sp|Q94AH6|CUL1_ARATH ----> Cullin-1

Intron 1 GTATGCAAAA ... TTCTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	31.84	122	36	78
A2	27.97	103	24	56
A3	31.86	77	29	43
A4	36.42	55	14	49
A5	42.86	22	11	22
A6	45.28	29	10	38
A7	29.85	141	27	93
A8	32.54	113	20	89
A9	27.13	90	7	60
A10	31.74	114	29	77

>TRINITY_DN43778_c0_g1_i9 from sample A8 / Example spliced isoform

CAAATGTGTACCAACTAAGGTTTGCTAACAACCTTTGATGGACAAATAGTATTCAGTGAACCAGGTACATTGTATTTTAACATTGTAGGAAAAGCTAGCATGCCGGCTTATATTTGATAAAAGTGCAAATAATAAACATGATTGGAGTATCATAATGAAATTGAAGCAACAATCTGGAGGCCAGTTTACTTCAAAGATGG
AGGGAATGCTTACTGACTTGACTTTGGCATGGGAGAACCAACCAAACTTTCAAAAATATCTTTATGATAATGTGCATGCACATCTTGGAATATAATTGACTGTAACAGCCTTGACTACTGGATTTTGGCCCAGCTACAAGTCATTTGATCTCAATTTGCCTGCTGAGATGGGATCTGTATTATTGCTGTTAAATTCTGCT
GAAAAATTGAACTATTCAGAAATCAAATCTCAGCTGAATTTGTCAGACAAAGATATTGTTAGATTGCTACATTCACTTTTGTGTTTAAAACACAAAGTTCTGAATAAGGAGCGAAGCAGAAAAACTGTCATACAGTCTGATCACTTCGAATTTAATGCAAAATTTACTGACAAATCAAGAAAGATCAAGATTCCTCTTCC
TCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGGTGATATGCAATTGGTGCTTGTATTATTTGAATCATAAAGAGTAGAAAAGTTTTAGCCCATGCACAATTAGTAACAGAGTGCAATGAGCAACTTGGACAAATGTTCAAGATATGCTTTCAAAGGATGCATTGCTTCTGGAGCCCAGTCAGCT
TCATATTGAGGAATTCAGAAATGGATGTTGATGACATATATGCTGCCTTATATTACAACTTACTATCAACTGAATTGCTTCTGCACCTGAAGATTATGTTTTCCGTTCTGCTTTAATAGGAAATATGTATTTTTTCGTGGAAAAAAGATGGTGCCAAGCATATGTGGGCTAGCATCAGAACTTGTTTTCATTTTCCAGGG
TCTTCAAGAGCTAACACGAGGACTTAGCTAAAATTTGTTTTGTTCTTGTTGGGTAATATTAAACAATGGCATCAAGAACTGTCTGGTAGGGGAGGGCTTTTCCACGGCTCAAGAATTGGCAGGAATTCGCTATTTTTCTGTGTATTTGTGTAATCATGCAATTTATTTCAATCCAAACAAAGAATTGGCGGAGGCCTGCT
TGATTCAATTATTAGGTTCCTTGTTTGATATCTGATTGCATGGATAATATGTGCAAATGAAGTGATCCCTACCTCCAACACTAATGAGTTGGTAAGAATAAACTCCTTCTGTAGGTGTCACG

>TRINITY_DN43778_c0_g1_i8 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CAAATGTGTACCAACTAAGGTTTGCTAACAACCTTTGATGGACAAATAGTATTCAGTGAACCAGGTACATTGTATTTTAACATTGTAGGAAAAGCTAGCATGCCGGCTTATATTTGATAAAAGTGCAAATAATAAACATGATTGGAGTATCATAATGAAATTGAAGCAACAATCTGGAGGCCAGTTTACTTCAAAGATGG
AGGGAATGgtatgcaaaatgtgactgttttttaaagtctgtaatgcttacagtttgtgtctttataatttaaaaccttgggaaataatttaatgctctttggttcatgttcttctaatccatatatttcttctcagCTTACTGACTTGACTTTGGCATGGGAGAACCAACCAAACTTTCAAAAATATCTTTATGATAATG
TGCATGCACATCTTGGAATATAATTGACTGTAACAGCCTTGACTACTGGATTTTGGCCCAGCTACAAGTCATTTGATCTCAATTTGCCTGCTGAGATGGGATCTGTATTATTGCTGTTAAATTCTGCTGAAAAATTGAACTATTCAGAAATCAAATCTCAGCTGAATTTGTCAGACAAAGATATTGTTAGATTGCTACAT
TCACTTTTGTGTTTAAAACACAAAGTTCTGAATAAGGAGCGAAGCAGAAAAACTGTCATACAGTCTGATCACTTCGAATTTAATGCAAAATTTACTGACAAATCAAGAAAGATCAAGATTCCTCTTCCTCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGGTGATATGCAATTGGTGCTTGTAT
TATTTGAATCATAAAGAGTAGAAAAGTTTTAGCCCATGCACAATTAGTAACAGAGTGCAATGAGCAACTTGGACAAATGTTCAAGGTAAGCACTATAGAATGGTTAATTTATTTGGTCATAACTCAGACAAGGAATTTTGCAAGTTTCATTCCGTGTTAGTCTTTTCACAAACTAGAAAACTCTTTGCTGGCAGCTGGAT
TTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAATATTTGATAGCAAGGGAATTCTTGGGGGTTGACAAAAACAACGCTAACATGTTCAGATATCTAGCCTGAAAAAGCTTCAACTAAATGAGTGGGTTTTTGGCTTTGTAAAATTCCCTGCCTTGCCCAAAATTTCATTAATTTGTAATCCAAATTTCATATATTCTTTAACTTTG
CTGGTTTGCTTTAGATCTATTAGTTTATTTTTAGTGTATATGGTTCCAAGTATATGTATTCTATTTATTAAAATTTGCATTGGAGTTGGAGTTCACACAGCTACAAGTTTTCAGGGACTCCTCTTTGACCATACAGTGGATGAATGATGAGCTCCAAGTATACAATACTGGGTTAACTCAATTGGCTATTCATTTGAAGC
AACTTAAGGGACTATTTTAGCAGATTTTCTTCACTCATATTTATTGAAAGATGAATACTGTGGCAGATATGCTTTCAAAGGATGCATTGCTTCTGGAGCCCAGTCAGCTTCATATTGAGGAATTCAGAAATGGATGTTGATGACATATATGCTGCCTTATATTACAACTTACTATCAACTGAATTGCTTCTGCACCTGAA
GATTATGTTTTCCGTTCTGCTTTAATAGGAAATATGTATTTTTTCGTGGAAAAAAGATGGTGCCAAGCATATGTGGGCTAGCATCAGAACTTGTTTTCATTTTCCAGGGTCTTCAAGAGCTAACACGAGGACTTAGCTAAAATTTGTTTTGTTCTTGTTGGGTAATATTAAACAATGGCATCAAGAACTGTCTGGTAGGG
GAGGGCTTTTCCACGGCTCAAGAATTGGCAGGAATTCGCTATTTTTCTGTGTATTTGTGTAATCATGCAATTTATTTCAATCCAAACAAAGAATTGGCGGAGGCCTGCTTGATTCAATTATTAGGTTCCTTGTTTGATATCTGATTGCATGGATAATATGTGCAAATGAAGTGATCCCTACCTCCAACACTAATGAGTTG
GTAAGAATAAACTCCTTCTGTAGGTGTCACG

Intron 2 GTCTGAGCTA ... TGAATTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20.36	65	22.9	10.4
A2	19.74	47	10	13.2
A3	12.18	56	10	5.5
A4	19.06	50.4	13	10.7
A5	9.83	17	0	3.7
A6	17.11	57	11	12.5
A7	14.69	169	24	34.4
A8	17.47	163.4	31	38.3
A9	13.27	132.4	18	22.5
A10	17.43	96.1	14	26.6

>TRINITY_DN110431_c4_g1_i7 from sample A2 / Example spliced isoform

GGTACTAGGAGATCAGTGGTTTTAGGATTTTTAAAATAGTTTGCATTTTGTTTCTACATTGTTCTTGTTTTGAATGATCCATTTTGTGTTTCTATATTCTTTTCTAATGCTGACAATTACTTTTTTTATCATGTTTGCATTTTGGTCATGTAATGATAACTATTTATACCTGTGGAAGAAGCTGGTGGAAATCACCCATA
TCTATAGTTGTAAATTTGGTTGCATTGCAGAATTGATTGTTCATAGTATTGATTTGTTTATTAATGGAGTATATGGGAATGTTCACTGTGCAGGGATCTGTATTATTGCTGTTAAATTCTGCTGAAAAATTGAACTATTCAGAAATCAAATCTCAGCTGAATTTGTCAGACAAAGATATTGTTAGATTGCTACATTCACT
TTTGTGTTTAAAACACAAAGTTCTGAATAAGGAGCGAAGCAGAAAAACTGTCATACAGTCTGATCACTTCGAATTTAATGCAAAATTTACTGACAAATCAAGAAAGATCAAGATTCCTCTTCCTCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGGTGATATGCAATTGGTGCTTGTATTATTT
GAATCATAAAGAGTAGAAAAGTTTTAGCCCATGCACAATTAGTAACAGAGTGCAATGAGCAACTTGGACAAATGTTCAAGCTGGATTTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAATATTTGATAGCAAGGGAATTCTTGGGGGTTGACAAAAACAACGCTAACATGTTCAGATATCTAGCCTGAAAAAGCTTCAACTAAATG
AGTGGGTTTTTGGCTTTGTAAAATTCCCTGCCTTGCCCAAAATTTCATTAATTTGTAATCCAAA

>TRINITY_DN110431_c4_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GGTACTAGGAGATCAGTGGTTTTAGGATTTTTAAAATAGTTTGCATTTTGTTTCTACATTGTTCTTGTTTTGAATGATCCATTTTGTGTTTCTATATTCTTTTCTAATGCTGACAATTACTTTTTTTATCATGTTTGCATTTTGGTCATGTAATGATAACTATTTATACCTGTGGAAGAAGCTGGTGGAAATCACCCATA
TCTATAGTTGTAAATTTGGTTGCATTGCAGAATTGATTGTTCATAGTATTGATTTGTTTATTAATGGAGTATATGGGAATGTTCACTGTGCAGGGATCTGTATTATTGCTGTTAAATTCTGCTGAAAAATTGAACTATTCAGAAATCAAATCTCAGCTGAATTTGTCAGACAAAGATATTGTTAGATTGCTACATTCACT
TTTGTGTTTAAAACACAAAGTTCTGAATAAGGAGCGAAGCAGAAAAACTGTCATACAGTCTGATCACTTCGAATTTAATGCAAAATTTACTGACAAATCAAGAAAGATCAAGgtctgagctaaaaacaaaccttaattatttgatttcatgtggatcttgtaacattaaaagatcacttgataatagcatttttactgaa
ttgtagATTCCTCTTCCTCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAG

Intron 3 GTAAGCACTA ... ACTGTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	39.74	12.1	13.9	2
A2	62.06	4	10.1	3
A3	68.42	3	7	6
A4	66.67	4	7	9
A5	100	0	0	2
A6	68.77	5.9	16	10
A7	46.48	25.9	28	17
A8	50.64	35.2	43.2	29
A9	46.63	24.1	28.1	14
A10	56.06	8.5	12.5	9

>TRINITY_DN48144_c1_g3_i2 from sample A7 / Example spliced isoform

AAGGTCTGAGCTAAAAACAAACCTTAATTATTTGATTTCATGTGGATCTTGTAACATTAAAAGATCACTTGATAATAGCATTTTTACTGAATTGTAGATTCCTCTTCCTCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGGTGATATGCAATTGGTGCTTGTATTATTTGAATCATAAAGAGCA
GAAAAGTTTTAGCCCATGCACAATTAGTAACAGAGTGCAATGAGCAACTTGGACAAATGTTCAAGATATGCTTTCAAAGGATGCATTGCTTCTGGAGCCCAGTCAGCTTCATATTGAGGAATTCAGAAATGGATGTTGATGACATATATGCTGCCTTATATTACAACTTACTATCAACTGAATTGCTTCTGCACCTGAAG
ATTATGTTTTCCGTTCTGCTTTAATAGGAAATATGTATTTTTTCGTGGAAAAAAGATGGTGCCAAGCATATGTGGGCTAGCATCAGAACTTGTTTTCATTTTCCAGGGTCTTCAAGAGCTAACACGAGGACTTAGCTAAAATTTGTTTTGTTCTTGTTGGGTAATATTAAACAATGGCATCAAGAACTGTCTGGTAGGGG
AGGGCTTTTCCACGGCTCAAGAATTGGCAGGAATTCGCTATTTTTCTGTGTATTTGTGTAATCATGCAATTTATTTCAATCCAAACAAAGAATTGGCGGAGGCCTGCTTGATTCAATTATTAGGTTCCTTGTTTGATATCTGATTGCATGGATAATATGTGCAAATGAAGTGATCCCTACCTCCAACACTAATGAGTTGG
TAAGAATAAACTCCTTCTGTAGGTGTCACGTTAAAGATTTATCTTATGAATTACATAAACAAAATTGAGCTCCATGC

>TRINITY_DN48144_c1_g3_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AAGGTCTGAGCTAAAAACAAACCTTAATTATTTGATTTCATGTGGATCTTGTAACATTAAAAGATCACTTGATAATAGCATTTTTACTGAATTGTAGATTCCTCTTCCTCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGGTGATATGCAATTGGTGCTTGTATTATTTGAATCATAAAGAGCA
GAAAAGTTTTAGCCCATGCACAATTAGTAACAGAGTGCAATGAGCAACTTGGACAAATGTTCAAGgtaagcactatagaatggttaatttatttggtcataactcagacaaggaattttgcaagtttcattccgtgttagtcttttcacaaactagaaaactctttgctggcagctggattttaaagcaatcaaaaagcg
gattgaatatttgatagcaagggaattcttgggggttgacaaaaacaacgctaacatgttcagatatctagcctgaaaaagcttcaactaaatgagtgggtttttggctttgtaaaattccctgccttgcccaaaatttcattaatttgtaatccaaatttcatatattctttaactttgctggtttgctttagatctat
tagtttatttttagtgtatatggttccaagtatatgtattctatttattaaaatttgcattggagttggagttcacacagctacaagttttcagggactcctctttgaccatacagtggatgaatgatgagctccaagtatacaatactgggttaactcaattggctattcatttgaagcaacttaagggactattttag
cagattttcttcactcatatttattgaaagatgaatactgtggcagATATGCTTTCAAAGGATGCATTGCTTCTGGAGCCCAGTCAGCTTCATATTGAGGAATTCAGAAATGGATGTTGATGACATATATGCTGCCTTATATTACAACTTACTATCAACTGAATTGCTTCTGCACCTGAAGATTATGTTTTCCGTTCTGC
TTTAATAGGAAATATGTATTTTTTCGTGGAAAAAAGATGGTGCCAAGCATATGTGGGCTAGCATCAGAACTTGTTTTCATTTTCCAGGGTCTTCAAGAGCTAACACGAGGACTTAGCTAAAATTTGTTTTGTTCTTGTTGGGTAATATTAAACAATGGCATCAAGAACTGTCTGGTAGGGGAGGGCTTTTCCACGGCTCA
AGAATTGGCAGGAATTCGCTATTTTTCTGTGTATTTGTGTAATCATGCAATTTATTTCAATCCAAACAAAGAATTGGCGGAGGCCTGCTTGATTCAATTATTAGGTTCCTTGTTTGATATCTGATTGCATGGATAATATGTGCAAATGAAGTGATCCCTACCTCCAACACTAATGAGTTGGTAAGAATAAACTCCTTCTG
TAGGTGTCACGTTAAAGATTTATCTTATGAATTACATAAACAAAATTGAGCTCCATGC

Intron 4 GTCCGAGCTA ... TTGATAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	46.43	30	26	10
A2	55.56	20	25	10
A3	65.63	11	21	11
A4	55.26	17	21	11
A5	20	8	2	3
A6	67.57	12	25	3
A7	47.46	62	56	20
A8	40.16	73	49	13
A9	43.9	46	36	2
A10	40.79	45	31	8

>TRINITY_DN118879_c2_g2_i13 from sample A1 / Example spliced isoform

CGTGTTTAAAACACAAAGTCTTGAATAAGGAGCCAAACACAAAAACTGTCACACAATCTGATTACTTCGAATTTAATGCAAAATTTACTGACAAATCAAGAAAGATTAAGCGGTTTTACTGCATTGTAGATTCCTCTTTCTCCTGTGGATGAGAAGAAGACAATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGACGATATGCAAT
TGATGCTTGTATTGTTCGAATCATGAAGAGCAGAAAACATTTAGGCTATCAACAATTAGTAACAGAGTGTGTTGAGCATCTTGGACAAATGTTCAAGCCGGATTTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAA

>TRINITY_DN118879_c2_g2_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGCTGCTGCCATTGCCTATGCTATTGCTAGTCTTGATTGATGATTCTAGTTCTAGTACTGGTGATGAGTTTGATGATTGATCATCTTGATCAATGACAAGTATGATGTATGATGTATTATGTAGTGGCATCATAGGATGTTATTTTTGGACTCTACGGGCCATTTAGGCCTCATTGATTACGTATTTTGTTCCAAATATG
TATTGCACTATTGCAAATACATGTTCGATTCTTTTATTTGTGGCCATCCACCTTTTTTTACTGCCAATTTGTTGCCATACACATGGGATGTTATTCATCATATTTATGGTTCTGGATGAGGTACTAGGAGATCAGTGGTTTTAGGATTTTTAAAATAGTTTGCATTTTGTTTCTACATTGTTCTTGTTTTGAATGATCCA
TTTTGTGTTTCTATATTCTTGAATCTTTTCTAATGCTGACAATTACTTTTTGTTACCATGTCTGCATTTTGTTAATACCTGTGTGGAAGAAGCAAGTGGAAATCACCCATATCTATAGTTGTAAATTTGGTTGCTCTGCAGAATTGATTGTTCACAGTATTGATTTGTTTACTAATGGAATATATGGGGATGTTCAATGT
GCAGGGATCTGTATTATTGCTGTTCAATTCTGCAGAAAAATTGAGCTACTCAGAAATCAAATCTCAGTTGAATTTGTCTGATGAAGATGTTGTTAGATTGCTACATTCACTTTCGTGTTTAAAACACAAAGTCTTGAATAAGGAGCCAAACACAAAAACTGTCACACAATCTGATTACTTCGAATTTAATGCAAAATTTA
CTGACAAATCAAGAAAGATTAAGgtccgagctaacaaaccttgattatttgatttcatgtctatcttgtcacattaaaggatctattgataacagCGGTTTTACTGCATTGTAGATTCCTCTTTCTCCTGTGGATGAGAAGAAGACAATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGACGATATGCAATTGATGCTTGTATTGT
TCGAATCATGAAGAGCAGAAAACATTTAGGCTATCAACAATTAGTAACAGAGTGTGTTGAGCATCTTGGACAAATGTTTAAGCCGGATTTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAAGAGTTGATCACAAGGGAATACTTGGAGCGTGACAAAAACAACCCTAACTTGTACATATATATAGCCTGAAAAGGCTTCAACTAAA
TGAGGGGGGTTTTGGCTTTGTAAAATACCCTGCCTTGCCCAAAATTTCATGAAGCATTAATCAAATTTCATATATTCTTCAACTTTGCTGGTTTCCTTTAGAGCTATTAGCTTATGTTTAGTGTATATGGTTCCAAGC

Intron 5 GTGGGTTTTT ... ACTGTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	94.59	2	35	2
A2	86.85	3	20	3
A3	95.83	1	23	6
A4	72.73	6	16	9
A5	100	0	6	2
A6	84.88	12	68	10
A7	84.69	19	105.5	17
A8	82.4	29	136.5	29
A9	83.19	20	100	14
A10	89.7	6	52.5	9

>TRINITY_DN48144_c1_g3_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

AAGGTCTGAGCTAAAAACAAACCTTAATTATTTGATTTCATGTGGATCTTGTAACATTAAAAGATCACTTGATAATAGCATTTTTACTGAATTGTAGATTCCTCTTCCTCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGGTGATATGCAATTGGTGCTTGTATTATTTGAATCATAAAGAGCA
GAAAAGTTTTAGCCCATGCACAATTAGTAACAGAGTGCAATGAGCAACTTGGACAAATGTTCAAGCTGGATTTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAATATTTGATAGCAAGGGAATTCTTGGGGGTTGACAAAAACAACGCTAACATGTTCAGATATCTAGCCTGAAAAAGCTTCAACTAAATGAATATGCTTTCAAAG
GATGCATTGCTTCTGGAGCCCAGTCAGCTTCATATTGAGGAATTCAGAAATGGATGTTGATGACATATATGCTGCCTTATATTACAACTTACTATCAACTGAATTGCTTCTGCACCTGAAGATTATGTTTTCCGTTCTGCTTTAATAGGAAATATGTATTTTTTCGTGGAAAAAAGATGGTGCCAAGCATATGTGGGCTA
GCATCAGAACTTGTTTTCATTTTCCAGGGTCTTCAAGAGCTAACACGAGGACTTAGCTAAAATTTGTTTTGTTCTTGTTGGGTAATATTAAACAATGGCATCAAGAACTGTCTGGTAGGGGAGGGCTTTTCCACGGCTCAAGAATTGGCAGGAATTCGCTATTTTTCTGTGTATTTGTGTAATCATGCAATTTATTTCAA
TCCAAACAAAGAATTGGCGGAGGCCTGCTTGATTCAATTATTAGGTTCCTTGTTTGATATCTGATTGCATGGATAATATGTGCAAATGAAGTGATCCCTACCTCCAACACTAATGAGTTGGTAAGAATAAACTCCTTCTGTAGGTGTCACGTTAAAGATTTATCTTATGAATTACATAAACAAAATTGAGCTCCATGC

>TRINITY_DN48144_c1_g3_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AAGGTCTGAGCTAAAAACAAACCTTAATTATTTGATTTCATGTGGATCTTGTAACATTAAAAGATCACTTGATAATAGCATTTTTACTGAATTGTAGATTCCTCTTCCTCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGGTGATATGCAATTGGTGCTTGTATTATTTGAATCATAAAGAGCA
GAAAAGTTTTAGCCCATGCACAATTAGTAACAGAGTGCAATGAGCAACTTGGACAAATGTTCAAGCTGGATTTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAATATTTGATAGCAAGGGAATTCTTGGGGGTTGACAAAAACAACGCTAACATGTTCAGATATCTAGCCTGAAAAAGCTTCAACTAAATGAgtgggtttttggct
ttgtaaaattccctgccttgcccaaaatttcattaatttgtaatccaaatttcatatattctttaactttgctggtttgctttagatctattagtttatttttagtgtatatggttccaagtatatgtattctatttattaaaatttgcattggagttggagttcacacagctacaagttttcagggactcctctttgac
catacagtggatgaatgatgagctccaagtatacaatactgggttaactcaattggctattcatttgaagcaacttaagggactattttagcagattttcttcactcatatttattgaaagatgaatactgtggcagATATGCTTTCAAAGGATGCATTGCTTCTGGAGCCCAGTCAGCTTCATATTGAGGAATTCAGAA
ATGGATGTTGATGACATATATGCTGCCTTATATTACAACTTACTATCAACTGAATTGCTTCTGCACCTGAAGATTATGTTTTCCGTTCTGCTTTAATAGGAAATATGTATTTTTTCGTGGAAAAAAGATGGTGCCAAGCATATGTGGGCTAGCATCAGAACTTGTTTTCATTTTCCAGGGTCTTCAAGAGCTAACACGAG
GACTTAGCTAAAATTTGTTTTGTTCTTGTTGGGTAATATTAAACAATGGCATCAAGAACTGTCTGGTAGGGGAGGGCTTTTCCACGGCTCAAGAATTGGCAGGAATTCGCTATTTTTCTGTGTATTTGTGTAATCATGCAATTTATTTCAATCCAAACAAAGAATTGGCGGAGGCCTGCTTGATTCAATTATTAGGTTCC
TTGTTTGATATCTGATTGCATGGATAATATGTGCAAATGAAGTGATCCCTACCTCCAACACTAATGAGTTGGTAAGAATAAACTCCTTCTGTAGGTGTCACGTTAAAGATTTATCTTATGAATTACATAAACAAAATTGAGCTCCATGC

Intron 6 GTACGCAAAA ... TTCTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	32.26	84	48	32
A2	27.84	92	45	26
A3	22.54	110	45	19
A4	31.3	45	23	18
A5	39.73	22	15	14
A6	37.66	24	14	15
A7	27.66	119	61	30
A8	23.08	85	28	23
A9	14.49	121	29	12
A10	29.6	88	38	36

>TRINITY_DN43778_c0_g1_i21 from sample A8 / Example spliced isoform

CAAATGTGTACCAACTAAGGTTTGCTAACAACCTTTGATGGACAAATAGTATTCAGTGAACAAGGTACATTGTATTTGAACATTGTAGGAAAAAACTAGCATGTCGGCTTATATTTGATAAAACTACAAATGATGAACATGAACGGAGTATCTTAATGAAATTGAAGCAAAAATGTGGAGGCCAGTTTACTTCAAAGATG
GAGGGAATGCTTACTGATTTGACTTTGGCACGGGAGAACGAACCAAAATTTCAAAAATATCTTGATGATAATGTGCATGCATC

>TRINITY_DN43778_c0_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:

GGTAAAGTCTTTTGCATACATCGGTGATAAATATCTATTTTCAGAATTTTATAGGAAAAAACTAGCACGTCGGCTTATGTTTGATAAAACTACAAATGATGAACATGAACGGAGTATCTTAATGAAATTGAAGCAAAAATGTGGAGGCCAGTTTACTTCAAAGATGGAGGGAATGgtacgcaaaatgtgactgttttttt
aagtctgtgtaatgcttacagcttgtgtatttataatttaaaaccctgagaaataatttaaacctccttgatttgtgttgttctaatccatatatttcttctcagCTTACTGATTTGACTTTGGCACGGGAGAACGAACCAAAATTTCAAAAATATCTTGATGATAATGTGCATGCATC

Intron 7 GTAAATTCTT ... CAATGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.59	156	38	12
A2	18.52	154	35	11
A3	21.16	164	44	5
A4	24.44	102	33	18
A5	21.21	52	14	7
A6	14.89	120	21	2
A7	15.45	416	76	14
A8	13.99	332	54	5
A9	13.5	314	49	3
A10	17.98	301	66	9

>TRINITY_DN43778_c0_g1_i15 from sample A8 / Example spliced isoform

TTTGTCTTGTGGGTTCACAATTAGTTTTATTTTTCCATATGTTTTGCTGTTTTTTACTAGTGTTTTGGCTTATTTTATTAGCCAAGCTGGTCCCAGAATGGCTTACTCTTGGCTGAGCAGGTGGGAAAATATGGCTGTTTTGGTGCATGTTGGGGACAGCAGGCTGCGGGAATGCCCAAAAGTTCATAAAGTGCTCAGTT
TTTGGGCAGGAAACTCACTGGGAATGTCAGCAATGTTTTCCAATGCCATTCCCTGCCAAATTGACCATTCCCTACCTGTTCCAGAATTCCCTGGGATATGTTAACCCAAAGAATGTGTCCCTTGGCAGTGGGAATGATATCCTGTTCAACTATGATTTTATTCTATGTTTTGGTCCTCAAAAACCAAACACTTGAGCAAT
GTCCGAAATAAAATCTTTTAGCATTGAAAGCGAAATCAGAGGACCCCAAAATAGTGATGGGTCATAGATGGAGATTCCATTTTTGGGTGGAGTAATTTTAATTTTTAAAGAAGTTATTGTAGGCTAAATCAACATATTTTTGGCATTACTTGCAAGCGGGTCAAGACATGTATTGAAATAGACATTCCACCAAGGTTGAA
ACACTAAATTGCAAATTGTAGCAAATAATAATGATTGATTGTCAAATTTCAATTACCAAGTGCTTTTTACCCTTCTTAACCCGCCTTTTAGGAATAACTCTTTCAAGAGTTGACGTTTTAGTCAGGTCCAACTAAGTAAGGCCTTCAATGTCACTGAGTCAAGTAGGGGGTGGAAATTCCAGCAGGCAGGGCAAGCGTGC
AACACAAAGCATGTTAAGTAATGATTGGTGGGTAAATTGCAAGTATGTAGTTTCCCTCACCACCCCAATGGTTTTGTGTCGTGTGTTTTATAGGAAAAGCCTGTGTAGTGTCATGATTATCTATCAATTATTGTATTTTTATTTAGCTTATTAATGATAAAGTTAGAAACCATTCATTCACTTATTTGAATAAGTTCCTA
ATTCAATGTTTGCAATTTGTCTCTCTAGAATTATTTGATTGTAACTTTTATGGATGTATTTGTTTTTGTTCCCACTCTGTTATTGCTACCTTACTGCTTGTGCTGTTCGTTGAAATTGGACCCTACACTTGAGCCATCCCTGAAAGTTATCACCCTGTTGCTGGAAGTTGGTGGAACCTATGAATATTATTTTGTAGAAC
TCGTAGGTGAGTTTTGATTGTTTGCCACCCTCTGTTTACAGGTAAAATGTGTAGAGGTATTTAAAGAATTCTACCAGACAGAAACTAAACATCGAAAGCTTACATGGATATACTCTTTAGGGACGTGCAATATTTTTGGCAATTTTAATGCCAGGTCGGTGGAACTTATTGTGACTACATATCAGGGATCTGTATTATTG
CTGTTCAATTCTGCAGAAAAATTGAGCTACTCAGAAATCAAATCTCAGTTGAATTTGTCTGATGAAGATGTTGTTAGATTGCTACATTCACTTTCGTGTTTAAAACACAAAGTCTTGAATAAGGAGCCAAACACAAAAACTGTCACACAATCTGATTACTTCGAATTTAATGCAAAATTTACTGACAAATCAAGAAAGAT
TAAGGTCCAAGCTAACAAACCTTGATTATTTGATTTCATGTCTATCTTGTCACATTAAAGGATCTATTGATAGCAGCGGTTTTACTGCATTGTAGATTCCTCTTTCTCCTGTGGATGAGAAGAAGACAATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGACGATATGCAATTGATGCTTGTATTGTTCGAATCATGAAGAGCAGA
AAACATTTAGGCTATCAACA

>TRINITY_DN43778_c0_g1_i16 from sample A8 / Example unspliced isoform:

TTTGTCTTGTGGGTTCACAATTAGTTTTATTTTTCCATATGTTTTGCTGTTTTTTACTAGTGTTTTGGCTTATTTTATTAGCCAAGCTGGTCCCAGAATGGCTTACTCTTGGCTGAGCAGGTGGGAAAATATGGCTGTTTTGGTGCATGTTGGGGACAGCAGGCTGCGGGAATGCCCAAAAGTTCATAAAGTGCTCAGTT
TTTGGGCAGGAAACTCACTGGGAATGTCAGCAATGTTTTCCAATGCCATTCCCTGCCAAATTGACCATTCCCTACCTGTTCCAGAATTCCCTGGGATATGTTAACCCAAAGAATGTGTCCCTTGGCAGTGGGAATGATATCCTGTTCAACTATGATTTTATTCTATGTTTTGGTCCTCAAAAACCAAACACTTGAGCAAT
GTCCGAAATAAAATCTTTTAGCATTGAAAGCGAAATCAGAGGACCCCAAAATAGTGATGGGTCATAGATGGAGATTCCATTTTTGGGTGGAGTAATTTTAATTTTTAAAGAAGTTATTGTAGGCTAAATCAACATATTTTTGGCATTACTTGCAAGCGGGTCAAGACATGTATTGAAATAGACATTCCACCAAGGTTGAA
ACACTAAATTGCAAATTGTAGCAAATAATAATGATTGATTGTCAAATTTCAATTACCAAGTGCTTTTTACCCTTCTTAACCCGCCTTTTAGGAATAACTCTTTCAAGAGTTGACGTTTTAGTCAGGTCCAACTAAGTAAGGCCTTCAATGTCACTGAGTCAAGTAGGGGGTGGAAATTCCAGCAGGCAGGGCAAGCGTGC
AACACAAAGCATGTTAAGTAATGATTGGTGGGTAAATTGCAAGTATGTAGTTTCCCTCACCACCCCAATGGTTTTGTGTCGTGTGTTTTATAGGAAAAGCCTGTGTAGTGTCATGATTATCTATCAATTATTGTATTTTTATTTAGCTTATTAATGATAAAGTTAGAAACCATTCATTCACTTATTTGAATAAGTTCCTA
ATTCAATGTTTGCAATTTGTCTCTCTAGAATTATTTGATTGTAACTTTTATGGATGTATTTGTTTTTGTTCCCACTCTGTTATTGCTACCTTACTGCTTGTGCTGTTCGTTGAAATTGGACCCTACACTTGAGCCATCCCTGAAAGTTATCACCCTGTTGCTGGAAGTTGGTGGAACCTATGAATATTATTTTGTAGAAC
TCGTAGGTGAGTTTTGATTGTTTGCCACCCTCTGTTTACAGGTAAAATGTGTAGAGGTATTTAAAGAATTCTACCAGACAGAAACTAAACATCGAAAGCTTACATGGATATACTCTTTAGGGACGTGCAATATTTTTGGCAATTTTAATGCCAGGTCGGTGGAACTTATTGTGACTACATATCAGgtaaattctttgttt
atttatttttatatatatttttttatgttttccgttcttttatttgttgccatccaccttttttcctgccaatttattgccatccacttgagatgttattgatcacatttatggttctggacgaggcactagcagattagtggttttaggatttttaaaatagtttgcattttgtttctacattgttcttgttttgaatg
atccattttgtgtttctatattcttgaatcttttctaatgctgacaattactttttgttaccatgtctgcattttgttaatacctgtgtggaagaagcaagtggaaatcacccatatctatagttgtaaatttggttgccctgcagaattgattgttcatagtattgatttgtttactaatggaatatatggggatgttc
aatgtgcagGGATCTGTATTATTGCTGTTAAATTCTGCTGAAAAATTGAACTATTCAGAAATCAAATCTCAGCTGAATTTGTCAGACAAAGATA

Intron 8 GTAAGCACTA ... TTGCTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	33.5	24.8	14.1	10.9
A2	29.97	20.2	10.1	6.9
A3	18.55	19.9	7	1.9
A4	41.14	11	7.1	8
A5	0	3.9	0	0
A6	26.07	50.7	16	19.7
A7	26.3	89.7	28.2	35.5
A8	25.5	108.4	43.4	30.6
A9	23.83	97.1	28.2	32.3
A10	25.31	47.8	12.5	19.8

>TRINITY_DN118879_c2_g2_i16 from sample A1 / Example spliced isoform

TGCTGCTGCCATTGCCTATGCTATTGCTAGTCTTGATTGATGATTCTAGTTCTAGTACTGGTGATGAGTTTGATGATTGATCATCTTGATCAATGACAAGTATGATGTATGATGTATTATGTAGTGGCATCATAGGATGTTATTTTTGGACTCTACGGGCCATTTAGGCCTCATTGATTACGTATTTTGTTCCAAATATG
TATTGCACTATTGCAAATACATGTTCGATTCTTTTATTTGTGGCCATCCACCTTTTTTTACTGCCAATTTGTTGCCATACACATGGGATGTTATTCATCATATTTATGGTTCTGGATGAGGTACTAGGAGATCAGTGGTTTTAGGATTTTTAAAATAGTTTGCATTTTGTTTCTACATTGTTCTTGTTTTGAATGATCCA
TTTTGTGTTTCTATATTCTTTTCTAATGCTGACAATTACTTTTTTTATCATGTTTGCATTTTGGTCATGTAATGATAACTATTTATACCTGTGGAAGAAGCTGGTGGAAATCACCCATATCTATAGTTGTAAATTTGGTTGCATTGCAGAATTGATTGTTCATAGTATTGATTTGTTTATTAATGGAGTATATGGGAATG
TTCACTGTGCAGGGATCTGTATTATTGCTGTTAAATTCTGCTGAAAAATTGAACTATTCAGAAATCAAATCTCAGCTGAATTTGTCAGACAAAGATATTGTTAGATTGCTACATTCACTTTTGTGTTTAAAACACAAAGTTCTGAATAAGGAGCGAAGCAGAAAAACTGTCATACAGTCTGATCACTTCGAATTTAATGC
AAAATTTACTGACAAATCAAGAAAGATCAAGATTCCTCTTCCTCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGGTGATATGCAATTGGTGCTTGTATTATTTGAATCATAAAGAGCAGAAAAGTTTTAGCCCATGCACAATTAGTAACAGAGTGCAATGAGCAACTTGGACAAATGTTCAAGC
TGGATTTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAATATTTGATAGCAAGGGAATTCTTGGGGGTTGACAAAAACAACGCTAACATGTTCAGATATCTAGCCTGAAAAAGCTTCAACTAAATGAGTGGGTTTTTGGCTTTGTAAAATTCCCTGCCTTGCCCAAAATTTCATTAATTTGTAATCCAAATTTCATATATTCTTTAA
CTTTGCTGGTTTGCTTTAGATCTATTAGTTTATTTTTAGTGTATATGGTTCCAAGTATATGTATTCTATTTATTAAAATTTGCATTGGAGTTGGAGTTCACACAGCTACAAGTTTTCAGGGACTCCTCTTTGACCATACAGTGGATGAATGATGAGCTCCAAGTATACAATACTGGGTTAACTCAATTGGCTATTCATTT
GAAGCAACTTAAGGGACTATTTTAGCAGATTTTCTTCACTCATATTTATTGAAAGATGAATACTGTGGCAGATATGCTTTCAAAGGATGCATTGCTTCTGGAGCCCAGTCAGCTTCATATTGAGGAATTCAGAAATGGATGTTGATGACATATATGCTGCCTTATATTACAACTTACTATCAACTGAATTGCTTCTGCAC
CTGAAGATTATGTTTTCCGTTCTGCTTTAATAGGAAATATGTATTTTTTCGTGGAAAAAAGATGGTGCCAAGCATATGTGGGCTAGCATCAGAACTTGTTTTCATTTTCCAGGGTCTTCAAGAGCTAACACGAGGACTTAGCTAAAATTTGTTTTGTTCTTGTTGGGTAATATTAAACAATGGCATCAAGAACTGTCTGG
TAGGGGAGGGCTTTTCCACGGCTCAAGAATTGGCAGGAATTCGCTATTTTTCTGTGTATTTGTGTAATCATGCAATTTATTTCAATCCAAACAAAGAATTGGCGG

>TRINITY_DN118879_c2_g2_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGCTGCTGCCATTGCCTATGCTATTGCTAGTCTTGATTGATGATTCTAGTTCTAGTACTGGTGATGAGTTTGATGATTGATCATCTTGATCAATGACAAGTATGATGTATGATGTATTATGTAGTGGCATCATAGGATGTTATTTTTGGACTCTACGGGCCATTTAGGCCTCATTGATTACGTATTTTGTTCCAAATATG
TATTGCACTATTGCAAATACATGTTCGATTCTTTTATTTGTGGCCATCCACCTTTTTTTACTGCCAATTTGTTGCCATACACATGGGATGTTATTCATCATATTTATGGTTCTGGATGAGGTACTAGGAGATCAGTGGTTTTAGGATTTTTAAAATAGTTTGCATTTTGTTTCTACATTGTTCTTGTTTTGAATGATCCA
TTTTGTGTTTCTATATTCTTTTCTAATGCTGACAATTACTTTTTTTATCATGTTTGCATTTTGGTCATGTAATGATAACTATTTATACCTGTGGAAGAAGCTGGTGGAAATCACCCATATCTATAGTTGTAAATTTGGTTGCATTGCAGAATTGATTGTTCATAGTATTGATTTGTTTATTAATGGAGTATATGGGAATG
TTCACTGTGCAGGGATCTGTATTATTGCTGTTAAATTCTGCTGAAAAATTGAACTATTCAGAAATCAAATCTCAGCTGAATTTGTCAGACAAAGATATTGTTAGATTGCTACATTCACTTTTGTGTTTAAAACACAAAGTTCTGAATAAGGAGCGAAGCAGAAAAACTGTCATACAGTCTGATCACTTCGAATTTAATGC
AAAATTTACTGACAAATCAAGAAAGATCAAGATTCCTCTTCCTCCTGTGGATTAGAAGAAGAGGATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGGTGATATGCAATTGGTGCTTGTATTATTTGAATCATAAAGAGCAGAAAAGTTTTAGCCCATGCACAATTAGTAACAGAGTGCAATGAGCAACTTGGACAAATGTTCAAGg
taagcactatagaatggttaatttatttggtcataactcagacaaggaattttgcaagtttcattccgtgttagtcttttcacaaactagaaaactctttgctggcagCTGGATTTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAATATTTGATAGCAAGGGAATTCTTGGGGGTTGACAAAAACAACGCTAACATGTTCAGATA
TCTAGCCTGAAAAAGCTTCAACTAAATGAGTGGGTTTTTGGCTTTGTAAAATTCCCTGCCTTGCCCAAAATTTCATTAATTTGTAATCCAAATTTCATATATTCTTTAACTTTGCTGGTTTGCTTTAGATCTATTAGTTTATTTTTAGTGTATATGGTTCCAAGTATATGTATTCTATTTATTAAAATTTGCATTGGAGT
TGGAGTTCACACAGCTACAAGTTTTCAGGGACTCCTCTTTGACCATACAGTGGATGAATGATGAGCTCCAAGTATACAATACTGGGTTAACTCAATTGGCTATTCATTTGAAGCAACTTAAGGGACTATTTTAGCAGATTTTCTTCACTCATATTTATTGAAAGATGAATACTGTGGCAGATATGCTTTCAAAGGATGCA
TTGCTTCTGGAGCCCAGTCAGCTTCATATTGAGGAATTCAGAAATGGATGTTGATGACATATATGCTGCCTTATATTACAACTTACTATCAACTGAATTGCTTCTGCACCTGAAGATTATGTTTTCCGTTCTGCTTTAATAGGAAATATGTATTTTTTCGTGGAAAAAAGATGGTGCCAAGCATATGTGGGCTAGCATCA
GAACTTGTTTTCATTTTCCAGGGTCTTCAAGAGCTAACACGAGGACTTAGCTAAAATTTGTTTTGTTCTTGTTGGGTAATATTAAACAATGGCATCAAGAACTGTCTGGTAGGGGAGGGCTTTTCCACGGCTCAAGAATTGGCAGGAATTCGCTATTTTTCTGTGTATTTGTGTAATCATGCAATTTATTTCAATCCAAA
CAAAGAATTGGCGG

Intron 9 GTATGCAAAA ... TTCTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	34.12	84	43	44
A2	24.59	92	34	26
A3	21.99	110	42	20
A4	33.33	45	20	25
A5	38.03	22	13	14
A6	37.66	24	12	17
A7	25.86	119	48	35
A8	23.42	85	28	24
A9	12	121	20	13
A10	29.88	88	37	38

>TRINITY_DN43778_c0_g1_i21 from sample A8 / Example spliced isoform

CAAATGTGTACCAACTAAGGTTTGCTAACAACCTTTGATGGACAAATAGTATTCAGTGAACAAGGTACATTGTATTTGAACATTGTAGGAAAAAACTAGCATGTCGGCTTATATTTGATAAAACTACAAATGATGAACATGAACGGAGTATCTTAATGAAATTGAAGCAAAAATGTGGAGGCCAGTTTACTTCAAAGATG
GAGGGAATGCTTACTGATTTGACTTTGGCACGGGAGAACGAACCAAAATTTCAAAAATATCTTGATGATAATGTGCATGCATC

>TRINITY_DN43778_c0_g1_i22 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CAAATGTGTACCAACTAAGGTTTGCTAACAACCTTTGATGGACAAATAGTATTCAGTGAACAAGGTACATTGTATTTGAACATTGTAGGAAAAAACTAGCATGTCGGCTTATATTTGATAAAACTACAAATGATGAACATGAACGGAGTATCTTAATGAAATTGAAGCAAAAATGTGGAGGCCAGTTTACTTCAAAGATG
GAGGGAATGgtatgcaaaatgtgactgttttttaaagtctgtaatgcttacagcttgtgtatttataatttaaaaccctgagaaataatttaaacctccttgatttgtgttgttctaatccatatatttcttctcagCTTACTGATTTGACTTTGGCACGGGAGAACGAACCAAAATTTCAAAAATATCTTGATGATAAT
GTGCATGCATC

Intron 10 GTCCAAGCTA ... TGCATTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.57	127.7	25.7	29.3
A2	18.73	103.7	23.7	24.7
A3	19.57	89.7	21	23
A4	17.44	83.3	20.3	15.3
A5	12.59	35.3	2	8.3
A6	18.27	120	24.7	29.7
A7	17.43	268.7	55.7	58.7
A8	15.2	322.3	48	69
A9	14.39	268.3	36	56
A10	15.58	218.7	31.3	50.3

>TRINITY_DN118879_c2_g2_i9 from sample A1 / Example spliced isoform

TGCTGCTGCCATTGCCTATGCTATTGCTAGTCTTGATTGATGATTCTAGTTCTAGTACTGGTGATGAGTTTGATGATTGATCATCTTGATCAATGACAAGTATGATGTATGATGTATTATGTAGTGGCATCATAGGATGTTATTTTTGGACTCTACGGGCCATTTAGGCCTCATTGATTACGTATTTTGTTCCAAATATG
TATTGCACTATTGCAAATACATGTTCGATTCTTTTATTTGTGGCCATCCACCTTTTTTTACTGCCAATTTGTTGCCATACACATGGGATGTTATTCATCATATTTATGGTTCTGGATGAGGTACTAGGAGATCAGTGGTTTTAGGATTTTTAAAATAGTTTGCATTTTGTTTCTACATTGTTCTTGTTTTGAATGATCCA
TTTTGTGTTTCTATATTCTTGAATCTTTTCTAATGCTGACAATTACTTTTTGTTACCATGTCTGCATTTTGTTCATGTAATGATAACTATTAATACCTGTGTGGAAGAAGCAAGTGGAAATCACCCATATCTATAGTTGTAAATTTGGTTGCTCTGCAGAATTGATTGTTCACAGTATTGATTTGTTTACTAATGGAATA
TATGGGGATGTTCAATGTGCAGGGATCTGTATTATTGCTGTTCAATTCTGCAGAAAAATTGAGCTACTCAGAAATCAAATCTCAGTTGAATTTGTCTGATGAAGATGTTGTTAGATTGCTACATTCACTTTCGTGTTTAAAACACAAAGTCTTGAATAAGGAGCCAAACACAAAAACTGTCACACAATCTGATTACTTCG
AATTTAATGCAAAATTTACTGACAAATCAAGAAAGATTAAGATTCCTCTTTCTCCTGTGGATGAGAAGAAGACAATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGACGATATGCAATTGATGCTTGTATTGTTCGAATCATGAAGAGCAGAAAACATTTAGGCTATCAACAATTAGTAACAGAGTGTGTTGAGCATCTTGGACAA
ATGTTTAAGCCGGATTTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAAGAGTTGATCACAAGGGAATACTTGGAGCGTGACAAAAACAACCCTAACTTGTACATATATATAGCCTGAAAAGGCTTCAACTAAATGAGGGGGGTTTTGGCTTTGTAAAATACCCTGCCTTGCCCAAAATTTCATGAAGCATTAATCAAATTTCATAT
ATTCTTCAACTTTGCTGGTTTCCTTTAGAGCTATTAGCTTATGTTTAGTGTATATGGTTCCAAGC

>TRINITY_DN118879_c2_g2_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGCTGCTGCCATTGCCTATGCTATTGCTAGTCTTGATTGATGATTCTAGTTCTAGTACTGGTGATGAGTTTGATGATTGATCATCTTGATCAATGACAAGTATGATGTATGATGTATTATGTAGTGGCATCATAGGATGTTATTTTTGGACTCTACGGGCCATTTAGGCCTCATTGATTACGTATTTTGTTCCAAATATG
TATTGCACTATTGCAAATACATGTTCGATTCTTTTATTTGTGGCCATCCACCTTTTTTTACTGCCAATTTGTTGCCATACACATGGGATGTTATTCATCATATTTATGGTTCTGGATGAGGTACTAGGAGATCAGTGGTTTTAGGATTTTTAAAATAGTTTGCATTTTGTTTCTACATTGTTCTTGTTTTGAATGATCCA
TTTTGTGTTTCTATATTCTTGAATCTTTTCTAATGCTGACAATTACTTTTTGTTACCATGTCTGCATTTTGTTAATACCTGTGTGGAAGAAGCAAGTGGAAATCACCCATATCTATAGTTGTAAATTTGGTTGCTCTGCAGAATTGATTGTTCACAGTATTGATTTGTTTACTAATGGAATATATGGGGATGTTCAATGT
GCAGGGATCTGTATTATTGCTGTTCAATTCTGCAGAAAAATTGAGCTACTCAGAAATCAAATCTCAGTTGAATTTGTCTGATGAAGATGTTGTTAGATTGCTACATTCACTTTCGTGTTTAAAACACAAAGTCTTGAATAAGGAGCCAAACACAAAAACTGTCACACAATCTGATTACTTCGAATTTAATGCAAAATTTA
CTGACAAATCAAGAAAGATTAAGgtccgagctaacaaaccttgattatttgatttcatgtctatcttgtcacattaaaggatctattgataacagcggttttactgcattgtagATTCCTCTTTCTCCTGTGGATGAGAAGAAGACAATAATTGAGGACGTGGACAAAGATAGACGATATGCAATTGATGCTTGTATTGT
TCGAATCATGAAGAGCAGAAAACATTTAGGCTATCAACAATTAGTAACAGAGTGTGTTGAGCATCTTGGACAAATGTTTAAGCCGGATTTTAAAGCAATCAAAAAGCGGATTGAAGAGTTGATCACAAGGGAATACTTGGAGCGTGACAAAAACAACCCTAACTTGTACATATATATAGCCTGAAAAGGCTTCAACTAAA
TGAGGGGGGTTTTGGCTTTGTAAAATACCCTGCCTTGCCCAAAATTTCATGAAGCATTAATCAAATTTCATATATTCTTCAACTTTGCTGGTTTCCTTTAGAGCTATTAGCTTATGTTTAGTGTATATGGTTCCAAGC