NA ----> NA


Intron 1 GTTATAAACT ... AATGTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A131.9810144.551
A239.958770.545.5
A325.6810935.540.5
A437.95696123.5
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A618.532015241
A721.91408100132
A825.02403129143.5
A916.8738680.579
A1018.772775475.5



>TRINITY_DN46503_c1_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoform
TTTCCACCTAGATTCTCTGATATAGTCTAGTGGACAGGGTCAGACTTGTTTAGCACAATTTCAGATTCTCAACCTGGGAAGCAAGCCCAGATGCAGGTTGGGCAGCACTGTCAGGCCCACTGTTACAGCAATCTCAACCCCAAAACATTCCAATGCGGCAGTTAATGGAACCACCTCCAGTGCAGCCTTCAGTTCAGTCA
TAG
ATAATGCCTGGCATGGTGTCTTCACAAATGGTGCCCAATTTCCACCCAGATTCTCTGAGATAGTCTGGTTGGCCTCAACAACCTTCCATCCAACTAAATCCGGGGAGTCTACATGAATGGCCACTACCACAACAACCAAGTACATCGTTGCAATCTCTTCCACCTGCAGGTCAGGTGCATAATCAGCCAACATCAGA
GGCACCTTTTCAGGAAACAGAGTATCAGGTTTAGTCTTAACCAGCCACCTAATTTGAGAAAATACAAATTCCTTTCCTTTATTGTAAGCAACGTAATTGTCTGTGAACACAAAATTCCTTAGTGAAAGGCCACAGAATAACTCACATACGATTGACGAGGAAGCTGTCGTATGATTCAACAAGAGGAGGATGTTATCGTT
TGCGTCATAACAAGTGGAAGAGTAGCATATCTTGACTTATGGAAGCATCGTAACATTTAAGGAACACACGATTCCTTTTTGTTTTGTGTTATTTGAGGCATGTAAGTCTTCAAGATGCCACATTAAGTCGTTCATGTGGCAAGTCAAAATATTTATAATTTATTTAGAATAAAATAAAGATTTTTTAATATAATAAAAGT
ATACCATAAAATTTTATGTCACCAAAGATACCTGAGAGGGGTTAGTATTAATCAAGGAAGTCCAAATTACAAATAGAAGTTATTGAAGTAC


>TRINITY_DN46503_c1_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TTTCCACCTAGATTCTCTGATATAGTCTAGTGGACAGGGTCAGACTTGTTTAGCACAATTTCAGATTCTCAACCTGGGAAGCAAGCCCAGATGCAGGTTGGGCAGCACTGTCAGGCCCACTGTTACAGCAATCTCAACCCCAAAACATTCCAATGCGGCAGTTAATGGAACCACCTCCAGTGCAGCCTTCAGTTCAGgtt
ataaacttatacaaactgatttctaggtgtactcgatgtttcttttccatgtgtttttcatttctgagtcctgatatctcaactcaggcagataatgcttggcatggtgtatccacaaatggtattttcagtttctcttaaatttagtattattgactatggaatttatttcaaatggagtatatagttcataatagtta
ataaatgttatttatgacatatttttcttctgaatgttgatatctcaaatgcattgttttgtgtctctgaatgtttcag
TCATAGATAATGCCTGGCATGGTGTCTTCACAAATGGTGCCCAATTTCCACCCAGATTCTCTGAGATAGTCTGGTTGGCCTCAACAACCTTCCATCCAACTAAATCCGGGGAGTCTACATG
AATGGCCACTACCACAACAACCAAGTACATCGTTGCAATCTCTTCCACCTGCAGGTCAGGTGCATAATCAGCCAACATCAGAGGCACCTTTTCAGGAAACAGAGTATCAGGTTTAGTCTTAACCAGCCACCTAATTTGAGAAAATACAAATTCCTTTCCTTTATTGTAAGCAACGTAATTGTCTGTGAACACAAAATTCC
TTAGTGAAAGGCCACAGAATAACTCACATACGATTGACGAGGAAGCTGTCGTATGATTCAACAAGAGGAGGATGTTATCGTTTGCGTCATAACAAGTGGAAGAGTAGCATATCTTGACTTATGGAAGCATCGTAACATTTAAGGAACACACGATTCCTTTTTGTTTTGTGTTATTTGAGGCATGTAAGTCTTCAAGATGC
CACATTAAGTCGTTCATGTGGCAAGTCAAAATATTTATAATTTATTTAGAATAAAATAAAGATTTTTTAATATAATAAAAGTATACCATAAAATTTTATGTCACCAAAGATACCTGAGAGGGGTTAGTATTAATCAAGGAAGTCCAAATTACAAATAGAAGTTATTGAAGTAC




Intron 2 GTATTTTCAA ... ACATTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A139.7399.128.665
A246.8382.123.771.9
A333.491051852
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A541.5734.312.624
A626.63181.4664
A727.38341.349.1125.3
A831.51392.343.4178
A923.83319.425.796.3
A1030.49230.33597



>TRINITY_DN135202_c0_g1_i15 from sample A1 / Example spliced isoform
ATGGAACCACCTCCAGTGCAGCCTTCAGTTCAGTCATAGATAATGCCTGGCATGGTGTCTTCACAAATGGTGCCCAATTTCCACCCAGATTCTCTGAGATAGTCTGGTTGGCCTCAACAACCTTCCATCCAACTAAATCCGGGGAGTCTACATGAATGGCCACTACCACAACAACCAAGTACATCGTTGCAATCTCTTCC
ACCTGCAGGTCAGGTGCATAATCAGCCAACATCAGAGGCACCTTTTCAGGAAACAGAGTATCAGGTTTAGTCTTAACCAGCCACCTAATTTGAGAAAATACAAATTCCTTTCCTTTATTGTAAGCAACGTAATTGTCTGTGAACACAAAATTCCTTAGTGAAAGGCCACAGAATAACTCACATACGATTGACGAGGAAGC
TGTCGTATGATTCAACAAGAGGAGGATGTTATCGTTTGCGTCATAACAAGTGGAAGAGTAGCATATCTTGACTTATGGAAGCATCGTAACATTTAAGGAACACACGATTCCTTTTTGTTTTGTGTTATTTGAGGCATGTAAGTCTTCAAGATGCCACATTAAGTCGTTCATGTGGCAAGTCAAAATATTTATAATTTATT
TAGAATAAAATAAAGATTTTTTAATATAATAAAAGTATACCATAAAATTTTATGTCACCAAAGATACCTGAGAGGGGTTAGTATTAATCAAGGAAGTCCAAATTACAAATAGAAGTTATTGAAGTACATAATGGAATGTTTTTATTTGTTTGTTCACTTGTAATAAAGAATTTACATATAGTTATTTAACCATGTAACTA
TAATGGAGAATTTTTTTCCTACTAAATTGTAATCAAGAGTTGTATATATAAATCAATGAAGTAATAAAAAAATATTATAATCAAGAATGCCATCATAAATTACGATA


>TRINITY_DN135202_c0_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CAAATGCATTGTTTTGTGTCTCTGAATGTTTCAGTCATAGATAATGCCTGGCATGGTGTCTTCACAAATGgtattttcaattttctcttaaacttagtatcattgactatggaatttctttcaaatggagtatatagttaattaatgttatttatgacacatttgcagGTGCCCAATTTCCACCCAGATTCTCTGAGATA
GTCTGGTTGGCCTCAACAACCTTCCATCCAACTAAATCCGGGGAGTCTACATGAATGGCCACTACCACAACAACCAAGTACATCGTTGCAATCTCTTCCACCTGCAGGTCAGGTGCATAATCAGCCAACATCAGAGGCACCTTTTCAGGAAACAGAGTATCAGGTTTAGTCTTAACCAGCCACCTAATTTGAGAAAATAC
AAATTCCTTTCCTTTATTGTAAGCAACGTAATTGTCTGTGAACACAAAATTCCTTAGTGAAAGGCCACAGAATAACTCACATACGATTGACGAGGAAGCTGTCGTATGATTCAACAAGAGGAGGATGTTATCGTTTGCGTCATAACAAGTGGAAGAGTAGCATATCTTGACTTATGGAAGCATCGTAACATTTAAGGAAC
ACACGATTCCTTTTTGTTTTGTGTTATTTGAGGCATGTAAGTCTTCAAGATGCCACATTAAGTCGTTCATGTGGCAAGTCAAAATATTTATAATTTATTTAGAATAAAATAAAGATTTTTTAATATAATAAAAGTATACCATAAAATTTTATGTCACCAAAGATACCTGAGAGGGGTTAGTATTAATCAAGGAAGTCCAA
ATTACAAATAGAAGTTATTGAAGTACATAATGGAATGTTTTTATTTGTTTGTTCACTTGTAATAAAGAATTTACATATAGTTATTTAACCATGTAACTATAATGGAGAATTTTTTTCCTACTAAATTGTAATCAAGAGTTGTATATATAAATCAATGAAGTAATAAAAAAATATTATAATCAAGAATGCCATCATAAATT
ACGATA




Intron 3 GTATTTTCAA ... TATGTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A136.71754938
A236.13614029
A334.91552435
A446.03343127
A538.64271717
A614.2969185
A726.612118964
A824.572188359
A912.321532617
A1023.51534450



>TRINITY_DN135202_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
GACCTGATGGGAATTGATCTAGAAACCTCTGTAAATTTCATGGTAACCCCAAAGGACCTGATGGGAATTGATCTAGAGACCTCTGTAAATTTCACATGAGTATCTATAAATCGAGCTTAGCTCTTGGAGCTAATTGTTATATAATGTTGCACGAGTATCTACAAATCGAGCTTAGCTCTTGGGGATAATTGTTGTATAAT
GTTATGGACCATAGTTCATTTAATGGTTTATATTTCATGACCTAGAGCAGTGGCCTATTATTGCATTCCGATATATATCCCTTTTGATCAGTTCATGATTATTCCTATTCTTTTTGTTATAATGCATTTTCCAAGGAAATAATATCATCCCAATGGGGGCGCTAATACTAGGCCAGCCTTGGCAGAGTGCTCCCCCTTCT
TCCTCGGAATTTTCGGATGGAAGGTGGAATGACCGCCAGCCTCAAAAGCGGCTGGTAACCCCAAAGGACCTGATGGGAATTGATCTAGAGACCTCTGTAAATGTCACGAGTATCTACAAATCGAACTTAGCTCTTGGGGCTAATTGCTGTATAATGTTATGGACCACGGTTCATTTAATGGTTTATATTTCATGACCTAG
GCTATGATTTTTCACATGATGGTGATTGTGACATTTATTCTTGGTAGCATTAGCGATTATGTTGCAGTTTTATGGTTGCATGTAAATTGTGTCATCGTGTTCCATTGTTGAAATGTTGTAGGGTGATTTATTTATTTATTTTGGAATGCATTGTGGACGTGGAGACCTAGCTAGTGGAAACTGGTACGCACTTGTATCTA
TATCTGCTCTCCATTGTAATGATATAAGCCATGCCTTTAGTGTGCCTATGGTTTACCTGGGCTTAGCACATAGGAGTTTCGTGAAATTACAGTGAGGCTGAAGGAGTTGTGTTGCTAGATAATAGTCTCTGAGGCGCCAATGTTAGTTATCCTGCTATATGATGGCGTGTTGATTCATAGTCTCTTTGATGGGGTAGAGA
TGAAGACATGGCGCTCACCTTTGGACTAGGGTCTCCATTGGGAGGTTTGCAAGCTGGCCATATAACTTCCCATGAATGCCCATTACATAGACAATCCATTGGCTTGGTAGTTGCATGCTCTTACTTTCTTGAGCAAGCAGGCATTGCGAACTACCGATGTATTAATTCTTCATTTGTGATAATATGTTTCAGGTGAAGGG
AAATTAATCTCTAACAATTACTACCAACATGAGACTATATTGCCAATTCCTCCTATGGACGCTGTCGTGTAGAGGCTAGTGTTCAAGAGCAGGGTTCCTTCCAACTCAATGAGGTCTTTTTAACTGTTGTCAATATTCCATCCAGGGACTGAAGAATGCGAGTGGTATTTCTCTGGTCTAGTTTCTTAACTATGGATTTT
CATCCAGGCTGCATTCCAATTCCTTTATTCAATCCCCAGCAAGCAGTCTTTCTTCCAAAATCCTTTCCACAATCAACCAATAAAAAATGTATCTCCTTGTCAACTGGGGGTGACTTGCATATTGAGTACATTTTTCATACCCGTTTGTCACGTTTCATCCCCATGTGTGAACTCATACCCGTTCCCATTACCTATTGAAA
AGCGATTGAGATTGGCCTCATGGTCGTGTGTCAAACTGGTTTCTAGGTGTACTCGGTGTTTATTTTCCAAGTGTTGTTCATTTCTGAATCTTGATATCTCAACTGCATCGTTTTGTGTCTCTGAATGTTTCAGGCACAGATAATGCTTGGCATGGCGTCTCCACAAAAGGCACAGATAATGCTTGGCATGGTGTCTCCAC
AAATGGTGCCCAATTTCCACCCAGATTCTCTGAGATAGTCTGGTTGGCCTCAACAACCTTCCATCCAACTAAATCCGGGGAGTCTACATGAATGGCCACTACCACAACAACCAAGTACATCGTTGCAATCTCTTCCACCTGCAGGTCAGGTGCATAATCAGCCAACATCAGAGGCACCTTTTCAGGAAACAGAGTATCAG
GTTTAGTCTTAACCAGCCACCTAATTTGAGAAAATACAAATTCCTTTCCTTTATTGTAAGCAACGTAATTGTCTGTGAACACAAAATTCCTTAGTGAAAGGCCACAGAATAACTCACATACGATTGACGAGGAAGCTGTCGTATGATTCAACAAGAGGAGGATGTTATCGTTTGCGTCATAACAAGTGGAAGAGTAGCAT
ATCTTGACTTATGGAAGCATCGTAACATTTAAGGAACACACGATTCCTTTTTGTTTTGTGTTATTTGAGGCATGTAAGTCTTCAAGATGCCACATTAAGTCGTTCATGTGGCAAGTCAAAATATTTATAATTTATTTAGAATAAAATAAAGATTTTTTAATATAATAAAAGTATACCATAAAATTTTATGTCACCAAAGA
TACCTGAGAGGGGTTAGTATTAATCAAGGAAGTCCAAATTACAAATAGAAGTTATTGAAGTACATAATGGAATGTTTTTATTTGTTTGTTCACTTGTAATAAAGAATTTACATATAGTTATTTAACCATGTAACTATAATGGAGAATTTTTTTCCTACTAAATTGTAATCAAGAGTTGTATATATAAATCAATGAAGTAA
TAAAAAAATATTATAATCAAGAATGCCATCATAAATTACGATAGGAAAATGAAGATCTCAATAAGAAATTTGAAGAAAATAGAAAGGGATGGCTAGATTCCTAGGTTAATAAGAAATTTGAAGAAAATAGAAAACAAAAAAATATTATAATCAAGAATGCAATCATAAATTACGATAGGAAAATCAAGATCTCAATAAGA
AATTTGAAGAAAATAGAAAGGGATGAGGAAAATGAAGATCTCAATAAGAAATTTGATGAAAATAAAAAGGGATGAAGAAAATAGAAAGGGATGGCTAGATTCCTAGGTTAATAAGAAATTTGAAGAAAATAGAAAGGGATGCTAGATTTCTAGGTTAACAAGAAATTTCAACTCATTTCAGCAGAAAATTCAACCTTCCG
AATTATAACTCCTCCTTGTTCAGCAGAAGATTCAATTTCTTGAATTATTCTCGTTTGACTTTTAGTCCCCTCCCTCATTTCTTCTACATTGTATTCTGTCTGTTGGAATCGACTTCCAAGAGGCTCTTATTGGAATAGGATTCCAACAGGTTCCTGAGGGGGTTTATGTTTTGAGGGTCTTTTATTGTCACGACTTCCTC
CAAATCCCGTTCTTGCTAATTCTGTGTTATTTTGTATTTTCGGCAGCTGGAAAAATTGGGTTAAAATTTTATTAGCTATTGAAAGCTCTGCTTTCAGTGGCTAATGAACAAGTAGCGTGTTCGCCTAAGCCACCGAGGCACCTTTAGACGTGTGGAGTTGGCCTCTTTTTTCGGTAACTAGATGAGTCCCACCTTTATAT
CCTAAGCCGCCGAAAATTGGAGTTTTTGGTAGCTAATGAACAATTTCCTATGTTCGCCTAAGCCACTGAAAACTGTGCTTGGTCTAGCCTGGAAAAATTTTGCAAAACTGTGTTTCCTGACTTCTGCTACTCGTCTTCTTGCTGTTGGGATTTCTCTTCATCCTCGGCCGAAACTGGAGTGTTAGCAAAACTGACTGCTG
CTGCTGCTAAGGTGTCAAGGTCCGAGGGTACCTTAGGCTGGGGTTTCGGAGTCATTTTCTCACCTCCGAGAAGCTCAACCTTCCTACTCAGTCTGATATTGTCTCTTATTAGTCTTATATTTCTCCCTTTCAACTTGCTATGCTTTTTGGTTAACCCTTAAAAAGAGACATAAAATTCAGCTTGCTTTTCAGTCAAGCTT
TCATTCTTCTTCTTGATCACCCTTTGAAGTAATTTGATATCCCAATAATCTTCTGTGATGAAGATTATTGGGATAATTAATTAATGTCTAACATCGGGTGATGTTCAGGTAATTTTAAGATTATTGGGAAAATTAATTCACCTGGTAATGTTCATTAACACTTGGAACCGGTTAAACATTAAGTGCCACACATGGTGAAG
GTTAAAGATGAGTTTACATGGTCAAGATTGTAAAGCCACATTCCTATTTTAAAGGGTTCTTACAGTGTGACACATATGACAATACGCATTTTATTAAGGAGATGCTTATTGCTATTCAAAGATTTGACCCACTTTAAGGTGTTTTACCGAAATTTTGTTGAGTGGCACATAAGACCATACAAATTTTGTTAAGGGGATGT
CTATTATTTTACTTCTCAAAGATTTGACTCAGGGAATCTTTAATAGGACTCCTCCACTTTACTTTATTAAAAAGGTTAAACAATTTTATTTATTTTTAAATTATGAAAGGTCAGCAATGGGATACTCATCCACTTATAAAAAAAAAAGGTCAAACAATTTTTTTTTTTAAAATTACGAAGGTTCACCAATGGAATAACAT
GAAGTTATTCCATGGAATGCAACTATTGTGCATAAAATGTAGTTTTTATCACTTTTCACGACGTCTAATGCATGTGCATTACATTACATGCATTAAATATATTTAATTTATAATCTGTACTACTTTGAAATTGAAATTTAGAAGTATTGAAGTATGTTGAAATATAAAAAATATATTAATTACATGCATTGAATATATTT
AATTTATAATCTGTACTACTTTGAAATTGAAATTTAGAAGTATTGAAATATGTTGAAATATAAAAATAAAATTGAAATTTAGAAGTACTGAAATATGTTTAGTTAAACATATAAAAATAAAATAAGTTATTGTTGAAATATGCTTGATTAAAAAAATAAAAATAATTTAATTAAATGGGTATTACCTTTGAAATTGATAA
TGGGTACTATCTTTAAATCATGACCCAAGTACATCTAAACGGATTGCACTTAGCCTAGGTCCCATTAACCCTCATCAATTCGTTGGATGCCTAGGTCACATTAACCCTCATCAATTCGTTGGATTTTGGGCGTCTCCTTCCAAATAGATCACTCCAACGGGACCAAAATAATAAATAAATATTTTAAAATTAAAAATAAA
TAATTAAAAAAGTTAAGCTATGAGTATTATTTTCTATTTGAAATGGGAAGTAAATA


>TRINITY_DN135202_c0_g1_i18 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TTCCATGGAAATAATCTCATCCCAATGCGAGCTCTAGTACTAGGCCAGTCCTGGAAGAGTGCCCCCCCTTCTTCCTCGGAATTTTCGGATGGAAGGTGGATTTGACCGCCAGCCTCAAAAGCGGCTGGTAACCCCAAAGGACCTGATGGGAATTGATCTAGAGACCTCTCTAAATTTGTAAATTTCACATGAGTATCTAT
AAATCGAGCTTAGCTCTTGGAGCTAATTGTTATATAATGTTGCACGAGTATCTACAAATCGAGCTTAGCTCTTTGGACCATAGTTCATTTAATGGTTTATATTTCATGACCTAGAGCAGTGGCCTATTATTGCATTCCGATATACATCCCTTCTGATCAGTTCATGATTATTCCTATTCTTTTTGTTATAATGCATTTTC
CAAGGAAATAATATCATCCCAATGGGGGCGCTAATACTAGGCCAGCCTTGGCAGAGTGCTCCCCCTTCTTCCTCGGAATTTTCGGATGGAAGGTGGATATGACCGCCAGCCTCAAAAGCGGCTGGTAACCCCAAAGGACCTGATGGGAATTGATCTAGAGACCTCTGTAAATGTCACGAGTATCTACAAATCGAACTTAG
CTCTTGGGGCTAATTGCTGTATAATGTTATGGACCACGGTTCATTTAATGGTTTATATTTCATGACCTAGGCTATGATTTTTCACATGATGGTGATTGTGACATTTATTCTTGGTAGCATTAGCGATTATGTTGCAGTTTTATGGTTGCATGTAAATTGTGTCATCGTGTTCCATTGTTGAAATGTTGTAGGGTGATTTA
TTTATTTATTTTGGAATGCATTGTGGACGTGGAGACCTAGCTAGTGGAAACTGGTACGCACTTGTATCTATATCTGCTCTCCATTGTAATGATATAAGCCATGCCTTTAGTGTGCCTATGGTTTACCTGGGCTTAGCACATAGGAGTTTCGTGAAATTACAGTGAGGCTGAAGGAGTTGTGTTGCTAGATAATAGTCTCT
GAGGCGCCAATGTTAGTTATCCTGCTATATGATGGCGTGTTGATTCATAGTCTCTTTGATGGGGTAGAGATGAAGACATGGCGCTCACCTTTGGACTAGGGTCTCCATTGGGAGGTTTGCAAGCTGGCCATATAACTTCCCATGAATGCCCATTACATAGACAATCCATTGGCTTGGTAGTTGCATGCTCTTACTTTCTT
GAGCAAGCAGGCATTGCGAACTACCGATGTATTAATTCTTCATTTGTGATAATATGTTTCAGGTGAAGGGAAATTAATCTCTAACAATTACTACCAACATGAGACTATATTGCCAATTCCTCCTATGGACGCTGTCGTGTAGAGGCTAGTGTTCAAGAGCAGGGTTCCTTCCAACTCAATGAGGTCTTTTTAACTGTTGT
CAATATTCCATCCAGGGACTGAAGAATGCGAGTGGTATTTCTCTGGTCTAGTTTCTTAACTATGGATTTTCATCCAGGCTGCATTCCAATTCCTTTATTCAATCCCCCAGCAAGCAGTCTTTCTTCCAAAATCCTTTCCACAATCAACCAATAAAAAATGTATCTCCTTGTCAACTGGGGGTGACTTGCATATTGAGTAC
ATTTTTCATACCCGTTTGTCACGTTTCATCCCCATGTGTGAACTCATACCCGTTCCCATTACCTATTGAAAAGCGATTGAGATTGGCCTCATGGTCGTGTGTCAAACTGGTTTCTAGGTGTACTCGGTGTTTATTTTCCAAGTGTTGTTCATTTCTGAATCTTGATATCTCAACTGCATCGTTTTGTGTCTCTGAATGTT
TCAGGCACAGATAATGCTTGGCATGGCGTCTCCACAAAAGgtattttcaattttctcttaaatttagtatcattgactatggatttttttttcaaatggagtatacactatacagttcataatagttaataaatgttatttatgacacatttttctgaatcccgatatctcaaatgcattgttttgtatctctgtatgtt
tcag
GCACAGATAATGCTTGGCATGGTGTCTCCACAAATGGTATTTTCAATTTTCTCTTAAACTTAGTATCATTGACTATGGAATTTCATTCAAATGGAGTATATAGTTCATAATAGTTAATAAATGTTATTTATGACACATTTTTCTGAATCCCGATATCTCAAATGCATTGTTTTGTATCTCTGTATGTTTCAGGCAC
AGATAATGCT