NA ----> NA
Intron 1 GTTTTGGCCA ... TAATGTGGAG
Found issues: Low number of reads
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
| A2 | 20 | 2 | 0 | 1 |
| A3 | 37.5 | 5 | 4 | 2 |
| A4 | 75 | 1 | 4 | 2 |
| A5 | 100 | 0 | 2 | 2 |
| A6 | 47.83 | 6 | 5 | 6 |
| A7 | 33.33 | 4 | 1 | 3 |
| A8 | 58.33 | 5 | 6 | 8 |
| A9 | 50 | 5 | 5 | 5 |
| A10 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
>TRINITY_DN24974_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoformATCTGGAGCTCTGATCTCTGTCAACACTCTCTCATCTAATCCCAGCCCCAATCCCAATCCTAATCCACCTGCTTTTTCTGCTGCTGCTGCTGTTTATTTGAGTTCACACTATGACTTGACATGGTGTGATTAGCTGCCACAATGGCAGTGAGTTGAATGCAGAGCTCCGTGTCTTCAGATGGATAGATATGCAATGTTGA
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TGGCAGTGCAGACAGCCCAAATTATTCCGATGCTGAAGATCAGTCATGGCATTCGCAATATACTTCAAATGGCGGAACTTATGATGATGAATATGATTATTCTAATGCTTCCGATCCTGAGATTGCAGGAGTATCAGATCTTGCAAGGCGTTCCCTGTCGGATAGTTCCGATGTAGATCTAGAGAAGGGTCCTGATCACG
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CTGGCTTTTCCATTTCAACATCCCCTCCTGAATTTGGTGGAAGGGATTTCTTAGAGTTTTGATATGTTATGAAGAAAACTGGAATGAACTTGTTACGGTGGCCACCATCTATTTGTGTAAAGTGTGCGAAAATCACATAATAGCACTATATCTTCTCCTGATTGTATTTTAGCTTGGAGAGTTTCAATATAATAAACCAT
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CACCTCTACCTCTAAGTGTGACATGGAGAACATTTTTATTGTTATCAAGGTTTAGGTTCATATTGGCAAAAAATAAATCGCA
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TGTTGGGTTCTTCAAAATCTCGAGCTTTGTATTGGGTGCACACCAGAATCTTGTTGGGTTTTCCTGGTTCAACTCGGATTTTCTGGGCATTTTGGTACTTCGGCATTGGGCTGTTCCCTATATATCTCATTTTCCCGGGTACCTAGTAAGTATACGGAACATTGCAGCTTGCTCCGTTGCTTCGGCTGAACGTGGCAGGG
ATTAATTTGTAATTTTGAGCCATAGCTATCTGGGGGGTACTGTACGGTGAACTTGTTGAGTTTTCTTAAAGTTGCAGTTTGGAGTTGATTTTTTCTTTGACAGTATTGGGTACATCCCAACACATAGCAAATGATAGGAGAACGCTGTTGTAGTTGGGGTATTGGTTGTTGGTTGTGGTCCCTAAGCACACAAACATAGT
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AAAATCAAGGGTAACAgttttggccaaaggcattgcttgcaccttggagacagtacatgtgtgcaccatgttcctgagcacgtatttaattcagcggtaatgtggagGGACTTGTGAAATCTGTGGTTCAACTGCTCGTAATGTTATTGGCATAGAGAATACAGATTTCTTGGACCAATGGAATGAAGGAAGTACTTCCA
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TATTTGTGTAAAGTGTGCGAAAATCACATAATAGCACTATATCTTCTCCTGATTGTATTTTAGCTTGGAGAGTTTCAATATAATAAACCATATCTAATTGGTTTCAGTAGTGGAACAGCCAGGAGTGATTTCAAGATGCTCCAAGCTCAATCCATTACAGTTCGTTCTTGAAAGTAAAAAATTAAAATGGTAACTGAACG
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Intron 2 GTTGCTGATA ... CAGGTCCAAG
Found issues: Low number of reads
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
| A2 | 33.33 | 1 | 0 | 1 |
| A3 | 25 | 3 | 0 | 2 |
| A4 | 33.33 | 2 | 2 | 0 |
| A5 | 50 | 2 | 4 | 0 |
| A6 | 41.18 | 5 | 2 | 5 |
| A7 | 25 | 3 | 0 | 2 |
| A8 | 42.86 | 8 | 5 | 7 |
| A9 | 16.67 | 5 | 0 | 2 |
| A10 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
>TRINITY_DN24974_c0_g1_i3 from sample A6 / Example spliced isoformATCTGGAGCTCTGATCTCTGTCAACACTCTCTCATCTAATCCCAGCCCCAATCCCAATCCTAATCCACCTGCTTTTTCTGCTGCTGCTGCTGTTTATTTGAGTTCACACTATGACTTGACATGGTGTGATTAGCTGCCACAATGGCAGTGAGTTGAATGCAGAGCTCCGTGTCTTCAGATGGATAGATATGCAATGTTGA
TTCAGGCGGTATTTGTGGATTGCTTGCCCTTTGGCATTGATTTAGATTAATGAAGAATAATTTGCGGGTTTCTTCTATACACCACATATTTTGTGTGTTACTGGGGACATTGGGATTGTGTGTTATTGAGCACATTGGGATTGTGTTGATTCTGGAGGCCTGCGGGTTCTTCAGCAGATTAGATTATTTTATTGTAGCCT
TGTTGGGTTCTTCAAAATCTCGAGCTTTGTATTGGGTGCACACCAGAATCTTGTTGGGTTTTCCTGGTTCAACTCGGATTTTCTGGGCATTTTGGTACTTCGGCATTGGGCTGTTCCCTATATATCTCATTTTCCCGGGTACCTAGTAAGTATACGGAACATTGCAGCTTGCTCCGTTGCTTCGGCTGAACGTGGCAGGG
ATTAATTTGTAATTTTGAGCCATAGCTATCTGGGGGGTACTGTACGGTGAACTTGTTGAGTTTTCTTAAAGTTGCAGTTTGGAGTTGATTTTTTCTTTGACAGTATTGGGTACATCCCAACACATAGCAAATGATAGGAGAACGCTGTTGTAGTTGGGGTATTGGTTGTTGGTTGTGGTCCCTAAGCACACAAACATAGT
AAGTGCAAGAAAAAGGAGTAGTTTTGAAGAGAGATGGGGAAATGTGGGTGCTTTTTCAGGCATATTAATGAGTAACACGAAGTTTATAGCCGATTCTGTGATAGCATGGAGAGGACTTCAACTTTTGCAGCTAAAGATGAGTCCAGAAACGTTCCAGTATACGAGCAGGAGGAACCCATGTCGTGTAGACCATCTGTGGA
TGGCAGTGCAGACAGCCCAAATTATTCCGATGCTGAAGATCAGTCATGGCATTCGCAATATACTTCAAATGGCGGAACTTATGATGATGAATATGATTATTCTAATGCTTCCGATCCTGAGATTGCAGGAGTATCAGATCTTGCAAGGCGTTCCCTGTCGGATAGTTCCGATGTAGATCTAGAGAAGGGTCCTGATCACG
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AAAATCAAGGGTAACAGTTTTGGCCAAAGGCATTGCTTGCACCTTGGAGACAGTACATGTGTGCACCATGTTCCTGAGCACGTATTTAATTCAGCGGTAATGTGGAGGGACTTGTGAAATCTGTGGTTCAACTGCTCGTAATGTTATTGGCATAGAGAATACAGATTTCTTGGACCAATGGAATGAAGGAAGTACTTCCA
CTCCAGCACCTACAGAGCCAAGAAATTTTTGGCGTGGGCACCGGTTTCTCAATTTTCTGCTTGCATGCATGGTTTTTGCCTTTGTAATTTCCTGGCTTTTCCATTTCAACATCCCCTCCTGAATTTGGTGGAAGGGATTTCTTAGAGTTTTGATATGTTATGAAGAAAACTGGAATGAACTTGTTACGGTGGCCACCATC
TATTTGTGTAAAGTGTGCGAAAATCACATAATAGCACTATATCTTCTCCTGATTGTATTTTAGCTTGGAGAGTTTCAATATAATAAACCATATCTAATTGGTTTCAGTAGTGGAACAGCCAGGAGTGATTTCAAGATGCTCCAAGCTCAATCCATTACAGTTCGTTCTTGAAAGTAAAAAATTAAAATGGTAACTGAACG
GAGACACTTTGCTCGAGTAGTCTCAAATGCTTTTGCATCCAGGGAGCGTTGTATGACCTCTGTACAGATCTCAGATTGTAGAATCAGTTTCCACCTCTACCTCTAAGTGTGACATGGAGAACATTTTTATTGTTATCAAGGTTTAGGTTCATATTGGCAAAAAATAAATCGCA
>TRINITY_DN24974_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:ATCTGGAGCTCTGATCTCTGTCAACACTCTCTCATCTAATCCCAGCCCCAATCCCAATCCTAATCCACCTGCTTTTTCTGCTGCTGCTGCTGTTTATTTGAGTTCACACTATGACTTGACATGGTGTGATTAGCTGCCACAATGGCAGTGAGTTGAATGCAGAGCTCCGTGTCTTCAGATGGATAGATATGCAATGTTGA
TTCAGGCGGTATTTGTGGATTGCTTGCCCTTTGGCATTGATTTAGATTAATGAAGAATAATTTGCGGGTTTCTTCTATACACCACATATTTTGTGTGTTACTGGGGACATTGGGATTGTGTGTTATTGAGCACATTGGGATTGTGTTGATTCTGGAGGCCTGCGGGTTCTTCAGCAGATTAGATTATTTTATTGTAGCCT
TGTTGGGTTCTTCAAAATCTCGAGCTTTGTATTGGGTGCACACCAGAATCTTGTTGGGTTTTCCTGGTTCAACTCGGATTTTCTGGGCATTTTGGTACTTCGGCATTGGGCTGTTCCCTATATATCTCATTTTCCCGGGTACCTAGTAAGTATACGGAACATTGCAGCTTGCTCCGTTGCTTCGGCTGAACGTGGCAGGG
ATTAATTTGTAATTTTGAGCCATAGCTATCTGGGGGGTACTGTACGGTGAACTTGTTGAGTTTTCTTAAAGTTGCAGTTTGGAGTTGATTTTTTCTTTGACAGTATTGGGTACATCCCAACACATAGCAAATGATAGGAGAACGCTGTTGTAGTTGGGGTATTGGTTGTTGGTTGTGGTCCCTAAGCACACAAACATAGT
AAGTGCAAGAAAAAGGAGTAGTTTTGAAGAGAGATGGGGAAATGTGGGTGCTTTTTCAGGCATATTAATGAGTAACACGAAGTTTATAGCCGATTCTGTGATAGCATGGAGAGGACTTCAACTTTTGCAGCTAAAGATGAGTCCAGAAACGTTCCAGTATACGAGCAGGAGGAACCCATGTCGTGTAGACCATCTGTGGA
TGGCAGTGCAGACAGCCCAAATTATTCCGATGCTGAAGATCAGTCATGGCATTCGCAATATACTTCAAATGGCGGAACTTATGATGATGAATATGATTATTCTAATGCTTCCGATCCTGAGATTGCAGGAGTATCAGATCTTGCAAGGCGTTCCCTGTCGGATAGTTCCGATGTAGATCTAGAGAAGGGTCCTGATCACG
AGGTGAAGGTAGCAGAAGGGAATGCTCCTTCTGAACAAGCGAGGCAATTAGACCGAATTGAGAGTCGGTCCGAGAAGGAGTGTAGAATATGCCATCTTACTCTGGAGACCAACCAAGAGGCTGGGGCATCTATGGTGCTGGGTTGTTCCTGCAAGGCTGATCTGGCTGCTGCTCATAAGCAGTGCGCGGAGGCCTGGTTC
AAAATCAAGGGTAACAGTTTTGGCCAAAGGCATTGCTTGCACCTTGGAGACAGTACATGTGTGCACCATGTTCCTGAGCACGTATTTAATTCAGCGGTAATGTGGAGGgttgctgatatttctgagtttttcaggtccaagGACTTGTGAAATCTGTGGTTCAACTGCTCGTAATGTTATTGGCATAGAGAATACAGATT
TCTTGGACCAATGGAATGAAGGAAGTACTTCCACTCCAGCACCTACAGAGCCAAGAAATTTTTGGCGTGGGCACCGGTTTCTCAATTTTCTGCTTGCATGCATGGTTTTTGCCTTTGTAATTTCCTGGCTTTTCCATTTCAACATCCCCTCCTGAATTTGGTGGAAGGGATTTCTTAGAGTTTTGATATGTTATGAAGAA
AACTGGAATGAACTTGTTACGGTGGCCACCATCTATTTGTGTAAAGTGTGCGAAAATCACATAATAGCACTATATCTTCTCCTGATTGTATTTTAGCTTGGAGAGTTTCAATATAATAAACCATATCTAATTGGTTTCAGTAGTGGAACAGCCAGGAGTGATTTCAAGATGCTCCAAGCTCAATCCATTACAGTTCGTTC
TTGAAAGTAAAAAATTAAAATGGTAACTGAACGGAGACACTTTGCTCGAGTAGTCTCAAATGCTTTTGCATCCAGGGAGCGTTGTATGACCTCTGTACAGATCTCAGATTGTAGAATCAGTTTCCACCTCTACCTCTAAGTGTGACATGGAGAACATTTTTATTGTTATCAAGGTTTAGGTTCATATTGGCAAAAAATAA
ATCGCA