sp|Q9SEX2|KTNA1_ARATH ----> Katanin p60 ATPase-containing subunit A1
Intron 1 GTAAGTTGTT ... TGATTTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 8.26 | 50 | 5 | 4 |
| A2 | 4.41 | 32.6 | 0 | 3 |
| A3 | 13.21 | 26.3 | 2 | 6 |
| A4 | 3.48 | 27.7 | 2 | 0 |
| A5 | 4 | 12 | 0 | 1 |
| A6 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A7 | 0 | 27.3 | 0 | 0 |
| A8 | 0 | 11 | 0 | 0 |
| A9 | 0 | 25.7 | 0 | 0 |
| A10 | 0 | 27.7 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN128281_c2_g2_i8 from sample A1 / Example spliced isoformCCAATCCTGTTTAGAGTGCCGTAATTCCGTTGAGAATCAGAGACCCGCAACCCTTGCAATTCATTTTAGCCTTCCTGTTGATCCGCCGCCTGCTTCGCCTGCCGTGATCTGCCTACCTCTTCTTACTTCAGTGTGGCCACCCGCCAACGGCGAGGGTTTTCTGGCTTATTTTTAGCGATCGGAGCTGAGGTGTGGCTTTA
CTTTTCGTTCAGAGGCTGCCCGGGTTCCTGTTTAGCAAGCGGGTCACATGGCCGAGAGTCTGATGGATGGGAGACTTGATCGAGCTGTATTCCTTGCGCTTGCAGTGGGGATTGCTGCAGGCACAGCTGCTACTATTACCTCAATAGGTTTTCCATATGCTTTTGGTTCTGTCTATACTGCACTTCAAGCCAGAAGAAAA
AGAGAACAGAGAGAACAAAGGAATCGTCTCAAATCAGAAAAGATGAAAAAGACACCACACAAACCAAAAGAATGTCAGATCTATAGAGAGATACTTCAGCGGGCATTGACAAGATGGAAGGATATTGATATTTCACTTGACAATTTTCCCTATTTTCTATCGGATAACACTAAGACTGCGCTATTGGATGCCATGTATGT
GTTTCTCAAGAGGCCAGAGTATATCAAATATGTGTCAAATTTGGTCACCGTTTGTTCTCGAATTCTTTTGACTGGACCACCAGGTTCCGAAATCTATCAGGAGATTCTGGTGAAGGGTTTGGCTCATTATTTGCAGGTTAATATACTGGTGCTTGATTGTACGGATATTCTACTGGAGGCAAGGGAGTTACAGCCCAGTA
ATCTACAGAAAGTAGATCTGTATACAAATGCACCTGTATCACCAAGCAGTGCAAATGGAGAAAATAAATCAAAGGATGTTGTTCCACCGTTAAGAAATAATCGTCAAAACAAGAATCCAGACATGGGACTGAGATCAGTCTACCAGTGGTCGGTGGAGAAGCAACCAAATACTGATCCTGAAGACAAACCTGTGGTGATG
ACGATTCCTCCCCAGTCAATTATAAGTGGGACATCAATGGATTCACCTAGGCGGCTATTCAGAAAGGGTGATAGAGTCAGGTATGTTGGACCAAGTAATGGGTCATCAACATCCAGTTTTGCTGTTTCTGCTCACCGTGGTTCCTCTGGAAGCAAAGGGCCATCAGTTGGTGCCAAAGGTCGAGTAATACTTTTGTTGGA
TGAGAATCCGAATAAAGTTGGAGTCCGGTTTGATAAGCCAGTTTATGGTGGAAACAACATGGTGGATCTTTGTGAAGATGGCTATGGGTATTTTTGCAATGTGTTGGAGCTTCGTTTGGAGCATTCTGTTGGCGAGGATGAGAATAAGACAATGCTTGATGCACTTATTGATGTTTTGAGTAGTGAAGCATCGAAGGACC
CGTTGGTCCTTTATATAAAGGATGTTGAAAGATCAATAATAGGCAACCTGGAACACTACAAGAAATTGGAACAACTGTTCAAAGCAGAGTCTAGGGTTGTCATTATTGGATCTCACACAATGGATTTTCAGAAGGATAAGGGGAATGTGGGTACTTATTCTACATCAAAATCTGGCAATAGTCTTGCTCCTCTTCTAGAC
TTGTCGTTCTTGGATAATTTTATGTCCCGGTTGGATGATATAAAGGGGGAAGGTTCAAAGTCTTCCAGATCTCTCTTCAAGCTTTTTCCTACTAGAATCTATTTACAACAGCCACAGGATGAAAACATGGCCATGGATTGGAACCAACAATTAGAGCAAGACATCGAAAGACTAAAGGCAGAAGCCAATAGGCAACAACT
TCGCATGGTTATGGGATCTTCAGGCATTACATGTAAAGATTTGGCTGAACTTGAAATTAAGAACAACATCTTAACTTATGATATGGCAGAAAAGGTGGTAGGATGGGCTGTAAGCCGCCAGTTGCAGACAGATTTGGAGCCAGTTTTATTCAATGGAAAACTGGTTATAACTGCAGAAAGCATGCAGAATAGCCTTACAG
AGCTTCTATCTGTGCAACGAGCTTCGCCACTTAAAAAATCTTTGAAGGATGTTACATGTGACAATGAGTTCGAGAAAATACTAATATCTGAAGTTATTCCACCTGATGAACTAGGAGTTACTTTTGATTGTATTGGAGCTCTCGACAACGTTAAAGAAGCACTTAGGGAGCTAGTTATGTTGCCATTGCAGCGACCAGAA
CTCTTTGCAAAGGGACAATTACGGAAGGTTTTTACTTTCAGAGATTCCTTACATCAGAATAATATGAAAATTCATACATTATTTGTTTTCATTTTCAACATAAGTGATCTGAGAAAATGTTTTATAAAGGTATATACCAAATTCAATGAAGTCATATGCACTTCTCTTCCAGGTAGTCACATCATTTGAAAGAGGCACAC
AAAATCAGCATTATGAAACTTGTTGCAATGAATAGTTTGTGTAGATATGGTTCACTGTGTTCCTAGATTTGACCCTAAAATGATGCCAGTTATAATGAAATGGCTTGTAAACATTTTGAAACAACTCTTCCAAATCTAGGAGGTTTAACTGTAAGTGACTGA
>TRINITY_DN128281_c2_g2_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:AATAGGCAACAACTTCGCATGGTATGATTTGTATCAGTTTACATTGAGGTGTATCTGTGGTATGCTTGAGTTCTTTGCTGGAAATTTTAACTTGTTTCTATTCTGAATAATTAAATTGCATATGATCAGGTTATGGGATCTTCAGGCATTACATGTAAAGATTTGGCTGAACTTGAAATTAAGAACAACATCTTAACTTA
TGATAgtaagttgttatggaaactaaattcagtatatattcgggaaacctgttgtaactctggccaatgattgttatatgaaattacaacttataatttaattgtttcataatttgttcatggcttactggctattgtttgtgcatgtctaactgattacggatctctatgattttgatttttagTGGCAGAAAAGGTGG
TAGGATGGGCTGTAAGCCGCCAGTTGCAGACAGATTTGGAGCCAGTTTTATTCAATGGAAAACTGGTTATAACTGCAGAAAGGTCAGTGTTTGGTTCTTTTCGAGCAGCATGTGG
Intron 2 GTAAGTTTGG ... GTTTCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.64 | 38 | 7 | 5 |
| A2 | 14.29 | 39 | 3 | 10 |
| A3 | 25.3 | 31 | 13 | 8 |
| A4 | 19.44 | 29 | 9 | 5 |
| A5 | 22.22 | 14 | 5 | 3 |
| A6 | 15 | 17 | 3 | 3 |
| A7 | 11.34 | 43 | 4 | 7 |
| A8 | 15.79 | 40 | 7 | 8 |
| A9 | 20.3 | 53 | 13 | 14 |
| A10 | 20.45 | 35 | 12 | 6 |
>TRINITY_DN105435_c1_g1_i3 from sample A5 / Example spliced isoformATCATAGTTGTACTTTACAAGTGCTGGATTGAAGACGTGCCATGGTTTTTCTTTGCAAACAGAAAAATTATTACGGGGAATGGATTTGATGGTTCAAGAGTAGGATTAAGATGGACTGGTGATGATTGAGTGGATCACCCTCATGACATTGTCTATTTTTACAGGTGATAGAGTCAGGTATGTTGGACCAAGTAATGGGT
CATCAACATCCAGTTTTGCTGTTTCTGCTCACCGTGGTTCCTCTGGAAGCAAAGGGCCATCAGTTGGTGCCAAAGGTCGAGTAATACTTTTGTTGGATGAGAATCCGAATAAAGTTGGAGTCCGGTTTGATAAGCCAGTTTATGGTGGAAACAACATGGTGGATCTTTGTGAAGATGGCTATGGGTATTTTTGCAATGTG
TTGGAGCTTCGTTTGGAGCATTCTGTTGGCGAGGATGAGAATAAGACAATGCTTGATGCACTTATTGATGTTTTGAGTAGTGAAGCATCGAAGGACCCGTTGGTCCTTTATATAAAGGATGTTGAAAGATCAATAATAGGCAACCTGGAACACTACAAGAAATTGGAACAACTGTTCAAAGCAGAGTCTAGGGTTGTCAT
TATTGGATCTCACACAATGGATTTTCAGAAGGATAAGGGGAATGTGGGTACTTATTCTACATCAAAATCTGGCAATAGTCTTGCTCCTCTTCTAGACTTGTCGTTCTTGGATAATTTTATGTCCCGGTTGGATGATATAAAGGGGGAAGGTTCAAAGTCTTCCAGATCTCTCTTCAAGCTTTTTCCTACTAGAATCTATT
TACAACAGCCACAGGATGAAAACATGGCCATGGATTGGAACCAACAATTAGAGCAAGACATCGAAAGACTAAAGGCAGAAGCCAATAGGCAACAACTTCGCATGGTTATGGGATCTTCAGGCATTACATGTAAAGATTTGGCTGAACTTGAAATTAAGAACAACATCTTAACTTATGATATGGCAGAAAAGGTGGTAGGA
TGGGCTGTAAGCCGCCAGTTGCAGACAGATTTGGAGCCAGTTTTATTCAATGGAAAACTGGTTATAACTGCAGAAAGCATGCAGAATAGCCTTACAGAGCTTCTATCTGTGCAACGAGCTTCGCCACTTAAAAAATCTTTGAAGGATGTTACATGTGACAATGAGTTCGAGAAAATACTAATATCTGAAGTTATTCCACC
TGATGAACTAGGAGTTACTTTTGATTGTATTGGAGCTCTCGACAACGTTAAAGAAGCACTTAGGGAGCTAGTTATGTTGCCATTGCAGCGACCAGAACTCTTTGCAAAGGGACAATTACGGAAGCCTTGCAGAGGTCTTCTTTTGTTTGGTCCTCCTGGAACTGGTAAAACAATGCTTGCAAAGGCTGTTGCCACAGAAG
CAGGAGCAAATTTTATAAATATCTCAATGTCAACAGTTGCCTCAAAGTGGTTTGGTGAAGCAGAGAAGTATGTCAAAGCGGTGTTTACTTTAGCTAATAAAATAGCCCCTAGTGTTATTTTTATTGATGAGGTGGACAGCATGCTGGGAAGAAGAGGAAAAGACTCTGAGCATTCTGCTATGCGTAAGCTAAAGAATGAA
TTTATGGCTAGTTGGGATGGTCTCAGGACACGGGATAAGGAACGAGTGCTTGTTCTTGCTGCCACAAACCGTCCATTTGATCTAGATGAGGCAGTCATTCGAAGGTTTCCAAGGAGGTTAATGGTTGATCTTCCAGATGCTGAGAATCGAGTAAAAATCCTCAGGGTCATCCTAGTAGATGAAGACTTGGCACCAGATTT
TAATATAGAGGAACTGGCTGCTGCCACTGATGGCTACTCAGGAAGCGACTTGAAGAGCTTATGCACAACTGCTGCATATCAACGAATCCGTGAGCTATTAGATCAAGAAACTAAGGAGAGAGAGAAAGCAAATTCTGAAGGACAGCCTCCACCTCTAACCTCTAAAACACCTGAACTCCGTCCCATAAGCATGGCTGATA
TGCGGCAAGCCATGGAAAAGGTTCGTTCTAGTGTCTCTTCAGATGCTCGAAGTATTCTTGAATTGCGGCAATGGAATGAGCAGTATGGAGAAGGTGGAACAAGGAAGGTGATGACTTTAAGTTATTTCATGTGAAATAAACTACACCTTCTAAGAGGTAGGAGACATCATGTACTCTGGAGATCATAAATTGTAAATTTT
CAATGGGAGATGATTATGATTTCACTATTTTGGCAAGTGGTTCACAAGAGTTTATTTTTTGAACTTCTGGAAGGTTAGAAGGTTGACCTCTGATACAGGGTGGGTGAACGAGTCATGAAATAAGTGAGATGAGCTTGGCTCTAATAAATGGCTTCTGATCCAAATTGAAGCCCAACAAACTGGGAGAAACTTGTAATGGA
TTCAAATCTCAAGGAAGTGCATACATGTCTGTGGACTTATTGGTTTACAACAAGGTCACGGAAATACATTCTACCTACATGAAAACATCTAGGTGAGTTTATTGGCAGGTGAACAGGCACACTTATGCAAAAAATCTTTAAACACATCTGATTGGGTCCGTAGTAAGGAGTTATATAATTTTGATATCTTTCCGTAGACT
GAATCGTGTTGAGTTATTATTTGCCACATTTCCATTTATGGTGAACTATCTGCATCAGAGCTCTGCTTATAGTCAATTGTATAAAATAAGTGAGGTGAATTATTCCATATTTTTCACATACACGTATTCCATTGATGGTCATGAATTAGTATCAGGTTGTCAGCATTACGGGTAAATATCTGATTCGATTAATGTCTATG
AGGAATGTGTATGTAATCTATAATGTGGTTAAGATAATTAATGTGGCAATGGGCAAATATATATACGACTTTTGCACATCAGCTCAGATGAGCATTTCATGTTGCAGATTTTTATTTACAATCAAGGCTTTAATTATGATATGCTATTTAAATTACTGAAGATATACAGAACATAAGTGGTACTTCTCTATAGGAGAAAA
AACATCAATCCATACCTATGGTTCTATCTCTACGTAAGTTGCCAAAAGTGAATGTCATGG
>TRINITY_DN105435_c1_g1_i10 from sample A5 / Example unspliced isoform:CTATTTAAATATCATCTCCCAACACCAATCCTGTTTAGAGTGCCGTAATTCCGTTGAGAATCAGAGACCCGCAACCCTTGCAATTCATTTTAGCCTTCCTGTTGATCCGCCGCCTGCTTCGCCTGCCGTGATCTGCCTACCTCTTCTTACTTCAGTGTGGCCACCCGCCAACGGCGAGGGTTTTCTGGCTTATTTTTAGC
GATCGGAGCTGAGGTGTGGCTTTACTTTTCGTTCAGAGGCTGCCCGGGTTCCTGTTTAGCAAGCGGGTCACATGGCCGAGAGTCTGATGGATGGGAGACTTGATCGAGCTGTATTCCTTGCGCTTGCAGTGGGGATTGCTGCAGGCACAGCTGCTACTATTACCTCAATAGGTTTTCCATATGCTTTTGGTTCTGTCTAT
ACTGCACTTCAAGCCAGAAGAAAAAGAGAACAGAGAGAACAAAGGAATCGTCTCAAATCAGAAAAGATGAAAAAGACACCACACAAACCAAAAGAATGTCAGATCTATAGAGAGATACTTCAGCGGGCATTGACAAGATGGAAGGATATTGATATTTCACTTGACAATTTTCCCTATTTTCTATCGGATAACACTAAGAC
TGCGCTATTGGATGCCATGTATGTGTTTCTCAAGAGGCCAGAGTATATCAAATATGTGTCAAATTTGGTCACCGTTTGTTCTCGAATTCTTTTGACTGGACCACCAGGTTCCGAAATCTATCAGGAGATTCTGGTGAAGGGTTTGGCTCATTATTTGCAGGTTAATATACTGGTGCTTGATTGTACGGATATTCTACTGG
AGGCAAGGGAGTTACAGCCCAGTAATCTACAGAAAGTAGATCTGTATACAAATGCACCTGTATCACCAAGCAGTGCAAATGGAGAAAATAAATCAAAGGATGTTGTTCCACCGTTAAGAAATAATCGTCAAAACAAGAATCCAGACATGGGACTGAGATCAGTCTACCAGTGGTCGGTGGAGAAGCAACCAAATACTGAT
CCTGAAGACAAACCTGTGGTGATGACGATTCCTCCCCAGTCAATTATAAGTGGGACATCAATGGATTCACCTAGGCGGCTATTCAGAAAGGGTGATAGAGTCAGGTATGTTGGACCAAGTAATGGGTCATCAACATCCAGTTTTGCTGTTTCTGCTCACCGTGGTTCCTCTGGAAGCAAAGGGCCATCAGTTGGTGCCAA
AGGTCGAGTAATACTTTTGTTGGATGAGAATCCGAATAAAGTTGGAGTCCGGTTTGATAAGCCAGTTTATGGTGGAAACAACATGGTGGATCTTTGTGAAGATGGCTATGGGTATTTTTGCAATGTGTTGGAGCTTCGTTTGGAGCATTCTGTTGGCGAGGATGAGAATAAGACAATGCTTGATGCACTTATTGATGTTT
TGAGTAGTGAAGCATCGAAGGACCCGTTGGTCCTTTATATAAAGGATGTTGAAAGATCAATAATAGGCAACCTGGAACACTACAAGAAATTGGAACAACTGTTCAAAGCAGAGTCTAGGGTTGTCATTATTGGATCTCACACAATGGATTTTCAGAAGGATAAGGGGAATGTGGGTACTTATTCTACATCAAAATCTGGC
AATAGTCTTGCTCCTCTTCTAGACTTGTCGTTCTTGGATAATTTTATGTCCCGGTTGGATGATATAAAGGGGGAAGGTTCAAAGTCTTCCAGATCTCTCTTCAAGCTTTTTCCTACTAGAATCTATTTACAACAGCCACAGGATGAAAACATGGCCATGGATTGGAACCAACAATTAGAGCAAGACATCGAAAGACTAAA
GGCAGAAGCCAATAGGCAACAACTTCGCATGGTTATGGGATCTTCAGGCATTACATGTAAAGATTTGGCTGAACTTGAAATTAAGAACAACATCTTAACTTATGATATGGCAGAAAAGGTGGTAGGATGGGCTGTAAGCCGCCAGTTGCAGACAGATTTGGAGCCAGTTTTATTCAATGGAAAACTGGTTATAACTGCAG
AAAGCATGCAGAATAGCCTTACAGAGCTTCTATCTGTGCAACGAGCTTCGCCACTTAAAAAATCTTTGAAGGATGTTACATGTGACAATGAGTTCGAGAAAATACTAATATCTGAAGTTATTCCACCTGATGAACTAGGAGTTACTTTTGATTGTATTGGAGCTCTCGACAACGTTAAAGAAGCACTTAGGGAGCTAGTT
ATGTTGCCATTGCAGCGACCAGAACTCTTTGCAAAGGGACAATTACGGAAGCCTTGCAGAGGTCTTCTTTTGTTTGGTCCTCCTGGAACTGGTAAAACAATGCTTGCAAAGGCTGTTGCCACAGAAGCAGGAGCAAATTTTATAAATATCTCAATGTCAACAGTTGCCTCAAAGTGGTTTGGTGAAGCAGAGAAGTATGT
CAAAGCGGTGTTTACTTTAGCTAATAAAATAGCCCCTAGTGTTATTTTTATTGATGAGgtaagtttggccagtgttcatgtcacatatcacaacaatttttcctttggaatgatatgtttatagttcataatattttcagatgtctcctagaaggctagaatacaatcatcttatgcaatacgactgttttctcatgttt
gttgttaaaatattttgatcaagtagtgtttctgcagGTGGACAGCATGCTGGGAAGAAGAGGAAAAGACTCTGAGCATTCTGCTATGCGTAAGCTAAAGAATGAATTTATGGCTAGTTGGGATGGTCTCAGGACACGGGATAAGGAACGAGTGCTTGTTCTTGCTGCCACAAACCGTCCATTTGATCTAGATGAGGCAG
TCATTCGAAGGTTTCCAAGGAGGTTAATGGTTGATCTTCCAGATGCTGAGAATCGAGTAAAAATCCTCAGGGTCATCCTAGTAGATGAAGACTTGGCACCAGATTTTAATATAGAGGAACTGGCTGCTGCCACTGATGGCTACTCAGGAAGCGACTTGAAGAGCTTATGCACAACTGCTGCATATCAACGAATCCGTGAG
CTATTAGATCAAGAAACTAAGGAGAGAGAGAAAGCAAATTCTGAAGGACAGCCTCCACCTCTAACCTCTAAAACACCTGAACTCCGTCCCATAAGCATGGCTGATATGCGGCAAGCCATGGAAAAGGTTCGTTCTAGTGTCTCTTCAGATGCTCGAAGTATTCTTGAATTGCGGCAATGGAATGAGCAGTATGGAGAAGG
TGGAACAAGGAAGGTGATGACTTTAAGTTATTTCATGTGAAATAAACTACACCTTCTAAGAGGTAGGAGACATCATGTACTCTGGAGATCATAAATTGTAAATTTTCAATGGGAGATGATTATGATTTCACTATTTTGGCAAGTGGTTCACAAGAGTTTATTTTTTGAACTTCTGGAAGGTTAGAAGGTTGACCTCTGAT
ACAGGGTGGGTGAACGAGTCATGAAATAAGTGAGATGAGCTTGGCTCTAATAAATGGCTTCTGATCCAAATTGAAGCCCAACAAACTGGGAGAAACTTGTAATGGATTCAAATCTCAAGGAAGTGCATACATGTCTGTGGACTTATTGGTTTACAACAAGGTCACGGAAATACATTCTACCTACATGAAAACATCTAGGT
GAGTTTATTGGCAGGTGAACAGGCACACTTATGCAAAAAATCTTTAAACACATCTGATTGGGTCCGTAGTAAGGAGTTATATAATTTTGATATCTTTCCGTAGACTGAATCGTGTTGAGTTATTATTTGCCACATTTCCATTTATGGTGAACTATCTGCATCAGAGCTCTGCTTATAGTCAATTGTATAAAATAAGTGAG
GTGAATTATTCCATATTTTTCACATACACGTATTCCATTGATGGTCATGAATTAGTATCAGGTTGTCAGCATTACGGGTAAATATCTGATTCGATTAATGTCTATGAGGAATGTGTATGTAATCTATAATGTGGTTAAGATAATTAATGTGGCAATGGGCAAATATATATACGACTTTTGCACATCAGCTCAGATGAGCA
TTTCATGTTGCAGATTTTTATTTACAATCAAGGCTTTAATTATGATATGCTATTTAAATTACTGAAGATATACAGAACATAAGTGGTACTTCTCTATAGGAGAAAAAACATCAATCCATACCTATGGTTCTATCTCTACGTAAGTTGCCAAAAGTGAATGTCATGG
Intron 3 GTATGTAGTG ... CCTATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 4.15 | 34.8 | 0 | 3 |
| A2 | 13.34 | 48.8 | 0 | 15 |
| A3 | 7.54 | 43.7 | 2 | 5 |
| A4 | 3.61 | 40.2 | 2 | 1 |
| A5 | 23.09 | 28.3 | 8 | 9 |
| A6 | 4.61 | 10.5 | 0 | 1 |
| A7 | 2.79 | 17.5 | 0 | 1 |
| A8 | 10.63 | 16.8 | 0 | 4 |
| A9 | 3.42 | 14.3 | 0 | 1 |
| A10 | 11.8 | 33.7 | 4 | 5 |
>TRINITY_DN105435_c1_g1_i1 from sample A5 / Example spliced isoformCTATTTAAATATCATCTCCCAACACCAATCCTGTTTAGAGTGCCGTAATTCCGTTGAGAATCAGAGACCCGCAACCCTTGCAATTCATTTTAGCCTTCCTGTTGATCCGCCGCCTGCTTCGCCTGCCGTGATCTGCCTACCTCTTCTTACTTCAGTGTGGCCACCCGCCAACGGCGAGGGTTTTCTGGCTTATTTTTAGC
GATCGGAGCTGAGGTGTGGCTTTACTTTTCGTTCAGAGGCTGCCCGGGTTCCTGTTTAGCAAGCGGGTCACATGGCCGAGAGTCTGATGGATGGGAGACTTGATCGAGCTGTATTCCTTGCGCTTGCAGTGGGGATTGCTGCAGGCACAGCTGCTACTATTACCTCAATAGGTTTTCCATATGCTTTTGGTTCTGTCTAT
ACTGCACTTCAAGCCAGAAGAAAAAGAGAACAGAGAGAACAAAGGAATCGTCTCAAATCAGAAAAGATGAAAAAGACACCACACAAACCAAAAGAATGTCAGATCTATAGAGAGATACTTCAGCGGGCATTGACAAGATGGAAGGATATTGATATTTCACTTGACAATTTTCCCTATTTTCTATCGGATAACACTAAGAC
TGCGCTATTGGATGCCATGTATGTGTTTCTCAAGAGGCCAGAGTATATCAAATATGTGTCAAATTTGGTCACCGTTTGTTCTCGAATTCTTTTGACTGGACCACCAGGTTCCGAAATCTATCAGGAGATTCTGGTGAAGGGTTTGGCTCATTATTTGCAGGTTAATATACTGGTGCTTGATTGTACGGATATTCTACTGG
AGGCAAGGGAGTTACAGCCCAGTAATCTACAGAAAGTAGATCTGTATACAAATGCACCTGTATCACCAAGCAGTGCAAATGGAGAAAATAAATCAAAGGATGTTGTTCCACCGTTAAGAAATAATCGTCAAAACAAGAATCCAGACATGGGACTGAGATCAGTCTACCAGTGGTCGGTGGAGAAGCAACCAAATACTGAT
CCTGAAGACAAACCTGTGGTGATGACGATTCCTCCCCAGTCAATTATAAGTGGGACATCAATGGATTCACCTAGGCGGCTATTCAGAAAGGGTGATAGAGTCAGGTATGTTGGACCAAGTAATGGGTCATCAACATCCAGTTTTGCTGTTTCTGCTCACCGTGGTTCCTCTGGAAGCAAAGGGCCATCAGTTGGTGCCAA
AGGTCGAGTAATACTTTTGTTGGATGAGAATCCGAATAAAGTTGGAGTCCGGTTTGATAAGCCAGTTTATGGTGGAAACAACATGGTGGATCTTTGTGAAGATGGCTATGGGTATTTTTGCAATGCTGCCAACGAATCTCTCATGCAGTGTTGGAGCTTCGTTTGGAGCATTCTGTTGGCGAGGATGAGAATAAGACAAT
GCTTGATGCACTTATTGATGTAAGTTTCTTCCAACTCTGTTTTGATAATGTCTCATTTATATTTAGAAAAGGCAGTATTTATGTTTAGAAAATCCCATGCTTATGCTGTTCAATGGTTTGTGGGTGGAAGGTTTTGAGTAGTGAAGCATCGAAGGACCCGTTGGTCCTTTATATAAAGGATGTTGAAAGATCAATAATAG
GCAACCTGGAACACTACAAGAAATTGGAACAACTGTTCAAAGCAGAGTCTAGGGTTGTCATTATTGGATCTCACACAATGGATTTTCAGAAGGATAAGGTATTGTGACATTTCTCTCGAATATATTCTCTGCAAGTGCAAAATGGATAAGATTTTATAGTCAAAAGTAAAACTAATGAAAGGTATATTTAAATGTGTCTA
TACTGCTAATGCAGTGGGATGCCTAGCTGATCCTAGTTATGGAGTAGAATCACTTTTGAAAGTAAAACAAAATGCATCGTGGTGG
>TRINITY_DN105435_c1_g1_i6 from sample A5 / Example unspliced isoform:ATCATAGTTGTACTTTACAAGTGCTGGATTGAAGACGTGCCATGGTTTTTCTTTGCAAACAGAAAAATTATTACGGGGAATGGATTTGATGGTTCAAGAGTAGGATTAAGATGGACTGGTGATGATTGAGTGGATCACCCTCATGACATTGTCTATTTTTACAGGTGATAGAGTCAGGTATGTTGGACCAAGTAATGGGT
CATCAACATCCAGTTTTGCTGTTTCTGCTCACCGTGGTTCCTCTGGgtatgtagtgtatgtaagatggctacttcagtttttagtttttcagataaacagaatagtggctaaatcatgattgttaattctgaagactttatacggattttggcagttgcttgttataaaaatgtttttatgatagcaatgccaaggagca
tattaatttcaaatgatcggcagagtgcatgttttcttatcactattaattattgttttttgaatatctgtcattacctattgcagAAGCAAAGGGCCATCAGTTGGTGCCAAAGGTCGAGTAATACTTTTGTTGGATGAGAATCCGAATAAAGTTGGAGTCCGGTTTGATAAGCCAGTTTATGGTGGAAACAACATGGT
GGATCTTTGTGAAGATGGCTATGGGTATTTTTGCAATGGTATGTCCTCACCTAACATATTCTTCAAAATTTTTAAATTCTCCCACACAACCATAATTTCTCTGTTGCTTCAATGCAAATTAGCATTTTTGATACTACTTTGGCAGTGCATTCCCTTTCTCCCTCTCTCTCTAAGACACAAAC
Intron 4 GTAAGTTTCT ... TGGGTGGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.9 | 41 | 11 | 12 |
| A2 | 21.79 | 60.1 | 9.5 | 24 |
| A3 | 26.41 | 41.7 | 18 | 12 |
| A4 | 25.64 | 57 | 14.5 | 25 |
| A5 | 26.09 | 17 | 7 | 5 |
| A6 | 22.5 | 6 | 2.5 | 1 |
| A7 | 11.69 | 45 | 5 | 7 |
| A8 | 7.35 | 22 | 1.5 | 2 |
| A9 | 13.62 | 22.1 | 2 | 5 |
| A10 | 14.73 | 47.7 | 5.5 | 11 |
>TRINITY_DN118340_c1_g1_i12 from sample A2 / Example spliced isoformTTGAGAATCAGAGACCCGCAACCCTTGCAATTCATTTTAGCCTTCCTGTTGATCCGCCGCCTGCTTCGCCTGCCGTGATCTGCCTACCTCTTCTTACTTCAGTGTGGCCACCCGCCAACGGCGAGGGTTTTCTGGCTTATTTTTAGCGATCGGAGCTGAGGTGTGGCTTTACTTTTCGTTCAGAGGCTGCCCGGGTTCCT
GTTTAGCAAGCGGGTCACATGGCCGAGGGATAACACTAAGACTGCGCTATTGGATGCCATGTATGTGTTTCTCAAGAGGCCAGAGTATATCAAATATGTGTCAAATTTGGTCACCGTTTGTTCTCGAATTCTTTTGACTGGACCACCAGGTTCCGAAATCTATCAGGAGATTCTGGTGAAGGGTTTGGCTCATTATTTGC
AGGTTAATATACTGGTGCTTGATTGTACGGATATTCTACTGGAGGCAAGGGAGTTACAGCCCAGTAATCTACAGAAAGTAGATCTGTATACAAATGCACCTGTATCACCAAGCAGTGCAAATGGAGAAAATAAATCAAAGGATGTTGTTCCACCGTTAAGAAATAATCGTCAAAACAAGAATCCAGACATGGGACTGAGA
TCAGTCTACCAGTGGTCGGTGGAGAAGCAACCAAATACTGATCCTGAAGACAAACCTGTGGTGATGACGATTCCTCCCCAGTCAATTATAAGTGGGACATCAATGGATTCACCTAGGCGGCTATTCAGAAAGGGTGATAGAGTCAGGTATGTTGGACCAAGTAATGGGTCATCAACATCCAGTTTTGCTGTTTCTGCTCA
CCGTGGTTCCTCTGGAAGCAAAGGGCCATCAGTTGGTGCCAAAGGTCGAGTAATACTTTTGTTGGATGAGAATCCGAATAAAGTTGGAGTCCGGTTTGATAAGCCAGTTTATGGTGGAAACAACATGGTGGATCTTTGTGAAGATGGCTATGGGTATTTTTGCAATGCTGCCAACGAATCTCTCATGCAGTGTTGGAGCT
TCGTTTGGAGCATTCTGTTGGCGAGGATGAGAATAAGACAATGCTTGATGCACTTATTGATGTTTTGAGTAGTGAAGCATCGAAGGACCCGTTGGTCCTTTATATAAAGGATGTTGAAAGATCAATAATAGGCAACCTGGAACACTACAAGAAATTGGAACAACTGTTCAAAGCAGAGTCTAGGGTTGTCATTATTGGAT
CTCACACAATGGATTTTCAGAAGGATAAGGGGAATGTGGGTACTTATTCTACATCAAAATCTGGCAATAGTCTTGCTCCTCTTCTAGACTTGTCGTTCTTGGATAATTTTATGTCCCGGTTGGATGATATAAAGGGGGAAGGTTCAAAGTCTTCCAGATCTCTCTTCAAGCTTTTTCCTACTAGAATCTATTTACAACAG
CCACAGGATGAAAACATGGCCATGGATTGGAACCAACAATTAGAGCAAGACATCGAAAGACTAAAGGCAGAAGCCAATAGGCAACAACTTCGCATGGTTATGGGATCTTCAGGCATTACATGTAAAGATTTGGCTGAACTTGAAATTAAGAACAACATCTTAACTTATGATATGGCAGAAAAGGTGGTAGGATGGGCTGT
AAGCCGCCAGTTGCAGACAGATTTGGAGCCAGTTTTATTCAATGGAAAACTGGTTATAACTGCAGAAAGCATGCAGAATAGCCTTACAGAGCTTCTATCTGTGCAACGAGCTTCGCCACTTAAAAAATCTTTGAAGGATGTTACATGTGACAATGAGTTCGAGAAAATACTAATATCTGAAGTTATTCCACCTGATGAAC
TAGGAGTTACTTTTGATTGTATTGGAGCTCTCGACAACGTTAAAGAAGCACTTAGGGAGCTAGTTATGTTGCCATTGCAGCGACCAGAACTCTTTGCAAAGGGACAATTACGGAAGCCTTGCAGAGGTCTTCTTTTGTTTGGTCCTCCTGGAACTGGTAAAACAATGCTTGCAAAGGCTGTTGCCACAGAAGCAGGAGCA
AATTTTATAAATATCTCAATGTCAACAGTTGCCTCAAAGTGGTTTGGTGAAGCAGAGAAGTATGTCAAAGCGGTGTTTACTTTAGCTAATAAAATAGCCCCTAGTGTTATTTTTATTGATGAGGTGGACAGCATGCTGGGAAGAAGAGGAAAAGACTCTGAGCATTCTGCTATGCGTAAGCTAAAGAATGAATTTATGGC
TAGTTGGGATGGTCTCAGGACACGGGATAAGGAACGAGTGCTTGTTCTTGCTGCCACAAACCGTCCATTTGATCTAGATGAGGCAGTCATTCGAAGGTTTCCAAGGAGGTTAATGGTTGATCTTCCAGATGCTGAGAATCGAGTAAAAATCCTCAGGGTCATCCTAGTAGATGAAGACTTGGCACCAGATTTTAATATAG
AGGAACTGGCTGCTGCCACTGATGGCTACTCAGGAAGCGACTTGAAGAGCTTATGCACAACTGCTGCATATCAACGAATCCGTGAGCTATTAGATCAAGAAACTAAGGAGAGAGAGAAAGCAAATTCTGAAGGACAGCCTCCACCTCTAACCTCTAAAACACCTGAACTCCGTCCCATAAGCATGGCTGATATGCGGCAA
GCCATGGAAAAGGTTCGTTCTAGTGTCTCTTCAGATGCTCGAAGTATTCTTGAATTGCGGCAATGGAATGAGCAGTATGGAGAAGGTGGAACAAGGAAGGTGATGACTTTAAGTTATTTCATGTGAAATAAACTACACCTTCTAAGAGGTAGGAGACATCATGTACTCTGGAGATCATAAATTGTAAATTTTCAATGGGA
GATGATTATGATTTCACTATTTTGGCAAGTGGTTCACAAGAGTTTATTTTTTGAACTTCTGGAAGGTTAGAAGGTTGACCTCTGATACAGGGTGGGTGAACGAGTCATGAAATAAGTGAGATGAGCTTGGCTCTAATAAATGGCTTCTGATCCAAATTGAAGCCCAACAAACTGGGAGAAACTTGTAATGGATTCAAATC
TCAAGGAAGTGCATACATGTCTGTGGACTTATTGGTTTACAACAAGGTCACGGAAATACATTCTACCTACATGAAAACATCTAGGTGAGTTTATTGGCAGGTGAACAGGCACACTTATGCAAAAAATCTTTAAACACATCTGATTGGGTCCGTAGTAAGGAGTTATATAATTTTGATATCTTTCCGTAGACTGAATCGTG
TTAAGGAGTTATTATTTGCCACATGTCCATTTATGGTGAACTATCTGCATCAGAGCTCTGCTTATAATCAATTGTATAAAATAAGTGAGGTGAATTATTCCATATTTTTCACATACACGTATTCCATTGATGGTCATGAATTAGTATCAGGTTGTCAGCATTACGGGTAAATATCTGATTCGATTAATGTCTATGAGGAA
TGTGTATGTAATCTATAATGTGGTTAAGATAATTAATGTGGCAATGGGCAAATATATATACGACTTTTGCACATCAGCTCAGATGAGCATTTCATGTTGCAGATTTTTATTTACAATCAAGGCTTTAATTATGATATGCTATTTAAATTACTGAAGATATACAGAACATAAGTGGTACTTCTCTATAGGAGAAAAAACAT
CAATCCATACCTATGGTTCTATCTCTACGTAAGTTGCCAAAAGTGAATGTCATGCCT
>TRINITY_DN118340_c1_g1_i16 from sample A2 / Example unspliced isoform:ATTTATTTTCACACTTTTTCTTATTTATTATTTGATTGTGCCTGGTGATTCTTAGTGTCATATATTGCCTTCAAATAATTCACAGGATGTTGTTCCACCGTTAAGAAATAATCGTCAAAACAAGAATCCAGACATGGGACTGAGATCAGTCTACCAGTGGTCGGTGGAGAAGCAACCAAATACTGATCCTGAAGACAAAC
CTGTGGTGATGACGATTCCTCCCCAGTCAATTATAAGTGGGACATCAATGGATTCACCTAGGCGGCTATTCAGAAAGGGTGATAGAGTCAGGTATGTTGGACCAAGTAATGGGTCATCAACATCCAGTTTTGCTGTTTCTGCTCACCGTGGTTCCTCTGGAAGCAAAGGGCCATCAGTTGGTGCCAAAGGTCGAGTAATA
CTTTTGTTGGATGAGAATCCGAATAAAGTTGGAGTCCGGTTTGATAAGCCAGTTTATGGTGGAAACAACATGGTGGATCTTTGTGAAGATGGCTATGGGTATTTTTGCAATGTGTTGGAGCTTCGTTTGGAGCATTCTGTTGGCGAGGATGAGAATAAGACAATGCTTGATGCACTTATTGATgtaagtttcttccaact
ctgttttgataatgtctcatttatatttagaaaaggcagtatttatgtttagaaaatcccatgcttatgctgttcaatggtttgtgggtggaagGTTTTGAGTAGTGAAGCATCGAAGGACCCGTTGGTCCTTTATATAAAGGATGTTGAAAGATCAATAATAGGCAACCTGGAACACTACAAGAAATTGGAACAACTGT
TCAAAGCAGAGTCTAGGGTTGTCATTATTGGATCTCACACAATGGATTTTCAGAAGGATAAGGTATTGTGACATTTCTCTCGAATATATTCTCTGCAAGTGCAAAATGGATAAGATTTTATAGTCAAAAGTAAAACTAATGAAAGGTATATTTAAATGTGTCTATACTGCTAATGCAGTGGGATGCCTAGCTGATCCTAG
TTATGGAGTAGAATCACTTTTGAAAGTAAAACAAAATGCATCGTGGTGGTCAGATGCTATTTTTTCTATCAAGAACTCACTTGAATGCACTAGCAATGTGAAGACATTCATGGAACATTTTCTTGCTTGTGGCATTTCTCTGCTATTTTACATTTTCTTCTTTTTAGTTCTGGCCTTGTTCGCAATTTACCTGGCAGACG
GCTTGTAATGGAGACATTGCTATGCCTGTATCAGGCAGTGTATTTGTGAGGTGAAATTCTGTTTTTCTTAATGTACTATCCGTTCCAATATGCACTGAGTGTAGTTTCCAGAAGTTTTTCCCCTCTTAAGATATTTTCAGATGCTCATCTCTTCTAGGTCGAGGACCAGTTGGGGAGGTAGTATAGTGTGAATGTTATAA
ATATAAATTATAACGTCCTTGCAGATGGTAGGCT
Intron 5 GTATGATTTG ... ATATGATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 15.61 | 70.2 | 8.5 | 13.5 |
| A2 | 5.83 | 74.9 | 14 | 5 |
| A3 | 7.44 | 31 | 3.5 | 2.5 |
| A4 | 15.18 | 36.9 | 7 | 7 |
| A5 | 14.42 | 14.4 | 0 | 3 |
| A6 | 0 | 4 | 0.5 | 0 |
| A7 | 8.83 | 28 | 3 | 3 |
| A8 | 5.88 | 15 | 1 | 1 |
| A9 | 10 | 24 | 0.5 | 3 |
| A10 | 5 | 27 | 1.5 | 1.5 |
>TRINITY_DN128281_c2_g2_i8 from sample A1 / Example spliced isoformCCAATCCTGTTTAGAGTGCCGTAATTCCGTTGAGAATCAGAGACCCGCAACCCTTGCAATTCATTTTAGCCTTCCTGTTGATCCGCCGCCTGCTTCGCCTGCCGTGATCTGCCTACCTCTTCTTACTTCAGTGTGGCCACCCGCCAACGGCGAGGGTTTTCTGGCTTATTTTTAGCGATCGGAGCTGAGGTGTGGCTTTA
CTTTTCGTTCAGAGGCTGCCCGGGTTCCTGTTTAGCAAGCGGGTCACATGGCCGAGAGTCTGATGGATGGGAGACTTGATCGAGCTGTATTCCTTGCGCTTGCAGTGGGGATTGCTGCAGGCACAGCTGCTACTATTACCTCAATAGGTTTTCCATATGCTTTTGGTTCTGTCTATACTGCACTTCAAGCCAGAAGAAAA
AGAGAACAGAGAGAACAAAGGAATCGTCTCAAATCAGAAAAGATGAAAAAGACACCACACAAACCAAAAGAATGTCAGATCTATAGAGAGATACTTCAGCGGGCATTGACAAGATGGAAGGATATTGATATTTCACTTGACAATTTTCCCTATTTTCTATCGGATAACACTAAGACTGCGCTATTGGATGCCATGTATGT
GTTTCTCAAGAGGCCAGAGTATATCAAATATGTGTCAAATTTGGTCACCGTTTGTTCTCGAATTCTTTTGACTGGACCACCAGGTTCCGAAATCTATCAGGAGATTCTGGTGAAGGGTTTGGCTCATTATTTGCAGGTTAATATACTGGTGCTTGATTGTACGGATATTCTACTGGAGGCAAGGGAGTTACAGCCCAGTA
ATCTACAGAAAGTAGATCTGTATACAAATGCACCTGTATCACCAAGCAGTGCAAATGGAGAAAATAAATCAAAGGATGTTGTTCCACCGTTAAGAAATAATCGTCAAAACAAGAATCCAGACATGGGACTGAGATCAGTCTACCAGTGGTCGGTGGAGAAGCAACCAAATACTGATCCTGAAGACAAACCTGTGGTGATG
ACGATTCCTCCCCAGTCAATTATAAGTGGGACATCAATGGATTCACCTAGGCGGCTATTCAGAAAGGGTGATAGAGTCAGGTATGTTGGACCAAGTAATGGGTCATCAACATCCAGTTTTGCTGTTTCTGCTCACCGTGGTTCCTCTGGAAGCAAAGGGCCATCAGTTGGTGCCAAAGGTCGAGTAATACTTTTGTTGGA
TGAGAATCCGAATAAAGTTGGAGTCCGGTTTGATAAGCCAGTTTATGGTGGAAACAACATGGTGGATCTTTGTGAAGATGGCTATGGGTATTTTTGCAATGTGTTGGAGCTTCGTTTGGAGCATTCTGTTGGCGAGGATGAGAATAAGACAATGCTTGATGCACTTATTGATGTTTTGAGTAGTGAAGCATCGAAGGACC
CGTTGGTCCTTTATATAAAGGATGTTGAAAGATCAATAATAGGCAACCTGGAACACTACAAGAAATTGGAACAACTGTTCAAAGCAGAGTCTAGGGTTGTCATTATTGGATCTCACACAATGGATTTTCAGAAGGATAAGGGGAATGTGGGTACTTATTCTACATCAAAATCTGGCAATAGTCTTGCTCCTCTTCTAGAC
TTGTCGTTCTTGGATAATTTTATGTCCCGGTTGGATGATATAAAGGGGGAAGGTTCAAAGTCTTCCAGATCTCTCTTCAAGCTTTTTCCTACTAGAATCTATTTACAACAGCCACAGGATGAAAACATGGCCATGGATTGGAACCAACAATTAGAGCAAGACATCGAAAGACTAAAGGCAGAAGCCAATAGGCAACAACT
TCGCATGGTTATGGGATCTTCAGGCATTACATGTAAAGATTTGGCTGAACTTGAAATTAAGAACAACATCTTAACTTATGATATGGCAGAAAAGGTGGTAGGATGGGCTGTAAGCCGCCAGTTGCAGACAGATTTGGAGCCAGTTTTATTCAATGGAAAACTGGTTATAACTGCAGAAAGCATGCAGAATAGCCTTACAG
AGCTTCTATCTGTGCAACGAGCTTCGCCACTTAAAAAATCTTTGAAGGATGTTACATGTGACAATGAGTTCGAGAAAATACTAATATCTGAAGTTATTCCACCTGATGAACTAGGAGTTACTTTTGATTGTATTGGAGCTCTCGACAACGTTAAAGAAGCACTTAGGGAGCTAGTTATGTTGCCATTGCAGCGACCAGAA
CTCTTTGCAAAGGGACAATTACGGAAGGTTTTTACTTTCAGAGATTCCTTACATCAGAATAATATGAAAATTCATACATTATTTGTTTTCATTTTCAACATAAGTGATCTGAGAAAATGTTTTATAAAGGTATATACCAAATTCAATGAAGTCATATGCACTTCTCTTCCAGGTAGTCACATCATTTGAAAGAGGCACAC
AAAATCAGCATTATGAAACTTGTTGCAATGAATAGTTTGTGTAGATATGGTTCACTGTGTTCCTAGATTTGACCCTAAAATGATGCCAGTTATAATGAAATGGCTTGTAAACATTTTGAAACAACTCTTCCAAATCTAGGAGGTTTAACTGTAAGTGACTGA
>TRINITY_DN128281_c2_g2_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:AATAGGCAACAACTTCGCATGgtatgatttgtatcagtttacattgaggtgtatctgtggtatgcttgagttctttgctggaaattttaacttgtttctattctgaataattaaattgcatatgatcagGTTATGGGATCTTCAGGCATTACATGTAAAGATTTGGCTGAACTTGAAATTAAGAACAACATCTTAACTTA
TGATAGTAAGTTGTTATGGAAACTAAATTCAGTATATATTCGGGAAACCTGTTGTAACTCTGGCCAATGATTGTTATATGAAATTACAACTTATAATTTAATTGTTTCATAATTTGTTCATGGCTTACTGGCTATTGTTTGTGCATGTCTAACTGATTACGGATCTCTATGATTTTGATTTTTAGTGGCAGAAAAGGTGG
TAGGATGGGCTGTAAGCCGCCAGTTGCAGACAGATTTGGAGCCAGTTTTATTCAATGGAAAACTGGTTATAACTGCAGAAAGGTCAGTGTTTGGTTCTTTTCGAGCAGCATGTGG
Intron 6 GTGGTGGTTG ... AATTTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.65 | 38 | 8 | 13 |
| A2 | 27.54 | 25 | 7 | 12 |
| A3 | 28.89 | 48 | 11 | 28 |
| A4 | 21.74 | 18 | 4 | 6 |
| A5 | 51.72 | 7 | 5 | 10 |
| A6 | 27.45 | 37 | 15 | 13 |
| A7 | 20.55 | 87 | 27 | 18 |
| A8 | 16.83 | 84 | 15 | 19 |
| A9 | 18.71 | 63 | 16 | 13 |
| A10 | 17.29 | 55 | 13 | 10 |
>TRINITY_DN105435_c1_g1_i3 from sample A5 / Example spliced isoformATCATAGTTGTACTTTACAAGTGCTGGATTGAAGACGTGCCATGGTTTTTCTTTGCAAACAGAAAAATTATTACGGGGAATGGATTTGATGGTTCAAGAGTAGGATTAAGATGGACTGGTGATGATTGAGTGGATCACCCTCATGACATTGTCTATTTTTACAGGTGATAGAGTCAGGTATGTTGGACCAAGTAATGGGT
CATCAACATCCAGTTTTGCTGTTTCTGCTCACCGTGGTTCCTCTGGAAGCAAAGGGCCATCAGTTGGTGCCAAAGGTCGAGTAATACTTTTGTTGGATGAGAATCCGAATAAAGTTGGAGTCCGGTTTGATAAGCCAGTTTATGGTGGAAACAACATGGTGGATCTTTGTGAAGATGGCTATGGGTATTTTTGCAATGTG
TTGGAGCTTCGTTTGGAGCATTCTGTTGGCGAGGATGAGAATAAGACAATGCTTGATGCACTTATTGATGTTTTGAGTAGTGAAGCATCGAAGGACCCGTTGGTCCTTTATATAAAGGATGTTGAAAGATCAATAATAGGCAACCTGGAACACTACAAGAAATTGGAACAACTGTTCAAAGCAGAGTCTAGGGTTGTCAT
TATTGGATCTCACACAATGGATTTTCAGAAGGATAAGGGGAATGTGGGTACTTATTCTACATCAAAATCTGGCAATAGTCTTGCTCCTCTTCTAGACTTGTCGTTCTTGGATAATTTTATGTCCCGGTTGGATGATATAAAGGGGGAAGGTTCAAAGTCTTCCAGATCTCTCTTCAAGCTTTTTCCTACTAGAATCTATT
TACAACAGCCACAGGATGAAAACATGGCCATGGATTGGAACCAACAATTAGAGCAAGACATCGAAAGACTAAAGGCAGAAGCCAATAGGCAACAACTTCGCATGGTTATGGGATCTTCAGGCATTACATGTAAAGATTTGGCTGAACTTGAAATTAAGAACAACATCTTAACTTATGATATGGCAGAAAAGGTGGTAGGA
TGGGCTGTAAGCCGCCAGTTGCAGACAGATTTGGAGCCAGTTTTATTCAATGGAAAACTGGTTATAACTGCAGAAAGCATGCAGAATAGCCTTACAGAGCTTCTATCTGTGCAACGAGCTTCGCCACTTAAAAAATCTTTGAAGGATGTTACATGTGACAATGAGTTCGAGAAAATACTAATATCTGAAGTTATTCCACC
TGATGAACTAGGAGTTACTTTTGATTGTATTGGAGCTCTCGACAACGTTAAAGAAGCACTTAGGGAGCTAGTTATGTTGCCATTGCAGCGACCAGAACTCTTTGCAAAGGGACAATTACGGAAGCCTTGCAGAGGTCTTCTTTTGTTTGGTCCTCCTGGAACTGGTAAAACAATGCTTGCAAAGGCTGTTGCCACAGAAG
CAGGAGCAAATTTTATAAATATCTCAATGTCAACAGTTGCCTCAAAGTGGTTTGGTGAAGCAGAGAAGTATGTCAAAGCGGTGTTTACTTTAGCTAATAAAATAGCCCCTAGTGTTATTTTTATTGATGAGGTGGACAGCATGCTGGGAAGAAGAGGAAAAGACTCTGAGCATTCTGCTATGCGTAAGCTAAAGAATGAA
TTTATGGCTAGTTGGGATGGTCTCAGGACACGGGATAAGGAACGAGTGCTTGTTCTTGCTGCCACAAACCGTCCATTTGATCTAGATGAGGCAGTCATTCGAAGGTTTCCAAGGAGGTTAATGGTTGATCTTCCAGATGCTGAGAATCGAGTAAAAATCCTCAGGGTCATCCTAGTAGATGAAGACTTGGCACCAGATTT
TAATATAGAGGAACTGGCTGCTGCCACTGATGGCTACTCAGGAAGCGACTTGAAGAGCTTATGCACAACTGCTGCATATCAACGAATCCGTGAGCTATTAGATCAAGAAACTAAGGAGAGAGAGAAAGCAAATTCTGAAGGACAGCCTCCACCTCTAACCTCTAAAACACCTGAACTCCGTCCCATAAGCATGGCTGATA
TGCGGCAAGCCATGGAAAAGGTTCGTTCTAGTGTCTCTTCAGATGCTCGAAGTATTCTTGAATTGCGGCAATGGAATGAGCAGTATGGAGAAGGTGGAACAAGGAAGGTGATGACTTTAAGTTATTTCATGTGAAATAAACTACACCTTCTAAGAGGTAGGAGACATCATGTACTCTGGAGATCATAAATTGTAAATTTT
CAATGGGAGATGATTATGATTTCACTATTTTGGCAAGTGGTTCACAAGAGTTTATTTTTTGAACTTCTGGAAGGTTAGAAGGTTGACCTCTGATACAGGGTGGGTGAACGAGTCATGAAATAAGTGAGATGAGCTTGGCTCTAATAAATGGCTTCTGATCCAAATTGAAGCCCAACAAACTGGGAGAAACTTGTAATGGA
TTCAAATCTCAAGGAAGTGCATACATGTCTGTGGACTTATTGGTTTACAACAAGGTCACGGAAATACATTCTACCTACATGAAAACATCTAGGTGAGTTTATTGGCAGGTGAACAGGCACACTTATGCAAAAAATCTTTAAACACATCTGATTGGGTCCGTAGTAAGGAGTTATATAATTTTGATATCTTTCCGTAGACT
GAATCGTGTTGAGTTATTATTTGCCACATTTCCATTTATGGTGAACTATCTGCATCAGAGCTCTGCTTATAGTCAATTGTATAAAATAAGTGAGGTGAATTATTCCATATTTTTCACATACACGTATTCCATTGATGGTCATGAATTAGTATCAGGTTGTCAGCATTACGGGTAAATATCTGATTCGATTAATGTCTATG
AGGAATGTGTATGTAATCTATAATGTGGTTAAGATAATTAATGTGGCAATGGGCAAATATATATACGACTTTTGCACATCAGCTCAGATGAGCATTTCATGTTGCAGATTTTTATTTACAATCAAGGCTTTAATTATGATATGCTATTTAAATTACTGAAGATATACAGAACATAAGTGGTACTTCTCTATAGGAGAAAA
AACATCAATCCATACCTATGGTTCTATCTCTACGTAAGTTGCCAAAAGTGAATGTCATGG
>TRINITY_DN105435_c1_g1_i8 from sample A5 / Example unspliced isoform:CATACATACATTTCAGATGGTTTGTCTGTCAAATATAAGTATCCTTTGCTCCCATCTCATCACTATTTTGAGTTTTCATTATATCTTTTTTGTCTATATAGTATTGAAATTTTAATTGTCTTTTAACCAGCATGCAGAATAGCCTTACAGAGCTTCTATCTGTGCAACGAGCTTCGCCACTTAAAAAATCTTTGAAGGAT
GTTACATGTGACAATGAGTTCGAGAAAATACTAATATCTGAAGTTATTCCACCTGATGAACTAGGAGTTACTTTTGATTGTATTGGAGCTCTCGACAACGTTAAAGAAGCACTTAGGGAGCTAGTTATGTTGCCATTGCAGCGACCAGAACTCTTTGCAAAGGGACAATTACGGAAGCCTTGCAGAGGTCTTCTTTTGTT
TGGTCCTCCTGGAACTGGTAAAACAATGCTTGCAAAGGCTGTTGCCACAGAAGCAGGAGCAAATTTTATAAATATCTCAATGTCAACAGTTGCCTCAAAGTGGTTTGGTGAAGCAGAGAAGTATGTCAAAGCGGTGTTTACTTTAGCTAATAAAATAGCCCCTAGTGTTATTTTTATTGATGAGGTGGACAGCATGCTGG
GAAGAAGAGGAAAAGACTCTGAGCATTCTGCTATGCGTAAGCTAAAGAATGAATTTATGGCTAGTTGGGATGGTCTCAGGACACGGGATAAGGAACGAGTGCTTGTTCTTGCTGCCACAAACCGTCCATTTGATCTAGATGAGGCAGTCATTCGAAGGTTTCCAAGGAGGTTAATGGTTGATCTTCCAGATGCTGAGAAT
CGAGTAAAAATCCTCAGGGTCATCCTAGTAGATGAAGACTTGGCACCAGATTTTAATATAGAGGAACTGGCTGCTGCCACTGATGGCTACTCAGGAAGCGACTTGAAGgtggtggttgttgcttatgcattcttatacttttatgttttagagagccaccctccctcttgcgtggagggtgatgctactcattttatgga
actagaactaattgacaagcaagaagcctttagttaccaattatcttgatatttgggctccccgagatctttacttagtatgctacctcgtttcattcatacacagagaatgctaacttggacttcacatctttcaagtaatgctgatgtggtttccaattttacagAGCTTATGCACAACTGCTGCATATCAACGAATC
CGTGAGCTATTAGATCAAGAAACTAAGGAGAGAGAGAAAGCAAATTCTGAAGGACAGCCTCCACCTCTAACCTCTAAAACACCTGAACTCCGTCCCATAAGCATGGCTGATATGCGGCAAGCCATGGAAAAGGTTCGTTCTAGTGTCTCTTCAGATGCTCGAAGTATTCTTGAATTGCGGCAATGGAATGAGCAGTATGG
AGAAGGTGGAACAAGGAAGGTGATGACTTTAAGTTATTTCATGTGAAATAAACTACACCTTCTAAGAGGTAGGAGACATCATGTACTCTGGAGATCATAAATTGTAAATTTTCAATGGGAGATGATTATGATTTCACTATTTTGGCAAGTGGTTCACAAGAGTTTATTTTTTGAACTTCTGGAAGGTTAGAAGGTTGACC
TCTGATACAGGGTGGGTGAACGAGTCATGAAATAAGTGAGATGAGCTTGGCTCTAATAAATGGCTTCTGATCCAAATTGAAGCCCAACAAACTGGGAGAAACTTGTAATGGATTCAAATCTCAAGGAAGTGCATACATGTCTGTGGACTTATTGGTTTACAACAAGGTCACGGAAATACATTCTACCTACATGAAAACAT
CTAGGTGAGTTTATTGGCAGGTGAACAGGCACACTTATGCAAAAAATCTTTAAACACATCTGATTGGGTCCGTAGTAAGGAGTTATATAATTTTGATATCTTTCCGTAGACTGAATCGTGTTGAGTTATTATTTGCCACATTTCCATTTATGGTGAACTATCTGCATCAGAGCTCTGCTTATAGTCAATTGTATAAAATA
AGTGAGGTGAATTATTCCATATTTTTCACATACACGTATTCCATTGATGGTCATGAATTAGTATCAGGTTGTCAGCATTACGGGTAAATATCTGATTCGATTAATGTCTATGAGGAATGTGTATGTAATCTATAATGTGGTTAAGATAATTAATGTGGCAATGGGCAAATATATATACGACTTTTGCACATCAGCTCAGA
TGAGCATTTCATGTTGCAGATTTTTATTTACAATCAAGGCTTTAATTATGATATGCTATTTAAATTACTGAAGATATACAGAACATAAGTGGTACTTCTCTATAGGAGAAAAAACATCAATCCATACCTATGGTTCTATCTCTACGTAAGTTGCCAAAAGTGAATGTCATGG