sp|Q9M9L0|APC11_ARATH ----> Anaphase-promoting complex subunit 11
Intron 1 GTAATAATAT ... TTTGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 56.99 | 20 | 15 | 38 |
| A2 | 45.95 | 10 | 6 | 11 |
| A3 | 60 | 7 | 11 | 10 |
| A4 | 63.64 | 4 | 4 | 10 |
| A5 | 100 | 0 | 1 | 0 |
| A6 | 56.86 | 35 | 37.3 | 55 |
| A7 | 53.15 | 67 | 62 | 90 |
| A8 | 60.1 | 81 | 111 | 133 |
| A9 | 62.08 | 51 | 88 | 79 |
| A10 | 70.21 | 21 | 38 | 61 |
>TRINITY_DN43456_c2_g2_i2 from sample A8 / Example spliced isoformCGCGGTACCAATGTGGGAATAAAAACAGCCCTAATTCTGTGCTTAACAGCTCCTAGCCTACGAAGGAAGACGCCAGGCCTGTTTGCACAGCTATTTAAGCAAAACGCCGAGGGAAAAACTTCTAGCCTTGAAACAAATCTTTATCCTCCCATTTATTCTCTGCAATCCTGTTTTGTTACAAGATGGAAGAGACACAGTAC
TGTGACAAATGCGGAGAGTACCGAGTTACGGTGGATGGCATAACCGCGATGATGGTCTGTGATTCGTGCGGTTATGTGCAGGAATACTCGGATTTCAGGTCCCCCTGGGACTTCACCACGGGCGATGGCGGAGGGAATTTCGTGTCGGCCAATGACACCGGTGCTCTTGCCGGTGGCTGTTTTTCAAACGTCAGGGGAGT
CTACACTTATCACGAACGGAAGAAGGCACTTGCAATTAAGAAATTGGACCAGATCACAGCGCTACTGAGGTTACCTGCCCAAAAGGTGGATGATGTGAAATTTATGGTTGACAAAATAACACAGGGAGAGTGGGGTGCAGGAAGATGGCTTGATATTTTAATTGGTGCTTGTATCTATGTGACTGTGCGACAAAGTCATC
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GGACGGTTGCTCCTTCAATGTGCTTTCCAATGGTTTTTGACTACAGGACGTCGACCTGTTCCTATTGTGGCTGCTATATTGGCGTTTCTTGCTGAAGTTAATGAGGTCAATATTGGACTTGAAGACCTTTCAAAAGAACTGAATGTACCAGCTCATACTTGCAAGCTACGATATAAAGAGCTTCAGGAATCTTTAGTTAG
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>TRINITY_DN43456_c2_g2_i7 from sample A8 / Example unspliced isoform:CGCGGTACCAATGTGGGAATAAAAACAGCCCTAATTCTGTGCTTAACAGCTCCTAGCCTACGAAGGAAGACGCCAGGCCTGTTTGCACAGCTATTTAAGCAAAACGCCGAGGGAAAAACTTCTAGCCTTGAAACAAATCTTTATCCTCCCATTTATTCTCTGCAATCCTGTTTTGTTACAAGATGGAAGAGACACAGTAC
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TGTCTGTAGAGAAAAGATTAAAGCTATCTGAAGAACAGACACAATGCAAATTGGTGGATATCACTGGTGGCCCTTTAATGTCTGAGAAGCACTCACAATCTGGATTAAATACTAATGGCACAGCTACAGATTTGATTGAGGAACAACAGCCTGGATTGGATTCGGTTGATGCAGGTGAAGATAAGATATCTGCAAAAGGC
TTATGTAAAATACATGACCAATTCTTACTACAGCATGCCTCAAGAAGAGCAAATGTGTTAAGGACTGAGGAGAGTATCAGAAAGAGACAACATGAAATCACTGGTAAAAAGAAGGGACATAGCCAGAATATACTTGCCAGATATCAACATGGCAGTACTCTTCCTCATCAAAGGATTTCAATGCAGGAAATTGTGGATAG
GCAAGTTGAATCTGATGCTCTGCCACCATCTTTTGTGGCAAGCGTTGAAGCACGTGCAAGGCGCCGGGGTAAAATCAATGCTGCTAAGTTACGTATAAGTAAATTACAGAAACCAATGACCAGATACTTGAGTTTCAAGGACCAAAGTGTACAAAAACATGGACAACAAATGAAAGATGATTTAAGAGAATCAGGCATTT
TGTCTTCACTATCAAAGAAAAGAAAAATGAAGCCTGGAAAAAGTGGGATTGATTGGGAAGATTCCATAATTGAATGTCTTCTCCTTCATGAGGCAGATGAGAAACAAATTGAAGATGGCCACTATAATGCCATGCTAGATCTACATGTGTTTAAATCAGATGAAAATATTTCTGATGAAGACTTGAGACAGTATTTTCGC
AGTAAAGGAGAGATCGCTTTGTTATCTGCCCTTTACGAGGATGAGCCCGTTTATCCCTGGATAAGAAACCAGGATCTTTGAAACATTGTTTGGGATCGTATATTACTATATACCATATGCAAGAAGCTCAACTTTTTTTCCCAGATAATATGCTTATTATGACAGAACCATTCCTTCAGATTAAAGTTTGGTCTTCTCAA
GATGTTCGAAGgtaataatattccactcgagacaacttatccggaatagattttgtatgcaaagaatttgagggatgcgcactctaaaatgtagttttcaatatttgttgcagCATCTACGTCAATTCAATTTTCAAGTCTTTATTGTAGAATATTCATTTTTTCTCCAGCTGGATGGAAATTACAAGTAGAATAAATTG
CTCTCTGGAGTTCAATGGCAAGCTGTGCATCTCCAAGGCTTAATGATGCAAACAATATTGGGTTGTTTTATAACTTGTAAGGGGAGATTCCACCTGAAGTTATATCAAATGGAGCAGAATGGTGTTATTGCAGGAAGAAAACTATAATCAAGTTCAGTAGTTCAGTTGGGGTAAGCATTTGATAATATGCCAGTTTTGTT
ATCCAAGGAGTATGTGCAAAAAAACTTGTGCTGTTTCTTTCTAATAAACATTTCCAATTTCATTCAAGATCGCTCCTGTTTTTCTCCTAGCCTTCCATTATTGATGATATATCCACCTATTAAGATGACATCATATGATTTCCATTGCTTATTAAATGTTGCCAAGATGATTGAACTCTTCCAAATGTTTTGTAAAATGT
TGGCATTGCTGTAGCATGTTTTTATGCATAATGAGCAAATAATCTCCTATTTCTTAAGCTTCTTCCTTTGTGAGCAGACAGAAACAATGGTCGAAATTTTGTTTTTTATTTGATTTAGAGTTTTTTAAGCTTAGGGATTACATGTGACCTTATGTTCAGTCCATTGTAAGCAAGCACAAGCAATGGTTGAAATGCTTTTA
ATTTTGGTTTAAAGTTTGTGAAGCTTGGGGATTAAATGTGACTCCATGTTTATTAAGCATCCATGTTTATATGGTGGCTTGGGAGCTCTGCACTGGCC