sp|Q8GY60|P2C52_ARATH ----> Probable protein phosphatase 2C 52

Intron 1 GTAGGTTTTT ... ATATGCTGAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	29.07	61	27	23
A2	29.13	45	22	15
A3	32.33	45	30	13
A4	34.78	30	17	15
A5	32.2	20	13	6
A6	32.57	88	53	32
A7	26.76	130	38	57
A8	35.76	106	59	59
A9	28.14	120	58	36
A10	27.98	130	54	47

>TRINITY_DN112536_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

TGCTTTTGGAAGGCTGTGCGTTTAACGAGTATTTTGTAAAGAATTCCATGCGTTACATAATAGATTTTAATGAAGTGGACGGCTGGATCGGTGGAGAGGCATGATCCCTTTAAATAGGTAAAAAGAAAAAAAATTGAAAGCGATATCAGTTTTCATGGAGAATCGAGTTCTCTGCCGATCCCATTCATCCCAGTATGTAC
ACCATACAATACTGTTTTCTAGATTCAAAATGGTCCACCCGTGGTCAAGTCATTTACTCGGCGCATGGCCCGCAGTTTGAATGCTTTTGTACAGTTGAGAGGAAGTTATATTATAGCTTTCTTCAGTACGTAGAGCTTGCCTTTTTCTGTTTGGATCCGAATCGATGAAATTCGAAGTCTAAACGATAACAGATTGTGAT
GTTACCAATTGGGTTTTGATGGTGGGAAGCGGGTTTGATTAATTGAAGCATTCGGGTGGACTAGCATGGGATCCTGCGTGTCGACGAACGCTGCCAGTGAGCGCCAGGAGCAAGATGCTTCGTGCATGCCTGGAATTCTATGGAGGAGCAAGAATTTGAAGGCTCTGGCTTCGTTTTCTGAGGATGATTATAAGGAGGGT
GGGCGTCTGGGTTTTGCTGGCAAGAGGATGTGCTCTAATGGGTCGAGTAAGGTTGCCTGTGTTTTTACTCAGCAAGGGCGGAAGGGGATTAATCAGGACGCCATGCTAGTTTGGGAGGATTTTGTTTCAGATGATTCAATCTTCTGTGGGGTTTTTGATGGCCATGGTCCTTATGGTCATCTTGTTGCCCGTAGGGTCAG
GGATTCATTGCCAGTGAAATTGCATTCTTTTTGGCAATCATTCAAGGATAAAGCAAACAACATCAATGCTTCTGATACATACAATAATAAAAAGAAAGCTAAAAATACCCAAAATGATTTGGGTAGTGACGGCCAAGTCAGTTCAGCAAAGGAATCCAGTCTTTTTTCTGCCTGGAAAGACACCTACCTGAAAGCGTACA
AAGTAATGGACAAAGAATTGAGGTCTCATCCAACTATAGACTGCTTTTGCAGTGGAAGCACCGCAGTTGCAGTTGTTAAACAGGGAGATTACCTTTTCATTGGGAATATTGGGGATTCCCGGGCTGTCCTGGGAACAAGAGCAGCCGATGGTTCCCTCGTTGCCATTCAACTGACAGTTGATTTAAAGCCTGACTTGCCA
AGGGAAGCTGAGCGCATCCGACGATGTAAGGGTCGAGTTTTTGCTTTGCAAGATGAGCCTGAAGTACATAGGGTGTGGTTACCATATGACGATGCACCGGGGTTGGCAATGGCAAGGGCTTTTGGAGATTTTTGTTTGAAAGAATATGGTGTAATTGCCATACCTGAAATTTCTCATAGGTTGTTGACAGAGAGGGACCA
ATTTGTGGTTCTTGCATCTGATGGGGTATGGGATGTACTGAGCAATGAAGAAGTGGTGGAAATTGTATCATCTGCACCTACCCGGTCACTGGCTGCAAGAATGCTTGTAGAGTCAGCTGTTCGTGAATGGAGATTTAAGTATCCAACCTCTAAGATTGATGATTGTGCTGTAGTATGCTTGTATATAAATACTAAAATTA
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GTCATACTGGAGCCTTCCAAAGAATTAAAAGATCACAGTGAAGAAAATGCTTTAGATCCTCTTGAATCTCTTGATGCCATGGATCAGAATTGGTCTGGACTTGAAGGTGTTACAAGAGTTAATTCACTGGTTCAGCTTCCCAGATTTCCTGAAGAAAAAAGCTTGTAGAGCAAAATAAAATCTTTGTAGTTTAATAATCA
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CATTTGCCATATGCATGTTTTGCATCTGGAAAGTATTAGAATGAAATCTTGGCTTCATGCTTCTGTAAATAATGAAATTACCATGTTAAAATATATTATTTGTTGCC

>TRINITY_DN112536_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGCTTTTGGAAGGCTGTGCGTTTAACGAGTATTTTGTAAAGAATTCCATGCGTTACATAATAGATTTTAATGAAGTGGACGGCTGGATCGGTGGAGAGGCATGATCCCTTTAAATAGGTAAAAAGAAAAAAAATTGAAAGCGATATCAGTTTTCATGGAGAATCGAGTTCTCTGCCGATCCCATTCATCCCAGTATGTAC
ACCATACAATACTGTTTTCTAGATTCAAAATGGTCCACCCGTGGTCAAGTCATTTACTCGGCGCATGGCCCGCAGTTTGAATGCTTTTGTACAGTTGAGAGGAAGTTATATTATAGCTTTCTTCAGTACGTAGAGCTTGCCTTTTTCTGTTTGGATCCGAATCGATGAAATTCGAAGTCTAAACGATAACAGATTGTGAT
GTTACCAATTGGGTTTTGATGGTGGGAAGCGGGTTTGATTAATTGAAGCATTCGGGTGGACTAGCATGGGATCCTGCGTGTCGACGAACGCTGCCAGTGAGCGCCAGGAGCAAGATGCTTCGTGCATGCCTGGAATTCTATGGAGGAGCAAGAATTTGAAGGCTCTGGCTTCGTTTTCTGAGGATGATTATAAGGAGGGT
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TGAAAGAATATGGTGTAATTGCCATACCTGAAATTTCTCATAGGTTGTTGACAGAGAGGGACCAATTTGTGGTTCTTGCATCTGATGGGGTATGGGATGTACTGAGCAATGAAGAAGTGGTGGAAATTGTATCATCTGCACCTACCCGGTCACTGGCTGCAAGAATGCTTGTAGAGTCAGCTGTTCGTGAATGGAGATTT
AAGTATCCAACCTCTAAGATTGATGATTGTGCTGTAGTATGCTTGTATATAAATACTAAAATTACTGAGCAGCCAAGACCAGAGGACATTTCAACTGCTTCCAATATTGTTGATCAGGTGGAACCTATTGGTACAGTCACTAATGAACTGAAGGATGCATATTCAGGACAGACAACAGACCAGGGTGAAGAAGAGGGTCC
ATTACTGCAGCGGCTTTTCACTCTCAGAAATGCCAACGAACCACAATCTTCCCTCCAATCAATAGTCATACTGGAGCCTTCCAAAGAATTAAAAGATCACAGTGAAGAAAATGCTTTAGATCCTCTTGAATCTCTTGATGCCATGGATCAGAATTGGTCTGGACTTGAAGGTGTTACAAGAGTTAATTCACTGGTTCAGC
TTCCCAGATTTCCTGAAGAAAAAAGCTTGTAGAGCAAAATAAAATCTTTGTAGTTTAATAATCATCCATTGTTCAGTATGTCAGTTTTGGATTTTTTTCTTTCTTTGATAGATGTTAGCGATTCACCAATGTAGTAGTTTGTTAATAAACTTTCTCCACGTGTAAGTTTTAAGCCTATTATCTGTTCTGCTGATAATTTC
ATAATAGCCATGATAGTCAAAGCCTTACCGATTCCCAGATGATTGCAGTTTACTATGGGCTGGACATTTGCCATATGCATGTTTTGCATCTGGAAAGTATTAGAATGAAATCTTGGCTTCATGCTTCTGTAAATAATGAAATTACCATGTTAAAATATATTATTTGTTGCC