtatattgtgttatatggttctaat
attcaaagatttatggacagaaatgcatgagaggaagagaatcgtagccatcgtggatatgtgaagtagcatattgagtaattgacgatcccgtttggaatggaacatcatacggtgatgattacaatggccattgcctttgcttctgtattaatgttttattatacaataaacagcaggtggagttacagaaacaagga
aatgcggggaatgcagagcaagatttctaagaaatcagcagagaataatggcaccaccaataccggagctgctgtaggagggaccgatgttataattgtgggagcaggggtcgcgggttcagctctggctaacacgctgggcaagGATGGAAGACGCGTTCTTGTAATTGAGAGAGACCTGAGTGAACCTGATAGGATTG
TAGGGGAACTTTTACAGCCAGGCGGATACTTGAAACTGATTGAGCTGGGACTAGAAGATTGTGTTGAAGGAATTGATGCCCAGCGTATAATGGGGTATGCTTTATTCAAGGAAGGAAAAGACACCAAAGTGGCATATCCATTAGATAGCCACCATGTGGATGTAGCTGGAAGGAGTTTCCACAATGGGCGTTTCATCCAG
CGCATGCGAGAAAAGGCTGCTTCACTTCCTACGGTTCGTCTGGAGCAAGGAACTGTACTTTCTTTGATTGAAAAGGATGGGGTTGTGAAGGGTGTAAAGTACAAGTCTACAGCTGGCGAGGAACTTGAAACATTTGCTCCTCTTACTGTTGTTTGTGATGGATGCTTTTCAAATCTGAGGCGATCACTTTGCAATGCAAA
GGTGGATGTGCCTTCATGTTTTGTAGGTCTTGTGCTGGAAAATTGCAACCTTCCACACCCTAATCATGGGCATGTTATATTAGCAGATCCCTCTCCTCTCCTATTCTATCCAATTAGCAGCACTGAAGTGCGCTGCTTAGTTGATGTACCTGGTAAAAAGGTTCCATCTGTGGGCAATGGAGACATGGCAAAATATTTGC
AAACTGTGGTGGCTCCTCAGCTTCCAAAGCAGCTACAAGTACCCTTTTTAGCTGCTGTTGAAAAGGGCAATATACGGACCATGCCAAACAAGAGTATGCCAGCCTCGCCATTGCCTAGGCCTGGAGCTCTTCTTCTAGGGGATGCCTTCAATATGCGGCATCCATTAACTGGTGGTGGAATGACTGTTGCATTGTCTGAC
ATTGTTGTTCTTGAGAGGCTTCTTAAACCTCTCCATAACCTTCATGATGCATCTTCCCTTTGTGAATATTTGGAAGCCTTTTACACACTACGTAAGCCTGTTGCATCAACAATAAATACTTTGGCAGGTGCTTTGTATAAAGTCTTTTGTGCTTCACCTGATCAAGCAATGAAAGAGATGCGCCAAGCTTGTTTTGACTA
TTTAAGCTTAGGAGGCGTGTTTTCCAGTGGACCTGTGGCATTGCTGTCTGGTCTGAATCCACGACCATTGAGTTTGGTTCTACATTTCTTTGCAGTGGCTGTATATGGTGTTGGTCGACTCTTGTATCCTTTCCCTTCGCCAAAACGATTTTGGCTTGGTGCTCATCTGATTGCAGGCGCTTCCAATATCATTCTTCCAA
TTATTCAGGCGGAAGGAGTCAGACAGATGTTCTTTCCTAACACTATCCCTGCATATTATAGAATGCCACCTGTGCATTCTATCAAGGGAGGGACTGGCAGTTAATGATTATCCGGAGAAAATTTGCCTTATTTGTTAGGGATTGATCGCTTTGTGTGATCCTTTGGAAGAAATCACAGTAAACTGTTTCTTCTTTTAACT
TCTAGTTAAAATGCATACCATTTATCAGCTTTCAGTTTGAACTACTAGGCATAGCATGCTATTTGGAAGACTTTAAAAGTTGGAAGCATTTGAATGTTGTATCCAAAATTAATTGGTTTGCTTGGCAAATTAATATAAGCTCTCCAAACTTTATTGCTTTATAGCTGAAAAA

Intron 3 GTAAGTATTT ... TCATACACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	10	126	2	14
A2	10.71	125	3	15
A3	10.67	134	2	16
A4	18.57	114	2	26
A5	18.02	91	1	20
A6	15.64	534	0	99
A7	14.29	390	0	65
A8	11.01	202	0	25
A9	15.41	313	0	57
A10	11.42	349	0	45

>TRINITY_DN103550_c0_g1_i8 from sample A4 / Example spliced isoform

ATTATCAATGGGGACGCCTCAGCAACAACAAGGATTGATAATGTGGTCTACGATGGAGCATCATACGCTGGTGATTACGGTAGCCATTGCCTTTGTTTCTGTCTTAATGTCCTATTATATAATTTTCAGCAGGTGGAAACACAGATCCGACGAATTACGGGGAATGCAAACCAAAAGTTTTGAGAAATTAGCAGACGACA
ATGGCATTGCCATCGAAGCTGCTGAAGGAGGGACGGATGTTATCATTGTGGGAGCAGGGGTCGCAGGTTCGGCTCTCGCTTACACACTTGGCAAGGATGGAAGACGTATACAAGTAATTGAGAGAGACCTGAGTGAGCCTGATAGGATTGTAGGGGAACTTTTACAGCCAGGTGGATACTTGAAACTGATTGAGCTGGGA
CTTCAAGATTGTGTTGAAGGAATTGATGCCCAGCGTATAATGGGGTATGCTTTATTCAAGGAAGGAAAAGATACCAAAGTGGCATATCCATTAGAAAACCACAATGCAGATGTAGCTGGAAGGAGTTTCCACAATGGGCGGTTCATCCAGCGCATGCGGGAAAAGGCTGCTTCACTACCTACGGTTCGTTTACAGCAAGG
AACTGTACTTTCTTTGATTGAAAAGGATGGGGTTGTGAAGGGTGTAAAGTACAAGTCTACAGCTGGCGAGGAACTTGAAACATTTGCTCCTCTTACTGTTGTTTGCGATGGGTGCTTTTCAAATCTGAGGCGCTCACTTTGCAATCCAAAGGTGGATGTGCCTTCATGTTTTGTAGGTCTTGTGCTGGAAGATTGCAAGC
TTCCACACCCTAATCATGGGCATGTTATATTAGCAGATCCCTCTCCTATTCTATTCTATCCGATTAGCAGCACTGAGGTGCGTTGCTTAGTTGATGTACCTGGTAAAAAAGTTCCATCTGTGGCCAGTGGAGACATGGCAAAATATTTGCAAACTGTGGTGGCTCCTCAGCTTCCAAAGCAGATACAAGGTCCATTTTTA
GTTGCTGTTGAGAAGGGAAATATACGCACAATGCCCAACAAGATTATGCCAGCCTCACCCTTGCCTAGGCCTGGAGCTCTTCTTTTAGGGGATGCCTTTAATATGCGGCATCCTTTAACTGGTGGTGGAATGACTGTTGCATTGGCAGACATTGCTGTTCTTGAGAGGCTTCTAAAACCTCTCCATAACCTTCACGATGC
ATCTTCCCTTTGTGAATATATGGAAGCCTTTTACACACTACGCAAGCCTGTTGCATCGACTATAAATACTTTGGCAGGTGCTCTGTATAAAGTTTTTTGTGCTTCACCTGATCAGGCAATGAAAGAGATGCGCCAAGCTTGTTTTGACTATTTAAGCTTAGGAGGTGTGTTTTCCAGTGGACCTGTGGCACTGTTGTCTG
GCCTGAATCCACGGCCATTGAGTTTGGTTCTACATTTCTTTGCAGTGGCTGTATATGGTGTTGGTCGGCTCCTGTATCCTTTCCCTTCACCAAAACGATTTTGGCTTGGCGCTCGCCTGATTTCTGGTGCCTCCAATATCATTTTGCCAATTATTAAGGCAGAAGGAATCAGACAGATGTTCTTTCCTAGTACTGTTCCT
GCATATTATAGAGCGCCGCCTGTGCAATCCATCAAGGGAGAGAGTGGCAATTAATGATTGTCAGTAGAAAAGTTTTTTTATTTGTCAGGGATTGATTTCTTCTTATGATTATTTTTAAAGAAATTGCAGTCATGTTGTTTCTAGTTCTACGTGCTAATTAAAATGGACACCATTTCTCAGTTTTCAATTTGAACTACCCG
TGTATTGCATGCTATTTGGATCACTTTGAAAATTGAAAGCATTTGAATGTTACATTGAAAATTAATTAATCTGTTTGACATAATAATGTAAGCTCTCCAAACTTCATTGTTTTATAGCTTATAACTTCAGTTCATTGAAGAACCAGTTTTCAAAACCTGTTCC

>TRINITY_DN103550_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:

CCTGATAGGATTGTAGGGGAACTTTTACAGCCAGGTGGATACTTGAAACTGATTGAGCTGGGACTTCAAGgtaagtattttggctgcatatttgatagtgtgtgattgctctaacattttagtttggcacgcagttcattatcttggcaagctgattcttatatcttttcttttaacttttgagtcaatttcaagtagat
tggtcaatttgtaaacaaggtgattgatcaagatcgcgtttaggtctgaaatttggtttgctatacagcttgtagttactgttttctgatgattagaagcttgtgaagctcatatttttgagctgtatttactaggaataagagggttttgattggttttttctatatactgttaacatacttatttctcatacacagAT
TGTGTTGAAGGAATTGATGCCCAGCGTATAATGGGGTATGCTTTATTCAAGGAAGGAAAAGATACCAAAGTGGCATATCCATTAGAAAACCACAATGCAGATGTAGCTGGAAGGAGTTTCCACAATGGGCGGTTCATCCAGCGCATGCGGGAAAAGGCTGCTTCACTACCTACGGTTCGTTTACAGCAAGGAACTGTACT
TTCTTTGATTGAAAAGGATGGGGTTGTGAAGGGTGTAAAGTACAAGTCTACAGCTGGCGAGGAACTTGAAACATTTGCTCCTCTTACTGTTGTTTGCGATGGGTGCTTTTCAAATCTGAGGCGCTCACTTTGCAATCCAAAGGTGGATGTGCCTTCATGTTTTGTAGGTCTTGTGCTGGAAGATTGCAAGCTTCCACACC
CTAATCATGGGCATGTTATATTAGCAGATCCCTCTCCTATTCTATTCTATCCGATTAGCAGCACTGAGGTGCGTTGCTTAGTTGATGTACCTGGTAAAAAAGTTCCATCTGTGGCCAGTGGAGACATGGCAAAATATTTGCAAACTGTGGTGGCTCCTCAGCTTCCAAAGCAGATACAAGGTCCATTTTTAGTTGCTGTT
GAGAAGGGAAATATACGCACAATGCCCAACAAGATTATGCCAGCCTCACCCTTGCCTAGGCCTGGAGCTCTTCTT

Intron 4 GTGATGATTG ... GGGAATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	63.48	21	41	32
A2	69.54	23	69	36
A3	63.24	25	36	50
A4	74.31	14	52	29
A5	76.12	8	33	18
A6	66.06	47	110	73
A7	66.2	43	110.5	58
A8	78.26	15	66	42
A9	73.84	31	102	73
A10	68.42	48	125	83

>TRINITY_DN44387_c0_g1_i7 from sample A9 / Example spliced isoform

AATCGTTTAGGTATTTCGGCGATAGGTATCACTCAAATCGTTTAGGTATTTCGGCGATAGGTATCACTCAAATCGTTTAGGTATTTCGGCGCAAATGCTATTGGACATACAACCATTGATTTACTCCAGGCCTACGAATAATAGACGCTCTGATACCACTGTCAGGTTTCCCACTGGGAAAGTAGGAAAAATATTGGCTT
AACACGGTCAAATACATAATATCAAGACGACGGAATTTTGATTTTCTGGATCATTTTAAAAAGAACTAAAATCCCTAGTAATATAGTTACACAGTGAAACTACAATTCCACCGATTTTTATAACCAAGGGAACAAATCACCAGAAAAACGGGGCGATTTGCATGACATTTATTAAGTAAACTTTCACTTGCCCCACCGAT
TAGCCACGCGATTCATCCTGTTTTTCTGAGTATGAAGGCCATACGTTTTTTAAGCGAGGACACTGTGCCAACGGTATATTGTGTTATATGGTTCTAATATTCAAAGATTTATGGACAGAAATGCATGAGAGGAAGAGAATCGTAGCCATCGTGGATGTGTGAAGTAGCATATTGAGTAATTGACGATCCCGTCTGGAATG
GAACATCATACGAGCAAGATTTCTAAGAAATCAGCAGAGAATAATGGCACCACCAATACCGGAGCTGCTGTAGGAGGGACCGATGTTATAATTGTGGGAGCAGGGGTCGCGGGTTCAGCTCTGGCTAACACGCTGGGCAAGGATGGAAGACGCGTTCTTGTAATTGAGAGAGACCTGAGTGAACCTGATAGGATTGTAGG
GGAACTTTTACAGCCAGGTGGATACTTGAAACTGATTGAGCTGGGACTAGAAGATTGTGTTGAAGGAATTGATGCCCAGCGTATAATGGGGTATGCTTTATTCAAGGAAGGAAAAGACACCAAAGTGGCATATCCATTAGATAGCCACCATGTGGATGTAGCTGGAAGGAGTTTCCACAATGGGCGTTTCATCCAGCGCA
TGCGAGAAAAGGCTGCTTCACTTCCTACGGTTCGTCTGGAGCAAGGAACTGTACTTTCTTTGATTGAAAAGGATGGGGTTGTGAAGGGTGTAAAGTACAAGTCTACAGCTGGCGAGGAACTTGAAACATTTGCTCCTCTTACTGTTGTTTGTGATGGATGCTTTTCAAATCTGAGGCGATCACTTTGCAATGCAAAGGTG
GATGTGCCTTCATGTTTTGTAGGTCTTGTGCTGGAAAATTGCAACCTTCCACACCCTAATCATGGGCATGTTATATTAGCAGATCCCTCTCCTCTCCTATTCTATCCAATTAGCAGCACTGAAGTGCGCTGCTTAGTTGATGTACCTGGTAAAAAGGTTCCATCTGTGGGCAATGGAGACATGGCAAAATATTTGCAAAC
TGTGGTGGCTCCTCAGCTTCCAAAGCAGCTACAAGTACCCTTTTTAGCTGCTGTTGAAAAGGGCAATATACGGACCATGCCAAACAAGAGTATGCCAGCCTCACCATTGCCTAGGCCTGGAGCTCTTCTTCTAGGGGATGCCTTCAATATGCGGCATCCATTAACTGGTGGTGGAATGACTGTTGCATTGTCTGACATTG
TTGTTCTTGAGAGGCTTCTTAAACCTCTCCATAACCTTCATGATGCATCTTCCCTTTGTGAATATTTGGAAGCCTTTTACACACTACGTAAGCCTGTTGCATCAACAATAAATACTTTGGCAGGTGCTTTGTATAAAGTCTTTTGTGCTTCACCTGATCAAGCGATGAAAGAGATGCGCCAAGCTTGTTTTGACTATTTA
AGCTTAGGAGGCGTGTTTTCCAGTGGACCTGTGGCATTGCTGTCTGGTCTGAATCCACGGCCATTGAGTTTGGTTCTACATTTCTTTGCAGTGGCTGTATATGGTGTTGGTCGACTCTTGTATCCTTTCCCTTCGCCAAAACGATTTTGGCTTGGTGCTCATCTGATTGCAGGCGCTTCCAATATCATTCTTCCAATTAT
TCAGGCGGAAGGAGTCAGACAGATGTTCTTTCCTAACACTATCCCTGCATATTATAGAATGCCACCTGTGCATTCTATCAAGGGAGGGACTGGCAGTTAATGATTATCCGGAGAAAATTTGCCTTATTTGTTAGGGATTGATCGCTTTGTGTGATCCTTTGGAAGAAATCACAGTAAACTGTTTCTTCTTTTAACTTCTA
GTTAAAATGCATACCATTTATCAGCTTTCAGTTTGAACTACTAGGCATAGCATGCTATTTGGAAGACTTTAAAAGTTGGAAGCATTTGAATGTTGTATCCAAAATTAATTGATTTGCTTGGCAAATTAATGTAAGCTCTCCAAACTTTATTGCTTTATAGCTGATAACTTTTTTTAAGTTCATTGAAGAACTAGCTTTCA
GAAAGGGTTGTACTTGTTTGCTTCTGGGGTTTTTATCATTTCAGGTTTTAAGCTGGTGTAGATTTGTTTCGCCCATTGTGGCAACAGACATATTTTTTCTGGTATGACTAAGACTTCTCTTCAACGGAAGAAGGAAAAACATGAAAGGATTATTTATCATGTTGACAGAGCCCTGTACATGCATGTTTCCAACTACACTT
TATGCATGAAGGCCATCTCACAGCATGTACCAGCAGAGAAAAGGCTATTACAGAACGATTGTGAAAAGCTAAAGTTAACCGAAGTTCTATCTGATAAATTTCGTAACTGTTGTAGCATAAACAGAGGTCATGGAAGTGACAAAATTCAGAAACATCCTTTGCAGACATTTTTATGTTGAGCTGCATTGCGTTTCTATTAA
TCAAAGGGAAATAGTTGCATGCATACAGCCCTAAATAGTTTTCCTCTGGTTTTGAAAATTTTTCTTTGGTACTCTTTTGTCAACTTCTTGCATAGCTGTAAAACAACATGGTCGCTTTACATGTTACCATGAGCCACATTGTTATTGTTATAGGTCTCACTATATGGCCAAATTATCACACTTGTGCAAGTTGGCATATA
AAATAGGGGCTTAAAGATAGTTTCATTTTTATGGTTAATTATCTTAGTTTCCAAGATAGGCCACTGCGCATTGTTTGTTTTAAAGAATAGATAATATTGAGGATATCATCTGGCCTCAAGATCGATAAATTTGAGGTTCTCTTAATATATGTTCCCGAGGATATCATATGGCCTTAAGATTGTTAACTTTGAGGTTATCA
TATAGTCTCAAAATCTTTATTTGTTG

>TRINITY_DN44387_c0_g1_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:

AATCGTTTAGGTATTTCGGCGATAGGTATCACTCAAATCGTTTAGGTATTTCGGCGATAGGTATCACTCAAATCGTTTAGGTATTTCGGCGCAAATGCTATTGGACATACAACCATTGATTTACTCCAGGCCTACGAATAATAGACGCTCTGATACCACTGTCAGGTTTCCCACTGGGAAAGTAGGAAAAATATTGGCTT
AACACGGTCAAATACATAATATCAAGACGACGGAATTTTGATTTTCTGGATCATTTTAAAAAGAACTAAAATCCCTAGTAATATAGTTACACAGTGAAACTACAATTCCACCGATTTTTATAACCAAGGGAACAAATCACCAGAAAAACGGGGCGATTTGCATGACATTTATTAAGTAAACTTTCACTTGCCCCACCGAT
TAGCCACGCGATTCATCCTGTTTTTCTGAGTATGAAGGCCATACGTTTTTTAAGCGAGGACACTGTGCCAACGGTATATTGTGTTATATGGTTCTAATATTCAAAGATTTATGGACAGAAATGCATGAGAGGAAGAGAATCGTAGCCATCGTGGATGTGTGAAGTAGCATATTGAGTAATTGACGATCCCGTCTGGAATG
GAACATCATACGgtgatgattgcaatggccattgcctttgcttctgtattaatgttttattatacaataaacagcaggtggagtaacagaaacaaggaaatgcggggaatgcagAGCAAGATTTCTAAGAAATCAGCAGAGAATAATGGCACCACCAATACCGGAGCTGCTGTAGGAGGGACCGATGTTATAATTGTGGG
AGCAGGGGTCGCGGGTTCAGCTCTGGCTAACACGCTGGGCAAGGATGGAAGACGCGTTCTTGTAATTGAGAGAGACCTGAGTGAACCTGATAGGATTGTAGGGGAACTTTTACAGCCAGGTGGATACTTGAAACTGATTGAGCTGGGACTAGAAGATTGTGTTGAAGGAATTGATGCCCAGCGTATAATGGGGTATGCTT
TATTCAAGGAAGGAAAAGACACCAAAGTGGCATATCCATTAGATAGCCACCATGTGGATGTAGCTGGAAGGAGTTTCCACAATGGGCGTTTCATCCAGCGCATGCGAGAAAAGGCTGCTTCACTTCCTACGGTTCGTCTGGAGCAAGGAACTGTACTTTCTTTGATTGAAAAGGATGGGGTTGTGAAGGGTGTAAAGTAC
AAGTCTACAGCTGGCGAGGAACTTGAAACATTTGCTCCTCTTACTGTTGTTTGTGATGGATGCTTTTCAAATCTGAGGCGATCACTTTGCAATGCAAAGGTGGATGTGCCTTCATGTTTTGTAGGTCTTGTGCTGGAAAATTGCAACCTTCCACACCCTAATCATGGGCATGTTATATTAGCAGATCCCTCTCCTCTCCT
ATTCTATCCAATTAGCAGCACTGAAGTGCGCTGCTTAGTTGATGTACCTGGTAAAAAGGTTCCATCTGTGGGCAATGGAGACATGGCAAAATATTTGCAAACTGTGGTGGCTCCTCAGCTTCCAAAGCAGCTACAAGTACCCTTTTTAGCTGCTGTTGAAAAGGGCAATATACGGACCATGCCAAACAAGAGTATGCCAG
CCTCACCATTGCCTAGGCCTGGAGCTCTTCTTCTAGGGGATGCCTTCAATATGCGGCATCCATTAACTGGTGGTGGAATGACTGTTGCATTGTCTGACATTGTTGTTCTTGAGAGGCTTCTTAAACCTCTCCATAACCTTCATGATGCATCTTCCCTTTGTGAATATTTGGAAGCCTTTTACACACTACGTAAGCCTGTT
GCATCAACAATAAATACTTTGGCAGGTGCTTTGTATAAAGTCTTTTGTGCTTCACCTGATCAAGCGATGAAAGAGATGCGCCAAGCTTGTTTTGACTATTTAAGCTTAGGAGGCGTGTTTTCCAGTGGACCTGTGGCATTGCTGTCTGGTCTGAATCCACGGCCATTGAGTTTGGTTCTACATTTCTTTGCAGTGGCTGT
ATATGGTGTTGGTCGACTCTTGTATCCTTTCCCTTCGCCAAAACGATTTTGGCTTGGTGCTCATCTGATTGCAGGCGCTTCCAATATCATTCTTCCAATTATTCAGGCGGAAGGAGTCAGACAGATGTTCTTTCCTAACACTATCCCTGCATATTATAGAATGCCACCTGTGCATTCTATCAAGGGAGGGACTGGCAGTT
AATGATTATCCGGAGAAAATTTGCCTTATTTGTTAGGGATTGATCGCTTTGTGTGATCCTTTGGAAGAAATCACAGTAAACTGTTTCTTCTTTTAACTTCTAGTTAAAATGCATACCATTTATCAGCTTTCAGTTTGAACTACTAGGCATAGCATGCTATTTGGAAGACTTTAAAAGTTGGAAGCATTTGAATGTTGTAT
CCAAAATTAATTGATTTGCTTGGCAAATTAATGTAAGCTCTCCAAACTTTATTGCTTTATAGCTGATAACTTTTTTTAAGTTCATTGAAGAACTAGCTTTCAGAAAGGGTTGTACTTGTTTGCTTCTGGGGTTTTTATCATTTCAGGTTTTAAGCTGGTGTAGATTTGTTTCGCCCATTGTGGCAACAGACATATTTTTT
CTGGTATGACTAAGACTTCTCTTCAACGGAAGAAGGAAAAACATGAAAGGATTATTTATCATGTTGACAGAGCCCTGTACATGCATGTTTCCAACTACACTTTATGCATGAAGGCCATCTCACAGCATGTACCAGCAGAGAAAAGGCTATTACAGAACGATTGTGAAAAGCTAAAGTTAACCGAAGTTCTATCTGATAAA
TTTCGTAACTGTTGTAGCATAAACAGAGGTCATGGAAGTGACAAAATTCAGAAACATCCTTTGCAGACATTTTTATGTTGAGCTGCATTGCGTTTCTATTAATCAAAGGGAAATAGTTGCATGCATACAGCCCTAAATAGTTTTCCTCTGGTTTTGAAAATTTTTCTTTGGTACTCTTTTGTCAACTTCTTGCATAGCTG
TAAAACAACATGGTCGCTTTACATGTTACCATGAGCCACATTGTTATTGTTATAGGTCTCACTATATGGCCAAATTATCACACTTGTGCAAGTTGGCATATAAAATAGGGGCTTAAAGATAGTTTCATTTTTATGGTTAATTATCTTAGTTTCCAAGATAGGCCACTGCGCATTGTTTGTTTTAAAGAATAGATAATATT
GAGGATATCATCTGGCCTCAAGATCGATAAATTTGAGGTTCTCTTAATATATGTTCCCGAGGATATCATATGGCCTTAAGATTGTTAACTTTGAGGTTATCATATAGTCTCAAAATCTTTATTTGTTG