sp|D2K8N5|TAP46_NICBE ----> PP2A regulatory subunit TAP46

Intron 1 GTGGTTTTAT ... GTTTTTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	24.44	51	20	13
A2	23.89	43	19	8
A3	21.57	40	10	12
A4	20.26	61	12	19
A5	30.91	19	2	15
A6	21.92	57	14	18
A7	24.56	129	34	50
A8	20.15	105	15	38
A9	18.75	130	27	33
A10	20.57	112	32	26

>TRINITY_DN110057_c0_g1_i8 from sample A3 / Example spliced isoform

GCTGCACAGGAGAGTCTGGTGGGAAGAAATCACCGTCTTAAAGCACTTCAAAATTTATTCACTCGCTGTATTTTGTTTCAGGGTTTGTAAGTTTGTTGAGGTTTTAGAACAGATTAATGGCACAAGTGAATATGGAGGACTTGCCGCTCCCAGCTCTGTTCGAGCAGGCGCGCCAAATCCACTCGACGGCAGCAGATTCG
ACCGTGGATCAGGATAAATTAAAAAAGGCATGTGATATATTGCGGCAATGCAATGCTATGATAGACCAGCTAGGATTATTTTCACCAAATGAGGGTAAAGAAGACATTAGTACTACAGATTTGAAATACTTGCTAGTGCCTTACTATCGTGGAGAATTGACAGAGAAGATCCATAATTCTAACAGACTGCAGATTATTAA
AACTTCTCAAGCACATTTGAAAGAGTTTGTTTCAATCTGCGAGAAACTAGAGCTTGTTCCCATGGAAGAAGCAGATGCTTTTGTCCAAGATGGCAGGGATACACCTGAAGCAAGGAGAGCCAAAAAGATAGCGAGGTTCAAACGACAAAAAGAAGCAGAGTCAAAGCTCCAAGAGATTAAAGAAAGGAAAGAACGTCGTA
GCCGGTCAATGCAGGCAGCTGCAATCACTACTTCGATTGAACATGGAGAGGAACCTATGCTAGATGATGATGGTGAAGAGGAAAGGGAGGCCTGGCTTACTACAATTTCTTTGGCACTATGTAAGGCGTTGGATCTTCTGGATGGGTTGAAAAAAGAAGAAGAACTGGTTTCTACCATGATGGCAAATAACTTGCAGAGT
GGGCAAGATGATGTTGTTAGAGCAATGCTTGATGAGCGATTAAAAAAGGCAGAGGCATGGCACAAGGGGGCTGCTAGAAACCGACAATTTGGAAAGCCAGCACAGCCAATTACATGTGCCAACTTTGCCATGGATGTTCTAGAAGGACGGGCAAAGCCTTCACAAGTAAATGAACACAGACACCAGCCTCCGTTGTTTGG
ACCTGCTAGTCTAATAGGTGGGAACATAACCACTGAAAGGGGAGAAATTGCTGCTCGAGTCTTTCAGCCAAGTCACAGGTTGCCCACCATGAGTATTGAAGAGGCTGGAATGCGGGAAATGGAGATTATGAATAAGTGGCAGGAAAATGCAGCAGCGCAATTAAAAGAAGCAAACTCATCTTGGGTGACAGATGGCAAAA
GGGATGCAACAAGTGATGATGAATCTGCTGAAGATAAGGCTAGGGCATGGGATGACTGGAAAGATGATAATCCTCGTGGAGCTGGCAACAAGAAGCTCACTCCTTGTGGCTAACTTGATAATACAAATTAACAAAACACTTGTGGCTATATTGTTGCAGCAGTGTTCAATCCTTTGGAAACCAATAGGCTTTATTTTCCT
TGTGGCTGGAGCATTAAGAAGAGAAATTAGTTTTGAATTTCCTTAATACTCGCAGCTATTAGTAGTTCATTGACTCACTTTGTTATAGACTAATTGATTCTGCAATGTCGGGAGGGATAGATTGATTTCCTTAATAATCCATTAGTAGTCCAGTAAAACTGATTAAACTTGTTCGGATTAAATTGTTTGCTTTTGGAGGG
TTGTGACAGGTGTCTTACATTGCATCCTAATACTGTAATGCCCTGCGTAACACATATAACACATTGTTTCCCTATTGTTCATATTGGAACAGAGTAGCATTTCCATTATTTTATTTTATTCCATTTTGTATTTTTATGTATTGATTTATCAAG

>TRINITY_DN110057_c0_g1_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GCTGCACAGGAGAGTCTGGTGGGAAGAAATCACCGTCTTAAAGCACTTCAAAATTTATTCACTCGCTGTATTTTGTTTCAGGGTTTGTAAGTTTGTTGAGGTTTTAGAACAGATTAATGGCACAAGTGAATATGGAGGACTTGCCGCTCCCAGCTCTGTTCGAGCAGGCGCGCCAAATCCACTCGACGGCAGCAGATTCG
ACCGTGGATCAGGATAAATTAAAAAAGGCATGTGATATATTGCGGCAATGCAATGCTATGATAGACCAGCTAGGATTATTTTCACCAAATGAGGGTAAAGAAGACATTAGTACTACAGATTTGAAATACTTGCTAGTGCCTTACTATCGTGGAGAATTGACAGAGAAGATCCATAATTCTAACAGACTGCAGATTATTAA
AACTTCTCAAGCACATTTGAAAGAGTTTGTTTCAATCTGCGAGAAACTAGAGCTTGTTCCCATGGAAGAAGCAGATGCTTTTGTCCAAGATGGCAGGGATACACCTGAAGCAAGGAGAGCCAAAAAGgtggttttattaaatgcaattttatggtcttccttggaaaaattaaagggatgatttggtagaccattcgatt
ttccttttggttagactttaatatataaataatgatgttttattttgtaatagacatggtcattattttttcaggtgtaatgcttggattaagttttgttttgaggcttgtttttgtagATAGCGAGGTTCAAACGGCAAAAAGAAGCAGAGTCAAAGCTCCAAGAGATTAAAGAAAGGAAAGAACGTCGTAGCCGGTCA
ATGCAGGCAGCTGCAATCACTACTTCGATTGAACATGGAGAGGAACCTATGCTAGATGATGATGGTGAAGAGGAAAGGGAGGCCTGGCTTACTACAATTTCTTTGGCACTATGTAAGGCGTTGGATCTTCTGGATGGGTTGAAAAAAGAAGAAGAACTGGTTTCTACCATGATGGCAAATAACTTGCAGAGTGGGCAAGA
TGATGTTGTTAGAGCAATGCTTGATGAGCGATTAAAAAAGGCAGAGGCATGGCACAAGGGGGCTGCTAGAAACCGACAATTTGGAAAGCCAGCACAGCCAATTACATGTGCCAACTTTGCCATGGATGTTCTAGAAGGACGGGCAAAGCCTTCACAAGTAAATGAACACAGACACCAGCCTCCGTTGTTTGGACCTGCTA
GTCTAATAGGTGGGAACATAACCACTGAAAGGGGAGAAATTGCTGCTCGAGTCTTTCAGCCAAGTCACAGGTTGCCCACCATGAGTATTGAAGAGGCTGGAATGCGGGAAATGGAGATTATGAATAAGTGGCAGGAAAATGCAGCAGCGCAATTAAAAGAAGCAAACTCATCTTGGGTGACAGATGGCAAAAGGGATGCA
ACAAGTGATGATGAATCTGCTGAAGATAAGGCTAGGGCATGGGATGACTGGAAAGATGATAATCCTCGTGGAGCTGGCAACAAGAAGCTCACTCCTTGTGGCTAACTTGATAATACAAATTAACAAAACACTTGTGGCTATATTGTTGCAGCAGTGTTCAATCCTTTGGAAACCAATAGGCTTTATTTTCCTTGTGGCTG
GAGCATTAAGAAGAGAAATTAGTTTTGAATTTCCTTAATACTCGCAGCTATTAGTAGTTCATTGACTCACTTTGTTATAGACTAATTGATTCTGCAATGTCGGGAGGGATAGATTGATTTCCTTAATAATCCATTAGTAGTCCAGTAAAACTGATTAAACTTGTTCGGATTAAATTGTTTGCTTTTGGAGGGTTGTGACA
GGTGTCTTACATTGCATCCTAATACTGTAATGCCCTGCGTAACACATATAACACATTGTTTCCCTATTGTTCATATTGGAACAGAGTAGCATTTCCATTATTTTATTTTATTCCATTTTGTATTTTTATGTATTGATTTATCAAG

Intron 2 GTCAGTGGGA ... TGCTTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	26.39	53	0	19
A2	33.7	37.4	4	19
A3	13.16	66	3	10
A4	18.82	69	1	16
A5	22.58	24	1	7
A6	16.87	123.2	2	25
A7	24.29	212	0	68
A8	17.89	202	0	44
A9	14.47	195	0	33
A10	19.43	170	0	41

>TRINITY_DN116588_c1_g1_i8 from sample A2 / Example spliced isoform

GGAAGAAATCACCGTCTTAAAGCACTTCAAAATTTATTCACTCGCTGTATTTTGTTTCAGGGTTTGTAAGTTTGTTGAGGTTTTAGAACAGATTAATGGCACAAGTGAATATGGAGGACTTGCCGCTCCCAGCTCTGTTCGAGCAGGCGCGCCAAATCCACTCGACGGCAGCAGATTCGACCGTGGATCAGGATAAATTA
AAAAAGGCATGTGATATATTGCGGCAATGCAATGCTATGATAGACCAGCTAGGATTATTTTCACCAAATGAGGGTAAAGAAGACATTAGTACTACAGATTTGAAATACTTGCTAGTGCCTTACTATCGTGGAGAATTGACAGAGAAGATCCATAATTCTAACAGACTGCAGATTATTAAAACTTCTCAAGCACATTTGAA
AGAGTTTGTTTCAATCTGCGAGAAACTAGAGCTTGTTCCCATGGAAGAAGCAGATGCTTTTGTCCAAGATGGCAGGGATACACCTGAAGCAAGGAGAGCCAAAAAGATAGCGAGGTTCAAACGACAAAAAGAAGCAGAGTCAAAGCTCCAAGAGATTAAAGAAAGGAAAGAACGTCGTAGCCGGTCAATGCAGGCAGCTG
CAATCACTACTTCGATTGAACATGGAGAGGAACCTATGCTAGATGATGATGGTGAAGAGGAAAGGGAGGCCTGGCTTACTACAATTTCTTTGGCACTATGTAAGGCGTTGGATCTTCTGGATGGGTTGAAAAAAGAAGAAGAACTGGTTTCTACCATGATGGCAAATAACTTGCAGAGTGGGCAAGATGATGTTGTTAGA
GCAATGCTTGATGAGCGATTAAAAAAGGCAGAGGCATGGCACAAGGGGGCTGCTAGAAACCGACAATTTGGAAAGCCAGCACAGCCAATTACATGTGCCAACTTTGCCATGGATGTTCTGGAAGGACGGGCAAAGCCTTCACAAGTAAATGAACACAGACACCAGCCTCCGTTGTTTGGACCTGCTAGTGTAATAGGTGG
GAACATAACCACTGAAAGGGGAGAAATTGCTGCTCGAGTCTTTCAGCCAAGTCACAGGTTGCCCACCATGAGTATTGAAGAGGCTGGAATGCGGGAAATGGAGATTATGAATAAGTGGCAGGAAAATGCAGCAGCGCAATTAAAAGAAGCAAACTCATCTTGGGTGACAGATGGCAAAAGGGATGCAACAAGTGATGATG
AATCTGCTGAAGATAAGGCTAGGGCATGGGATGACTGGAAAGATGATAATCCTCGTGGAGCTGGCAACAAGAAGCTCACTCCTTGTGGCTAACTTGATAATACAAATTAACAAGTGAGATTTCTTTGGTGTAAATTTTTGTCTTATTTTGTTCTCTTTATATGTTTGAAAATCTCATGGCTACGTGACTCTCATTTTCTT
TGTGTAGAACACTTGTGGCTATATTGTTGCAGCAGTGTTCAATCCTTTGGAAACCAATAGGCTTTATTTTCCTTGTGGCTGGAGAATGAAGAAGAGAAATTAGTTTTGAATTTCCTTAATACTCGCAGCTATTAGTAGTTCATTGACTCACTTTGTTATAGACTAATTGATTCTGCAATGTCGGGAGGGATAGATTGATT
TCCTTAATAATCCATTAGTAGTCCAGCAAAACTGATTAAACTTGTTTGGATTAAATTGTTTGCTTTTGGAGGGTTGTACTTGTGACAGGTGTCTTACATTGCATCCTAATACTGTAATGCCCTGCGTAACACATATAACACATTGTTTCCCTATTGTTCATATTGGAACAGAGTAGCACTTCCATTATTTTATTTTATTC
CATTTTGTATTTTTATGTATTCATTTATCAAGTTGAGATTAAGCTCATCCTTGGTTAACTTTAATCAGTTTATTTAAAG

>TRINITY_DN116588_c1_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TGTTTTAAATTTTTCTCACCAGATAGGAAAACCATGTTTTTGGTGGACTTCCAAAAGTGATGTCAACTGAGTAGACACTTTCTTTTTTTATTTAATATGCAGTTATTGAAATTCTTAATAAATAAAAAGAAACCTAGCTGGCTGACGAATTGCTGTTATTGTTTGTTTGTATACTGCAAAGTGCTTCTAAAGTAATGGGA
AGTATATAGTTTTCTTTACTACTTCATGAGCTGTTACCCGCAAATGAACTGTTACGTAACGAAAGTGATAATCTCTGCATTGGTAGTTGACTTTATGCTTCTTGTTGCAGGCCTGGCTTACTACAATTTCTTTGGCACTATGTAAGgtcagtgggagagtattgctatgttgatttaagggatgctttggtgtcatatca
ttacaagtcagttattaacctgcaatactattctgcattaggtgatctatatttaagtggaatttgtgtttgcaagcatttgcttgccatttgagttcgtttagacaataatgctgtatcctgctttttctggtgctacaaactctagtcttatctccttgcatttattgtgttttgctgaatctttgtgcttttcagGC
GTTGGATCTTCTGGATGGGTTGAAAAAAGAAGAAGAACTGGTTTCTACCATGATGGCAAATAACTTGCAGAGTGGGCAAGATGATGTTGTTAGAGCAATGCTTGATGAGCGATTAAAAAAGGCAGAGGCATGGCACAAGGGGGCTGCTAGAAACCGACAATTTGGAAAGCCAGCACAGCCAATTACATGTGCCAACTTTG
CCATGGATGTTCTGGAAGGACGGGCAAAGCCTTCACAAGTAAATGAACACAGACACCAGCCTCCGTTGTTTGGACCTGCTAGTGTAATAGGTGGGAACATAACCACTGAAAGGGGAGAAATTGCTGCTCGAGTCTTTCAGCCAAGTCACAGGTTG

Intron 3 GTGAGATTTC ... CTTTGTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	45.47	37.8	45	18
A2	38.54	40.7	36	15
A3	30.3	46	28	12
A4	34.07	30	23	8
A5	38.27	25	21	10
A6	32.69	249.1	159	83
A7	34.38	211.9	148	74
A8	33.46	280.4	191	91
A9	32.35	240.6	166	64
A10	31.07	181.9	106	58

>TRINITY_DN132720_c4_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

ACTGAATGGAACAATATTTCTAGGAATGCAAGCTCAATTGGTTTTAAGTTTATAACTTTTGCAGTGTTTTTTTGGCAGGATAAATTAAAAAAGGCATGTGATATATTGCGGCAATGCAATGCTATGATAGACCAGCTAGGATTATTTTCACCAAATGAGGGTAAAGAAGACATTAGTACTACAGATTTGAAATACTTGCT
AGTGCCTTACTATCGTGGAGAATTGACAGAGAAGATCCATAATTCTAACAGACTGCAGATTATTAAAACTTCTCAAGCACATTTGAAAGAGTTTGTTTCAATCTGCGAGAAACTAGAGCTTGTTCCCATGGAAGAAGCAGATGCTTTTGTCCAAGATGGCAGGGATACACCTGAAGCAAGGAGAGCCAAAAAGATAGCGA
GGTTCAAACGACAAAAAGAAGCAGAGTCAAAGCTCCAAGAGATTAAAGAAAGGAAAGAACGTCGTAGCCGGTCAATGCAGGCAGCTGCAATCACTACTTCGATTGAACATGGAGAGGAACCTATGCTAGATGATGATGGTGAAGAGGAAAGGGAGGCCTGGCTTACTACAATTTCTTTGGCACTATGTAAGGCGTTGGAT
CTTCTGGATGGGTTGAAAAAAGAAGAAGAACTGGTTTCTACCATGATGGCAAATAACTTGCAGAGTGGGCAAGATGATGTTGTTAGAGCAATGCTTGATGAGCGATTAAAAAAGGCAGAGGCATGGCACAAGGGGGCTGCTAGAAACCGACAATTTGGAAAGCCAGCACAGCCAATTACATGTGCCAACTTTGCCATGGA
TGTTCTGGAAGGACGGGCAAAGCCTTCACAAGTAAATGAACACAGACACCAGCCTCCGTTGTTTGGACCTGCTAGTGTAATAGGTGGGAACATAACCACTGAAAGGGGAGAAATTGCTGCTCGAGTCTTTCAGCCAAGTCACAGGTTGCCCACCATGAGTATTGAAGAGGCTGGAATGCGGGAAATGGAGATTATGAATA
AGTGGCAGGAAAATGCAGCAGCGCAATTAAAAGAAGCAAACTCATCTTGGGTGACAGATGGCAAAAGGGATGCAACAAGTGATGATGAATCTGCTGAAGATAAGGCTAGGGCATGGGATGACTGGAAAGATGATAATCCTCGTGGAGCTGGCAACAAGAAGCTCACTCCTTGTGGCTAACTTGATAATACAAATTAACAA


AACACTTGTGGCTATATTGTTGCAGCAGTGTTCAATCCTTTGGAAACCAATAGGCTTTATTTTCCTTGTGGCTGGAGAATGAAGAAGAGAAATTAGTTTTGAATTTCCTTAATACTCGCAGCTATTAGTAGTTCATTGACTCACTTTGTTATAGACTAATTGATTCTGCAATGTCGGGAGGGATAGATTGATTTCCTTAA
TAATCCATTAGTAGTCCAGTAAAACTGATTAAACTTGTTCGGATTAAATTGTTTGCTTTTGGAGGGTTGTACTTGTGACAGGTGTCTTACATTGCATCCTAATACTGTAATGCCCTGCGTAACACATATAACACATTGTTTCCCTATTGTTCATATTGGAACAGAGTAGCATTTCCATTATTTTATTTTATTCCATTTTG
TATTTTTATGTATTGATTTATCAAGTTGAGATTAAAAAAAAA

>TRINITY_DN132720_c4_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGAGAGTATTGCTATGTTGATTTAAGGGATGCTTTGGTGTCATATCATTACAAGTCAGTTATTAACCTGCAATACTATTCTGCATTAGGTGATCTATATTTAAGTGGAATTTGTGTTTGCAAGCATTTGCTTGCCATTTGAGTTCGTTTAAACAATAATGCTGTATCCTGCTTTTTCTGGTGCTACAAACTCTAGTCTTA
TCTCCTTGCATTTATTGTGTTTTGCTGAATCTTTGTGCTTTTCAGGCGTTGGATCTTCTGGATGGGTTGAAAAAAGAAGAAGAACTGGTTTCTACCATGATGGCAAATAACTTGCAGAGTGGGCAAGATGATGTTGTTAGAGCAATGCTTGATGAGCGATTAAAAAAGGCAGAGGCATGGCACAAGGGGGCTGCTAGAAA
CCGACAATTTGGAAAGCCAGCACAGCCAATTACATGTGCCAACTTTGCCATGGATGTTCTGGAAGGACGGGCAAAGCCTTCACAAGTAAATGAACACAGACACCAGCCTCCGTTGTTTGGACCTGCTAGTGTAATAGGTGGGAACATAACCACTGAAAGGGGAGAAATTGCTGCTCGAGTCTTTCAGCCAAGTCACAGGT
TGCCCACCATGAGTATTGAAGAGGCTGGAATGCGGGAAATGGAGATTATGAATAAGTGGCAGGAAAATGCAGCAGCGCAATTAAAAGAAGCAAACTCATCTTGGGTGACAGATGGCAAAAGGGATGCAACAAGTGATGATGAATCTGCTGAAGATAAGGCTAGGGCATGGGATGACTGGAAAGATGATAATCCTCGTGGA
GCTGGCAACAAGAAGCTCACTCCTTGTGGCTAACTTGATAATACAAATTAACAAgtgagatttctttggtgtaaatttttgtcttattttgttctctttatatgtttgaaaatctcatggctacgtgactctcattttctttgtgtagAACACTTGTGGCTATATTGTTGCAGCAGTGTTCAATCCTTTGGAAACCAATA
GGCTTTATTTTCCTTGTGGCTGGAGAATGAAGAAGAGAAATTAGTTTTGAATTTCCTTAATACTCGCAGCTATTAGTAGTTCATTGACTCACTTTGTTATAGACTAATTGATTCTGCAATGTCGGGAGGGATAGATTGATTTCCTTAATAATCCATTAGTAGTCCAGTAAAACTGATTAAACTTGTTCGGATTAAATTGT
TTGCTTTTGGAGGGTTGTACTTGTGACAGGTGTCTTACATTGCATCCTAATACTGTAATGCCCTGCGTAACACATATAACACATTGTTTCCCTATTGTTCATATTGGAACAGAGTAGCATTTCCATTATTTTATTTTATTCCATTTTGTATTTTTATGTATTGATTTATCAAGTTGAGATTAAAAAAAAA