sp|P52783|GLNA_PINSY ----> Glutamine synthetase cytosolic isozyme
Intron 1 GTACTCGCTG ... CTAAATGGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 65.22 | 8 | 18 | 12 |
| A2 | 89.74 | 2 | 31 | 4 |
| A3 | 52.78 | 17 | 20 | 18 |
| A4 | 51.52 | 8 | 4 | 13 |
| A5 | 52.38 | 5 | 5 | 6 |
| A6 | 57.02 | 26 | 26 | 43 |
| A7 | 57.63 | 25 | 28 | 40 |
| A8 | 69.05 | 13 | 32 | 26 |
| A9 | 59.72 | 29 | 42 | 44 |
| A10 | 64.1 | 14 | 23 | 27 |
>TRINITY_DN42145_c0_g3_i7 from sample A9 / Example spliced isoformGCACAACTTCACATCAACCGTCACAATTCTTTGCCACTAGTTGTGAATGTATGATGGATTGGGCGGATTGGACACCTTGGAATTAATACAGGCAGCAAATATTCTTCCCCGATTTGCATTACTAGTTTCATGCAGAGTCAGGGAATGGCCAGTTTGAAATAGCCTTGGGGCATTCACCTTGTATGGAGGCAGCTGATAAC
TTAGTTTGCTTAAAAGAGGCTATAAGGGCAATTGCAAACAGAAATGGTCTTCTTGCGACGTTTATACCCAAGTATATTTCAACTGATATTGGTTCAGGATGCCATGTACATCTAAGTTTATGGCAAAATGGCAAGAACAAGTTCATGGCTGAAGATGGGTCAATTAGTAAGCATGGTATGTCCACGATTGGGGAGGAGTT
TATGGCTGGTGTCTTCCACCATCTTCCATCCATATTGGCCTTTACTGCTCCATTGCCAAACAGTTATGAGCGATTGAAGCCTAATACATGGAGTGGAGCATATCATTGTTGGGGGAAGGAAAATCGAGAAGCTCCGATCCGGACAGCATGCCCTCCTGGGATTTCAAGTGAAGTTGTGAGCAACTTTGAGATTAAAGCAT
TTGATGGTTGTGCCAATCCACATCTGGGACTAGCAGCAATTATAGCTGCCGGAATAGATGGCCTGCGGAAGCACCTTGTTTTGCCAGAACCTGTTGACTCAAATCCATATGATCTCAAGGAAGGTGCAGTGCACAGATTGCCCACATCATTGGACGAGTCTGTTACAGAACTCAGAAATAATGAAGTTTTGAGGAGCTTT
ATTGGTGATAAACTCATGAATGCAATAATTGCTGTCCGCGAGGCTGAAGTTCGACATTATTCAGTTAACAAAGATGTTATGGAGCAATTGATCCATACGTATTGACATCAAAATTTATGACAAGACAATGGCATGTCACAATAACTTATTCGATGTTATTTGACAAAATGTCTGGGATTTTCATTTTGTAACAATTTTGA
AGACGTCAAGTGGATATCTTTCTTGAATCACATCAATAATGAGCTTGTTAACAAGGAATATTTAGTGGTTAATTAGCGGTCCATGGACGATGCATATAATTATACTTTAAAAATATTGCAAATTAAAGAGCACGGGTATATTTGTCAAAACCTACTCATAGCCTTAACCAAAAAAGGATTTCATGTAGTAAATATTTGTT
ATATTATTCGATCATTAAAGTTCTCATATTTAAACTTTATTAACATTGTAAGTTTCCTGTTCTTCTTGGAAAAAAGTTTCCTGTGTAAATAGAATTTTATCTTTATAGAAGTTATTATTTGTAATTAACAAAATTTGTGGGCAACTTGTAACCAAAATAAATGATTAATCTTGCAAGTAATACAAGTTAAGTGTAAGCAT
CATAACATAGCTCGGGGATGGCTATTCC
>TRINITY_DN42145_c0_g3_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:GCACAACTTCACATCAACCGTCACAATTCTTTGCCACTAGTTGTGAATGTATGATGGATTGGGCGGATTGGACACCTTGGAATTAATACAGGCAGCAAATATTCTTCCCCGATTTGCATTACTAGgtactcgctgtttgaagtaaactttcaacagattcgtcctcccgtgaatctttctcaagtgattgtctacagggt
tttagcaacctttcggttttggtgtaatctcaattgtataaccgctcgatcagtggctgggacagtggcaactagacagaaaacgaatgatggttgatgacttattccaattctttgctagcgacccgtctgaccactgaggaataataacgttttcctgaaaaaccctgacgcgactccgatttattcgtcaggcggat
tgacgtcgaggcaatctaattaaaatctctaattcccttcgaatgaatttctgccaccgtggacagaaaaatttcgttctaaatggagTTTCATGCAGAGTCAGGGAATGGCCAGTTTGAAATAGCCTTGGGGCATTCACCTTGTATGGAGGCAGCTGATAACTTAGTTTGCTTAAAAGAGGCTATAAGGGCAATTGCAA
ACAGAAATGGTCTTCTTGCGACGTTTATACCCAAGTATATTTCAACTGATATTGGTTCAGGATGCCATGTACATCTAAGTTTATGGCAAAATGGCAAGAACAAGTTCATGGCTGAAGATGGGTCAATTAGTAAGCATGGTATGTCCACGATTGGGGAGGAGTTTATGGCTGGTGTCTTCCACCATCTTCCATCCATATTG
GCCTTTACTGCTCCATTGCCAAACAGTTATGAGCGATTGAAGCCTAATACATGGAGTGGAGCATATCATTGTTGGGGGAAGGAAAATCGAGAAGCTCCGATCCGGACAGCATGCCCTCCTGGGATTTCAAGTGAAGTTGTGAGCAACTTTGAGATTAAAGCATTTGATGGTTGTGCCAATCCACATCTGGGACTAGCAGC
AATTATAGCTGCCGGAATAGATGGCCTGCGGAAGCACCTTGTTTTGCCAGAACCTGTTGACTCAAATCCATATGATCTCAAGGAAGGTGCAGTGCACAGATTGCCCACATCATTGGACGAGTCTGTTACAGAACTCAGAAATAATGAAGTTTTGAGGAGCTTTATTGGTGATAAACTCATGAATGCAATAATTGCTGTCC
GCGAGGCTGAAGTTCGACATTATTCAGTTAACAAAGATGTTATGGAGCAATTGATCCATACGTATTGACATCAAAATTTATGACAAGACAATGGCATGTCACAATAACTTATTCGATGTTATTTGACAAAATGTCTGGGATTTTCATTTTGTAACAATTTTGAAGACGTCAAGTGGATATCTTTCTTGAATCACATCAAT
AATGAGCTTGTTAACAAGGAATATTTAGTGGTTAATTAGCGGTCCATGGACGATGCATATAATTATACTTTAAAAATATTGCAAATTAAAGAGCACGGGTATATTTGTCAAAACCTACTCATAGCCTTAACCAAAAAAGGATTTCATGTAGTAAATATTTGTTATATTATTCGATCATTAAAGTTCTCATATTTAAACTT
TATTAACATTGTAAGTTTCCTGTTCTTCTTGGAAAAAAGTTTCCTGTGTAAATAGAATTTTATCTTTATAGAAGTTATTATTTGTAATTAACAAAATTTGTGGGCAACTTGTAACCAAAATAAATGATTAATCTTGCAAGTAATACAAGTTAAGTGTAAGCATCATAACATAGCTCGGGGATGGCTATTCC
Intron 2 GTACTCGCTG ... TTTGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 67.35 | 8 | 18 | 15 |
| A2 | 90.48 | 2 | 31 | 7 |
| A3 | 54.67 | 17 | 20 | 21 |
| A4 | 40.74 | 8 | 4 | 7 |
| A5 | 65.52 | 5 | 5 | 14 |
| A6 | 53.98 | 26 | 26 | 35 |
| A7 | 57.98 | 25 | 28 | 41 |
| A8 | 67.9 | 13 | 32 | 23 |
| A9 | 56.72 | 29 | 42 | 34 |
| A10 | 62.67 | 14 | 23 | 24 |
>TRINITY_DN42145_c0_g3_i7 from sample A9 / Example spliced isoformGCACAACTTCACATCAACCGTCACAATTCTTTGCCACTAGTTGTGAATGTATGATGGATTGGGCGGATTGGACACCTTGGAATTAATACAGGCAGCAAATATTCTTCCCCGATTTGCATTACTAGTTTCATGCAGAGTCAGGGAATGGCCAGTTTGAAATAGCCTTGGGGCATTCACCTTGTATGGAGGCAGCTGATAAC
TTAGTTTGCTTAAAAGAGGCTATAAGGGCAATTGCAAACAGAAATGGTCTTCTTGCGACGTTTATACCCAAGTATATTTCAACTGATATTGGTTCAGGATGCCATGTACATCTAAGTTTATGGCAAAATGGCAAGAACAAGTTCATGGCTGAAGATGGGTCAATTAGTAAGCATGGTATGTCCACGATTGGGGAGGAGTT
TATGGCTGGTGTCTTCCACCATCTTCCATCCATATTGGCCTTTACTGCTCCATTGCCAAACAGTTATGAGCGATTGAAGCCTAATACATGGAGTGGAGCATATCATTGTTGGGGGAAGGAAAATCGAGAAGCTCCGATCCGGACAGCATGCCCTCCTGGGATTTCAAGTGAAGTTGTGAGCAACTTTGAGATTAAAGCAT
TTGATGGTTGTGCCAATCCACATCTGGGACTAGCAGCAATTATAGCTGCCGGAATAGATGGCCTGCGGAAGCACCTTGTTTTGCCAGAACCTGTTGACTCAAATCCATATGATCTCAAGGAAGGTGCAGTGCACAGATTGCCCACATCATTGGACGAGTCTGTTACAGAACTCAGAAATAATGAAGTTTTGAGGAGCTTT
ATTGGTGATAAACTCATGAATGCAATAATTGCTGTCCGCGAGGCTGAAGTTCGACATTATTCAGTTAACAAAGATGTTATGGAGCAATTGATCCATACGTATTGACATCAAAATTTATGACAAGACAATGGCATGTCACAATAACTTATTCGATGTTATTTGACAAAATGTCTGGGATTTTCATTTTGTAACAATTTTGA
AGACGTCAAGTGGATATCTTTCTTGAATCACATCAATAATGAGCTTGTTAACAAGGAATATTTAGTGGTTAATTAGCGGTCCATGGACGATGCATATAATTATACTTTAAAAATATTGCAAATTAAAGAGCACGGGTATATTTGTCAAAACCTACTCATAGCCTTAACCAAAAAAGGATTTCATGTAGTAAATATTTGTT
ATATTATTCGATCATTAAAGTTCTCATATTTAAACTTTATTAACATTGTAAGTTTCCTGTTCTTCTTGGAAAAAAGTTTCCTGTGTAAATAGAATTTTATCTTTATAGAAGTTATTATTTGTAATTAACAAAATTTGTGGGCAACTTGTAACCAAAATAAATGATTAATCTTGCAAGTAATACAAGTTAAGTGTAAGCAT
CATAACATAGCTCGGGGATGGCTATTCC
>TRINITY_DN42145_c0_g3_i9 from sample A9 / Example unspliced isoform:GCACAACTTCACATCAACCGTCACAATTCTTTGCCACTAGTTGTGAATGTATGATGGATTGGGCGGATTGGACACCTTGGAATTAATACAGGCAGCAAATATTCTTCCCCGATTTGCATTACTAGgtactcgctgtttgaagtaaactttcaacagattcgtcctcccgtgaatctttctcaagtgattgtctacagggt
tttagcaacctttcggttttggtgtaatctcaattgtataaccgctcgatcagtggctgggacagtggcaactagacagaaaacgaatgatggttgatgacttattccaattctttgctagcgacccgtctgaccactgaggaataataacgttttcctgaaaaaccctgacgcgactccgatttattcgtcaggcggat
tgacgtcgaggcaatctaattaaaatctctaattcccttcgaatgaatttctgccaccgtggacagaaaaatttcgttctaaatggagatgagtgtgctctaaattttttagatttttattaacattttataacgagtgtatttgcatcataccaagtgctccgtggtgaagttattgagagaagcctcttttcttaatt
ctttcagtttaaaattgtttaatattcagttctggtagtcggttggcaaaatgatttaatccgtatgctctatatgctagttaagaagtttgttttggtctacatataaattggtcgcatattttttgttgcagTTTCATGCAGAGTCAGGGAATGGCCAGTTTGAAATAGCCTTGGGGCATTCACCTTGTATGGAGGCA
GCTGATAACTTAGTTTGCTTAAAAGAGGCTATAAGGGCAATTGCAAACAGAAATGGTCTTCTTGCGACGTTTATACCCAAGTATATTTCAACTGATATTGGTTCAGGATGCCATGTACATCTAAGTTTATGGCAAAATGGCAAGAACAAGTTCATGGCTGAAGATGGGTCAATTAGTAAGCATGGTATGTCCACGATTGG
GGAGGAGTTTATGGCTGGTGTCTTCCACCATCTTCCATCCATATTGGCCTTTACTGCTCCATTGCCAAACAGTTATGAGCGATTGAAGCCTAATACATGGAGTGGAGCATATCATTGTTGGGGGAAGGAAAATCGAGAAGCTCCGATCCGGACAGCATGCCCTCCTGGGATTTCAAGTGAAGTTGTGAGCAACTTTGAGA
TTAAAGCATTTGATGGTTGTGCCAATCCACATCTGGGACTAGCAGCAATTATAGCTGCCGGAATAGATGGCCTGCGGAAGCACCTTGTTTTGCCAGAACCTGTTGACTCAAATCCATATGATCTCAAGGAAGGTGCAGTGCACAGATTGCCCACATCATTGGACGAGTCTGTTACAGAACTCAGAAATAATGAAGTTTTG
AGGAGCTTTATTGGTGATAAACTCATGAATGCAATAATTGCTGTCCGCGAGGCTGAAGTTCGACATTATTCAGTTAACAAAGATGTTATGGAGCAATTGATCCATACGTATTGACATCAAAATTTATGACAAGACAATGGCATGTCACAATAACTTATTCGATGTTATTTGACAAAATGTCTGGGATTTTCATTTTGTAA
CAATTTTGAAGACGTCAAGTGGATATCTTTCTTGAATCACATCAATAATGAGCTTGTTAACAAGGAATATTTAGTGGTTAATTAGCGGTCCATGGACGATGCATATAATTATACTTTAAAAATATTGCAAATTAAAGAGCACGGGTATATTTGTCAAAACCTACTCATAGCCTTAACCAAAAAAGGATTTCATGTAGTAA
ATATTTGTTATATTATTCGATCATTAAAGTTCTCATATTTAAACTTTATTAACATTGTAAGTTTCCTGTTCTTCTTGGAAAAAAGTTTCCTGTGTAAATAGAATTTTATCTTTATAGAAGTTATTATTTGTAATTAACAAAATTTGTGGGCAACTTGTAACCAAAATAAATGATTAATCTTGCAAGTAATACAAGTTAAG
TGTAAGCATCATAACATAGCTCGGGGATGGCTATTCC
Intron 3 GTATTAGAAC ... CATTGTATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 35.48 | 10 | 8 | 3 |
| A2 | 26.98 | 23 | 4 | 13 |
| A3 | 19.15 | 19 | 7 | 2 |
| A4 | 35 | 13 | 4 | 10 |
| A5 | 14.29 | 6 | 1 | 1 |
| A6 | 33.33 | 2 | 2 | 0 |
| A7 | 9.8 | 23 | 2 | 3 |
| A8 | 16.13 | 13 | 4 | 1 |
| A9 | 24.24 | 25 | 10 | 6 |
| A10 | 22.58 | 12 | 6 | 1 |
>TRINITY_DN117392_c0_g2_i7 from sample A1 / Example spliced isoformAGAAACTCAGTTTGAAAAATAGTAAAACAATTGCTTCCCTAAGAGAAATCTATATAATAATAATAATAATTATAAACGGTAAAGTCATGAACCACGCGATGAAGATAATTCTCTACAGTAAACAGAAAAGTCATAAGTCGCGGCCTGCCAATTGTGACCGGGTCCATGTACTATATATTTAACTTGTGGCCATGAAACAA
CCGCAGGGGAGGAGCCACTGTGTGTCAGAGGTGAGAGAGAAAGCAGACCAGTCCGTGCAAAATGGCGACGACAACTACTACGGAGACGATGTTAAGTGAGGTGGTGGACAGAATATCGATGATAGACGCTCATGCCCACAACATTGTGTCCCTTGATTCTCAATTTCCTTTTCTGCGCTGCTTCTCAGAGGCCGAAGGTG
AAGCTGCCAAGGATGTCTGCCATACCCTATCCTTTAAGAGAAGTATACGGGACATTGCAAAGCTTTACAATTGTGATGCGACATTAGAGGGGATTGAGGTGTGCCGCAATTCTTTGGGTCTAGAGAGTATTTGCTTAAAGTGTTTCAGTGCTGCCAATATTTCTACAGTGCTCATCGATGATGGAATCCACTTTGATAAA
ATGTATCCTGTGGGCTGGCATAAGAACTATGTGCCAGCTGTGGGTAGGATTTTAAGGATTGAGACTGTTGCTGAAGCGATTCTTAATCAGGGTCCACCCGATGGCACAACATGGTCACTAGAGAGGTTTATTCAGCTCTTTCAGTCGACATTGAAATCACATGCCAAGGGTGTTGTTGCTTTTAAGAGTATAGCTGCCTA
TCGCAGTGGTCTTAATATAAATCCATTGGTGAAAAGTCAAGAGGCAGAAGATGGTCTTTACAAAGATTTATGCGCCAGGAAGCCTGTACGCATCAGTAACAAAAGCTTCATTGACTACATCTTTACGGTCAGCTTGGAAGTGGCTGCATCTTTTGATTGTCCCATGCAAATACATACAGGTTTTGGAGACAAGGACCTGG
ATCTGAGGCTTGCAAACCCTCTTCATCTTCGGGCAATCTTGGAAGATGATCGGTTCAAAAATTGTCGGATTGTGCTTCTTCATGCGTCCCATCCCTACTCAAAGGAAGCATCTTATTTGGCTTCTGTTTATCCACAGGTCTACTTGGACTTTGGCCTAGCAGTACCAAAGCTCAGTGTTCATGGGATGCTCTCTGCAGTT
AAGGGTCTTTTAGAACTGTGCCCACTAAACAAGGTGATGTTTAGCACAGATGGATATGCATTTCCTGAAACATATTATCTTGGTGCAAAATGGGCACGCAAAGTAATTGTATCTGTTCTTTCTGATGCTTGTGATGGTGGGGATCTCTCTATTCAAGAAGCTATCGAAGCCGCACAAAATATCCTAAGGGACAATGCAGT
CAGTTTCTATAAGCTGGATGAATATAGTACACAAAATATGATATCTGAAGTGGGTACGTCAGCCACTAATTCTCAGATTCTGGATCTAGAGGCTAACAAAGGAAAACCTAAGTTTGTTCGTCTCCTTTGGGTTGATAATTCAGGTCAACAAAGATGTCGAGTTGTTCCAGAAAACCGTTTCAACCAAGTAGTGAAGGATC
ATGGAGTGGGTTTAACGCATGCATGCATGGGTATGCCCTCATTCTCAGATGGTCCAGCTGAAGGTTCCAATCTTACAGGTGTTGGTGAAATCCGACTGATGCCTGACATGAAAACACTACGCAGTTTGCCCTGGTCTGACCAAGAGAAGATGGTATTCGTTGATATGCACTTGAAACCTAGCCATCCTTGGGAATATTGC
CCAAGGACAGCCTTACGAAGAGTTGCTATGACATTGGAAGAAGAATTTGGTTTGGTTGTGAATGCTGGTTTTGAGAGTGAGTTCTACATTTTGAGGCAAACAATGAGGGAAGGTAATAACAAGTGGGTGCCCATTGATTTCACACCATACTGCTCAACTTCAGGATTTGATGCTGCAACTCCTCTTCTATTAGAAGTTAT
TGAAGTTCTCCAGAGCATGCACATTTCTGTAGAACAGTTTCATGCAGAGTCAGGGAATGGCCAGTTTGAAATAGCCTTGGGGCATTCACCTTGTATGGAGGCAGCTGATAACTTAGTTTGCTTAAAAGAGGCTATAAGGGCAATTGCAAACAGAAATGGTCTTCTTGCGACGTTTATACCCAAGTATATTTCAACTGATA
TTGGTTCAGGATGCCATGTACATCTAAGTTTATGGCAAAATGGCAAGAACAAGTTCATGGCTGAAGATGGGTCAATTAGTAAGCATGGTATGTCCACGATTGGGGAGGAGTTTATGGCTGGTGTCTTCCACCATCTTCCATCCATATTGGCCTTTACTGCTCCATTGCCAAACAGTTATGAGCGATTGAAGCCTAATACA
TGGAGTGGAGCATATCATTGTTGGGGGAAGGAAAATCGAGAAGCTCCGATCCGGACAGCATGCCCTCCTGGGATTTCAAGTGAAGTTGTGAGCAACTTTGAGATTAAAGCATTTGATGGTTGTGCCAATCCACATCTGGGACTAGCAGCAATTATAGCTGCCGGAATAGATGGCCTGCGGAAGCACCTTGTTTTGCCAGA
ACCTGTTGACTCAAATCCATATGATCTCAAGGAAGGTGCAGTGCACAGATTGCCCACATCATTGGACGAGTCTGTTACAGAACTCAGAAATAATGAAGTTTTGAGGAGCTTTATTGGTGATAAACTCATGAATGCAATAATTGCTGTCCGCGAGGCTGAAGTTCGACATTATTCAGTTAACAAAGATGTTATGGAGCAAT
TGATCCATACGTATTGACATCAAAATTTATGACAAGACAATGGCATGTCACAATAACTTATTCGATGTTATTTGACAAAATGTCTGGGATTTTCATTTTGTAACAATTTTGAAGACGTCAAGTGGATATCTTTCTTGAATCACATCAATAATGAGCTTGTTAACAAGGAATATTTAGTGGTTAATTAGCGGTCCATGGAC
GATGCATATAATTATACTTTAAAAATATTGCAAATTAAAGAGCACGGGTATATTTGTCAAAACCTACTCATAGCCTTAACCAAAAAAGGATTTCATGTAGTAAATATTTGTTATATTATTCGATCATTAAAGTTCTCATATTTAAACTTTAT
>TRINITY_DN117392_c0_g2_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:AGAAACTCAGTTTGAAAAATAGTAAAACAATTGCTTCCCTAAGAGAAATCTATATAATAATAATAATAATTATAAACGGTAAAGTCATGAACCACGCGATGAAGATAATTCTCTACAGTAAACAGAAAAGTCATAAGTCGCGGCCTGCCAATTGTGACCGGGTCCATGTACTATATATTTAACTTGTGGCCATGAAACAA
CCGCAGGGGAGGAGCCACTGTGTGTCAGAGGTGAGAGAGAAAGCAGACCAGTCCGTGCAAAATGGCGACGACAACTACTACGGAGACGATGTTAAGTGAGGTGGTGGACAGAATATCGATGATAGACGCTCATGCCCACAACATTGTGTCCCTTGATTCTCAATTTCCTTTTCTGCGCTGCTTCTCAGAGGCCGAAGGTG
AAGCTGCCAAGGATGTCTGCCATACCCTATCCTTTAAGAGAAGTATACGGGACATTGCAAAGCTTTACAATTGTGATGCGACATTAGAGGGGATTGAGGTGTGCCGCAATTCTTTGGGTCTAGAGAGTATTTGCTTAAAGTGTTTCAGTGCTGCCAATATTTCTACAGTGCTCATCGATGATGGAATCCACTTTGATAAA
ATGTATCCTGTGGGCTGGCATAAGAACTATGTGCCAGCTGTGGGTAGGATTTTAAGGATTGAGACTGTTGCTGAAGCGATTCTTAATCAGGGTCCACCCGATGGCACAACATGGTCACTAGAGAGGTTTATTCAGCTCTTTCAGTCGACATTGAAATCACATGCCAAGGGTGTTGTTGCTTTTAAGAGTATAGCTGCCTA
TCGCAGTGGTCTTAATATAAATCCATTGGTGAAAAGTCAAGAGGCAGAAGATGGTCTTTACAAAGATTTATGCGCCAGGAAGCCTGTACGCATCAGTAACAAAAGCTTCATTGACTACATCTTTACGGTCAGCTTGGAAGTGGCTGCATCTTTTGATTGTCCCATGCAAATACATACAGGTTTTGGAGACAAGGACCTGG
ATCTGAGGCTTGCAAACCCTCTTCATCTTCGGGCAATCTTGGAAGATGATCGGTTCAAAAATTGTCGGATTGTGCTTCTTCATGCGTCCCATCCCTACTCAAAGGAAGCATCTTATTTGGCTTCTGTTTATCCACAGGTCTACTTGGACTTTGGCCTAGCAGTACCAAAGCTCAGTGTTCATGGGATGCTCTCTGCAGTT
AAGGGTCTTTTAGAACTGTGCCCACTAAACAAGGTGATGTTTAGCACAGATGGATATGCATTTCCTGAAACATATTATCTTGGTGCAAAATGGGCACGCAAAGTAATTGTATCTGTTCTTTCTGATGCTTGTGATGGTGGGGATCTCTCTATTCAAGAAGCTATCGAAGCCGCACAAAATATCCTAAGGGACAATGCAGT
CAGTTTCTATAAGCTGGATGAATATAGTACACAAAATATGATATCTGAAGTGGGTACGTCAGCCACTAATTCTCAGATTCTGGATCTAGAGGCTAACAAAGGAAAACCTAAGTTTGTTCGTCTCCTTTGGGTTGATAATTCAGGTCAACAAAGATGTCGAGTTGTTCCAGAAAACCGTTTCAACCAAGTAGTGAAGGATC
ATGGAGTGGGTTTAACGCATGCATGCATGGGTATGCCCTCATTCTCAGATGGTCCAGCTGAAGGTTCCAATCTTACAGGTGTTGGTGAAATCCGACTGATGCCTGACATGAAAACACTACGCAGTTTGCCCTGGTCTGACCAAGAGAAGATGGTATTCGTTGATATGCACTTGAAACCTAGCCATCCTTGGGAATATTGC
CCAAGGACAGCCTTACGAAGAGTTGCTATGACATTGGAAGAAGAATTTGGTTTGgtattagaacttgatctccttaatgtggacaaacaaatcatcacttgttattattcttgatttgtagaaatagttaagttttgctatgtggctacatttaaccaaagagtgatttgtgacctcaaatattttcattgtatagGTTG
TGAATGCTGGTTTTGAGAGTGAGTTCTACATTTTGAGGCAAACAATGAGGGAAGGTAATAACAAGTGGGTGCCCATTGATTTCACACCATACTGCTCAACTTCAGGATTTGATGCTGCAA
Intron 4 GTAAGGCTCA ... TATGTCTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25 | 27 | 0 | 9 |
| A2 | 9.52 | 19 | 4 | 2 |
| A3 | 8.33 | 11 | 0 | 1 |
| A4 | 31.58 | 13 | 4 | 6 |
| A5 | 20 | 4 | 0 | 1 |
| A6 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A7 | 0 | 8 | 0 | 0 |
| A8 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A9 | 41.67 | 7 | 0 | 5 |
| A10 | 25 | 3 | 0 | 1 |
>TRINITY_DN99287_c1_g2_i8 from sample A4 / Example spliced isoformCATGAACCACGCGATGAAGATAATTCTCTACAGTAAACAGAAAAGTCATAAGTCGCGGCCTGCCAATTGTGACCGGGTCCATGTACTATATATTTAACTTGTGGCCATGAAACAACCGCAGGGGAGGAGCCACTGTGTGTCAGAGGTGAGAGAGAAAGCAGACCAGTCCGTGCAAAATGGCGACGACAACTACTACTGAG
ACGATGTTAAGTGAGGTGGTGGACAGAATATCGATGATAGACGCTCATGCCCACAACATTGTGTCCCTTGATTCTCAATTTCCTTTTCTGCGCTGCTTCTCAGAGGCCGAAGGTGAAGCTGCCAAGGATGTCTGCCATACCCTATCCTTTAAGAGAAGTATACGGGACATTGCAAAGCTTTACAATTGTGATGCGACATT
AGAGGGGATTGAGGTGTGCCGCAATTCTTTGGGTCTAGAGAGTATTTGCTTAAAGTGTTTCAGTGCTGCCAATATTTCTACAGTGCTCATCGATGATGGAATCCACTTTGATAAAATGTATCCTGTGGGCTGGCATAAGAACTATGTGCCAGCTGTGGGTAGGATTTTAAGGATTGAGACTGTTGCTGAAGCGATTCTTA
ATCAGGGTCCACCCGATGGCACAACATGGTCACTAGAGAGGTTTATTCAGCTCTTTCAGTCGACATTGAAATCACATGCCAAGGGTGTTGTTGCTTTTAAGAGTATAGCTGCCTATCGCAGTGGTCTTAATATAAATCCATTGGTGAAAAGTCAAGAGGCAGAAGATGGTCTTTACAAAGATTTATGCGCCAGGAAGCCT
GTACGCATCAGTAACAAAAGCTTCATTGACTACATCTTTACGGTCAGCTTGGAAGTGGCTGCATCTTTTGATTGTCCCATGCAAATACATACAGGTTTTGGAGACAAGGACCTGGATCTGAGGCTTGCAAACCCTCTTCATCTTCGGGCAATCTTGGAAGATGATCGGTTCAAAAATTGTCGGATTGTGCTTCTTCATGC
GTCCCATCCCTACTCAAAGGAAGCATCTTATTTGGCTTCTGTTTATCCACAGGTCTACTTGGACTTTGGCCTAGCAGTACCAAAGCTCAGTGTTCATGGGATGCTCTCTGCAGTTAAGGGTCTTTTAGAACTGTGCCCACTAAACAAGGTGATGTTTAGCACAGATGGATATGCATTTCCTGAAACATATTATCTTGGTG
CAAAATGGGCACGCAAAGTAATTGTATCTGTTCTTTCTGATGCTTGTGATGGTGGGGATCTCTCTATTCAAGAAGCTATCGAAGCCGCACAAAATATCCTAAGGGACAATGCAGTCAGTTTCTATAAGCTGGATGAATATAGTACACAAAATATGATATCTGAAGTGGGTACGTCAGCCACTAATTCTCAGATTCTGGAT
CTAGAGGCTAACAAAGGAAAACCTAAGTTTGTTCGTCTCCTTTGGGTTGATAATTCAGGTCAACAAAGATGTCGAGTTGTTCCAGAAAACCGTTTC
>TRINITY_DN99287_c1_g2_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:CATGCCAAGGGTGTTGTTGCTTTTAAGAGTATAGCTGCCTATCGCAGTGGTCTTAATATAAATCCATTGGTGAAAAGTCAAGAGGCAGAAGATGGTCTTTACAAAGATTTATGCGgtaaggctcaatggtgcatttattccttcaattggtgtctagactaaaccattttatgataatgagtgttttaacattattttgt
taagttgattttaatagtaactgatatgttaagtttattttagtagtaactgatggttttgtatttacaagttatgtctcagCCAGGAAGCCTGTACGCATCAGTAACAAAAGCTTCATTGACTACATCTTTACGGTCAGCTTGGAAGTGGCTGCATCTTTTGATTGTCCCATGCAAATACATACAGGTTTTGGAGACAA
GGACCTGGATCTGAGGCTTGCAAACCCTCTTCATCTTCGGGCAATCTTGGAAGATGATCGGTTCAAAAATTGTCGGATTGTGCTTCTTCATGCGTCCCATCCCTACTCAAAGGAAGCATCTTATTTGGCTTCTGTTTATCCACAGGTGCATTGTCATACTGCCTAGTATATGCCACAAAAAGAATTATGGATTGAATCTA
ATTTCTGAAATGATTGTTGAACAGGTCTACTTGGACTTTGGCCTAGCAGTACCAAAGCTCAGTGTTCATGGGATGCTCTCTGCAGTTAAGGGTCTTTTAGAACTGTGCCCACTAAACAAGGTGATGTTTAGCACAGATGGATATGCATTTCCTGAAACATATTATCTTGGTGCAAAATGGGCACGCAAAGTAATTGTATC
TGTTCTTTCTGATGCTTGTGATGGTGGGGATCTCTCTATTCAAGAAGCTATCGAAGCCGCACAAAATATCCTAAGGGACAATGCAGTCAGTTTCTATAAGCTGGATGAATATAGTACACAAAATATGATATCTGAAGTGGGTACGTCAGCCACTAATTCTCAGATTCTGGATCTAGAGGCTAACAAAGGAAAACCTAAGT
TTGTTCGTCTCCTTTGGGTTGATAATTCAGGTCAACAAAGATGTCGAGTTGTTCCAGAAAACCGTTTC
Intron 5 GTGCATTGTC ... TGTTGAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.67 | 11 | 1 | 7 |
| A2 | 16.67 | 5 | 2 | 0 |
| A3 | 0 | 4 | 0 | 0 |
| A4 | 44.44 | 5 | 3 | 5 |
| A5 | 16.67 | 5 | 2 | 0 |
| A6 | 33.33 | 1 | 1 | 0 |
| A7 | 0 | 7 | 0 | 0 |
| A8 | 14.29 | 3 | 0 | 1 |
| A9 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| A10 | 0 | 4 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN99287_c1_g2_i8 from sample A4 / Example spliced isoformCATGAACCACGCGATGAAGATAATTCTCTACAGTAAACAGAAAAGTCATAAGTCGCGGCCTGCCAATTGTGACCGGGTCCATGTACTATATATTTAACTTGTGGCCATGAAACAACCGCAGGGGAGGAGCCACTGTGTGTCAGAGGTGAGAGAGAAAGCAGACCAGTCCGTGCAAAATGGCGACGACAACTACTACTGAG
ACGATGTTAAGTGAGGTGGTGGACAGAATATCGATGATAGACGCTCATGCCCACAACATTGTGTCCCTTGATTCTCAATTTCCTTTTCTGCGCTGCTTCTCAGAGGCCGAAGGTGAAGCTGCCAAGGATGTCTGCCATACCCTATCCTTTAAGAGAAGTATACGGGACATTGCAAAGCTTTACAATTGTGATGCGACATT
AGAGGGGATTGAGGTGTGCCGCAATTCTTTGGGTCTAGAGAGTATTTGCTTAAAGTGTTTCAGTGCTGCCAATATTTCTACAGTGCTCATCGATGATGGAATCCACTTTGATAAAATGTATCCTGTGGGCTGGCATAAGAACTATGTGCCAGCTGTGGGTAGGATTTTAAGGATTGAGACTGTTGCTGAAGCGATTCTTA
ATCAGGGTCCACCCGATGGCACAACATGGTCACTAGAGAGGTTTATTCAGCTCTTTCAGTCGACATTGAAATCACATGCCAAGGGTGTTGTTGCTTTTAAGAGTATAGCTGCCTATCGCAGTGGTCTTAATATAAATCCATTGGTGAAAAGTCAAGAGGCAGAAGATGGTCTTTACAAAGATTTATGCGCCAGGAAGCCT
GTACGCATCAGTAACAAAAGCTTCATTGACTACATCTTTACGGTCAGCTTGGAAGTGGCTGCATCTTTTGATTGTCCCATGCAAATACATACAGGTTTTGGAGACAAGGACCTGGATCTGAGGCTTGCAAACCCTCTTCATCTTCGGGCAATCTTGGAAGATGATCGGTTCAAAAATTGTCGGATTGTGCTTCTTCATGC
GTCCCATCCCTACTCAAAGGAAGCATCTTATTTGGCTTCTGTTTATCCACAGGTCTACTTGGACTTTGGCCTAGCAGTACCAAAGCTCAGTGTTCATGGGATGCTCTCTGCAGTTAAGGGTCTTTTAGAACTGTGCCCACTAAACAAGGTGATGTTTAGCACAGATGGATATGCATTTCCTGAAACATATTATCTTGGTG
CAAAATGGGCACGCAAAGTAATTGTATCTGTTCTTTCTGATGCTTGTGATGGTGGGGATCTCTCTATTCAAGAAGCTATCGAAGCCGCACAAAATATCCTAAGGGACAATGCAGTCAGTTTCTATAAGCTGGATGAATATAGTACACAAAATATGATATCTGAAGTGGGTACGTCAGCCACTAATTCTCAGATTCTGGAT
CTAGAGGCTAACAAAGGAAAACCTAAGTTTGTTCGTCTCCTTTGGGTTGATAATTCAGGTCAACAAAGATGTCGAGTTGTTCCAGAAAACCGTTTC
>TRINITY_DN99287_c1_g2_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:CATGCCAAGGGTGTTGTTGCTTTTAAGAGTATAGCTGCCTATCGCAGTGGTCTTAATATAAATCCATTGGTGAAAAGTCAAGAGGCAGAAGATGGTCTTTACAAAGATTTATGCGGTAAGGCTCAATGGTGCATTTATTCCTTCAATTGGTGTCTAGACTAAACCATTTTATGATAATGAGTGTTTTAACATTATTTTGT
TAAGTTGATTTTAATAGTAACTGATATGTTAAGTTTATTTTAGTAGTAACTGATGGTTTTGTATTTACAAGTTATGTCTCAGCCAGGAAGCCTGTACGCATCAGTAACAAAAGCTTCATTGACTACATCTTTACGGTCAGCTTGGAAGTGGCTGCATCTTTTGATTGTCCCATGCAAATACATACAGGTTTTGGAGACAA
GGACCTGGATCTGAGGCTTGCAAACCCTCTTCATCTTCGGGCAATCTTGGAAGATGATCGGTTCAAAAATTGTCGGATTGTGCTTCTTCATGCGTCCCATCCCTACTCAAAGGAAGCATCTTATTTGGCTTCTGTTTATCCACAGgtgcattgtcatactgcctagtatatgccacaaaaagaattatggattgaatcta
atttctgaaatgattgttgaacagGTCTACTTGGACTTTGGCCTAGCAGTACCAAAGCTCAGTGTTCATGGGATGCTCTCTGCAGTTAAGGGTCTTTTAGAACTGTGCCCACTAAACAAGGTGATGTTTAGCACAGATGGATATGCATTTCCTGAAACATATTATCTTGGTGCAAAATGGGCACGCAAAGTAATTGTATC
TGTTCTTTCTGATGCTTGTGATGGTGGGGATCTCTCTATTCAAGAAGCTATCGAAGCCGCACAAAATATCCTAAGGGACAATGCAGTCAGTTTCTATAAGCTGGATGAATATAGTACACAAAATATGATATCTGAAGTGGGTACGTCAGCCACTAATTCTCAGATTCTGGATCTAGAGGCTAACAAAGGAAAACCTAAGT
TTGTTCGTCTCCTTTGGGTTGATAATTCAGGTCAACAAAGATGTCGAGTTGTTCCAGAAAACCGTTTC
Intron 6 ATATCCTTGC ... CTTTCTTTAC
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28.3 | 19 | 8 | 7 |
| A2 | 42.11 | 11 | 11 | 5 |
| A3 | 19.15 | 19 | 5 | 4 |
| A4 | 41.38 | 17 | 10 | 14 |
| A5 | 71.43 | 1 | 3 | 2 |
| A6 | 0 | 4 | 0 | 0 |
| A7 | 26.32 | 7 | 5 | 0 |
| A8 | 33.33 | 1 | 1 | 0 |
| A9 | 33.33 | 6 | 5 | 1 |
| A10 | 33.33 | 7 | 6 | 1 |
>TRINITY_DN99287_c1_g2_i8 from sample A4 / Example spliced isoformCATGAACCACGCGATGAAGATAATTCTCTACAGTAAACAGAAAAGTCATAAGTCGCGGCCTGCCAATTGTGACCGGGTCCATGTACTATATATTTAACTTGTGGCCATGAAACAACCGCAGGGGAGGAGCCACTGTGTGTCAGAGGTGAGAGAGAAAGCAGACCAGTCCGTGCAAAATGGCGACGACAACTACTACTGAG
ACGATGTTAAGTGAGGTGGTGGACAGAATATCGATGATAGACGCTCATGCCCACAACATTGTGTCCCTTGATTCTCAATTTCCTTTTCTGCGCTGCTTCTCAGAGGCCGAAGGTGAAGCTGCCAAGGATGTCTGCCATACCCTATCCTTTAAGAGAAGTATACGGGACATTGCAAAGCTTTACAATTGTGATGCGACATT
AGAGGGGATTGAGGTGTGCCGCAATTCTTTGGGTCTAGAGAGTATTTGCTTAAAGTGTTTCAGTGCTGCCAATATTTCTACAGTGCTCATCGATGATGGAATCCACTTTGATAAAATGTATCCTGTGGGCTGGCATAAGAACTATGTGCCAGCTGTGGGTAGGATTTTAAGGATTGAGACTGTTGCTGAAGCGATTCTTA
ATCAGGGTCCACCCGATGGCACAACATGGTCACTAGAGAGGTTTATTCAGCTCTTTCAGTCGACATTGAAATCACATGCCAAGGGTGTTGTTGCTTTTAAGAGTATAGCTGCCTATCGCAGTGGTCTTAATATAAATCCATTGGTGAAAAGTCAAGAGGCAGAAGATGGTCTTTACAAAGATTTATGCGCCAGGAAGCCT
GTACGCATCAGTAACAAAAGCTTCATTGACTACATCTTTACGGTCAGCTTGGAAGTGGCTGCATCTTTTGATTGTCCCATGCAAATACATACAGGTTTTGGAGACAAGGACCTGGATCTGAGGCTTGCAAACCCTCTTCATCTTCGGGCAATCTTGGAAGATGATCGGTTCAAAAATTGTCGGATTGTGCTTCTTCATGC
GTCCCATCCCTACTCAAAGGAAGCATCTTATTTGGCTTCTGTTTATCCACAGGTCTACTTGGACTTTGGCCTAGCAGTACCAAAGCTCAGTGTTCATGGGATGCTCTCTGCAGTTAAGGGTCTTTTAGAACTGTGCCCACTAAACAAGGTGATGTTTAGCACAGATGGATATGCATTTCCTGAAACATATTATCTTGGTG
CAAAATGGGCACGCAAAGTAATTGTATCTGTTCTTTCTGATGCTTGTGATGGTGGGGATCTCTCTATTCAAGAAGCTATCGAAGCCGCACAAAATATCCTAAGGGACAATGCAGTCAGTTTCTATAAGCTGGATGAATATAGTACACAAAATATGATATCTGAAGTGGGTACGTCAGCCACTAATTCTCAGATTCTGGAT
CTAGAGGCTAACAAAGGAAAACCTAAGTTTGTTCGTCTCCTTTGGGTTGATAATTCAGGTCAACAAAGATGTCGAGTTGTTCCAGAAAACCGTTTC
>TRINITY_DN99287_c1_g2_i6 from sample A4 / Example unspliced isoform:CATGAACCACGCGATGAAGATAATTCTCTACAGTAAACAGAAAAGTCATAAGTCGCGGCCTGCCAATTGTGACCGGGTCCATGTACTATATATTTAACTTGTGGCCATGAAACAACCGCAGGGGAGGAGCCACTGTGTGTCAGAGGTGAGAGAGAAAGCAGACCAGTCCGTGCAAAATGGCGACGACAACTACTACTGAG
ACGATGTTAAGTGAGGTGGTGGACAGAATATCGATGATAGACGCTCATGCCCACAACATTGTGTCCCTTGATTCTCAATTTCCTTTTCTGCGCTGCTTCTCAGAGGCCGAAGGTGAAGCTGCCAAGGATGTCTGCCATACCCTATCCTTTAAGAGAAGTATACGGGACATTGCAAAGCTTTACAATTGTGATGCGACATT
AGAGGGGATTGAGGTGTGCCGCAATTCTTTGGGTCTAGAGAGTATTTGCTTAAAGTGTTTCAGTGCTGCCAATATTTCTACAGTGCTCATCGATGATGGAATCCACTTTGATAAAATGTATCCTGTGGGCTGGCATAAGAACTATGTGCCAGCTGTGGGTAGGATTTTAAGGATTGAGACTGTTGCTGAAGCGATTCTTA
ATCAGGGTCCACCCGATGGCACAACATGGTCACTAGAGAGGTTTATTCAGCTCTTTCAGTCGACATTGAAATCatatccttgcaagattttttccatttttttctcacatttcatatcttatcttcttgaatggaaattaagaagtccatttatttattgggtacacatttttttactacatctttctttacACATGCCA
AGGGTGTTGTTGCTTTTAAGAGTATAGCTGCCTATCGCAGTGGTCTTAATATAAATCCATTGGTGAAAAGTCAAGAGGCAGAAGATGGTCTTTACAAAGATTTATGCGCCAGGAAGCCTGTACGCATCAGTAACAAAAGCTTCATTGACTACATCTTTACGGTCAGCTTGGAAGTGGCTGCATCTTTTGATTGTCCCATG
CAAATACATACAGGTTTTGGAGACAAGGACCTGGATCTGAGGCTTGCAAACCCTCTTCATCTTCGGGCAATCTTGGAAGATGATCGGTTCAAAAATTGTCGGATTGTGCTTCTTCATGCGTCCCATCCCTACTCAAAGGAAGCATCTTATTTGGCTTCTGTTTATCCACAGGTCTACTTGGACTTTGGCCTAGCAGTACC
AAAGCTCAGTGTTCATGGGATGCTCTCTGCAGTTAAGGGTCTTTTAGAACTGTGCCCACTAAACAAGGTGATGTTTAGCACAGATGGATATGCATTTCCTGAAACATATTATCTTGGTGCAAAATGGGCACGCAAAGTAATTGTATCTGTTCTTTCTGATGCTTGTGATGGTGGGGATCTCTCTATTCAAGAAGCTATCG
AAGCCGCACAAAATATCCTAAGGGACAATGCAGTCAGTTTCTATAAGCTGGATGAATATAGTACACAAAATATGATATCTGAAGTGGGTACGTCAGCCACTAATTCTCAGATTCTGGATCTAGAGGCTAACAAAGGAAAACCTAAGTTTGTTCGTCTCCTTTGGGTTGATAATTCAGGTCAACAAAGATGTCGAGTTGTT
CCAGAAAACCGTTTC
Intron 7 GTACGATATC ... TTTGTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.94 | 20 | 3 | 5.3 |
| A2 | 64.58 | 5 | 10 | 8.5 |
| A3 | 24.08 | 13 | 3 | 5.3 |
| A4 | 15.38 | 11 | 4 | 0 |
| A5 | 25.75 | 9 | 6 | 0.3 |
| A6 | 8.33 | 1 | 0 | 0.3 |
| A7 | 11.07 | 9 | 2.3 | 0 |
| A8 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A9 | 20 | 6 | 3 | 0 |
| A10 | 6.67 | 7 | 1 | 0 |
>TRINITY_DN111510_c0_g2_i5 from sample A2 / Example spliced isoformGTCGCGGCCTGCCAATTGTGACCGGGTCCATGTACTATATATTTAACTTGTGGCCATGAAACAACCGCAGGGGAGGAGCCACTGTGTGTCAGAGGTGAGAGAGAAAGCAGACCAGTCCGTGCAAAATGGCGACGACAACTACTACTGAGACGATGTTAAGTGAGGTGGTGGACAGAATATCGATGATAGACGCTCATGCC
CACAACATTGTGTCCCTTGATTCTCAATTTCCTTTTCTGCGCTGCTTCTCAGAGGCCGAAGGTGAAGCTGCCAAGGATGTCTGCCATACCCTATCCTTTAAGAGAAGTATACGGGACATTGCAAAGCTTTACAATTGTGATGCGACATTAGAGGGGATTGAGGTGTGCCGCAATTCTTTGGGTCTAGAGAGTATTTGCTT
AAAGTGTTTCAGTGCTGCCAATATTTCTACAGTGCTCATCGATGATGGAATCCACTTTGATAAAATGTATCCTGTGGGCTGGCATAAGAACTATGTGCCAGCTGTGGGTAGGATTTTAAGGATTGAGACTGTTGCTGAAGCGATTCTTAATCAGGGTCCACCCGATGGCACAACATGGTCACTAGAGAGGTTTATTCAGC
TCTTTCAGTCGACATTGAAATCACATGCCAAGGGTGTTGTTGCTTTTAAGAGTATAGCTGCCTATCGCAGTGGTCTTAATATAAATCCATTGGTGAAAAGTCAAGAGGCAGAAGATGGTCTTTACAAAGATTTATGCGGTAAGGCTCAATGGTGCGTTTATTCCTTCAATTG
>TRINITY_DN111510_c0_g2_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:GTCGCGGCCTGCCAATTGTGACCGGGTCCATGTACTATATATTTAACTTGTGGCCATGAAACAACCGCAGGGGAGGAGCCACTGTGTGTCAGAGGTGAGAGAGAAAGCAGACCAGTCCGTGCAAAATGGCGACGACAACTACTACTGAGACGATGTTAAGTGAGGTGGTGGACAGAATATCGATGATAGACGCTCATGCC
CACAACATTGTGTCCCTTGATTCTCAATTTCCTTTTCTGCGCTGCTTCTCAGAGGCCGAAGGTGAAGCTGCCAAGGATGTCTGCCATACCCTATCCTTTAAGAGAAGTATACGGGACATTGCAAAGCTTTACAATTGTGATGCGACATTAGAGGGGATTGAGGTGTGCCGCAATTCTTTGGGTCTAGAGAGTATTTGCTT
AAAGTGTTTCAGTGCTGCCAATATTTCTACAGTGCTCATCGATGATGGAATCCACTTTGATAAAATGTATCCTGTGGGCTGGCATAAGAACTATGTGCCAGCTGTGGGTAGGATTTTAAGGATTGAGACTGTTGCTGAAGCGATTCTTAATCAGgtacgatatctctttaattctattgccagaaggattgagaacattt
ttaacaggaaaaaatatacaattacatcttaatgacatgtaagaggtcattgcagctatggcagagaatcctattgtaagacctgttggcaaccactattatccatcttgtggcaagagaaagcacatcatattctttagagatacattatattgtacttacaaattgaattttgtggcagGGTCCACCCGATGGCACAA
CATGGTCACTAGAGAGGTTTATTCAGCTCTTTCAGTCGACATTGAAATCATATCCTTGCAAGATTTTTTCCATTTTTTTCTCACATTTCATATCTTATCTTCTTGAATGGAAATTAAGAAGTCCATTTATTTATTGGGTACACATTTTTTTACTACATCTTTCTTTAC