sp|A9NUH8|METK1_PICSI ----> S-adenosylmethionine synthase 1
Intron 1 ATTGCAAAGA ... ATTACAATAC
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.74 | 122 | 7 | 30 |
| A2 | 22.43 | 83 | 2 | 24 |
| A3 | 23.12 | 143 | 15 | 43 |
| A4 | 24.83 | 109 | 4 | 36 |
| A5 | 22.12 | 81 | 3 | 23 |
| A6 | 20.58 | 355 | 14 | 92 |
| A7 | 20.2 | 569 | 23 | 144 |
| A8 | 20.86 | 277 | 9 | 73 |
| A9 | 19.23 | 693 | 21 | 165 |
| A10 | 21.07 | 502 | 21 | 134 |
>TRINITY_DN107007_c0_g1_i8 from sample A3 / Example spliced isoformTGTTGGGAGAAGTAAAAAGTCAAGATCCACAAATCATGTTCATGTACCTTGCTTTTACCGTCATAGGTTCAAATTGCATCCAGATTCACTGAACAGTATCCTCCTTACATTTAAAATAATTAATAATTAAATTATGTATGCCAGACTGTAAAGGAAGATAGCAACGACAGTGAGTATAAAAGCAGGGAGCAATCCTCTTT
CTCCATACACTTCGCTCCGTTCTTCGTCTCTTAAGCCCTTACGCACAAGAGGAGAAACAGGAGGATACTGTTCAGCTCAGCTCTTTTTTTAATATTAAGATGGATACCTTTCTCTTCACATCAGAGTCTGTAAATGAGGGACACCCTGACAAACTCTGTGATCAGATTTCTGATGCCATCTTGGATGCTTGCTTGGAGCA
AGATCCTGATAGCAAGGTTGCATGCGAGACCTGTACAAAGACAAACATGGTAATGGTTTTTGGAGAAATCACAACTAAAGCTAATATAGACTATGAGAAGATAGTAAGGGACACCTGCAGGGGAATTGGATTCGTGTCAGCAGATGTTGGATTGGATGCAGATAATTGCAAGGTCCTGGTGAATATTGAACAGCAAAGCC
CTGACATTGCACAGGGTGTCCATGGCCACCTTACTAAGAAGCCCGAAGAGATTGGTGCAGGAGATCAGGGCCACATGTTTGGGTATGCTACAGATGAGACTCCAGAGTTGATGCCTCTCACTCATGTCCTAGCGACAAAGCTTGGAGCAAGGTTGACTGAAGTAAGAAAGAATGGAACCTGTTCTTGGTTGAGACCAGAT
GGAAAGACCCAAGTTACTGTTGAGTATAAAAATGAGGGAGGGGCAATGGTCCCGTTAAGAGTTCACACTGTGCTCATCTCTACTCAACATGATGAAACTGTTACCAATGATCAGATTGCAGCTGATCTCAAGGAGCATGTCATTAAGCCGGTTGTCCCTTCTCAATATCTAGATGAAAATACAATATTCCATTTGAACCC
ATCTGGGCGTTTTGTAATTGGAGGGCCTCATGGAGATGCTGGTCTGACTGGGAGGAAAATTATTATTGATACATATGGTGGTTGGGGTGCTCATGGTGGAGGAGCCTTTTCTGGAAAGGATCCCACCAAGGTGGATCGAAGTGGTGCTTACATTGTCAGACAAGCTGCCAAGAGTGTTGTTGCTGCTGGGCTAGCACGCC
GCTGCCTTGTGCAGGTTTCATATGCGATTGGTGTGCCTGAACCACTTTCTGTGTTTGTTGACACATATGGAACTGGAAAAATTCCGGATGCTGAAATCCTGAAGTTAATCAAAGAAAATTTTGACTTCCGTCCTGGCATGATATCTATCAACCTTGACCTAAAACGAGGAGGCAATATGAGGTTCCAGAAAACAGCTGCA
TATGGCCATTTTGGTCGGGAGGATCCTGATTTCACTTGGGAGACTGTAAAGATCCTTAAGTGGGAGAAAGCTTGAAATTGTGGAGTAAGGGGGCAAACAGATTTTTCTGATGCAGATCACGTATTATAGGGTTCACTATTTTTGGCAATCCTTAGAACATGCCAGTAATCTTAGTTATGGGTTTCATATTGGATTCTTTA
AGTTTGACGTGTTATTTTTCATGATAGTCAGAGATACCTTTGTCATCTATTAAAAGATGCTAGTGCAATTTGTGGCCTCGTTATGTTGGGTGTAGATCTATTGAATGCCTTATTGTTCTACATGATTCATTGTGGCAATCCTTTTGTGTACCCGTGGCAATCTTCACTCTCTTGCATTACCATACTTCTACATATGTGGC
>TRINITY_DN107007_c0_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:TGTTGGGAGAAGTAAAAAGTCAAGATCCACAAATCATGTTCATGTACCTTGCTTTTACCGTCATAGGTTCAAATTGCATCCAGATTCACTGAACAGTATCCTCCTTACATTTAAAATAATTAATAATTAAATTATGTATGCCAGACTGTAAAGGAAGATAGCAACGACAGTGAGTATAAAAGCAGGGAGCAATCCTCTTT
CTCCATACACTTCGCTCCGTTCTTCGTCTCTTAAGCCCTTACGCACAAGAGGAGAAACAGGAGGATACTGTTCAGCTCAGCTCTTTTTTTAATATTAAGattgcaaagatacgagggatatcattacaatacATGGATACCTTTCTCTTCACATCAGAGTCTGTAAATGAGGGACACCCTGACAAACTCTGTGATCAGAT
TTCTGATGCCATCTTGGATGCTTGCTTGGAGCAAGATCCTGATAGCAAGGTTGCATGCGAGACCTGTACAAAGACAAACATGGTAATGGTTTTTGGAGAAATCACAACTAAAGCTAATATAGACTATGAGAAGATAGTAAGGGACACCTGCAGGGGAATTGGATTCGTGTCAGCAGATGTTGGATTGGATGCAGATAATT
GCAAGGTCCTGGTGAATATTGAACAGCAAAGCCCTGACATTGCACAGGGTGTCCATGGCCACCTTACTAAGAAGCCCGAAGAGATTGGTGCAGGAGATCAGGGCCACATGTTTGGGTATGCTACAGATGAGACTCCAGAGTTGATGCCTCTCACTCATGTCCTAGCGACAAAGCTTGGAGCAAGGTTGACTGAAGTAAGA
AAGAATGGAACCTGTTCTTGGTTGAGACCAGATGGAAAGACCCAAGTTACTGTTGAGTATAAAAATGAGGGAGGGGCAATGGTCCCGTTAAGAGTTCACACTGTGCTCATCTCTACTCAACATGATGAAACTGTTACCAATGATCAGATTGCAGCTGATCTCAAGGAGCATGTCATTAAGCCGGTTGTCCCTTCTCAATA
TCTAGATGAAAATACAATATTCCATTTGAACCCATCTGGGCGTTTTGTAATTGGAGGGCCTCATGGAGATGCTGGTCTGACTGGGAGGAAAATTATTATTGATACATATGGTGGTTGGGGTGCTCATGGTGGAGGAGCCTTTTCTGGAAAGGATCCCACCAAGGTGGATCGAAGTGGTGCTTACATTGTCAGACAAGCTG
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GGAGGCAATATGAGGTTCCAGAAAACAGCTGCATATGGCCATTTTGGTCGGGAGGATCCTGATTTCACTTGGGAGACTGTAAAGATCCTTAAGTGGGAGAAAGCTTGAAATTGTGGAGTAAGGGGGCAAACAGATTTTTCTGATGCAGATCACGTATTATAGGGTTCACTATTTTTGGCAATCCTTAGAACATGCCAGTA
ATCTTAGTTATGGGTTTCATATTGGATTCTTTAAGTTTGACGTGTTATTTTTCATGATAGTCAGAGATACCTTTGTCATCTATTAAAAGATGCTAGTGCAATTTGTGGCCTCGTTATGTTGGGTGTAGATCTATTGAATGCCTTATTGTTCTACATGATTCATTGTGGCAATCCTTTTGTGTACCCGTGGCAATCTTCAC
TCTCTTGCATTACCATACTTCTACATATGTGGC
Intron 2 GTAAGTACTT ... TTTGTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 46.05 | 41 | 5 | 35 |
| A2 | 50 | 31 | 3 | 31 |
| A3 | 50 | 41 | 4 | 41 |
| A4 | 49.43 | 44 | 1 | 43 |
| A5 | 49.09 | 28 | 0 | 27 |
| A6 | 49.78 | 115 | 2 | 114 |
| A7 | 50 | 146 | 7 | 146 |
| A8 | 52.3 | 83 | 0 | 91 |
| A9 | 51.88 | 179 | 0 | 193 |
| A10 | 49.7 | 168 | 1 | 166 |
>TRINITY_DN42422_c0_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoformTGTTGGGAGAAGTAAAAAGTCAAGATCCACAAATCATGTTCATGTACCTTGCTTTTACCGTCATAGGTTCAAATTGCATCCAGATTCACTGAACAGTATCCTCCTTACATTTAAAATAATTAATAATTAAATTATGTATGCCAGACTGTAAAGGAAGATAGCAACGACAGTGAGTATAAAAGCAGGGAGCAATCCTCTTT
CTCCATACACTTCGCTCCGTTCTTCGTCTCTTAAGCCCTTACGCACAAGAGGAGAAACAGGAGGATACTGTTCAGCTCAGCTCTTTTTTTAATATTAAGATTGCAAAGATACGAGGGATATCATTACAATACCTTCCGGCATCGACTGGGAAATTTAGCAAGTTGTTCAGCTCCCTTGGCTGAACTTGATGCATTGACAG
ATTTTCTGATTTAGATCTGTACTGAGCATTGACATTTCTGATGGATACCTTTCTCTTCACATCAGAGTCTGTAAATGAGGGACACCCTGACAAACTCTGTGATCAGATTTCTGATGCCATCTTGGATGCTTGCTTGGAGCAAGATCCTGAAAGCAAGGTTGCATGCGAGACCTGTACAAAGACAAACATGGTAATGGTTT
TTGGAGAAATCACAACTAAAGCTAATATAGACTATGAGAAGATAGTGAGGGACACCTGCAGGGGAATTGGATTCGTGTCAGCAGATGTTGGATTGGATGCAGATAATTGCAAGGTCCTGGTGAATATTGAACAGCAAAGCCCTGACATTGCACAGGGTGTCCATGGCCACCTTACTAAGAAGCCCGAAGAGATTGGTGCA
GGAGATCAGGGCCACATGTTTGGGTATGCTACAGATGAGACTCCAGAGTTGATGCCTCTCACTCATGTCCTAGCGACAAAGCTTGGAGCAAGGTTGACTGAAGTAAGAAAGAATGGAACCTGTTCTTGGTTGAGACCAGATGGAAAGACCCAAGTTACTGTTGAGTATAAAAATGAGGGCGGGGCAATGGTCCCGTTAAG
AGTTCACACTGTGCTCATCTCTACTCAACATGATGAAACTGTTACCAATGATCAGATTGCAGCTGATCTCAAGGAGCATGTCATTAAGCCGGTTGTTCCTTCTCAATATCTAGACGAAAATACAATATTCCATTTGAACCCATCTGGGCGTTTTGTAATTGGAGGGCCTCATGGAGATGCTGGTCTGACTGGGAGGAAAA
TTATTATTGATACATATGGTGGTTGGGGTGCTCATGGTGGAGGAGCCTTTTCTGGAAAGGATCCCACCAAGGTGGATCGAAGTGGTGCTTACATTGTCAGACAAGCTGCCAAGAGTGTTGTTGCTGCTGGGCTAGCACGCCGCTGCCTTGTGCAGGTTTCATATGCGATTGGTGTGCCTGAACCACTTTCTGTGTTTGTT
GACACATATGGAACTGGAAAAATTCCGGATGCTGAAATCCTGAAGTTAATCAAAGAAAATTTTGACTTCCGTCCTGGCATGATATCTATCAACCTTGACCTAAAACGAGGAGGCAATATGAGGTTCCAGAAAACAGCTGCATATGGCCATTTTGGTCGGGAGGATCCTGATTTCACTTGGGAGACTGTAAAGATCCTTAA
GTGGGAGAAAGCTTGAAATTGTGGAGTAAGGGGGCAAACAGATTTTTCTGATGCAGATCACGTATTATAGGGTTCACTATTTTTGGCAATCCTTAGAACATGCCAGTAATCTTAGTTATGGGTTTCATATTGGATTCTTTAAGTTTGACGTGTTATTTTTCATGATAGTCAGAGATACCTTTGTCATCTATTAAAAGATG
CTAGTGCAATTTGTGGCCTCGTTATGTTGGGTGTAGATCTATTGAATGCCTTATTGTTCTACATGATTCATTGTGGCAATCCTTTTGTGTACCCGTGGCAATCTTCACTCTCTTGCATTACCATACTTCTACATATGTGGCAG
>TRINITY_DN42422_c0_g1_i4 from sample A9 / Example unspliced isoform:TGCAAAGATACGAGGGATATCATTACAATACCTTCCGGCATCGACTGGGAAATTTAGCAAGTTGTTCAGCTCCCTTGGCTGAACTTGATGCATTGACAGATTTTCTGATTTAGATCTGTCCTGAGCATTGACATTTCTGgtaagtacttcatatgaaatctccattttacgaatcaatctgtatctgctttataacatcc
ttttgccttcgttgctatcataactcgagatgggagatggttttctccattgtgttgaatttttcctttatatgtaatagtgacaaagtgttcctccttctaaaggaagcttacctgtttattcaaaaggattgggtaggatgtttgcaatgtcactcccagttcttctatatgaaagcattcttgatttctaccaaccc
tcttgagaaattcctggcctccaaactggggttctatataaaataataaattactggttctacgcaaaatgcatctacttaacttgtcctgaagagaaagggttttcagtcttcttttaatacactcattccttttataagtagaagacaaatccaaacccaagtgcttcaaagatacacatcttctgttttccggctct
ccaaatgggttttatccgacttttatctcttacaccaattactactacctttgttttacctacaatgtttatctaatttttaagcattcttgttttgctaagatgtttagtgactaacgtttatccatccaaattcctatcctcgtgttgaaagctaacatctaatatgtttcatattttggctacgatactatgttgaa
ttgctggctgtatgttcaaatgcctattctcagcttgaaagctgaagtcatacagggtggcttttggatgaagtttgaatattatgttatattgcaatattcaactgttgtaatgttgaaaataaagcatcacaaagaacagaagatgaccagctgaccccagcccagtgttaggctgcattaataagttctgccaggtt
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cgcatttatctctttggagataggaatcaagaaacacataacaatagcctacttatgtgtccttggagatgggttcaagtaagtgtagtaaggctgccccatccaatgagctaataaatggtactgcaagacttgccaagttttcctagcccttttacagttccagtgacattcttacctgattccatgaacccacactg
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taaacagaaaccaaacaatctgctgttaatgaagggcccattccaccaaatataggtttatacgctttaccatttcttaagccgtctcaatctcagctcagtactttggctaacctgcaatgccttgcatttttgctggagcatgtaaaaagccttcgattttaatgctttgctttgagaatgtaatcccctagttttat
aatgtctcagccactctaaaaaaattgggatgttggatttggtgtctgttaacccaccttttcccttatgtagaatgcattgctcccagatttggtacatttctttggatccatcgtccttcgtctagcgaagcattttacaagctagacgaggccatcataaccaccttcggagaggcacttacatgcttagcagtata
tatctatgccaattaaccctttattgagtactttcaccttgcctgctatggacaagttcttgcaggcatttcattcttttacagctctgttcaaatctagtttcacatgttcccaggagaaagatcaaatccacgatcccctttctttgttagaaattatagcacatgttctatttttcaatcctgggatatcacaatca
aaatatctgaagaatggtgatggattgattaggatttggccaaagatttatccaaagcatcaagacgttttttcaataaggttcctggtaatattttctagtgataaagaggaggttcatgctggttcctggtgatattttctgtaatactggttgttcttattccacagtatactttgttctttctggctaacaatatg
ctgtttgacagtttataataaatggtaagcactgcatataaagcaaagcgtttggtcattttttttcatgcctgctgacagtttgacgtgttttgttgtagATGGATACCTTTCTCTTCACATCAGAGTCTGTAAATGAGGGACACCCTGACAAACTCTGTGATCAGATTTCTGATGCCATCTTGGATGCTTGCTTGGAG
CAAGATCCTGAAAGCAAGGTTGCATGCGAGACCTGTACAAAGACAAACATGGTAATGGTTTTTGGAGAAATCACAACTAAAGCTAATATAGACTATGAGAAGATAGTGAGGGACACCTGCAGGGGAATTGGATTCGTGTCAGCAGATGTTGGATTGGATGCAGATAATTGCAAGGTCCTGGTGAATATTGAACAGCAAAG
CCCTGACATTGCACAGGGTGTCCATGGCCACCTTACTAAGAAGCCCGAAGAGATTGGTGCAGGAGATCAGGGCCACATGTTTGGGTATGCTACAGATGAGACTCCAGAGTTGATGCCTCTCACTCATGTCCTAGCGACAAAGCTTGGAGCAAGGTTGACTGAAGTAAGAAAGAATGGAACCTGTTCTTGGTTGAGACCAG
ATGGAAAGACCCAAGTTACTGTTGAGTATAAAAATGAGGGCGGGGCAATGGTCCCGTTAAGAGTTCACACTGTGCTCATCTCTACTCAACATGATGAAACTGTTACCAATGATCAGATTGCAGCTGATCTCAAGGAGCATGTCATTAAGCCGGTTGTTCCTTCTCAATATCTAGACGAAAATACAATATTCCATTTGAAC
CCATCTGGGCGTTTTGTAATTGGAGGGCCTCATGGAGATGCTGGTCTGACTGGGAGGAAAATTATTATTGATACATATGGTGGTTGGGGTGCTCATGGTGGAGGAGCCTTTTCTGGAAAGGATCCCACCAAGGTGGATCGAAGTGGTGCTTACATTGTCAGACAAGCTGCCAAGAGTGTTGTTGCTGCTGGGCTAGCACG
CCGCTGCCTTGTGCAGGTTTCATATGCGATTGGTGTGCCTGAACCACTTTCTGTGTTTGTTGACACATATGGAACTGGAAAAATTCCGGATGCTGAAATCCTGAAGTTAATCAAAGAAAATTTTGACTTCCGTCCTGGCATGATATCTATCAACCTTGACCTAAAACGAGGAGGCAATATGAGGTTCCAGAAAACAGCTG
CATATGGCCATTTTGGTCGGGAGGATCCTGATTTCACTTGGGAGACTGTAAAGATCCTTAAGTGGGAGAAAGCTTGAAATTGTGGAGTAAGGGGGCAAACAGATTTTTCTGATGCAGATCACGTATTATAGGGTTCACTATTTTTGGCAATCCTTAGAACATGCCAGTAATCTTAGTTATGGGTTTCATATTGGATTCTT
TAAGTTTGACGTGTTATTTTTCATGATAGTCAGAGATACCTTTGTCATCTATTAAAAGATGCTAGTGCAATTTGTGGCCTCGTTATGTTGGGTGTAGATCTATTGAATGCCTTATTGTTCTACATGATTCATTGTGGCAATCCTTTTGTGTACCCGTGGCAATCTTCACTCTCTTGCATTACCATACTTCTACATATGTG
GCAG