sp|Q9LW86|SUT34_ARATH ----> Probable sulfate transporter 3.4

Intron 1 GTCAGTCACT ... TTGTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	15.05	79	5.7	14
A2	16.67	110	6.7	22
A3	9.09	100	6.3	10
A4	20.29	55	5.3	14
A5	10	27	2.7	3
A6	14.83	293	22.7	51
A7	15.98	347	20	66
A8	16.75	651	31.3	131
A9	16.42	402	21.3	79
A10	21.31	240	10.7	65

>TRINITY_DN43906_c0_g3_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

GTTGGCTTTATGTGACCAGCGTTGAGGAACAACTATTTAGAGTTTCGCAGCGGAATGGAATGGGTCCCATACTTTGTTTTTCCATCAAAAATCTTGATGGTGTGTTTTCAAGGGAACTCGTCTTAATCGAAGAGGAGGATGATCATATCTGATAAATCCATGTTCAAAGCTATTTTTAGGAACAGAGAAACTTTCTAATG
AGCCCGCCCTTACATCTATATTTCCCTTGTTCACCACTTTTTCTTCTGTGCCCAAGGTTTCGGCCTGTTTCTGCGCTCCCAATTTGAGTTCTTGAAAACGCTGCGTCCCAAATCTGAAAGGGACATTACGATAGGGTGGCCCGATCAAGATCCGGTCACAGGATCGACATTGTGCCCTGATCTTTATCCGGCAACAGGAA
ACCGATGGATATCACTTTTGACTCATGTTTTTTATTAGATTCTTTGGGTTTTAGTGTTATATAAGGAGAACGAGTAGCTACATTCTTGCACAGCTCTTTCTGCGTTGTTGGGGTTTCCGTTTTACCTATTGTGTTGGGTTTCCAAAGCCTCTGTTTTCACTGTATATGGTCCTGCTTTTGAGGTACAGTCAGGATCTGCA
AGAACGGGTTTCATGACCGCAAGATCCAAATTGCACTGTGCATTTCTGTGAACTTCAGGATTTGCTTTGCATATTTAAATCCTTCCATGGCGCCCATTCTAGTGGATTGCGGGGTGTCCACGTCTTAAAAGCTTGAAGGATCTGTTTCGCATGCTTCTGTCTTGTTTTTTCTATACTTTTTTATTGATTTGTGTGAGACT
AGTATCATGGTGGGAGGCTCCGGAAGAGTAGACTGTTACGATGACGGCAATTCTGCTGGCGACAATGTGAATTCTCCCAGAGTTTCAGAAATGAATGTAGGTGATGGGCAGCGCGCTGGGAGCTGTTGCCCTAGCTGCCATGGAGCTATGGGTTTTGAGAAGAAAACGATTGATGAGAGGGTTCACAAGGTGGGCATTCC
TGAATCAAAGAGTGTAGCTCGTCAATTCAGTTCTAAGATGAAGGAGACATTCTTCCCTGATGATCCATTCAGACAGTTTAGAGGCCAAGCTTGTGGCAGGCAATGGTGGTTGGGGCTGATGTATTTCTTTCCAGTACTGGAATGGGCTCCCAATTATAGCCTCGCTGTTTTTAAGTCTGATGTTATTTCTGGTCTAACCA
TAGCCAGCCTCGCTATCCCTCAGGGCATTAGTTATGCCAAGTTAGCCAGTTTGCCACCCATCATCGGGTTATATTCAAGCTTCGTTCCGCCTTTAATCTATTCAGTACTTGGTAGCTCTAGAGATCTTGCAGTTGGGCCTGTCTCTATTGCTTCTTTGCTGCTCGGAGCCATGCTTAGAGAGGAGATTTCTCCAACCACA
GAGCCTGTGTTGTACTTGCAGGTTGCATTCACTGCAACTTTTTTTGCTGGCGTTTTCCAGGCTTCTTTGGGGATTCTCAGGCTGGGATTTATAATCGACTTTCTGTCGCGGGCAACTCTTATTGGATTCATGGCAGGCGCAGCTGTTATAGTGTCCTTGCAGCAATTTAAAGGCCTTCTGGGGATTCAACACTTCACTCC
CAAGATGGACATAGTCTCTGTCTTGCGTTCTGTCTTTGAACGTAAAAGCGAGTGGACATGGCAGACGTTTGTGATGGGTTTGTTTTTCTTAGCATTGCTGCTAACTGCACGCTATATTAGCAAGAAAAGGAGCCAACTCTTTTGGGTTTCTGCTGCTGCTCCCTTGACTTCAGTAATTCTAGCTACTCTATTCGTCTTCG
CCACCAAGGCTGATAAACACGGCATTAGCGTTATTGGTCACTTGAAAAAGGGGCTGAATCCACCTTCCCTTCAAATGCTGCGTTTTAATGGCAATTACTTAGGATTGGCGATAAAAACTGGGCTTGTTACCGGACTCATCTCACTGACGGAAGGTATAGCAGTGGGAAGAACATTTGCTTCAATCAAAGATTATCGGGTT
GATGGAAACAAGGAGATGATGGCCATTGGATTGATGAACATGGCAGGCTCTTGCACTTCCAGCTATGTTACAACAGGGTCGTTCTCTCGATCAGCAGTGAATTACAATGCTGGATGCAAGAGCGCAGTATCAAATGTAGTGATGGCTTTAACAGTCATGGTGACCCTTCTGCTTCTAACGCCTTTGTTCTACTACACGCC
TGGAGTTGTGTTGGCATCCATAATAGTTGCAGCAGTTCTGGGTTTAATCGACATCCCTGCAGCATATTTCATATGGAAAGTCGATAAGGTGGATTTCCTTGCATGTTTGGGAGCTTTTGTAGGAGTCATCTTCGTCTCTGTGCAAATGGGCCTTCTTATTGCGGTCGGCATCTCTGTGTTCAAAATACTGTTGCATGTAA
CGAGGCCTAACACTTCCCTTATGGGCAAGATTCCTGGAACCAATTATTATAGAAACTTGGAACAATACAGCGAAGCCACCAGAATCCCTGCATTTCTCATTCTTCGAATCGATGCCCCTATTTACTTCGCCAACTCAACCTACTTGAGAGAAAGGATAATGAGGTGGGTAAGTGAAGAGGAGGACAGAATTGAGAGTGAA
AATGATGATACCCTGCAGTATGTCATACTGGACCTGACTGCTGTAACAACTATTGACACAACAGGGGTCAATATTATTGTGGAGGTCAAGAAAACTCTGGAGAAAAGAGGATTACAGGTTGCCATGGTGAATCCCGGGGCAGGAGTTATGGAAAAACTACGGAGAGCAGATTTAATACAAAATCTGGGACAGGATTGCCT
GTATTTAAGTGTACGAGAAGCTGTATTTTCGTATTCATCAATTCTCAAAGAGCAAGTTTGATCGTGTGCATCGATTCGGATCAAAATGGCTCTGACAAGCTTTAAATTCACGCAACCCCAAAATGGGACACGCAAACCGAGAAAAGACACGGAATAATGTGCGGGTTTTGCAATGCACGATGACGTAAATGCAAAACGTG
CAGCTAAATATTTTGCAATGTAATCGCTGAATAAGGACGTAATTGTAACCGGGTTTCGATTTTATGTTTATTTTAAAAAAATTATTTGATAAATTTGAGTATGAGTTTGTTTTAAAATAGAATCTCTTAAATGATTAATTATGGAAAATGATCG

>TRINITY_DN43906_c0_g3_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GTATGTCATACTGGACCTGACTGgtcagtcactcactcattaatcatcccacaacttctgattacaattttgacttgtcctggagtatgtaatccaacttggtctaaacatgttatctattgtttgcagCTGTAACAACTATTGACACAACAGGGGTCAATATTATTGTGGAGGTCAAGAAAACTCTGGAGAAAAGAGGA
TTACAGGTTGCCATGGTGAATCCCGGGGCAGGAGTTATGGAAAAACTACGGAGAGCAGATTTAATACAAAATCTGGGACAGGATTGCCTGTATTTAAGTGTACGAGAAGCTGTATTTTCGTATTCATCAATTCTCAAAGAGCAAGTTTGATCGTGTGCATCGATTCGGATCAAAATGGCTCTGACAAGCTTTAAATTCAC
GCAACCCCAAAATGGGACACGCAAACCGAGAAAAGACACGGAATAATGTGCGGGTTTTGCAATGCACGATGACGTAAATGCAAAACGTGCAGCTAAATATTTTGCAATGTAATCGCTGAATAAGGACGTAATTGTAACCGGGTTTCGATTTTATGTTTATTTTAAAAAAATTATTTGATAAATTTGAGTATGAGTTTGTT
TTAAAATAGAATCTCTTAAATGATTAATTATGGAAAATGATCG

Intron 2 GTTGGTTTCA ... TAATGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	7.81	59	0	5
A2	18.37	40	0	9
A3	19.23	63	0	15
A4	10.53	34	0	4
A5	7.14	26	0	2
A6	13.02	187	0	28
A7	15.79	208	0	39
A8	19.74	244	0	60
A9	16.97	230	1	47
A10	11.69	136	0	18

>TRINITY_DN40836_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

CGGGGAGGAACAACTATTTAGAGTTTCGCAGCGGAATGGAATGGGTCCCATACTTTGTTTTTCCATCAAAAATCTTGATGGTGTGTTTTCATGGGAACTCGTCTTAATCGAAGAGGAGGATGATCATATCTGATAAATCCATGTTCAAAGCTATTTTTAGGAACAGAGAAACTTTCTAATGAGCCCGCCCTTACATCTAT
ATTTCCCTTGTTCACCACTTTTTCTTCTGTGCCCAAGGTTTCGGCCTGTTTCTGCGCTCCCAATTTGAGTTCTTGAAAACGCTGCGTCCCAAATCTGAAAGGGACATTACGATAGGGTGGCCCGATCAAGATCCGGTCACAGGATCGACATTGTGCCCTGATCTTTATCCGGCAACAGGAAACCGATGGATATCACTTTT
GACTCATGTTTTTTATTAGATTCTTTGGGTTTTGGTGTTATATAAGGAGAACGAGTAGCTACATTCTTGCACAGCTCTTTCTGCGTTGTTGGGGTTTCCGTTTTACCTATTGTGTTGGGTTTCCAAAGCCTCTGTTTTCACTGTATATGGTCCTGCTTTTGAGGTACAGTCAGGATCTGCAAGAACGGGTTTCATGACCG
CAAGATCCAAATTGCACTGTGCATTTCTGTGAACTTCAGGATTTGCTTTGCATATTTAAATCCTTCCATGGCGCCCATTCTAGTGGATTGCGGGGTGTCCACGTCTTAAAAGCTTGAAGGATCTGTTTCGCATGCTTCTGTCTTGTTTTTTCTATACTTTTTTATTGATTTGTGTGAGACTAGTATCATGGTGGGAGGCT
CCGGAAGAGTAGACTGTTACGATGACGGCAATTCTGCTGGCGACAATGTGAATTCTCCCAGAGTTTCAGAAATGAATGTAGGTGATGGGCAGCGCGCTGGGAGCTGTTGCCCTAGCTGCCATGGAGCTATGGGTTTTGAGAAGAAAACGATTGATGAGAGGGTTCACAAGGTGGGCATTCCTGAATCAAAGAGTGTAGCT
CGTCAATTCAGTTCTAAGATGAAGGAGACATTCTTCCCTGATGATCCATTCAGACAGTTTAGAGGCCAAGCTTGTGGCAGGCAATGGTGGTTGGGGCTGATGTATTTCTTTCCAGTACTGGAATGGGCTCCCAATTATAGCCTCGCTGTTTTTAAGTCTGATGTTATTTCTGGTCTAACCATAGCCAGCCTCGCTATCCC
TCAGGGCATTAGTTATGCCAAGTTAGCCAGTTTGCCACCCATCATCGGGTTATATTCAAGCTTCGTTCCGCCTTTAATCTATTCAGTACTTGGTAGCTCTAGAGATCTTGCAGTTGGGCCTGTCTCTATTGCTTCTTTGCTGCTCGGAGCCATGCTTAGAGAGGAGATTTCTCCAACCACAGAGCCTGTGTTGTACTTGC
AGGTTGCATTCACTGCAACCTTTTTTGCTGGCGTTTTCCAGGCTTCTTTGGGGATTCTCAGGCTGGGATTTATAATCGACTTTCTGTCGCGGGCAACTCTTATTGGATTCATGGCAGGCGCAGCTGTTATAGTGTCCTTGCAGCAATTTAAAGGCCTTCTGGGGATTCAACACTTCACTCCCAAGATGGACATAGTCTCT
GTCTTGCGTTCTGTCTTTGAACGTAAAAGCGAGTGGACATGGCAGACGTTTGTGATGGGTTTGTTTTTCTTAGCATTGCTGCTAACTGCACGCTATATTAGCAAGAAAAGGAGCCAACTCTTTTGGGTTTCTGCTGCTGCTCCCTTGACTTCAGTAATTCTAGCTACTCTATTCGTCTTCGCCACCAAGGCTGATAAACA
CGGCATTAGCGTTATTGGTCACTTGAAAAAGGGGCTGAATCCACCTTCCCTTCAAATGCTGCGTTTTAATGGCAATTACTTAGGATTGGCGATAAAAACTGGGCTTGTTACCGGACTCATCTCACTGACGGAAGGTATAGCAGTGGGAAGAACATTTGCTTCAATCAAAGATTATCGGGTTGATGGAAACAAGGAGATGA
TGGCCATTGGATTGATGAACATGGCAGGCTCTTGCACTTCCAGCTATGTTACAACAGGGTCGTTCTCTCGATCAGCAGTGAATTACAATGCTGGATGCAAGAGCGCAGTATCAAATGTAGTGATGGCTTTAACAGTCATGGTGACCCTTCTGCTTCTAACGCCTTTGTTCTACTACACGCCTGGAGTTGTGTTGGCATCC
ATAATAGTTGCAGCAGTTCTGGGTTTAATCGACATCCCTGCAGCATATTTCATATGGAAAGTCGATAAGGTGGATTTCCTTGCATGTTTGGGAGCTTTTGTAGGAGTCATCTTCGTCTCTGTGCAAATGGGCCTTCTTATTGCGGTCGGCATCTCTGTGTTCAAAATACTGTTGCATGTAACGAGGCCTAACACTTCCCT
TATGGGCAAGATTCCTGGAACCAATTATTATAGAAACTTGGAACAATACAGCGAAGCCACCAGAATCCCTGCATTTCTCATTCTTCGAATCGATGCCCCTATTTACTTCGCCAACTCAACCTACTTGAGAGAAAGGATAATGAGGTGGGTAAGTGAAGAGGAGGACAGAATTGAGAGTGAAAATGATGATACCCTGCAGT
ATGTCATACTGGACCTGACTGCTGTAACAACTATTGACACAACAGGGGTCAATATTATTGTGGAGGTCAAGAAAACTCTGGAGAAAAGAGGATTACAGGTTGCCATGGTGAATCCCGGGGCAGGAGTTATGGAAAAACTACGGAGAGCAGATTTAATACAAAATCTGGGACAGGATTGCCTGTATTTAAGTGTACGAGAA
GCTGTATTTTCGTATTCATCAATTCTCAAAGAGCAAGTTTGATCGTGTGCATCGATTCGGATCAAAATGGCTCTGACAAGCTTTAAATTCACGCAACCCCAAAATGGGACACGCAAACCGAGAAAAGACACGGAATAATGTGCGGGTTTTGCAATGCACGATGACGTAAATGCAAAACGTGCAGCTAAATATTTTGCAAT
GTAATCGCTGAATAAGGACGTAATTGTAACCGGGTTTCGATTTTATGTTTATTTTAAAAAAATTATTTGATAAATTTGAGTATGAGTTTGTTTTAAAATAGAATCTCTTAAATGATTAATTATGGAAAATGATCGA

>TRINITY_DN40836_c0_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:

ACTCAACCTACTTGAGAGAAAGgttggtttcagttgctttatatgttcccaagattcagcattaatggtagagtcttgagaactgtaatctgcattgattatactgagtttgccagcttctgaggttgtaaataatgtgcagGATAATGAGGTGGGTAAGTGAAGAGGAGGACAGAATTGAGAGTGAAAATGATGATACC
CTGCAGTATGTCATACTGGACCTGACTGCTGTAACAACTATTGACACAACAGGGGTCAATATTATTGTGGAGGTCAAGAAAACTCTGGAGAAAAGAGGATTACAGGTTGCCATGGTGAATCCCGGGGCAGGAGTTATGGAAAAACTACGGAGAGCAGATTTAATACAAAATCTGGGACAGGATTGCCTGTATTTAAGTGT
ACGAGAAGCTGTATTTTCGTATTCATCAATTCTCAAAGAGCAAGTTTGATCGTGTGCATCGATTCGGATCAAAATGGCTCTGACAAGCTTTAAATTCACGCAACCCCAAAATGGGACACGCAAACCGAGAAAAGACACGGAATAATGTGCGGGTTTTGCAATGCACGATGACGTAAATGCAAAACGTGCAGCTAAATATT
TTGCAATGTAATCGCTGAATAAGGACGTAATTGTAACCGGGTTTCGATTTTATGTTTATTTTAAAAAAATTATTTGATAAATTTGAGTATGAGTTTGTTTTAAAATAGAATCTCTTAAATGATTAATTATGGAAAATGATCGA