sp|Q8VZQ4|2AB2C_ARATH ----> Probable serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''gamma
Intron 1 GTGAGCATTC ... TTCCTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 46.03 | 34 | 39 | 19 |
| A2 | 37.74 | 33 | 28 | 12 |
| A3 | 45.16 | 17 | 20 | 8 |
| A4 | 46.85 | 35 | 26 | 35.7 |
| A5 | 41.67 | 7 | 5 | 5 |
| A6 | 35.36 | 107.9 | 76 | 42 |
| A7 | 39.78 | 108 | 71 | 71.7 |
| A8 | 37.67 | 111.6 | 69 | 65.9 |
| A9 | 39.44 | 92 | 71 | 48.9 |
| A10 | 43.34 | 83 | 64 | 63 |
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i19 from sample A2 / Example spliced isoformCGTGAACAAAAAGTCTAAATACACACCGTATGTATATGTGTAAGAAAGAATGCGGACCTTCCGAGGGAGCGATTTAAACTAACCAGGCGTAATATTCTCCGTCCGTCTCACAGAAGCTCCCCAGGGTTTGAAGAAGCTACAACCAATCCGTCTATTTAATAAAAAAGGAAAGCTTCGTGCAAAAAATTGATCGATTACTC
TCTAGTTTTCATCTCGAAATTAGCCGAATCTACCCGGCAATTCCGTATCGGTTAAAAAATTGACAGGTCTCCATTTTATCCCATCTGATTGGGTGGTTGCCCGGCAAAATTTGGTGGGATTTTTAACACTGTGGACTCCATTCAGACATGGTTGGAGCAGACCTTGGCCGAAATCTTATCCGAAGTTAGGGTTTAGCTGT
GGGAGCTTTGATATCCAGGGCATCTGGGCGGTGAATTTGGTGTAATAGGCTGCGGATTCTATTAGATTCTATGGATCCGGGGCTGGGCGTGACAGTCGACATGGCGTCGGTGGATCCAGAATTGTTGCAGCTGCAGGACGTCCCTATGCTGTCATTGAAGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCC
AGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTCCACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTC
ATGAGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGTGTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTTTTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGAATTTAAACT
GCTGACAAAGGAAATCTGCAAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAAATCTTCACAGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGATG
ATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGAC
GAGGAAGAGGATATAAACAAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTGGATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAA
AGCTGAAGGGAAGATGGGGTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTTTAAGTGTGTGGACTTGGATGGTAATGGTGTACTGACACCAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAACAATTGCATCGCATGGAATGCATGGCCCAAGAGCCAGTCCTTT
TTGAGGACATATTATGCCAAATGGTGGATATGATTGCCCCCGAGAAAGAATGGCTATTTACTCTACGGGATCTGAAGCGATGCAAGTTGTCAGGAAGTGTTTTTAATATTCTTTTTAATCTTAATAAATTTATGGCTTTTGAAACTCGAGATCCATTCCTTATCCGTCAGGAACGGGAAGATCCTACTTTGACAGAGTGG
GATCGGTTTGCACACAAAGAATATATCAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCTAATGGCAGTGCAGAAGTCTGGGATGAATCTCTTGAGGCTCCTTTCTGAATTAGTCTTGCTCCTAAATGGATGGAACTATGTCTGGATATTTGAAATGGCGGACCTGCAGATCCCTGGTGGGGATGGTTATCTTCTAT
TTCAGAATACTGGACTTGGAAGGAATGTCTTCAGCACCATCGTGCAGCTGTACACAAAGGTTGGTCAATTGGTAGATGTTTTGCCATTCTGAAATAATCAGATGAAATAGAGGTTCATTGGAATAGTATTTGAATATTTTTGTACAGGACTTGTATTTTTAATTTATTTTTAATTAAAGCCTGTTGCAAGTTCTGCTAGA
GGTTCAATGTTTAATAACCATCAGGCCTTTGAGATTGGCTTTTGAAAAGTTGGCTTTGTTGTTTAGTACCTTGTTGATTGCAAAGAGAGACAAAGGATCCACAGATTTTATCTTTCCAGTTGTGTTTGAATCAAGTGTTTTTGCATTAATATGGTGGAATATTTAAGCTCCGTGAGAGATGGGGGTATGTACCATATTGG
TTCTCAGCAGAATGTGGAAAGAATGGCAGCCCTAATTACCTGTCAAAGAGAATGGCAGCTATGTAGTGAGGAATGTAGATAGCTATTCTATGGCAGATATTTTGCCAGTATTATTATACTAAAAAACATATCTGTATGGTCATTCTCCGTTCCGTTATTGCACATCATCGTTATGCTCAGAATTTTCATTGTTGCTATGT
TGCCAATTTAGCCTTTCAGTGTATTCTCTTATGATATATGTAGTTGAAACATTACTCTCAATTAATTCAGG
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i12 from sample A2 / Example unspliced isoform:CGTGAACAAAAAGTCTAAATACACACCGTATGTATATGTGTAAGAAAGAATGCGGACCTTCCGAGGGAGCGATTTAAACTAACCAGGCGTAATATTCTCCGTCCGTCTCACAGAAGCTCCCCAGGGTTTGAAGAAGCTACAACCAATCCGTCTATTTAATAAAAAAGGAAAGCTTCGTGCAAAAAATTGATCGATTACTC
TCTAGTTTTCATCTCGAAATTAGCCGAATCTACCCGGCAATTCCGTATCGGTTAAAAAATTGACAGGTCTCCATTTTATCCCATCTGATTGGGTGGTTGCCCGGCAAAATTTGGTGGGATTTTTAACACTGTGGACTCCATTCAGACATGGTTGGAGCAGACCTTGGCCGAAATCTTATCCGAAGTTAGGGTTTAGCTGT
GGGAGCTTTGATATCCAGGGCATCTGGGCGGTGAATTTGGTGTAATAGGCTGCGGATTCTATTAGATTCTATGGATCCGGGGCTGGGCGTGACAGTCGACATGGCGTCGGTGGATCCAGAATTGTTGCAGCTGCAGGACGTCCCTATGCTGTCATTGAAGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCC
AGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTCCACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTC
ATGAGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGTGTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTTTTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGAATTTAAACT
GCTGACAAAGGAAATCTGCAAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAAATCTTCACAGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGATG
ATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGAC
GAGGAAGAGGATATAAACAAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTGGATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAA
AGCTGAAGGGAAGATGGGGTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTTTAAGTGTGTGGACTTGGATGGTAATGGTGTACTGACACCAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAACAATTGCATCGCATGGAATGCATGGCCCAAGAGCCAGTCCTTT
TTGAGGACATATTATGCCAAATGGTGGATATGATTGCCCCCGAGAAAGAATGGCTATTTACTCTACGGGATCTGAAGCGATGCAAGTTGTCAGGAAGTGTTTTTAATATTCTTTTTAATCTTAATAAATTTATGGCTTTTGAAACTCGAGATCCATTCCTTATCCGTCAGGTAAAATATATCCTGTTCTACAATATTGGT
TCTATTGTTACTTATTAAGGATAGATTGTCTTATCAAGCCACAATAAAGTTTCTGATATAGTTATGGGAATAAGCAGGAACGGGAAGATCCTACTTTGACAGAGTGGGATCGGTTTGCACACAAAGAATATATCAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCTAATGGCAGTGCAGAAGTCTGGGATGAATCT
CTTGAGGCTCCTTTCTGAATgtgagcattctttgtcgacagcatcagcacgttcagctgtttctgcattttgtcgaccatacaggctttttgccttctgcttttcatgtaatgctccagaatttgagttgcacatgcatttatgattggaatgcctgctaaatgttatcaatgaatctgatgttatatgcatgaatgaat
atttcattggtcacttttcaaaaacttccttgagcatgtgaggcaggtggtatgatgatgatcacaggttagtgcatgggcgagctccttaatatgtgctatttagtgtattcaacgtcctggcatacataaatttcattcaatcctagataccagaatacccggagttgtattctggtaactggaaggacaattggatg
cctggaaatgagaatatatagaatgattacctgaaaacaagacgatggaaataaaattgcagtcggaataaatgctgtgtgcaaccttcatagagggaggaaaaaatacaagcatattattaaaaggataccgtgttttgttaaaatgatgaatgttatgattacttgattctctttccaaattgaaactctcttatctg
cgttgtttccttgcagTAGTCTTGCTCCTAAATGGATGGAACTATGTCTGGATATTTGAAATGGCGGACCTGCAGATCCCTGGTGGGGATGGTTATCTTCTATTTCAGAATACTGGACTTGGAAGGAATGTCTTCAGCACCATCGTGCAGCTGTACACAAAGGTTGGTCAATTGGTAGATGTTTTGCCATTCTGAAATAA
TCAGATGAAATAGAGGTTCATTGGAATAGTATTTGAATATTTTTGTACAGGACTTGTATTTTTAATTTATTTTTAATTAAAGCCTGTTGCAAGTTCTGCTAGAGGTTCAATGTTTAATAACCATCAGGCCTTTGAGATTGGCTTTTGAAAAGTTGGCTTTGTTGTTTAGTACCTTGTTGATTGCAAAGAGAGACAAAGGA
TCCACAGATTTTATCTTTCCAGTTGTGTTTGAATCAAGTGTTTTTGCATTAATATGGTGGAATATTTAAGCTCCGTGAGAGATGGGGGTATGTACCATATTGGTTCTCAGCAGAATGTGGAAAGAATGGCAGCCCTAATTACCTGTCAAAGAGAATGGCAGCTATGTAGTGAGGAATGTAGATAGCTATTCTATGGCAGA
TATTTTGCCAGTATTATTATACTAAAAAACATATCTGTATGGTCATTCTCCGTTCCGTTATTGCACATCATCGTTATGCTCAGAATTTTCATTGTTGCTATGTTGCCAATTTAGCCTTTCAGTGTATTCTCTTATGATATATGTAGTTGAAACATTACTCTCAATTAATTCAGG
Intron 2 GTAAGTACTC ... CATCCATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 59.7 | 20 | 36 | 23.3 |
| A2 | 64.85 | 24 | 55 | 33.6 |
| A3 | 60.38 | 38 | 73 | 42.9 |
| A4 | 63.74 | 13 | 28 | 17.7 |
| A5 | 77.04 | 4 | 16 | 10.9 |
| A6 | 60.44 | 18 | 40 | 15 |
| A7 | 73.21 | 39 | 133 | 80.1 |
| A8 | 73.61 | 20 | 66 | 45.6 |
| A9 | 62.84 | 46 | 100 | 55.6 |
| A10 | 64.38 | 32 | 62 | 53.7 |
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i20 from sample A2 / Example spliced isoformCTACCGCGCTCTTGCATTACGAAGTTTCCAGCCAAATTGTTCTGTCCAGGGTGAAAATCACTGTTTCAAACTCGAATTTGGACACAAACTCCTCCATTTCCCATTTTGGCATCTGAGGACCAGCTTATTTGGCCTTTTACTGACAATCGTCGACGGCTTACACGGTGATTTTGGTGGTTTTACTGCTAGATTTCGTGCAG
AGGAAGATTTTTGCAAGTTTTCTATTTCTTTTAAGAACCCGGGGTTTAGTTGAGTTTGGACTTCGACGTTGTTTATATTTATTTTCTCGGCCTTTTTTGGGGGGGCTGAATTTGGTAAAATATGGATTCGGCGACGGCGGTGGATGTGGCGACGGTGGATGTCGATTTCTTGCAGCTTCCCGAGCTCCCCGCGGAGCCGG
GAAAATTCAATCCATATAAGGGCCACATTGAGGAGATCTTTTCGCAGTGGCTTTCACTTCCGGAGACCGAGCAATTGGTAATGTCTTTAGTTGAAGATGCAAAGGCTGGTATTCCTTTGAATGCACCAAATAGTTCATGCACTGCCAGTTTGAGTACGCACTGGAGCAGGCTCAGGTTCTCTAAGTTGTGCTCTGAAGCG
GGTTAGTGAACCAGTGAATGAAATCATACCTCAGTTCTACTTCCCTAATGGACCTACACCACCAAAAGAAATTGTAGATGAATTTTTGAAGGAAATTGATTTATATTTTGTATCCCATTCAGATGGGCTGCATTTTTCCGAGTTTGTGCCTTTGACCAAAGAAGTTTGCAAGTTACCATCATTTTTTTCAAGTTCCCTCT
TCAAAAAAATTGATATGGAAAACTCAGGGCTCGTGACAAGGGATCAGTTTGTACAATATTGGCTTGACAGCAATCTTTTAAGTATGGACTTGGCAACAAAAATTTTCAATCTCCTAAAGCAGACAGACAAGAATTTTCTTACTCAGGATGATTTTAGACCTATACTAAAGGAACTTTTAGCTACACACCGGGGATTGGAA
TTCCTACAAAATACACTGGAGTTTCAAGAAAGATATGCGGAGACTGTGATTTATAGAATCTTTTACTACATAAATAGGTCTGGGAATGGCTGCATTACTCTCAGAGATCTGAAACGAAGCAATCTTATAGCTACAATGCAGCAAGTGGATGAGGAGGAGGATATCAATAAAATCTTGAGGTACTTTTCTTATGAACACTT
TTATGTGATATACTGCAAATTCTGGGAGCTGGACACAGATCATGATTTCCTTCTTGACAAAGAGGACCTTTTAAGATATGGGAATCATTCTCTTACATACCGTATTGTTCAAAGGATATTTTCTCAGGCTCCAAGAAAATTCACTAGCAAAGTCGGAGGAAAAATGGGATATGAAGACTTTGTTTATTTCATGTTATCTG
AGGAGGACAAGTCATCTGAACCCAGTCTTGAATATTGGTTCAACTGTGTGGACATGGATTGTAATGGGATGATTACACCAAATGAGATGCAATTCTTTTACGAGGAACAATTGCACCGCATGGAGTGCATGGGCCACGAGCCAGTGCTCTTTGAGGACATTCTATGCCAGATTGTTGACATGATTGGTCCCGAGAAACAA
TGGCATTTGACGCTACATGATCTTAAACACTGCAAGTTATCAGGGAATTTCTTCAATATTCTTTTCAATCTGAACAAATTTGTGGCTTTTGAAACTCGAGATCCATTTCTCATTCGTCAGGAAAGAGAACTTCCAGCATTGACTGAATGGGATCGGTTTGCACACCAAGAATACATCAGATTGTCTATGGAAGAAGATAG
TGAAAATATTTCTAATGGAAGTATAGAAGTCTGGGAAGATTCCATCGAGGAAGGAGGCACTGCAGGAAAAGGATCAGATGTTGAAATGGTTATATATGCGAACCAGCATTGGTGATAACTATTCTTGTGTTTCTAGTGATATACAGAAACATCATGAGCTATCTATCATGCATCCACACAGAAGCAGAAGTAGCATTTGT
TGATATACTGGCATGATAAATTCACGAAAAGAAACTATTACACGGTCACCTATCCAGTGTTGGAAGCTTTTTGTATAGATGCCCTTGTATATTATTTTTTGAGAATATCAACAAATGCTTGTTATCTATTAATTAGGCTAATATTTAGAATCATATTGTTTGTTTCCTG
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i16 from sample A2 / Example unspliced isoform:CTACCGCGCTCTTGCATTACGAAGTTTCCAGCCAAATTGTTCTGTCCAGGGTGAAAATCACTGTTTCAAACTCGAATTTGGACACAAACTCCTCCATTTCCCATTTTGGCATCTGAGGACCAGCTTATTTGGCCTTTTACTGACAATCGTCGACGGCTTACACGGTGATTTTGGTGGTTTTACTGCTAGATTTCGTGCAG
AGGAAGATTTTTGCAAGTTTTCTATTTCTTTTAAGAACCCGGGGTTTAGTTGAGTTTGGACTTCGACGTTGTTTATATTTATTTTCTCGGCCTTTTTTGGGGGGGCTGAATTTGGTAAAATATGGATTCGGCGACGGCGGTGGATGTGGCGACGGTGGATGTCGATTTCTTGCAGCTTCCCGAGCTCCCCGCGGAGCCGG
GAAAATTCAATCCATATAAGGGCCACATTGAGGAGATCTTTTCGCAGTGGCTTTCACTTCCGGAGACCGAGCAATTGGTAATGTCTTTAGTTGAAGATGCAAAGGCTGGTATTCCTTTGAATGCACCAAATAGTTCATGCACTGCCAGTTTGAGTgtaagtactccatcgatgtttcctgctggcaccgtgccacctctt
tctcctcgaactggttctggttcatttttctcaccaagatcatccatcagACGCACTGGAGCAGGCTCAGGTTCTCTAAGTTGTGCTCTGAAGCGGGTTAGTGAACCAGTGAATGAAATCATACCTCAGTTCTACTTCCCTAATGGACCTACACCACCAAAAGAAATTGTAGATGAATTTTTGAAGGAAATTGATTTATA
TTTTGTATCCCATTCAGATGGGCTGCATTTTTCCGAGTTTGTGCCTTTGACCAAAGAAGTTTGCAAGTTACCATCATTTTTTTCAAGTTCCCTCTTCAAAAAAATTGATATGGAAAACTCAGGGCTCGTGACAAGGGATCAGTTTGTACAATATTGGCTTGACAGCAATCTTTTAAGTATGGACTTGGCAACAAAAATTT
TCAATCTCCTAAAGCAGACAGACAAGAATTTTCTTACTCAGGATGATTTTAGACCTATACTAAAGGAACTTTTAGCTACACACCGGGGATTGGAATTCCTACAAAATACACTGGAGTTTCAAGAAAGATATGCGGAGACTGTGATTTATAGAATCTTTTACTACATAAATAGGTCTGGGAATGGCTGCATTACTCTCAGA
GATCTGAAACGAAGCAATCTTATAGCTACAATGCAGCAAGTGGATGAGGAGGAGGATATCAATAAAATCTTGAGGGTTTTCTTCATATTCCTTTGGCTTGAGGTTTTCTACTATACTTTTGGGAGATGACTTTTGCTATCCCCTTATCACCATTTTGGTATGTTGTACTTTCTAGTCCCATTGACCCATTTTGGTTATCA
GTGGATTAATATAATTAATTTTCCTTTGATTCATTCTATTGTTGATGGTACATTTGTATAAATAACTTTTAGCAACTTTGCTTTGATTGCTTAAAGGTCCAAAGGTTCATTTGAATTTATTTGAAAATAGGAAGCCGTGGTGTGGCAAATTTCTCCTAATAATGAGTCTGTTACAGTACTTCTCATTTTAAAAGATGCTA
AGTTTATCTATTAATTTTTTGTTTTGCTGAGCCAATGTGGGGAGTGCTTATGTTGTTATTTGATTTCAAGCACCTTGGGACCGGATATGATGTTTATTTGTTGCATATTGAAAATCAGGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATACTGCAAATTCTGGGAGCTGGACACAGATCATGATTTCCTTCTTGACAAA
GAGGACCTTTTAAGATATGGGAATCATTCTCTTACATACCGTATTGTTCAAAGGATATTTTCTCAGGTTGCCTTTTATTAACTTGTTTTTGTTTTTAGGGAAGGAGTTTCATGCTATAGATAATTATTTACATTCAGGATTCTTGACCAATTGGATGCACATCTTGGAGTTTTCTTTGGTAGTCATTTGTTGTATTGGAT
ATTTGGTAGGCTCCAAGAAAATTCACTAGC
Intron 3 GTTTGTGTCA ... CTTCTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 34.67 | 35 | 21 | 16.2 |
| A2 | 19.9 | 33 | 7 | 10.1 |
| A3 | 23.9 | 40 | 11 | 14.5 |
| A4 | 19.98 | 20 | 6 | 4.3 |
| A5 | 30.93 | 19 | 8 | 9.3 |
| A6 | 22.04 | 24 | 9 | 4.8 |
| A7 | 16.32 | 36 | 7 | 7.5 |
| A8 | 21.06 | 16 | 6 | 2.7 |
| A9 | 18.31 | 44 | 7 | 13.8 |
| A10 | 19.33 | 45 | 12 | 10.1 |
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i15 from sample A1 / Example spliced isoformGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCCAGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTC
CACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTCATGAGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGTGTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTT
TTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGAATTTAAACTGCTGACAAAGGAAATCTGCAAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAAATCTTCAC
AGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGATGATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAAC
TGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAACAAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTG
GATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAAAGCTGAAGGGAAGATGGGGTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTAAGTTTTCAACCTGTTGTTTAACAGTTTTTGATTACCATTATCTTTTCAAGATCTGTGATTCTGTCCAAA
TGCAAGTTTAAAG
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATAGATCAAGCTTTTATGGTCTGAAAGTTTTTCTTCCTAAAAAATCTAATATTCCAAAACTTGTTCCTTAAGGATCTCTCTACAATACTAAAGTCCCTGTTTAATTTATCTGCAAACTTTTCTGGAAATGTGATGAATGCTCAATGTGTGGTGTAGTTGGCTAGAGCTTAATTTACAAAATCAGTTTAGTGTTATAAAAT
TTCATCTCTTAAATGCGAAGCACCACCGTACGAAATACAGGAATCTAAGAAGTTTCTGAATTCTATGTTTCAAAAACTTTGGCTCACTCAGCAGGTTGAGAATGGTGCCACCAGTTTTTCTCTTTATATCTAATCAGATTCTTAAACACCTTAGTTCCTTCTGAAGTTACTGTTAATTGCACCTCTAAGTTTGAATACTT
TGTTTGCAACATATTATTTTATTATCCAGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTCCACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTCATG
AGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGgtttgtgtcacctttttgaatttttctgagatactctacaggtgtgcaactttttgttaccatatagtgctaagcattgtggttgtccatcaactgattctcgttgcaaacacttcttt
gatgtttgcatgtgaaaagctttgttactatcaatttctggaaatatattattaggaattcaggaagtgtattgttaggaaataaatggctagcctgttttatgttagaataacataccacatctgagatattaatggggccttcttgcagTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGT
GTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTTTTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGGTCTGTAATAAATTTAATCCCCATTTCACAATAATTGTACAAATTCACCTAAAAGGAACAATTATTGTTGTTAGTGTTGGCAACTTATGTAGGATTCTGGTGATCGTTTGGCAGAATTTAAACTGCTGACAAAGGAAATCTGC
AAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGG
Intron 4 GTACACACTT ... GTGAGATTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 29.41 | 48 | 25 | 15 |
| A2 | 29.94 | 62 | 17 | 36 |
| A3 | 18.52 | 33 | 9 | 6 |
| A4 | 30.43 | 32 | 13 | 15 |
| A5 | 24.39 | 31 | 11 | 9 |
| A6 | 19.27 | 44 | 7 | 14 |
| A7 | 17.99 | 98 | 21 | 22 |
| A8 | 13.85 | 56 | 8 | 10 |
| A9 | 19.17 | 78 | 17 | 20 |
| A10 | 15.08 | 76 | 8 | 19 |
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i14 from sample A2 / Example spliced isoformCTACCGCGCTCTTGCATTACGAAGTTTCCAGCCAAATTGTTCTGTCCAGGGTGAAAATCACTGTTTCAAACTCGAATTTGGACACAAACTCCTCCATTTCCCATTTTGGCATCTGAGGACCAGCTTATTTGGCCTTTTACTGACAATCGTCGACGGCTTACACGGTGATTTTGGTGGTTTTACTGCTAGATTTCGTGCAG
AGGAAGATTTTTGCAAGTTTTCTATTTCTTTTAAGAACCCGGGGTTTAGTTGAGTTTGGACTTCGACGTTGTTTATATTTATTTTCTCGGCCTTTTTTGGGGGGGCTGAATTTGGTAAAATATGGATTCGGCGACGGCGGTGGATGTGGCGACGGTGGATGTCGATTTCTTGCAGCTTCCCGAGCTCCCCGCGGAGCCGG
GAAAATTCAATCCATATAAGGGCCACATTGAGGAGATCTTTTCGCAGTGGCTTTCACTTCCGGAGACCGAGCAATTGGTAATGTCTTTAGTTGAAGATGCAAAGGCTGGTATTCCTTTGAATGCACCAAATAGTTCATGCACTGCCAGTTTGAGTGTAAGTACTCCATCGATGTTTCCTGCTGGCACCGTGCCACCTCTT
TCTCCTCGAACTGGTTCTGGTTCATTTTTCTCACCAAGATCATCCATCAGACGCACTGGAGCAGGCTCAGGTTCTCTAAGTTGTGCTCTGAAGCGGGTTAGTGAACCAGTGAATGAAATCATACCTCAGTTCTACTTCCCTAATGGACCTACACCACCAAAAGAAATTGTAGATGAATTTTTGAAGGAAATTGATTTATA
TTTTGTATCCCATTCAGATGGGCTGCATTTTTCCGAGTTTGTGCCTTTGACCAAAGAAGTTTGCAAGTTACCATCATTTTTTTCAAGTTCCCTCTTCAAAAAAATTGATATGGAAAACTCAGGGCTCGTGACAAGGGATCAGTTTGTACAATATTGGCTTGACAGCAATCTTTTAAGTATGGACTTGGCAACAAAAATTT
TCAATCTCCTAAAGCAGACAGACAAGAATTTTCTTACTCAGGATGATTTTAGACCTATACTAAAGGAACTTTTAGCTACACACCGGGGATTGGAATTCCTACAAAATACACTGGAGTTTCAAGAAAGATATGCGGAGACTGTGATTTATAGAATCTTTTACTACATAAATAGGTCTGGGAATGGCTGCATTACTCTCAGA
GATCTGAAACGAAGCAATCTTATAGCTACAATGCAGCAAGTGGATGAGGAGGAGGATATCAATAAAATCTTGAGGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATACTGCAAATTCTGGGAGCTGGACACAGATCATGATTTCCTTCTTGACAAAGAGGACCTTTTAAGATATGGGAATCATTCTCTTACATACCGTAT
TGTTCAAAGGATATTTTCTCAGGCTCCAAGAAAATTCACTAGCAAAGTCGGAGGAAAAATGGGATATGAAGACTTTGTTTATTTCATGTTATCTGAGGAGGACAAGTCATCTGAACCCAGTCTTGAATATTGGTAAGCATGCAATATATACAGCGTCTGTTATTTATGAATAAAAGTTATGGAAGATGTTATGAATGTTC
TAGTGTGCATAATAGAAAGACATAATAT
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i21 from sample A2 / Example unspliced isoform:CTACCGCGCTCTTGCATTACGAAGTTTCCAGCCAAATTGTTCTGTCCAGGGTGAAAATCACTGTTTCAAACTCGAATTTGGACACAAACTCCTCCATTTCCCATTTTGGCATCTGAGGACCAGCTTATTTGGCCTTTTACTGACAATCGTCGACGGCTTACACGGTGATTTTGGTGGTTTTACTGCTAGATTTCGTGCAG
AGGAAGATTTTTGCAAGTTTTCTATTTCTTTTAAGAACCCGGGGTTTAGTTGAGTTTGGACTTCGACGTTGTTTATATTTATTTTCTCGGCCTTTTTTGGGGGGGCTGAATTTGGTAAAATATGGATTCGGCGACGGCGGTGGATGTGGCGACGGTGGATGTCGATTTCTTGCAGCTTCCCGAGCTCCCCGCGGAGCCGG
GAAAATTCAATCCATATAAGGGCCACATTGAGGAGATCTTTTCGCAGTGGCTTTCACTTCCGGAGACCGAGCAATTGGTAATGTCTTTAGTTGAAGATGCAAAGGCTGGTATTCCTTTGAATGCACCAAATAGTTCATGCACTGCCAGTTTGAGTGTAAGTACTCCATCGATGTTTCCTGCTGGCACCGTGCCACCTCTT
TCTCCTCGAACTGGTTCTGGTTCATTTTTCTCACCAAGATCATCCATCAGACGCACTGGAGCAGGCTCAGGTTCTCTAAGTTGTGCTCTGAAGCGGGTTAGTGAACCAGTGAATGAAATCATACCTCAGTTCTACTTCCCTAATGGACCTACACCACCAAAAGAAATTGTAGATGAATTTTTGAAGGAAATTGATTTATA
TTTTGTATCCCATTCAGATGGGCTGCATTTTTCCGAGTTTGTGCCTTTGACCAAAGAAGTTTGCAAGTTACCATCATTTTTTTCAAGTTCCCTCTTCAAAAAAATTGATATGGAAAACTCAGGGCTCGTGACAAGGGATCAGTTTGTACAATATTGGCTTGACAGCAATCTTTTAAGTATGGACTTGGCAACAAAAATTT
TCAATCTCCTAAAGCAGACAGACAAGAATTTTCTTACTCAGGATGATTTTAGACCTATACTAAAGGAACTTTTAGCTACACACCGGGGATTGGAATTCCTACAAAATACACTGGAGTTTCAAGAAAGATATGgtacacactttttgttactgctgttaattgcatgacatttgtcctttgaacttgtttactaaatttct
gaaggactatataaagttataaacttataaactatgtagcttgaactatataatattactatttctgtatattgtttcattatattttctgactctgaatcttattattttggtgtgagattagCGGAGACTGTGATTTATAGAATCTTTTACTACATAAATAGGTCTGGGAATGGCTGCATTACTCTCAGAGATCTGAA
ACGAAGCAATCTTATAGCTACAATGCAGCAAGTGGATGAGGAGGAGGATATCAATAAAATCTTGAGGTGAGTTACTACTTGTGGCAGTTTGAAGACACTCGTTTTTTGGTTCAGTAACGAGGAGCATGTGAAAGAATTATTCATACCAAGTATAGCTTTTCCTAGGATTTGGCTATATTCACTATAATGGCAATATTTTG
CTGTTGGACAGCAAATCTAACTAATCCTTCGTATAGCGCAACATAGAGAGAAGGATTTGCACTATTATGTTGAATAGGGTTGTAACAGTCCTGCCTATTTAAAGATTCAGGCTTGCAATATAAAAATCAAACGTTTCATGATGCAGACCATGATGCAGACCGTATCTGGTATCTTTCTTTGGAGTTTCAAGATTATTTAG
TAAATGCAAAGCATGGCTCAAATTTGGGGCATTTTCTTTCTTCCTCTAATGTATATTTCAATCCCCCTTGGAAGACCCTG
Intron 5 GTTGCCTTTT ... TATTTGGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.4 | 42.9 | 4.1 | 12.1 |
| A2 | 13.19 | 41 | 10.1 | 6.6 |
| A3 | 15.93 | 40.4 | 14 | 8.3 |
| A4 | 36.78 | 19 | 12.3 | 11.6 |
| A5 | 5.92 | 13 | 1.6 | 0.9 |
| A6 | 9.7 | 42.7 | 8.8 | 5.3 |
| A7 | 13.44 | 98.7 | 11.7 | 18 |
| A8 | 11.64 | 95.9 | 25.3 | 13.4 |
| A9 | 5.25 | 96.8 | 10.1 | 5.8 |
| A10 | 7.39 | 71.9 | 19.4 | 6 |
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i14 from sample A2 / Example spliced isoformCTACCGCGCTCTTGCATTACGAAGTTTCCAGCCAAATTGTTCTGTCCAGGGTGAAAATCACTGTTTCAAACTCGAATTTGGACACAAACTCCTCCATTTCCCATTTTGGCATCTGAGGACCAGCTTATTTGGCCTTTTACTGACAATCGTCGACGGCTTACACGGTGATTTTGGTGGTTTTACTGCTAGATTTCGTGCAG
AGGAAGATTTTTGCAAGTTTTCTATTTCTTTTAAGAACCCGGGGTTTAGTTGAGTTTGGACTTCGACGTTGTTTATATTTATTTTCTCGGCCTTTTTTGGGGGGGCTGAATTTGGTAAAATATGGATTCGGCGACGGCGGTGGATGTGGCGACGGTGGATGTCGATTTCTTGCAGCTTCCCGAGCTCCCCGCGGAGCCGG
GAAAATTCAATCCATATAAGGGCCACATTGAGGAGATCTTTTCGCAGTGGCTTTCACTTCCGGAGACCGAGCAATTGGTAATGTCTTTAGTTGAAGATGCAAAGGCTGGTATTCCTTTGAATGCACCAAATAGTTCATGCACTGCCAGTTTGAGTGTAAGTACTCCATCGATGTTTCCTGCTGGCACCGTGCCACCTCTT
TCTCCTCGAACTGGTTCTGGTTCATTTTTCTCACCAAGATCATCCATCAGACGCACTGGAGCAGGCTCAGGTTCTCTAAGTTGTGCTCTGAAGCGGGTTAGTGAACCAGTGAATGAAATCATACCTCAGTTCTACTTCCCTAATGGACCTACACCACCAAAAGAAATTGTAGATGAATTTTTGAAGGAAATTGATTTATA
TTTTGTATCCCATTCAGATGGGCTGCATTTTTCCGAGTTTGTGCCTTTGACCAAAGAAGTTTGCAAGTTACCATCATTTTTTTCAAGTTCCCTCTTCAAAAAAATTGATATGGAAAACTCAGGGCTCGTGACAAGGGATCAGTTTGTACAATATTGGCTTGACAGCAATCTTTTAAGTATGGACTTGGCAACAAAAATTT
TCAATCTCCTAAAGCAGACAGACAAGAATTTTCTTACTCAGGATGATTTTAGACCTATACTAAAGGAACTTTTAGCTACACACCGGGGATTGGAATTCCTACAAAATACACTGGAGTTTCAAGAAAGATATGCGGAGACTGTGATTTATAGAATCTTTTACTACATAAATAGGTCTGGGAATGGCTGCATTACTCTCAGA
GATCTGAAACGAAGCAATCTTATAGCTACAATGCAGCAAGTGGATGAGGAGGAGGATATCAATAAAATCTTGAGGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATACTGCAAATTCTGGGAGCTGGACACAGATCATGATTTCCTTCTTGACAAAGAGGACCTTTTAAGATATGGGAATCATTCTCTTACATACCGTAT
TGTTCAAAGGATATTTTCTCAGGCTCCAAGAAAATTCACTAGCAAAGTCGGAGGAAAAATGGGATATGAAGACTTTGTTTATTTCATGTTATCTGAGGAGGACAAGTCATCTGAACCCAGTCTTGAATATTGGTAAGCATGCAATATATACAGCGTCTGTTATTTATGAATAAAAGTTATGGAAGATGTTATGAATGTTC
TAGTGTGCATAATAGAAAGACATAATAT
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i16 from sample A2 / Example unspliced isoform:CTACCGCGCTCTTGCATTACGAAGTTTCCAGCCAAATTGTTCTGTCCAGGGTGAAAATCACTGTTTCAAACTCGAATTTGGACACAAACTCCTCCATTTCCCATTTTGGCATCTGAGGACCAGCTTATTTGGCCTTTTACTGACAATCGTCGACGGCTTACACGGTGATTTTGGTGGTTTTACTGCTAGATTTCGTGCAG
AGGAAGATTTTTGCAAGTTTTCTATTTCTTTTAAGAACCCGGGGTTTAGTTGAGTTTGGACTTCGACGTTGTTTATATTTATTTTCTCGGCCTTTTTTGGGGGGGCTGAATTTGGTAAAATATGGATTCGGCGACGGCGGTGGATGTGGCGACGGTGGATGTCGATTTCTTGCAGCTTCCCGAGCTCCCCGCGGAGCCGG
GAAAATTCAATCCATATAAGGGCCACATTGAGGAGATCTTTTCGCAGTGGCTTTCACTTCCGGAGACCGAGCAATTGGTAATGTCTTTAGTTGAAGATGCAAAGGCTGGTATTCCTTTGAATGCACCAAATAGTTCATGCACTGCCAGTTTGAGTGTAAGTACTCCATCGATGTTTCCTGCTGGCACCGTGCCACCTCTT
TCTCCTCGAACTGGTTCTGGTTCATTTTTCTCACCAAGATCATCCATCAGACGCACTGGAGCAGGCTCAGGTTCTCTAAGTTGTGCTCTGAAGCGGGTTAGTGAACCAGTGAATGAAATCATACCTCAGTTCTACTTCCCTAATGGACCTACACCACCAAAAGAAATTGTAGATGAATTTTTGAAGGAAATTGATTTATA
TTTTGTATCCCATTCAGATGGGCTGCATTTTTCCGAGTTTGTGCCTTTGACCAAAGAAGTTTGCAAGTTACCATCATTTTTTTCAAGTTCCCTCTTCAAAAAAATTGATATGGAAAACTCAGGGCTCGTGACAAGGGATCAGTTTGTACAATATTGGCTTGACAGCAATCTTTTAAGTATGGACTTGGCAACAAAAATTT
TCAATCTCCTAAAGCAGACAGACAAGAATTTTCTTACTCAGGATGATTTTAGACCTATACTAAAGGAACTTTTAGCTACACACCGGGGATTGGAATTCCTACAAAATACACTGGAGTTTCAAGAAAGATATGCGGAGACTGTGATTTATAGAATCTTTTACTACATAAATAGGTCTGGGAATGGCTGCATTACTCTCAGA
GATCTGAAACGAAGCAATCTTATAGCTACAATGCAGCAAGTGGATGAGGAGGAGGATATCAATAAAATCTTGAGGGTTTTCTTCATATTCCTTTGGCTTGAGGTTTTCTACTATACTTTTGGGAGATGACTTTTGCTATCCCCTTATCACCATTTTGGTATGTTGTACTTTCTAGTCCCATTGACCCATTTTGGTTATCA
GTGGATTAATATAATTAATTTTCCTTTGATTCATTCTATTGTTGATGGTACATTTGTATAAATAACTTTTAGCAACTTTGCTTTGATTGCTTAAAGGTCCAAAGGTTCATTTGAATTTATTTGAAAATAGGAAGCCGTGGTGTGGCAAATTTCTCCTAATAATGAGTCTGTTACAGTACTTCTCATTTTAAAAGATGCTA
AGTTTATCTATTAATTTTTTGTTTTGCTGAGCCAATGTGGGGAGTGCTTATGTTGTTATTTGATTTCAAGCACCTTGGGACCGGATATGATGTTTATTTGTTGCATATTGAAAATCAGGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATACTGCAAATTCTGGGAGCTGGACACAGATCATGATTTCCTTCTTGACAAA
GAGGACCTTTTAAGATATGGGAATCATTCTCTTACATACCGTATTGTTCAAAGGATATTTTCTCAGgttgccttttattaacttgtttttgtttttagggaaggagtttcatgctatagataattatttacattcaggattcttgaccaattggatgcacatcttggagttttctttggtagtcatttgttgtattggat
atttggtagGCTCCAAGAAAATTCACTAGC
Intron 6 GTATGAGTTA ... GTATCCTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 43.37 | 41.8 | 12 | 32 |
| A2 | 36.11 | 31.9 | 13 | 18 |
| A3 | 35.07 | 27.8 | 3 | 15 |
| A4 | 34.16 | 34.7 | 7 | 18 |
| A5 | 29.47 | 23.9 | 3 | 10 |
| A6 | 33.56 | 29.7 | 0 | 15 |
| A7 | 19.48 | 78.6 | 1 | 19 |
| A8 | 30.78 | 38.4 | 2 | 17 |
| A9 | 21.44 | 58.6 | 1 | 16 |
| A10 | 14.7 | 75.5 | 1 | 13 |
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i15 from sample A1 / Example spliced isoformGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCCAGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTC
CACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTCATGAGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGTGTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTT
TTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGAATTTAAACTGCTGACAAAGGAAATCTGCAAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAAATCTTCAC
AGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGATGATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAAC
TGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAACAAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTG
GATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAAAGCTGAAGGGAAGATGGGGTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTAAGTTTTCAACCTGTTGTTTAACAGTTTTTGATTACCATTATCTTTTCAAGATCTGTGATTCTGTCCAAA
TGCAAGTTTAAAG
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i12 from sample A1 / Example unspliced isoform:TAATATTCATTCTTCACTGTAAGTAACTTGCAGCATATCTCATTTTTTAAAATGTTGACGAAGTAATGTGTGTTACTTCCACATTTATTTAAAAGATTACGTGTAATAATAGTGATAAATTTGTTTTGTGTGTTGAGATTTTACTTTGTTTTGCTTTGCAAAATCAATTTGTTTTTTTTGTGATTTTAGTTATATTTATT
TAGAAGAAAAACAATAACGTAGCTACAGTTATTATAATTGAAAGTTCACTTTTATCTTAACAAGTAAATTTTAATAGCAACATTTACTGAATCTTTAAAATATAAAAAAATTTAAATATATTTAATCATTTAGAAATTACTGTACTGTATCCACACTATATCGAATATTCGCCGAATTTCAAATTCGAAACGAATTTTTC
CATACAGGAACCCCCAATACGGCCGAATCTTGCTACTATGGTATAAACCCATGTGCAGATTGCTCACGAGACTTTAGAGAGTTAGAGGCACACTACTTTACACTAATGGGTGATGCTTTTGGGGTTGATGGGAATGCAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAA
ATCTTCACAGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGTCTATATTGAATTTCCTTGGTATTCTACTAGTGCTTGAAGGTCACTATTATATGTCTTAATGAGTTGTGTATTGAAGGCTTGACTTGGCTTTTGGACTGCTGACAAACAAGCATCAGGGTTTTGTACTTTGCTATTTATGTTCTAGTTACTCAA
AGTGTGATGGAATTGACAGGATGATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGgtatgagttattactttccctatgatctaatggtaaattcttaatgttgacatgtacaacttaacatcagcgcctaaatatggtttctta
atgtatgcattttacttgtgtcaagttgtcaacaataaatactaaattattgtttgttttaaaagtcaatggctgtattacttgttttaattagcaaggggatcagaagtaggtgtgctcggaattaacatttgagattcttgtttttggtcatgtagattgaatcctgtaaggaatgttcacagttctttagcaattat
atttgttcttcaattattgaggatgtaagtattggtcattagtgtctagatttaactaaattaatgtttgcagtattctattgcttttgcaactgtagttccatattgtcagaaccataagtacagtatggtgaatattagagggagggatgactatttaatcctgtaaatggccatgtaccagagttgttttttgggtt
tctcctcagaaaccttagtttaaggcatttttgttggtgtacgtagcgatagttcaggagttaatacctaggtgattcaatgactgggcttgtattactatctaatgtagttttggagtgatgaatggtattactctttagtagaatcaaggattttgtgtgcaatcatatacaaataagttagtaaacaggttgtgtcc
agaatcaatttaatttaaatattattgtcttccatttattgctcatttcttcttgtttaagatttcacatttcttgtttatctgatacttggctttaatacaaatagtggaatttaatttaaatattattgtctaccatttatctcacatttcttcatgtttaacatttattgtttatctgatacttggctgtaatacaa
atagtggttcatgttttggtgctgccatattttctaacttattttggctttttgatgatgtatcctcagCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAAC
AAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTGGATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAAAGCTGAAGGGAAGATGGG
GTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTTTAAGTGTGTGGACTTGGATGGTAATGGTGTACTGACACCAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAACAATTGCATCGCATGGAATGCATGGCCCAAGAGCCAGTCCTTTTTGAGGACATATTATGCC
AAATGGTGGATATGATTGCCCCCGAGAAAGAATGGCTATTTACTCTACGGGATCTGAAGCGATGCAAGTTGTCAGGAAGTGTTTTTAATATTCTTTTTAATCTTAATAAATTTATGGCTTTTGAAACTCGAGATCCATTCCTTATCCGTCAGGAACGGGAAGATCCTACTTTGACAGAGTGGGATCGGTTTGCACACAAA
GAATATATCAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCTAATGGCAGTGCAGAAGTCTGGGATGAATCTCTTGAGGCTCCTTTCTGAATTAGTCTTGCTCCTAAATGGATGGAACTATGTCTGGATATTTGAAATGGTGGACCTGCAGATCCCTGGTGGGGATGGTTATCTTCTATTTCAGAATACTGGACTTG
GAAGGAATGTCTTCAGCACCATCGTGCAGCTGTACACAAAGGTTGGTCAATTGGTAGATGTTTTGCCATTCTGAAATAATCAGATGAAATAGAGGTTCATTGGAATAGTATTTGAATATTTTTGTACAGGACTTGTATTTTTAATTTATTTTTAATTAAAGCCTGTTGCAAGTTCTGCTAGAGGTTCAATGTTTAATAAC
CATCAGGCCTTTGAGATTGGCTTTTGAAAAGTTGGCTTTGTTGTTTAGTACCTTGTTGATTGCAAAGAGAGACAAAGGATCCACAGATTTTATCTTTCCAGTTGTGTTTGAATCAAGTGTTTTTGCATTAATATGGTGGAATATTTAAGCTCCGTGAGAGATGGGGGTATGTACCATATTGGTTCTCAGCAGAATGTGGA
AAGAATGGCAGCCCTAATTACCTGTCAAAGAGAATGGCAGCTATGTAGTGAGGAATGTAGATAGCTATTCTATGGCAGATATTTTGCCAGTATTATTATACTAAAAAACATATCTGTATGGTCATTCTCCGTTCCGTTATTGCACATCATCGTTATGCTCAGAATTTTCATTGTTGCTATGTTGCCAATTTAGCCTTTCA
GTGTATTCTCT
Intron 7 GTCTATATTG ... GAATTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 44.72 | 35.1 | 28.5 | 18 |
| A2 | 39.72 | 30.9 | 20.4 | 14.1 |
| A3 | 36.82 | 29.9 | 17.5 | 9.8 |
| A4 | 36.85 | 35 | 20.5 | 5.6 |
| A5 | 50.15 | 13 | 13.1 | 4.6 |
| A6 | 7.19 | 43.9 | 3.5 | 6 |
| A7 | 16.43 | 68.6 | 13.5 | 15.2 |
| A8 | 7.27 | 41.9 | 3.3 | 3.6 |
| A9 | 8.43 | 71.6 | 6.7 | 11.8 |
| A10 | 3.95 | 62.7 | 2.7 | 10.4 |
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i15 from sample A1 / Example spliced isoformGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCCAGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTC
CACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTCATGAGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGTGTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTT
TTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGAATTTAAACTGCTGACAAAGGAAATCTGCAAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAAATCTTCAC
AGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGATGATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAAC
TGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAACAAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTG
GATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAAAGCTGAAGGGAAGATGGGGTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTAAGTTTTCAACCTGTTGTTTAACAGTTTTTGATTACCATTATCTTTTCAAGATCTGTGATTCTGTCCAAA
TGCAAGTTTAAAG
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:TAATATTCATTCTTCACTGTAAGTAACTTGCAGCATATCTCATTTTTTAAAATGTTGACGAAGTAATGTGTGTTACTTCCACATTTATTTAAAAGATTACGTGTAATAATAGTGATAAATTTGTTTTGTGTGTTGAGATTTTACTTTGTTTTGCTTTGCAAAATCAATTTGTTTTTTTTGTGATTTTAGTTATATTTATT
TAGAAGAAAAACAATAACGTAGCTACAGTTATTATAATTGAAAGTTCACTTTTATCTTAACAAGTAAATTTTAATAGCAACATTTACTGAATCTTTAAAATATAAAAAAATTTAAATATATTTAATCATTTAGAAATTACTGTACTGTATCCACACTATATCGAATATTCGCCGAATTTCAAATTCGAAACGAATTTTTC
CATACAGGAACCCCCAATACGGCCGAATCTTGCTACTATGGTATAAACCCATGTGCAGATTGCTCACGAGACTTTAGAGAGTTAGAGGCACACTACTTTACACTAATGGGTGATGCTTTTGGGGTTGATGGGAATGCAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAA
ATCTTCACAGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGgtctatattgaatttccttggtattctactagtgcttgaaggtcactattatatgtcttaatgagttgtgtattgaaggcttgacttggcttttggactgctgacaaacaagcatcagggttttgtactttgctatttatgttctagttactcaa
agtgtgatggaattgacagGATGATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGGTATGAGTTATTACTTTCCCTATGATCTAATGGTAAATTCTTAATGTTGACATGTACAACTTAACATCAGCGCCTAAATATGGTTTCTTA
ATGTATGCATTTTACTTGTGTCAAGTTGTCAACAATAAATACTAAATTATTGTTTGTTTTAAAAGTCAATGGCTGTATTACTTGTTTTAATTAGCAAGGGGATCAGAAGTAGGTGTGCTCGGAATTAACATTTGAGATTCTTGTTTTTGGTCATGTAGATTGAATCCTGTAAGGAATGTTCACAGTTCTTTAGCAATTAT
ATTTGTTCTTCAATTATTGAGGATGTAAGTATTGGTCATTAGTGTCTAGATTTAACTAAATTAATGTTTGCAGTATTCTATTGCTTTTGCAACTGTAGTTCCATATTGTCAGAACCATAAGTACAGTATGGTGAATATTAGAGGGAGGGATGACTATTTAATCCTGTAAATGGCCATGTACCAGAGTTGTTTTTTGGGTT
TCTCCTCAGAAACCTTAGTTTAAGGCATTTTTGTTGGTGTACGTAGCGATAGTTCAGGAGTTAATACCTAGGTGATTCAATGACTGGGCTTGTATTACTATCTAATGTAGTTTTGGAGTGATGAATGGTATTACTCTTTAGTAGAATCAAGGATTTTGTGTGCAATCATATACAAATAAGTTAGTAAACAGGTTGTGTCC
AGAATCAATTTAATTTAAATATTATTGTCTTCCATTTATTGCTCATTTCTTCTTGTTTAAGATTTCACATTTCTTGTTTATCTGATACTTGGCTTTAATACAAATAGTGGAATTTAATTTAAATATTATTGTCTACCATTTATCTCACATTTCTTCATGTTTAACATTTATTGTTTATCTGATACTTGGCTGTAATACAA
ATAGTGGTTCATGTTTTGGTGCTGCCATATTTTCTAACTTATTTTGGCTTTTTGATGATGTATCCTCAGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAAC
AAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTGGATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAAAGCTGAAGGGAAGATGGG
GTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTTTAAGTGTGTGGACTTGGATGGTAATGGTGTACTGACACCAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAACAATTGCATCGCATGGAATGCATGGCCCAAGAGCCAGTCCTTTTTGAGGACATATTATGCC
AAATGGTGGATATGATTGCCCCCGAGAAAGAATGGCTATTTACTCTACGGGATCTGAAGCGATGCAAGTTGTCAGGAAGTGTTTTTAATATTCTTTTTAATCTTAATAAATTTATGGCTTTTGAAACTCGAGATCCATTCCTTATCCGTCAGGTAAAATATATCCTGTTCTACAATATTGGTTCTATTGTTACTTATTAA
GGATAGATTGTCTTATCAAGCCACAATAAAGTTTCTGATATAGTTATGGGAATAAGCAGGAACGGGAAGATCCTACTTTGACAGAGTGGGATCGGTTTGCACACAAAGAATATATCAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCTAATGGCAGTGCAGAAGTCTGGGATGAATCTCTTGAGGCTCCTTTCTGA
ATGTGAGCATTCTTTGTCGACAGCATCAGCACGTTCAGCTGTTTCTGCATTTTGTCGACCATACAGGCTTTTTGCCTTCTGCTTTTCATGTAATGCTCCAGAATTTGAGTTGCACATGCATTTATGATTGGAATGCCTGCTAAATGTTATCAATGAATCTGATGTTATATGCATGAATGAATATTTCATTGGTCACTTTT
CAAAAACTTCCTTGAGCATGTGAGGCAGGTGGTATGATGATGATCACAGGTTAGTGCATGGGCGAGCTCCTTAATATGTGCTATTTAGTGTATTCAACGTCCTGGCATACATAAATTTCATTCAATCCTAG
Intron 8 GTAACAACAT ... TCTCACTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 67.53 | 25 | 69 | 35 |
| A2 | 56.92 | 28 | 43 | 31 |
| A3 | 58.82 | 35 | 70 | 30 |
| A4 | 61.67 | 23 | 39 | 35 |
| A5 | 56.76 | 16 | 29 | 13 |
| A6 | 64.29 | 20 | 28 | 44 |
| A7 | 63.38 | 39 | 66 | 69 |
| A8 | 69.41 | 13 | 17 | 42 |
| A9 | 65.52 | 35 | 61 | 72 |
| A10 | 59.2 | 51 | 85 | 63 |
>TRINITY_DN100796_c3_g2_i6 from sample A4 / Example spliced isoformGGACCTTCCGAGGGAGCGATTTAAACTAACCAGGCGTAATATTCTCCGTCCGTCTCACAGAAGCTCCCCAGGGTTTGAAGAAGCTACAACCAATCCGTCTATTTAATAAAAAAGGAAAGCTTCGTGCAAAAAATTGATCGATTACTCTCTAGTTTTCATCTCGAAATTAGCCGAATCTACCCGGCAATTCCGTATCGGTT
AAAAAATTGACAGGTCTCCATTTTATCCCATCTGATTGGGTGGTTGCCCGGCAAAATTTGGTGGGATTTTTAACACTGTGGACTCCATTCAGACATGGTTGGAGCAGACCTTGGCCGAAATCTTATCCGAAGTTAGGGTTTAGCTGTGGGAGCTTTGATATCCAGGGCATCTGGGCGGTGAATTTGGTGTAATAGGCTGC
GGATTCTATTAGATTCTATGGATCCGGGGCTGGGCGTGACAGTCGACATGGCGTCGGTGGATCCAGAATTGTTGCAGCTGCAGGACGTCCCTATGCTGTCATTGAAGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCCAGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGGATGATTTCAAGCCCATATTG
AGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAA
CAAAGTCTTAAAGTA
>TRINITY_DN100796_c3_g2_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:GGACCTTCCGAGGGAGCGATTTAAACTAACCAGGCGTAATATTCTCCGTCCGTCTCACAGAAGCTCCCCAGGGTTTGAAGAAGCTACAACCAATCCGTCTATTTAATAAAAAAGGAAAGCTTCGTGCAAAAAATTGATCGATTACTCTCTAGTTTTCATCTCGAAATTAGCCGAATCTACCCGGCAATTCCGTATCGGTT
AAAAAATTGACAGGTCTCCATTTTATCCCATCTGATTGGGTGGTTGCCCGGCAAAATTTGGTGGGATTTTTAACACTGTGGACTCCATTCAGACATGGTTGGAGCAGACCTTGGCCGAAATCTTATCCGAAGTTAGGGTTTAGCTGTGGGAGCTTTGATATCCAGGGCATCTGGGCGGTGAATTTGGTGTAATAGGCTGC
GGATTCTATTAGATTCTATGGATCCGGGGCTGGGCGTGACAGTCGACATGGCGTCGGTGGATCCAGAATTGTTGCAGCTGCAGGACGTCCCTATGCTGTCATTGAAGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCCAGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGgtaacaacattacttgaagaa
gcaaaagcaggtagccctttgagtgttccagggagttcctacaatgcaaatacaggcatgagtaattctatgttgccaaatatgtttcctgctggttgtacacctccactttctcctcgaagtgtttctggttccccaaggtcagtcatgagacggcatggagctggtccaagttctctaggatctccactaaaatgggc
caatgatccagcaaaagaagtcatcccacagttctactttcataatggacctccccttccaaaagaaatggccgagaagtgtttatcaagaattgatcagctcttttttggtcacatggatgggttgcgtgtggaagaatttaaactgctgacaaaggaaatctgcaagctaccttcattcttttctaccactctgttca
aaaagattgatattgataatacaggagttgtgacaagggaccagtttgttagttattggattgacaagaaaatggtaactatggacttggcaaaccaaatcttcacagttctaaggcagccagacaagaactatctcactcagGATGATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTC
CTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAACAAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTA
TGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTGGATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAAAGCTGAAGGGAAGATGGGGTATGAGG
Intron 9 GTCTGTAATA ... CGTTTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.68 | 68.8 | 14.9 | 15 |
| A2 | 21.79 | 52.3 | 16 | 14 |
| A3 | 15.55 | 75.6 | 9.5 | 19 |
| A4 | 27.16 | 30.9 | 13.6 | 10.5 |
| A5 | 19.13 | 31.4 | 11.1 | 4 |
| A6 | 13.03 | 26.8 | 3.8 | 5.5 |
| A7 | 11.05 | 54.1 | 7.3 | 7 |
| A8 | 14.79 | 49.1 | 3.8 | 14 |
| A9 | 10.34 | 65.4 | 10 | 6 |
| A10 | 9.56 | 70 | 8.9 | 7 |
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i15 from sample A1 / Example spliced isoformGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCCAGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTC
CACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTCATGAGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGTGTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTT
TTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGAATTTAAACTGCTGACAAAGGAAATCTGCAAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAAATCTTCAC
AGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGATGATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAAC
TGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAACAAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTG
GATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAAAGCTGAAGGGAAGATGGGGTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTAAGTTTTCAACCTGTTGTTTAACAGTTTTTGATTACCATTATCTTTTCAAGATCTGTGATTCTGTCCAAA
TGCAAGTTTAAAG
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATAGATCAAGCTTTTATGGTCTGAAAGTTTTTCTTCCTAAAAAATCTAATATTCCAAAACTTGTTCCTTAAGGATCTCTCTACAATACTAAAGTCCCTGTTTAATTTATCTGCAAACTTTTCTGGAAATGTGATGAATGCTCAATGTGTGGTGTAGTTGGCTAGAGCTTAATTTACAAAATCAGTTTAGTGTTATAAAAT
TTCATCTCTTAAATGCGAAGCACCACCGTACGAAATACAGGAATCTAAGAAGTTTCTGAATTCTATGTTTCAAAAACTTTGGCTCACTCAGCAGGTTGAGAATGGTGCCACCAGTTTTTCTCTTTATATCTAATCAGATTCTTAAACACCTTAGTTCCTTCTGAAGTTACTGTTAATTGCACCTCTAAGTTTGAATACTT
TGTTTGCAACATATTATTTTATTATCCAGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTCCACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTCATG
AGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGGTTTGTGTCACCTTTTTGAATTTTTCTGAGATACTCTACAGGTGTGCAACTTTTTGTTACCATATAGTGCTAAGCATTGTGGTTGTCCATCAACTGATTCTCGTTGCAAACACTTCTTT
GATGTTTGCATGTGAAAAGCTTTGTTACTATCAATTTCTGGAAATATATTATTAGGAATTCAGGAAGTGTATTGTTAGGAAATAAATGGCTAGCCTGTTTTATGTTAGAATAACATACCACATCTGAGATATTAATGGGGCCTTCTTGCAGTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGT
GTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTTTTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGgtctgtaataaatttaatccccatttcacaataattgtacaaattcacctaaaaggaacaattattgttgttagtgttggcaacttatgtaggattctggtgatcgtttggcagAATTTAAACTGCTGACAAAGGAAATCTGC
AAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGG
Intron 10 GTAATGCTCC ... TTCCTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 36.84 | 36 | 23 | 19 |
| A2 | 38.87 | 21.4 | 15.2 | 12 |
| A3 | 21.43 | 22 | 4 | 8 |
| A4 | 40.77 | 34 | 11 | 35.8 |
| A5 | 45.45 | 3 | 0 | 5 |
| A6 | 23.03 | 117 | 28 | 42 |
| A7 | 29.4 | 127 | 34 | 71.8 |
| A8 | 28.99 | 104 | 19 | 65.9 |
| A9 | 26.07 | 109 | 28 | 48.9 |
| A10 | 26.43 | 128.1 | 29 | 63 |
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i30 from sample A2 / Example spliced isoformCGTGAACAAAAAGTCTAAATACACACCGTATGTATATGTGTAAGAAAGAATGCGGACCTTCCGAGGGAGCGATTTAAACTAACCAGGCGTAATATTCTCCGTCCGTCTCACAGAAGCTCCCCAGGGTTTGAAGAAGCTACAACCAATCCGTCTATTTAATAAAAAAGGAAAGCTTCGTGCAAAAAATTGATCGATTACTC
TCTAGTTTTCATCTCGAAATTAGCCGAATCTACCCGGCAATTCCGTATCGGTTAAAAAATTGACAGGTCTCCATTTTATCCCATCTGATTGGGTGGTTGCCCGGCAAAATTTGGTGGGATTTTTAACACTGTGGACTCCATTCAGACATGGTTGGAGCAGACCTTGGCCGAAATCTTATCCGAAGTTAGGGTTTAGCTGT
GGGAGCTTTGATATCCAGGGCATCTGGGCGGTGAATTTGGTGTAATAGGCTGCGGATTCTATTAGATTCTATGGATCCGGGGCTGGGCGTGACAGTCGACATGGCGTCGGTGGATCCAGAATTGTTGCAGCTGCAGGACGTCCCTATGCTGTCATTGAAGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCC
AGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTCCACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTC
ATGAGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGTGTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTTTTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGAATTTAAACT
GCTGACAAAGGAAATCTGCAAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAAATCTTCACAGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGATG
ATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGAC
GAGGAAGAGGATATAAACAAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTGGATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAA
AGCTGAAGGGAAGATGGGGTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTTTAAGTGTGTGGACTTGGATGGTAATGGTGTACTGACACCAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAACAATTGCATCGCATGGAATGCATGGCCCAAGAGCCAGTCCTTT
TTGAGGACATATTATGCCAAATGGTGGATATGATTGCCCCCGAGAAAGAATGGCTATTTACTCTACGGGATCTGAAGCGATGCAAGTTGTCAGGAAGTGTTTTTAATATTCTTTTTAATCTTAATAAATTTATGGCTTTTGAAACTCGAGATCCATTCCTTATCCGTCAGGAACGGGAAGATCCTACTTTGACAGAGTGG
GATCGGTTTGCACACAAAGAATATATCAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCTAATGGCAGTGCAGAAGTCTGGGATGAATCTCTTGAGGCTCCTTTCTGAATGTGAGCATTCTTTGTCGACAGCATCAGCACGTTCAGCTGTTTCTGCATTTTGTCGACCATACAGGCTTTTTGCCTTCTGCTTTTCAT
TAGTCTTGCTCCTAAATGGATGGAACTATGTCTGGATATTTGAAATGGCGGACCTGCAGATCCCTGGTGGGGATGGTTATCTTCTATTTCAGAATACTGGACTTGGAAGGAATGTCTTCAGCACCATCGTGCAGCTGTACACAAAGGTTGGTCAATTGGTAGATGTTTTGCCATTCTGAAATAATCAGATGAAATAGAGG
TTCATTGGAATAGTATTTGAATATTTTTGTACAGGACTTGTATTTTTAATTTATTTTTAATTAAAGCCTGTTGCAAGTTCTGCTAGAGGTTCAATGTTTAATAACCATCAGGCCTTTGAGATTGGCTTTTGAAAAGTTGGCTTTGTTGTTTAGTACCTTGTTGATTGCAAAGAGAGACAAAGGATCCACAGATTTTATCT
TTCCAGTTGTGTTTGAATCAAGTGTTTTTGCATTAATATGGTGGAATATTTAAGCTCCGTGAGAGATGGGGGTATGTACCATATTGGTTCTCAGCAGAATGTGGAAAGAATGGCAGCCCTAATTACCTGTCAAAGAGAATGGCAGCTATGTAGTGAGGAATGTAGATAGCTATTCTATGGCAGATATTTTGCCAGTATTA
TTATACTAAAAAACATATCTGTATGGTCATTCTCCGTTCCGTTATTGCACATCATCGTTATGCTCAGAATTTTCATTGTTGCTATGTTGCCAATTTAGCCTTTCAGTGTATTCTCTTATGATATATGTAGTTGAAACATTACTCTCAATTAATTCAGG
>TRINITY_DN119084_c0_g1_i12 from sample A2 / Example unspliced isoform:CGTGAACAAAAAGTCTAAATACACACCGTATGTATATGTGTAAGAAAGAATGCGGACCTTCCGAGGGAGCGATTTAAACTAACCAGGCGTAATATTCTCCGTCCGTCTCACAGAAGCTCCCCAGGGTTTGAAGAAGCTACAACCAATCCGTCTATTTAATAAAAAAGGAAAGCTTCGTGCAAAAAATTGATCGATTACTC
TCTAGTTTTCATCTCGAAATTAGCCGAATCTACCCGGCAATTCCGTATCGGTTAAAAAATTGACAGGTCTCCATTTTATCCCATCTGATTGGGTGGTTGCCCGGCAAAATTTGGTGGGATTTTTAACACTGTGGACTCCATTCAGACATGGTTGGAGCAGACCTTGGCCGAAATCTTATCCGAAGTTAGGGTTTAGCTGT
GGGAGCTTTGATATCCAGGGCATCTGGGCGGTGAATTTGGTGTAATAGGCTGCGGATTCTATTAGATTCTATGGATCCGGGGCTGGGCGTGACAGTCGACATGGCGTCGGTGGATCCAGAATTGTTGCAGCTGCAGGACGTCCCTATGCTGTCATTGAAGCCTAATCCCTACAAGACGCATATCGACGAGCTCTTTTCCC
AGTGGCTTTCGCTTCCAGAGACAGCAAAAATGGTAACAACATTACTTGAAGAAGCAAAAGCAGGTAGCCCTTTGAGTGTTCCAGGGAGTTCCTACAATGCAAATACAGGCATGAGTAATTCTATGTTGCCAAATATGTTTCCTGCTGGTTGTACACCTCCACTTTCTCCTCGAAGTGTTTCTGGTTCCCCAAGGTCAGTC
ATGAGACGGCATGGAGCTGGTCCAAGTTCTCTAGGATCTCCACTAAAATGGGCCAATGATCCAGCAAAAGAAGTCATCCCACAGTTCTACTTTCATAATGGACCTCCCCTTCCAAAAGAAATGGCCGAGAAGTGTTTATCAAGAATTGATCAGCTCTTTTTTGGTCACATGGATGGGTTGCGTGTGGAAGAATTTAAACT
GCTGACAAAGGAAATCTGCAAGCTACCTTCATTCTTTTCTACCACTCTGTTCAAAAAGATTGATATTGATAATACAGGAGTTGTGACAAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAAATCTTCACAGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGATG
ATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGAC
GAGGAAGAGGATATAAACAAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTGGATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAA
AGCTGAAGGGAAGATGGGGTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTTTAAGTGTGTGGACTTGGATGGTAATGGTGTACTGACACCAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAACAATTGCATCGCATGGAATGCATGGCCCAAGAGCCAGTCCTTT
TTGAGGACATATTATGCCAAATGGTGGATATGATTGCCCCCGAGAAAGAATGGCTATTTACTCTACGGGATCTGAAGCGATGCAAGTTGTCAGGAAGTGTTTTTAATATTCTTTTTAATCTTAATAAATTTATGGCTTTTGAAACTCGAGATCCATTCCTTATCCGTCAGGTAAAATATATCCTGTTCTACAATATTGGT
TCTATTGTTACTTATTAAGGATAGATTGTCTTATCAAGCCACAATAAAGTTTCTGATATAGTTATGGGAATAAGCAGGAACGGGAAGATCCTACTTTGACAGAGTGGGATCGGTTTGCACACAAAGAATATATCAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCTAATGGCAGTGCAGAAGTCTGGGATGAATCT
CTTGAGGCTCCTTTCTGAATGTGAGCATTCTTTGTCGACAGCATCAGCACGTTCAGCTGTTTCTGCATTTTGTCGACCATACAGGCTTTTTGCCTTCTGCTTTTCATgtaatgctccagaatttgagttgcacatgcatttatgattggaatgcctgctaaatgttatcaatgaatctgatgttatatgcatgaatgaat
atttcattggtcacttttcaaaaacttccttgagcatgtgaggcaggtggtatgatgatgatcacaggttagtgcatgggcgagctccttaatatgtgctatttagtgtattcaacgtcctggcatacataaatttcattcaatcctagataccagaatacccggagttgtattctggtaactggaaggacaattggatg
cctggaaatgagaatatatagaatgattacctgaaaacaagacgatggaaataaaattgcagtcggaataaatgctgtgtgcaaccttcatagagggaggaaaaaatacaagcatattattaaaaggataccgtgttttgttaaaatgatgaatgttatgattacttgattctctttccaaattgaaactctcttatctg
cgttgtttccttgcagTAGTCTTGCTCCTAAATGGATGGAACTATGTCTGGATATTTGAAATGGCGGACCTGCAGATCCCTGGTGGGGATGGTTATCTTCTATTTCAGAATACTGGACTTGGAAGGAATGTCTTCAGCACCATCGTGCAGCTGTACACAAAGGTTGGTCAATTGGTAGATGTTTTGCCATTCTGAAATAA
TCAGATGAAATAGAGGTTCATTGGAATAGTATTTGAATATTTTTGTACAGGACTTGTATTTTTAATTTATTTTTAATTAAAGCCTGTTGCAAGTTCTGCTAGAGGTTCAATGTTTAATAACCATCAGGCCTTTGAGATTGGCTTTTGAAAAGTTGGCTTTGTTGTTTAGTACCTTGTTGATTGCAAAGAGAGACAAAGGA
TCCACAGATTTTATCTTTCCAGTTGTGTTTGAATCAAGTGTTTTTGCATTAATATGGTGGAATATTTAAGCTCCGTGAGAGATGGGGGTATGTACCATATTGGTTCTCAGCAGAATGTGGAAAGAATGGCAGCCCTAATTACCTGTCAAAGAGAATGGCAGCTATGTAGTGAGGAATGTAGATAGCTATTCTATGGCAGA
TATTTTGCCAGTATTATTATACTAAAAAACATATCTGTATGGTCATTCTCCGTTCCGTTATTGCACATCATCGTTATGCTCAGAATTTTCATTGTTGCTATGTTGCCAATTTAGCCTTTCAGTGTATTCTCTTATGATATATGTAGTTGAAACATTACTCTCAATTAATTCAGG
Intron 11 GTAAAATATA ... GAATAAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 30.65 | 43 | 24 | 14 |
| A2 | 22.73 | 34 | 8 | 12 |
| A3 | 25.4 | 47 | 20 | 12 |
| A4 | 20 | 40 | 13 | 7 |
| A5 | 16.49 | 28 | 9.1 | 2 |
| A6 | 17.43 | 154 | 43 | 22 |
| A7 | 27.16 | 118 | 57 | 31 |
| A8 | 22.12 | 132 | 47 | 28 |
| A9 | 19.31 | 117 | 35 | 21 |
| A10 | 17.46 | 104 | 34 | 10 |
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i12 from sample A1 / Example spliced isoformTAATATTCATTCTTCACTGTAAGTAACTTGCAGCATATCTCATTTTTTAAAATGTTGACGAAGTAATGTGTGTTACTTCCACATTTATTTAAAAGATTACGTGTAATAATAGTGATAAATTTGTTTTGTGTGTTGAGATTTTACTTTGTTTTGCTTTGCAAAATCAATTTGTTTTTTTTGTGATTTTAGTTATATTTATT
TAGAAGAAAAACAATAACGTAGCTACAGTTATTATAATTGAAAGTTCACTTTTATCTTAACAAGTAAATTTTAATAGCAACATTTACTGAATCTTTAAAATATAAAAAAATTTAAATATATTTAATCATTTAGAAATTACTGTACTGTATCCACACTATATCGAATATTCGCCGAATTTCAAATTCGAAACGAATTTTTC
CATACAGGAACCCCCAATACGGCCGAATCTTGCTACTATGGTATAAACCCATGTGCAGATTGCTCACGAGACTTTAGAGAGTTAGAGGCACACTACTTTACACTAATGGGTGATGCTTTTGGGGTTGATGGGAATGCAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAA
ATCTTCACAGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGTCTATATTGAATTTCCTTGGTATTCTACTAGTGCTTGAAGGTCACTATTATATGTCTTAATGAGTTGTGTATTGAAGGCTTGACTTGGCTTTTGGACTGCTGACAAACAAGCATCAGGGTTTTGTACTTTGCTATTTATGTTCTAGTTACTCAA
AGTGTGATGGAATTGACAGGATGATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGGTATGAGTTATTACTTTCCCTATGATCTAATGGTAAATTCTTAATGTTGACATGTACAACTTAACATCAGCGCCTAAATATGGTTTCTTA
ATGTATGCATTTTACTTGTGTCAAGTTGTCAACAATAAATACTAAATTATTGTTTGTTTTAAAAGTCAATGGCTGTATTACTTGTTTTAATTAGCAAGGGGATCAGAAGTAGGTGTGCTCGGAATTAACATTTGAGATTCTTGTTTTTGGTCATGTAGATTGAATCCTGTAAGGAATGTTCACAGTTCTTTAGCAATTAT
ATTTGTTCTTCAATTATTGAGGATGTAAGTATTGGTCATTAGTGTCTAGATTTAACTAAATTAATGTTTGCAGTATTCTATTGCTTTTGCAACTGTAGTTCCATATTGTCAGAACCATAAGTACAGTATGGTGAATATTAGAGGGAGGGATGACTATTTAATCCTGTAAATGGCCATGTACCAGAGTTGTTTTTTGGGTT
TCTCCTCAGAAACCTTAGTTTAAGGCATTTTTGTTGGTGTACGTAGCGATAGTTCAGGAGTTAATACCTAGGTGATTCAATGACTGGGCTTGTATTACTATCTAATGTAGTTTTGGAGTGATGAATGGTATTACTCTTTAGTAGAATCAAGGATTTTGTGTGCAATCATATACAAATAAGTTAGTAAACAGGTTGTGTCC
AGAATCAATTTAATTTAAATATTATTGTCTTCCATTTATTGCTCATTTCTTCTTGTTTAAGATTTCACATTTCTTGTTTATCTGATACTTGGCTTTAATACAAATAGTGGAATTTAATTTAAATATTATTGTCTACCATTTATCTCACATTTCTTCATGTTTAACATTTATTGTTTATCTGATACTTGGCTGTAATACAA
ATAGTGGTTCATGTTTTGGTGCTGCCATATTTTCTAACTTATTTTGGCTTTTTGATGATGTATCCTCAGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAAC
AAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTGGATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAAAGCTGAAGGGAAGATGGG
GTATGAGGACTTTGTTTACTTTATGCTGTCCGAGGAGGATAAGTCATCTGAACCGAGTCTTGAATATTGGTTTAAGTGTGTGGACTTGGATGGTAATGGTGTACTGACACCAAATGAAATGCAGTTCTTTTATGAGGAACAATTGCATCGCATGGAATGCATGGCCCAAGAGCCAGTCCTTTTTGAGGACATATTATGCC
AAATGGTGGATATGATTGCCCCCGAGAAAGAATGGCTATTTACTCTACGGGATCTGAAGCGATGCAAGTTGTCAGGAAGTGTTTTTAATATTCTTTTTAATCTTAATAAATTTATGGCTTTTGAAACTCGAGATCCATTCCTTATCCGTCAGGAACGGGAAGATCCTACTTTGACAGAGTGGGATCGGTTTGCACACAAA
GAATATATCAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCTAATGGCAGTGCAGAAGTCTGGGATGAATCTCTTGAGGCTCCTTTCTGAATTAGTCTTGCTCCTAAATGGATGGAACTATGTCTGGATATTTGAAATGGTGGACCTGCAGATCCCTGGTGGGGATGGTTATCTTCTATTTCAGAATACTGGACTTG
GAAGGAATGTCTTCAGCACCATCGTGCAGCTGTACACAAAGGTTGGTCAATTGGTAGATGTTTTGCCATTCTGAAATAATCAGATGAAATAGAGGTTCATTGGAATAGTATTTGAATATTTTTGTACAGGACTTGTATTTTTAATTTATTTTTAATTAAAGCCTGTTGCAAGTTCTGCTAGAGGTTCAATGTTTAATAAC
CATCAGGCCTTTGAGATTGGCTTTTGAAAAGTTGGCTTTGTTGTTTAGTACCTTGTTGATTGCAAAGAGAGACAAAGGATCCACAGATTTTATCTTTCCAGTTGTGTTTGAATCAAGTGTTTTTGCATTAATATGGTGGAATATTTAAGCTCCGTGAGAGATGGGGGTATGTACCATATTGGTTCTCAGCAGAATGTGGA
AAGAATGGCAGCCCTAATTACCTGTCAAAGAGAATGGCAGCTATGTAGTGAGGAATGTAGATAGCTATTCTATGGCAGATATTTTGCCAGTATTATTATACTAAAAAACATATCTGTATGGTCATTCTCCGTTCCGTTATTGCACATCATCGTTATGCTCAGAATTTTCATTGTTGCTATGTTGCCAATTTAGCCTTTCA
GTGTATTCTCT
>TRINITY_DN128644_c2_g4_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:TAATATTCATTCTTCACTGTAAGTAACTTGCAGCATATCTCATTTTTTAAAATGTTGACGAAGTAATGTGTGTTACTTCCACATTTATTTAAAAGATTACGTGTAATAATAGTGATAAATTTGTTTTGTGTGTTGAGATTTTACTTTGTTTTGCTTTGCAAAATCAATTTGTTTTTTTTGTGATTTTAGTTATATTTATT
TAGAAGAAAAACAATAACGTAGCTACAGTTATTATAATTGAAAGTTCACTTTTATCTTAACAAGTAAATTTTAATAGCAACATTTACTGAATCTTTAAAATATAAAAAAATTTAAATATATTTAATCATTTAGAAATTACTGTACTGTATCCACACTATATCGAATATTCGCCGAATTTCAAATTCGAAACGAATTTTTC
CATACAGGAACCCCCAATACGGCCGAATCTTGCTACTATGGTATAAACCCATGTGCAGATTGCTCACGAGACTTTAGAGAGTTAGAGGCACACTACTTTACACTAATGGGTGATGCTTTTGGGGTTGATGGGAATGCAGGGACCAGTTTGTTAGTTATTGGATTGACAAGAAAATGGTAACTATGGACTTGGCAAACCAA
ATCTTCACAGTTCTAAGGCAGCCAGACAAGAACTATCTCACTCAGGTCTATATTGAATTTCCTTGGTATTCTACTAGTGCTTGAAGGTCACTATTATATGTCTTAATGAGTTGTGTATTGAAGGCTTGACTTGGCTTTTGGACTGCTGACAAACAAGCATCAGGGTTTTGTACTTTGCTATTTATGTTCTAGTTACTCAA
AGTGTGATGGAATTGACAGGATGATTTCAAGCCCATATTGAGAGAGCTTCTGGCTACACATCCAGGATTGGAATTCCTACAAAGTACACAAGAATTTCAAGAGAGATATGGTATGAGTTATTACTTTCCCTATGATCTAATGGTAAATTCTTAATGTTGACATGTACAACTTAACATCAGCGCCTAAATATGGTTTCTTA
ATGTATGCATTTTACTTGTGTCAAGTTGTCAACAATAAATACTAAATTATTGTTTGTTTTAAAAGTCAATGGCTGTATTACTTGTTTTAATTAGCAAGGGGATCAGAAGTAGGTGTGCTCGGAATTAACATTTGAGATTCTTGTTTTTGGTCATGTAGATTGAATCCTGTAAGGAATGTTCACAGTTCTTTAGCAATTAT
ATTTGTTCTTCAATTATTGAGGATGTAAGTATTGGTCATTAGTGTCTAGATTTAACTAAATTAATGTTTGCAGTATTCTATTGCTTTTGCAACTGTAGTTCCATATTGTCAGAACCATAAGTACAGTATGGTGAATATTAGAGGGAGGGATGACTATTTAATCCTGTAAATGGCCATGTACCAGAGTTGTTTTTTGGGTT
TCTCCTCAGAAACCTTAGTTTAAGGCATTTTTGTTGGTGTACGTAGCGATAGTTCAGGAGTTAATACCTAGGTGATTCAATGACTGGGCTTGTATTACTATCTAATGTAGTTTTGGAGTGATGAATGGTATTACTCTTTAGTAGAATCAAGGATTTTGTGTGCAATCATATACAAATAAGTTAGTAAACAGGTTGTGTCC
AGAATCAATTTAATTTAAATATTATTGTCTTCCATTTATTGCTCATTTCTTCTTGTTTAAGATTTCACATTTCTTGTTTATCTGATACTTGGCTTTAATACAAATAGTGGAATTTAATTTAAATATTATTGTCTACCATTTATCTCACATTTCTTCATGTTTAACATTTATTGTTTATCTGATACTTGGCTGTAATACAA
ATAGTGGTTCATGTTTTGGTGCTGCCATATTTTCTAACTTATTTTGGCTTTTTGATGATGTATCCTCAGCGGAAACTGTGATTTACAGAATCTTTTACTACATAAATCGGTCTGGAAATGGCCATATTACACTGAGAGAACTGAAACGTGGTAATCTGATACCTGCAATGCAGCATGTAGACGAGGAAGAGGATATAAAC
AAAGTCTTAAAGTACTTTTCTTATGAACACTTTTATGTGATATATTGCAAATTCTGGGAGCTGGATACAGACCACGATTTCTTGATTGATAAAGAGAACCTTTTAAGATATGGAAATCATGCTCTGACATACCGGATAGTGGATAGGATATTTTCTCAGGTCCCTCGAAAGTTTACAAGTAAAGCTGAAGGGAAGATGGG
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