sp|Q0J969|CAEH1_ORYSJ ----> Probable carboxylesterase Os04g0669500

Intron 1 GTATAAGAGC ... GGTTGAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	11.37	97.5	20	5
A2	7.14	52	8	0
A3	14.29	75	7	18
A4	5.88	48	4	2
A5	6.67	35	4	1
A6	6.37	647	55	33
A7	5.54	435.5	29	22
A8	4.49	473.5	34	10.5
A9	5.79	382.5	34	13
A10	5.77	339	34	7.5

>TRINITY_DN47843_c0_g1_i5 from sample A7 / Example spliced isoform

CAGGAATTGAACCCTGGTCTCTGGTCTCTGACGTAGGGACCATCTGGACCAGCCGCTGCGTCCGGAGCCTCAGCCCCTTAGTGACCCGATACTCATAGTCAATGTGAAGTGAAATGAAAAAGGAAAGAATCAGTGTGTAACAGGAGTGAGATTTTACACTGGGTGTGTAATAACCCCAAGTTGCATCCCAGTGTATATAT
ATGGGGGAGTGACAGGACAACTCCGTTCCGTTTGTATTTGGAGAACTAAACAAACAAAGACATGGCCGGGAACATCGTAATACTCTGGTTACATGGCCGGGGGGAATCCGGCCCCAACAGTATGCCCATACGACGATTCTTTTCTGCTCCTGAATTCGCTAGCACAAAGTGGCTATTCCCCTCCGCTCCATCTCGGACAA
GTACATACGAAAATGGAGTAAGCAAGCCGGCATGGTTTGACACTTATCAGATACCTGTCACTGCTGATTCTCCCAGGGATGAAGAAGGGATTTTGAAATCTGTAGAAAAGGTACATGAGATGATAGACAAGGAGGTGGCAGCTGGAATCAGTCCCAACAAAATTTTTGTCTGTGGTTTTAGCCAAGGGGGTGCTCTGACT
TTAGCAAGCACAATGCTGTATCCAAAAACTCTTGGCGGAGCTGCAGTGTTTAGTGGTTATATGCCCTTCAATTCATCGTTTATTGAAAAGATTTCCTCTGAAGCTAAACAGACACCAGTGGTATGGTTCCATGGAATGAGTGATAATAGGGTGGACTTTAGTGCTGGCCAAGCTGGACCGCCATTGCTTGAACAGGCCGG
TATTAGTTGTCAGTTTAAGGCCTACCCAGGTCTTGGCCATTCGATAAGTCCATATGAATTGACCTCTCTGGAATCTTGGATCAAGGCTCGCTTACAATCTTCTGTTGATTGATTTCTTATGCATGTAGCTTTAGTTCAAATCCATTTTAAATTGCAATTTGGTTGATACCCAAAAGTGCTACAGTTTCCAAAATTCATTT
AAATATTTATGATCTAGCTTTCCTTGAAGTTTATTTGATATCTTAAATTATAGATATTCTTTCACCGTGTTAAATTTAAGCAACAAGCATAACACTTTTGATTGTTTACATGCATTGGGTGCAATTTAATTTGCATAATTTAGACG

>TRINITY_DN47843_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CAGGAATTGAACCCTGGTCTCTGGTCTCTGACGTAGGGACCATCTGGACCAGCCGCTGCGTCCGGAGCCTCAGCCCCTTAGTGACCCGATACTCATAGTCAATGTGAAGTGAAATGAAAAAGGAAAGAATCAGTGTGTAACAGGAGTGAGATTTTACACTGGGTGTGTAATAACCCCAAGTTGCATCCCAGTGTATATAT
ATGGGGGAGTGACAGGACAACTCCGTTCCGTTTGTATTTGGAGAACTAAACAAACAAAGACATGGCCGGGAACATCGTAATACTCTGGTTACATGGCCGGGGGGAATCCGGCCCCAACAGTATGCCCATACGACGATTCTTTTCTGCTCCTGAATTCGCTAGCACAAAGTGGCTATTCCCCTCCGCTCCATCTCGGACAA
GTACATACGAAAATGGAGTAAGCAAGCCGGCATGGTTTGACACTTATCAGATACCTGTCACTGCTGATTCTCCCAGGGATGAAGAAGGGATTTTGAAATCTGTAGAAAAGGTACATGAGATGATAGACAAGGAGGTGGCAGCTGGAATCAGTCCCAACAAAATTTTTGTCTGTGGTTTTAGCCAAGGGGGTGCTCTGACT
TTAGCAAGCACAATGCTGTATCCAAAAACTCTTGGCGGAGCTGCAGTGTTTAGTGGTTATATGCCCTTCAATTCATCGTTTATTGAAAAGATTTCCTCTGAAGCTAAACAGACACCAGTGGTATGGTTCCATGGAATGAGTGATAATAGGGTGGACTTTAGTGCTGGCCAAGCTGGACCGCCATTGCTTGAACAGGCCGG
TATTAGTTGTCAGTTTAAGgtataagagcatatgaatatatcttatcaacttgtacttcgttaatccaaatagattggctatatgtagatgttagtgaaagttttgaacttattattatttcacattctggttgaacagGCCTACCCAGGTCTTGGCCATTCGATAAGTCCATATGAATTGACCTCTCTGGAATCTTGGA
TCAAGGCTCGCTTACAATCTTCTGTTGATTGATTTCTTATGCATGTAGCTTTAGTTCAAATCCATTTTAAATTGCAATTTGGTTGATACCCAAAAGTGCTACAGTTTCCAAAATTCATTTAAATATTTATGATCTAGCTTTCCTTGAAGTTTATTTGATATCTTAAATTATAGATATTCTTTCACCGTGTTAAATTTAAG
CAACAAGCATAACACTTTTGATTGTTTACATGCATTGGGTGCAATTTAATTTGCATAATTTAGACG

Intron 2 GTATTCCTAG ... TTAATTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.73	90.5	22	0
A2	22.36	69.5	20	2
A3	23.02	67.5	20	0
A4	18.55	57.5	13	0
A5	28.99	32.5	13	0
A6	21.4	605.5	164	0
A7	18.24	458.5	102	0
A8	15.89	442	83	0
A9	18.36	410.5	92	0
A10	18.41	338.5	76	0

>TRINITY_DN112291_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

ATATAATGGGGAATGACTGGACAGCTCCGTTTATTTGGAAAACCAAACAAAGAAATGGCCAGGAGCATCGTAATACTCTGGTTACATGGCCGGGGAGATTCCGGCCCCAACAATATGCCCATACGACGCTTTTTTTCTGCTCCTGAATTCGCTAGCACAAAGTGGTTATTCCCCTCCGCTCCTTCTCGGCCAATTACATA
CGACAATGGAGTAAGGATGCCGGCATGGTTTGACACTTATGAGATACCTGTCACTGCTGATTCTCCCAGGGATGAAGAAGGGATTTTGAAATCTGTAGAAAAGGTACATGAGATGATAGACAAGGAGGTGGCAACTGGATTCAGTCCCAACAAAATTTTTGTCTGTGGTTTTAGCCAAGGGGGTGCTCTGAGTTTAGCAA
GTGCAATGCTGTATCCAAAAACTCTTGGCGGAGCTGCAGTGTTTAGTGGTTATATGCCCTTCAATTCATCGTTTATTGAAAAGATCTCCTCTGAAGCTAAACAGACACCAGTGGTATGGTTTCATGGAATGAGTGATAATGTGGTGGAATTTAGTGCTGGCCAAGCTGGACCGCCATTGCTTGAACAGGCCGGTATTAAC
TGTCAGTTTAAGGCTTACCCTGGTCTTGGCCATTCAATTAGTCCAGATGAATTGACCTCTTTGGAATCTTGGATCAAGGCTCGCTTACAACCTTCTTTTGATTGATTTCTTATGCATGGTAACTTTAGTTCAATTCCATGTTAAATTGCAATTTGGTTGATACCCAAAAGTGCTACAGTTTCCAAAATTCATTTAAATAT
TTATGATCTAGCTTTCCTTGAAGTTTATTTGATATCTTAAAATATAGATATTCTTTGACCATGTTGAATTTAAGCAACACACGACCCTTTTTGTTTTTCAGACTCCAAAGATTAGTGTGTTACTACATTAATTCACATTAATTCTTCAAGGTTGTATATTTTGAAACTAAGGCAAAGACTGCTTGATGATGCTATTTGGT
GTATATATCAAGCTTATCATAATTCTAGTAAATGAATAAAACTCATTG

>TRINITY_DN112291_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

ATATAATGGGGAATGACTGGACAGCTCCGTTTATTTGGAAAACCAAACAAAGAAATGGCCAGGAGCATCGTAATACTCTGGTTACATGGCCGGGGAGATTCCGGCCCCAACAATATGCCCATACGACGCTTTTTTTCTGCTCCTGAATTCGCTAGCACAAAGTGGTTATTCCCCTCCGCTCCTTCTCGGCCAATTACATA
CGACAATGGAGTAAGGATGCCGGCATGGTTTGACACTTATGAGATACCTGTCACTGCTGATTCTCCCAGGGATGAAGAAGGGATTTTGAAATCTGTAGAAAAGGTACATGAGATGATAGACAAGGAGGTGGCAACTGGATTCAGTCCCAACAAAATTTTTGTCTGTGGTTTTAGCCAAGGGGGTGCTCTGAGTTTAGCAA
GTGCAATGCTGTATCCAAAAACTCTTGGCGGAGCTGCAGTGTTTAGTGGTTATATGCCCTTCAATTCATCGTTTATTGAAAAGATCTCCTCTGAAGCTAAACAGgtattcctagaattatgaatcatgttgttaattacagACACCAGTGGTATGGTTTC