NA ----> NA
Intron 1 GTAGTATTTG ... GGATATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 29.41 | 6 | 2 | 3 |
| A2 | 23.08 | 5 | 2 | 1 |
| A3 | 33.33 | 6 | 6 | 0 |
| A4 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| A5 | 26.32 | 7 | 5 | 0 |
| A6 | 19.51 | 66 | 21 | 11 |
| A7 | 19.15 | 57 | 16 | 11 |
| A8 | 23.33 | 69 | 26 | 16 |
| A9 | 21.82 | 43 | 11 | 13 |
| A10 | 12.73 | 24 | 5 | 2 |
>TRINITY_DN41600_c0_g1_i4 from sample A8 / Example spliced isoformGTAAAATAGTCAATAAGATTTGAGGAGACTGTCGGGACACGTAAGCATCATGTAGAACGCGTGGACTCTGGCCAGCCTTTGAATCCCCGAGGAAGACTCCCACAACACTTTTGGGGCGCCGACGGACGGTGAAAACGATGCTCGGTGTATGTAAAGCGCTCGTTTCTCACACGCACTCTGTGGCTCTTCACGTCCAGAGT
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>TRINITY_DN41600_c0_g1_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:TATGAGCTTGTGCAAGGAGCACTGGTTAGTTGGAGTTCGGTCAAGGGCAAATCAATGCCTGAACCACCAACAGCCGTTCTTCTTCATGGAATCCTTGGTGGAAGGAAGAATTGGGGATCCTTTGCAAGGAGGCTTGCACAAGAATTTCCAATGTGGCAGTTTCTTCTGGTGGATTTACGATGCCATGGTGACTCAGCATC
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GCTTACTTTGATTATCAGCCTTTATTGGCTAAGGTGACACCAGGGCAGCTTACTTTGATTATCAGCCTTTATTGGCTCATTTTTTAATTTCATTTTTGTTTTCAGAATAATTTAAATATTGATGTTCATTATTGATTGGCTCAATGCTCGTTTCAGTGGTATTTGTATCGAGTACAGGAGAGTTATGGTGGATTATTCTA
TTTTCTTTCTATGAAATGGAAAATCCAGTTTTGAGGATTTCACTCCACATTATTATGACTATAGTTATAATCACACAAAAAAAAACAGGTTTGAGTGTGTCTAATAATCCCAGTGAAAATTGGGACATGTACCAAAAGCTTTGCCAAT