sp|Q10L91|DIS1_ORYSJ ----> E3 ubiquitin-protein ligase DIS1

Intron 1 GTAAGTACCC ... GGATTTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	70.58	98.3	202	67
A2	70.7	63.3	136	40
A3	72.96	88	203	59
A4	72.53	72.3	161	43
A5	68.48	37.7	69	17
A6	70.48	75	148	36
A7	69.06	172.7	317	47
A8	69.74	86	158	18
A9	67.96	124.7	215	38
A10	69.14	179.7	334	43

>TRINITY_DN45435_c1_g4_i4 from sample A6 / Example spliced isoform

CGAAGGTTTCCAAATCCACCCGGATCTTAAATACTCAGCGTAAAATCAAACTCGTATCGGTTGAGATAGAGATAAACAGTAGCCAGTAGGTAGTTTTGTATTCTATTGTTTTAAAGCCGGTCGATTCCCTTTTTATTCGAATTTGAATTGACTCACGGAAAGCTTGCAAATCATGAATGGAAGTGCGAGCGTAGGAAGTC
GTGAAGCAGCGGCTTTATCGAGGCCAATTCAATTCAATTCAGTCTGTCCAGTTCTCTGTCATCATCATAATGATCTTCTAATTCTTCTTTTGGATTTGATAAACCATTTTCTGGAAGCTTGGACAGGAAGAATCTTATACACCCCATGCATTTATTTATCCGGGGCCTTGTACTTGTCTGCTTTAATGATTTGAATGTAA
ACTTGAGGCAAACCCAGCAACCTTTTCGAATTTCCTAGGGTTTTGCGTCGCAAGCGGGAAGAACAAACAATGGAATCGGAAGGCTGTTTGTTCAAATTTCAGTTCATTGTCAATGTCTTCTTTCTTTCTTTGGGAATCGGAGCTTCCTCAAATGGGTAATTAGTGACCACTGTTCCTGTGTATGCAGAATATATGCAGTG
TTGGTGGCTTGGAAGAGTGCTGCTAGTGTTGGGTTATATAGTTGACTAGGAATATGGTATTTTGGTTGGAGATACTGGAGAATGTGGTAGAGGTGATTTTATAAATTCTGCGGGTCTGGGTAATGGGAAATAGGTCCACTGGGCTAAGTTCATCGAAAAATTGGGAAAAAAAGGGAAGAAAGAAAACCAGTGAAGTATCC
AATGGGGGAATGGTTCAGTGGTGAAGAAAGTGGCATGTCAGGTTACCTACCAAGTTTCAATTCCCCCATAGGTACGATTAAGTTGTTGGGACAGGTGCAAGTGCTGGGTAATTTGGATGGGAGAGTACACTGTGTTTCTGCAATTAATCAATGGCGTGCCCTGCTAGGGCTGTCTCGCCTGTGAAAGCTTTATTAGTCAT
TTTCTTTGTTATGTTTTGGATCTTGAATTTATGACAACGCCACTGAGATTATTATGAGTTTTTAGAATGGCTTGGGAGATGCACAGTCTTCAACTCTCCAAATGTGAAACCAAATTGATAATTGCAACCCAAAGAAATACAGCCTGCCGATCTCTATCTGTTCGTCTTTTCTTGACAGCCAGGGGAATTTTACGAGAATA
TCCCAGGACAACTTTGTAGTGTGGACCAGCAGTGGTGTGGTCATGTCTGCTCTTTCTATACCATATGCTGGATATGACACATGCAGCCATGGGAAAGAGGCGAAGAGTGAGCATTACCCAATGGCATATACAGCAACTACCAGAGATCCCCGTGTCTCACAGAATAATATAATTCCAGAGTGGTGCTAGATGTTTAAGGT
GACCAGTATGGCTTGTTTCTGGCAAGAGAGCAAGTTGAATGCTATCAAGATCAGCACATTTTGAAATTTGTAAATGACTGCTATTTTGATTAGCTTGCACCCTGAATTTATTATTGTTAATCTTAATGTAACTTGCAATTAGTAACAGGTGCTTCTATTCTACAGCTGGAGAATGTTTTTCTTTCATGTATAGAAGCTTT
CTTTCCTTATTTGGAAAATAATGACGA

>TRINITY_DN45435_c1_g4_i5 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CGAAGGTTTCCAAATCCACCCGGATCTTAAATACTCAGCGTAAAATCAAACTCGTATCGGTTGAGATAGAGATAAACAGTAGCCAGTAGGTAGTTTTGTATTCTATTGTTTTAAAGCCGGTCGATTCCCTTTTTATTCGAATTTGAATTGACTCACGGAAAGCTTGCAAATCATGAATGGAAGTGCGAGCGTAGGAAGTC
GTGAAGCAGCGGCTTTATCGAGGCCAATTCAATTCAATTCAGTCTGTCCAGTTCTCTGTCATCATCATAATGATCTTCTAATTCTTCTTTTGGATTTGATAAACCATTTTCTGGAAGCTTGGACAGGAAGAATCTTATACACCCCATGCATTTATTTATCCGGGGCCTTGTACTTGTCTGCTTTAATGATTTGAATGTAA
ACTTGAGGCAAACCCAGCAACCTTTTCGAATTTCCTAGGGTTTTGCGTCGCAAGCGGGAAGAACAAACAATGGAATCGGAAGGCTGTTTGTTCAAATTTCAGTTCATTGTCAATGTCTTCTTTCTTTCTTTGGGAATCGGAGCTTCCTCAAATGGGTAATTAGTGACCACTGTTCCTgtaagtacccaccgtattttctt
ttaatgtgtatggactctgtattcaggtctgtaatggaatgcattgtttttaatcatttagtagtcaatcaacaaagccgttttatataaatttatccttgatgtattggctataggaattggccttgaatgggttctgtgaaattgggcattcttggttttctttccttgacgtttcaggatagtagtctaaaacatac
gggatttttagGTGTATGCAGAATATATGCAGTGTTGGTGGCTTGGAAGAGTGCTGCTAGTGTTGGGTTATATAGTTGACTAGGAATATGGTATTTTGGTTGGAGATACTGGAGAATGTGGTAGAGGTGATTTTATAAATTCTGCGGGTCTGGGTAATGGGAAATAGGTCCACTGGGCTAAGTTCATCGAAAAATTGGGA
AAAAAAGGGAAGAAAGAAAACCAGTGAAGTATCCAATGGGGGAATGGTTCAGTGGTGAAGAAAGTGGCATGTCAGGTTACCTACCAAGTTTCAATTCCCCCATAGGTACGATTAAGTTGTTGGGACAGGTGCAAGTGCTGGGTAATTTGGATGGGAGAGTACACTGTGTTTCTGCAATTAATCAATGGCGTGCCCTGCTA
GGGCTGTCTCGCCTGTGAAAGCTTTATTAGTCATTTTCTTTGTTATGTTTTGGATCTTGAATTTATGACAACGCCACTGAGATTATTATGAGTTTTTAGAATGGCTTGGGAGATGCACAGTCTTCAACTCTCCAAATGTGAAACCAAATTGATAATTGCAACCCAAAGAAATACAGCCTGCCGATCTCTATCTGTTCGTC
TTTTCTTGACAGCCAGGGGAATTTTACGAGAATATCCCAGGACAACTTTGTAGTGTGGACCAGCAGTGGTGTGGTCATGTCTGCTCTTTCTATACCATATGCTGGATATGACACATGCAGCCATGGGAAAGAGGCGAAGAGTGAGCATTACCCAATGGCATATACAGCAACTACCAGAGATCCCCGTGTCTCACAGAATA
ATATAATTCCAGAGTGGTGCTAGATGTTTAAGGTGACCAGTATGGCTTGTTTCTGGCAAGAGAGCAAGTTGAATGCTATCAAGATCAGCACATTTTGAAATTTGTAAATGACTGCTATTTTGATTAGCTTGCACCCTGAATTTATTATTGTTAATCTTAATGTAACTTGCAATTAGTAACAGGTGCTTCTATTCTACAGC
TGGAGAATGTTTTTCTTTCATGTATAGAAGCTTTCTTTCCTTATTTGGAAAATAATGACGA

Intron 2 GTGACTGTTT ... CTGGTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	22.33	273	70	87
A2	22.29	197	58	55
A3	24.96	254	84	85
A4	23.73	180	42	70
A5	23.47	75	22	24
A6	23.55	323	86	113
A7	23.27	610	162	208
A8	24.42	568	157	210
A9	25.46	571	199	191
A10	23.57	613	167	211

>TRINITY_DN127743_c1_g2_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

GGCCCATTAACCAAAGTGACTAGTCTTTGGTTGTGTTTGAGGTTCTATTTATTCAAGGGTCTGTTTGAGAGCCCTCTCTTGCTTTTTCTATGGGTTGGAAATCATACAGGGTTTGTGACTGTTAGCTATGCTTTCATTTATTTAATGCTGCAATTCTATGGCTTGCTTTCTTTACCTAATACAAAGATTCCTTATAAGAT
AGTTACATGCAATAGTAATGCTTGGATTTTCATTGAATGTGGATGCAGTGCCCAAATGGCCATACGCTTTGTTCTGCATGCAAGTCTAGAATACATAACCGGTGCCCCACATGCCAAAGTGAACTTGGTAATATCAGATGTTTGGCTCTCGAAAAGGTGGCTGCTTACCTAGAGCTCCCTTGCAAATATCAAACCTATGG
TTGTCATGGACTATTTCCTTACTATTGTAAGTTAAAGCATGAAGGACAATGCACTTTTAGGCCATACAACTGCCCATATGCTGGTTCTGAATGTACAATATCTGGCAGTATATCATTTCTGATATCCCATTTGAGAGAAAAGCACGAAGTTGATATGCACTACAGTAGCACGTTTAATCATCGATATGTAAAATCCAATC
CTGATGAGGTTGACAATGCTACTTGGATGTTGACGGTGTTCAATTGTTTTGGCCAATACTTTTGTTTACATTTTGAAGCCTTTCAAATAGGCATGGCTCCTGTATACATAGTTTTTTTGCGCTTCATGGGTGAAGATGATGAAGCAAAGAACTTTGGCTACAGCCTTGAAGTCGGAGGGAATGGGCGGAAAATAATTTGG
CAAGGAGTTCCGAGAAGCATAAGGGATAGTCACGTAAAAGTCCGTGACAGTCATGATGGTTTGATCATCCATAGAAACATGGCTCTATTCTTTTCAGGGGGTGACAAAAAAGAATTAAAGCTGAAGGTCAGTGGGTGTATTTGGGAGGAGCAATAAGTTTGCTTACCATACTGCTCATTGAACACCAAGGAGATCATATT
CCCATCTTGCTCATATTATTAATTCCAGGGGGTGACAAAAAAATATTAAAGCTCAACGTCAGTGGGTGCATTTAGGAGGAGCTATAATGTTTACTCGCTGTACTGCTTATTGAGAACTAAGGAGATCCTATCCCTATCTTGCTCATTTTATGCTGATAGATGGCTTGTATTTTCCATAAAGAAAGCTTTACAAGCAAGAT
CCCGTTGGTGTATGTCTGGCAGAAGCATTCCTTGATCAGTGACTACTGTGCATAACATGAAAATGTAGCCCTTAAAGGCCAACAACACGAAATGGTGTGATATTTTGGGTGGATATTATGCCAATTATCTATCTGAAGTCCTTTTTGATGAGCAGACACTTTTTTTTTTCAGTTCCCTAAGATCTTCAAGGAGACATTAA
GCTAACAATATAGAGGTGAACAGCCGGCTGTTGTTTGAAGATTTAAGAAAATCAAAGTCCACTTGCTCTGATATCCCTCTTCCCAAGTTGTTTTGATCTGCTTTTGATATTTTAATCGCTGGAAAAATCTAATGGCATTTCTGAGCTTAATGAGATAGCAGTCGTACATCTGGTGGGAAATTAAATTTGTGCGACAGATT
TTATGTTTGCAACTAGTGTTTGGTGAGTATAGTGAGCAATTTTTAGGCATAGTATTTGTAATTGTCATTTGATTAAATCTCTGAAGGTGATATTAGCTACCCAATATAGGAAAAAATCATTCACAAGGTCACAGGTGTAAACAATAGTTTTACAGCCTACACAGGCCATTAATTGCTGGGTATAGGAAAAGCAGATCACG
ATTATGAAGTACAATTAGAGCAATGCAGAGTGTATTTTAAATTCTAAAAAAAAGTGATAAGCAATTTGATGTCTCGTGTCATTATTCTGCATGAGACAAATAAACTTTTTAGGCATAGTATTTGTACCTGTAATTTGATTAATCTCTGATGTTGATATAAGTTACCCAATATAATAAAAAATTACTCAGGTGAAAACAAT
ACTTTTACAGCCTACACGGGCCATCGAATTGGTGGTTATGGGAAAAGCAGGTCAAGACTACGAGGTACAATTAGAGCAATGCACTGAAACTACATCGAGACAGTATAGTCTATACACACTTGGCCCTTTGGACCTCCCAAGGCCTC

>TRINITY_DN127743_c1_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGCCCAAATGGCCATACGCTTTGTTCTGCATGCAAGTCTAGAATACATAACCGGTGCCCCACATGCCAAAGTGAACTTGGTAATATCAGATGTTTGGCTCTCGAAAAGGTGGCTGCTTACCTAGAGCTCCCTTGCAAATATCAAACCTATGGTTGTCATGGACTATTTCCTTACTATTGTAAGTTAAAGCATGAAGGACA
ATGCACTTTTAGGCCATACAACTGCCCATATGCTGGTTCTGAATGTACAATATCTGGCAGTATATCATTTCTGATATCCCATTTGAGAGAAAAGCACGAAGTTGATATGCACTACAGTAGCACGTTTAATCATCGATATGTAAAATCCAATCCTGATGAGGTTGACAATGCTACTTGGATGTTGACGgtgactgttttct
ttctcttcactacagtattttatattctcttttggcatattttctttcttattccttgcagttaatttgtattttacatttacattgtccaacgttttgctggtttcagGTGTTCAATTGTTTTGGCCAATACTTTTGTTTACATTTTGAAGCCTTTCAAATAGGCATGGCTCCTGTATACATAGTTTTTTTGCGCTTCA
TGGGTGAAGATGATGAAGCAAAGAACTTTGGCTACAGCCTTGAAGTCGGAGGGAATGGGCGGAAAATAATTTGGCAAGGAGTTCCGAGAAGCATAAGGGATAGTCACGTAAAAGTCCGTGACAGTCATGATGGTTTGATCATCCATAGAAACATGGCTCTATTCTTTTCAGGGGGTGACAAAAAAGAATTAAAGCTGAAG
GTCAGTGGGTGTATTTGGGAGGAGCAATAAGTTTGCTTACCATACTGCTCATTGAACACCAAGGAGATCATATTCCCATCTTGCTCATATTATTAATTCCAGGGGGTGACAAAAAAATATTAAAGCTCAACGTCAGTGGGTGCATTTAGGAGGAGCTATAATGTTTACTCGCTGTACTGCTTATTGAGAACTAAGGAGAT
CCTATCCCTATCTTGCTCATTTTATGCTGATAGATGGCTTGTATTTTCCATAAAGAAAGCTTTACAAGCAAGATCCCGTTGGTGTATGTCTGGCAGAAGCATTCCTTGATCAGTGACTACTGTGCATAACATGAAAATGTAGCCCTTAAAGGCCAACAACACGAAATGGTGTGATATTTTGGGTGGATATTATGCCAATT
ATCTATCTGAAGTCCTTTTTGATGAGCAGACACTTTTTTTTTTCAGTTCCCTAAGATCTTCAAGGAGACATTAAGCTAACAATATAGAGGTGAACAGCCGGCTGTTGTTTGAAGATTTAAGAAAATCAAAGTCCACTTGCTCTGATATCCCTCTTCCCAAGTTGTTTTGATCTGCTTTTGATATTTTAATCGCTGGAAAA
ATCTAATGGCATTTCTGAGCTTAATGAGATAGCAGTCGTACATCTGGTGGGAAATTAAATTTGTGCGACAGATTTTATGTTTGCAACTAGTGTTTGGTGAGTATAGTGAGCAATTTTTAGGCATAGTATTTGTAATTGTCATTTGATTAAATCTCTGAAGGTGATATTAGCTACCCAATATAGGAAAAAATCATTCACAA
GGTCACAGGTGTAAACAATAGTTTTACAGCCTACACAGGCCATTAATTGCTGGGTATAGGAAAAGCAGATCACGATTATGAAGTACAATTAGAGCAATGCAGAGTGTATTTTAAATTCTAAAAAAAAGTGATAAGCAATTTGATGTCTCGTGTCATTATTCTGCATGAGACAAATAAACTTTTTAGGCATAGTATTTGTA
CCTGTAATTTGATTAATCTCTGATGTTGATATAAGTTACCCAATATAATAAAAAATTACTCAGGTGAAAACAATACTTTTACAGCCTACACGGGCCATCGAATTGGTGGTTATGGGAAAAGCAGGTCAAGACTACGAGGTACAATTAGAGCAATGCACTGAAACTACATCGAGACAGTATAGTCTATACACACTTGGCCC
TTTGGACCTCCCAAGGCCTC

Intron 3 GTAAGCGTCT ... TTCTTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	58.95	47	8	84.5
A2	65.48	24	2	55.5
A3	55.79	41.5	6	64.5
A4	62.9	31.5	7	60
A5	53.62	23	0	31.5
A6	55.55	31.5	0	58.5
A7	58.31	45	0	95
A8	60.53	19.5	1	50.5
A9	54.18	53	0	88.5
A10	60.94	54.5	0	124.5

>TRINITY_DN113831_c0_g2_i10 from sample A2 / Example spliced isoform

ACCCAGCAGTATAAGTGGGATCAGGCGCCTCGGATCAGCTCTGGCCAAGAACTCCATTGGCCCTGGCACCACGGCGGGAAGAACAAACAATGGAATCGGAAGGCTGTTTGCTCAAATTTCAGTTCATTACCAATTTGCCAATGTCTTCTTTCTTTCTTCGGGAATCGGAGCTTCCTCAAATGGGTAATTAGTGACCACTG
TTCCTGTAAGTACCCACTGTATTTTGAATTTGTGTATGGACTCTGTATTTAGGTCTG

>TRINITY_DN113831_c0_g2_i13 from sample A2 / Example unspliced isoform:

ACCCAGCAGTATAAGTGGGATCAGGCGCCTCGGATCAGCTCTGGCCAAGAACTCCATTGGCCCTGGCACCACGgtaagcgtctctccatctggtttgcttagtctctgcatttcaatatagaggtctctccatctgctttaatgatttgaatatgaacagagtaaaacccagcaatcttttcgaatttcctaaggttttt
cttggcagGCGGGAAGAACAAACAATGGAATCGGAAGGCTGTTTGCTCAAATTTCAGTTCATTACCAATTTGCCAATGTCTTCTTTCTTTCTTCGGGAATCGGAGCTTCCTCAAATGGGTAATTAGTGACCACTGTTCCTGTAAGTACCCACTGTATTTTGAATTTGTGTATGGACTCTGTATTTAGGTCTG