sp|O64764|TRXO1_ARATH ----> Thioredoxin O1, mitochondrial


Intron 1 GTAGTTTTCT ... CTTTTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A19.866427
A253812
A34.554202
A403400
A56.92702
A6031100
A7022200
A8022000
A90.78256.502
A10017600



>TRINITY_DN119856_c12_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform
CACGGCTATATTTTTTATTCTGCTCGATAAATGTTACGGGAGATTCATTTGGTGCCGTTTTCATACTTCCATCTTAAACCCTTTTTGCCCACTGCTACCAGAGGGATTGACTGATTTTCTTGTTGTACAGTTTGTTCATATACCAATTGCATTTAAACGCGATACAAATAAATCCTTCAATCTACTCCTTCGTAATGGGG
TCCAGAGTCCTACAGGCCATTGCTCGTGGGTGCTCACTCAAAACCCAAAATCCCATTCGGTCACTGTATTCATGCTCTGCTGCCACAATTCACTCATCCCCAAACTCTTCTTCAGCTCTTCAATGTCCTGCTTCTCAGATTTGGCAGCACAAGCCATGGAGCCCTTCTTCGGCAAGAACGAGATCTTTATCTGCTTCTTC
AGGCTCGTCAAAAGTTCTTTTAGTGAATTCAGATGCAGAATTTTCAAATGTGCTAAGCAAAGCACAAGATAATCAAGGTCTTGCAATTGCCTACTTTACTGCAACATGGTGTGGGCCATGCCGAGCCATGGCTCCTATTGTTGAGAACTTGAGCACAAGCTATCCGAATGTCACAATTTTGAAACTAGACATAGACCTGG
AAACTCTTTCAAACAGTCTGCAAACTTCAGGAGTCACATCAGTGCCGACCTTTCACTTCTACAAAAATGGGGAAAAAGTTGCAGATCTCGTAGGAGCTGATCCTCACCGCTTGAAGGAAATTGTTGGAAATTTAGCAAAATGATTATTTTCAACTGTTTTCATGCAAATATGCTGAGAAATAATGGAAAACATTAATTTC
AGAGTTGAAACTTGAACAAGGCAAGTCACTAATCCTAGCACCATACCTAGCGGATCTCCATCCTAGTGTGGCAGAAATGACTACTGGATTTTGTTTCTAAGGTCTCATCTAGCCAGCAAGTTTAGAGCTATGTATTATTACATTTAGTTCAATCCTCGATCGCATCAATGGTGGATATGCTGATAATACACCCCAGAGAC
CTTTTAGTCTTTAGCTGTGCACATTGTAGATGGATTTTTACTTTTGATGCTTATCAAAATATTAACTACGTTAAAATTTGTTTAAAGAAATTGATTTTAACTACGTTAAAATTTGTTTAAAGAAATCGATTTAATTGCAGAATTGGCTTCTCCCCCAACCTAAAAGGAGACGAAAAAGAAAATGAACAATATATTTGGTG
GGGTAGGATTAATGTTTGTATTCATGTAAACAGACAGGCATGCACATACTTGCAATTCTATTTGATCAATGAATATACACCGGTATTTTTGTGAAATTTAACACTCACACATAGAAACCCTCTCTGTCACAC


>TRINITY_DN119856_c12_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AAATGTGCTAAGCAAAGCACAAGgtagttttctatgcgtttttagtttggctgagcaagaatggtaggttatatttgaagagagaaggttattagaattgcttgtatctttttgattggggatcattattatttgtagtctgttataaaaaactgagattgtattttgtcatgcttttttcagATAATCAAGGTCTTGCA
ATTGCCTACTTTACTGCAACATGGTGTGGGCCATGTAAGTTTTTTTTTTCTTATAAATTTTGGTTTATGTTGTTCTTGTTGCATGTTTACACATGTGCACTTGTTGTATAGACTAGCACCCTCCATTGCACCCCTTAAAGCATCTTTACATACCAGTAAAGAGAAACCATAGCTGTACTGAGATATTCCACAAGCCCTTT
TTTTTGAAAAATATGCATGTCTGTTACATTAAAAACACATAATTGTGTTAGACCATAATTTGTCTGGATGATGCAATCAACCCCCTTTCCCAACATAAGTGAGCAGAGCCAATGCATCTGCCTTATCTCTTATCTGCATGAAATCACATGTTTTCTGGCTACTATCTATATTGCTAGATCAGTTTTAAGTGCAGCAAACA
CTCCAAGACAAATATTAGGAGAATATTCATTAGAATTTGATCTACGCCTTCTCTTCCAAAGGTAGGCAGTGCTCATTCTGGCTATGATATATGTTGCTAGATCAGCTTTAAATGCAACAAACTCTCTATTACCACCAAAGTTGTACTTAGTTGGATTTTTCAGTGAGTCGCCGAAGTATGAACAAGTCCCTTGTTCATGA
TCATTGTTTAGAAGTCGAGCAGGCCTAGTTTGGGCCCTTTTTAAATTTTTTTGCATGTTCATACCCCACTGGGAATTGTAATAAGTTGATGTAACATGATGAATTTTTGTAACAGAC