NA ----> NA
Intron 1 GTTTGAATTA ... TGGCTTATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 1 | 1 |
| A2 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A3 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A4 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 50 | 2 | 0 | 4 |
| A7 | 67.5 | 1.5 | 6 | 0 |
| A8 | 85.19 | 2 | 12 | 11 |
| A9 | 50.08 | 6.5 | 4 | 9 |
| A10 | 50.5 | 5 | 5 | 5 |
>TRINITY_DN40660_c0_g1_i11 from sample A9 / Example spliced isoformTGTATCAAGATTTTTTATGGATGCCATCGAGGGATGGATTTGCTCTGTAAATGGACGAAAGAAAATCATCTCATCTCCGACTGGCCCACTGCTAGGTTGGACTGTAGAATACGGTCCCCATTTCTCTGCAGATTGGAATGTAGAAGGCAGTTTCCATTCTAATTTGAAGTCTGATCGTAGCAGGAGGCCTCTTGAGGATC
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>TRINITY_DN40660_c0_g1_i13 from sample A9 / Example unspliced isoform:GCCTCAGGGAGAGGGCCATCTCCATTAACTTATATCTTAGTGCTATTATTTTTATCTTTGTGATCTTTGTAACAGTTAGACTGCTTGTTTAGAGATAAACTCTAGGGAAGGAACTGAACTCTATTCCATTTAAAGAAGGAGGAGCAGCCCCTTTGTAGATCATTAATGTGTTTTAGGGATTCATAATAATTATTGATAAT
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TAAAATCTATCTTGCTATGGTCTTGTTTATGGCTTATAGGGACATGCAAAACGTTCAGCGTGGGAGGATGATGGTCTGCATTTTTGCCCAGTTTTTGTCACTATATAGgtttgaattaatctttatctttgttttctccattttttttttgtacataatggtatctagtccacgattgcaagcatataccagtcattttt
ggtattacacgacatagatcaggcaattgaatttatttttccatgatttctttatgaattgtagcatagattttatttttaaaagagatttgacaaattaaaatctatcttgctatggtcttgtttatggcttatagGCCGGGTGACCCTTTCTCGTCCCTATTTTACATATCAATTCCAGCGTGGACTTTTCAAATGAG
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ATTATTTGTTTTTTAAAATGGAATTTCGCTTTTTTAAATGGAATTACGCTTTTTTAAAATGG