sp|Q9SI53|PP147_ARATH ----> Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g03880, mitochondrial
Intron 1 GTGAGCCCTC ... GAAACTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20 | 2 | 0 | 1 |
| A2 | 60 | 2 | 5 | 1 |
| A3 | 63.64 | 2 | 5 | 2 |
| A4 | 100 | 0 | 2 | 1 |
| A5 | 50 | 1 | 1 | 1 |
| A6 | 44.19 | 12 | 10 | 9 |
| A7 | 46.34 | 11 | 10 | 9 |
| A8 | 47.37 | 15 | 17 | 10 |
| A9 | 56.67 | 13 | 16 | 18 |
| A10 | 48.72 | 10 | 7 | 12 |
>TRINITY_DN45684_c8_g2_i1 from sample A8 / Example spliced isoformTGAAGATGTTTTGGAAGATGCCTGAACGAAATGTAGTCTCGTGGACAGCGATGATTGCAGGATATGCACAGAATGGGCACAGTGAGGAAGCCTTGAGGCTTTTTTGGGAAATGCGGTTATCCCGTGTGAAACTGAATTCAAAAACCTTCGCAAGTGTTCTTCCAGCATGTGCTGAGCTGACTGCTTTGGAACAGGGCATG
TGGATCCACGGAGAAATAATCAGGAATGGGTTTGCGTCTGAAGTTTTTGTGGCAAATGGACTTGTAGATATGTATGCAAAATGTGGGAGTCTCTTGAAATCACGCCATGTGTTTGAAAAAATGTTTGAGCGAGATCTCTTCTCGTGGACGACTATGATTGGAGGGTATGCAATCCATGGCTGTGGCAAGGAAGCTCTCAA
ATTATTCGAGCAAATGCAAGAGTTAGGTATTAAACCAGACCATGTCACCTTTCTATGTGTTTTATCAGCATGCTGCCATGCAGGTTTAGTAGAGGAGGGGTGCAAATACTTTGATCATATGAGTCAAAAATATAACATCACACCTACAATGGAACACTATGGTTGCATCATTGATATACTTGGGCGTGCCGGGCATCTGG
ATGAAGCACATAATATTATCAAGAATATGCCAATAAAACCTAATGCAAACATATTGGGGTGTTTGCTGGGTTCCTGTAGAATCCATAACAATACCGATCTAGGAGAACTTGTGGCAGAATGCATTCTTGAGTTAGACCCGAAAAATGCTGGAACCTATGTGCTGCTATCAAATATCTATGCAGCAGCTCAGAGGTGGGAT
GACAAGGAAGCACTGCGTAAAACAATGAAAGACAGAGGGGTGAAATCCAAGCCAGGATGCAGTTGGATTGAGGTCAATAAGCATGTATATGCATTCCTTGTAGGAGATAGTCCCTTAACATAAAGGAAAACACTTGTTACTGGATAAAGTATCCCCAACATGTTATGTTGATCGATGTGGACACATGCAAGGACAAATTC
TTTCACCGATGGAGCGAGTAACTGGCAATAACAATGTCGTATCAAATTATTGATTGATGGAGAGAGTGACCATGCACTTTGGAACAGGTAAGGCTTATGCATGAGGAGGATGCTGGACTTGGGAACTTGGATGCAACATTGATTTTGCAGAGGCTGAAGCCTGGGCCCTGTACTCTAGTATCTCCTTGCTGAGGCATTAA
ATAGTGGCTAGCACATTTATATTGCATATCCATGCAATGAGGGGTTGAAGCCATTTCTGACCTGACACAAAAATTGCAGTTACTGTATCACTTCTTTGAAGACCAAATCGGACCTTTTCAAGTGGTCGGTGACACCTTTTGGGCTTACCAATGCAGCTATACTTTTCAGAGGCTCATCAATGATGTTTTCCAGTCTTTTT
GGTAAGCTTGTAGTAGTATACTTGGATGATATTCTTGTTTATAGCAAACCTTGGGAAAAGCATGTGCATCATGTGCTGGTGCAGGTTGTATTGGATTTGCTCAGTCAAATAAGCTATGAACTAAGATGAAGAAATCATTCTTTGGCTAAACTTCTATCAAGTCCTCTGGATTTGTCATAGACTAACAGGGAGTTCATGTT
GATACAGAAAAAGTCAAGGTGCTAAAAGATTGACCCACTTTTACTTCAGTTTCAGACATGAAAGGTTTTTCGGGAGGTTGAATTTCTACGTAAAGTTCATCCATCACTAATCTTATATCGCTCTCTTTTTTATTGCCTGATTAGTTAGAACTTAGAAGACTTTCACATGGGGACCTCACTGTGAAACTGTTTTTTAAGAG
TTGAGGTTGTTTGTTTGACCCCAGTTTTGTCTCTCCTTGACCTACATAAGCCATTTGAGGTCGAGACAAATGCCTTGCAGTATGCCATATGTGCTGTTCTTAAGCAGGAAGTGGCAGGTTCCTCACATCCTATTGCTTACCATGTTAACATTTGACCTAAGTTGCCAGGAAAATTGGGTTTAGGGACGGGGACTGATTGT
TGAATCGGAATTGGAATCGGCTGATTTGACCAAGCAGACACCAAACTGATCCAAACCAGCCATCAAATAAAAAATTACTCAATTTACTCAAAAATTACTGAACAAATTACTCAAAAAATTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTCTTCTGATTTTTCCCTAATCTAATCTAAACTTAAAGATAGTGCTTGAGCCAGCGCT
>TRINITY_DN45684_c8_g2_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:TGAAGATGTTTTGGAAGATGCCTGAACGAAATGTAGTCTCGTGGACAGCGATGATTGCAGGATATGCACAGAATGGGCACAGTGAGGAAGCCTTGAGGCTTTTTTGGGAAATGCGGTTATCCCGTGTGAAACTGAATTCAAAAACCTTCGCAAGTGTTCTTCCAGCATGTGCTGAGCTGACTGCTTTGGAACAGGGCATG
TGGATCCACGGAGAAATAATCAGGAATGGGTTTGCGTCTGAAGTTTTTGTGGCAAATGGACTTGTAGATATGTATGCAAAATGTGGGAGTCTCTTGAAATCACGCCATGTGTTTGAAAAAATGTTTGAGCGAGATCTCTTCTCGTGGACGACTATGATTGGAGGGTATGCAATCCATGGCTGTGGCAAGGAAGCTCTCAA
ATTATTCGAGCAAATGCAAGAGTTAGGTATTAAACCAGACCATGTCACCTTTCTATGTGTTTTATCAGCATGCTGCCATGCAGGTTTAGTAGAGGAGGGGTGCAAATACTTTGATCATATGAGTCAAAAATATAACATCACACCTACAATGGAACACTATGGTTGCATCATTGATATACTTGGGCGTGCCGGGCATCTGG
ATGAAGCACATAATATTATCAAGAATATGCCAATAAAACCTAATGCAAACATATTGGGGTGTTTGCTGGGTTCCTGTAGAATCCATAACAATACCGATCTAGGAGAACTTGTGGCAGAATGCATTCTTGAGTTAGACCCGAAAAATGCTGGAACCTATGTGCTGCTATCAAATATCTATGCAGCAGCTCAGAGGTGGGAT
GACAAGGAAGCACTGCGTAAAACAATGAAAGACAGAGGGGTGAAATCCAAGCCAGGATGCAGTTGGATTGAGGTCAATAAGCATGTATATGCATTCCTTGTAGGAGATAGTCCCTTAACATAAAGGAAAACACTTGTTACTGGATAAAGTATCCCCAACATGTTATGTTGATCGATGTGGACACATGCAAGGACAAATTC
TTTCACCGATGGAGCGAGTAACTGGCAATAACAATGTCGTATCAAATTATTGATTGATGGAGAGAGTGACCATGCACTTTGGAACAGGTAAGGCTTATGCATGAGGAGGATGCTGGACTTGGGAACTTGGATGCAACATTGATTTTGCAGAGGCTGAAGgtgagccctcataaggaagttattcaaaccaatctatgtga
gttgcctgggttatatccttttgttattaatcttaaggctaagtctcatgagaaggttgacagtattggagagaatcagagtattgctgctcatacagttatacttccatatagaaataattaattgtgtccttattttgaattgtatgaaactgcagCCTGGGCCCTGTACTCTAGTATCTCCTTGCTGAGGCATTAAA
TAGTGGCTAGCACATTTATATTGCATATCCATGCAATGAGGGGTTGAAGCCATTTCTGACCTGACACAAAAATTGCAGTTACTGTATCACTTCTTTGAAGACCAAATCGGACCTTTTCAAGTGGTCGGTGACACCTTTTGGGCTTACCAATGCAGCTATACTTTTCAGAGGCTCATCAATGATGTTTTCCAGTCTTTTTG
GTAAGCTTGTAGTAGTATACTTGGATGATATTCTTGTTTATAGCAAACCTTGGGAAAAGCATGTGCATCATGTGCTGGTGCAGGTTGTATTGGATTTGCTCAGTCAAATAAGCTATGAACTAAGATGAAGAAATCATTCTTTGGCTAAACTTCTATCAAGTCCTCTGGATTTGTCATAGACTAACAGGGAGTTCATGTTG
ATACAGAAAAAGTCAAGGTGCTAAAAGATTGACCCACTTTTACTTCAGTTTCAGACATGAAAGGTTTTTCGGGAGGTTGAATTTCTACGTAAAGTTCATCCATCACTAATCTTATATCGCTCTCTTTTTTATTGCCTGATTAGTTAGAACTTAGAAGACTTTCACATGGGGACCTCACTGTGAAACTGTTTTTTAAGAGT
TGAGGTTGTTTGTTTGACCCCAGTTTTGTCTCTCCTTGACCTACATAAGCCATTTGAGGTCGAGACAAATGCCTTGCAGTATGCCATATGTGCTGTTCTTAAGCAGGAAGTGGCAGGTTCCTCACATCCTATTGCTTACCATGTTAACATTTGACCTAAGTTGCCAGGAAAATTGGGTTTAGGGACGGGGACTGATTGTT
GAATCGGAATTGGAATCGGCTGATTTGACCAAGCAGACACCAAACTGATCCAAACCAGCCATCAAATAAAAAATTACTCAATTTACTCAAAAATTACTGAACAAATTACTCAAAAAATTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTCTTCTGATTTTTCCCTAATCTAATCTAAACTTAAAGATAGTGCTTGAGCCAGCGCT
Intron 2 GTGAGTTGCC ... GAAACTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 0 | 1 |
| A2 | 71.43 | 1 | 4 | 1 |
| A3 | 26.32 | 7 | 3 | 2 |
| A4 | 33.33 | 3 | 2 | 1 |
| A5 | 100 | 0 | 0 | 1 |
| A6 | 46.67 | 8 | 5 | 9 |
| A7 | 45.45 | 12 | 11 | 9 |
| A8 | 56.76 | 8 | 11 | 10 |
| A9 | 82.1 | 3.5 | 14 | 18 |
| A10 | 45.11 | 11 | 6 | 12 |
>TRINITY_DN45684_c8_g2_i4 from sample A8 / Example spliced isoformAGTGACCATGCACTTTGGAACAGATTCTGAACAGGTAAGGCTTATGCATGAGGAGGATGCTGGACTTGGGAACTTGGATGCAACATTGATTTTGCAGAGGCTGAAGGTGAGCCCTCATAAGGAAGTTATTCAAACCAATCTATCCTGGGCCCTGTACTCTAGTATCTCCTTGCTGAGGCATTAAATAGTGGCTAGCACAT
TTATATTGCATATCCATGCAATGAGGGGTTGAAGCCATTTCTGACCTGACACAAAAATTGCAGTTACTGTATCACTTCTTTGAAGACCAAATCGGACCTTTTCAAGTGGTCGGTGACACCTTTTGGGCTTACCAATGCAGCTATACTTTTCAGAGGCTCATCAATGATGTTTTCCAGTCTTTTTGGTAAGCTTGTAGTAG
TATACTTGGATGATATTCTTGTTTATAGCAAACCTTGGGAAAAGCATGTGCATCATGTGCTGGTGCAGGTTGTATTGGATTTGCTCAGTCAAATAAGCTATGAACTAAGATGAAGAAATCATTCTTTGGCTAAACTTCTATCAAGTCCTCTGGATTTGTCATAGACTAACAGGGAGTTCATGTTGATACAGAAAAAGTCA
AGGTGCTAAAAGATTGACCCACTTTTACTTCAGTTTCAGACATGAAAGGTTTTTCGGGAGGTTGAATTTCTACGTAAAGTTCATCCATCACTAATCTTATATCGCTCTCTTTTTTATTGCCTGATTAGTTAGAACTTAGAAGACTTTCACATGGGGACCTCACTGTGAAACTGTTTTTTAAGAGTTGAGGTTGTTTGTTT
GACCCCAGTTTTGTCTCTCCTTGACCTACATAAGCCATTTGAGGTCGAGACAAATGCCTTGCAGTATGCCATATGTGCTGTTCTTAAGCAGGAAGTGGCAGGTTCCTCACATCCTATTGCTTACCATGTTAACATTTGACCTAAGTTGCCAGGAAAATTGGGTTTAGGGACGGGGACTGATTGTTGAATCGGAATTGGAA
TCGGCTGATTTGACCAAGCAGACACCAAACTGATCCAAACCAGCCATCAAATAAAAAATTACTCAATTTACTCAAAAATTACTGAACAAATTACTCAAAAAATTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTCTTCTGATTTTTCCCTAATCTAATCTAAACTTAAAGATAGTGCTTGAGCCAGCGCT
>TRINITY_DN45684_c8_g2_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:TGAAGATGTTTTGGAAGATGCCTGAACGAAATGTAGTCTCGTGGACAGCGATGATTGCAGGATATGCACAGAATGGGCACAGTGAGGAAGCCTTGAGGCTTTTTTGGGAAATGCGGTTATCCCGTGTGAAACTGAATTCAAAAACCTTCGCAAGTGTTCTTCCAGCATGTGCTGAGCTGACTGCTTTGGAACAGGGCATG
TGGATCCACGGAGAAATAATCAGGAATGGGTTTGCGTCTGAAGTTTTTGTGGCAAATGGACTTGTAGATATGTATGCAAAATGTGGGAGTCTCTTGAAATCACGCCATGTGTTTGAAAAAATGTTTGAGCGAGATCTCTTCTCGTGGACGACTATGATTGGAGGGTATGCAATCCATGGCTGTGGCAAGGAAGCTCTCAA
ATTATTCGAGCAAATGCAAGAGTTAGGTATTAAACCAGACCATGTCACCTTTCTATGTGTTTTATCAGCATGCTGCCATGCAGGTTTAGTAGAGGAGGGGTGCAAATACTTTGATCATATGAGTCAAAAATATAACATCACACCTACAATGGAACACTATGGTTGCATCATTGATATACTTGGGCGTGCCGGGCATCTGG
ATGAAGCACATAATATTATCAAGAATATGCCAATAAAACCTAATGCAAACATATTGGGGTGTTTGCTGGGTTCCTGTAGAATCCATAACAATACCGATCTAGGAGAACTTGTGGCAGAATGCATTCTTGAGTTAGACCCGAAAAATGCTGGAACCTATGTGCTGCTATCAAATATCTATGCAGCAGCTCAGAGGTGGGAT
GACAAGGAAGCACTGCGTAAAACAATGAAAGACAGAGGGGTGAAATCCAAGCCAGGATGCAGTTGGATTGAGGTCAATAAGCATGTATATGCATTCCTTGTAGGAGATAGTCCCTTAACATAAAGGAAAACACTTGTTACTGGATAAAGTATCCCCAACATGTTATGTTGATCGATGTGGACACATGCAAGGACAAATTC
TTTCACCGATGGAGCGAGTAACTGGCAATAACAATGTCGTATCAAATTATTGATTGATGGAGAGAGTGACCATGCACTTTGGAACAGGTAAGGCTTATGCATGAGGAGGATGCTGGACTTGGGAACTTGGATGCAACATTGATTTTGCAGAGGCTGAAGGTGAGCCCTCATAAGGAAGTTATTCAAACCAATCTATgtga
gttgcctgggttatatccttttgttattaatcttaaggctaagtctcatgagaaggttgacagtattggagagaatcagagtattgctgctcatacagttatacttccatatagaaataattaattgtgtccttattttgaattgtatgaaactgcagCCTGGGCCCTGTACTCTAGTATCTCCTTGCTGAGGCATTAAA
TAGTGGCTAGCACATTTATATTGCATATCCATGCAATGAGGGGTTGAAGCCATTTCTGACCTGACACAAAAATTGCAGTTACTGTATCACTTCTTTGAAGACCAAATCGGACCTTTTCAAGTGGTCGGTGACACCTTTTGGGCTTACCAATGCAGCTATACTTTTCAGAGGCTCATCAATGATGTTTTCCAGTCTTTTTG
GTAAGCTTGTAGTAGTATACTTGGATGATATTCTTGTTTATAGCAAACCTTGGGAAAAGCATGTGCATCATGTGCTGGTGCAGGTTGTATTGGATTTGCTCAGTCAAATAAGCTATGAACTAAGATGAAGAAATCATTCTTTGGCTAAACTTCTATCAAGTCCTCTGGATTTGTCATAGACTAACAGGGAGTTCATGTTG
ATACAGAAAAAGTCAAGGTGCTAAAAGATTGACCCACTTTTACTTCAGTTTCAGACATGAAAGGTTTTTCGGGAGGTTGAATTTCTACGTAAAGTTCATCCATCACTAATCTTATATCGCTCTCTTTTTTATTGCCTGATTAGTTAGAACTTAGAAGACTTTCACATGGGGACCTCACTGTGAAACTGTTTTTTAAGAGT
TGAGGTTGTTTGTTTGACCCCAGTTTTGTCTCTCCTTGACCTACATAAGCCATTTGAGGTCGAGACAAATGCCTTGCAGTATGCCATATGTGCTGTTCTTAAGCAGGAAGTGGCAGGTTCCTCACATCCTATTGCTTACCATGTTAACATTTGACCTAAGTTGCCAGGAAAATTGGGTTTAGGGACGGGGACTGATTGTT
GAATCGGAATTGGAATCGGCTGATTTGACCAAGCAGACACCAAACTGATCCAAACCAGCCATCAAATAAAAAATTACTCAATTTACTCAAAAATTACTGAACAAATTACTCAAAAAATTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTCTTCTGATTTTTCCCTAATCTAATCTAAACTTAAAGATAGTGCTTGAGCCAGCGCT