sp|Q5VQ78|COB21_ORYSJ ----> Coatomer subunit beta'-1

Intron 1 GTTGAGTCTT ... TCTATTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	63.85	5	10.7	7
A2	86.67	1	4	9
A3	85.71	1	9	3
A4	87.96	1	3.7	11
A5	43.77	4	4.3	2
A6	66.02	3	5.7	6
A7	66.32	7	16.7	11
A8	61.29	6	7	12
A9	62.96	5	8	9
A10	86.67	1	3	10

>TRINITY_DN44820_c1_g1_i17 from sample A9 / Example spliced isoform

TGAGTAGAACAATTTGGGCCCTAAGAAGGTTGAGTGGAGAAGATACCGTAAACATTGCAAATTCATGGCAGAGGATCATGACCTATATTGGGGATCATGAGAGTACAAAATGGACTTTTTATCTGTACAAAACAAACTCTAAGGGAGGGAAAGAATGCACATTGCATAAAAGATGGTGTATGGAGAGAGGAAGTCTACAA
TTTTTTGTTTGTTTTTTCGTGTCATTTAGTTTTCTTGGGTTTAAGCATGGCCACACTTTGTTTCGTTTGTCATGTGTTATGGTTGTTTCTCTTTGTTTTGCAATTTTTTTTTGTGGTTTGGTTTTGCTTGTTGGTCGGAGGGGGAAAGTGGTACAAATAGTATACAAAAGAGATGAGATGGGGATTATTGTTCAAACATG
AAGTGGGTGACTGCATACATTTGTAGAATCTAAATTGTAGAATCTAAGAAGGTGGAGTGGTGAAGATGCCTTACAAATGGCAATTGCAGCATAGATGATAGGGCTTATTGTTTTTGGTTGTCATTGTTATCACGTTGATTTGTGTTTGACGAACCCATAGAAGTTGGCAATGGCCAAGCACACAGAGTGAGTGACTACAA
CTTGGGCCCTAAGAAGGCCGAGTGGAGAAGATACCATAAATATTGCAATTCATGGCCAGAGGATTGGCTTGAGAATACTTTGAATTATGGGCTGGAAAGATTTTGGGCCACCGGCTATTTGAAAAACTCAAATTGATAATTGCTGCAGCAAAGAGGGGATACATTTCTGAATAATTTTTTTAAGTTGGGGCTGATCCGAA
TCCATTCCTTGCAGCACAAGGGTGGCTGGAACTGGGATGTACAGGATTAAACTGTTCTCATGAGAAAAGTGTCCAATGTTCATTGAGGATTAATGGAAACTTAGTCAAAGGCTCAAAATTGCCTAATATGGAGAATGCCCTCTCTAGAATATTGAGATGGGGTAGCTTCTCATCATTCCAAGGACATGATATGTTATGTA
ACAAGAAACACCCCCCTTGAAATGTTGATTATCTAGAGCAACACATTTCCCAGAAGAAATGATTGTTAGAAAGAGGATGAAGGCGTTGGTGAATATGTGTTCTCTGCTATGGGTAAATCATTTTGATGTTAGAACTGCCATATCGCATTTTATTGGTACAGATCTCTATCTCTAGATTTGTTATATATT

>TRINITY_DN44820_c1_g1_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:

AAGAAGGTTGAGTGGAGAAGATACCGTAAACATTGCAAATTCATGGCAGAGGATCATGACCTATATTGGGGCTCATACTAGAACTATATGTCTTTTTGCAGTGAGTAGAACAATTTGGGCCCTAAGAAGGTTGAGTGGAGAAGATACCGTAAACATTGCAAATTCATGGCAGAGGATCgttgagtcttattattgttttg
caaattaacattagtttctaagcgaatgaaatattccttgttgcactattatttctcttatgaatacattgattatattgttgctatataagtacatttagttcaaaatgttcatattatttgaaatatagcatgaaatataaatgcaatcgttcttgccttcaactctatagattaacatgtatgatgattccaatatc
ttattatggctctattgtagATGACCTATATTGGGGATCATGAGAGTACAAAATGGACTTTTTATCTGTACAAAACAAACTCTAAGGGAGGGAAAGAATGCACATTGCATAAAAGATGGTGTATGGAGAGAGGAAGTCTACAATTTTTTGTTTGTTTTTTCGTGTCATTTAGTTTTCTTGGGTTTAAGCATGGCCACACT
TTGTTTCGTTTGTCATGTGTTATGGTTGTTTCTCTTTGTTTTGCAATTTTTTTTTGTGGTTTGGTTTTGCTTGTTGGTCGGAGGGGGAAAGTGGTACAAATAGTATACAAAAGAGATGAGATGGGGATTATTGTTCAAACATGAAGTGGGTGACTGCATACATTTGTAGAATCTAAATTGTAGAATCTAAGAAGGTGGAG
TGGTGAAGATGCCTTACAAATGGCAATTGCAGCATAGATGATAGGGCTTATTGTTTTTGGTTGTCATTGTTATCACGTTGATTTGTGTTTGACGAACCCATAGAAGTTGGCAATGGCCAAGCACACAGAGTGAGTGACTACAACTTGGGCCCTAAGAAGGCCGAGTGGAGAAGATACCATAAATATTGCAATTCATGGCC
AGAGGATTGGCTTGAGAATACTTTGAATTATGGGCTGGAAAGATTTTGGGCCACCGGCTATTTGAAAAACTCAAATTGATAATTGCTGCAGCAAAGAGGGGATACATTTCTGAATAATTTTTTTAAGTTGGGGCTGATCCGAATCCATTCCTTGCAGCACAAGGGTGGCTGGAACTGGGATGTACAGGATTAAACTGTTC
TCATGAGAAAAGTGTCCAATGTTCATTGAGGATTAATGGAAACTTAGTCAAAGGCTCAAAATTGCCTAATATGGAGAATGCCCTCTCTAGAAGATTGAGATGGGGTGGCTTCTCATCATTCCAAGGACATGATATGTTATTTAATAAGAAACACCCCCCTTGAAATGTTGATTATCTAGAGCAACACATTTCCCAAGAAG
AAATGATTGTTAGAAAGAGGATGAAGGCTTTGGTGAATATGTATTCTCTGCTATGGGTAAATCATATTGATGTTAGAACTGCCATATCACATTTTGTTGGTACAGATCTTTATCTCTAGATTTGTTATATATTTATTGTGGGCTATTTGGATTTTAGAGGACTTTGTTCACTCTCATTTGATACTGTTGCTAATCTCTTT
CCTTCTTGATTGCATCATATGGCAG

Intron 2 GTGAGTACAA ... AACTCTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	0	26	0	0
A2	8.33	11	0	1
A3	4.55	21	2	1
A4	0	8	0	0
A5	16.67	10	0	2
A6	36.84	24	2	14
A7	5.88	64	0	4
A8	14.06	55	0	9
A9	12.96	47	0	7
A10	20.83	38	0	10

>TRINITY_DN44448_c5_g1_i3 from sample A6 / Example spliced isoform

TTGTGGTTTGGTTTTGCTTGTTGGTCGGAGGGGGAAAGTGGTACAAATAGTATACAAAAGAGATGAAATGGAGATTATTGTTCAAATATGAAGTCAGTCATTGCAGTTGTAGAATCTAAGGTGGAGTGGTGAAAATGCCTTGCAAATGGAAAAAGTAGTGCGGAGGATAGGTGAGTCATGATTTTCTCCTACAAACTAAT
GTTGTCATTTAAGTGAATGAAATATTGTCGTTTGTAGAATGATTTACCCTTTGTCATGGTTACGGGGCACTATCATGTTGCTAATGGTTGGGTGATTCAAAAGTTTCTTGGAATTATCATAGAGACATTATATTGTTGTTGTTATCACGTTGATTTATCTGATGAGTCCACGGAAGTTGGCAATGACCAAGCAAACATAG
CGACTGTACACTTTGGGCCCTAAGAAGGCCGAGTGGAGAAGATACCATAAATATTGCAATTCATGGCCAGAGGATTGGCTTGAGAATACTTTGAATTATGGGCTGGAAAGATTTTGGGCCACCGGCTATTTGAAAAACTCAAATTGATAATTGCTGCAGCAAAGAGGGGATACATTTCTGAATAATTTTTTAAAGTTGGG
GCTGATCCGAATCCATTCCTTGCAGCACAAGGGTGGCTGGAACTGAGATGTACAGGGTTAAACTGTTCTCATGAGAAAAGTGTCCAATGCTCATTGAGGGTTAATGGAAGCTTGGTCAAAGGCTCAAAATTGCCTAATATGGAGAATGCCCTCTCTAGAAGATTGAGATGGGGTGGCTTCTCATCATTCCAAGGACATGA
TATGTTATTTAATAAGAAACACCCCCCTTGAAATGTTGATTATCTAGAGCAACACATTTCCCAAGAAGAAATGATTGTTAGAAAGAGGATGAAGGCTTTGGTGAATATGTATTCTCTGCTATGGGTAAATCATATTGATGTTAGAACTGCCATATCACATTTTGTTGGTACAGATCTTTATCTCTAGATTTGTTATATAT
TTATTGTGGGCTATTTGGATTTTAGAGGACTTTGTTC

>TRINITY_DN44448_c5_g1_i4 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GGATTGGCTTGAGAATACTTTGAATTATGGGCTGGAAAGATTTTGGGCCACCGGCTATTTGAAAAACTCAAATTGgtgagtacaatatgtttgatcaatctagatgagtttatgtttgttgtaactaccaaataaactgcattgcttgtttgatcattgacttaactggccaactcttcagATAATTGCTGCAGCAAAGA
GGGGATACATTTCTGAATAATTTTTTAAAGTTGGGGCTGATCAGAATCCATTCCTTGCAGCACAAGGGTGGCTGGAACTGAGATGTACAGGGTTAAACTGTTCTCATGAGAAAAGTGTCCAATGCTCATTGAGGGTTAATGGAAGCTTGGTCAAAGGCTCAAAATTGCCTAATATGGAGAATGCCCTCTCTAGAAGATTG
AGATGGGGTGGCTTCTCATCATTCCAAGGACATGATATGTTATTTAATAAGAAACACCCCCCTTGAAATGTTGATTATCTAGAGCAACACATTTCCCAAGAAGAAATGATTGTTAGAAAGAGGATGAAGGCTTTGGTGAATATGTATTCTCTGCTATGGGTAAATCATATTGATGTTAGAACTGCCATATCACATTTTGT
TGGTACAGATCTTTATCTCTAGATTTGTTATATATTTATTGTGGGCTATTTGGATTTTAGAGGACTTTGTTC

Intron 3 GTTATGTATG ... CTTTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	75.76	4	10	15
A2	100	0	10	11
A3	88.89	1	8	8
A4	87.5	2	12	16
A5	78.95	2	6	9
A6	57.14	3	3	5
A7	79.31	3	10	13
A8	84.62	3	17	16
A9	69.23	4	6	12
A10	92.31	1	12	12

>TRINITY_DN44820_c1_g1_i19 from sample A9 / Example spliced isoform

TGTTTATGGTTGTCTTCGTTATCATTATGATTTATGTCTGATGATTCCATGGAAGTTGGAAATGGCCAAGCACACGGATGAGTAGAACAATTTGGGCCCTAAGAAGGTTGAGTGGAGAAGATACCGTAAACATTGCAAATTCATGGCAGAGGATCGTTGAGTCTTATTATTGTTTTGCAAATTAACATTAGTTTCTAAGC
GAATGAAATATTCCTTGTTGCACTATTATTTCTCTTATGAATACATTGATTATATTGTTGCTATATAAGTACATTTAGTTCAAAATGTTCATATTATTTGAAATATAGCATGAAATATAAATGCAATCGTTCTTGCCTTCAACTCTATAGATTAACATGTATGATGATTCCAATATCTTATTATGGCTCTATTGTAGATG
ACCTATATTGGGGATCATGAGAGTACAAAATGGACTTTTTATCTGTACAAAACAAACTCTAAGGGAGGGAAAGAATGCACATTGCATAAAAGATGGTGTATGGAGAGAGGAAGTCTACAATTTTTTGTTTGTTTTTTCGTGTCATTTAGTTTTCTTGGGTTTAAGCATGGCCACACTTTGTTTCGTTTGTCATGTGTTAT
GGTTGTTTCTCTTTGTTTTGCAATTTTTTTTTGTGGTTTGGTTTTGCTTGTTGGTCGGAGGGGGAAAGTGGTACAAATAGTATACAAAAGAGATGAGATGGGGATTATTGTTCAAACATGAAGTGGGTGACTGCATACATTTGTAGAATCTAAATTGTAGAATCTAAGAAGGTGGAGTGGTGAAGATGCCTTACAAATGG
CAATTGCAGCATAGATGATAGGGCTTATTGTTTTTGGTTGTCATTGTTATCACGTTGATTTGTGTTTGACGAACCCATAGAAGTTGGCAATGGCCAAGCACACAGAGTGAGTGACTACAACTTGGGCCCTAAGAAGGCCGAGTGGAGAAGATACCATAAATATTGCAATTCATGGCCAGAGGATTGGCTTGAGAATACTT
TGAATTATGGGCTGGAAAGATTTTGGGCCACCGGCTATTTGAAAAACTCAAATTGATAATTGCTGCAGCAAAGAGGGGATACATTTCTGAATAATTTTTTTAAGTTGGGGCTGATCCGAATCCATTCCTTGCAGCACAAGGGTGGCTGGAACTGGGATGTACAGGATTAAACTGTTCTCATGAGAAAAGTGTCCAATGTT
CATTGAGGATTAATGGAAACTTAGTCAAAGGCTCAAAATTGCCTAATATGGAGAATGCCCTCTCTAGAAGATTGAGATGGGGTGGCTTCTCATCATTCCAAGGACATGATATGTTATTTAATAAGAAACACCCCCCTTGAAATGTTGATTATCTAGAGCAACACATTTCCCAAGAAGAAATGATTGTTAGAAAGAGGATG
AAGGCTTTGGTGAATATGTATTCTCTGCTATGGGTAAATCATATTGATGTTAGAACTGCCATATCACATTTTGTTGGTACAGATCTTTATCTCTAGATTTGTTATATATTTATTGTGGGCTATTTGGATTTTAGAGGACTTTGTTCACTCTCATTTGATACTGTTGCTAATCTCTTTCCTTCTTGATTGCATCATATGGC
AG

>TRINITY_DN44820_c1_g1_i4 from sample A9 / Example unspliced isoform:

TGTTTATGGTTGTCTTCGTTATCATTATGATTTATGTCTGATGATTCCATGGAAGTTGGAAATGGCCAAGCACACGGAgttatgtatgataattcatcattttatctatttgttatttaatttcctagaatttgtggtttatttgtggtctcatactagaactatatgtctttttgcagTGAGTAGAACAATTTGGGCCC
TAAGAAGGTTGAGTGGAGAAGATACCGTAAACATTGCAAATTCATGGCAGAGGATCGTTGAGTCTTATTATTGTTTTGCAAATTAACATTAGTTTCTAAGCGAATGAAATATTCCTTGTTGCACTATTATTTCTCTTATGAATACATTGATTATATTGTTGCTATATAAGTACATTTAGTTCAAAATGTTCATATTATTT
GAAATATAGCATGAAATATAAATGCAATCGTTCTTGCCTTCAACTCTATAGATTAACATGTATGATGATTCCAATATCTTATTATGGCTCTATTGTAGATGACCTATATTGGGGATCATGAGAGTACAAAATGGACTTTTTATCTGTACAAAACAAACTCTAAGGGAGGGAAAGAATGCACATTGCATAAAAGATGGTGT
ATGGAGAGAGGAAGTCTACAATTTTTTGTTTGTTTTTTCGTGTCATTTAGTTTTCTTGGGTTTAAGCATGGCCACACTTTGTTTCGTTTGTCATGTGTTATGGTTGTTTCTCTTTGTTTTGCAATTTTTTTTTGTGGTTTGGTTTTGCTTGTTGGTCGGAGGGGGAAAGTGGTACAAATAGTATACAAAAGAGATGAGAT
GGGGATTATTGTTCAAACATGAAGTGGGTGACTGCATACATTTGTAGAATCTAAATTGTAGAATCTAAGAAGGTGGAGTGGTGAAGATGCCTTACAAATGGCAATTGCAGCATAGATGATAGGGCTTATTGTTTTTGGTTGTCATTGTTATCACGTTGATTTGTGTTTGACGAACCCATAGAAGTTGGCAATGGCCAAGC
ACACAGAGTGAGTGACTACAACTTGGGCCCTAAGAAGGCCGAGTGGAGAAGATACCATAAATATTGCAATTCATGGCCAGAGGATTGGCTTGAGAATACTTTGAATTATGGGCTGGAAAGATTTTGGGCCACCGGCTATTTGAAAAACTCAAATTGATAATTGCTGCAGCAAAGAGGGGATACATTTCTGAATAATTTTT
TTAAGTTGGGGCTGATCCGAATCCATTCCTTGCAGCACAAGGGTGGCTGGAACTGGGATGTACAGGATTAAACTGTTCTCATGAGAAAAGTGTCCAATGTTCATTGAGGATTAATGGAAACTTAGTCAAAGGCTCAAAATTGCCTAATATGGAGAATGCCCTCTCTAGAAGATTGAGATGGGGTGGCTTCTCATCATTCC
AAGGACATGATATGTTATTTAATAAGAAACACCCCCCTTGAAATGTTGATTATCTAGAGCAACACATTTCCCAAGAAGAAATGATTGTTAGAAAGAGGATGAAGGCTTTGGTGAATATGTATTCTCTGCTATGGGTAAATCATATTGATGTTAGAACTGCCATATCACATTTTGTTGGTACAGATCTTTATCTCTAGATT
TGTTATATATTTATTGTGGGCTATTTGGATTTTAGAGGACTTTGTTCACTCTCATTTGATACTGTTGCTAATCTCTTTCCTTCTTGATTGCATCATATGGCAG

Intron 4 GTAATTTTTG ... TCTTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.06	19	5	6
A2	5.88	8	1	0
A3	9.03	12	2	0
A4	11.8	7.5	2	0
A5	20	4	1	1
A6	26.24	14	8	1
A7	1.19	43.5	1	0
A8	10.76	42	7	3
A9	5.57	25.5	3	0
A10	3.63	26.5	2	0

>TRINITY_DN46322_c1_g3_i6 from sample A8 / Example spliced isoform

TGACTGCATTTGTAGAATCTAAGGTGGAGTGGTGAAGATGCCTTACAAATGGCAATTGTAGCACAGATGATAGTGAGTGACTACAACTTGGGCTAAGGTGGAGTGGTGAAGATGCCTTACAAATGGCAATTGTAGCACAAATGATAGGGCTTATTGTTTTTGGTTGTCATTGTTATCACGTTGATTTGTGTTTGACTAAG
AAGGCCGAGTGGAGAAGATACCATAAATATTGCAATTCATGGCAGAGGATTGGCTTGAGAATACTTTGAATTATGGGCTGGAAAGATTTTGGGCCACCGGCTATTTGAAAAACTCAAATTGATAATTGCTGCAGCAAAGAGGGGATACATTTCTGAATAATTTTTTTAAGTTGGGGCTGATCCGAATCCATTCCTTGCAG
CACAAGGGTGGCTGGAACTGAGATGTACAGGGTTAAACTGTTCTCATGAGAAAAGTGTCCAATGCTCATTGAGGGTTAATGGAAGCTTGGTCAAAGGCTCAAAATTGCCTAATATGGAGAATGCCCTCTCTAGAAGATTGAGATGGGGTGGCTTCTCATCATTCCAAGGACATGATATGTTATTTAATAAGAAACACCCC
CCTTGAAATGTTGATTATCTAGAGCAACACATTTCCCAAGAAGAAATGATTGTTAGAAAGAGGATGAAGGCTTTGGTGAATATGTATTCTCTGCTATGGGTAAATCATATTGATGTTAGAACTGCCATATCACATTTTGTTGGTACAGATCTTTATCTCTAGATTTGTTATATATTTATTGTGGGCTATTTGGATTTTAG
AGGACTTTGTTCACTCTCATTTGATACTGTTGC

>TRINITY_DN46322_c1_g3_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:

GGAATCTGTAGCTCAAAGGCAAGTGACAACAATTTGGGCCCTAAGAAGGTCGAGTAGAGAAGATACCATAAACATTGCAAACTCACGGCATGGGATCGCTATGTTGGAGATGGCCTATTTTGGGAATCACGAGTGTACAAAATGAACATTCTATATTTATAAAACAAACTCAAAGGGGAGGAAAGCACATTGCAGAAAAG
ATGATGGGGAAAGTGGTACAAATAGTATACAAAAGAGATGAGATGGGGATTATTGTTCAAACATGAAGTGGGTGACTGCATTTGTAGAATCTAAGAAGGTGGAGTGGTGAAGATGCCTTACAAATGGCAATTGTAGCACAACAGCATAGATGATAGGGCTTATTGTTTTTGGTTGTCATTGTTATCACGTTGATTTGTGT
TTGATGAGTCCATAGAAGTTGGAAATGGCCAAGCACACAGAGGTATGTATGGTAATTCATCATTATATATCTATTTGTTATTTAATTTCTTGGAATTTCTCGTTTATTCATGGTCTCATACTCGAACTATATGCTTCGTGCGAACCCATAGAAGTTGGCAATGGCCAAGCACACAGAGTGAGTGACTACAACTTGGGCCC
TAAGAAGGCCGAGTGGAGAAGATACCATAAATATTGCAATTCATGGCAGAGGATTGgtaatttttgtaaatgtgagagttgaatccttaaaatttgtttattaaatacaatggctaatggtaaaaggattcttttgcagGCTTGAGAATACTTTGAATTATGGGCTGGAAAGATTTTGGGCCACTACATTTGTAGAATCC
TTAAAGTGGGTGACTACATTTGTAGAATCTAAAAAGGTGGAGTGGTGAAGATGCCTTACAAATGGCAATTGCAGCATAGATGATAGGGCTTATTGTTTTTGGTTGTCATTGTTATCACGTTGATTTGTGTTTGACGAACCCATAGAAGTTGGCAATGGCCAAGC