sp|Q9M7I9|STEP1_ARATH ----> Stress enhanced protein 1, chloroplastic

Intron 1 GTATCCTTCT ... TTTCCCGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20	32	6	10
A2	20.24	67	16	18
A3	17.91	55	9	15
A4	21.88	50	8	20
A5	20	50	7	18
A6	15.51	662	72	171
A7	14.1	259	34	51
A8	18.84	224	42	62
A9	15.67	288	33	74
A10	15.57	225	49	34

>TRINITY_DN95327_c0_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoform

AGCATTTACACCGGATAAGTTCATTAATGGCGTCATATACATGACGATAACGTTTGAAAGGTAACCAGTGAAGATTGCGTTAGATAAAACCCCAACTCCGGTTTTCCTTCATTCTTTCAAATTCTGTTTTGAATGGGAATGGCGATGCAAATGGCTTGCACACTCAGAGGATTACCCTCTCCCTTATTCCGAAAATCTAA
TGGCGAAATTAACGGTTCACGTTCAGCAATGCCAGTCATGTCCTTACGTTCGCCGCTGATTAAGAATGGAATTTCATTCAGTTCTTCTTGTCAGTTGCTGCAAAGCTCTCGAATTTTCATTTTGCAAGCTATCTGCCCAAGGATAAGAGAACGCAGACGAGTTTCAGTTGGTGTTCGTTGTGAGCAGAGCTCCGAGGGGG
GTAACAGCTTGGATATATGGTTGGGTCGAATTGCAATGCTTAGTTTTGTAGGTGCTATTACCATCGAGATAACTACAGGCAAGGGCCTTTTACAGAATGTTGGACTTACTTCTCCCCTGCCAACAGTATCTTTGGGACTTGTAACGGCAGTGGGTGTTTTTGTAGCTTTTAATATTTTCCGGTCCGCCTCTGAAGACTGA
TTATGGAGACCACATTTGAATTCTGTTTTATATGAATAGAAAAGGAGGTCAAAATAATGTTGATTGTACAAGTAGTGGTGCATTGTAAGGGTGGTTTTATGGAAATGAAGCCATCAACCCATGTTTGGCAATTTTTGGTTATTCTGTAGCTTCAAATCTTGTTATATTGTCTGCATTTGTGTGTTTTGAGTTTCCAGTTT
GAATTCTAAGTTTCCAGTTTGAATTCTATTGTCCATCATTCATTATCTTACTTTCTAATTGCATTGTGTTTCTGATTTTTAATTTTTCAACTCTCTTGTCAAAATTGTAATCAGTGGTCAATATCATACATGTTATATCCC

>TRINITY_DN95327_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:

AGCATTTACACCGGATAAGTTCATTAATGGCGTCATATACATGACGATAACGTTTGAAAGGTAACCAGTGAAGATTGCGTTAGATAAAACCCCAACTCCGGTTTTCCTTCATTCTTTCAAATTCTGTTTTGAATGGGAATGGCGATGCAAATGGCTTGCACACTCAGAGGATTACCCTCTCCCTTATTCCGAAgtatcct
tcttcagttatccacattatcttccagtctttaacgcttcttctgtgttcagtttaagacaggccataattgcttttagttcttcattgtaattagatacatttcctgaatttcccgcagAATCTAATGGCGAAATTAACGGTTCACGTTCAGCAATGCCAGTCATGTCCTTACGTTCGCCGCTGATTAAGAATGGAATT
TCATTCAGTTCTTCTTGTCAGTTGCTGCAAAGCTCTCGAATTTGTTAGTATTTCTGAATCCTTCGCGAACTTGCCTCTTAAGTAGAATAACCGTTCACATTTTCATCTGAATTGTTCCAAAATAACTTTATGCGTTAAGCGCCTCTAAATTTTGCTGAAAAATTAACCCCATTTCAAGTGGTGCTCAAATGTATTTTACG
GAAATATATGAAACTGCTTTCTCTTAATGTTAAAAATTATAGAAAGCGCAGTGTTTAAACATTTGGAGTTACAGTGAGCAGTTGTTAAAGCACCTCCTTTGTCTGTAAAAAAGAGCTTTTATTTCTATGGAATATGTCCG