NA ----> NA
Intron 1 GTTGATATCA ... TTTGACGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.94 | 42 | 13 | 12 |
| A2 | 28.3 | 19 | 7 | 8 |
| A3 | 14.29 | 27 | 5 | 4 |
| A4 | 27.54 | 25 | 9 | 10 |
| A5 | 27.27 | 4 | 0 | 3 |
| A6 | 30.43 | 56 | 20 | 29 |
| A7 | 27.3 | 205 | 79 | 75 |
| A8 | 25.77 | 252 | 71 | 104 |
| A9 | 23.58 | 209 | 54 | 75 |
| A10 | 23.57 | 154 | 43 | 52 |
>TRINITY_DN116100_c1_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoformGCTGTGAATACCAGAAAGTTAGAAACTGAGCTTACCAAGGCAAATTTAACCACTATGAAAGTTTCTCATGAGATGAATTAAATAAATCCAATACCAGATCCAATTTGCAAAACATAAATTATCTGATAATAACCTCTCTTGCAATTCTCTGCTCCTCACTAAATTTGATATTGAATTTCACCATTTTCTCTGCTATTAGA
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TCTTTTTACAGAGAGTAAGAAACACATTCTTTTTACAGCCAATACCTGTGAGTTTCCATCCTCTTACCTGTGCCACGAATATAAGCAAAAGAACAGAAACAAATGTGTAAAGGAATAAGAAATATATTCTTTTGATTTCCATCTCAGATATAACATGCATAATTATTTTATCTATTTCTGATTTTGGGTTTTTTCTTATT
TGAAGTCCGATTGAATGTCTATGTTCCTCTTTTTTGTGAATAGAAACAAAATGTAGTCTGATGGTTTATCTTGTATACAAATATCGGCTGGAAAGCCCTTTTACAAAGTGAGACCATCCAGATGTGGTTGTGGACTCACACCATGCAAGCAGGCATGCGCACACAAAAAGTTGAAGCAACCCTCAGCCAGgttgatatca
ctgacgacacctgatcagtttttacttttatattttggtatcagtggattggtattataatttattgaataatttgatgcaggagcgtaccattgtattgatgttatgatttattgcatgatttgacgcagGAGCATACCGATAAATGAGAAATTGGGGACAGGTGGGAGTCGGAAACAACAGCAATTTAGCATATTAGC
ATGGTTAGATCAGGAGGTCCGGCCGTAGGGCCGGCTATGAGCCCTACTAATACAAATGAAGATCTATTCAGTGTTCTTATTGTGATAATCAGCCCTAGGTGTAAATGGGGGGGTCTTCACAGTTTGATCCATGGATTTCTCAGGCTTTGTTTTCAGTGTTCTACTTGTCATAGTCATTCCTTGGTGTAGAACATGTAGTG
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ATGGCAAGCAAATTCAAATCAAATTGCATACAGCACTAACCATTGTAGTAATGGTGTTTTATGCTGCTTCTGCATATGGTGAACTGATTTTCCAAAAAAAGATTTGTCAATTCCTAATTTTTTAAAATTGATTCGCTCAAATTCCATGGAAAAACTTAAAATTTTCC