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Intron 1 GTGTTTAATT ... TTCTTCAAAG

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>TRINITY_DN41701_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform
TGCTGTGGTTAGGTATCCCTTGAAAGCTTGAAGCCCTTCTGCTACAACTATAAAATACGTGTCCAAGGGAGAAACCGGGAATGTCGACAGAGGGAAGACCGACATGGCGTCCAGATCTCTCACTCTCACTCGCCTACTGCGCCCGCGATCTTGTTTATCAATGGGAAATCCTCAATTGCTTGGGCATTCTTCTTCATTCA
GAAGGTGGTCGACAACAGATGCCCAGAACGTTCACAGGGGTGGGAAGTGGATTCGAAGGGTGATGTTCGGGGGATCGTTTGTAGGTCTGGGTGCCCTCGGCTGCCTGTCTCTCGGGTGGGACACCGATTTCTCAAGGACGCTCAAGGTCTTATGGGCGCTGCCTATTCGCCTTGGCCGGGATGCTCTCACTGCTGCCACC
ATTGCGATTGATTATGAATATTCATTATGGGGATTGCCGGAAGGAAGCATTGAGAGAACAATGGCAAAACATGAAGTGCACCTTCGATGTGCGAATAGACTTCAACAATTATGTTTCCAGAATGGTGGAATCTATATTAAGCTTGGGCAACATATTGGGCAATTGGAATACCTAATTCCTGAGGAATACGTACAGGTTAT
GAGGGCATCAATGCTGAACAAGTGTCCTGTATCTTCGTATGCACAAGTCTGTGATGTGTTTATGAAAGAACTAGGCAAGCTTCCACATGAAGTGTTCTTGGAGTTTGACCGGATTCCGTTGGCAAGTGCTTCACTTGCTCAAGTGCATGCTGCTCGCACCCATGATGGCAGGAAAGTTGCTGTCAAGGTTCAGCACACAC
ATTTGACAGACACAGCAGCTGTGGATACTGCCACTGTAGAGTTGGTTGTCAATATTTTGTATTGGATTTTTCCTGCATTTGATTATAGGTGGCTAATTGATGAAGTGCACGAGAGTCTTCCAAAGGAGCTAGATTTCCTGTACGAGGCAAAGAATAGTGAACAGTGTGTTTATAATTTCAAAAGATTATCTCCTCATCTT
GCACCTTATGTTTATATTCCCAAAGTTTATTGGAATTTGAGTACATCAAGATTGATGACGATGGAGTTCATGGATGGAGTCGGAGTCACTGATGTGAATGCCATCAAGCGACTTGGAATTCGGCCAAGTGATGTTGCAAAACTGATAAGCCAGGCTTTTGCAGAGATGATTTTCAAACATGGATTTGTGCATTGTGACCC
ACATGCCGCAAACATGATGGTTCAGGTTGCACCCTCTGGTAAAACAGGCATCCTGGGTAAAAAAAAACCACAGTTGGTATTACTTGACCATGGTTTATATAGGGTGCTTGAACCATCAACACGGGCACACTATGCTAAGCTTTGGAAGTTCATGTGCAGGCTCTTGTGTTTGCAGATGTCAAGGGGATAAAGGAGAATAG
TGTCAAATTAGGTGCAGGTGAGGATCTCTATGTGCTTTTTGCTGGTATTCTAACAATGAGGCCATGGCAGAAGGTGCTTGATCCAGCAATCGACCATTTACGTTTGAATGGGACTGATGCTGATCGTGCTGAACTTCAGATGTATGCATCACAATATTTCATGCAAATTTCAGAGCTTTTGAAGAGACTTCCTCGTGTAA
TTCTATTGCTTCTGAAGACTAATGACTGCTTACGTGCGGTGGATAATGCCCTGGGAGCATCTGTCAACACGTATGTCATCATTGGGAGAGTCTCATCAATGGCAGTTGCTGAGATGCAGCTGTCACAAGGGTCATCTATTTGGTCAAGTTTGAGTATTTATTTAGATAAGTTGGAAGTGGAAGCTCGTCTCCTTGCTTTA
CAAGTTGCTGCTTGGCTTATGAGCCTTCAAAGATTTTTGAGCTCATTTGGTATGAGATTGGGGTTCAGGGAGCAGGTATTGTAGTATAGCAGGTATTTATACTCGGTTGTATTTCTGAGGATTCAATTCTTTCCATCAAGGTGAGGACCTTCATGGGACTCTTTTTTACATGGTAAGCGGAAATGTATTTCTCGGAAAAG
GTATATGCAATTTTCTGTGACATGGATTGAAATATAATTTTTTTCAATACCTTGATTCAGAAAAAGCATGGTATCAAGAATAGTGCCATTGATATCAATAAGAGAACAATGTATCCTGTCATAATTTTCCTTGATGATGACAACTTTGATTTCCAAAAAATTGTTGTGTTGTCTATTTATTGCTTATTACATGC


>TRINITY_DN41701_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TGCTGTGGTTAGGTATCCCTTGAAAGCTTGAAGCCCTTCTGCTACAACTATAAAATACGTGTCCAAGGGAGAAACCGGGAATGTCGACAGAGGGAAGACCGACATGGCGTCCAGATCTCTCACTCTCACTCGCCTACTGCGCCCGCGATCTTGTTTATCAATGGGAAATCCTCAATTGCTTGGGCATTCTTCTTCATTCA
GAAGGTGGTCGACAACAGATGCCCAGAACGTTCACAGGGGTGGGAAGTGGATTCGAAGGGTGATGTTCGGGGGATCGTTTGTAGGTCTGGGTGCCCTCGGCTGCCTGTCTCTCGGGTGGGACACCGATTTCTCAAGGACGCTCAAGGTCTTATGGGCGCTGCCTATTCGCCTTGGCCGGGATGCTCTCACTGCTGCCACC
ATTGCGATTGATTATGAATATTCATTATGGGGATTGCCGGAAGGAAGCATTGAGAGAACAATGGCAAAACATGAAGTGCACCTTCGATGTGCGAATAGACTTCAACAATTATGTTTCCAGAATGGTGGAATCTATATTAAGCTTGGGCAACATATTGGGCAATTGGAATACCTAATTCCTGAGGAATACGTACAGGTTAT
GAGGGCATCAATGCTGAACAAGTGTCCTGTATCTTCGTATGCACAAGTCTGTGATGTGTTTATGAAAGAACTAGGCAAGCTTCCACATGAAGTGTTCTTGGAGTTTGACCGGATTCCGTTGGCAAGTGCTTCACTTGCTCAAGTGCATGCTGCTCGCACCCATGATGGCAGGAAAGTTGCTGTCAAGGTTCAGCACACAC
ATTTGACAGACACAGCAGCTGTGGATACTGCCACTGTAGAGTTGGTTGTCAATATTTTGTATTGGATTTTTCCTGCATTTGATTATAGGTGGCTAATTGATGAAGTGCACGAGAGTCTTCCAAAGGAGCTAGATTTCCTGTACGAGGCAAAGAATAGTGAACAGTGTGTTTATAATTTCAAAAGATTATCTCCTCATCTT
GCACCTTATGTTTATATTCCCAAAGTTTATTGGAATTTGAGTACATCAAGATTGATGACGATGGAGTTCATGGATGGAGTCGGAGTCACTGATGTGAATGCCATCAAGCGACTTGGAATTCGGCCAAGTGATGTTGCAAAACTGATAAGCCAGGCTTTTGCAGAGATGATTTTCAAACATGGATTTGTGCATTGTGACCC
ACATGCCGCAAACATGATGGTTCAGGTTGCACCCTCTGGTAAAACAGGCATCCTGGGTAAAAAAAAACCACAGTTGGTATTACTTGACCATGGTTTATATAGGGTGCTTGAACCATCAACACGGGCACACTATGCTAAGCTTTGGAAGgtgtttaattaaacttttgaagttttgtttggcccaaaacttttagctttta
ttgcttctgctatatctttctaatttgtggatctaatggttcttcaaag
TTCATGTGCAGGCTCTTGTGTTTGCAGATGTCAAGGGGATAAAGGAGAATAGTGTCAAATTAGGTGCAGGTGAGGATCTCTATGTGCTTTTTGCTGGTATTCTAACAATGAGGCCATGGCAGAAGGTGCTTGATCCAGCAATCGACCATTT
ACGTTTGAATGGGACTGATGCTGATCGTGCTGAACTTCAGATGTATGCATCACAATATTTCATGCAAATTTCAGAGCTTTTGAAGAGACTTCCTCGTGTAATTCTATTGCTTCTGAAGACTAATGACTGCTTACGTGCGGTGGATAATGCCCTGGGAGCATCTGTCAACACGTATGTCATCATTGGGAGAGTCTCATCAA
TGGCAGTTGCTGAGATGCAGCTGTCACAAGGGTCATCTATTTGGTCAAGTTTGAGTATTTATTTAGATAAGTTGGAAGTGGAAGCTCGTCTCCTTGCTTTACAAGTTGCTGCTTGGCTTATGAGCCTTCAAAGATTTTTGAGCTCATTTGGTATGAGATTGGGGTTCAGGGAGCAGGTATTGTAGTATAGCAGGTATTTA
TACTCGGTTGTATTTCTGAGGATTCAATTCTTTCCATCAAGGTGAGGACCTTCATGGGACTCTTTTTTACATGGTAAGCGGAAATGTATTTCTCGGAAAAGGTATATGCAATTTTCTGTGACATGGATTGAAATATAATTTTTTTCAATACCTTGATTCAGAAAAAGCATGGTATCAAGAATAGTGCCATTGATATCAAT
AAGAGAACAATGTATCCTGTCATAATTTTCCTTGATGATGACAACTTTGATTTCCAAAAAATTGTTGTGTTGTCTATTTATTGCTTATTACATGC




Intron 2 GTATGATTTG ... TAAAATGAAG

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>TRINITY_DN101765_c0_g1_i5 from sample A5 / Example spliced isoform
CCCTTGAAAGCTTGAAGCCCTTCTGCTACAACTATAAAATACGTGTCCAAGGAAGAAACCGGGAATGTCGACAGAGGGAAGACCGACATGGCGTCCAGATCTCTCACTCTCACTCGCCTACTGCGCCCGCGATCTTGTTTATCATTGGGAAATCCTCAATTGCTTGGGCATTCTTCTTCATTCAGAAGGTGGTCGACAAC
AGATGCCCAGAACGTTCACAGGGGTGGGAAGTGGATTCGAAGGGTGATGTTCGGGGGATCGTTTGTAGGTCTGGGTGCCCTCGGCTGCCTGTCTCTCGGGTGGGACACCGATTTCTCAAGGACGCTCAAGGTCTTATGGGCGCTGCCTATTCGCCTTGGCCGGGATGCTCTCACTGCTGCCACCATTGCGATTGATTATG
AATATTCATTATGGGGATTGCCGGAAGGAAGCATTGAGAGAACAATGGCAAAACATGAAGTGCACCTTCGATGTGCGAATAGACTTCAACAATTATGTTTCCAGAATGGTGGAATCTATATTAAGCTTGGGCAACATATTGGGCAATTGGAATACCTAATTCCTGAGGAATACGTACAGGTTATGAGGGCATCAATGCTG
AACAAGTGTCCTGTATCTTCGTATGCACAAGTCTGTGATGTGTTTATGAAAGAACTAGGCAAGCTTCCACATGAAGTGTTCTTGGAGTTTGACCGGATTCCGTTGGCAAGTGCTTCACTTGCTCAAGTGCATGCTGCTCGCACCCATGATGGCAGGAAAGTTGCTGTCAAGGTTCAGCACACACATTTGACAGACACAGC
AGCTGTGGATACTGCCACTGTAGAGTTGGTTGTCAATATTTTGTATTGGATTTTTCCTGCATTTGATTATAGGTGGCTAATTGATGAAGTGCACGAGAGTCTTCCAAAGGAGCTAGATTTCCTGTACGAGGCAAAGAATAGTGAACAGTGTGTTTATAATTTCAAAAGATTATCTCCTCATCTTGCACCTTATGTTTATA
TTCCCAAAGTTTATTGGAATTTGAGTACATCAAGATTGATGACGATGGAGTTCATGGATGGAGTCGGAGTCACTGATGTGAATGCCATCAAGCGACTTGGAATTCGGCCAAGTGATGTTGCAAAACTGATAAGCCAGGCTTTTGCAGAGATGATTTTCAAACATGGATTTGTGCATTGTGACCCACATGCCGCAAACATG
ATGGTTCAGGTTGCACCCTCTGGTAAAACAGGCATCCTGGGTAAAAAAAAACCACAGTTGGTATTACTTGACCATGGTTTATATAGGGTGCTTGAACCATCAACACGGGCACACTATGCTAAGCTTTGGAAGGCTCTTGTGTTTGCAGATGTCAAGGGGATAAAGGAGAATAGTGTCAAATTAGGTGCAGGTGAGGATCT
CTATGTGCTTTTTGCTGGTATTCTAACAATGAGGCCATGGCAGAAGGTGCTTGATCCAGCAATCGACCATTTACGTTTGAATGGGACTGATGCTGATCGTGCTGAACTTCAGATGTATGCATCACAATATTTCATGCAAATTTCAGAGCTTTTGAAGAGACTTCCTCGTGTAATTCTATTGCTTCTGAAGACTAATGACT
GCTTACGTGCGGTGGATAATGCCCTGGTATCTCTTTCCCTCTATTTGTAAAGGAAACCAAAAGCAAAATCTTATTAGCGCTTCATTTCATGAGTATGTAAATATAGTATATACAAGTGGGATTTTATTTGGCATGTATTATCTACTTTTGAAAGCATCCTAGATTTCCTACTCATTTTTGTCAGAGCA


>TRINITY_DN101765_c0_g1_i3 from sample A5 / Example unspliced isoform:
CCCTTGAAAGCTTGAAGCCCTTCTGCTACAACTATAAAATACGTGTCCAAGGAAGAAACCGGGAATGTCGACAGAGGGAAGACCGACATGGCGTCCAGATCTCTCACTCTCACTCGCCTACTGCGCCCGCGATCTTGTTTATCATTGGGAAATCCTCAATTGCTTGGGCATTCTTCTTCATTCAGAAGGTGGTCGACAAC
AGATGCCCAGAACGTTCACAGGGGTGGGAAGTGGATTCGAAGGGTGATGTTCGGGGGATCGTTTGTAGGTCTGGGTGCCCTCGGCTGCCTGTCTCTCGGGTGGGACACCGATTTCTCAAGGACGCTCAAGGTCTTATGGGCGCTGCCTATTCGCCTTGGCCGGGATGCTCTCACTGCTGCCACCATTGCGATTGATTATG
AATATTCATTATGGGGATTGCCGGAAGGAAGCATTGAGAGAACAATGGCAAAACATGAAGTGCACCTTCGATGTGCGAATAGACTTCAACAATTATGTTTCCAGAATGGTGGAATCTATATTAAGCTTGGGCAACATATTGGGCAATTGGAATACCTAATTCCTGAGGAATACGTACAGGTTATGAGGGCATCAATGCTG
AACAAGTGTCCTGTATCTTCGTATGCACAAGTCTGTGATGTGTTTATGAAAGAACTAGGCAAGCTTCCACATGAAgtatgatttgaacctagtcttttgtttacaactttacattgcagtgctgaaaatgacatttccataatgttagaaatgttatgttcagaacttagagagttgaatcatattttctagatttctct
cgagtaaaaaaatgtggaggtctcgcacacttaatcatggtatatcctccttttttttaaaatgaag
GTGTTCTTGGAGTTTGACCGGATTCCGTTGGCAAGTGCTTCACTTGCTCAAGTGCATGCTGCTCGCACCCATGATGGCAGGAAAGTTGCTGTCAAGGTTCAGCACACACATTTGACAGACACAGCAGCTGTGG
ATACTGCCACTGTAGAGTTGGTTGTCAATATTTTGTATTGGATTTTTCCTGCATTTGATTATAGGTGGCTAATTGATGAAGTGCACGAGAGTCTTCCAAAGGAGCTAGATTTCCTGTACGAGGCAAAGAATAGTGAACAGTGTGTTTATAATTTCAAAAGATTATCTCCTCATCTTGCACCTTATGTTTATATTCCCAAA
GTTTATTGGAATTTGAGTACATCAAGATTGATGACGATGGAGTTCATGGATGGAGTCGGAGTCACTGATGTGAATGCCATCAAGCGACTTGGAATTCGGCCAAGTGATGTTGCAAAACTGATAAGCCAGGCTTTTGCAGAGATGATTTTCAAACATGGATTTGTGCATTGTGACCCACATGCCGCAAACATGATGGTTCA
GGTTGCACCCTCTGGTAAAACAGGCATCCTGGGTAAAAAAAAACCACAGTTGGTATTACTTGACCATGGTTTATATAGGGTGCTTGAACCATCAACACGGGCACACTATGCTAAGCTTTGGAAGGCTCTTGTGTTTGCAGATGTCAAGGGGATAAAGGAGAATAGTGTCAAATTAGGTGCAGGTGAGGATCTCTATGTGC
TTTTTGCTGGTATTCTAACAATGAGGCCATGGCAGAAGGTGCTTGATCCAGCAATCGACCATTTACGTTTGAATGGGACTGATGCTGATCGTGCTGAACTTCAGATGTATGCATCACAATATTTCATGCAAATTTCAGAGCTTTTGAAGAGACTTCCTCGTGTAATTCTATTGCTTCTGAAGACTAATGACTGCTTACGT
GCGGTGGATAATGCCCTGG




Intron 3 GTGTTTAATT ... TCGTGTGCAG

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A914.293005
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>TRINITY_DN129316_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
GTGCTGTGGTTAGGTATCCCTTGAAAGCTTGAAGCCCTTCTGCTACAACTATAAAATACGTGTCCAAGGGAGAAACCGGGAATGTCGACAGAGGGAAGACCGACATGGCGTCCAGATCTCTCACTCTCACTCGCCTACTGCGCCCGCGATCTTGTTTATCAATGGGAAATCCTCAATTGCTTGGGCATTCTTCTTCATTC
AGAAGGTGGTCGACAACAGATGCCCAGAACGTTCACAGGGGCGGGAAGTGGATTCGAAGGGTGATGTTCGGGGGATCGTTTGTAGGTCTGGGTGCCCTCGGCTGCCTGTCTCTCGGGTGGGACACCGATTTCTCAAGGACGCTCAAGGTCTTATGGGCGCTGCCTATTCGCCTTGGCCGGGATGCTCTCACTGCTGCCAC
CATTGCGATTGATTATGAATATTCATTATGGGGATTGCCGGAAGGAAGCATTGAGAGAACAATGGCAAAACATGAAGTGCACCTTCGATGTGCGAATAGACTTCAACAATTATGTTTCCAGAATGGTGGAATCTATATTAAGCTTGGGCAACATATTGGGCAATTGGAATACCTAATTCCTGAGGAATACGTACAGGTTA
TGAGGGCATCAATGCTGAACAAGTGTCCTGTATCTTCGTATGCACAAGTCTGTGATGTGTTTATGAAAGAACTAGGCAAGCTTCCACATGAAGTGTTCTTGGAGTTTGACCGGATTCCGTTGGCAAGTGCTTCACTTGCTCAAGTGCATGCTGCTCGCACCCATGATGGCAGGAAAGTTGCTGTCAAGGTTCAGCACACA
CATTTGACAGACACAGCAGCTGTGGATACTGCCACTGTAGAGTTGGTTGTCAATATTTTGTATTGGATTTTTCCTGCATTTGATTATAGGTGGCTAATTGATGAAGTGCACGAGAGTCTTCCAAAGGAGCTAGATTTCCTGTACGAGGCAAAGAATAGTGAACAGTGTGTTTATAATTTCAAAAGATTATCTCCTCATCT
TGCACCTTATGTTTATATTCCCAAAGTTTATTGGAATTTGAGTACATCAAGATTGATGACGATGGAGTTCATGGATGGAGTCGGAGTCACTGATGTGAATGCCATCAAGCGACTTGGAATTCGGCCAAGTGATGTTGCAAAACTGATAAGCCAGGCTTTTGCAGAGATGATTTTCAAACATGGATTTGTGCATTGTGACC
CACATGCCGCAAACATGATGGTTCAGGTTGCACCCTCTGGTAAAACAGGCATCCTGGGTAAAAAAAAACCACAGTTGGTATTACTTGACCATGGTTTATATAGGGTGCTTGAACCATCAACACGGGCACACTATGCTAAGCTTTGGAAGGCTCTTGTGTTTGCAGATGTCAAGGGGATAAAGGAGAATAGTGTCAAATTA
GGTGCAGGTGAGGATCTCTATGTGCTTTTTGCTGGTATTCTAACAATGAGGCCATGGCAGAAGGTGCTTGATCCAGCAATCGACCATTTACGTTTGAATGGGACTGATGCTGATCGTGCTGAACTTCAGATGTATGCATCACAATATTTCATGCAAATTTCAGAGCTTTTGAAGAGACTTCCTCGTGTAATTCTATTGCT
TCTGAAGACTAATGACTGCTTACGTGCGGTGGATAATGCCCTGGGAGCATCTGTCAACACGTATGTCATCATTGGGAGAGTCTCATCAATGGCAGTTGCTGAGATGCAGCTGTCACAAGGGTCATCTATTTGGTCAAGTTTGAGTATTTATTTAGATAAGTTGGAAGTGGAAGCTCGTCTCCTTGCTTTACAAGTTGCTG
CTTGGCTTATAAGCCTTCAAAGATTTTTGAGCTCATTTGGTATGAGATTGGGGTTCAGGGAGCAGGTATTGTAGTATAGCAGGTATTTATACTCGGTTGTATTTCTGAGGATTCAATTCTTTCCATCAAGGTGAGGACCTTCATGGGACTCTTTTTTACATGGTAAGCGGAAATGTATTTCTCGGAAAAGGTATATGCAA
TTTTCTG


>TRINITY_DN129316_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
ACACTATGCTAAGCTTTGGAAGgtgtttaattaaacttttgaagttttgtttggcccaaaacttttagcttttattgcttctgctatatctgccttcagaaatatctttctaatttgtggatctaatggttcttcaaagttcgtgtgcagGCTCTTGTGTTTGCAGATGTCAAGGGGATAAAGGAGAATAGTGTCAAATT
AGGTGCAGGTGAGGATCTCTATGTGCTTTTTGCTGGTATTCTAACAATGAGGCCATGGCAGAAGGTGCTTGATCCAGCAATCGACCATTTACGTTTGAATGGGACTGATGCTGATCGTGCTGAACTTCAGGTATTTCTTTCATTTGTTCTGTAGTATGTGTGTGCTCTGTCATTGGTTACTATGTGAACTTTATGATATA
TTTGATTCTGTGCATTATTAAAAATAAAAAATAACAATGCCTTTATGTTTAAGTATCTGCCTTGAGATTGGAAGAGGACTCACTTTATTTGATTCTGTGCATTATTACAAATAAAAAA




Intron 4 GTGTTTAATT ... TCATGTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN41701_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform
TGCTGTGGTTAGGTATCCCTTGAAAGCTTGAAGCCCTTCTGCTACAACTATAAAATACGTGTCCAAGGGAGAAACCGGGAATGTCGACAGAGGGAAGACCGACATGGCGTCCAGATCTCTCACTCTCACTCGCCTACTGCGCCCGCGATCTTGTTTATCAATGGGAAATCCTCAATTGCTTGGGCATTCTTCTTCATTCA
GAAGGTGGTCGACAACAGATGCCCAGAACGTTCACAGGGGTGGGAAGTGGATTCGAAGGGTGATGTTCGGGGGATCGTTTGTAGGTCTGGGTGCCCTCGGCTGCCTGTCTCTCGGGTGGGACACCGATTTCTCAAGGACGCTCAAGGTCTTATGGGCGCTGCCTATTCGCCTTGGCCGGGATGCTCTCACTGCTGCCACC
ATTGCGATTGATTATGAATATTCATTATGGGGATTGCCGGAAGGAAGCATTGAGAGAACAATGGCAAAACATGAAGTGCACCTTCGATGTGCGAATAGACTTCAACAATTATGTTTCCAGAATGGTGGAATCTATATTAAGCTTGGGCAACATATTGGGCAATTGGAATACCTAATTCCTGAGGAATACGTACAGGTTAT
GAGGGCATCAATGCTGAACAAGTGTCCTGTATCTTCGTATGCACAAGTCTGTGATGTGTTTATGAAAGAACTAGGCAAGCTTCCACATGAAGTGTTCTTGGAGTTTGACCGGATTCCGTTGGCAAGTGCTTCACTTGCTCAAGTGCATGCTGCTCGCACCCATGATGGCAGGAAAGTTGCTGTCAAGGTTCAGCACACAC
ATTTGACAGACACAGCAGCTGTGGATACTGCCACTGTAGAGTTGGTTGTCAATATTTTGTATTGGATTTTTCCTGCATTTGATTATAGGTGGCTAATTGATGAAGTGCACGAGAGTCTTCCAAAGGAGCTAGATTTCCTGTACGAGGCAAAGAATAGTGAACAGTGTGTTTATAATTTCAAAAGATTATCTCCTCATCTT
GCACCTTATGTTTATATTCCCAAAGTTTATTGGAATTTGAGTACATCAAGATTGATGACGATGGAGTTCATGGATGGAGTCGGAGTCACTGATGTGAATGCCATCAAGCGACTTGGAATTCGGCCAAGTGATGTTGCAAAACTGATAAGCCAGGCTTTTGCAGAGATGATTTTCAAACATGGATTTGTGCATTGTGACCC
ACATGCCGCAAACATGATGGTTCAGGTTGCACCCTCTGGTAAAACAGGCATCCTGGGTAAAAAAAAACCACAGTTGGTATTACTTGACCATGGTTTATATAGGGTGCTTGAACCATCAACACGGGCACACTATGCTAAGCTTTGGAAGGCTCTTGTGTTTGCAGATGTCAAGGGGATAAAGGAGAATAGTGTCAAATTAG
GTGCAGGTGAGGATCTCTATGTGCTTTTTGCTGGTATTCTAACAATGAGGCCATGGCAGAAGGTGCTTGATCCAGCAATCGACCATTTACGTTTGAATGGGACTGATGCTGATCGTGCTGAACTTCAGATGTATGCATCACAATATTTCATGCAAATTTCAGAGCTTTTGAAGAGACTTCCTCGTGTAATTCTATTGCTT
CTGAAGACTAATGACTGCTTACGTGCGGTGGATAATGCCCTGGTATCTCTTTCCCTCTATTTGTAATGGAAACCAAAAGCAAAATCTTATTAGCGCTTCATTTCATGAGTGTGTAAATATAGTATATACAAGTGGGATTTTATTTGGCATGTATTATCTACTTTTGAAAGCATCCTAGATTTCCTACTCATTTTTGTCAG
AGCAGTCTAAACATTACACATTTT


>TRINITY_DN41701_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TGCTGTGGTTAGGTATCCCTTGAAAGCTTGAAGCCCTTCTGCTACAACTATAAAATACGTGTCCAAGGGAGAAACCGGGAATGTCGACAGAGGGAAGACCGACATGGCGTCCAGATCTCTCACTCTCACTCGCCTACTGCGCCCGCGATCTTGTTTATCAATGGGAAATCCTCAATTGCTTGGGCATTCTTCTTCATTCA
GAAGGTGGTCGACAACAGATGCCCAGAACGTTCACAGGGGTGGGAAGTGGATTCGAAGGGTGATGTTCGGGGGATCGTTTGTAGGTCTGGGTGCCCTCGGCTGCCTGTCTCTCGGGTGGGACACCGATTTCTCAAGGACGCTCAAGGTCTTATGGGCGCTGCCTATTCGCCTTGGCCGGGATGCTCTCACTGCTGCCACC
ATTGCGATTGATTATGAATATTCATTATGGGGATTGCCGGAAGGAAGCATTGAGAGAACAATGGCAAAACATGAAGTGCACCTTCGATGTGCGAATAGACTTCAACAATTATGTTTCCAGAATGGTGGAATCTATATTAAGCTTGGGCAACATATTGGGCAATTGGAATACCTAATTCCTGAGGAATACGTACAGGTTAT
GAGGGCATCAATGCTGAACAAGTGTCCTGTATCTTCGTATGCACAAGTCTGTGATGTGTTTATGAAAGAACTAGGCAAGCTTCCACATGAAGTGTTCTTGGAGTTTGACCGGATTCCGTTGGCAAGTGCTTCACTTGCTCAAGTGCATGCTGCTCGCACCCATGATGGCAGGAAAGTTGCTGTCAAGGTTCAGCACACAC
ATTTGACAGACACAGCAGCTGTGGATACTGCCACTGTAGAGTTGGTTGTCAATATTTTGTATTGGATTTTTCCTGCATTTGATTATAGGTGGCTAATTGATGAAGTGCACGAGAGTCTTCCAAAGGAGCTAGATTTCCTGTACGAGGCAAAGAATAGTGAACAGTGTGTTTATAATTTCAAAAGATTATCTCCTCATCTT
GCACCTTATGTTTATATTCCCAAAGTTTATTGGAATTTGAGTACATCAAGATTGATGACGATGGAGTTCATGGATGGAGTCGGAGTCACTGATGTGAATGCCATCAAGCGACTTGGAATTCGGCCAAGTGATGTTGCAAAACTGATAAGCCAGGCTTTTGCAGAGATGATTTTCAAACATGGATTTGTGCATTGTGACCC
ACATGCCGCAAACATGATGGTTCAGGTTGCACCCTCTGGTAAAACAGGCATCCTGGGTAAAAAAAAACCACAGTTGGTATTACTTGACCATGGTTTATATAGGGTGCTTGAACCATCAACACGGGCACACTATGCTAAGCTTTGGAAGgtgtttaattaaacttttgaagttttgtttggcccaaaacttttagctttta
ttgcttctgctatatctttctaatttgtggatctaatggttcttcaaagttcatgtgcag
GCTCTTGTGTTTGCAGATGTCAAGGGGATAAAGGAGAATAGTGTCAAATTAGGTGCAGGTGAGGATCTCTATGTGCTTTTTGCTGGTATTCTAACAATGAGGCCATGGCAGAAGGTGCTTGATCCAGCAATCGACCATTT
ACGTTTGAATGGGACTGATGCTGATCGTGCTGAACTTCAGATGTATGCATCACAATATTTCATGCAAATTTCAGAGCTTTTGAAGAGACTTCCTCGTGTAATTCTATTGCTTCTGAAGACTAATGACTGCTTACGTGCGGTGGATAATGCCCTGGGAGCATCTGTCAACACGTATGTCATCATTGGGAGAGTCTCATCAA
TGGCAGTTGCTGAGATGCAGCTGTCACAAGGGTCATCTATTTGGTCAAGTTTGAGTATTTATTTAGATAAGTTGGAAGTGGAAGCTCGTCTCCTTGCTTTACAAGTTGCTGCTTGGCTTATGAGCCTTCAAAGATTTTTGAGCTCATTTGGTATGAGATTGGGGTTCAGGGAGCAGGTATTGTAGTATAGCAGGTATTTA
TACTCGGTTGTATTTCTGAGGATTCAATTCTTTCCATCAAGGTGAGGACCTTCATGGGACTCTTTTTTACATGGTAAGCGGAAATGTATTTCTCGGAAAAGGTATATGCAATTTTCTGTGACATGGATTGAAATATAATTTTTTTCAATACCTTGATTCAGAAAAAGCATGGTATCAAGAATAGTGCCATTGATATCAAT
AAGAGAACAATGTATCCTGTCATAATTTTCCTTGATGATGACAACTTTGATTTCCAAAAAATTGTTGTGTTGTCTATTTATTGCTTATTACATGC