sp|Q9SZN1|VATB2_ARATH ----> V-type proton ATPase subunit B2


Intron 1 GTATGCCTCT ... TTAATTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A123.861504252
A223.081051350
A323.421393550
A423.4691.32234
A529.41602030
A623.69963231367
A723.97801203302
A823.31972.3231360
A923.32786185293
A1024.17607134253



>TRINITY_DN43005_c10_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform
CGAGGAATGTCTTTCTCCACTTTCAAATTGACAAAACCGATAACCAAATAAAAAATTAAAAAATCCTCTACATACAGCTGGGATAAAGCTACGAAAATATACGTATATATATACATGTATTCCGTGGGCGATTGGGTAATCTCGTATCTGATCTGGGTCCTTCAGCTGACTGAAGAAGCCTCAGCCTCTGTTTCCCAAGA
TCTCTCTGCAAAAGAAATGGTGGCCAAAGGAGATGCCCTGCGGGACTATGAATGCCAGCCCTTGATCGAATATAGAACCGTTTCAGGAGTTGCAGGTCCATTGGTTATTTTGGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAATATCAGGAGATTGTCAACATTAGATTAGGAGATGGCACCACACGTCGAGGTCAGGTTTTGGAAGTTG
ATGGTGAAAGGGCTGTTGTGCAGGTCTTTGAAGGAACGTCAGGAATTGATAATAAGCACACGACAATTCAATTTACTGGAGAGGTTTTGAAGACACCTGTATCTTTGGATATGCTTGGTCGCATATTTAATGGGTCGGGAAAGCCTATAGACAATGGTCCTCCTATATTGCCAGAGGCCTACTGTGACATCTCAGGTAGT
TCCATTAATCCAAGTGAAAGAACCTATCCAGAAGAAATGATCCAAACTGGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTCCATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTTGTT
AGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCATAGTTTTTGCAGCCATGGGAGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCAAGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTG
CGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATTTTGACAGACATGAGCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCTGCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCC
ATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTACCCACCCAATTCCAGATCTAACTGGTTACATTACAGAAGGGCAGATATATATTGACAGGCAACTTCATAATCGACAGATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGAGTGCTATAGGAGAGGGAATGACTCGACGGGATCATGCAGATGTTTC
AAATCAGCTATATGCAAATTATGCCATTGGAAAAGATGTACAAGCAATGAAGGCTGTGGTTGGAGAGGAGGCCTTATCATCAGAGGATCTGCTGTACCTAGAATTCTTGGACAAGTTTGAACGCAAATTTGTCGCACAAGGAGCATATGATACCCGTGACATCTATCAATCCTTGGATCTGGCGTGGACACTTCTACGTA
TCTTCCCAAGGGAGCTTCTCCACCGTATACCTGCAAAGACCTTAGACCTGTTCTACAGCAGAGATTCTGCTCATTGAGTCTTAAGGTTATTTAAGTTTCACCATGTCAGTCTGATTTTTTCTAGGCTTGTATTTTTAAGTGGCCGGATTAAGTTTTGTGGTGTTTTCATTCAAAACACTTCAGTAGAAAAAGGCATAAAT
TATGGTCATCTGACATGAGGCATAATTTCTTGCGTGTATGGGCTTTTCCCTGAGATATTTTTATAATAAATTTGAGGGCTTACGGTGGATCAACTGAACCTCAATTGCTTTTGGATATCGAATTAGTGTTTATGCATTCTTGGGACATATTCTCTTAATTCAAAATGAGATGCACGATCGTTTTGTTCCTGGTCACATTA
TGGGCATGAACATTTCCATAACATATCTGTTTGCCTGTGAATGTTGGTGGTTTTATCTAGTCGAAGATTTATAAATTGTTTAGAACTATATTCGAGGATCAATAGTGGTTGAACTTGTCATTAACCCTGCATAACATATTCTCTTAATTCAAAATG


>TRINITY_DN43005_c10_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GGGTAATCTCGTGTAAATATCGAAGCCCACTAGTACTCTTATCTTGAGCAATTGAGCCATTTGTACTTATTTCACTGTTACGATCAAATTGCTTGTTCATGTTTATGCATCAGATCTGATCTGGGTCCTTCAGCTGACTGAAGAAGCCTCAGCCTCTGTTTCCCAAGATCTCTCTGCAAAAGAAATGGTGGCCAAAGGAG
ATGCCCTGCGGGACTATGAATGCCAGCCCTTGATCGAATATAGAACCGTTTCAGGAGTTGCAGGTCCATTGGTTATTTTGGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAATATCAGGAGATTGTCAACATTAGATTAGGAGATGGCACCACACGTCGAGGTCAGGTTTTGGAAGTTGATGGTGAAAGGGCTGTTGTGCAGGTCTTTGAA
GGAACGTCAGGAATTGATAATAAGCACACGACAATTCAATTTACTGGAGAGGTTTTGAAGACACCTGTATCTTTGGATATGCTTGGTCGCATATTTAATGGGTCGGGAAAGCCTATAGACAATGGTCCTCCTATATTGCCAGAGGCCTACTGTGACATCTCAGGTAGTTCCATTAATCCAAGTGAAAGAACCTATCCAGA
AGAAATGATCCAAACTGGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTCCATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTTGTTAGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCATAG
TTTTTGCAGCCATGGGAGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCAAGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATT
TTGACAGACATGAGCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCTGCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCCATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTACCCA
CCCAATTCCAGATCTAACTGGTTACATTACAGAAGGGCAGATATATATTGACAGGCAACTTCATAATCGACAGATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGAGTGCTATAGGAGAGGGAATGACTCGACGGGATCATGCAGATGTTTCAAATCAGCTATATGCAAATTATGCCATTGGAA
AAGATGTACAAGCAATGAAGGCTGTGGTTGGAGAGGAGGCCTTATCATCAGAGGATCTGgtatgcctctatattttcttgtttcccaaactgattggtatattaagaaattctcgttcatggttctagtttcctttgaggatcttagaagctttacacatatcttatcattagttttgtcctgaagaaacatgtactata
tatatatcgactgcatttatcatggattaggtcactagttctgatatcaattgacacattgttttgaattgctatctacttatcctgtgcatgtttttgtaaaaacggaattaggtaaataatcatggttatttgatgatatctgcagaggtttaaagagtctatttaatgttcccatttcctgttaagaacctacatgc
ggaattgttgatgcattttatttgattttaattgcag
CTGTACCTAGAATTCTTGGACAAGTTTGAACGCAAATTTGTCGCACAAGGAGCATATGATACCCGTGACATCTATCAATCCTTGGATCTGGCGTGGACACTTCTACGTATCTTCCCAAGGGAGCTTCTCCACCGTATACCTGCAAAGACCTTAGACCTGTTCT
ACAGCAGAGATTCTGCTCATTGAGTCTTAAGGTTATTTAAGTTTCACCATGTCAGTCTGATTTTTTCTAGGCTTGTATTTTTAAGTGGCCGGATTAAGTTTTGTGGTGTTTTCATTCAAAACACTTCAGTAGAAAAAGGCATAAATTATGGTCATCTGACATGAGGCATAATTTCTTGCGTGTATGGGCTTTTCCCTGAG
ATATTTTTATAATAAATTTGAGGGCTTACGGTGGATCAACTGAACCTCAATTGCTTTTGGATATCGAATTAGTGTTTATGCATTCTTGGGACATATTCTCTTAATTCAAAATGAGATGCACGATCGTTTTGTTCCTGGTCACATTATGGGCATGAACATTTCCATAACATATCTGTTTGCCTGTGAATGTTGGTGGTTTT
ATCTAGTCGAAGATTTATAAATTGTTTAGAACTATATTCGAGGATCAATAGTGGTTGAACTTGTCATTAACCCTGCATAACATATTCTCTTAATTCAAAATG




Intron 2 GTAATATAAA ... TGTTATACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A120.09179045
A215.57141026
A320.77164043
A424.86130343
A525.4191031
A615.1343061
A718.41390088
A815.71263049
A915.95369070
A1016.85306062



>TRINITY_DN113940_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
TAAATATCGAAGCCCACTAGTACTCTTATCTTGAGCAATTGAGCCATTTGTACTTATTTCACTGTTACGATCAAATTGCTTGTTCATGTTTATGCATCAGATCTGATCTGGGTCCTTCAGCTGACTGAAGAAGCCTCAGCCTCTGTTTCCCAAGATCTCTCTGCAAAAGAAATGGTGGCCAAAGGAGATGCCCTGCGGGA
CTATGAATGCCAGCCCTTGATCGAATATAGAACCGTTTCAGGAGTTGCAGGTCCATTGGTTATTTTGGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAATATCAGGAGATTGTCAACATTAGATTAGGAGATGGCACCACACGTCGAGGTCAGGTTTTGGAAGTTGATGGTGAAAGGGCTGTTGTGCAGGTCTTTGAAGGAACGTCAGGAA
TTGATAATAAGCACACGACAATTCAATTTACTGGAGAGGTTTTGAAGACACCTGTATCTTTGGATATGCTTGGTCGCATATTTAATGGGTCGGGAAAGCCTATAGACAATGGTCCTCCTATATTGCCAGAGGCCTACTGTGACATCTCAGGTAGTTCCATTAATCCAAGTGAAAGAACCTATCCAGAAGAAATGATCCAA
ACTGGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTCCATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTTGTTAGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCATAGTTTTTGCAGCCAT
GGGAGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCAAGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATTTTGACAGACATGA
GCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCTGCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCCATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTACCCACCCAATTCCAGAT
CTAACTGGTTACATTACAGAAGGGCAGATATATATTGACAGGCAACTTCATAATCGACAGATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGAGTGCTATAGGAGAGGGAATGACTCGACGGGATCATGCAGATGTTTCAAATCAGCTATATGCAAATTATGCCATTGGAAAAGATGTACAAGC
AATGAAGGCTGTGGTTGGAGAGGAGGCCTTATCATCAGAGGATCTGCTGTACCTAGAATTCTTGGACAAGTTTGAACGCAAATTTGTCGCACAAGGAGCATATGATACCCGTGACATCTATCAATCCTTGGATCTGGCGTGGACACTTCTACGTATCTTCCCAAGGGAGCTTCTCCACCGTATACCTGCAAAGACCTTAG
ACCTGTTCTACAGCAGAGATTCTGCTCATTGAGTCTTAAGGTTATTTAAGTTTCACCATGTCAGTCTGATTTTTTCTAGGCTTGTATTTTTAAGTGGCCGGATTAAGTTTTGTGGTGTTTTCATTCAAAACACTTCAGTAGAAAAAGGCATAAATTATGGTCATCTGACATGAGGCATAATTTCTTGCGTGTATGGGCTT
TTCCCTGAGATATTTTTATAATAAATTTGAGGGCTTACGGTGGATCAACTGAACCTCAATTGCTTTTGGATATCGAATTAGTGTTTATGCATTCTTGGGACATATTCTCTTAATTCAAAATGAGATGCACGATCGTTTTGTTCCTGGTCACATTATGGGCATGAACATTTCCATAACATATCTGTTTGCCTGTGAATGTT
GGTGGTTTTATCTAGTCGAAGATTTATAAATTGTTTAGAACTATATTCGAGGATCAATAGTGGTTGAACTTGTCATTAACCCTGCATAACATATTCTCTTAATTCAAAATG


>TRINITY_DN113940_c0_g1_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GGCCTACTGTGACATCTCAGgtaatataaaaacggaagaaaaatattctgtcttattatcatctgcaagattgctactatgtttgctttccaagttgttttgattcttttaatttctagaacttcagttattaacttatttccaataaagaatcctataatgtaggaggtagtgttgtgatttttttttcaactatgtaa
tgaaggtttttctgatcatgtacgtgcaagtaacacagacttttgcttatgtgctatttcttgactccttattgtagtatcttctgtaattaaccttaattatgcaagtgttatacag
GTAGTTCCATTAATCCAAGTGAAAGAACCTATCCAGAAGAAATGATCCAAACTGGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTC
CATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTTGTTAGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCATAGTTTTTGCAGCCATGGGAGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCA
AGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATTTTGACAGACATGAGCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCT
GCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCCATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTACCCACCCAATTCCAGATCTAACTGGTTACATTACAGAAGGGCAGATATA
TATTGACAGGCAACTTCATAATCGACAGATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGAGTGCTATAGGAGAGGGAATGACTCGACGGGATCATGCAGATGTTTCAAATCAGCTATATGCAAATTATGCCATTGGAAAAGATGTACAAGCAATGAAGGCTGTGGTTGGAGAGGAGGCCTTAT
CATCAGAGGATCTGCTGTACCTAGAATTCTTGGACAAGTTTGAACGCAAATTTGTCGCACAAGGAGCATATGATACCCGTGACATCTATCAATCCTTGGATCTGGCGTGGACACTTCTACGTATCTTCCCAAGGGAGCTTCTCCACCGTATACCTGCAAAGACCTTAGACCTGTTCTACAGCAGAGATTCTGCTCATTGA
GTCTTAAGGTTATTTAAGTTTCACCATGTCAGTCTGATTTTTTCTAGGCTTGTATTTTTAAGTGGCCGGATTAAGTTTTGTGGTGTTTTCATTCAAAACACTTCAGTAGAAAAAGGCATAAATTATGGTCATCTGACATGAGGCATAATTTCTTGCGTGTATGGGCTTTTCCCTGAGATATTTTTATAATAAATTTGAGG
GCTTACGGTGGATCAACTGAACCTCAATTGCTTTTGGATATCGAATTAGTGTTTATGCATTCTTGGGACATATTCTCTTAATTCAAAATGAGATGCACGATCGTTTTGTTCCTGGTCACATTATGGGCATGAACATTTCCATAACATATCTGTTTGCCTGTGAATGTTGGTGGTTTTATCTAGTCGAAGATTTATAAATT
GTTTAGAACTATATTCGAGGATCAATAGTGGTTGAACTTGTCATTAACCCTGCATAACATATTCTCTTAATTCAAAATG




Intron 3 GTAAATATGC ... GTCTCCACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A112.3999147
A214.1697160
A39.91100112
A417.277166
A515.9174140
A612.95195294
A713.33208320
A815.53136250
A911.45239.7314
A1014.64204350



>TRINITY_DN113940_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
TAAATATCGAAGCCCACTAGTACTCTTATCTTGAGCAATTGAGCCATTTGTACTTATTTCACTGTTACGATCAAATTGCTTGTTCATGTTTATGCATCAGATCTGATCTGGGTCCTTCAGCTGACTGAAGAAGCCTCAGCCTCTGTTTCCCAAGATCTCTCTGCAAAAGAAATGGTGGCCAAAGGAGATGCCCTGCGGGA
CTATGAATGCCAGCCCTTGATCGAATATAGAACCGTTTCAGGAGTTGCAGGTCCATTGGTTATTTTGGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAATATCAGGAGATTGTCAACATTAGATTAGGAGATGGCACCACACGTCGAGGTCAGGTTTTGGAAGTTGATGGTGAAAGGGCTGTTGTGCAGGTCTTTGAAGGAACGTCAGGAA
TTGATAATAAGCACACGACAATTCAATTTACTGGAGAGGTTTTGAAGACACCTGTATCTTTGGATATGCTTGGTCGCATATTTAATGGGTCGGGAAAGCCTATAGACAATGGTCCTCCTATATTGCCAGAGGCCTACTGTGACATCTCAGGTAGTTCCATTAATCCAAGTGAAAGAACCTATCCAGAAGAAATGATCCAA
ACTGGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTCCATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTTGTTAGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCATAGTTTTTGCAGCCAT
GGGAGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCAAGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATTTTGACAGACATGA
GCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCTGCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCCATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTACCCACCCAATTCCAGAT
CTAACTGGTTACATTACAGAAGGGCAGATATATATTGACAGGCAACTTCATAATCGACAGATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGAGTGCTATAGGAGAGGGAATGACTCGACGGGATCATGCAGATGTTTCAAATCAGCTATATGCAAATTATGCCATTGGAAAAGATGTACAAGC
AATGAAGGCTGTGGTTGGAGAGGAGGCCTTATCATCAGAGGATCTGCTGTACCTAGAATTCTTGGACAAGTTTGAACGCAAATTTGTCGCACAAGGAGCATATGATACCCGTGACATCTATCAATCCTTGGATCTGGCGTGGACACTTCTACGTATCTTCCCAAGGGAGCTTCTCCACCGTATACCTGCAAAGACCTTAG
ACCTGTTCTACAGCAGAGATTCTGCTCATTGAGTCTTAAGGTTATTTAAGTTTCACCATGTCAGTCTGATTTTTTCTAGGCTTGTATTTTTAAGTGGCCGGATTAAGTTTTGTGGTGTTTTCATTCAAAACACTTCAGTAGAAAAAGGCATAAATTATGGTCATCTGACATGAGGCATAATTTCTTGCGTGTATGGGCTT
TTCCCTGAGATATTTTTATAATAAATTTGAGGGCTTACGGTGGATCAACTGAACCTCAATTGCTTTTGGATATCGAATTAGTGTTTATGCATTCTTGGGACATATTCTCTTAATTCAAAATGAGATGCACGATCGTTTTGTTCCTGGTCACATTATGGGCATGAACATTTCCATAACATATCTGTTTGCCTGTGAATGTT
GGTGGTTTTATCTAGTCGAAGATTTATAAATTGTTTAGAACTATATTCGAGGATCAATAGTGGTTGAACTTGTCATTAACCCTGCATAACATATTCTCTTAATTCAAAATG


>TRINITY_DN113940_c0_g1_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TCTACATACAGCTGGGATAAAGCTACGAAAATATACGTATATATATACATGTATTCCGTGGGCGATTGGGTAATCTCGTATCTGATCTGGGTCCTTCAGCTGACTGAAGAAGCCTCAGCCTCTGTTTCCCAAGATCTCTCTGCAAAAGAAATGGTGGCCAAAGGAGATGCCCTGCGGGACTATGAATGCCAGCCCTTGAT
CGAATATAGAACCGTTTCAGGAGTTGCAGGTCCATTGGTTATTTTGGAAAAAGTGAAGgtaaatatgcaaaaccatgatcatcttctctttggaatattgtttttatgtacattttttactggtttcgttctctctacttgtttacctaagttgatgtccaggatataagaaagttatctaacaataggttttatatgga
tgagaaatgttgagattcccccagttattactttgtaaaattagtttgacagacccgtataacttagcattgttgttcttttagcttatcataaatcttgggtctccacag
GGTCCAAAATATCAGGAGATTGTCAACATTAGATTAGGAGATGGCACCACACGTCGAGGTCAGGTTTTGGAAGTTGATGGTGAAAGGGC
TGTTGTGCAGGTAATATTGATTTCGATTTAGATCTTTGACTGCTTTCCAAATTGTTACATGCTATGAAATTTACATTATCCTGTTGCTGTAATTCAGTTCTACA




Intron 4 GTAAATATCG ... TATGCATCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A176.1925080
A277.1926788
A380.99273115
A476.9215050
A568.2427058
A679.08502189
A777.6860.35210
A882.8618187
A977.91555194
A1077.69589202



>TRINITY_DN103511_c0_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoform
CCGATAACCAAATAAAAAATTAAAAAATCCTCTACATACAGCTGGGATAAAGCTACGAAAATATACGTATATATATACATGTATTCCGTGGGCGATTGGGTAATCTCGTATCTGATCTGGGTCCTTCAGCTGACTGAAGAAGCCTCAGCCTCTGTTTCCCAAGATCTCTCTGCAAAAGAAATGGTGGCCAAAGGAGATGC
CCTGCGGGACTATGAATGCCAGCCCTTGATCGAATATAGAACCGTTTCAGGAGTTGCAGGTCCATTGGTTATTTTGGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAATATCAGGAGATTGTCAACATTAGATTAGGAGATGGCACCACACGTCGAGGTCAGGTTTTGGAAGTTGATGGTGAAAGGGCTGTTGTGCAGGTCTTTGAAGGAA
CGTCAGGAATTGATAATAAGCACACGACAATTCAATTTACTGGAGAGGTTTTGAAGACACCTGTATCTTTGGATATGCTTGGTCGCATATTTAATGGGTCGGGAAAGCCTATAGACAATGGTCCTCCTATATTGCCAGAGGCCTACTGTGACATCTCAGGTAGTTCCATTAATCCAAGTGAAAGAACCTATCCAGAAGAA
ATGATCCAAACTGGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTCCATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTTGTTAGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCATAGTTTT
TGCAGCCATGGGAGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCAAGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATTTTGA
CAGACATGAGCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCTGCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCCATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTACCCACCCA
ATTCCAGATCTAACTGGTTACATTACAGAAGGGCAGATATATATTGACAGGCAACTTCATAATCGACAGATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGAGTGCTATAGGAGAGGGAATGACTCGACGGGATCATGCAGATGTTTCAAATCAGCTATATGCAAATTATGCCATTGGAAAAGA
TGTACAAGCAATGAAGGCTGTGGTTGGAGAGGAGGCCTTATCATCAGAGGATCTGCTGTACCTAGAATTCTTGGACAAGTTTGAACGCAAATTTGTCGCACAAGGAGCATATGATACCCGTGACATCTATCAATCCTTGGATCTGGCGTGGACACTTCTACGTATCTTCCCAAGGGAGCTTCTCCACCGTATACCTGCAA
AGACCTTAGACCTGTTCTACAGCAGAGATTCTGCTCATTGAGTCTTAAGGTTATTTAAGTTTCACCATGTCAGTCTGATTTTTTCTAGGCTTGTATTTTTAAGTGGCCGGATTAAGTTTTGTGGTGTTTTCATTCAAAACACTTCAGTAGAAAAAGGCATAAATTATGGTCATCTGACATGAGGCATAATTTCTTGCGTG
TATGGGCTTTTCCCTGAGATATTTTTATAATAAATTTGAGGGCTTACGGTGGATCAACTGAACCTCAATTGCTTTTGGATATCGAATTAGTGTTTATGCATTCTTGGGACATATTCTCTTAATTCAAAATGAGATGCACGATCGTTTTGTTCCTGGTCACATTATGGGCATGAACATTTCCATAACATATCTGTTTGCCT
GTGAATGTTGGTGGTTTTATCTAGTCGAAGATTTATAAATTGTTTAGAACTATATTCGAGGATCAATAGTGGTTGAACTTGTCATTAACCCT


>TRINITY_DN103511_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:
ATTGGGTAATCTCGTgtaaatatcgaagcccactagtactcttatcttgagcaattgagccatttgtacttatttcactgttacgatcaaattgcttgttcatgtttatgcatcagATCTGATCTGGGTCCTTCAGCTGACTGAAGAAGCCTCAGCCTCTGTTTCCCAAGATCTCTCTGCAAAAGAAATGGTGGCCAAAG
GAGATGCCCTGCGGGACTATGAATGCCAGCCCTTGATCGAATATAGAACCGTTTCAGGAGTTGCAGGTCCATTGGTTATTTTGGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAATATCAGGAGATTGTCAACATTAGATTAGGAGATGGCACCACACGTCGAGGTCAGGTTTTGGAAGTTGATGGTGAAAGGGCTGTTGTGCAGGTCTTT
GAAGGAACGTCAGGAATTGATAATAAGCACACGACAATTCAATTTACTGGAGAGGTTTTGAAGACACCTGTATCTTTGGATATGCTTGGTCGCATATTTAATGGGTCGGGAAAGCCTATAGACAATGGTCCTCCTATATTGCCAGAGGCCTACTGTGACATCTCAGGTAGTTCCATTAATCCAAGTGAAAGAACCTATCC
AGAAGAAATGATCCAAACTGGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTCCATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTTGTTAGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCA
TAGTTTTTGCAGCCATGGGAGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCAAGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTT
ATTTTGACAGACATGAGCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCTGCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCCATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTAC
CCACCCAATTCCAGATCTAACTGGTTACATTACAGAAGGGCAGATATATATTGACAGGCAACTTCATAATCGACAGATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGAGTGCTATAGGAGAGGGAATGACTCGACGGGATCATGCAGATGTTTCAAATCAGCTATATGCAAATTATGCCATTG
GAAAAGATGTACAAGCAATGAAGGCTGTGGTTGGAGAGGAGGCCTTATCATCAGAGGATCTGCTGTACCTAGAATTCTTGGACAAGTTTGAACGCAAATTTGTCGCACAAGGAGCATATGATACCCGTGACATCTATCAATCCTTGGATCTGGCGTGGACACTTCTACGTATCTTCCCAAGGGAGCTTCTCCACCGTATA
CCTGCAAAGACCTTAGACCTGTTCTACAGCAGAGATTCTGCTCATTGAGTCTTAAGGTTATTTAAGTTTCACCATGTCAGTCTGATTTTTTCTAGGCTTGTATTTTTAAGTGGCCGGATTAAGTTTTGTGGTGTTTTCATTCAAAACACTTCAGTAGAAAAAGGCATAAATTATGGTCATCTGACATGAGGCATAATTTC
TTGCGTGTATGGGCTTTTCCCTGAGATATTTTTATAATAAATTTGAGGGCTTACGGTGGATCAACTGAACCTCAATTGCTTTTGGATATCGAATTAGTGTTTATGCATTCTTGGGACATATTCTCTTAATTCAAAATGAGATGCACGATCGTTTTGTTCCTGGTCACATTATGGGCATGAACATTTCCATAACATATCTG
TTTGCCTGTGAATGTTGGTGGTTTTATCTAGTCGAAGATTTATAAATTGTTTAGAACTATATTCGAGGATCAATAGTGGTTGAACTTGTCATTAACCCT




Intron 5 GTATCTAATG ... TATGACACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A121.3181490
A222.96104312
A318.05109241
A426.3695345
A521.1541113
A623.047152140
A725.955051770
A822.856992070
A924.335101640
A1018.654451020



>TRINITY_DN105598_c1_g1_i4 from sample A4 / Example spliced isoform
GCAGCCTGTAAGTAGCATTTAATTGCGTGTTTGACTGTTATGGAAAAATTCATAAGTAACCTACAGCCAATGCAAAACCGGCTGTAGGTGAAAATCACATTTGTTAACACAAACCAGCAGGCAGTTAAAGGGCAGAAAATTCTATAGGTGGTGTGCACTATGGTTCATGCTTATTAAAAAGTCATCTATTTCTTTTGAGC
AATTAATAATTTAAATCCTGCTAGGAGGTGATTTGCTTATTTAGTACATTGTAGTCTTAGGAAATAGTTTGTTAGGTAATAGTTTCCACCTGTATGAAACTTTTTAAATTTGTAGGTTGCTATCAGACCATTTATATTTTCAATAATTTTTTTTTCTGTCAAATGCACTTTGTTTCACTATATTTTGTGAATATTGCTTT
TTACTTATTTTGATATGCATTTGCAGGTCTTTGAAGGAACGTCAGGAATTGATAATAAGCACACGACAATTCAATTTACTGGAGAGGTTTTGAAGACACCTGTATCTTTGGATATGCTTGGTCGCATATTTAATGGGTCGGGAAAGCCTATAGACAATGGTCCTCCTATATTGCCAGAGGCCTACTGTGACATCTCAGGT
AGTTCCATTAATCCAAGTGAAAGAACCTATCCAGAAGAAATGATCCAAACTGGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTCCATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTT
GTTAGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCATAGTTTTTGCAGCCATGGGAGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCAAGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATC
TTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATTTTGACAGACATGAGCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCTGCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATT
CCCATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTACCCACCCAATTCCAGATCTAACTGGTTACATTACAGAAGGGCAGATATATATTGACAGGCAACTTCATAATCGACAGATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGAGTGCTATAGGAGAGGGAATGACTCGACGGGATCATGCAGATGT
TTCAAATCAGCTATATGCAAATTATGCCATTGGAAAAGATGTACAAGCAATGAAGGCTGTGGTTGGAGAGGAGGCCTTATCATCAGAGGATCTGCTGTACCTAGAATTCTTGGACAAGTTTGAACGCAAATTTGTCGCACAAGGAGCATATGATACCCGTGACATCTATCAATCCTTGGATCTGGCGTGGACACTTCTAC
GTATCTTCCCAAGGGAGCTTCTCCACCGTATACCTGCAAAGACCTTAGACCTGTTCTACAGCAGAGATTCTGCTCATTGAGTCTTAAGGTTATTTAAGTTTCACCATGTCAGTCTGATTTTTTCTAGGCTTGTATTTTTAAGTGGCCGGATTAAGTTTTGTGGTGTTTTCATTCAAAACACTTCAGTAGAAAAAGGCATA
AATTATGGTCATCTGACATGAGGCATAATTTCTTGCGTGTATGGGCTTTTCCCTGAGATATTTTTATAATAAATTTGAGGGCTTACGGTGGATCAACTGAACCTCAATTGCTTTTGGATATCGAATTAGTGTTTATGCATTCTTGGGACATATTCTCTTAATTCAAAATGAGATGCACGATCGTTTTGTTCCTGGTCACA
TTATGGGCATGAACATTTCCATAACATATCTGTTTGCCTGTGAATGTTGGTGGTTTTATCTAGTCGAAGATTTATAAATTGTTTAGAACTATATTCGAGGATCAATAGTGGTTGAACTTGTCATTAACCCTGCAAAACATATTCTCTTAATTCAAAATG


>TRINITY_DN105598_c1_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:
ATATCGAAGCCCACTAGTACTCTTATCTTGAGCAATTGAGCCATTTGTACTTATTTCACTGTTACGATCAAATTGCTTGTTCATGTTTATGCATCAGATCTGATCTGGGTCCTTCAGCTGACTGAAGAAGCCTCAGCCTCTGTTTCCCAAGATCTCTCTGCAAAAGAAATGGTGGCCAAAGGAGATGCCCTGCGGGACTA
TGAATGCCAGCCCTTGATCGAATATAGAACCGTTTCAGGAGTTGCAGGTCCATTGGTTATTTTGGAAAAAGTGAAGGGTCCAAAATATCAGGAGATTGTCAACATTAGATTAGGAGATGGCACCACACGTCGAGGTCAGGTTTTGGAAGTTGATGGTGAAAGGGCTGTTGTGCAGGTCTTTGAAGGAACGTCAGGAATTG
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GGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTCCATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTTGTTAGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCATAGTTTTTGCAGCCATGGG
AGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCAAGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATTTTGACAGACATGAGCT
CATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCTGCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCCATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTACCCACCCAATTCCAGATCTA
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ATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGGTAATCTGCTAGATCTTGATCTTGTATTTTAAATCAGGTTGCTTATATCAAAGAGCTATAAGAGCTCGACCCTCTTCTTTTTTTCTT




Intron 6 GTGAGTTTAT ... TCTTCTGTAG

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>TRINITY_DN113940_c0_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoform
GGCCTACTGTGACATCTCAGGTAATATAAAAACGGAAGAAAAATATTCTGTCTTATTATCATCTGCAAGATTGCTACTATGTTTGCTTTCCAAGTTGTTTTGATTCTTTTAATTTCTAGAACTTCAGTTATTAACTTATTTCCAATAAAGAATCCTATAATGTAGGAGGTAGTGTTGTGATTTTTTTTTCAACTATGTAA
TGAAGGTTTTTCTGATCATGTACGTGCAAGTAACACAGACTTTTGCTTATGTGCTATTTCTTGACTCCTTATTGTAGTATCTTCTGTAATTAACCTTAATTATGCAAGTGTTATACAGGTAGTTCCATTAATCCAAGTGAAAGAACCTATCCAGAAGAAATGATCCAAACTGGGATTTCTACAATAGATGTGATGAACTC
CATTGCCCGTGGTCAGAAGATTCCTCTTTTTTCTGCTGCTGGTTTGCCACATAACGAGATTGCTGCTCAAATTTGCAGACAAGCAGGACTTGTGAAAAGACTGGAACAATCTGAAAATTTGTTAGAGGCTGTTGCAGAAGATAACTTTGCCATAGTTTTTGCAGCCATGGGAGTTAACATGGAAACTGCTCAATTTTTCA
AGCGCGACTTTGAAGAAAATGGGTCAATGGAGAGAGTTACTCTATTTCTGAACTTGGCAAATGATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATTTTGACAGACATGAGCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCT
GCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGACTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCCATTCTGACCATGCCCAATGATGATATTACCCACCCAATTCCAGATCTAACTGGTTACATTACAGAAGGGCAGATATA
TATTGACAGGCAACTTCATAATCGACAGATATACCCACCAATCAATGTTCTTCCATCTCTGTCACGATTGATGAAGAGTGCTATAGGAGAGGGAATGACTCGACGGGATCATGCAGATGTTTCAAATCAGCTATATGCAAATTATGCCATTGGAAAAGATGTACAAGCAATGAAGGCTGTGGTTGGAGAGGAGGCCTTAT
CATCAGAGGATCTGCTGTACCTAGAATTCTTGGACAAGTTTGAACGCAAATTTGTCGCACAAGGAGCATATGATACCCGTGACATCTATCAATCCTTGGATCTGGCGTGGACACTTCTACGTATCTTCCCAAGGGAGCTTCTCCACCGTATACCTGCAAAGACCTTAGACCTGTTCTACAGCAGAGATTCTGCTCATTGA
GTCTTAAGGTTATTTAAGTTTCACCATGTCAGTCTGATTTTTTCTAGGCTTGTATTTTTAAGTGGCCGGATTAAGTTTTGTGGTGTTTTCATTCAAAACACTTCAGTAGAAAAAGGCATAAATTATGGTCATCTGACATGAGGCATAATTTCTTGCGTGTATGGGCTTTTCCCTGAGATATTTTTATAATAAATTTGAGG
GCTTACGGTGGATCAACTGAACCTCAATTGCTTTTGGATATCGAATTAGTGTTTATGCATTCTTGGGACATATTCTCTTAATTCAAAATGAGATGCACGATCGTTTTGTTCCTGGTCACATTATGGGCATGAACATTTCCATAACATATCTGTTTGCCTGTGAATGTTGGTGGTTTTATCTAGTCGAAGATTTATAAATT
GTTTAGAACTATATTCGAGGATCAATAGTGGTTGAACTTGTCATTAACCCTGCATAACATATTCTCTTAATTCAAAATG


>TRINITY_DN113940_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AGTTACTCTATTTCTGAACTTGgtgagtttatttggctttaaagctcaaaataatttttgtggttccttgcagccaattcaggtggatggatgagttccttgctgtgaggagaagcttgaaattatacagctatttaaatgatggtcatggaagtttgatctaaagttctactataacagtataatgttctcttctgtag


GCAAAT
GATCCCACCATTGAACGTATTATTACGCCGAGGATTGCTTTGACAACAGCAGAATATCTTGCGTATGAATGTGGAAAGCATGTTTTGGTTATTTTGACAGACATGAGCTCATATGCAGATGCTTTACGTGAAGTGTCTGCAGCTCGTGAAGAAGTTCCTGGTCGCCGTGGTTATCCTGGGTACATGTATACTGA
CTTGGCAACCATTTATGAACGAGCGGGACGTATTGAAGGCCGAAAAGGCTCTATTACTCAGATTCCCATTCTGACCATGCCCAATGATGGTAAGTGCAAACTTGATGTTTCTATTTTGTTCAAAGACACTATTTATATCGTTTTTTTTTAACACTGAAGTACTGTATGTTATTGGATCAGAT