sp|Q8GUH7|CSCLC_ARATH ----> CSC1-like protein HYP1
Intron 1 GTGCGTCCTC ... TCATTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.17 | 53 | 24 | 24 |
| A2 | 36.17 | 30 | 15 | 19 |
| A3 | 23.08 | 35 | 7 | 14 |
| A4 | 22.45 | 38 | 9 | 13 |
| A5 | 13.64 | 19 | 0 | 6 |
| A6 | 24 | 95 | 22 | 38 |
| A7 | 24.02 | 85 | 24.7 | 29 |
| A8 | 21.49 | 148 | 43 | 38 |
| A9 | 18.63 | 107 | 17 | 32 |
| A10 | 21.05 | 67 | 22.7 | 13 |
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i13 from sample A1 / Example spliced isoformATTATGATAGTTAACGGGGTTTATGAAAACCAAAACCTGACGGGATAAAGGTTCAAACTAGACGTCAAGCGACGGCACTTTAACTTCTTTGTAACTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACAT
CAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTGAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCAT
CGGCACAGTACCGGTTTGGTACATTCGGTAATGAAAGGATGCGAGGTTGATTTGCGTACGCTGTTTTGGTGTCCGTGCAGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGT
GGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATT
TGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTA
TGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGC
TGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATG
CAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAACATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAAGGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCT
TCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGCAGTCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATT
CTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAG
TGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAG
GGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGAT
CTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAAT
ATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGC
TATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGTATACATGCTACTCTCCATTCTCTGATTTGTTCTTTAGTAGATGATTCATTTATTTGTAAATATATTTTTTCTATGTAATGTTGTATGTAATATGGTATTCTTTTTGTTTTTCAATGCAAATTTCATTC
TTGATAAAAACACATGTCATGGATGGGATTGATGTATTATTCATATTGCCAAATTCTATTTCCTTTGCTCTGTAATAGCATTTTTAATGAAACTTCATTACCTATTAATATCTTCTCCGTCCTTGCCTATTTCTATGCATTGAATTGAATTACAGGTATCCCTGAACATTGAAACTGTTATCTTAGATTGGGGATTACCA
TTAATTATGTAAGTAAGAAAAACAATATGTTTAAAATTTAAAGACATACATAAACAAGAAATTGTGATCATAGATTGGGGATTACCAATTATTGTCATAAGTAATAAAAACAATATGTTTAAAAAGCTACTTAAGCAAGATTAGCCTAACCTTCTATGTGTCTACACTCTACCCATTGTTTTACTTGACTGTTCCCATAT
ACATCAGTTGGCCAGGGTCTGAGTTATTATTCAAATGTAGTGAGACTCGAGTAGTTGATTAAATTGGCACTCCAATACTCCATTTTTTCTTGCAATAGTAACCTTTTAAACTTTATGGACACCTCAAATCAATTCCTAGAGACAATCCAGTAGTACCTTTATCTATCGAAGTAGGGATTGCTATGGGCTTGTTAGATGAC
AT
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i20 from sample A1 / Example unspliced isoform:TCGTTTACGATGGCAAAAAGACCCCCCTCTTTGGCACATCTGTTAGGGTGTGCTATAGAGAATCTGTGGCGTAACACACCCAAAACCATGGTGGAATCAAGCAAAAAGGTGGTCAATAATTTGAAGAGCTTTATCCATATGAGTAACCAACAGTATACATGTGCTACCTCAAACCAAAATGCATAGATATGCTGAAGGAA
TCATCTGCTATGCAATATGTGCATCCTCAACACATCACCTAGACACCATCACTAAACTACCATCAAAATACTTAATATCAGAACAGAAACTCCGGTGCAATGAATCAATGCAACACTATAATTCTGCAAACTCTATGGGCAAAAACCAATCACTTTGCACCAAAACACCTTCCTCTAGACACTGCACACCATGTTGTTGA
GGCAGTAAGTCAGGTCAAGCTGAGCTAGTGTGATGCTAGGAAAAGTGTGTGCATCCATAATGACCCGAGTACCAAAAATTATCAATCCATAAGATGAAGTCTGTCTGTACTGTACTATTGAACAAGAAACCAAAATGGAAGTGATTCATCATGTAGTGTGAGGAGTAACACAATCAAAATGCTATCCTAATAAAAATCTA
TGTTTTCTGTTAGTCATATTTTGTTTAAAAAATCATAAATCATTTAAGAAAATACATGCATATAATCAAATGTGTAAATTTAAATAAATAATAGTTTGTGGGAAAGCCCGAGTTTATACAGTGTACAGTGTACCACTACTTGGTGACAAATTTTTTTTCTGAAGATTATGCATTATTAATAGATTATTTAACATTCATAT
TTGTCTGTCTGCAGGAACTTCCAGCTTCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGCAGTCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTG
GGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATTCTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGACATTTGCAAGTCAAATCATCACTGGCTACCTTCCTAGTGTTATTCTCCAATTATTTCTGTATGCTATTCCACCCATAATGATGTT
GTTTTCAGCCATCCAAGGTTCGGTGTCATATAGTGGAAAGAAAAAGAGTGCATGTGCCAAAATGCTCTACTTCACAGTTTGGAATGTGTTCTTCGTAAATGTTTTATCTGGAACGGTCATCAACCAACTCAATAACATCATTTCCAGCCCTAAAGACTTACCCAGGCAGCTTGCAAAAGCAATACCTGGACAGGCAACTT
TCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAGTGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTG
GTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAGGGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCC
TGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGgtgcgtcctcttttactcaagttccgttactgtgcatatcgttctttatgtttaattaaatgaacccttgtgtatacttttagaatcatgcctttca
atctgagtttgaatgttagcttgcacacaagttaataaattaagcaagtttgtgactatctaaaataaaaatctttaaaaagaccaaatttttattcatgtacagagaacaaaaacatagaagtaataagactaaaaagaaaaacataataattcttggcttattcaataccagtgagggaaaaatttagaaaagttaat
atatttgtaaagatatctggattttgaggttgatatcaatttttagcatacctgattagtgatttcttttattgtttttgatacattgggatttaaatttgaattgtcttttcactcaatttcattgcctatttttgtgaatgaattagttaattaatagtaatttatttttaaattagtaaaatttaaataatagtatc
aagattcaaaaaaagtccgttattcccagaaactacttttcaagtaaaggattttgaaagatgtggggtttatcagaagaaatatagacataccaacaaatattatctgttagtaacttgctcccccttaaaaagataaatgaaattacttagaaattatagtaataaaaagacccattacatagaatattattatgttc
aatccacattgaaagaacattattcagagtgagcccgatgttgttagacattattattatgttctttcattgtgaacacgagtttttttatttgacatcaacatcattggcagGATCTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCATCCA
ACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATA
TTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGTATACATGCTACT
CTCCATTCTCTGATTTGTTCTTTAGTAGATGATTCATTTATTTGTAAATATATTTTTTCTATGTAATGTTGTATGTAATATGGTATTCTTTTTGTTTTTCAATGCAAATTTCATTCTTGATAAAAACACATGTCATGGATGGGATTGATGTATTATTCATATTGCCAAATTCTATTTCCTTTGCTCTGTAATAGCATTTT
TAATGAAACTTCATTACCTATTAATATCTTCTCCGTCCTTGCCTATTTCTATGCATTGAATTGAATTACAGGTATCCCTGAACATTGAAACTGTTATCTTAGATTGGGGATTACCATTAATTATGTAAGTAAGAAAAACAATATGTTTAAAATTTAAAGACATACATAAACAAGAAATTGTGATCATAGATTGGGGATTA
CCAATTATTGTCATAAGTAATAAAAACAATATGTTTAAAAAGCTACTTAAGCAAGATTAGCCTAACCTTCTATGTGTCTACACTCTACCCATTGTTTTACTTGACTGTTCCCATATACATCAGTTGGCCAGGGTCTGAGTTATTATTCAAATGTAGTGAGACTCGAGTAGTTGATTAAATTGGCACTCCAATACTCCATT
TTTTCTTGCAATAGTAACCTTTTAAACTTTATGGACACCTCAAATCAATTCCTAGAGACAATCCAGTAGTACCTTTATCTATCGAAGTAGGGATTGCTATGGGCTTGTTAGATGACAT
Intron 2 GCTGCATGTA ... GTCCGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.44 | 78 | 22 | 37 |
| A2 | 21.31 | 96 | 21 | 31 |
| A3 | 19.19 | 80 | 17 | 21 |
| A4 | 25.09 | 100 | 23 | 44 |
| A5 | 28.33 | 43 | 10 | 24 |
| A6 | 23.23 | 38 | 16 | 7 |
| A7 | 25.42 | 44 | 16 | 14 |
| A8 | 20.59 | 27 | 7 | 7 |
| A9 | 29.73 | 39 | 13 | 20 |
| A10 | 14.93 | 57 | 7 | 13 |
>TRINITY_DN40775_c7_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoformTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACATCAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCT
GAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCATCGGCACAGTACCGGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATA
TAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATT
CCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTT
GTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGC
TACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGA
TTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATGCAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAACATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAAGGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGC
CATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCTTCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGCAATCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAAT
TATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATTCTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGACATTTGCAAGTCAAATCATCACTGGCTACCTTCCTAGTGTTATTCTCCAATTATTTCTGTATGCTATTCCAC
CCATAATGATGTTGTTTTCAGCCATCCAAGGTTCGGTGTCATATAGTGGAAAGAAAAAGAGTGCATGTGCCAAAATGCTCTACTTCACAGTTTGGAATGTGTTCTTCGTAAATGTTTTATCTGGAACGGTCATCAACCAACTCAATAACATCATTTCCAGCCCTAAAGACTTACCCAGGCAGCTTGCAAAAGCAATACCT
GGACAGGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAGTGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTT
CAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAGGGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGA
TAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGATCTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCAT
CCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAG
ATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGAAGGAGCTTC
TAAATTATGTACGATTCAGTATTTGCCGACCAAAGAATATAATAGAGATCCATAGATACAAGGGCGTTAACGCGGGTTGCCTAGAATTAGAGAAGATGGGAGGTGATTTCCTGTATTCCTGGGGAATAAGCGTGGCTGAACTACATGGTCAAGCAAAGGCCAGCGAAACAAAAGGGAATCTAAAAACGGCGACTAGCTCA
CTTTTAAGAGAAAGCATGGGTACCTTCGAATCAGTGCAGAATCGGTATTCTAGAAAAGAATTTGTATTGGAGAGACTGCTTGTAAAGAGGGGTGTGCGTAATCTTTCCACATTAATAAAAATTGTAAGCCATGGGTGGTTTATGGAATTATTCATATAAAAGATTTGCCAATTTGGAAGTTGGTTTTGGGTGCAAGTCTT
TGGATTGTTGTGGTAATATCCTTCCTCATTTTGGTACTAACATCACATACCAGTGTCCTTGTGTTTTGTCGATTCCCTTTATTTGTGGTTATCTTTATTTTTAATTGTTTAAATGCAAGCTTCATAGCATACGTAATCATTTTGG
>TRINITY_DN40775_c7_g1_i11 from sample A8 / Example unspliced isoform:TGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACATCAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCT
GAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCATCGGCACAGTACCGGgctgcatgtatttttccaaaaagggctaaatacaaagaatctggttaaatttcgtccagtttggtacattcggtaatgaaa
ggatgcgaggttgatttgcgtacgctgttttggtgtccgtgcagCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCC
TCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGA
AAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCA
AAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCC
TCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATGCAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAAC
ATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAAGGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCTTCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCA
GTTGCTGCACAGGTTCGGCAATCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATTCTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACA
GTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGACATTTGCAAGTCAAATCATCACTGGCTACCTTCCTAGTGTTATTCTCCAATTATTTCTGTATGCTATTCCACCCATAATGATGTTGTTTTCAGCCATCCAAGGTTCGGTGTCATATAGTGGAAAGAAAAAGAGTGCATGTGCCAAAA
TGCTCTACTTCACAGTTTGGAATGTGTTCTTCGTAAATGTTTTATCTGGAACGGTCATCAACCAACTCAATAACATCATTTCCAGCCCTAAAGACTTACCCAGGCAGCTTGCAAAAGCAATACCTGGACAGGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTA
TTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAGTGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCG
TAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAGGGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCA
GGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGATCTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGC
TTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCA
TCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGAAGGAGCTTCTAAATTATGTACGATTCAGTATTTGCCGACCAAAGAATATAATAGAGATCCATAGATACAAGGGCGTTAACGCGG
GTTGCCTAGAATTAGAGAAGATGGGAGGTGATTTCCTGTATTCCTGGGGAATAAGCGTGGCTGAACTACATGGTCAAGCAAAGGCCAGCGAAACAAAAGGGAATCTAAAAACGGCGACTAGCTCACTTTTAAGAGAAAGCATGGGTACCTTCGAATCAGTGCAGAATCGGTATTCTAGAAAAGAATTTGTATTGGAGAGA
CTGCTTGTAAAGAGGGGTGTGCGTAATCTTTCCACATTAATAAAAATTGTAAGCCATGGGTGGTTTATGGAATTATTCATATAAAAGATTTGCCAATTTGGAAGTTGGTTTTGGGTGCAAGTCTTTGGATTGTTGTGGTAATATCCTTCCTCATTTTGGTACTAACATCACATACCAGTGTCCTTGTGTTTTGTCGATTC
CCTTTATTTGTGGTTATCTTTATTTTTAATTGTTTAAATGCAAGCTTCATAGCATACGTAATCATTTTGG
Intron 3 GTAAAAAATA ... TGTGATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 39.02 | 25 | 16 | 16 |
| A2 | 28.57 | 20 | 6 | 10 |
| A3 | 38.98 | 18 | 12 | 11 |
| A4 | 25.81 | 23 | 9 | 7 |
| A5 | 37.78 | 14 | 5 | 12 |
| A6 | 31.03 | 20 | 9 | 9 |
| A7 | 19.42 | 56 | 7 | 20 |
| A8 | 18.84 | 56 | 6 | 20 |
| A9 | 21.28 | 37 | 9 | 11 |
| A10 | 20.22 | 43.4 | 11 | 11 |
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i29 from sample A1 / Example spliced isoformATTATGATAGTTAACGGGGTTTATGAAAACCAAAACCTGACGGGATAAAGGTTCAAACTAGACGTCAAGCGACGGCACTTTAACTTCTTTGTAACTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACAT
CAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTGAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCAT
CGGCACAGTACCGGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAA
TATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTAC
CATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCT
TCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCG
CGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATGCAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAACATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAA
GGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCTTCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGCAGTCATCCAAT
CCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATTCTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATT
CCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGACATTTGCAAGTCAAATCATCACTGGCTACCTTCCTAGTGTTATTCTCCAATTATTTCTGTATGCTATTCCACCCATAATGATGTTGTTTTCAGCCATCCAAGGTTCGGTGTCATATAGTGGAAAGAAAAAGAGTGCATGTGCCAAAATGCTCTACTTCACAGTTTGGAATGTGTTCT
TCGTAAATGTTTTATCTGGAACGGTCATCAACCAACTCAATAACATCATTTCCAGCCCTAAAGACTTACCCAGGCAGCTTGCAAAAGCAATACCTGGACAGGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGT
TGTTTCTCCAAGAGTGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAA
ATCTGAGACTGAAGGGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATT
ACTCTGCAGAGGATCTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTC
ATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCT
GGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGTATACATGCTACTCTCCATTCTCTGATTTGTTCTTTAGTAGATGATTCATTTATTTGTAAATATATTTTTTCTATGTAATGTTGTATGTAATATGGTATTCTTTTTGTTTTTCAA
TGCAAATTTCATTCTTGATAAAAACACATGTCATGGATGGGATTGATGTATTATTCATATTGCCAAATTCTATTTCCTTTGCTCTGTAATAGCATTTTTAATGAAACTTCATTACCTATTAATATCTTCTCCGTCCTTGCCTATTTCTATGCATTGAATTGAATTACAGGTATCCCTGAACATTGAAACTGTTATCTTAG
ATTGGGGATTACCATTAATTATGTAAGTAAGAAAAACAATATGTTTAAAATTTAAAGACATACATAAACAAGAAATTGTGATCATAGATTGGGGATTACCAATTATTGTCATAAGTAATAAAAACAATATGTTTAAAAAGCTACTTAAGCAAGATTAGCCTAACCTTCTATGTGTCTACACTCTACCCATTGTTTTACTT
GACTGTTCCCATATACATCAGTTGGCCAGGGTCTGAGTTATTATTCAAATGTAGTGAGACTCGAGTAGTTGATTAAATTGGCACTCCAATACTCCATTTTTTCTTGCAATAGTAACCTTTTAAACTTTATGGACACCTCAAATCAATTCCTAGAGACAATCCAGTAGTACCTTTATCTATCGAAGTAGGGATTGCTATGG
GCTTGTTAGATGACAT
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i34 from sample A1 / Example unspliced isoform:TTATGAATTGAATGAAAGCTTCCAACTTTCTGTGAAATTTATTTATCTTTGGAAATATCGAGACAAGGGGCTGTGGGGGGAGAATCCTTTTTCTTCTCTTTTTTTCTGACACGCTACACTGTTTCTTTTGTTCTTTTTCATATGCAGGACATTTGCAAGTCAAATCATCACTGGCTACCTTCCTAGTGTTATTCTCCAAT
TATTTCTGTATGCTATTCCACCCATAATGATGTTGTTTTCAGCCATCCAAGGTTCGGTGTCATATAGTGGAAAGAAAAAGAGTGCATGTGCCAAAATGCTCTACTTCACAGTTTGGAATGTGTTCTTCGTAAATGTTTTATCTGGAACGGTCATCAACCAACTCAATAACATCATTTCCAGCCCTAAAGACTTACCCAGG
CAGCTTGCAAAAGCAATACCTGGACAGgtaaaaaatacctttagctttagtaactttgtatcaatcagccatagatactattttaaattggttgaatggaggttcaatataactgcttgtccgcaatacaacaacagtgaagtgatgtgaagatttcttggtgtttcaaatgcttctataaacttgttgagcatcttgtt
gtgccagtttatatcctttttccatctctgacacacctaccaatgtttgatttgttttagccactttcagagatattagaagctaaaaaggatagtgaggcatggaaacaaatatgaaataaaagtcctaaacaaggtatattaacaaatgaattaatacattcaaaccttcatgaatataagcgagtgtgagatcataa
acaaggtgcacaagagcatgagatgataaacaaaggcacaatttcttgatccagggatgtgaaccaccaaacgaacaagtgtcctagattaattgctgtcttgcttttctggttcagtggattcctttgcagtgccataatgttctaaacttgcatctggtgggcctttctggcctcatgagtggtgatattatctattt
tgtcctccttacaacatagtaaaggatgaacagaatcaataaaacaaatggtaatcaatgatttgctttattttgtgatgcagGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAGTGGC
AATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGGTAAATTCCAAAAATTCTTTTCCCTTAGTGAGAATGTAATC
TTATTGAAATATTTTTATCATGAGTATGACATACAATCATTCCAGACAGCAAATGTATGGCAGCTCTTATAGAAAAACTCTTAAGTAATCTTACTGCTGGTTCCTATCTAGAAACACTCCCCACCCTCTTTTTAGTTTATATAGTTTTGCTGCATATTTGCAGGGGCAAAAGACAGAATACTCCTTTTAGTATTGTGACC
ATGTTTGTTTGAACCAATCATTTAAATGCATGAACTCTTTCTATCATGTTGTGCTCCCTCCAGTCTCTTTCTGTGTGGTTGTCTCTTTCTGTGTGGTTGGAGAATTGTTGAAGTCTGTTAAGTTTAATTAACTTTGTACAGTCCTGAATCACGAGATTGTACTTTTGTTGGGATAGCTGTACACGGAAACTTCTGTAAAA
TTATAGTAATCATGTGGATTATTTGTTTAGAAGGATTAACTGTACCTTCATTAAACATAGCACACAATTTCACAGGAAAATGCATTATTTTGTCTTTTAACTTTCCCGTCTTCTTCTTTCTAGATGTTCATATATAACATTGTTCTGTTATTCGATTGATTGCATTTCCTTTATATGCAAATGTTTTAACTTCCTGTATA
AATACAGCTAAAATATTAGTTCTTTTCTCAAAATATGTAAATTCATCCATATGTTTGTGCTTTATGCATCTTACATTCTTCCAACTTAGTAGTTGAGAATATACAAAATGCTCAGATTGCATGTTACAGAACAATCCCTTGTTAAAATGGAGTCACTGGAAGGTATTAATTAGTCATGTCAGGGACTGATAAGAAGATAT
ATAGATAATTTGAATTCTGTGCTTAAACAGTCAAAGATAGTCCTCAAACTCTTCCATAGATCAAAATTGTCTTTATGCCTGCTAAACCAGTATAGAGTCTCCTAGAGATCTGCGCCTTCCTTAGTTCTTCAAAATTTCGCCCTTACTCTTCATTTCGACCTTCTTAGGACTGTCTTCGACCTGCTGCTCTGCTTCCTCAG
ATCTGCATCTGTCTGTATTCAATTCACTGCCTCAGATCACTATCTCAAAAATGTCCTTATCAATCCATTAAATGAGGGCACCTTTCCTTATATTTATACAAGTCAAATGTGTTTTAAAGATTGCGGCCGATCTTACTTCTTTGGCTGGGCCGACTTGGTACTTTGACTGAGCATAAAGAAAC
Intron 4 GTATGAGAAT ... GTCCGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 32.37 | 76.5 | 38 | 35 |
| A2 | 21.45 | 95 | 23 | 28.9 |
| A3 | 22.64 | 78.7 | 26.4 | 19.5 |
| A4 | 27.45 | 98.8 | 33 | 41.7 |
| A5 | 28.03 | 42.4 | 10 | 23 |
| A6 | 23.08 | 37.5 | 16 | 6.5 |
| A7 | 27.84 | 43.7 | 20 | 13.7 |
| A8 | 20.36 | 26.6 | 7 | 6.6 |
| A9 | 29.28 | 38.6 | 13 | 19 |
| A10 | 16.17 | 56.2 | 10 | 11.7 |
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i29 from sample A1 / Example spliced isoformATTATGATAGTTAACGGGGTTTATGAAAACCAAAACCTGACGGGATAAAGGTTCAAACTAGACGTCAAGCGACGGCACTTTAACTTCTTTGTAACTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACAT
CAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTGAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCAT
CGGCACAGTACCGGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAA
TATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTAC
CATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCT
TCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCG
CGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATGCAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAACATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAA
GGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCTTCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGCAGTCATCCAAT
CCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATTCTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATT
CCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGACATTTGCAAGTCAAATCATCACTGGCTACCTTCCTAGTGTTATTCTCCAATTATTTCTGTATGCTATTCCACCCATAATGATGTTGTTTTCAGCCATCCAAGGTTCGGTGTCATATAGTGGAAAGAAAAAGAGTGCATGTGCCAAAATGCTCTACTTCACAGTTTGGAATGTGTTCT
TCGTAAATGTTTTATCTGGAACGGTCATCAACCAACTCAATAACATCATTTCCAGCCCTAAAGACTTACCCAGGCAGCTTGCAAAAGCAATACCTGGACAGGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGT
TGTTTCTCCAAGAGTGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAA
ATCTGAGACTGAAGGGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATT
ACTCTGCAGAGGATCTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTC
ATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCT
GGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGTATACATGCTACTCTCCATTCTCTGATTTGTTCTTTAGTAGATGATTCATTTATTTGTAAATATATTTTTTCTATGTAATGTTGTATGTAATATGGTATTCTTTTTGTTTTTCAA
TGCAAATTTCATTCTTGATAAAAACACATGTCATGGATGGGATTGATGTATTATTCATATTGCCAAATTCTATTTCCTTTGCTCTGTAATAGCATTTTTAATGAAACTTCATTACCTATTAATATCTTCTCCGTCCTTGCCTATTTCTATGCATTGAATTGAATTACAGGTATCCCTGAACATTGAAACTGTTATCTTAG
ATTGGGGATTACCATTAATTATGTAAGTAAGAAAAACAATATGTTTAAAATTTAAAGACATACATAAACAAGAAATTGTGATCATAGATTGGGGATTACCAATTATTGTCATAAGTAATAAAAACAATATGTTTAAAAAGCTACTTAAGCAAGATTAGCCTAACCTTCTATGTGTCTACACTCTACCCATTGTTTTACTT
GACTGTTCCCATATACATCAGTTGGCCAGGGTCTGAGTTATTATTCAAATGTAGTGAGACTCGAGTAGTTGATTAAATTGGCACTCCAATACTCCATTTTTTCTTGCAATAGTAACCTTTTAAACTTTATGGACACCTCAAATCAATTCCTAGAGACAATCCAGTAGTACCTTTATCTATCGAAGTAGGGATTGCTATGG
GCTTGTTAGATGACAT
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTATGATAGTTAACGGGGTTTATGAAAACCAAAACCTGACGGGATAAAGGTTCAAACTAGACGTCAAGCGACGGCACTTTAACTTCTTTGTAACTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACAT
CAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTGAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCAT
CGGCACAGTACCGGgtatgagaatgcttaaatatggcaactgagtgttaactttgaaaatttcagtattctgcgtttattagcagacgttcgtttctcaggctgcatgtatttttccaaaaagggctaaatacaaagaatctggttaaatttcgtccagtttggtacattcggtaatgaaaggatgcgaggttgatttgc
gtacgctgttttggtgtccgtgcagCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACG
GAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGA
GAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTT
CTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACC
ATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGGTGAGCATTTCTTTGAGCTTGTGCTCTACTTTTAATTAGTATATATTTTCAGGCAAGCGATA
ATTTTATTTGAAAGTGTCATTTGAATATTGCCTTACAGTTCTTTTGTCCCCAAAATCACATGTGATTCGTGAGCAAACACACTGGTGATGGCATTGTTTTGTCTCATCCTTTGATGGTAATTGCTTTTAAGGGCCACAGTAAGGTACTTTGAGAGTTGGGCTGAACATTTACAAAATATATAGTAGGACTAAGTCTTTGA
AGAAGGTGTGAAGAATTGGGAAGTTGGCAATTAGGCTGTCATTTTAATCTAAGTCACAATCTCTTGAAATAAGATTAAAAGTAGATATGTTTCAAACATAATTATTCCTCTTGTACAATGCTTATTTCTTATTAACGAGATTTATTTTGAATATGATGCAAATATTTTCAATGATGTGGAACCATTAATCATGGAATGTA
TTGCCTTTCTAAAGAAATCGTGTATAGTTGGATGCTACTGATAAATCTTGCACTTAAGATATAAAGCCCAAATATCAGGTACAAACTTATAGGAATTCAAGAGGGTGCCACTGTCAGGACACATCCCTCCTCTCTCTTTTGACTGGCTCTCTTCTGGTACAAGGGGGGTATTCCTAATAGGATTTGCGAAAATGTAGGTC
AATAAGGTTCAAGGTGAGCTGGAAATTATCTTAGCAAAACAGAGCTTTAATTTGATTTGATTTAATTAATTCGTGGTTGTTGATGAGGTTAAGAGTCTAAGACTAGTGCCAAAATCTCCAAGGGCATATGGGGTTGATATGAGGCTTTATGAGGGCTGGAAATGAGTGCAAAATGAAAGTAATCCATGATTCCATGCTGT
AAATACATACAGAAATCACAGTGGCGGCAGATCTATATAGCTAGAATCAATGTTTTAGGGTTCTTTAGGGGGGGTACTCCTGAGTCCTAGTTATGCATATACTAGACCATGCCTGTTGGGAGCGCGAGCGAAAAGCGAAAATTTCAAAAGCTTCCGTTTTGGGAATGTTTTTTATATAATGCATATTTTAATATATTTTC
Intron 5 GTAAGTGTTT ... CTTCTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 23.08 | 40 | 15 | 9 |
| A2 | 21.54 | 51 | 10 | 18 |
| A3 | 19.72 | 57 | 8 | 20 |
| A4 | 24.41 | 48 | 15 | 16 |
| A5 | 33.33 | 14 | 7 | 7 |
| A6 | 17.95 | 32 | 5 | 9 |
| A7 | 15.87 | 53 | 4 | 16 |
| A8 | 17.31 | 43 | 3 | 15 |
| A9 | 20 | 42 | 8 | 13 |
| A10 | 17.31 | 43 | 2 | 16 |
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i13 from sample A1 / Example spliced isoformATTATGATAGTTAACGGGGTTTATGAAAACCAAAACCTGACGGGATAAAGGTTCAAACTAGACGTCAAGCGACGGCACTTTAACTTCTTTGTAACTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACAT
CAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTGAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCAT
CGGCACAGTACCGGTTTGGTACATTCGGTAATGAAAGGATGCGAGGTTGATTTGCGTACGCTGTTTTGGTGTCCGTGCAGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGT
GGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATT
TGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTA
TGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGC
TGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATG
CAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAACATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAAGGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCT
TCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGCAGTCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATT
CTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAG
TGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAG
GGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGAT
CTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAAT
ATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGC
TATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGTATACATGCTACTCTCCATTCTCTGATTTGTTCTTTAGTAGATGATTCATTTATTTGTAAATATATTTTTTCTATGTAATGTTGTATGTAATATGGTATTCTTTTTGTTTTTCAATGCAAATTTCATTC
TTGATAAAAACACATGTCATGGATGGGATTGATGTATTATTCATATTGCCAAATTCTATTTCCTTTGCTCTGTAATAGCATTTTTAATGAAACTTCATTACCTATTAATATCTTCTCCGTCCTTGCCTATTTCTATGCATTGAATTGAATTACAGGTATCCCTGAACATTGAAACTGTTATCTTAGATTGGGGATTACCA
TTAATTATGTAAGTAAGAAAAACAATATGTTTAAAATTTAAAGACATACATAAACAAGAAATTGTGATCATAGATTGGGGATTACCAATTATTGTCATAAGTAATAAAAACAATATGTTTAAAAAGCTACTTAAGCAAGATTAGCCTAACCTTCTATGTGTCTACACTCTACCCATTGTTTTACTTGACTGTTCCCATAT
ACATCAGTTGGCCAGGGTCTGAGTTATTATTCAAATGTAGTGAGACTCGAGTAGTTGATTAAATTGGCACTCCAATACTCCATTTTTTCTTGCAATAGTAACCTTTTAAACTTTATGGACACCTCAAATCAATTCCTAGAGACAATCCAGTAGTACCTTTATCTATCGAAGTAGGGATTGCTATGGGCTTGTTAGATGAC
AT
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTATGATAGTTAACGGGGTTTATGAAAACCAAAACCTGACGGGATAAAGGTTCAAACTAGACGTCAAGCGACGGCACTTTAACTTCTTTGTAACTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACAT
CAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTGAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCAT
CGGCACAGTACCGGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAA
TATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTAC
CATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCT
TCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTgtaagtgtttagaacccctagtacaagcttttatgttggttttgcacttatggttaatctctgcctgaatgatatcttcattt
cagtttgtataagatttaatatgacttaatatagtctgataaaactattctccttttacatcactttcccacatttttataaaatgcttctaaatctcttatgcctcattggggaggcagaatattacgttggtgtgtcaacttattctgtaaaggtgctggttcatatgtaaaatttattgcatagccattgtaaaatg
actgatggtagtagtgctaggaacctgttaatgaaaatattatcatgggaggccatatgttggtatatggtactaaaattgggtatcaagctattgctgcaagaatgtttgtgctctcatgggattgggtaaaaggaaacccttatgaataaattatttgcagataaagacattctaatctcactgcttcttgcagGAGT
ACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCA
CTTATGGTGAGCATTTCTTTGAGCTTGTGCTCTACTTTTAATTAGTATATATTTTCAGGCAAGCGATAATTTTATTTGAAAGTGTCATTTGAATATTGCCTTACAGTTCTTTTGTCCCCAAAATCACATGTGATTCGTGAGCAAACACACTGGTGATGGCATTGTTTTGTCTCATCCTTTGATGGTAATTGCTTTTAAGG
GCCACAGTAAGGTACTTTGAGAGTTGGGCTGAACATTTACAAAATATATAGTAGGACTAAGTCTTTGAAGAAGGTGTGAAGAATTGGGAAGTTGGCAATTAGGCTGTCATTTTAATCTAAGTCACAATCTCTTGAAATAAGATTAAAAGTAGATATGTTTCAAACATAATTATTCCTCTTGTACAATGCTTATTTCTTAT
TAACGAGATTTATTTTGAATATGATGCAAATATTTTCAATGATGTGGAACCATTAATCATGGAATGTATTGCCTTTCTAAAGAAATCGTGTATAGTTGGATGCTACTGATAAATCTTGCACTTAAGATATAAAGCCCAAATATCAGGTACAAACTTATAGGAATTCAAGAGGGTGCCACTGTCAGGACACATCCCTCCTC
TCTCTTTTGACTGGCTCTCTTCTGGTACAAGGGGGGTATTCCTAATAGGATTTGCGAAAATGTAGGTCAATAAGGTTCAAGGTGAGCTGGAAATTATCTTAGCAAAACAGAGCTTTAATTTGATTTGATTTAATTAATTCGTGGTTGTTGATGAGGTTAAGAGTCTAAGACTAGTGCCAAAATCTCCAAGGGCATATGGG
GTTGATATGAGGCTTTATGAGGGCTGGAAATGAGTGCAAAATGAAAGTAATCCATGATTCCATGCTGTAAATACATACAGAAATCACAGTGGCGGCAGATCTATATAGCTAGAATCAATGTTTTAGGGTTCTTTAGGGGGGGTACTCCTGAGTCCTAGTTATGCATATACTAGACCATGCCTGTTGGGAGCGCGAGCGAA
AAGCGAAAATTTCAAAAGCTTCCGTTTTGGGAATGTTTTTTATATAATGCATATTTTAATATATTTTC
Intron 6 GTCAATTCTA ... TTGTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 72 | 31 | 68.5 | 91 |
| A2 | 57.05 | 53 | 61.5 | 80 |
| A3 | 58.66 | 56 | 48.5 | 111 |
| A4 | 59.26 | 54 | 75.5 | 82 |
| A5 | 57.42 | 27 | 38 | 35 |
| A6 | 59.05 | 28 | 18 | 63 |
| A7 | 59.98 | 46 | 31 | 107 |
| A8 | 60.91 | 24 | 21 | 54 |
| A9 | 59.57 | 29 | 28.5 | 57 |
| A10 | 68.85 | 25 | 40 | 71 |
>TRINITY_DN118412_c0_g1_i18 from sample A2 / Example spliced isoformGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACATCAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTG
AAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCATCGGCACAGTACCGGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGTATACGGATATTTGC
AATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTG
TAAGTGTTTAGAACCCCTAGTACAAGCTTTTATGTTGGTTTTGCACTTATGGTTAATCTCTGCCTGAATGATATCTTCATTTCAGTTTGTATAAGATTTAATATGACTTAATATAGTCTGATAAAACTATTCTCCTTTTACATCACTTTCCCACATTTTTATAAAATGCTTCTAAATCTCTTATGCCTCATTGGGGAGGC
AGAATATTACGTTGGTGTGTCAACTTATTCTGTAAAGGTGCTGGTTCATATGTAAAATTTATTGCATAGCCATTGTAAAATGACTGATGGTAGTAGTGCTAGGAACCTGTTAATGAAAATATTATCATGGGAGGCCATATGTTGGTATATGGTACTAAAATTGGGTATCAAGCTATTGCTGCAAGAATGTTTGTGCTCTC
ATGGGATTGGGTAAAAGGAAACCCTTATGAATAAATTATTTGCAGATAAAGACATTCTAATCTCACTGCTTCTTGCAGGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGAC
CGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGGTGAGCATTTCTTTGAGCTTGTGCTCTACTTTTAATTAGTATATATTTTCAGGCAAGCGATAATTTTATTTGAAAGTGTCATTTGAATATTGCCTTACAGTTCTTTTGTCCC
CAAAATCACATGTGATTCGTGAGCAAACACACTGGTGATGGCATTGTTTTGTCTCATCCTTTGATGGTAATTGCTTTTAAGGGCCACAGTAAGGTACTTTGAGAGTTGGGCTGAACATTTACAAAATATATAGTAGGACTAAGTCTTTGAAGAAGGTGTGAAGAATTGGGAAGTTGGCAATTAGGCTGTCATTTTAATCT
AAGTCACAATCTCTTGAAATAAGATTAAAAGTAGATATGTTTCAAACATAATTATTCCTCTTGTACAATGCTTATTTCTTATTAACGAGATTTATTTTGAATATGATGCAAATATTTTCAATGATGTGGAACCATTAATCATGGAATGTATTGCCTTTCTAAAGAAATCGTGTATAGTTGGATGCTACTGATAAATCTTG
CACTTAAGATATAAAGCCCAAATATCAGGTACAAACTTATAGGAATTCAAGAGGGTGCCACTGTCAGGACACATCCCTCCTCTCTCTTTTGACTGGCTCTCTTCTGGTACAAGGGGGGTATTCCTAATAGGATTTGCGAAAATGTAGGTCAATAAGGTTCAAGGTGAGCTGGAAATTATCTTAGCAAAACAGAGCTTTAA
TTTGATTTGATTTAATTAATTCGTGGTTGTTGATGAGGTTAAGAGTCTAAGACTAGTGCCAAAATCTCCAAGGGCATATGGGGTTGATATGAGGCTTTATGAGGGCTGGAAATGAGTGCAAAATGAAAGTAATCCATGATTCCATGCTGTAAATACATACAGAAATCACAGTGGCGGCAGATCTATATAGCTAGAATCAA
TGTTTTAGGGTTCTTTAGGGGGGGTACTCCTGAGTCCTAGTTATGCATATACTAGACCATGCCTGTTGGGAGCGCGAGCGAAAAGCGAAAATTTCAAAAGCTTCCGTTTTGGGAATGTTTTTTATATAATGCATATTTTAATATATTTTCATGCATATATATTAAAAAAAA
>TRINITY_DN118412_c0_g1_i17 from sample A2 / Example unspliced isoform:GAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACATCAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTG
AAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCATCGGCACAGTACCGGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGgtcaattctaaatat
aacagagtattgcaaagatccatagatgccatctttgtggttgactttattttgaggaaattctgcagaagtcctcccagaaatgatttgacggaggaaaggaatatttaaataccttgagaagccatgaatattgcagctctgttgacttctgcgggtgttaacataggcatatgcatattatttttctgtctgtattc
catcttgagaaaacagcccgtcaattttaatgtttatttgcctggtaagattgcagaagaacaacataggaagaaaaattcttttagtttagagaggctagtaccatcggctagttggattaaggaggcatgggaagcatcggaagaggatattctggaagtagctggcttagatgctgtggtcttcctcaggatttttg
ttttcagTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGTTAGGTGCTAGTTTTGTTTTCTGTGATTCTTTAACAAGTGAT
TGAGATTGGATTTATGTCATATTTATTCTCATTACAGATTTCCCTTCTATGTTAGAACTTGAAGGCAATCTTGTTGTATACCTAACCATGATATTTATTATGTTGTTAGGTTCTATGTACATGAGATGTTGTAAATAAGCCCATAATGTTGGAATGATGTTTTAATCCTTGGTTATTATATTCCAATGATTATAAAATGC
CACTTTTGTAACTGTTAACCCCCAGATTGTTTACGCAATTGGAGGGTTAAGTTCTAGCTTGATTTCATCCTGTTGGTCCATTTATAGCTACATACGAGGTTTCACATATTTTAATGCCTTCTACAGAATCAGTATTAG
Intron 7 GCTGCATGTA ... TTTCGTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25.4 | 47 | 22 | 10 |
| A2 | 28.3 | 38 | 21 | 9 |
| A3 | 30.43 | 24 | 17 | 4 |
| A4 | 28.16 | 37 | 23 | 6 |
| A5 | 30.56 | 25 | 10 | 12 |
| A6 | 33.33 | 18 | 16 | 2 |
| A7 | 25 | 33 | 16 | 6 |
| A8 | 25.71 | 13 | 7 | 2 |
| A9 | 27.27 | 28 | 13 | 8 |
| A10 | 24.14 | 11 | 7 | 0 |
>TRINITY_DN40775_c7_g1_i6 from sample A8 / Example spliced isoformTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACATCAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCT
GAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCATCGGCACAGTACCGGTTTGGTACATTCGGTAATGAAAGGATGCGAGGTTGATTTGCGTACGCTGTTTTGGTGTCCGTGCAGCTTTTTCAAATAATA
TGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATA
TTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGG
GAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGC
AAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCT
TGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATGCAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAACATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAAGGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCA
AAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCTTCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGCAATCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACC
AGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATTCTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGACATTTG
CAAGTCAAATCATCACTGGCTACCTTCCTAGTGTTATTCTCCAATTATTTCTGTATGCTATTCCACCCATAATGATGTTGTTTTCAGCCATCCAAGGTTCGGTGTCATATAGTGGAAAGAAAAAGAGTGCATGTGCCAAAATGCTCTACTTCACAGTTTGGAATGTGTTCTTCGTAAATGTTTTATCTGGAACGGTCATC
AACCAACTCAATAACATCATTTCCAGCCCTAAAGACTTACCCAGGCAGCTTGCAAAAGCAATACCTGGACAGGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAGTGGCAATTCAACGGA
CTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAGGGCAGTATTGGCCAG
TTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGATCTAATAAATAAGGAC
AGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGA
GATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGA
ACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGAAGGAGCTTCTAAATTATGTACGATTCAGTATTTGCCGACCAAAGAATATAATAGAGATCCATAGATACAAGGGCGTTAACGCGGGTTGCCTAGAATTAGAGAAGATGGGAGGTGATTTCCTGTATTCCTGGGGAATAAGCGTG
GCTGAACTACATGGTCAAGCAAAGGCCAGCGAAACAAAAGGGAATCTAAAAACGGCGACTAGCTCACTTTTAAGAGAAAGCATGGGTACCTTCGAATCAGTGCAGAATCGGTATTCTAGAAAAGAATTTGTATTGGAGAGACTGCTTGTAAAGAGGGGTGTGCGTAATCTTTCCACATTAATAAAAATTGTAAGCCATGG
GTGGTTTATGGAATTATTCATATAAAAGATTTGCCAATTTGGAAGTTGGTTTTGGGTGCAAGTCTTTGGATTGTTGTGGTAATATCCTTCCTCATTTTGGTACTAACATCACATACCAGTGTCCTTGTGTTTTGTCGATTCCCTTTATTTGTGGTTATCTTTATTTTTAATTGTTTAAATGCAAGCTTCATAGCATACGT
AATCATTTTGG
>TRINITY_DN40775_c7_g1_i11 from sample A8 / Example unspliced isoform:TGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACATCAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCT
GAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCATCGGCACAGTACCGGgctgcatgtatttttccaaaaagggctaaatacaaagaatctggttaaatttcgtccagTTTGGTACATTCGGTAATGAAA
GGATGCGAGGTTGATTTGCGTACGCTGTTTTGGTGTCCGTGCAGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCC
TCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGA
AAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCA
AAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCC
TCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATGCAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAAC
ATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAAGGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCTTCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCA
GTTGCTGCACAGGTTCGGCAATCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATTCTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACA
GTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGACATTTGCAAGTCAAATCATCACTGGCTACCTTCCTAGTGTTATTCTCCAATTATTTCTGTATGCTATTCCACCCATAATGATGTTGTTTTCAGCCATCCAAGGTTCGGTGTCATATAGTGGAAAGAAAAAGAGTGCATGTGCCAAAA
TGCTCTACTTCACAGTTTGGAATGTGTTCTTCGTAAATGTTTTATCTGGAACGGTCATCAACCAACTCAATAACATCATTTCCAGCCCTAAAGACTTACCCAGGCAGCTTGCAAAAGCAATACCTGGACAGGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTA
TTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAGTGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCG
TAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAGGGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCA
GGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGATCTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGC
TTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCA
TCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGAAGGAGCTTCTAAATTATGTACGATTCAGTATTTGCCGACCAAAGAATATAATAGAGATCCATAGATACAAGGGCGTTAACGCGG
GTTGCCTAGAATTAGAGAAGATGGGAGGTGATTTCCTGTATTCCTGGGGAATAAGCGTGGCTGAACTACATGGTCAAGCAAAGGCCAGCGAAACAAAAGGGAATCTAAAAACGGCGACTAGCTCACTTTTAAGAGAAAGCATGGGTACCTTCGAATCAGTGCAGAATCGGTATTCTAGAAAAGAATTTGTATTGGAGAGA
CTGCTTGTAAAGAGGGGTGTGCGTAATCTTTCCACATTAATAAAAATTGTAAGCCATGGGTGGTTTATGGAATTATTCATATAAAAGATTTGCCAATTTGGAAGTTGGTTTTGGGTGCAAGTCTTTGGATTGTTGTGGTAATATCCTTCCTCATTTTGGTACTAACATCACATACCAGTGTCCTTGTGTTTTGTCGATTC
CCTTTATTTGTGGTTATCTTTATTTTTAATTGTTTAAATGCAAGCTTCATAGCATACGTAATCATTTTGG
Intron 8 GCAAGTGTAT ... TTGGTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 73.24 | 13 | 27.3 | 44 |
| A2 | 64.35 | 16 | 28 | 30 |
| A3 | 93.15 | 2 | 19.5 | 35 |
| A4 | 70.44 | 9 | 15.3 | 28 |
| A5 | 75.93 | 4 | 10.3 | 15 |
| A6 | 65.52 | 15 | 20 | 37 |
| A7 | 72.63 | 19 | 46.5 | 55 |
| A8 | 67.64 | 30 | 45.8 | 80 |
| A9 | 65.81 | 29 | 40.8 | 71 |
| A10 | 75.25 | 14 | 35 | 51 |
>TRINITY_DN41847_c0_g1_i7 from sample A6 / Example spliced isoformAACTTCCAGCTTCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGCAATCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGCAACTTTCTTCATCACTTATAT
TTTGACATCAGGATGGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAGGGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTC
GGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGATCTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTC
TGCATATTTGCATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCA
GATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCA
AGGTATACATGCTACTCTCCATTCTCTGATTTGTTCTTTAGTAGATGATTCATTTATTTGTAAATATATTTTTTCTATGTAATGTTGTATGTAATATGGTATTCTTTTTGTTTTTCAATGCAAATTTCATTCTTGATAAAAACACATGTCATGGATGGGATTGATGTATTATTCATATTGCCAAATTCTATTTCCTTTGC
TCTGTAA
>TRINITY_DN41847_c0_g1_i8 from sample A6 / Example unspliced isoform:CGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACATCAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTGAAATACCTTTAAAGGTCG
GGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCATCGGCACAGTACCGGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGA
TCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCC
CGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATAT
TTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTAC
TTTGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGT
GCAGGCACTTATGCAAGATGCAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAACATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAAGGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAG
AAGCAAAGGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGgcaagtgtatcatcagaactcctacaactattctctctgatttggaatgtttataaacgttgtttctccaagagtggcaattcaacggactatgtgccatcatttccttaccatcaagaaatccctaaagtgctactttttgggcttcttggt
ttcagTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAGGGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGG
GATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGATCTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGTCAAGTTTAAATTCTGCATATTTGC
ATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATAT
AGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGTATACATG
CTACTCTCCATTCTCTGATTTGTTCTTTAGTAGATGATTCATTTATTTGTAAATATATTTTTTCTATGTAATGTTGTATGTAATATGGTATTCTTTTTGTTTTTCAATGCAAATTTCATTCTTGATAAAAACACATGTCATGGATGGGATTGATGTATTATTCATATTGCCAAATTCTATTTCCTTTGCTCTGTAA
Intron 9 GTATGAGAAT ... TTTCGTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
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| A2 | 30.28 | 38 | 23 | 10 |
| A3 | 42.34 | 23.5 | 26.5 | 8 |
| A4 | 36.21 | 37 | 33 | 9 |
| A5 | 34.21 | 25 | 10 | 16 |
| A6 | 40 | 18 | 16 | 8 |
| A7 | 28.26 | 33 | 20 | 6 |
| A8 | 29.73 | 13 | 7 | 4 |
| A9 | 27.27 | 28 | 13 | 8 |
| A10 | 31.25 | 11 | 10 | 0 |
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i13 from sample A1 / Example spliced isoformATTATGATAGTTAACGGGGTTTATGAAAACCAAAACCTGACGGGATAAAGGTTCAAACTAGACGTCAAGCGACGGCACTTTAACTTCTTTGTAACTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACAT
CAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTGAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCAT
CGGCACAGTACCGGTTTGGTACATTCGGTAATGAAAGGATGCGAGGTTGATTTGCGTACGCTGTTTTGGTGTCCGTGCAGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGT
GGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACGGAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATT
TGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGAGAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTA
TGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTTCTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGC
TGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACCATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATG
CAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAACATAATCATCTCTGTCAAGGACAGTCTCAAAGGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCT
TCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGCAGTCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATT
CTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGATATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAG
TGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAAGTGCTACTTTTTGGGCTTCTTGGTTTCAGTTGTTCCGTGGTAGCACCTTTAATTCTACCATTTCTTCTTGTATACTTTTCACTTGGGTACATCATCTACCGTAATCAGATGCTGAACGTATATCGCAGTAAATCTGAGACTGAAG
GGCAGTATTGGCCAGTTATGCATACCAGTACCATATTTTCATTGATTCTGATGCAAATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGAT
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ATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAGAAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGC
TATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCAGTTGTATTTTGCAAGGTATACATGCTACTCTCCATTCTCTGATTTGTTCTTTAGTAGATGATTCATTTATTTGTAAATATATTTTTTCTATGTAATGTTGTATGTAATATGGTATTCTTTTTGTTTTTCAATGCAAATTTCATTC
TTGATAAAAACACATGTCATGGATGGGATTGATGTATTATTCATATTGCCAAATTCTATTTCCTTTGCTCTGTAATAGCATTTTTAATGAAACTTCATTACCTATTAATATCTTCTCCGTCCTTGCCTATTTCTATGCATTGAATTGAATTACAGGTATCCCTGAACATTGAAACTGTTATCTTAGATTGGGGATTACCA
TTAATTATGTAAGTAAGAAAAACAATATGTTTAAAATTTAAAGACATACATAAACAAGAAATTGTGATCATAGATTGGGGATTACCAATTATTGTCATAAGTAATAAAAACAATATGTTTAAAAAGCTACTTAAGCAAGATTAGCCTAACCTTCTATGTGTCTACACTCTACCCATTGTTTTACTTGACTGTTCCCATAT
ACATCAGTTGGCCAGGGTCTGAGTTATTATTCAAATGTAGTGAGACTCGAGTAGTTGATTAAATTGGCACTCCAATACTCCATTTTTTCTTGCAATAGTAACCTTTTAAACTTTATGGACACCTCAAATCAATTCCTAGAGACAATCCAGTAGTACCTTTATCTATCGAAGTAGGGATTGCTATGGGCTTGTTAGATGAC
AT
>TRINITY_DN121457_c6_g1_i24 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATTATGATAGTTAACGGGGTTTATGAAAACCAAAACCTGACGGGATAAAGGTTCAAACTAGACGTCAAGCGACGGCACTTTAACTTCTTTGTAACTGAACGTTCTCGAAACTCCCGGCCATGGACGATCATAGCTTATGGCAACAAATCATTTATTGCTTTAAACCAAAACCTGACGGCATAAAAGTTCAAACTAGACAT
CAAGCGACGGTACTTTTAAATTTCTTTTCAACCGAACGCCCTAGAAACTCCCGGCCATGGACGAACAAAACTTATGCAACAAATAATTTATTGCTGAAATACCTTTAAAGGTCGGGTTTGCAGCTCGAATTAGCCAAAGGGAGCACCGTAGACGGAGTTGTCTGAATCTATTTGATGCTTGTGCAAATTTTCAGAAGCAT
CGGCACAGTACCGGgtatgagaatgcttaaatatggcaactgagtgttaactttgaaaatttcagtattctgcgtttattagcagacgttcgtttctcaggctgcatgtatttttccaaaaagggctaaatacaaagaatctggttaaatttcgtccagTTTGGTACATTCGGTAATGAAAGGATGCGAGGTTGATTTGC
GTACGCTGTTTTGGTGTCCGTGCAGCTTTTTCAAATAATATGCATTCTGATGGAGCTTAAAAATAGCTGAAAGCGTGTATCTGGCATTCTAGGTCAATTCTAAATATAACAGAGTATTGCAAAGATCCATAGATGCCATCTTTGTGGTTGACTTTATTTTGAGGAAATTCTGCAGAAGTCCTCCCAGAAATGATTTGACG
GAGGAAAGGAATATTTAAATACCTTGAGAAGCCATGAATATTGCAGCTCTGTTGACTTCTGCGGGTGTTAACATAGGCATATGCATATTATTTTTCTGTCTGTATTCCATCTTGAGAAAACAGCCCGTCAATTTTAATGTTTATTTGCCTGGTAAGATTGCAGAAGAACAACATAGGAAGAAAAATTCTTTTAGTTTAGA
GAGGCTAGTACCATCGGCTAGTTGGATTAAGGAGGCATGGGAAGCATCGGAAGAGGATATTCTGGAAGTAGCTGGCTTAGATGCTGTGGTCTTCCTCAGGATTTTTGTTTTCAGTATACGGATATTTGCAATCTCAGCTACTCTATGCATTGCTGTTGTCCTTCCAATGAACTACTTTGCAAAAGAGCACAAAGATATTT
CTCGTCTTTCTTCTATATCACTAGATTTGTTCGCCATAGCAAATGTTCCACCCGGATCTAAAAGGCTCTGGGCACACTTCTTTGCTTTGTATCTTATTTCCTGTGCTACTTGTTGTCTACTTTACTTTGAGTACAAAGGTATTGCTGCAAGGAGGCTGGCCATTTTGGAAGCATCTCAGCCTCAGTCTAAGCACTTCACC
ATTCTCGTTCGCGGCATCCCATTGACACATGAGCATAGCTTGAGTGAGACCGTAGAGCTCTTTTTCACTCGGTACCATCCTTTGACTTATCATTCACATCAAATGATTTATCGAACTGGCAGAGTGCAGGCACTTATGCAAGATGCAGAAAAACTGTATAAAAAGATTGTGCACTTGAAACATAATCATCTCTGTCAAGG
ACAGTCTCAAAGGGAAGGGTCTCTTTGTCTTTGTTGTTCAAAGATAGATCCTGTGAATCTATACACAAAGAAGCTTGAGAACGTCGAGCGTAAGGCTAGGCATGGCCATTCAGAATATTTTGAAGAAGCAAAGGAACTTCCAGCTTCCTTTGTTTCCTTTAAGTCACGATATGGTGCAGCAGTTGCTGCACAGGTTCGGC
AGTCATCCAATCCCATGTTGTGGGTGACAGAGCTGGCACCAGAACCAAGGGATGTTTATTGGTCAAACCTTTCTATAGCTCCTAGACAGCTATGGTTCCGTAGAATTATGATTCTTTTGGGATCTGTTAGCCTTACACTTTCATTCTTTATTCCTGTCACATTTGTACAGGGTCTTTCACAGTTGGACAAATTACAGCGA
TATTTTCCATTCCTGAGAAAAGTGCTGAGAACGCAACTTTCTTCATCACTTATATTTTGACATCAGGATGGGCAAGTGTATCATCAGAACTCCTACAACTATTCTCTCTGATTTGGAATGTTTATAAACGTTGTTTCTCCAAGAGTGGCAATTCAACGGACTATGTGCCATCATTTCCTTACCATCAAGAAATCCCTAAA
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AATAATTGCACTCGGAATATTTGGGATAAAGAAAGTTCCTGTAGCAGCAGGCCTGATGTTACCACTAGTCATGTTTACTCTTCTTTTCAACCAATACTGCAGGCAACGTTTCTATCATACGTTTCAGAATTACTCTGCAGAGGATCTAATAAATAAGGACAGGGAAGATGAGCAAAAGGGGGAAATAGAGAACTTCTTGT
CAAGTTTAAATTCTGCATATTTGCATCCAACTTTGCATCCAATTGAATTGTCAGACATTGAAAAGAATAACAAACAAGTTAGCGTAGCTGTTAAGAGATGCTTGAGGCTTTCTTTGGTGAATCCACCACTCATTGGATCAATAATATCAAGACTTCAGGAGATTGGCACGTGGCTATCAATGGCCCTGGCTTATCAGGAG
AAAAGAGTGTCCAGATAAAGATATAGATATTGTACAGTTTGATGGAAGAGATGTGAATTCGAGCTCACCACAAGATTTGCTTATGTGAAAGTGGGGTTTCATCCTTTGCTTTACTTCTCTTATTTTGTGCTGGCATTGCATTGGCTATATAGATTCTAGAACAAAGAAAGCAGGGACTGCACTTAAGAGTTGCATTGGCA
GTTGTATTTTGCAAGGTATACATGCTACTCTCCATTCTCTGATTTGTTCTTTAGTAGATGATTCATTTATTTGTAAATATATTTTTTCTATGTAATGTTGTATGTAATATGGTATTCTTTTTGTTTTTCAATGCAAATTTCATTCTTGATAAAAACACATGTCATGGATGGGATTGATGTATTATTCATATTGCCAAATT
CTATTTCCTTTGCTCTGTAATAGCATTTTTAATGAAACTTCATTACCTATTAATATCTTCTCCGTCCTTGCCTATTTCTATGCATTGAATTGAATTACAGGTATCCCTGAACATTGAAACTGTTATCTTAGATTGGGGATTACCATTAATTATGTAAGTAAGAAAAACAATATGTTTAAAATTTAAAGACATACATAAAC
AAGAAATTGTGATCATAGATTGGGGATTACCAATTATTGTCATAAGTAATAAAAACAATATGTTTAAAAAGCTACTTAAGCAAGATTAGCCTAACCTTCTATGTGTCTACACTCTACCCATTGTTTTACTTGACTGTTCCCATATACATCAGTTGGCCAGGGTCTGAGTTATTATTCAAATGTAGTGAGACTCGAGTAGT
TGATTAAATTGGCACTCCAATACTCCATTTTTTCTTGCAATAGTAACCTTTTAAACTTTATGGACACCTCAAATCAATTCCTAGAGACAATCCAGTAGTACCTTTATCTATCGAAGTAGGGATTGCTATGGGCTTGTTAGATGACAT