NA ----> NA
Intron 1 GTAAACGCAA ... TTTTTAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.55 | 29 | 9 | 6 |
| A2 | 30.77 | 9 | 6 | 2 |
| A3 | 36.84 | 12 | 8 | 6 |
| A4 | 25.93 | 10 | 4 | 3 |
| A5 | 0 | 6 | 0 | 0 |
| A6 | 28.85 | 37 | 20 | 10 |
| A7 | 23.89 | 86 | 32 | 22 |
| A8 | 22.16 | 72 | 18 | 23 |
| A9 | 18.18 | 72 | 16 | 16 |
| A10 | 19.44 | 87 | 21 | 21 |
>TRINITY_DN42111_c0_g6_i1 from sample A6 / Example spliced isoformGCTCAATTCCGATCGTTCTACATTGCCGACAATTATTAAAAGGGCGAGCGGAAAGTCAATGCAGTCCAACTCATCAGTTGCAGAGAATTGCGGGTTCGATAATATGATATCAAAGGCCGGGGACGCCATAGCTACAGGCAACGAGAGATCTATATCACAGCTTGATCATAATATCGATATTGCTCTTTCTTCTCCAATAA
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>TRINITY_DN42111_c0_g6_i5 from sample A6 / Example unspliced isoform:GCTCAATTCCGATCGTTCTACATTGCCGACAATTATTAAAAGGGCGAGCGGAAAGTCAATGCAGTCCAACTCATCAGTTGCAGAGAATTGCGGGTTCGATAATATGATATCAAAGGCCGGGGACGCCATAGCTACAGGCAACGAGAGATCTATATCACAGCTTGATCATAATATCGATATTGCTCTTTCTTCTCCAATAA
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AAAAGTGCTTACTTAGGCAATATGTGCAGTTTTGAATATCTGGGAAAACATGCACTTGGAGCAGATATTTTGTTTTGTTTTGAGTTTGCTAATCTATGGCCTTAGAATGCAATTTATTGTTTATCAGGTATCCATGTTCCCACGGTGCCTTGGGAAGTCCACCTGCCATGCTATTTTTTTAATTTGTTAGGCTCAGGCTT
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AGTGCACTTGCTACAGCTGTAAACATCTCAAATTATTTTTTATGGGGCTCAAATGTATTTCCTGCTTATAAAACAGGCACATTCTCA