sp|Q9FFY3|LTG30_ARATH ----> Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 30

Intron 1 GTCAGAACTC ... TGGTGAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.19	40	7	12
A2	28	27	9	12
A3	18.4	51	13	10
A4	20.48	33	11	6
A5	11.11	36	3	6
A6	19.08	899	229	195
A7	18.68	505	131	101
A8	18.38	513	133	98
A9	20.32	494	147	105
A10	18.84	364	93	76

>TRINITY_DN40984_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

CCTCCAGAGCAGCATCATTCTTCTTTCCACTCTATTTATACCTCACCGCCACCACTTTACCTTCCATCTTTTATTTTTGCACTGTTTACCTGGCTAGTGGAGCAGTTGAAGATGGATGCCAGAGGATTGAAGTTCAGCGGTTTTCTGTGCCTGGTTTTCGTGTCGATGTTGATGTTCGTGGCGTGTCAAGACACAGACAA
TACCTCGTGCCTATCGACCCTCAGCCCCTGTGCTCCTTATTTGAACGATACCAAGAAGCCCGATTCCTCATGTTGCACTGCTCTCAAATCTGTCATCGACAAGGACGCCCAATGCCTCTGTAATCTCCTCAACAGCGACACCGTTAAGCAGCTGGGCGTCAACGTTACCCAAGCCTTGATGCTGCCTGGAGAGTGTGGCA
GGAATGCTAGCGCCAGCCAATGCAACACCACTACTGCGGGTAGTTCGTCTACCGGCAAAACTCCAACTTCAACTCCTTCTTCACCTACAGCTTCTACCACCACAACACCAACCCCAAAGAGCAGCTCAAACGCGGCGGCGTCTGTATCTGTGAAAATGTTGCCAGTGGCTGCTTTGGTGTTTGTGGCAGTGGCATCCGCT
GTAGTTTTAGACGGTCCCTGCGTCCGTTGATTAAAGAAAATTATGGGTGTGCTGCAATCAGTGCAGATGCTGATCATGGGGCATTTTGTTCATCCTCGAACGTTTTGCCAATCAAGTGAGCAAGATGTTGGTCATGGGGTTTTTGACGATGAGCAAAATGCTGGTTTATTTTGTCTACCCTGGAACATTTTGCCTGTCAA
ATATGGTCAGGTCAGTATTTATTGTAAATCTTTGTCCATCCTGGAACATTTTACCTGTCAAATATGGTTAGTATTTATATTTTATAGTAAATCGTCAGAAACAAAGTATTTATAGTAAATCGTCAAAAACAGCAAG

>TRINITY_DN40984_c0_g1_i5 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CCTCCAGAGCAGCATCATTCTTCTTTCCACTCTATTTATACCTCACCGCCACCACTTTACCTTCCATCTTTTATTTTTGCACTGTTTACCTGGCTAGTGGAGCAGTTGAAGATGGATGCCAGAGGATTGAAGTTCAGCGGTTTTCTGTGCCTGGTTTTCGTGTCGATGTTGATGTTCGTGGCGTGTCAAGACACAGACAA
TACCTCGTGCCTATCGACCCTCAGCCCCTGTGCTCCTTATTTGAACGATACCAAGAAGCCCGATTCCTCATGTTGCACTGCTCTCAAATCTGTCATCGACAAGGACGCCCAATGCCTCTGTAATCTCCTCAACAGCGACACCGTTAAGCAGCTGGGCGTCAACGTTACCCAAGCCTTGATGCTGCCTGGAGAGTGTGGCA
GGAATGCTAGCGCCAGCCAATGCAACACCACTACTGCGGGTAGTTCGTCTACCGGCAAAACTCCAACTTCAACTCCTTCTTCACCTACAGgtcagaactcctcctcctttcttttgcttgtctcatcaattgatatttccttccgttgagagagaatagagttgagaattaatgaaaatgggaattttatggtgaacagC
TTCTACCACCACAACACCAACCCCAAAGAGCAGCTCAAACGCGGCGGCGTCTGTATCTGTGAAAATGTTGCCAGTGGCTGCTTTGGTGTTTGTGGCAGTGGCATCCGCTGTAGTTTTAGACGGTCCCTGCGTCCGTTGATTAAAGAAAATTATGGGGTTTTATTCTTTTCACTGTCTCATTCCTCACACTCTTGTTTGTG
CTGGGCGAATTGTGTACTCATTTCATTTGTGGATTTTACTGTATATTATTGTGCATGGCTCTGCCTCTGCCTCTACACAGTATTTACTAGGGTTTTTAATTCATTATGACGTCGTCTGTTGGGGTTTCGTATTTTTATAATTTTGGGTCCTGCTTCATGAGATGCAAGATTTTAATTTTGAATGCTAAGCTAATTAACAC
ATATTTTATACTACTTAAATTTGATTGTATTTGTATTTCATTAGGATAAAAAAGCTATTTGATTGTATTTGTTGAGCTAAAAGACTCTTTTAAATAATAGTTTAACAAAATTTAGACAGTGTGCTGCAATCAGTGCAGATGCTGATCATGGGGCATTTTGTTCATCCTCGAACGTTTTGCCAATCAAGTGAGCAAGATGT
TGGTCATGGGGTTTTTGACGATGAGCAAAATGCTGGAACATTTTGCCTGTCAAATATGGTCAGGTCAGTATTTATTGTAAATCTTTGTCCATCCTGGAACATTTTACCTGTCAAATATGGTTAGTATTTATATTTTATAGTAAATCGTCAGAAACAAAGTATTTATTGTAAATCTTTGTCCATCCTGGAACATTTTACCT
GTCAAATATGGTTAGT

Intron 2 GTTTTATTCT ... ATTTAGACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	85.71	9	54	9
A2	74.51	13	38	10
A3	88.31	9	68	0
A4	76	6	19	6
A5	71.43	16	40	8
A6	86.97	195	1301	18
A7	85.71	108	648	11
A8	86.93	149	991	8
A9	86.19	117	730	21
A10	82.71	93	445	9

>TRINITY_DN40984_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

CCTCCAGAGCAGCATCATTCTTCTTTCCACTCTATTTATACCTCACCGCCACCACTTTACCTTCCATCTTTTATTTTTGCACTGTTTACCTGGCTAGTGGAGCAGTTGAAGATGGATGCCAGAGGATTGAAGTTCAGCGGTTTTCTGTGCCTGGTTTTCGTGTCGATGTTGATGTTCGTGGCGTGTCAAGACACAGACAA
TACCTCGTGCCTATCGACCCTCAGCCCCTGTGCTCCTTATTTGAACGATACCAAGAAGCCCGATTCCTCATGTTGCACTGCTCTCAAATCTGTCATCGACAAGGACGCCCAATGCCTCTGTAATCTCCTCAACAGCGACACCGTTAAGCAGCTGGGCGTCAACGTTACCCAAGCCTTGATGCTGCCTGGAGAGTGTGGCA
GGAATGCTAGCGCCAGCCAATGCAACACCACTACTGCGGGTAGTTCGTCTACCGGCAAAACTCCAACTTCAACTCCTTCTTCACCTACAGCTTCTACCACCACAACACCAACCCCAAAGAGCAGCTCAAACGCGGCGGCGTCTGTATCTGTGAAAATGTTGCCAGTGGCTGCTTTGGTGTTTGTGGCAGTGGCATCCGCT
GTAGTTTTAGACGGTCCCTGCGTCCGTTGATTAAAGAAAATTATGGGTGTGCTGCAATCAGTGCAGATGCTGATCATGGGGCATTTTGTTCATCCTCGAACGTTTTGCCAATCAAGTGAGCAAGATGTTGGTCATGGGGTTTTTGACGATGAGCAAAATGCTGGTTTATTTTGTCTACCCTGGAACATTTTGCCTGTCAA
ATATGGTCAGGTCAGTATTTATTGTAAATCTTTGTCCATCCTGGAACATTTTACCTGTCAAATATGGTTAGTATTTATATTTTATAGTAAATCGTCAGAAACAAAGTATTTATAGTAAATCGTCAAAAACAGCAAG

>TRINITY_DN40984_c0_g1_i4 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CCTCCAGAGCAGCATCATTCTTCTTTCCACTCTATTTATACCTCACCGCCACCACTTTACCTTCCATCTTTTATTTTTGCACTGTTTACCTGGCTAGTGGAGCAGTTGAAGATGGATGCCAGAGGATTGAAGTTCAGCGGTTTTCTGTGCCTGGTTTTCGTGTCGATGTTGATGTTCGTGGCGTGTCAAGACACAGACAA
TACCTCGTGCCTATCGACCCTCAGCCCCTGTGCTCCTTATTTGAACGATACCAAGAAGCCCGATTCCTCATGTTGCACTGCTCTCAAATCTGTCATCGACAAGGACGCCCAATGCCTCTGTAATCTCCTCAACAGCGACACCGTTAAGCAGCTGGGCGTCAACGTTACCCAAGCCTTGATGCTGCCTGGAGAGTGTGGCA
GGAATGCTAGCGCCAGCCAATGCAACACCACTACTGCGGGTAGTTCGTCTACCGGCAAAACTCCAACTTCAACTCCTTCTTCACCTACAGCTTCTACCACCACAACACCAACCCCAAAGAGCAGCTCAAACGCGGCGGCGTCTGTATCTGTGAAAATGTTGCCAGTGGCTGCTTTGGTGTTTGTGGCAGTGGCATCCGCT
GTAGTTTTAGACGGTCCCTGCGTCCGTTGATTAAAGAAAATTATGGGgttttattcttttcactgtctcattcctcacactcttgtttgtgctgggcgaattgtgtactcatttcatttgtggattttactgtatattattgtgcatggctctgcctctgcctctacacagtatttactagggtttttaattcattatga
cgtcgtctgttggggtttcgtatttttataattttgggtcctgcttcatgagatgcaagattttaattttgaatgctaagctaattaacacatattttatactacttaaatttgattgtatttgtatttcattaggataaaaaagctatttgattgtatttgttgagctaaaagactcttttaaataatagtttaacaaa
atttagacagTGTGCTGCAATCAGTGCAGATGCTGATCATGGGGCATTTTGTTCATCCTCGAACGTTTTGCCAATCAAGTGAGCAAGATGTTGGTCATGGGGTTTTTGACGATGAGCAAAATGCTGGTTTATTTTGTCTACCCTGGAACATTTTGCCTGTCAAATATGGTCAGGTCAGTATTTATTGTAAATCTTTGTCC
ATCCTGGAACATTTTACCTGTCAAATATGGTTAGTATTTATATTTTATAGTAAATCGTCAGAAACAAAGTATTTATTGTAAATCTTTGTCCATCCTGGAACATTTTACCTGTCAAATATGGTTAGT

Intron 3 GTAAGTCTTT ... TGTGCAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	13.46	45	6.5	7
A2	18.75	39	5.5	9
A3	17.5	66	11	14
A4	16	42	3	8
A5	12.73	48	6	7
A6	20.41	1010	105.5	259
A7	16.01	619	70	118
A8	19.84	594	56	147
A9	15.16	571	54.5	102
A10	15.07	451	47	80

>TRINITY_DN109237_c0_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoform

CTTCTTTCCACTCTATTTATACCTCACCGCCACCACTTTACCTTCCATCTTTTATTTTTGCACTGTTTACCTGGCTAGTGGAGCAGTTGAAGATGGATGCCAGAGGATTGAAGTTCAGCGGTTTTCTGTGCCTGGTTTTCGTGTCGATGTTGATGTTCGTGGCGTGTCAAGACACAGACAATACCTCGTGCCTATCGACC
CTCAGCCCCTGTGCTCCTTATTTGAACGATACCAAGAAGCCCGATTCCTCATGTTGCACTGCTCTCAAATCTGTCATCGACAAGGACGCCCAATGCCTCTGTAATCTCCTCAACAGCGACACCGTTAAGCAGCTGGGCGTCAACGTTACCCAAGCCTTGATGCTGCCTGGAGAGTGTGGCAGGAATGCTAGCGCCAGCCA
ATGCAACACCACTACTGCGGGTAGTTCGTCTACCGGCAAAACTCCAACTTCAACTCCTTCTTCACCTACAGCTTCTACCACCACAACACCAACCCCAAAGAGCAGCTCAAACGCGGCGGCGTCTGTATCTGTGAAAATGTTGCCAGTGGCTGCTTTGGTGTTTGTGGCAGTGGCATCCGCTGTAGTTTTAGACGGTCCCT
GCGTCCGTTGATTAAAGAAAATTATGGGGTTTTATTCTTTTCACTGTCTCATTCCTCACACTCTTGTTTGTGCTGGGCGAATTGTGTACTCATTTCATTTGTGGATTTTACTGTATATTATTGTGCATGGCTCTGCCTCTGCCTCTACACAGTATTTACTAGGGTTTTTAATTCATTATGACGTCGTCTGTTGGGGTTTC
GTATTTTTATAATTTTGGGTCCTGCTTCATGAGATGCAAGATTTTAATTTTGAATGCTAAGCTAATTAACACATATTTTATACTACTTAAATTTGATTGTATTTGTATTTCATTAGGATAAAAAAGCTATTTGATTGTATTTGTTGAGCTAAAAGACTCTTTTAAATAATAGTTTAACAAAATTTAGACAGTGTGCTGCA
ATCAGTGCAGATGCTGATCATGGGGCATTTTGTTCATCCTCGAACGTTTTGCCAATCAAGTGAGCAAGATGTTGGTCATGGGGTTTTTGACGATGAGCAAAATGCTGGTTTATTTTGTCTACCCTGGAACATTT

>TRINITY_DN109237_c0_g1_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CTTCTTTCCACTCTATTTATACCTCACCGCCACCACTTTACCTTCCATCTTTTATTTTTGCACTGTTTACCTGGCTAGTGGAGCAGTTGAAGATGGATGCCAGAGGATTGAAGTTCAGCGGTTTTCTGTGCCTGGTTTTCGTGTCGATGTTGATGTTCGTGGCGTGTCAAGACACAGACAATACCTCGTGCCTATCGACC
CTCAGCCCCTGTGCTCCTTATTTGAACGATACCAAGAAGCCCGATTCCTCATGTTGCACTGCTCTCAAATCTGTCATCGACAAGGACGCCCAATGCCTCTGTAATCTCCTCAACAGCGACACCGTTAAGCAGCTGGGCGTCAACGTTACCCAAGCCTTGATGCTGCCTGGAGAGTGTGGCAGGAATGCTAGCGCCAGCCA
ATGCAACACCAgtaagtctttcgcctcaccccatttcttgcatttcttttcatatttcttctcaccccttcttgcatttcatatttcttctcatgccttgatcttccttcttggatttgtgatttgtgcaacagCTACTGCGGGTAGTTCGTCTACCGGCAAAACTCCAACTTCAACTCCTTCTTCACCTACAGCTTCTA
CCACCACAACACCAACCCCAAAGAGCAGCTCAAACGCGGCGGCGTCTGTATCTGTGAAAATGTTGCCAGTGGCTGCTTTGGTGTTTGTGGCAGTGGCATCCGCTGTAGTTTTAGACGGTCCCTGCGTCCGTTGATTAAAGAAAATTATGGGGTTTTATTCTTTTCACTGTCTCATTCCTCACACTCTTGTTTGTGCTGGG
CGAATTGTGTACTCATTTCATTTGTGGATTTTACTGTATATTATTGTGCATGGCTCTGCCTCTGCCTCTACACAGTATTTACTAGGGTTTTTAATTCATTATGACGTCGTCTGTTGGGGTTTCGTATTTTTATAATTTTGGGTCCTGCTTCATGAGATGCAAGATTTTAATTTTGAATGCTAAGCTAATTAACACATATT
TTATACTACTTAAATTTGATTGTATTTGTATTTCATTAGGATAAAAAAGCTATTTGATTGTATTTGTTGAGCTAAAAGACTCTTTTAAATAATAGTTTAACAAAATTTAGACAGTGTGCTGCAATCAGTGCAGATGCTGATCATGGGGCATTTTGTTCATCCTCGAACGTTTTGCCAATCAAGTGAGCAAGATGTTGGTC
ATGGGGTTTTTGACGATGAGCAAAATGCTGGTTTATTTTGTCTACCCTGGAACATTT