sp|Q9SHD3|CCU21_ARATH ----> Cyclin-U2-1
Intron 1 GTAAAGATCG ... AATTGGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 59.09 | 9 | 13 | 13 |
| A2 | 62.96 | 5 | 11 | 6 |
| A3 | 60.98 | 8 | 8 | 17 |
| A4 | 79.31 | 3 | 9 | 14 |
| A5 | 68.42 | 3 | 4 | 9 |
| A6 | 72 | 7 | 24 | 12 |
| A7 | 53.06 | 23 | 20 | 32 |
| A8 | 52.38 | 5 | 4 | 7 |
| A9 | 60 | 11 | 17 | 16 |
| A10 | 52.54 | 14 | 14 | 17 |
>TRINITY_DN112292_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformGGTAAGTGTAGGGCGGTGGCCGCGTGATTACCGGGACATCAAGATTTGACAAATTTTATGAATTCTTACATCGACTTCGCGAAAAACATAAAGATTTGACCAAATGGTACATCGGCCAGAAGGATTGAAACGGTCGAATTTCTTTCGTTCTTCGAGGCCGGAATTTAACCACGAAAATGCCTAATTTATTTACCAGTCAA
ACGCTGAACCTTCACCATTTTCTGTAACCAGTATGTATCTCGGAGCAAAGTAAAATGGCAAGTAAATGCTTCAAAGTACAGGTTCTGGTGGTAATATTCCAACCTTTGACATCCATATACCGTCTCTGCAGACATCTGACGCTGTGGTATCGCCGCGTTGTGGCAGTATATGCTGTCAAAACATTGAATTCCGTCAAAAA
CATTCGTTCTAATTCGTACTTTTGATGACTTGCAACTATGGTGGTAAATATGCGTATCTCTGGTTAAAAGTAAAAGAATGTGTTCTCTTTACTCGGAAAGCATGTCATTCTGTCGGCAGCAAATTGTGTGGAAGAAATGCATCGACGTCGGAATATCCTTAGGCGGGAAGAAATGCGGTACTGTTGCAATACGCGTCAGC
ATTCAACCCAGCGGGCCCCTTCAAGGATCCCTTCCGCGCCAATTGACCTTCTTTTCGCGGATGAACAATCATTACGTTGGCGCAAGAATCTTTTCTTGGTGCTAGAATGTCCGGAAGTACTTTCTACGATTAAGGCTTTTGTGCTTTAAAACCTCTGGTTCGATGTCCATGACATAAAACTTATTTGCAATGATGATGGT
GGCAGCCTTTGAAACATAAATTCCTCTCTCTTTGCATACACATGGCTTCTGTCATGAAGCACGTCTCGCCTAGAAGGATTCGGTCTGATATATACTCATTTTCAGCCTCTGATATTAGTTCTGCAGAACCAAGTAGTCCTTGTATCCTTTCAGTTCTCTCATCCCTTCTTGAGAGGGTTGTGGTTAGGAATGAGAGACAA
TCAACATCTACAGGTCAGTGCTTATCACCTTCAAGGTTGGGGGTTTTTCATGGCATTCGAATTCCAGACATCAGCATTGAGCAGTATTTGGAGAGGATTTTCAAGTATGTGCACTGTAGTCCCTCTGTTTTTGTAGTTGCATATGCGTATATAGACCGCTTGATTCAACTCAATTCAGGGTTCCGGATTACTTCTCAGAA
TGTTCACAGACTTTTGATCACTAGTGTGATGGTTGCTGCCAAGTTTCTTGATGATATGAACTACAACAATGCATATTATGCGAAAGTAGGCGGTCTTTCAACCAGGGATATTAATCATCTTGAAATTGAGTTCTTGTTCATGTTAGACTTTCGTCTGCAGGTAACTGTTAGTGTGTTTGAAAGCTATTGTGCACATCTTG
AACGAGAAGTTGCCTTGGGAGGAGGTTACCAAATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATATGTGGGTTGGATGAAGGCTCCTCACAAGATGATCCTCAAAAGCAAGTGTTGAGGAAGTGATCAGATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATGTATGGGACGGATGGGGATTCCTCATAAGATGATTCTCGAAAGCAAGAGTTGTCTAT
GAGATGCAGTTACAGGGGACCGTAGAAGACCTTTGTAGCAGCTGTAAGAATTCATTGAAAAGAACAGTGGAACTCAGCATGTGTCCTTAATATCATCAGTATTGTACCATATCATAATTTCATAATTTCATGCAATCTCCTTTGCACAAAGCCATCATCAGTATTAGACTGGTAATATGTATGGAAGAGACAGAGTAAGG
CAGGGTTGTACTGTGTGAGAAATTAGCACCTAATCTTTCATTACAGGATGGTTGAATGCAAATCTTTGAGCTACCCTGTTACATATGTGGCTGTATCTGCATTGTGATTTGCAAGATGACGAGCAACTCTGAAGGCTTGTAAGTGATCTCTCGGAAGAGTGGTGTGACTACTATGTGGGGAGAAGCTGGTAACATCAGCG
GACAGAGGCCCCCTTTTTTCATCCTGAAGTCTTTCACTTTGATTTTGCCATCATGATATTTAATTGCTTGTAACTAAATAGAACTGTACAGATTATACAGATTTGGTCCATGCTGATTGTTACGTGCATTGCTACCTATGCTTGCAACTTCAACCATCATGCATCGCCAACTTCTTTACCGATATATTTTATTTCTGAGT
TGACCCATGCCCTAGCAGCATAAGGCCTAATAGAACTAGCAGATCATACTGATGTGAGAAAC
>TRINITY_DN112292_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:GGTAAGTGTAGGGCGGTGGCCGCGTGATTACCGGGACATCAAGATTTGACAAATTTTATGAATTCTTACATCGACTTCGCGAAAAACATAAAGATTTGACCAAATGGTACATCGGCCAGAAGGATTGAAACGGTCGAATTTCTTTCGTTCTTCGAGGCCGGAATTTAACCACGAAAATGCCTAATTTATTTACCAGTCAA
ACGCTGAACCTTCACCATTTTCTGTAACCAGTATGTATCTCGGAGCAAAGTAAAATGGCAAGTAAATGCTTCAAAGTACAGGTTCTGGTGGTAATATTCCAACCTTTGACATCCATATACCGTCTCTGCAGACATCTGACGCTGTGGTATCGCCGCGTTGTGGCAGTATATGCTGTCAAAACATTGAATTCCGTCAAAAA
CATTCGTTCTAATTCGTACTTTTGATGACTTGCAACTATGGTGGTAAATATGCGTATCTCTGGTTAAAAGTAAAAGAATGTGTTCTCTTTACTCGGAAAGCATGTCATTCTGTCGGCAGCAAATTGTGTGGAAGAAATGCATCGACGTCGGAATATCCTTAGGCGGGAAGAAATGCGGTACTGTTGCAATACGCGTCAGC
ATTCAACCCAGCGGGCCCCTTCAAGGATCCCTTCCGCGCCAATTGACCTTCTTTTCGCGGATGAACAATCATTACGTTGGCGCAAGAATCTTTTCTTGGTGCTAGAATGTCCGGAAGTACTTTCTACGATTAAGGCTTTTGTGCTTTAAAACCTCTGGTTCGATGTCCATGACATAAAACTTATTTGCAAgtaaagatcg
tcatttctgcagtttttacaaataagtttgggtattggattagttttggagcaacaccagttcatcatttctgcctctttgtacatgatcctgtgtttggctttcatttgggggaaattaggcccattatttatgcaagataatgcacatgaccctgggttttggctgttttcttggggttgaatcagtttattgttctg
tatttttcacaactgactttgtgcaccattcagcttagagttgggacatattatgttccttgtttcagcaaattttgtacttgatttcctgcagctttagattgctatgcgttttgtgcttagtttccctcagctctgcaatccatgtcaaaatactgaatgattagcctgctttcaagagtaatactcccttgtcttaa
ttggacagTGATGATGGTGGCAGCCTTTGAAACATAAATTCCTCTCTCTTTGCATACACATGGCTTCTGTCATGAAGCACGTCTCGCCTAGAAGGATTCGGTCTGATATATACTCATTTTCAGCCTCTGATATTAGTTCTGCAGAACCAAGTAGTCCTTGTATCCTTTCAGTTCTCTCATCCCTTCTTGAGAGGGTTGTG
GTTAGGAATGAGAGACAATCAACATCTACAGGTCAGTGCTTATCACCTTCAAGGTTGGGGGTTTTTCATGGCATTCGAATTCCAGACATCAGCATTGAGCAGTATTTGGAGAGGATTTTCAAGTATGTGCACTGTAGTCCCTCTGTTTTTGTAGTTGCATATGCGTATATAGACCGCTTGATTCAACTCAATTCAGGGTT
CCGGATTACTTCTCAGAATGTTCACAGACTTTTGATCACTAGTGTGATGGTTGCTGCCAAGTTTCTTGATGATATGAACTACAACAATGCATATTATGCGAAAGTAGGCGGTCTTTCAACCAGGGATATTAATCATCTTGAAATTGAGTTCTTGTTCATGTTAGACTTTCGTCTGCAGGTAACTGTTAGTGTGTTTGAAA
GCTATTGTGCACATCTTGAACGAGAAGTTGCCTTGGGAGGAGGTTACCAAATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATATGTGGGTTGGATGAAGGCTCCTCACAAGATGATCCTCAAAAGCAAGTGTTGAGGAAGTGATCAGATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATGTATGGGACGGATGGGGATTCCTCATAAGATGATTCTCG
AAAGCAAGAGTTGTCTATGAGATGCAGTTACAGGGGACCGTAGAAGACCTTTGTAGCAGCTGTAAGAATTCATTGAAAAGAACAGTGGAACTCAGCATGTGTCCTTAATATCATCAGTATTGTACCATATCATAATTTCATAATTTCATGCAATCTCCTTTGCACAAAGCCATCATCAGTATTAGACTGGTAATATGTAT
GGAAGAGACAGAGTAAGGCAGGGTTGTACTGTGTGAGAAATTAGCACCTAATCTTTCATTACAGGATGGTTGAATGCAAATCTTTGAGCTACCCTGTTACATATGTGGCTGTATCTGCATTGTGATTTGCAAGATGACGAGCAACTCTGAAGGCTTGTAAGTGATCTCTCGGAAGAGTGGTGTGACTACTATGTGGGGAG
AAGCTGGTAACATCAGCGGACAGAGGCCCCCTTTTTTCATCCTGAAGTCTTTCACTTTGATTTTGCCATCATGATATTTAATTGCTTGTAACTAAATAGAACTGTACAGATTATACAGATTTGGTCCATGCTGATTGTTACGTGCATTGCTACCTATGCTTGCAACTTCAACCATCATGCATCGCCAACTTCTTTACCGA
TATATTTTATTTCTGAGTTGACCCATGCCCTAGCAGCATAAGGCCTAATAGAACTAGCAGATCATACTGATGTGAGAAAC
Intron 2 GTTCGTATGG ... TTCTCAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.25 | 11 | 2 | 8 |
| A2 | 20 | 6 | 1 | 2 |
| A3 | 20.83 | 38 | 5 | 15 |
| A4 | 26.67 | 11 | 2 | 6 |
| A5 | 37.5 | 10 | 0 | 12 |
| A6 | 16 | 21 | 3 | 5 |
| A7 | 18.92 | 30 | 10 | 4 |
| A8 | 27.27 | 4 | 2 | 1 |
| A9 | 21.84 | 34 | 9 | 10 |
| A10 | 18.31 | 29 | 6 | 7 |
>TRINITY_DN95126_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoformCGATGTTTGAATAAAATGGGTAAGTGTAGGGCGGTGGCCGCGTGATAACCGGGACATCAAGATTTGACAAATTTTATGAATTCTTACATCGACTTCGCGAAAATCATAAAGATTTGACCAAATGGTACATCGGCCAGAAGGATTGAAACGGTCGAATTTCTTTCGTTCTTCGAGGCCGGAATTTAACCACGAAAATGCCT
AATTTATTTACCAGTCAAACGCTGAACCTTCACCATTTTCTGTAACCAGTATGTATCTCGGAGCAAAGTAAAATGGCAAGTAAATGCTTCAAAGTACAGGTTCTGGTGGTAATATTCCAACCTTTGACATCCATATACCGTCTCTGCAGACATCTGACGCTGTGGTATCGCCGCGTTGTGGCAGTATATGCTGTCAAAAC
ATTGAATTCCGTCAAAAACATTCGTTCTAATTCGTACTTTTGATGACTTGCAACTATGGTGGTAAATATGCGTATCTCTGGTTAAAAGTAAAAGAATGTGTTCTCTTTACTCGGAAAGCATGTCATTCTGTCGGCAGCAAATTGTGTGGAAGAAATGCATCGACGTCGGAATATCCTTAGGCGGGAAGAAATGCGGTACT
GTTGCAATACGCGTCAGCATTCAACCCAGCGGGCCCCTTCAAGGATCCCTTCCGCGCCAATTGACCTTCTTTTCGCGGATGAACAATCATTACGTTGGCGCAAGAATCTTTTCTTGGTGCTAGAATGTCCGGAAGTACTTTCTACGATTAAGGCTTTTGTGCTTTAAAACCTCTGGTTCGATGTCCATGACATAAAACTT
ATTTGCAAGTAAAGATCGTCATTTCTGCAGTTTTTACAAATAAGTTTGGGTATTGGATTAGTTTTGGAGCAACACCAGTTCATCATTTCTGCCTCTTTGTACATGATCCTGTGTTTGGCTTTCATTTGGGGGAAATTAGGCCCATTATTTATGCAAGATAATGCACATGACCCTGGGTTTTGGCTGTTTTCTTGGGGTTG
AATCAGTTTATTGTTCTGTATTTTTCACAACTGACTTTGTGCACCATTCAGCTTAGAGTTGGGACATATTATGTTCCTTGTTTCAGCAAATTTTGTACTTGATTTCCTGCAGCTTTAGATTGCTATGCGTTTTGTGCTTAGTTTCCCTCAGCTCTGCAATCCATGTCAAAATACTGAATGATTAGCCTGCTTTCAAGAGT
AATACTCCCTTGTCTTAATTGGACAGTGATGATGGTGGCAGCCTTTGAAACATAAATTCCTCTCTCTTTGCATACACATGGCTTCTGTCATGAAGCACGTCTCGCCTAGAAGGATTCGGTCTGATATATACTCATTTTCAGCCTCTGATATTAGTTCTGCAGAACCAAGTAGTCCTTGTATCCTTTCAGTTCTCTCATCC
CTTCTTGAGAGGGTTGTGGTTAGGAATGAGAGACAATCAACATCTACAGGTCAGTGCTTATCACCTTCAAGGTTGGGGGTTTTTCATGGCATTCGAATTCCAGACATCAGCATTGAGCAGTATTTGGAGAGGATTTTCAAGTATGTGCACTGTAGTCCCTCTGTTTTTGTAGTTGCATATGCGTATATAGACCGCTTGAT
TCAACTCAATTCAGGGTTCCGGATTACTTCTCAGAATGTTCACAGACTTTTGATCACTAGTGTGATGGTTGCTGCCAAGTTTCTTGATGATATGAACTACAACAATGCATATTATGCGAAAGTAGGCGGTCTTTCAACCAGGGATATTAATCATCTTGAAATTGAGTTCTTGTTCATGTTAGACTTTCGTCTGCAGGTAA
CTGTTAGTGTGTTTGAAAGCTATTGTGCACATCTTGAACGAGAAGTTGCCTTGGGAGGAGGTTACCAAATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATATGTGGGTTGGATGAAGGCTCCTCACAAGATGATCCTCAAAAGCAAGTGTTGAGGAAGTGATCAGATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATGTATGGGACGGATGGGGATTC
CTCATAAGATGATTCTCGAAAGCAAGAGTTGTCTATGAGATGCAGTTACAGGGGACCGTAGAAGACCTTTGTAGCAGCTGTAAGAATTCATTGAAAAGAACAGTGGAACTCAGCATGTGTCCTTAATATCATCAGTATTGTACCATATCATAATTTCATAATTTCATGCAATCTCCTTTGCACAAAGCCATCATCAGTAT
TAGACTGGTAATATGTATGGAAGAGACAGAGTAAGGCAGGGTTGTACTGTGTGAGAAATTAGCACCTAATCTTTCATTACAGGATGGTTGAATGCAAATCTTTGAGCTACCCTGTTACATATGTGGCTGTATCTGCATTGTGATTTGCAAGATGACGAGCAACTCTGAAGGCTTGTAAGTGATCTCTCGGAAGAGTGGTG
TGACTACTATGTGGGGAGAAGCTGGTAACATCAGCGGACAGAGGCCCCCTTTTTTCATCCTGAAGTCTTTCACTTTGATTTTGCCATCATGATATTTAATTGCTTGTAACTAAATAGAACTGTACAGATTATACAGATTTGGTCCATGCTGATTGTTACGTGCATTGCTACCTATGCTTGCAACTTCAACCATCATGCAT
CGCCAACTTCTTTACCGATATATTTTATTTCTGAGTTGACCCATGCCCTAGCAGCATAAGGCCTAATAGAACTAGCAG
>TRINITY_DN95126_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:CGATGTTTGAATAAAATGGGTAAGTGTAGGGCGGTGGCCGCGTGATAACCGGGACATCAAGATTTGACAAATTTTATGAATTCTTACATCGACTTCGCGAAAATCATAAAGATTTGACCAAATGGTACATCGGCCAGAAGGATTGAAACGGTCGAATTTCTTTCGTTCTTCGAGGCCGGAATTTAACCACGAAAATGCCT
AATTTATTTACCAGTCAAACGCTGAACCTTCACCATTTTCTGTAACCAGTATGTATCTCGGAGCAAAGTAAAATGGCAAGTAAATGCTTCAAAGTACAGGTTCTGGTGGTAATATTCCAACCTTTGACATCCATATACCGTCTCTGCAGACATCTGACGCTGTGGTATCGCCGCGTTGTGGCAGTATATGCTGTCAAAAC
ATTGAATTCCGTCAAAAACATTCGTTCTAATTCGTACTTTTGATGACTTGCAACTATGGTGGTAAATATGCGTATCTCTGGTTAAAAGTAAAAGAATGTGTTCTCTTTACTCGGAAAGCATGTCATTCTGTCGGCAGCAAATTGTGTGGAAGAAATGCATCGACGTCGGAATATCCTTAGGCGGGAAGAAATGCGGTACT
GTTGCAATACGCGTCAGCATTCAACCCAGCGGGCCCCTTCAAGgttcgtatggtagaccttgtctttccgctttttttgcctggtctcttttcacggcatagatggtgcctgaagtcggtggtgcgcttccgttagaattcggtgtgaatttggccggaaacaatgcaggtaggtaggtagggtttgatggcattggcct
gtatttgttttattgttctcactgtatttgttttattgttctcagcagGATCCCTTCCGCGCCAATTGACCTTCTTTTCGCGGATGAACAATCATTACGTTGGCGCAAGAATCTTTTCTTGGTGCTAGAATGTCCGGAAGTACTTTCTACGATTAAGGCTTTTGTGCTTTAAAACCTCTGGTTCGATGTCCATGACATAA
AACTTATTTGCAAGTAAAGATCGTCATTTCTGCAGTTTTTACAAATAAGTTTGGGTATTGGATTAGTTTTGGAGCAACACCAGTTCATCATTTCTGCCTCTTTGTACATGATCCTGTGTTTGGCTTTCATTTGGGGGAAATTAGGCCCATTATTTATGCAAGATAATGCACATGACCCTGGGTTTTGGCTGTTTTCTTGG
GGTTGAATCAGTTTATTGTTCTGTATTTTTCACAACTGACTTTGTGCACCATTCAGCTTAGAGTTGGGACATATTATGTTCCTTGTTTCAGCAAATTTTGTACTTGATTTCCTGCAGCTTTAGATTGCTATGCGTTTTGTGCTTAGTTTCCCTCAGCTCTGCAATCCATGTCAAAATACTGAATGATTAGCCTGCTTTCA
AGAGTAATACTCCCTTGTCTTAATTGGACAGTGATGATGGTGGCAGCCTTTGAAACATAAATTCCTCTCTCTTTGCATACACATGGCTTCTGTCATGAAGCACGTCTCGCCTAGAAGGATTCGGTCTGATATATACTCATTTTCAGCCTCTGATATTAGTTCTGCAGAACCAAGTAGTCCTTGTATCCTTTCAGTTCTCT
CATCCCTTCTTGAGAGGGTTGTGGTTAGGAATGAGAGACAATCAACATCTACAGGTCAGTGCTTATCACCTTCAAGGTTGGGGGTTTTTCATGGCATTCGAATTCCAGACATCAGCATTGAGCAGTATTTGGAGAGGATTTTCAAGTATGTGCACTGTAGTCCCTCTGTTTTTGTAGTTGCATATGCGTATATAGACCGC
TTGATTCAACTCAATTCAGGGTTCCGGATTACTTCTCAGAATGTTCACAGACTTTTGATCACTAGTGTGATGGTTGCTGCCAAGTTTCTTGATGATATGAACTACAACAATGCATATTATGCGAAAGTAGGCGGTCTTTCAACCAGGGATATTAATCATCTTGAAATTGAGTTCTTGTTCATGTTAGACTTTCGTCTGCA
GGTAACTGTTAGTGTGTTTGAAAGCTATTGTGCACATCTTGAACGAGAAGTTGCCTTGGGAGGAGGTTACCAAATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATATGTGGGTTGGATGAAGGCTCCTCACAAGATGATCCTCAAAAGCAAGTGTTGAGGAAGTGATCAGATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATGTATGGGACGGATGGG
GATTCCTCATAAGATGATTCTCGAAAGCAAGAGTTGTCTATGAGATGCAGTTACAGGGGACCGTAGAAGACCTTTGTAGCAGCTGTAAGAATTCATTGAAAAGAACAGTGGAACTCAGCATGTGTCCTTAATATCATCAGTATTGTACCATATCATAATTTCATAATTTCATGCAATCTCCTTTGCACAAAGCCATCATC
AGTATTAGACTGGTAATATGTATGGAAGAGACAGAGTAAGGCAGGGTTGTACTGTGTGAGAAATTAGCACCTAATCTTTCATTACAGGATGGTTGAATGCAAATCTTTGAGCTACCCTGTTACATATGTGGCTGTATCTGCATTGTGATTTGCAAGATGACGAGCAACTCTGAAGGCTTGTAAGTGATCTCTCGGAAGAG
TGGTGTGACTACTATGTGGGGAGAAGCTGGTAACATCAGCGGACAGAGGCCCCCTTTTTTCATCCTGAAGTCTTTCACTTTGATTTTGCCATCATGATATTTAATTGCTTGTAACTAAATAGAACTGTACAGATTATACAGATTTGGTCCATGCTGATTGTTACGTGCATTGCTACCTATGCTTGCAACTTCAACCATCA
TGCATCGCCAACTTCTTTACCGATATATTTTATTTCTGAGTTGACCCATGCCCTAGCAGCATAAGGCCTAATAGAACTAGCAG
Intron 3 GTAGGTAGGT ... TTCTCAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 72.73 | 3 | 4 | 8 |
| A2 | 66.67 | 1 | 0 | 2 |
| A3 | 57.69 | 11 | 2 | 15 |
| A4 | 75 | 2 | 3 | 6 |
| A5 | 63.16 | 7 | 5 | 12 |
| A6 | 55.56 | 4 | 0 | 5 |
| A7 | 50 | 4 | 0 | 4 |
| A8 | 50 | 1 | 0 | 1 |
| A9 | 55.56 | 8 | 3 | 10 |
| A10 | 70 | 3 | 3 | 7 |
>TRINITY_DN38215_c0_g1_i3 from sample A9 / Example spliced isoformGGTCTCTTTTCATGGCATAGATGGTGCCTGAAGTCGGTGGTGCGCTTCCGTTAGAATTCGGTGTGAATTTGGCCGGAAACAATGCAGGATCCCTTCCGCGCCAATTGACCTTCTTTTCGCGGATGAACAATCATTACGTTGGCGCAAGAATCTTTTCTTGGTGCTAGAATGTCCGGAAGTACTTTCTACGATTAAGGCTT
TTGTGCTTTAAAACCTCTGGTTCGATGTCCATGACATAAAACTTATTTGCAAGTAAAGATCGTCATTTCTGCAGTTTTTACAAATAAGTTTGGGTATTGGATTAGTTTTGGAGCAACACCAGTTCATCATTTCTGCCTCTTTGTACATGATCCTGTGTTTGGCTTTCATTTGGGGGAAATTAGGCCCATTATTTATGCAA
GATAATGCACATGACCCTGGGTTTTGGCTGTTTTCTTGGGGTTGAATCAGTTTATTGTTCTGTATTTTTCACAACTGACTTTGTGCACCATTCAGCTTAGAGTTGGGACATATTATGTTCCTTGTTTCAGCAAATTTTGTACTTGATTTCCTGCAGCTTTAGATTGCTATGCGTTTTGTGCTTAGTTTCCCTCAGCTCTG
CAATCCATGTCAAAATACTGAATGATTAGCCTGCTTTCAAGAGTAATACTCCCTTGTCTTAATTGGACAGTGATGATGGTGGCAGCCTTTGAAACATAAATTCCTCTCTCTTTGCATACACATGGCTTCTGTCATGAAGCACGTCTCGCCTAGAAGGATTCGGTCTGATATATACTCATTTTCAGCCTCTGATATTAGTT
CTGCAGAACCAAGTAGTCCTTGTATCCTTTCAGTTCTCTCATCCCTTCTTGAGAGGGTTGTGGTTAGGAATGAGAGACAATCAACATCTACAGGTCAGTGCTTATCACCTTCAAGGTTGGGGGTTTTTCATGGCATTCGAATTCCAGACATCAGCATTGAGCAGTATTTGGAGAGGATTTTCAAGTATGTGCACTGTAGT
CCCTCTGTTTTTGTAGTTGCATATGCGTATATAGACCGCTTGATTCAACTCAATTCAGGGTTCCGGATTACTTCTCAGAATGTTCACAGACTTTTGATCACTAGTGTGATGGTTGCTGCCAAGTTTCTTGATGATATGAACTACAACAATGCATATTATGCGAAAGTAGGCGGTCTTTCAACCAGGGATATTAATCATCT
TGAAATTGAGTTCTTGTTCATGTTAGACTTTCGTCTGCAGGTAACTGTTAGTGTGTTTGAAAGCTATTGTGCACATCTTGAACGAGAAGTTGCCTTGGGAGGAGGTTACCAAATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATATGTGGGTTGGATGAAGGCTCCTCACAAGATGATCCTCAAAAGCAAGTGTTGAGGAAGTGATCAG
ATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATGTATGGGACGGATGGGGATTCCTCATAAGATGATTCTCGAAAGCAAGAGTTGTCTATGAGATGCAGTTACAGGGGACCGTAGAAGACCTTTGTAGCAGCTGTAAGAATTCATTGAAAAGAACAGTGGAACTCAGCATGTGTCCTTAATATCATCAGTATTGTACCATATCATAATTT
CATAATTTCATGCAATCTCCTTTGCACAAAGCCATCATCAGTATTAGACTGGTAATATGTATGGAAGAGACAGAGTAAGGCAGGGTTGTACTGTGTGAGAAATTAGCACCTAATCTTTCATTACAGGATGGTTGAATGCAAATCTTTGAGCTACCCTGTTACATATGTGGCTGTATCTGCATTGTGATTTGCAAGATGAC
GAGCAACTCTGAAGGCTTGTAAGTGATCTCTCGGAAGAGTGGTGTGACTACTATGTGGGGAGAAGCTGGTAACATCAGCGGACAGAGGCCCCCTTTTTTCATCCTGAAGTCTTTCACTTTGATTTTGCCATCATGATATTTAATTGCTTGTAACTAAATAGAACTGTACAGATTATACAGATTTGGTCCATGCTGATTGT
TACGTGCATTGCTACCTATGCTTGCAACTTCAACCATCATGCATCGCCAACTTCTTTACCGATATATTTTATTTCTGAGTTGACCCATGCCCTAGCAGCATAAGGCCTAATAGAACTAGCAGATCATACTGATGTGAGAAACTAGGTTCTGAATCGTCTACAGAACTTGTTTTGTTATAATTCTTATTTCTTTCTGTTCT
TACTATTGAACTGTGGATTGTAAAAGTGATCCCAGGTTAGGTTCTACAGTATCCAGAAGTAATGCTTGCAAGAGGTATAAGAAGTCTGCAACAGTACATGTATCTTGCATTTGTTTTGTGGAGCTGTTCTCAGTGTCTTTGAGTTAGAAATATGAACTGTTTTTGTAGTATTTTTCTGGGTTATCCAGGAATGATTATCA
AGACTATGAATGGCATCTAGTTGTTTGAACTTTGAAGGCAGGTTCATAAAATTCTTGCTGACATGGTGTCTTGTGTTTATGCGAGCAATGGGA
>TRINITY_DN38215_c0_g1_i7 from sample A9 / Example unspliced isoform:GGTCTCTTTTCATGGCATAGATGGTGCCTGAAGTCGGTGGTGCGCTTCCGTTAGAATTCGGTGTGAATTTGGCCGGAAACAATGCAGgtaggtaggtagggtttgatggcattggcctgtatttgttttattgttctcactgtatttgttttattgttctcagcagGATCCCTTCCGCGCCAATTGACCTTCTTTTCGCG
GATGAACAATCATTACGTTGGCGCAAGAATCTTTTCTTGGTGCTAGAATGTCCGGAAGTACTTTCTACGATTAAGGCTTTTGTGCTTTAAAACCTCTGGTTCGATGTCCATGACATAAAACTTATTTGCAAGTAAAGATCGTCATTTCTGCAGTTTTTACAAATAAGTTTGGGTATTGGATTAGTTTTGGAGCAACACCA
GTTCATCATTTCTGCCTCTTTGTACATGATCCTGTGTTTGGCTTTCATTTGGGGGAAATTAGGCCCATTATTTATGCAAGATAATGCACATGACCCTGGGTTTTGGCTGTTTTCTTGGGGTTGAATCAGTTTATTGTTCTGTATTTTTCACAACTGACTTTGTGCACCATTCAGCTTAGAGTTGGGACATATTATGTTCC
TTGTTTCAGCAAATTTTGTACTTGATTTCCTGCAGCTTTAGATTGCTATGCGTTTTGTGCTTAGTTTCCCTCAGCTCTGCAATCCATGTCAAAATACTGAATGATTAGCCTGCTTTCAAGAGTAATACTCCCTTGTCTTAATTGGACAGTGATGATGGTGGCAGCCTTTGAAACATAAATTCCTCTCTCTTTGCATACAC
ATGGCTTCTGTCATGAAGCACGTCTCGCCTAGAAGGATTCGGTCTGATATATACTCATTTTCAGCCTCTGATATTAGTTCTGCAGAACCAAGTAGTCCTTGTATCCTTTCAGTTCTCTCATCCCTTCTTGAGAGGGTTGTGGTTAGGAATGAGAGACAATCAACATCTACAGGTCAGTGCTTATCACCTTCAAGGTTGGG
GGTTTTTCATGGCATTCGAATTCCAGACATCAGCATTGAGCAGTATTTGGAGAGGATTTTCAAGTATGTGCACTGTAGTCCCTCTGTTTTTGTAGTTGCATATGCGTATATAGACCGCTTGATTCAACTCAATTCAGGGTTCCGGATTACTTCTCAGAATGTTCACAGACTTTTGATCACTAGTGTGATGGTTGCTGCCA
AGTTTCTTGATGATATGAACTACAACAATGCATATTATGCGAAAGTAGGCGGTCTTTCAACCAGGGATATTAATCATCTTGAAATTGAGTTCTTGTTCATGTTAGACTTTCGTCTGCAGGTAACTGTTAGTGTGTTTGAAAGCTATTGTGCACATCTTGAACGAGAAGTTGCCTTGGGAGGAGGTTACCAAATTGAGAGA
GCTCTTCGATTCATATGTGGGTTGGATGAAGGCTCCTCACAAGATGATCCTCAAAAGCAAGTGTTGAGGAAGTGATCAGATTGAGAGAGCTCTTCGATTCATGTATGGGACGGATGGGGATTCCTCATAAGATGATTCTCGAAAGCAAGAGTTGTCTATGAGATGCAGTTACAGGGGACCGTAGAAGACCTTTGTAGCAG
CTGTAAGAATTCATTGAAAAGAACAGTGGAACTCAGCATGTGTCCTTAATATCATCAGTATTGTACCATATCATAATTTCATAATTTCATGCAATCTCCTTTGCACAAAGCCATCATCAGTATTAGACTGGTAATATGTATGGAAGAGACAGAGTAAGGCAGGGTTGTACTGTGTGAGAAATTAGCACCTAATCTTTCAT
TACAGGATGGTTGAATGCAAATCTTTGAGCTACCCTGTTACATATGTGGCTGTATCTGCATTGTGATTTGCAAGATGACGAGCAACTCTGAAGGCTTGTAAGTGATCTCTCGGAAGAGTGGTGTGACTACTATGTGGGGAGAAGCTGGTAACATCAGCGGACAGAGGCCCCCTTTTTTCATCCTGAAGTCTTTCACTTTG
ATTTTGCCATCATGATATTTAATTGCTTGTAACTAAATAGAACTGTACAGATTATACAGATTTGGTCCATGCTGATTGTTACGTGCATTGCTACCTATGCTTGCAACTTCAACCATCATGCATCGCCAACTTCTTTACCGATATATTTTATTTCTGAGTTGACCCATGCCCTAGCAGCATAAGGCCTAATAGAACTAGCA
GATCATACTGATGTGAGAAACTAGGTTCTGAATCGTCTACAGAACTTGTTTTGTTATAATTCTTATTTCTTTCTGTTCTTACTATTGAACTGTGGATTGTAAAAGTGATCCCAGGTTAGGTTCTACAGTATCCAGAAGTAATGCTTGCAAGAGGTATAAGAAGTCTGCAACAGTACATGTATCTTGCATTTGTTTTGTGG
AGCTGTTCTCAGTGTCTTTGAGTTAGAAATATGAACTGTTTTTGTAGTATTTTTCTGGGTTATCCAGGAATGATTATCAAGACTATGAATGGCATCTAGTTGTTTGAACTTTGAAGGCAGGTTCATAAAATTCTTGCTGACATGGTGTCTTGTGTTTATGCGAGCAATGGGA